5DSIA

Structure of co2 bound holo-form of human carbonic anhydrase ii with 0 sec (no) warming
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Tracking solvent and protein movement during CO2 release in carbonic anhydrase II crystals
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5dsiA00
5JDVB 2HNCA 4L5UA 4ZX1A 4YGNA 2NXRA 1G4OA 5EHVA 3KOKA 4BF1A 4IWZA 1FLJA 1Y7WA 2Q1BA 1ZSAA 3M1WA 2QP6A 3U3AX 1CVBA 1CNKA 1XEGA 3RYYA 1CVEA 2CBDA 3MHOA 1CAMA 1RAZA 2H4NA 1YDCA 5DSRA 4WUPA 5IPZA 4MLTA 1H4NA 5A25A 5AMDA 2X7UA 4DZ9A 5SZ5A 3RLDA 1CANA 5EIJA 1YDBA 1H9NA 3FE4A 5EKHA 5CJFA 3OY0A 1G48A 1RZBA 2IT4A 4YXUA 3S74B 1CAIA 4FU5A 1I9OA 1BN4A 4FIKA 3ML2A 4E9OX 1KWQA 5BYIA 3KOIA 3OILA 5DSMA 3S78B 4E49A 5JQTA 4DZ7A 5G0BA 4QIYA 4ZX0A 1V9EA 3M67A 3N3JA 1TEUX 5BRWA 3P4VA 3P5AA 3DC3A 4RIUA 4YGFA 1AZMA 1IF5A 5DVXA 5BRVA 3V3GB 4Q7VA 5EHEA 4E3GA 1BNNA 4MO8A 1ZSBA 3W6HA 4Z1JA 2X7SA 5EH8A 4Q78A 4K0ZA 3KONA 1G45A 4Q99A 3S72B 4E3FA 1CALA 1Z97A 4HEWA 5G0CA 2EU3A 2WEGA 1I8ZA 1FQMA 3VBDA 3V3FA 3M1QA 4KP8A 5DSIA 4YYTA 1CCTA 1YO2A 5E2SA 1F2WA 3KIGA 3M5TA 3MHIA 1ZGFA 5LMDA 4R5BA 4UOVA 1FR4A 4RH2A 3ZNCA 5SZ3A 3M2NA 1YO1A 4E4AA 4Q06A 1A42A 3P58A 3NB5A 4RUYA 2FMGA 3RZ1B 4CQ0A 3FW3A 5FDCA 1CCUA 1OKMA 4ITOA 1TTMA 4FRCA 3DCSA 1G6VA 1YDDA 5SZ4A 4Q8XA 4Z1EA 4IDRX 1CINA 4C3TA 1DCBA 4TWMA 1JCZA 5CLUA 2NMXA 3TVOX 1LZVA 1CIMA 1YDAA 4HF3A 4Q90A 3F7UA 1ZE8A 1CVCA 4KV0A 3T82A 2POWA 5FL6A 3RYXB 4KNMA 4Q08A 3OIMA 4QJ0A 4X5SA 2Q38A 5FLOA 3MNIA 3OIKA 3FFPX 5DSPA 2EU2A 2NWZA 5EH7A 9CA2A 1CNYA 4QK1A 1CCSA 3RYVB 3KS3A 3T83A 3T85A 1ZH9A 3IGPA 5FL5A 5E2RA 5JGTB 3PYKA 1CNWA 1CILA 4QSIA 3IAIA 1UGEA 2NNGA 3S73B 3SAPA 1JV0A 1CAKA 4E3HA 2ABEA 5JEPB 1Z93A 3D93A 2CABA 1LGDA 1TEQX 3RG4A 1IF6A 4BF6A 3S77B 2HL4A 5FLQA 3SBHA 2NXTA 4JSAA 5FNMA 4YXIA 1CA3A 1DMXA 1TG3A 3R16A 3KKXA 2HD6A 3K34A 5FLRA 5L6KA 5E5RA 5A6HA 1CAHA 5JG5B 3S8XA 1I91A 4E5QA 2CBEA 3MYQA 4QK2A 3GZ0A 3DD0A 4JSWA 1TG9A 5EOIA 4YWPA 5BNLA 3M3XA 3K7KA 5FLTA 1BN3A 3KWAA 3RZ5A 1BICA 1OKLA 4YGLA 1BNWA 4MDGA 1AVNA 4KUYA 2W2JA 1TH9A 2NWYA 1CAZA 3M98A 4JS6A 4QJMA 5FLPA 4Q49A 1I9MA 3DC9A 3HKQA 3N4BA 3M40A 1CVDA 4XE1A 4RUXA 1UGCA 5SZ7A 3B1BA 5FNJA 5DSKA 4HT0A 2FOYA 1HVAA 3HLJA 3MWOA 5E28A 2FMZA 3DAZA 1FSQA 1CAJA 3DVDA 3DA2A 3V2JA 5DOHA 1G4JA 4ZWZA 4WW6A 2WD3A 4FVOA 1RZEA 4PYXA 3OKUA 1BV3A 1UGBA 2FOSA 3T5ZA 3JXFA 1J9WA 2POUA 4ZWIA 3OYSA 4XIWA 1OQ5A 3M5SA 4RN4A 1URTA 1RZDA 1BCDA 1LUGA 1TBTX 2H15A 2FW4A 4ETQC 2WD2A 3P44A 3S9TA 2X7TA 3M04A 4Z1NA 3T5UA 2NNVA 2FOUA 4Z1KA 1CZMA 4COQA 1BNUA 3HKTA 3SAXA 4PXXA 1CVFA 4Q8YA 4MTYA 4RIVA 3ML5A 5SZ2A 3BETA 4Z0QA 5JESB 5E2NA 4KAPA 4Q8ZA 5CACA 2OSFA 2CBBA 1CAYA 3KNEA 5SZ1A 5FLSA 3MDZA 3V5GA 1XQ0A 5G01A 1FSNA 3P5LA 3MNAA 3DD8A 3HS4A 3CZVA 3D8WA 5E5UA 1CNXA 1UGFA 3M5EA 4K0TA 2Q1QA 1HECA 1UGAA 4Q7SA 5FNIA 4JSSA 1RJ5A 3V3IB 5J8ZA 1ZSCA 1BNVA 3W6IA 3EFTA 2NN7A 4WW8A 2AX2A 3M2YA 1IF4A 3DCCA 4YGKA 1BNQA 1HEAA 1AM6A 4Q7WA 5EZTX 4Q6EA 4KNJA 4WR7A 1FSRA 1CNJA 2FNMA 5JEGB 3DVCA 3UYQA 5C8IA 5FNHA 3PO6A 1LG6A 2FOQA 5JGSB 12CAA 2ILIA 5AMLA 1CNGA 1KWRA 4PQ7A 3V2MA 5SZ6A 1CNIA 1G53A 1THKA 2FNNA 3HKUA 1MUAA 3RYJB 3NJ9A 3JXHC 4K1QA 4ZAOA 3IBNA 2QO8A 1BNMA 2HOCA 1BNTA 2GD8A 4QY3A 4Q07A 4RUZA 4Q0LA 3MMFA 3ZP9A 4LU3A 4N16A 2NWOA 1I9LA 1EOUA 1UGGA 3CYUA 4TWLA 5EKJA 5E2KA 4XIXA 5BRUA 3MNKA 4Q9YA 3MHLA 3RYZA 1BN1A 1HEDA 1G0EA 3KLDB 3S76A 4QK3A 1KEQA 5EKMA 3IBUA 4G7AA 4G0CA 4ITPA 4PYYA 3RG3A 5E2MA 5EHWA 1HCAA 1FQNA 3P3JA 2HKKA 3IEOA 4Q7PA 4FVNA 5EH5A 1IF9A 4QEFA 3M2ZA 2VVBX 1KOPA 3S97A 1DCAA 2WEJA 4ZWXA 3TVNX 4KUVA 1XEVA 3P3HA 5FL4A 3EFIA 4QSJA 1CNCA 4R59A 3OYQA 2POVA 1G0FA 5DSQA 4K0SA 1TB0X 2AW1A 3MHCA 2CA2A 4Q83A 4CNXA 1ZGEA 1UGDA 4RFCA 1H9QA 1T9NA 4Q09A 3V3HB 2EZ7A 4Q81A 1CA2A 3L14A 4N0XB 4QTLA 4E3DA 4M2RA 4LHIA 3IBLA 4HU1A 4QJWA 4QIZA 3MHMA 3SBIA 3N0NA 1CVHA 4R5AA 1RAYA 4HBAA 5FNLA 3TMJA 5FNGA 3DCWA 3U45X 3U7CA 4CACA 5JQ0A 3M1KA 4LP6A 3HKNA 1HCBA 3U47A 3RZ8A 1RZAA 1CAOA 1ZFQA 3NI5A 4CA2A 1HEBA 3S71B 3T84A 3MNHA 4PZHA 1YO0A 3MZCA 2O4ZA 1FQRA 2HFWA 4KNNA 1LG5A 3R17B 4QSBA 4K13A 1I9QA 2QOAA 3M1JA 4M2VA 4RFDA 1G52A 1RJ6A 3CAJA 4JSZA 1I9NA 2WEOA 4YXOA 3F4XA 1IF8A 3QYKA 4HEYA 3P55A 2CBAA 3BL1A 2VVAX 3IBIA 4M2UA 1G1DA 1FQLA 5DOGA 4KNIA 4L5VA 1Z9YA 5CA2A 2WEHA 2NWPA 1TE3X 3MNUA 4QJPA 2GEHA 3M2XA 1MOOA 4WL4A 3CA2A 4YHAA 1ZFKA 2NN1A 5DRSA 4CNWA 4ZWYA 5JEHB 3RZ7A 3PJJA 5DSNA 2NNOA 5AMGA 3RZ0B 6CA2A 5DSLA 3V3JA 1G46A 4Q87A 3F8EA 2CBCA 4QJOA 3M96A 3V7XA 1G3ZA 3Q31A 4CNRA 3UYNA 2FOVA 2F14A 5SZ0A 3S75B 5FNKA 1I90A 1HUGA 1XPZA 1CVAA 3B4FA 4YX4A 3HFPA 4KP5A 1CNHA 4KUWA 5L3OA 4BCWA 1CRAA 8CA2A 1G54A 4Y0JA 4GL1X 1CNBA 3D0NA 3RJ7A 3C7PA 1OKNA 2NNSA 3DV7A 3DVBA 1DMYA 4QJXA 5DSJA 2OSMA 1ZNCA 3RGEA 3N2PA 7CA2A 1CRMA 3M14A 1JD0A 5JG3B 3JXGA 3MNJA 4L5WA 3D9ZA 2NXSA 3LXEA 1I9PA 4M2WA 3K2FA 2FNKA 4MLXA 4MDLA 3D92A 1BZMA 4HT2A 4QSAA 4XFWA 4YGJA 1FR7A 3F7BA 4FPTA 4ILXA 4XZ5A 1IF7A 3DBUA 2ZNCA 4MDMA 1KOQA 3OKVA 4YVYA 4CNVA 5DSOA 4WUQA 5HPJA 1RZCA 1V9IC 4HEZA 5FDIA 1HUHA 5G03A 4Q6DA 3BL0A 4FL7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5JDV B;  2HNC A;  4L5U A;  4ZX1 A;  4YGN A;  2NXR A;  1G4O A;  5EHV A;  3KOK A;  4BF1 A;  4IWZ A;  1FLJ A;  1Y7W A;  2Q1B A;  1ZSA A;  3M1W A;  2QP6 A;  3U3A X;  1CVB A;  1CNK A;  1XEG A;  3RYY A;  1CVE A;  2CBD A;  3MHO A;  1CAM A;  1RAZ A;  2H4N A;  1YDC A;  5DSR A;  4WUP A;  5IPZ A;  4MLT A;  1H4N A;  5A25 A;  5AMD A;  2X7U A;  4DZ9 A;  5SZ5 A;  3RLD A;  1CAN A;  5EIJ A;  1YDB A;  1H9N A;  3FE4 A;  5EKH A;  5CJF A;  3OY0 A;  1G48 A;  1RZB A;  2IT4 A;  4YXU A;  3S74 B;  1CAI A;  4FU5 A;  1I9O A;  1BN4 A;  4FIK A;  3ML2 A;  4E9O X;  1KWQ A;  5BYI A;  3KOI A;  3OIL A;  5DSM A;  3S78 B;  4E49 A;  5JQT A;  4DZ7 A;  5G0B A;  4QIY A;  4ZX0 A;  1V9E A;  3M67 A;  3N3J A;  1TEU X;  5BRW A;  3P4V A;  3P5A A;  3DC3 A;  4RIU A;  4YGF A;  1AZM A;  1IF5 A;  5DVX A;  5BRV A;  3V3G B;  4Q7V A;  5EHE A;  4E3G A;  1BNN A;  4MO8 A;  1ZSB A;  3W6H A;  4Z1J A;  2X7S A;  5EH8 A;  4Q78 A;  4K0Z A;  3KON A;  1G45 A;  4Q99 A;  3S72 B;  4E3F A;  1CAL A;  1Z97 A;  4HEW A;  5G0C A;  2EU3 A;  2WEG A;  1I8Z A;  1FQM A; 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