5DOHA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with 2-[(1s)-2,3-dihydro-1h-inden-1-ylamino]-3,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)thio]benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5dohA00
5E2RA 3OILA 1XQ0A 4QTLA 1CVDA 5A6HA 5JEGB 3IGPA 6CA2A 1BN3A 2FW4A 1CAIA 4TWMA 3SBIA 4G7AA 3ZNCA 4MDMA 1CNBA 5DSLA 4E5QA 1CVAA 4K1QA 1IF6A 3QYKA 5FLPA 4L5VA 4Q6DA 3N4BA 3N0NA 3RZ8A 3S73B 3GZ0A 3M5SA 1ZNCA 4Q8YA 4ZAOA 1LG6A 3OKVA 3P3JA 3RLDA 3IBIA 2GD8A 2FOVA 1CVBA 1LGDA 1CA2A 3MHIA 4Q90A 3M2XA 5FNGA 5DSQA 3PJJA 4Q0LA 1CANA 1BICA 3RYZA 5SZ3A 3P5LA 3FW3A 5FL5A 1YO2A 1I9PA 5FNIA 3M1JA 3S71B 4Z1JA 4C3TA 4TWLA 3T84A 3HLJA 3TVNX 4QEFA 5EKHA 5EH5A 1UGAA 4QJWA 4KUVA 3Q31A 1CALA 1H4NA 4Q83A 3DVBA 4HEYA 3D8WA 3JXFA 3MHCA 3RG4A 2NWOA 2HD6A 3S74B 1CCTA 4FPTA 3R16A 1YO0A 1CVEA 1OKMA 4ZX0A 1CAMA 3NB5A 5E5UA 5EKMA 4Z1EA 1CNCA 3M3XA 2GEHA 4YVYA 1CCUA 1BNTA 1MUAA 1YDCA 2WEJA 5JGTB 3RZ7A 4K0SA 4YGKA 3OKUA 2ZNCA 1G53A 1TB0X 4M2VA 4YGNA 1G0EA 1I9LA 5DSNA 3S75B 3M67A 5IPZA 5E28A 3IBNA 4YGLA 1CRMA 1G0FA 4L5WA 3RYVB 1G4JA 1G6VA 3MNIA 3P4VA 5BNLA 2QO8A 3MNKA 1CAKA 3PO6A 5L6KA 5SZ4A 5FDCA 1RJ6A 3OYSA 4HBAA 4KP8A 5JESB 1AVNA 1BNMA 4JSSA 3S72B 3M2NA 4JSWA 1YDDA 5E2KA 1I9MA 4YX4A 4QK2A 1XPZA 3MNHA 4YWPA 5SZ7A 1JCZA 1FR4A 3DD8A 3F8EA 3HKNA 4QSIA 4WUQA 3B1BA 3V3JA 3JXGA 1BNUA 2WD2A 4FRCA 4Z1KA 1V9IC 5EKJA 4CA2A 4COQA 3MNUA 3B4FA 2CBBA 3TMJA 3MHLA 1RZAA 4R5BA 4LHIA 1TBTX 2NN7A 2O4ZA 4ITPA 4PQ7A 1DCAA 4QJXA 2Q1QA 4N0XB 4DZ7A 1RAYA 1TG3A 4DZ9A 2NNSA 4KAPA 1G4OA 1RZCA 3VBDA 5AMGA 1RAZA 4JSAA 5DVXA 3EFIA 1IF8A 3RJ7A 2HOCA 4UOVA 1ZSCA 4CNRA 4ETQC 3RG3A 1I91A 4HEZA 5AMLA 1BNWA 2FMZA 3N2PA 5BRVA 3M04A 1FQRA 3K34A 5DSIA 1ZSAA 1HVAA 2WEHA 1CNYA 2ABEA 4Q06A 3T83A 2CBDA 4KNJA 4RIUA 3FFPX 3P55A 5FNKA 1CNIA 2EU2A 2H4NA 2POWA 3M40A 4FL7A 3M2YA 4RFCA 1DMXA 5FL6A 5FLTA 5LMDA 4E3HA 5DOGA 4Q08A 5DSOA 4ZWIA 4M2RA 1LG5A 1TTMA 5JG3B 1CNGA 4QSJA 5DSMA 4Q87A 1CAHA 3OYQA 3U7CA 4CNVA 3MWOA 1BNVA 4YHAA 2FNNA 4YXIA 4YXOA 5L3OA 2AW1A 3M96A 2X7SA 3MNJA 1HUGA 1I90A 1FQNA 4E3DA 1TEQX 1ZFKA 1TG9A 4E9OX 3DBUA 5EHWA 1TE3X 1BZMA 3UYNA 1MOOA 3KNEA 5CA2A 3M2ZA 5JEHB 1AM6A 1CNJA 1DCBA 1I9QA 1XEGA 1IF9A 3F7UA 3V3HB 3HFPA 4XZ5A 4MLTA 4RUYA 5SZ5A 2Q38A 5JDVB 4Y0JA 3D0NA 5DRSA 4FU5A 4QJ0A 3IBLA 4HT2A 1UGBA 5CACA 1HCBA 3M98A 1FQLA 3RZ1B 2NMXA 3MNAA 2HFWA 3RYYA 3DC9A 4KUYA 1ZH9A 3V7XA 2NXRA 3N3JA 4MLXA 3DC3A 4KNNA 5SZ1A 1HEBA 1OKLA 4Q8ZA 1RZEA 4ILXA 5DSJA 4X5SA 1J9WA 3T82A 4HEWA 3PYKA 1KEQA 5E2NA 4ZWYA 5JG5B 3R17B 2FMGA 4FVNA 1G52A 4K13A 2NNVA 3F4XA 2OSFA 3V3IB 3NI5A 1CAZA 2FOSA 1UGDA 4WR7A 3V2MA 4LP6A 3K7KA 1RZDA 3M1QA 2FNMA 1XEVA 3U47A 2HL4A 4QSBA 5BYIA 5HPJA 3P58A 2OSMA 5SZ0A 1BNNA 3BL1A 5JEPB 2CBAA 1JD0A 1KWRA 1YDBA 4YGJA 4E3FA 4E3GA 2CBCA 2EU3A 4Q6EA 4KNMA 4WL4A 3V3GB 3NJ9A 2CABA 5SZ6A 4RIVA 2NWYA 3MDZA 4RH2A 8CA2A 4BF1A 4PYXA 5FL4A 1CNWA 4L5UA 1URTA 1BV3A 3FE4A 4XE1A 2QP6A 1UGGA 3DCCA 3SAXA 3KKXA 2IT4A 1UGCA 3OY0A 4QJOA 1G46A 2NXTA 3M5TA 1HEDA 1LUGA 4XFWA 5JQTA 5JQ0A 3OIKA 2Q1BA 3U3AX 7CA2A 3M14A 3S8XA 1KOQA 2NWPA 2HNCA 3D9ZA 4K0TA 1RZBA 2FOUA 1FR7A 4Z0QA 5C8IA 4JS6A 2VVAX 4Q7WA 1CVFA 1FSNA 4FVOA 5J8ZA 3OIMA 1G1DA 1ZE8A 3P3HA 4Q07A 1FQMA 5FLOA 4YXUA 3T5ZA 1T9NA 4QIZA 3ML2A 5CLUA 4KP5A 4Q49A 1CAYA 3MMFA 3CZVA 3M5EA 4QJPA 3P44A 4CQ0A 5G03A 3RZ5A 3UYQA 4ZWZA 4E4AA 1FSQA 3D93A 1HEAA 2AX2A 2FOYA 4YYTA 3HKTA 4Q7PA 1Z9YA 4RUZA 5FDIA 1F2WA 5EIJA 4PYYA 3KONA 3SBHA 2WEOA 3W6IA 1BCDA 4FIKA 4RFDA 4WW6A 1HCAA 1A42A 1CAJA 4Q7VA 1BN1A 3F7BA 5EHVA 5BRWA 1KOPA 3RYJB 1UGFA 4QY3A 4Q09A 3DVCA 3T85A 1TEUX 1THKA 3ZP9A 5FNJA 1G48A 5A25A 1YO1A 3L14A 3IAIA 3M1WA 3C7PA 3S97A 3V5GA 3D92A 1YDAA 4JSZA 5FNLA 4R59A 1CNHA 4PZHA 1CAOA 3KIGA 3M1KA 2NNOA 2POVA 1CRAA 3DA2A 4LU3A 3MZCA 4G0CA 5EH7A 5FNHA 1EOUA 3CA2A 1ZGFA 3KS3A 2FNKA 5G01A 4KUWA 2H15A 4Q7SA 1G3ZA 1FLJA 3KOKA 3DD0A 4KV0A 3DVDA 4BCWA 1H9QA 2QOAA 1BN4A 4M2WA 4BF6A 2CA2A 3TVOX 4RN4A 3IEOA 4ZX1A 5E5RA 1OKNA 4R5AA 1HECA 3CAJA 3IBUA 1RJ5A 4QJMA 2WD3A 4WW8A 2FOQA 5BRUA 3K2FA 2POUA 5FLRA 5FLQA 4Z1NA 4KNIA 3MHMA 1H9NA 2VVBX 3W6HA 1HUHA 1IF4A 4QK1A 4M2UA 2ILIA 5FNMA 3P5AA 1I9NA 5E2SA 5CJFA 1CNKA 5E2MA 1V9EA 1IF7A 2EZ7A 3KWAA 3S76A 1CVCA 4MDLA 1IF5A 1ZGEA 2NXSA 5EHEA 3CYUA 1CVHA 3S78B 3T5UA 4CNWA 9CA2A 4XIXA 3EFTA 4HU1A 1BNQA 1OQ5A 4Q81A 3SAPA 3HS4A 3JXHC 2NNGA 5G0CA 1Z97A 1ZSBA 3HKUA 1CCSA 5SZ2A 5JGSB 1FSRA 4Q99A 1Z93A 4XIWA 1I8ZA 1UGEA 4PXXA 4Q9YA 1CNXA 4YGFA 4Q78A 4RUXA 4K0ZA 4MO8A 2W2JA 2X7TA 3RGEA 4QIYA 3RYXB 2NN1A 3V2JA 4CACA 5G0BA 1TH9A 1JV0A 3KLDB 2CBEA 4WUPA 3U45X 2HKKA 3S77B 1CZMA 1G45A 4ZWXA 3MYQA 5FLSA 12CAA 3KOIA 2F14A 1KWQA 4E49A 1CA3A 5DOHA 4GL1X 1DMYA 4N16A 4MDGA 5DSPA 3DV7A 2WEGA 3S9TA 1LZVA 3BETA 4HF3A 4CNXA 3LXEA 1Y7WA 4HT0A 1CILA 3MHOA 1AZMA 3DCWA 3ML5A 4MTYA 3V3FA 3BL0A 4ITOA 4QSAA 4QK3A 5EOIA 1I9OA 1ZFQA 2NWZA 1G54A 1CIMA 3DAZA 5DSRA 5AMDA 4IWZA 5DSKA 4Q8XA 4IDRX 5EZTX 5EH8A 3RZ0B 1CINA 3HKQA 2X7UA 3DCSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5E2R A;  3OIL A;  1XQ0 A;  4QTL A;  1CVD A;  5A6H A;  5JEG B;  3IGP A;  6CA2 A;  1BN3 A;  2FW4 A;  1CAI A;  4TWM A;  3SBI A;  4G7A A;  3ZNC A;  4MDM A;  1CNB A;  5DSL A;  4E5Q A;  1CVA A;  4K1Q A;  1IF6 A;  3QYK A;  5FLP A;  4L5V A;  4Q6D A;  3N4B A;  3N0N A;  3RZ8 A;  3S73 B;  3GZ0 A;  3M5S A;  1ZNC A;  4Q8Y A;  4ZAO A;  1LG6 A;  3OKV A;  3P3J A;  3RLD A;  3IBI A;  2GD8 A;  2FOV A;  1CVB A;  1LGD A;  1CA2 A;  3MHI A;  4Q90 A;  3M2X A;  5FNG A;  5DSQ A;  3PJJ A;  4Q0L A;  1CAN A;  1BIC A;  3RYZ A;  5SZ3 A;  3P5L A;  3FW3 A;  5FL5 A;  1YO2 A;  1I9P A;  5FNI A;  3M1J A;  3S71 B;  4Z1J A;  4C3T A;  4TWL A;  3T84 A;  3HLJ A;  3TVN X;  4QEF A;  5EKH A;  5EH5 A;  1UGA A;  4QJW A;  4KUV A;  3Q31 A;  1CAL A;  1H4N A;  4Q83 A;  3DVB A;  4HEY A;  3D8W A;  3JXF A;  3MHC A;  3RG4 A;  2NWO A;  2HD6 A;  3S74 B;  1CCT A;  4FPT A;  3R16 A;  1YO0 A;  1CVE A;  1OKM A;  4ZX0 A;  1CAM A;  3NB5 A;  5E5U A;  5EKM A;  4Z1E A;  1CNC A;  3M3X A;  2GEH A;  4YVY A;  1CCU A;  1BNT A;  1MUA A;  1YDC A;  2WEJ A;  5JGT B; 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