5DSMA

Structure of co2 released holo-form of human carbonic anhydrase ii with 25 min warming
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Tracking solvent and protein movement during CO2 release in carbonic anhydrase II crystals
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5dsmA00
5DRSA 3P5AA 2OSFA 5FL4A 5CLUA 3OILA 1UGFA 4TWMA 1FSNA 3U45X 1KOPA 5CACA 4E4AA 1TEUX 3DCCA 4MLTA 5EIJA 4G7AA 3T82A 2QP6A 5CA2A 2FW4A 4RIUA 4IWZA 4ETQC 5DSKA 3PO6A 3DCSA 1FQMA 4YGJA 5EKMA 1A42A 2W2JA 4WL4A 1LUGA 1T9NA 1CCTA 3M2YA 3P3JA 5SZ1A 4K0ZA 1CNBA 2HL4A 4KV0A 2NNOA 3RYVB 4UOVA 1YDBA 5FL5A 1HEBA 5JEHB 2F14A 4Q07A 4HEYA 4HU1A 1TB0X 1URTA 5A25A 1CNGA 4FVOA 4CQ0A 9CA2A 4LP6A 3ML5A 5EHEA 1CVBA 4QEFA 5FNIA 5E2RA 4FPTA 1Z9YA 1XEVA 2POUA 4YX4A 5J8ZA 3OYQA 7CA2A 4YXOA 2NN1A 3HS4A 3CAJA 1G0FA 2POWA 3S73B 1IF7A 3D9ZA 3IBUA 6CA2A 1TH9A 1RZDA 3DC3A 5JGSB 3ZP9A 3DA2A 1BNTA 3N4BA 5DSMA 4E9OX 1G0EA 3OIKA 4QJWA 1BNQA 3DBUA 4LHIA 3FE4A 4E3HA 1BNVA 4XIWA 1FR4A 3S77B 4Q8XA 4YHAA 4MDMA 2ABEA 2CBAA 3BETA 3RJ7A 3M2NA 4M2RA 5DSLA 3ML2A 1DCBA 4Q8YA 1XEGA 3RGEA 3R17B 5DSOA 1DCAA 3S97A 4L5WA 1CIMA 4CNXA 1RJ6A 4Q0LA 1CA2A 2NXSA 3FFPX 4YXUA 1HEAA 4RH2A 4COQA 5FNKA 2X7SA 1THKA 4DZ9A 3T5ZA 5FNLA 3V2JA 1CCSA 3MNJA 4QJ0A 1CANA 4QJOA 1CVCA 4KP8A 4M2UA 1BCDA 1BNWA 1OKLA 1FQLA 3HKUA 4Q99A 4JS6A 5BNLA 1UGDA 3V3FA 2WEGA 5FLOA 4YGLA 3UYNA 5EKHA 3D93A 3N2PA 3EFIA 3KS3A 3RYJB 1ZFKA 2FMZA 1CVDA 3U7CA 1G45A 4K0TA 4Q08A 3MZCA 1CNCA 3DV7A 3RZ5A 3U47A 2VVAX 4JSSA 1RZAA 1YDDA 1ZFQA 4MTYA 5SZ6A 4Q8ZA 4TWLA 2EU2A 1CAZA 1G54A 1H9QA 1JCZA 4KNMA 1ZSCA 4KNIA 2QOAA 4CACA 5SZ5A 5DSPA 4MLXA 3F4XA 5L6KA 2H4NA 3F8EA 3LXEA 2WEJA 4ILXA 3MNIA 5EZTX 1UGEA 2CBDA 1BICA 3M1QA 4PYXA 5JDVB 3T84A 3KKXA 4FIKA 2NN7A 1CALA 3N0NA 5G0BA 2HFWA 4YYTA 3JXFA 3RYZA 5FNMA 4ZWYA 3IAIA 3MHMA 4BF6A 3P3HA 1FR7A 5SZ4A 4KUWA 3DCWA 4Z1JA 4Q6DA 3OY0A 1IF5A 5E2SA 5JEGB 1F2WA 1HUGA 2WD2A 2HNCA 5DSNA 1JD0A 4RUXA 1UGBA 5FLRA 4JSAA 5BRUA 1LZVA 5E2KA 1TBTX 3M1KA 1I90A 3L14A 4RUYA 5JQTA 4ITOA 5EKJA 2Q1QA 1RZBA 1OKMA 1YDCA 3MNHA 2GD8A 3IBIA 3T5UA 3MMFA 4PYYA 4QIZA 3PYKA 1G52A 1DMXA 1G46A 2NXTA 3KOIA 3M1JA 4KNNA 3P55A 5SZ3A 1CRAA 4YVYA 4XE1A 4JSWA 1YDAA 1LGDA 3DVCA 4MDLA 4KUVA 4QK1A 1RJ5A 1CAJA 3IBLA 1XPZA 3M2ZA 1CRMA 4HF3A 4PZHA 1CVHA 5EHVA 2Q38A 4ZWXA 2EZ7A 4ZWZA 3HLJA 3HKQA 3M1WA 1JV0A 5DSQA 3OIMA 5DSJA 3KOKA 4CNVA 2FOQA 3MHLA 3KNEA 3B1BA 4FRCA 3V5GA 1V9IC 3S74B 1RAYA 5DVXA 1OKNA 1AM6A 5BRVA 4RFDA 1IF9A 3C7PA 4QSJA 2X7UA 3MHOA 3S9TA 4E3FA 2FMGA 3D92A 1H9NA 2NWOA 1CNXA 2FOVA 2X7TA 1BV3A 5DOGA 4ZAOA 4Q78A 5E5UA 3U3AX 4ZX1A 4HT0A 3B4FA 4Q7VA 1FQRA 1FSQA 5E2MA 1CVFA 4GL1X 2OSMA 5BYIA 4BCWA 1KWRA 3NI5A 4WR7A 2ILIA 3S78B 1J9WA 1I9PA 3DD8A 3CA2A 5G0CA 5FDCA 5EH8A 3MHIA 5L3OA 3M5SA 4XFWA 3K2FA 4PQ7A 3K7KA 4FL7A 3RG4A 3MNUA 5JESB 1CINA 4HEWA 1H4NA 4HT2A 1CNIA 5CJFA 3S72B 5SZ7A 1CAYA 3MYQA 2NMXA 3R16A 3K34A 3D8WA 2NNSA 3JXGA 2NNGA 2WEOA 4XIXA 1I9MA 4E5QA 3CZVA 4QSBA 5A6HA 1UGGA 4FVNA 1TTMA 1Z97A 5AMGA 3TMJA 1CNJA 1RAZA 2WD3A 4E3DA 2CA2A 1Y7WA 4HEZA 3JXHC 4Q7SA 1Z93A 4Z0QA 1YO1A 3S76A 5C8IA 4WW6A 5DOHA 4CA2A 5E5RA 2CBCA 2FOYA 2CBBA 2QO8A 4K1QA 4M2VA 4Q9YA 4QK2A 3ZNCA 1MUAA 4KAPA 1RZEA 3V7XA 4JSZA 1CAHA 1TG3A 5FDIA 1HEDA 4QK3A 3SAXA 1KEQA 3M5EA 3RZ7A 4QJXA 4YXIA 5IPZA 4MDGA 1MOOA 2CABA 4YWPA 3T85A 1CNHA 3F7UA 2NWZA 4HBAA 1BNUA 3VBDA 3QYKA 4WUQA 3RYYA 2FNNA 3IBNA 3NB5A 5SZ2A 3S75B 4MO8A 4L5VA 3IGPA 3M3XA 1EOUA 1UGCA 1IF4A 2HOCA 5EH7A 4Z1NA 1CNYA 3FW3A 1CVAA 3S71B 4KUYA 3IEOA 2FOSA 5JG5B 1CZMA 1OQ5A 3N3JA 5EH5A 5EOIA 3D0NA 5DSIA 3BL0A 1DMYA 3OKVA 4YGFA 1ZSBA 4Q49A 5E28A 5SZ0A 4M2WA 3V3HB 3M67A 12CAA 1G48A 4ZWIA 3P44A 3M04A 1IF6A 5FNGA 3W6HA 1AVNA 5E2NA 3M5TA 4QJPA 1BNMA 3DVDA 4Q90A 1CAOA 1CAMA 3CYUA 2Q1BA 3HKNA 1CAIA 4E49A 1YO0A 1FLJA 3RZ0B 5DSRA 8CA2A 2VVBX 1I9LA 3KIGA 3DD0A 4Q87A 1I9QA 1ZE8A 1AZMA 3P4VA 2O4ZA 4C3TA 1I9NA 1BN4A 1RZCA 2HD6A 3MDZA 5FL6A 1FSRA 4Q09A 1G3ZA 4Q6EA 5JQ0A 4R5AA 4X5SA 3S8XA 3NJ9A 3F7BA 4Q81A 4Q83A 4Z1EA 4Q7PA 4QIYA 1G1DA 4CNRA 3M40A 1HUHA 2WEHA 1CA3A 4BF1A 4R5BA 4KNJA 4PXXA 4DZ7A 2FNKA 3V2MA 3SBHA 3MNKA 1G4OA 2HKKA 5FNJA 3RLDA 4YGNA 3KWAA 3P58A 1FQNA 1G6VA 5JG3B 4N16A 2NXRA 2GEHA 1BN1A 1CILA 3BL1A 3SBIA 1IF8A 4RN4A 4E3GA 2AX2A 3GZ0A 1V9EA 4FU5A 1CNKA 3HKTA 4RIVA 5FNHA 1BZMA 1ZSAA 3V3IB 2CBEA 2H15A 3M98A 5JGTB 1UGAA 1TG9A 3RYXB 3M14A 5JEPB 3M96A 4WUPA 1G53A 4N0XB 3SAPA 2FNMA 3OKUA 4IDRX 5G01A 3RG3A 3P5LA 1KWQA 4KP5A 1G4JA 1BN3A 5HPJA 4QY3A 4LU3A 5AMLA 5FLPA 4ZX0A 5LMDA 3MHCA 4G0CA 4WW8A 1I9OA 1LG5A 4R59A 3M2XA 5FLSA 4Q7WA 3RZ1B 1HECA 4Q06A 5G03A 3RZ8A 2IT4A 3TVOX 3TVNX 4QJMA 3PJJA 1HCAA 3V3JA 3V3GB 3MWOA 4QSAA 4QTLA 1CAKA 2AW1A 5BRWA 3KONA 3DAZA 3DVBA 3UYQA 1HCBA 1ZGEA 3Q31A 2NNVA 1BNNA 1CNWA 1TE3X 2NWPA 1HVAA 1ZGFA 2POVA 3EFTA 3OYSA 4L5UA 4K0SA 4YGKA 1TEQX 1CVEA 4Y0JA 3W6IA 1LG6A 1ZNCA 4XZ5A 4CNWA 4ITPA 2NWYA 1CCUA 4RUZA 3HFPA 5EHWA 5FLTA 1ZH9A 3KLDB 4Z1KA 2FOUA 5AMDA 4RFCA 1YO2A 1KOQA 3MNAA 4QSIA 2EU3A 3DC9A 1I8ZA 4K13A 3T83A 2ZNCA 1XQ0A 5FLQA 1I91A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5DRS A;  3P5A A;  2OSF A;  5FL4 A;  5CLU A;  3OIL A;  1UGF A;  4TWM A;  1FSN A;  3U45 X;  1KOP A;  5CAC A;  4E4A A;  1TEU X;  3DCC A;  4MLT A;  5EIJ A;  4G7A A;  3T82 A;  2QP6 A;  5CA2 A;  2FW4 A;  4RIU A;  4IWZ A;  4ETQ C;  5DSK A;  3PO6 A;  3DCS A;  1FQM A;  4YGJ A;  5EKM A;  1A42 A;  2W2J A;  4WL4 A;  1LUG A;  1T9N A;  1CCT A;  3M2Y A;  3P3J A;  5SZ1 A;  4K0Z A;  1CNB A;  2HL4 A;  4KV0 A;  2NNO A;  3RYV B;  4UOV A;  1YDB A;  5FL5 A;  1HEB A;  5JEH B;  2F14 A;  4Q07 A;  4HEY A;  4HU1 A;  1TB0 X;  1URT A;  5A25 A;  1CNG A;  4FVO A;  4CQ0 A;  9CA2 A;  4LP6 A;  3ML5 A;  5EHE A;  1CVB A;  4QEF A;  5FNI A;  5E2R A;  4FPT A;  1Z9Y A;  1XEV A;  2POU A;  4YX4 A;  5J8Z A;  3OYQ A;  7CA2 A;  4YXO A;  2NN1 A;  3HS4 A;  3CAJ A;  1G0F A;  2POW A;  3S73 B;  1IF7 A;  3D9Z A;  3IBU A;  6CA2 A;  1TH9 A;  1RZD A;  3DC3 A;  5JGS B;  3ZP9 A;  3DA2 A;  1BNT A;  3N4B A;  5DSM A;  4E9O X;  1G0E A;  3OIK A;  4QJW A;  1BNQ A;  3DBU A;  4LHI A;  3FE4 A;  4E3H A;  1BNV A;  4XIW A;  1FR4 A;  3S77 B;  4Q8X A;  4YHA A; 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