5DSRA

Structure of co2 released apo-form of human carbonic anhydrase ii with 10 min warming
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Tracking solvent and protein movement during CO2 release in carbonic anhydrase II crystals
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5dsrA00
3D0NA 4KV0A 1IF9A 4HU1A 1CAYA 4R5BA 1FQLA 5DSJA 5SZ5A 1YO1A 9CA2A 5DSKA 5SZ1A 4RUYA 3V3JA 3M1JA 4RFDA 5JG5B 1CNKA 1HECA 1HUHA 4QJXA 1DCBA 1Y7WA 4MTYA 3T82A 4YYTA 5FNIA 4RUXA 4JSWA 4YVYA 2FOSA 1CA3A 4CA2A 4Q6DA 1I9LA 1CNBA 1T9NA 5EHVA 3IBLA 4HEWA 4QSJA 2NN7A 1G6VA 3F7BA 3HLJA 3RYVB 1KWRA 1TB0X 3RGEA 2NWZA 4UOVA 1KEQA 8CA2A 1MOOA 3JXFA 4K0TA 3OYQA 3M2XA 3MHLA 4Q09A 4QJPA 3D93A 5DSRA 3S9TA 1DMYA 3ML5A 1XQ0A 2X7UA 4YGFA 4FU5A 3N4BA 5DSIA 2X7TA 1OKMA 3S77B 5FNLA 5AMLA 4PXXA 4Z1NA 3IBNA 3DC9A 1I91A 4YGLA 3S8XA 4FVOA 3M98A 4M2RA 1BCDA 4WUQA 3L14A 1OKLA 4KUYA 4YXUA 1RZEA 4Z0QA 2FMZA 1BNWA 1RZDA 3FE4A 3V3GB 1IF6A 2CBEA 3ZNCA 6CA2A 1G48A 3P3JA 4KNIA 1CCUA 3KIGA 5E2NA 2FNKA 4YGNA 1KWQA 4Q0LA 4RIUA 4Q78A 3MWOA 4WW6A 4KNMA 3QYKA 2NXRA 4YGKA 3M1KA 1G3ZA 4JSSA 3BL1A 1IF8A 1RZCA 1YDBA 3KWAA 4FL7A 1J9WA 1BICA 4BF6A 5E2KA 4Z1EA 4QJWA 3P5LA 3T5UA 1G52A 3DVBA 2NXSA 3IEOA 1ZGFA 4L5VA 5JEHB 4TWLA 1V9IC 2CA2A 3TVOX 3NJ9A 5A6HA 5EHEA 2AW1A 1HVAA 3DCSA 3P58A 2VVAX 4HEYA 4KUVA 3RZ0B 2CBAA 3N3JA 3P4VA 3RZ8A 3HKUA 3S73B 4PZHA 4FVNA 1UGDA 1CVEA 1TG3A 4RFCA 3MDZA 4RH2A 4E4AA 1ZFKA 3M5TA 5CJFA 5FNMA 5AMGA 1G45A 4MDGA 3CYUA 1TBTX 3MNUA 4FPTA 4CACA 4BCWA 2WEHA 3M14A 5SZ2A 2ABEA 1H9QA 3DVDA 4WR7A 4CNRA 1YDDA 4L5WA 3DV7A 4ITPA 2HOCA 3M2ZA 4Q08A 2NXTA 1CAZA 5BYIA 4PYYA 1CVFA 1BNNA 4COQA 1TH9A 1XEGA 2HD6A 5L3OA 3K7KA 4RUZA 5FDIA 3N0NA 1HEBA 3RZ5A 3V3FA 4DZ7A 5CA2A 4E3GA 5AMDA 1THKA 1RZBA 1I9NA 2NMXA 3CA2A 2EU2A 4WUPA 3IAIA 1G0EA 1IF5A 1FR7A 1G1DA 1ZSCA 4R5AA 4WL4A 2FNMA 4QSAA 4X5SA 4Q7WA 12CAA 3RYYA 1ZFQA 3B1BA 3F7UA 3JXHC 3KOIA 1CAKA 2O4ZA 3IGPA 3M96A 1CAHA 4Q07A 1RJ5A 3U47A 1CNYA 5CACA 3KONA 3U3AX 3HKNA 1CAIA 5EH5A 3RG3A 3HKQA 3KKXA 4K0SA 1G0FA 4Q06A 4ZX1A 3RJ7A 4YX4A 3M67A 5DVXA 3DD0A 2H4NA 3P55A 4QSBA 3OYSA 3MZCA 1I9PA 1BNMA 1Z93A 2X7SA 1CAJA 2EU3A 4Q90A 4QSIA 1A42A 1CNIA 4JSZA 3NB5A 4XFWA 5JQ0A 1ZH9A 3OY0A 1RAYA 4JS6A 4LU3A 1UGBA 1FQNA 4RIVA 2NNSA 3HFPA 5EH8A 4Z1KA 3V3IB 1FSQA 5EKHA 1DMXA 4YHAA 1AVNA 4FRCA 1Z97A 3DD8A 4FIKA 1H9NA 3OKVA 3KNEA 4ETQC 4IDRX 3UYQA 4KP8A 5EIJA 4K0ZA 2OSFA 4Q8XA 4QK1A 5DSMA 4CNWA 3SAXA 4E3DA 5EZTX 4IWZA 4K13A 1YDAA 1UGFA 1FR4A 5DOHA 5FL4A 4LHIA 2NWYA 5G03A 3MNHA 3MNKA 3F8EA 5JEGB 1CRAA 1I90A 2HKKA 3DCCA 4Q7PA 5BRVA 1I8ZA 1ZSBA 5E5UA 5EOIA 4PYXA 4CNXA 1CCTA 3OKUA 5JG3B 1CNHA 3MNAA 2HL4A 5J8ZA 3PYKA 4XZ5A 4G7AA 4YWPA 3MHOA 2FNNA 1CAMA 3M5SA 5FLTA 5EKJA 3P3HA 4YXIA 2F14A 3S76A 1CA2A 2FW4A 3GZ0A 3MNIA 3TMJA 1CVCA 1ZSAA 5DOGA 1ZNCA 1YO2A 1I9MA 2ZNCA 4Y0JA 3RZ1B 3BL0A 1H4NA 5EH7A 3M04A 3W6IA 1V9EA 5DSOA 4Z1JA 4Q81A 3W6HA 1CINA 4XE1A 3T85A 3V2JA 2QO8A 4ZWZA 5FL6A 4E9OX 3OILA 3R16A 1LZVA 1CNWA 1FQMA 3MHMA 3OIKA 4QEFA 2NNGA 4Q87A 2NNOA 1CALA 3R17B 3MHIA 1UGAA 4BF1A 4E3FA 5FLPA 3S78B 4GL1X 4RN4A 2WEOA 4KNNA 3S71B 2FMGA 3IBIA 4XIXA 4L5UA 1HUGA 1OQ5A 5JDVB 2FOVA 3RYJB 4ZX0A 2NN1A 4Q9YA 4QIYA 1CZMA 2GEHA 1CANA 5E2MA 5FLSA 5E2RA 4CQ0A 2CBCA 3MYQA 4QJ0A 5FNGA 5G01A 4QK3A 1BZMA 1YO0A 1FLJA 5HPJA 2IT4A 5JEPB 2FOQA 3F4XA 1XEVA 2CBBA 3KLDB 1TTMA 3Q31A 1UGCA 2FOUA 5IPZA 3DVCA 1G4JA 3N2PA 3DAZA 4QK2A 2VVBX 3TVNX 3M2NA 1KOQA 4Q7VA 3RYZA 1HEDA 1CNGA 4M2UA 3SBHA 3M40A 1BNQA 4M2VA 5FDCA 2OSMA 5EKMA 1XPZA 1BNUA 2NWPA 3BETA 4Q8ZA 4MLXA 3EFIA 1BNTA 1Z9YA 1HEAA 4R59A 4QJOA 5SZ7A 4TWMA 3K34A 4Q83A 4MDLA 1CVDA 5JESB 5L6KA 1G54A 1UGEA 3D92A 5SZ0A 3PJJA 1FSNA 3U7CA 1RJ6A 1CNCA 5LMDA 3S74B 5BNLA 1TG9A 4Q8YA 1CVAA 5DSNA 2WEGA 1UGGA 3M1WA 1RAZA 1G4OA 3EFTA 3ML2A 3DA2A 3K2FA 5EHWA 4HF3A 4G0CA 4JSAA 5C8IA 4HBAA 5JQTA 2GD8A 2WD3A 3NI5A 3FW3A 2HFWA 3T5ZA 1CCSA 2Q1BA 2NNVA 2AX2A 3DC3A 1IF7A 1HCBA 3P5AA 1LG6A 4QTLA 3M5EA 3DBUA 3RZ7A 1TEUX 1LGDA 2W2JA 1LG5A 4Q99A 4ITOA 1CILA 4LP6A 2POVA 1CNJA 3DCWA 3HKTA 5A25A 4KAPA 3M2YA 3OIMA 3RG4A 2CBDA 1AM6A 1BNVA 5JGTB 1AZMA 5JGSB 3UYNA 1TE3X 3V3HB 4ZWXA 1LUGA 5E28A 4WW8A 1IF4A 4YGJA 2WEJA 4KNJA 3FFPX 4Q7SA 3D8WA 4YXOA 1CIMA 5BRWA 1ZE8A 3SAPA 1URTA 3JXGA 3SBIA 4K1QA 3CZVA 3PO6A 3T84A 4QY3A 3MHCA 5FNJA 4M2WA 1BV3A 5CLUA 2Q38A 1JCZA 1CRMA 2FOYA 3B4FA 5FNHA 4XIWA 3V7XA 4E3HA 1MUAA 1CAOA 1G46A 5DRSA 4C3TA 2Q1QA 4ZWYA 3P44A 3MNJA 4HT2A 5DSQA 4QIZA 5FLOA 3LXEA 5DSPA 2HNCA 3S75B 3V2MA 4KP5A 3S72B 4Q6EA 5BRUA 5SZ3A 1KOPA 4MO8A 5DSLA 3T83A 5G0CA 1G53A 1YDCA 2EZ7A 3D9ZA 3S97A 1CVHA 2WD2A 4KUWA 1BN4A 3M3XA 4N16A 4PQ7A 5FLQA 1I9QA 3U45X 1CVBA 7CA2A 1BN1A 1DCAA 3IBUA 1OKNA 1JD0A 3M1QA 3RYXB 2ILIA 1F2WA 4HT0A 3VBDA 2QP6A 1BN3A 4N0XB 3ZP9A 5E2SA 1CNXA 3KOKA 3MMFA 2H15A 2QOAA 3RLDA 1ZGEA 3KS3A 1FSRA 1RZAA 1TEQX 1JV0A 2POWA 5FL5A 4E5QA 4QJMA 3HS4A 4ZWIA 4DZ9A 1I9OA 5E5RA 1EOUA 4E49A 2POUA 4HEZA 4ILXA 1FQRA 5G0BA 4Q49A 5FNKA 3CAJA 4CNVA 5FLRA 3V5GA 3C7PA 4ZAOA 5SZ4A 2CABA 5SZ6A 2NWOA 4MDMA 4MLTA 1HCAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3D0N A;  4KV0 A;  1IF9 A;  4HU1 A;  1CAY A;  4R5B A;  1FQL A;  5DSJ A;  5SZ5 A;  1YO1 A;  9CA2 A;  5DSK A;  5SZ1 A;  4RUY A;  3V3J A;  3M1J A;  4RFD A;  5JG5 B;  1CNK A;  1HEC A;  1HUH A;  4QJX A;  1DCB A;  1Y7W A;  4MTY A;  3T82 A;  4YYT A;  5FNI A;  4RUX A;  4JSW A;  4YVY A;  2FOS A;  1CA3 A;  4CA2 A;  4Q6D A;  1I9L A;  1CNB A;  1T9N A;  5EHV A;  3IBL A;  4HEW A;  4QSJ A;  2NN7 A;  1G6V A;  3F7B A;  3HLJ A;  3RYV B;  1KWR A;  1TB0 X;  3RGE A;  2NWZ A;  4UOV A;  1KEQ A;  8CA2 A;  1MOO A;  3JXF A;  4K0T A;  3OYQ A;  3M2X A;  3MHL A;  4Q09 A;  4QJP A;  3D93 A;  5DSR A;  3S9T A;  1DMY A;  3ML5 A;  1XQ0 A;  2X7U A;  4YGF A;  4FU5 A;  3N4B A;  5DSI A;  2X7T A;  1OKM A;  3S77 B;  5FNL A;  5AML A;  4PXX A;  4Z1N A;  3IBN A;  3DC9 A;  1I91 A;  4YGL A;  3S8X A;  4FVO A;  3M98 A;  4M2R A;  1BCD A;  4WUQ A;  3L14 A;  1OKL A;  4KUY A;  4YXU A;  1RZE A;  4Z0Q A;  2FMZ A;  1BNW A;  1RZD A;  3FE4 A;  3V3G B;  1IF6 A;  2CBE A;  3ZNC A;  6CA2 A;  1G48 A;  3P3J A;  4KNI A;  1CCU A;  3KIG A;  5E2N A;  2FNK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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