5DSPA

Structure of co2 released apo-form of human carbonic anhydrase ii with 40 sec warming
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Tracking solvent and protein movement during CO2 release in carbonic anhydrase II crystals
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5dspA00
3FFPX 4QSJA 1EOUA 1CNWA 5EKJA 2AW1A 3RZ1B 3DD0A 5E2MA 1OKNA 5FDIA 1ZNCA 4ITOA 5E28A 3S72B 4Q49A 5FLSA 1RAYA 1DCBA 4Q9YA 4CQ0A 4FPTA 3V2MA 1G54A 5JG5B 5FNGA 1CAJA 1G45A 3RGEA 5DSNA 3PO6A 5FNMA 3MNKA 4IDRX 3QYKA 1BCDA 1TG3A 1FQLA 2WD3A 1CZMA 1CCUA 3DA2A 2Q1QA 4FVOA 4QJMA 1HCBA 1OKLA 4E3DA 5EZTX 4QJPA 1JV0A 4JSWA 4JS6A 5JEPB 4E49A 4HF3A 3BL1A 1G52A 4WUQA 5FLPA 3S71B 3M1KA 3P5LA 1I8ZA 1ZSAA 4R5BA 5CACA 1DMYA 1CVHA 3U45X 3N3JA 3RZ8A 4CNWA 2CBBA 2NWOA 3V5GA 3T5ZA 4XIWA 4BCWA 5E2NA 4KUVA 1CALA 1BV3A 1RZCA 1ZE8A 2GEHA 1A42A 1CA3A 1CAMA 2FNMA 5DOGA 1CCSA 3D8WA 1XQ0A 6CA2A 2VVBX 3MYQA 1THKA 3TMJA 1ZSBA 4Z0QA 3MNHA 2NWYA 5FNIA 3K7KA 4TWLA 1TG9A 1UGAA 4QSBA 1BZMA 1UGGA 4Q0LA 5JEHB 3MHLA 5BYIA 3M40A 5BRVA 2HKKA 2FMZA 2POVA 1IF5A 4BF6A 2NNSA 1BN3A 4CNVA 4MLTA 2FNNA 3RZ7A 1HEDA 1Y7WA 2X7TA 1IF8A 3JXFA 3M14A 4HEZA 4PZHA 4CNRA 3KLDB 2FMGA 4N0XB 4YGNA 1KEQA 2O4ZA 2NWPA 4G0CA 3KNEA 3P3HA 1CNHA 2NMXA 4QIZA 3F4XA 3JXGA 4KUYA 2FOUA 1G3ZA 2H15A 1G0FA 3IBLA 1HCAA 3ML2A 5SZ5A 1BNNA 4CA2A 3MNAA 4KP5A 1FSRA 3DCWA 1CVEA 2OSFA 3OYQA 4LHIA 4Q6EA 3MNUA 5L3OA 3M5SA 3RZ5A 8CA2A 4Q09A 1IF7A 1UGEA 4FRCA 3RLDA 4QSIA 3MHIA 3M1JA 2X7SA 4QTLA 4M2WA 1OKMA 1CINA 4R59A 3TVNX 5DSKA 4YXOA 4Z1KA 3M2XA 5DOHA 4RN4A 1G46A 4E9OX 2NWZA 1FR4A 3MHMA 2Q38A 1HVAA 5EH5A 1TEUX 4KNMA 1JCZA 5FLRA 1ZH9A 2WEHA 3M5TA 4WW6A 3S73B 2EU3A 3IEOA 3JXHC 1CAHA 2VVAX 1CVFA 4HU1A 3V3HB 3DC9A 3HKTA 3Q31A 5CA2A 5G01A 4Z1NA 3V3IB 3UYNA 1XEVA 3LXEA 5DSMA 4RUXA 5C8IA 3MDZA 1YDCA 5EOIA 3D9ZA 4YXUA 1T9NA 3EFIA 1BICA 3M1WA 1LUGA 3M98A 3IBIA 2H4NA 4KP8A 4Q8YA 1CNYA 1IF4A 1UGFA 4WR7A 4KNNA 5EKMA 3L14A 5FL6A 3S78B 3DVBA 3RJ7A 2CABA 5JESB 3RZ0B 5DSRA 3N0NA 4QJWA 1F2WA 1BNUA 3KWAA 3T84A 1G4OA 2ILIA 3K34A 1YDBA 3BL0A 5JGSB 3N4BA 1ZFQA 1G1DA 4R5AA 2FW4A 1CNKA 1YO1A 1Z9YA 4ETQC 3MNJA 1RZBA 3P3JA 2NN7A 2FNKA 2HOCA 4QSAA 3MWOA 1CNIA 5DSIA 2NXSA 2NXRA 2NNVA 4ILXA 5L6KA 1Z93A 1BN1A 3V3JA 1ZSCA 3KKXA 1I9PA 3S74B 1KOPA 3OKVA 1URTA 4LP6A 3W6IA 4MDMA 3CYUA 4PXXA 4ZWZA 2QO8A 4YGJA 9CA2A 3TVOX 4RFCA 3CAJA 1CAIA 1G0EA 4YGFA 3DCCA 3DC3A 1KOQA 4FVNA 1BN4A 5BRUA 3NI5A 4X5SA 5FNKA 4M2VA 5CJFA 3KOKA 5DSQA 2POWA 3KOIA 4XZ5A 2OSMA 1AVNA 3RYZA 4XIXA 2AX2A 4MDLA 1MUAA 1HECA 4Q78A 3MHCA 1I9LA 1TB0X 3SBHA 3ZP9A 3P58A 2NN1A 1CNJA 4Q8XA 1HUHA 3DCSA 4QJ0A 3P55A 4GL1X 3M96A 3ZNCA 3KIGA 4MLXA 5DVXA 4K0ZA 1ZGEA 3B4FA 4RH2A 2WEGA 4Q7PA 4RIUA 4DZ7A 3S9TA 4Q07A 5EHVA 3MZCA 5FLTA 1V9IC 4Q6DA 5LMDA 4QY3A 4YGKA 1Z97A 3T5UA 3HKNA 4Q99A 1RJ6A 1TTMA 2CA2A 1UGBA 1DCAA 4M2RA 4QK3A 3M2YA 2EU2A 1H9QA 1CNCA 1CVCA 1ZGFA 1RZAA 3S75B 1TH9A 4E4AA 1CILA 4Q81A 3RG3A 5G03A 5FL4A 1CVAA 1FQMA 5DSPA 2W2JA 2F14A 4JSAA 3DAZA 2QOAA 4Q90A 1CRMA 1FQNA 1TE3X 3RYVB 1I9QA 3M2ZA 2FOQA 3MNIA 3P4VA 4ZWXA 5G0CA 1YO2A 1AZMA 2FOVA 4E3FA 5IPZA 3K2FA 1CAYA 4K13A 5EHWA 3RG4A 1CANA 3B1BA 2HD6A 5EIJA 1I91A 5J8ZA 4QIYA 4Q7VA 1HEBA 5JDVB 4G7AA 3OILA 5SZ0A 3KS3A 4KNJA 3IAIA 5BRWA 2NNGA 4KAPA 1KWRA 2CBDA 4YWPA 3M5EA 1CAKA 3CZVA 1CAOA 1UGDA 5E5UA 5FL5A 2POUA 3SBIA 2CBAA 5E5RA 1I9NA 4FL7A 1ZFKA 4PQ7A 2HFWA 4Q7WA 3V3FA 1V9EA 3F7BA 1LZVA 3IBUA 4KUWA 4XE1A 2NXTA 7CA2A 2EZ7A 4WL4A 1KWQA 2CBEA 4ZX0A 2WD2A 2HNCA 3SAPA 1IF6A 1FQRA 5AMGA 3S77B 4YGLA 1H9NA 2WEJA 5CLUA 1HUGA 5JQ0A 4FU5A 3T83A 5FNJA 3SAXA 1RJ5A 5EH8A 4BF1A 1AM6A 5A25A 1OQ5A 3CA2A 1G4JA 1RZDA 1CCTA 4TWMA 3EFTA 1YDDA 1HEAA 3D92A 4L5WA 4Q06A 3DV7A 1CRAA 3ML5A 4E5QA 5JQTA 3IGPA 5E2KA 1FSNA 4ZX1A 3HKUA 4K1QA 5DRSA 5AMLA 1RZEA 5A6HA 3RYJB 1FSQA 1CVDA 4Z1EA 1BNWA 4L5UA 4N16A 3M3XA 3KONA 1XEGA 2QP6A 1TEQX 4KNIA 4XFWA 5DSLA 4JSSA 4Q7SA 1FLJA 4RIVA 5SZ4A 1BNVA 1CA2A 1BNMA 4COQA 4HBAA 5EHEA 1G6VA 3HLJA 3M2NA 4ZWYA 5E2RA 1MOOA 1TBTX 2NNOA 4Q83A 2WEOA 5SZ3A 1YDAA 2X7UA 4HEYA 3P44A 4MTYA 4QJXA 4RUZA 3OY0A 5BNLA 3VBDA 4FIKA 3C7PA 4MO8A 3U3AX 4HEWA 3MHOA 1I90A 5JGTB 4E3HA 1IF9A 3PJJA 5EH7A 5SZ6A 5E2SA 3U7CA 1RAZA 3V2JA 4CACA 1I9MA 1FR7A 4RUYA 3DD8A 5FLQA 3S76A 4YXIA 3IBNA 1BNQA 3T82A 2FOSA 12CAA 5HPJA 1LG5A 4WW8A 3RYYA 2Q1BA 3MMFA 3S97A 3W6HA 3P5AA 1CAZA 4M2UA 2FOYA 4Q08A 5SZ1A 5FDCA 4RFDA 3DVCA 4MDGA 4K0TA 4PYXA 3DBUA 5FNHA 1BNTA 3HS4A 5FLOA 1I9OA 5SZ7A 5DSJA 5FNLA 1H4NA 1DMXA 4ZWIA 3M1QA 3GZ0A 3HFPA 3PYKA 2ZNCA 1XPZA 4Z1JA 4QJOA 1CIMA 3R17B 4HT0A 4PYYA 1LG6A 2CBCA 4CNXA 1G53A 2ABEA 2GD8A 1YO0A 4DZ9A 2IT4A 3R16A 3RYXB 3FW3A 4L5VA 1CVBA 3F7UA 1JD0A 3V3GB 3UYQA 3U47A 3D93A 1G48A 2HL4A 4Y0JA 3D0NA 4YX4A 5G0BA 3OIKA 3NB5A 1CNBA 4Q8ZA 5DSOA 3NJ9A 1LGDA 4IWZA 3V7XA 4LU3A 4QK1A 3T85A 4ITPA 4UOVA 3DVDA 3F8EA 5AMDA 4K0SA 3M67A 5EKHA 4YHAA 4Q87A 1CNXA 4C3TA 4YYTA 1CNGA 5SZ2A 3OYSA 3OKUA 4JSZA 4WUPA 4QK2A 3BETA 1UGCA 5JG3B 3HKQA 4HT2A 3S8XA 4E3GA 5JEGB 3FE4A 4KV0A 4YVYA 4ZAOA 3OIMA 1J9WA 3M04A 3N2PA 4QEFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FFP X;  4QSJ A;  1EOU A;  1CNW A;  5EKJ A;  2AW1 A;  3RZ1 B;  3DD0 A;  5E2M A;  1OKN A;  5FDI A;  1ZNC A;  4ITO A;  5E28 A;  3S72 B;  4Q49 A;  5FLS A;  1RAY A;  1DCB A;  4Q9Y A;  4CQ0 A;  4FPT A;  3V2M A;  1G54 A;  5JG5 B;  5FNG A;  1CAJ A;  1G45 A;  3RGE A;  5DSN A;  3PO6 A;  5FNM A;  3MNK A;  4IDR X;  3QYK A;  1BCD A;  1TG3 A;  1FQL A;  2WD3 A;  1CZM A;  1CCU A;  3DA2 A;  2Q1Q A;  4FVO A;  4QJM A;  1HCB A;  1OKL A;  4E3D A;  5EZT X;  4QJP A;  1JV0 A;  4JSW A;  4JS6 A;  5JEP B;  4E49 A;  4HF3 A;  3BL1 A;  1G52 A;  4WUQ A;  5FLP A;  3S71 B;  3M1K A;  3P5L A;  1I8Z A;  1ZSA A;  4R5B A;  5CAC A;  1DMY A;  1CVH A;  3U45 X;  3N3J A;  3RZ8 A;  4CNW A;  2CBB A;  2NWO A;  3V5G A;  3T5Z A;  4XIW A;  4BCW A;  5E2N A;  4KUV A;  1CAL A;  1BV3 A;  1RZC A;  1ZE8 A;  2GEH A;  1A42 A;  1CA3 A;  1CAM A;  2FNM A;  5DOG A;  1CCS A;  3D8W A;  1XQ0 A;  6CA2 A;  2VVB X;  3MYQ A;  1THK A;  3TMJ A;  1ZSB A;  4Z0Q A;  3MNH A;  2NWY A;  5FNI A;  3K7K A;  4TWL A;  1TG9 A;  1UGA A;  4QSB A;  1BZM A;  1UGG A;  4Q0L A; 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