5DOHA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with 2-[(1s)-2,3-dihydro-1h-inden-1-ylamino]-3,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)thio]benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5dohA00
4WW8A 5SZ4A 4MLXA 1BCDA 1G1DA 1CCSA 1RZCA 4FVOA 4DZ9A 1RZAA 4QSAA 3RYZA 5EIJA 3V5GA 5FNIA 4CACA 2X7TA 1UGFA 4Q81A 3RG4A 3RZ5A 4QIZA 4YHAA 5EHVA 1IF9A 1RAZA 3S8XA 1DCBA 2HD6A 4IDRX 1FSRA 1HEAA 1RJ5A 4RUZA 4X5SA 2CBCA 4FIKA 1I9MA 3KKXA 4ZWIA 4Z1JA 3V3FA 4M2WA 4KNNA 5G0BA 2POWA 4KNJA 2CBBA 2NXRA 3M14A 3M2XA 3NB5A 3MNAA 3V2MA 3MHOA 3HKQA 4HEZA 1TB0X 1IF6A 1DCAA 1G4JA 4Q7SA 3R17B 3V3IB 4YWPA 1CAKA 3RYVB 4Q78A 3OILA 1A42A 3KS3A 5EKHA 5AMGA 5AMDA 1G3ZA 3MNUA 3DVCA 1TH9A 3TVNX 3N3JA 3M96A 3KIGA 4YGLA 3KWAA 1CANA 4QJ0A 4KP8A 3F8EA 4WUQA 1EOUA 1FR4A 5FDCA 5BRVA 1F2WA 7CA2A 1HCAA 1BN1A 3HLJA 3MWOA 1JV0A 1LG6A 4Z1KA 4WUPA 5A6HA 4KUVA 2WD2A 1RZDA 4L5VA 5EH7A 3RGEA 1MUAA 4Q90A 1CAYA 1AVNA 1H9NA 3JXHC 3MNJA 3BL1A 2NMXA 5FL4A 4KAPA 1G6VA 3DA2A 1AM6A 3DV7A 1CAHA 1ZGFA 4YXOA 2VVAX 5FLTA 3V3HB 1CNGA 2EZ7A 1Y7WA 2ZNCA 3M1WA 4G7AA 4ZX1A 3TMJA 5DOGA 1BZMA 3PO6A 4XIXA 4ZAOA 5SZ0A 4G0CA 4BF1A 4QSBA 3KONA 3IBNA 3P5LA 3T5UA 1I9OA 1ZSCA 3IBLA 4E5QA 4LHIA 4YXUA 1TTMA 4RIVA 1CRAA 3D93A 4JSSA 1CNJA 4K0TA 4IWZA 1LGDA 3Q31A 2AW1A 3M5SA 1BNTA 1I9NA 3DCCA 1I9QA 1I90A 3S78B 1G4OA 5JEPB 4Q6DA 5FNKA 5FNMA 1CNBA 1HEBA 1ZE8A 3QYKA 4UOVA 3S71B 1CAMA 2FOQA 3P5AA 5IPZA 1JD0A 4ZWYA 3RZ7A 3MNIA 4JSZA 1MOOA 3M1QA 4RUXA 4BCWA 5FLRA 1BNVA 3JXFA 4LP6A 4RIUA 3S76A 5DSJA 2NWOA 3OY0A 3DD8A 3C7PA 3L14A 4Q08A 2Q1BA 3V3GB 5SZ6A 4YGJA 5DSOA 3CAJA 1TG3A 3LXEA 3DCWA 5BNLA 4E3HA 1CVEA 2NWPA 4E4AA 2H15A 1CAZA 12CAA 1BNWA 1IF4A 4R59A 5SZ1A 2OSFA 3MYQA 4MLTA 3CA2A 3FW3A 1YDCA 3OYQA 1CALA 4Q07A 1BNMA 3RYJB 4Z0QA 4WW6A 5DSMA 2X7UA 3IBUA 4RFCA 3HFPA 3K34A 1BNNA 4E9OX 1HCBA 3ML2A 5EHWA 1CNIA 5JDVB 4QJMA 4N0XB 5E2KA 3MZCA 1UGCA 1G52A 2Q1QA 3MMFA 3SBHA 4Z1EA 1FQNA 4MDLA 1T9NA 5SZ3A 3NI5A 5E2RA 3FFPX 2QO8A 4Q7VA 2CBDA 4Q87A 1KOQA 4Q9YA 3S74B 4CNWA 2NN7A 1ZSAA 3M1KA 1XEVA 3RYXB 3M2YA 3IBIA 5JEHB 1ZSBA 1J9WA 3S75B 3KOKA 3R16A 3RZ0B 4ILXA 1TEUX 4Q6EA 1I9PA 1CAOA 1OKLA 2HKKA 4HT2A 4QK2A 5DSKA 1CVHA 1UGEA 4QJXA 5JG3B 2ABEA 3K2FA 4KV0A 4KUYA 1BN4A 2FNMA 5E5RA 4QY3A 1CCTA 3U3AX 2NNSA 4HEWA 4Q49A 2FOVA 4M2VA 5FNLA 1TG9A 4WR7A 3V3JA 2GEHA 5FL5A 3T82A 4YX4A 1UGGA 5HPJA 5L6KA 3M67A 4R5BA 3DD0A 5SZ7A 5JGSB 3P3HA 2F14A 3MDZA 4L5UA 3M2NA 3HKUA 4Z1NA 4Q8ZA 3D92A 5EKMA 1G46A 1AZMA 1BV3A 4FU5A 5JESB 5FNGA 3MHCA 3P44A 3M04A 4M2RA 4RFDA 4YVYA 4CNRA 3BL0A 1RZEA 5EH5A 1CA3A 1CA2A 5LMDA 1YDAA 4KNIA 4Y0JA 3OKVA 4KNMA 4XFWA 1CAJA 3NJ9A 4YGKA 1HECA 5AMLA 2CBEA 1IF5A 1ZFKA 5JQTA 1I91A 1RJ6A 4COQA 5FLOA 1DMYA 2AX2A 4K1QA 2NNOA 2WEOA 3SAXA 3ML5A 3HS4A 1G54A 4PXXA 3UYNA 9CA2A 5G01A 3CZVA 3D9ZA 4Q8XA 3HKNA 3RZ8A 3KNEA 4GL1X 2FOUA 2EU3A 4DZ7A 3JXGA 4Q8YA 5E2MA 5FLQA 5JQ0A 4XIWA 1CVDA 5FNJA 2FMZA 4ZWXA 3W6IA 4YGNA 4E3DA 4FL7A 1XPZA 5EH8A 1CVBA 4QTLA 5DVXA 3T84A 1FSQA 1CZMA 3MHLA 3OIKA 3M98A 3P55A 1V9IC 1H4NA 1FLJA 5DSRA 1BNUA 4LU3A 4MDGA 4ZWZA 4FVNA 4Q09A 4QJOA 1CILA 5DSIA 2WEGA 1THKA 3P58A 2GD8A 3K7KA 1KEQA 1JCZA 2EU2A 2HNCA 4C3TA 4CQ0A 4CNVA 2HL4A 2H4NA 2NN1A 3S73B 3IAIA 2ILIA 1LZVA 1CVFA 3PYKA 2CA2A 3PJJA 3M2ZA 4TWMA 5JGTB 3T5ZA 3KOIA 4KUWA 1CAIA 4E3FA 5SZ5A 4MO8A 3RG3A 3SBIA 1IF7A 2POVA 2WEJA 4K0SA 3RJ7A 2FW4A 3CYUA 1CINA 2NWYA 1CIMA 4QJWA 1BICA 3DC3A 3EFIA 5DRSA 4HU1A 4QSJA 4RUYA 2IT4A 2CBAA 5L3OA 3DVBA 1CNKA 1DMXA 4YYTA 5CJFA 1UGBA 1Z9YA 2HFWA 1FQLA 3M5EA 5SZ2A 5JG5B 5DSLA 3P4VA 4CNXA 2W2JA 1UGAA 4RH2A 4JSAA 3RZ1B 1HUGA 1TEQX 5FLPA 3M1JA 3OKUA 3D8WA 4Q0LA 1HEDA 3OYSA 4QK3A 5EOIA 1TBTX 4HBAA 3VBDA 1FQMA 5G0CA 5DSQA 4FRCA 1CNCA 3ZP9A 2NNVA 5FDIA 2VVBX 4K13A 5DSPA 2WEHA 4MDMA 4Q7PA 3U45X 5CLUA 1HUHA 3DCSA 1CNHA 1LUGA 1URTA 2NWZA 4R5AA 5E2NA 3M3XA 3M40A 4PYXA 4E3GA 1OKMA 1KOPA 3TVOX 1G48A 3RYYA 3IGPA 3S97A 3DAZA 3DBUA 4HEYA 5CACA 4Q83A 1TE3X 1V9EA 3BETA 4QEFA 1ZH9A 1LG5A 5EHEA 1UGDA 4YXIA 1H9QA 4PZHA 4JSWA 2QOAA 1CNWA 5DSNA 3ZNCA 3B4FA 1I9LA 3D0NA 4PYYA 4Q99A 4TWLA 1RZBA 4PQ7A 1FSNA 1G45A 3S77B 5FL6A 3OIMA 5BRUA 2NXSA 1CVCA 1ZGEA 1G0EA 1IF8A 3B1BA 5DOHA 5BRWA 5C8IA 4N16A 3FE4A 4CA2A 3F7UA 4Q06A 1YO2A 3GZ0A 3MHIA 4JS6A 3DC9A 4QK1A 4RN4A 2Q38A 3MHMA 5JEGB 3P3JA 4K0ZA 1G53A 1CNYA 3IEOA 4HT0A 1YO1A 3F4XA 4QIYA 1BNQA 3MNHA 5E28A 4HF3A 4Q7WA 4MTYA 4ETQC 4L5WA 1FQRA 3DVDA 5CA2A 4QSIA 1G0FA 2WD3A 3RLDA 8CA2A 4QJPA 1YDBA 4YGFA 2FNKA 2FOYA 4ITPA 3T85A 2O4ZA 1CCUA 2HOCA 4XZ5A 1OQ5A 1ZFQA 3W6HA 2POUA 5J8ZA 3F7BA 1BN3A 2CABA 3V7XA 3N0NA 1Z97A 3U47A 3T83A 4WL4A 3N2PA 3N4BA 3MNKA 4E49A 1HVAA 2NXTA 3M5TA 1Z93A 4KP5A 1XQ0A 3EFTA 1OKNA 1KWRA 5FLSA 5EKJA 1YDDA 1CVAA 5BYIA 2FNNA 2FMGA 5FNHA 3UYQA 5A25A 3KLDB 5E5UA 2OSMA 3S72B 3SAPA 4FPTA 1CNXA 1KWQA 1RAYA 1I8ZA 1XEGA 2FOSA 2QP6A 5G03A 3S9TA 1FR7A 4XE1A 3V2JA 3HKTA 1ZNCA 4BF6A 1YO0A 2X7SA 3U7CA 2NNGA 5EZTX 4M2UA 5E2SA 4ITOA 1CRMA 4ZX0A 6CA2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WW8 A;  5SZ4 A;  4MLX A;  1BCD A;  1G1D A;  1CCS A;  1RZC A;  4FVO A;  4DZ9 A;  1RZA A;  4QSA A;  3RYZ A;  5EIJ A;  3V5G A;  5FNI A;  4CAC A;  2X7T A;  1UGF A;  4Q81 A;  3RG4 A;  3RZ5 A;  4QIZ A;  4YHA A;  5EHV A;  1IF9 A;  1RAZ A;  3S8X A;  1DCB A;  2HD6 A;  4IDR X;  1FSR A;  1HEA A;  1RJ5 A;  4RUZ A;  4X5S A;  2CBC A;  4FIK A;  1I9M A;  3KKX A;  4ZWI A;  4Z1J A;  3V3F A;  4M2W A;  4KNN A;  5G0B A;  2POW A;  4KNJ A;  2CBB A;  2NXR A;  3M14 A;  3M2X A;  3NB5 A;  3MNA A;  3V2M A;  3MHO A;  3HKQ A;  4HEZ A;  1TB0 X;  1IF6 A;  1DCA A;  1G4J A;  4Q7S A;  3R17 B;  3V3I B;  4YWP A;  1CAK A;  3RYV B;  4Q78 A;  3OIL A;  1A42 A;  3KS3 A;  5EKH A;  5AMG A;  5AMD A;  1G3Z A;  3MNU A;  3DVC A;  1TH9 A;  3TVN X;  3N3J A;  3M96 A;  3KIG A;  4YGL A;  3KWA A;  1CAN A;  4QJ0 A;  4KP8 A;  3F8E A;  4WUQ A;  1EOU A;  1FR4 A;  5FDC A;  5BRV A;  1F2W A;  7CA2 A;  1HCA A;  1BN1 A;  3HLJ A;  3MWO A;  1JV0 A;  1LG6 A;  4Z1K A;  4WUP A;  5A6H A;  4KUV A;  2WD2 A;  1RZD A;  4L5V A;  5EH7 A;  3RGE A;  1MUA A;  4Q90 A; 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