5E2MA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme i with 3-(cyclooctylamino)-2,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)sulfonyl]benzenesulfonamide
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
total genus 76
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2mA00
4M2RA 4CA2A 1LUGA 3F4XA 3M40A 1HUGA 1FLJA 4Y0JA 5DSQA 4JS6A 1G0EA 3CYUA 4YYTA 5JEGB 1XQ0A 4ZWXA 4XZ5A 1CAOA 1UGAA 4HEZA 1ZSBA 3DA2A 4Q09A 4RIUA 3MHLA 5AMDA 1UGEA 2OSMA 3OIMA 1RJ6A 4K0SA 4COQA 3SBIA 5FNIA 1CCUA 4E4AA 3S72B 1RAYA 1Z97A 2QO8A 6CA2A 2FNMA 3PYKA 2F14A 5HPJA 1CNWA 4Q90A 1TE3X 1CAJA 1CVHA 4QJWA 5EOIA 3CAJA 4QJPA 1CCSA 3V5GA 1FSQA 3T84A 2FOVA 4FPTA 5SZ0A 2CA2A 3N2PA 3S77B 1YDCA 3VBDA 5E5UA 3MHMA 2GD8A 2NNVA 1YDAA 4FVNA 3M1JA 4GL1X 3SBHA 4E3HA 3M04A 3OYSA 4KNNA 1HCAA 3HKUA 1AVNA 4ITOA 1BNVA 3P5AA 3BL1A 3HS4A 4KAPA 4BF1A 7CA2A 1KWQA 4G0CA 2CBCA 2QP6A 4PQ7A 3U45X 2FOUA 1FQMA 1BN4A 5G03A 5DOHA 3M98A 1G0FA 1HVAA 4KNIA 1UGDA 1I9OA 4MDMA 4YGKA 4MTYA 5JGSB 3W6HA 3R16A 5FLRA 1XPZA 3FW3A 4QSJA 4X5SA 3V3JA 3B1BA 3NI5A 3U3AX 3U7CA 2NXRA 1CA3A 2WEGA 3RZ5A 5SZ7A 5FNJA 2NN1A 1CAHA 3RLDA 3K34A 1CRMA 3CA2A 5EHVA 3S78B 3MNKA 4K0TA 3F7UA 2CBBA 3DVCA 4RFCA 3CZVA 8CA2A 3D9ZA 3DAZA 1G48A 1F2WA 5FNMA 5DRSA 4WUQA 3S8XA 1ZNCA 4FIKA 4MDLA 3HFPA 3P5LA 5A25A 1MOOA 3KNEA 5FLSA 3K7KA 4WUPA 3OYQA 4Z0QA 3W6IA 5JG3B 1YDDA 3RYXB 2NMXA 5JQTA 3HLJA 9CA2A 1BN3A 1FSNA 3IBLA 2POVA 3ZNCA 4E9OX 3JXFA 4BCWA 3P3JA 1HEBA 3SAPA 5FNLA 1CZMA 1LG5A 4XE1A 1YO2A 3MNJA 1Z93A 5LMDA 1ZGEA 1CRAA 4Z1KA 5FDIA 1RZBA 3D0NA 4CNXA 4QJXA 4XIWA 4CNVA 4Q7WA 2FOYA 4KUVA 4FU5A 4FVOA 4HEYA 3RZ8A 3M14A 4MLXA 4Q7VA 3RG4A 2FOQA 1OKLA 3HKTA 3UYNA 1HEDA 4R5BA 4ZAOA 4E49A 3F8EA 4Q83A 4QK1A 3DCWA 4BF6A 5JQ0A 5E2NA 3T83A 5FDCA 2Q1QA 1CINA 3DBUA 2NNOA 3F7BA 4DZ7A 1H9NA 3OILA 1YO1A 4RUYA 1BCDA 4UOVA 4XIXA 2VVAX 1TB0X 1TG3A 4M2WA 4WW6A 4Q8YA 4HBAA 4QSBA 4Q06A 3MHIA 3NB5A 4QJ0A 3V3FA 5CJFA 3V3HB 1CVAA 3N4BA 4MDGA 4Q78A 1G53A 3HKNA 4WW8A 4QJMA 4Z1NA 4YWPA 1BNMA 5EH7A 3KS3A 1IF6A 1Y7WA 1UGFA 2EZ7A 2CBDA 3DD0A 3OY0A 1IF7A 2NWZA 4YVYA 5JESB 2HKKA 5JEHB 4KP8A 2W2JA 2H4NA 1G6VA 1H9QA 1CNCA 1OKNA 2EU2A 4Q87A 3MNHA 4Q8XA 1G4JA 4XFWA 5BRWA 1CNHA 4CNRA 1UGGA 1JCZA 4YHAA 5DSPA 2NN7A 2ILIA 5EHWA 3RG3A 4E3DA 1TG9A 1BNTA 1HUHA 1JV0A 1I9PA 3M2ZA 5SZ2A 5BRVA 1CNXA 3S74B 1LZVA 3M2XA 3RYZA 1ZSAA 3ML2A 5BYIA 3T85A 2O4ZA 4Q9YA 4QK3A 4QIZA 1FR7A 3SAXA 4Q6EA 4RN4A 4C3TA 4Q6DA 4TWMA 3U47A 3M67A 1CNYA 1I9LA 1ZH9A 1CNKA 5SZ1A 2FW4A 2AX2A 2QOAA 1ZGFA 3P4VA 4Q8ZA 1CAKA 4FRCA 3M2YA 2X7UA 1EOUA 2EU3A 3M5EA 1CAIA 3P58A 2NWPA 1T9NA 3NJ9A 1ZFQA 4YGJA 3V3GB 3C7PA 3RZ0B 5DSMA 5FNKA 5EZTX 2NWOA 4Q99A 3RZ7A 5FLTA 3JXHC 4Q07A 1DMXA 4PYYA 1CNBA 3DC3A 3MYQA 3P55A 3R17B 3MNUA 2ZNCA 4HF3A 1OKMA 5CA2A 1ZE8A 1FQNA 3T5ZA 3RYYA 4YGLA 1J9WA 5BNLA 4ETQC 1I9QA 1CANA 5E2RA 2WEJA 4HEWA 4JSAA 2VVBX 3P3HA 1RJ5A 4E3FA 4QK2A 5SZ6A 3KLDB 3BETA 5DSRA 3EFTA 3RGEA 3QYKA 4Q0LA 5EIJA 3KONA 2HOCA 3M5SA 4ZX0A 3L14A 1CVBA 5AMGA 3M3XA 2FMZA 4KUYA 1I91A 5FNGA 3IAIA 2WEOA 4KP5A 1YDBA 1YO0A 12CAA 1G52A 1I90A 4Q7SA 1IF4A 4MLTA 3T5UA 2POUA 5JGTB 1RZAA 1FQRA 3EFIA 1TH9A 5SZ4A 1RZDA 2HNCA 5SZ5A 2FNKA 4CQ0A 3GZ0A 2X7TA 5EHEA 3B4FA 4WL4A 4Z1EA 3IGPA 4M2VA 2HL4A 5AMLA 1CCTA 4KNJA 4G7AA 3KOIA 1G4OA 1G3ZA 1CVDA 3D8WA 1IF8A 1BNNA 3IEOA 3MNIA 3OKUA 2AW1A 4JSWA 4YXUA 4QEFA 5IPZA 1BN1A 3DVBA 1G45A 2CABA 4RUZA 2WD3A 5EKHA 3K2FA 1TBTX 4JSZA 3V2MA 2NNGA 4K13A 1LG6A 1ZFKA 3MNAA 3DVDA 4QSIA 3LXEA 1CVEA 4PYXA 1HEAA 4FL7A 3P44A 1I9NA 1CIMA 2Q1BA 4QTLA 5EH8A 3RJ7A 5FL4A 3V3IB 1CNJA 1TEUX 1CAYA 2FOSA 2H15A 3DCCA 4N0XB 2FNNA 1LGDA 4ZWYA 4YXIA 1AZMA 1Z9YA 4N16A 5L6KA 3V7XA 1IF5A 1FSRA 5A6HA 4QSAA 3FFPX 5E28A 2WD2A 5DSLA 3UYQA 1UGBA 3KIGA 1BV3A 4PZHA 3RYVB 5G0CA 2OSFA 5BRUA 4DZ9A 1CILA 5G01A 4JSSA 5DSIA 1RZEA 1BZMA 1FR4A 3TVOX 5JG5B 2CBEA 5EKMA 3M1WA 4YGNA 5DSKA 4ZWZA 1G46A 5E2MA 4L5WA 5DSNA 3ML5A 4PXXA 4YGFA 4RUXA 4ZX1A 1AM6A 3Q31A 1G54A 4R5AA 4LHIA 3S97A 3PJJA 2NXTA 3TMJA 2HFWA 4E5QA 3TVNX 3ZP9A 3DV7A 4TWLA 3MWOA 4CNWA 1CNIA 1KEQA 5E2SA 4MO8A 4L5VA 4IDRX 3MDZA 1XEVA 1MUAA 3OKVA 3D92A 3S76A 1H4NA 3IBNA 1OQ5A 4WR7A 1HCBA 5FLOA 4Q08A 3PO6A 4QY3A 5EH5A 4HT2A 5DOGA 3IBUA 3S73B 1A42A 1HECA 1CNGA 1TEQX 1CAMA 5DSOA 1IF9A 3M96A 5FL6A 4M2UA 3M1QA 3MMFA 4RH2A 3DCSA 4RIVA 1BNWA 1XEGA 3T82A 1G1DA 5JDVB 4K0ZA 3MHOA 3IBIA 2ABEA 3JXGA 2NWYA 3M1KA 5CACA 2HD6A 3N3JA 3S71B 4HU1A 4R59A 5FLQA 5SZ3A 5C8IA 1DCBA 4ZWIA 3MZCA 1CA2A 4IWZA 4Z1JA 1BNUA 2CBAA 4QIYA 2IT4A 3OIKA 5FL5A 2NNSA 3N0NA 3DD8A 3BL0A 1FQLA 1CAZA 1CVFA 3KKXA 4Q81A 4KUWA 4LP6A 2POWA 1BNQA 2WEHA 3MHCA 1I9MA 1V9EA 5FLPA 5E2KA 3M5TA 3S9TA 4KNMA 4E3GA 4KV0A 1UGCA 1DMYA 5CLUA 1I8ZA 2FMGA 4YX4A 4LU3A 2X7SA 1RZCA 1URTA 3M2NA 1THKA 4Q49A 1KOPA 1KOQA 1CALA 4ILXA 4RFDA 2GEHA 5L3OA 2NXSA 1BICA 3KWAA 1DCAA 1KWRA 1JD0A 1V9IC 4HT0A 1RAZA 4CACA 2Q38A 3DC9A 5JEPB 5G0BA 3FE4A 4QJOA 3RYJB 5J8ZA 4L5UA 5E5RA 4YXOA 5DSJA 5DVXA 3KOKA 3D93A 5EKJA 3HKQA 1TTMA 3V2JA 1ZSCA 4ITPA 3S75B 4K1QA 4Q7PA 1CVCA 5FNHA 3RZ1B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M2R A;  4CA2 A;  1LUG A;  3F4X A;  3M40 A;  1HUG A;  1FLJ A;  4Y0J A;  5DSQ A;  4JS6 A;  1G0E A;  3CYU A;  4YYT A;  5JEG B;  1XQ0 A;  4ZWX A;  4XZ5 A;  1CAO A;  1UGA A;  4HEZ A;  1ZSB A;  3DA2 A;  4Q09 A;  4RIU A;  3MHL A;  5AMD A;  1UGE A;  2OSM A;  3OIM A;  1RJ6 A;  4K0S A;  4COQ A;  3SBI A;  5FNI A;  1CCU A;  4E4A A;  3S72 B;  1RAY A;  1Z97 A;  2QO8 A;  6CA2 A;  2FNM A;  3PYK A;  2F14 A;  5HPJ A;  1CNW A;  4Q90 A;  1TE3 X;  1CAJ A;  1CVH A;  4QJW A;  5EOI A;  3CAJ A;  4QJP A;  1CCS A;  3V5G A;  1FSQ A;  3T84 A;  2FOV A;  4FPT A;  5SZ0 A;  2CA2 A;  3N2P A;  3S77 B;  1YDC A;  3VBD A;  5E5U A;  3MHM A;  2GD8 A;  2NNV A;  1YDA A;  4FVN A;  3M1J A;  4GL1 X;  3SBH A;  4E3H A;  3M04 A;  3OYS A;  4KNN A;  1HCA A;  3HKU A;  1AVN A;  4ITO A;  1BNV A;  3P5A A;  3BL1 A;  3HS4 A;  4KAP A;  4BF1 A;  7CA2 A;  1KWQ A;  4G0C A;  2CBC A;  2QP6 A;  4PQ7 A;  3U45 X;  2FOU A;  1FQM A;  1BN4 A;  5G03 A;  5DOH A;  3M98 A;  1G0F A;  1HVA A;  4KNI A;  1UGD A;  1I9O A;  4MDM A;  4YGK A;  4MTY A;  5JGS B;  3W6H A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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