5E2MA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme i with 3-(cyclooctylamino)-2,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)sulfonyl]benzenesulfonamide
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2mA00
5FNHA 3DD8A 3RG4A 4K0SA 3V2MA 2QP6A 1BNVA 1UGFA 2IT4A 3IBNA 1HECA 1BN4A 3JXFA 4QEFA 1RZCA 1RZEA 5FNLA 5FNGA 4IWZA 4QJXA 1FSNA 3MHLA 2CA2A 4E3FA 3CAJA 2QOAA 3HKNA 3S71B 4BF1A 2Q1BA 1HCBA 3MNJA 4Y0JA 2FOSA 4JS6A 3R17B 5DSQA 4FU5A 5L6KA 1BNQA 3RYYA 1LZVA 3MNIA 1T9NA 3OIMA 4CNWA 4R59A 3C7PA 1CVAA 3MDZA 4CNVA 1G54A 4Z0QA 1IF7A 1AM6A 2HFWA 3HKUA 1CA3A 1I9LA 3RGEA 5HPJA 3HKTA 1FQRA 5G0CA 1ZGFA 2Q38A 4WUQA 4ITOA 3HFPA 4ITPA 4JSZA 3F7BA 5L3OA 4YXIA 3DC3A 3BL0A 4N16A 5JEPB 3KIGA 1TTMA 3BETA 4QJOA 2NXRA 3K2FA 1ZSCA 4HF3A 4ZAOA 4K1QA 1BICA 3RYXB 3ML2A 5FL6A 2FOYA 3DA2A 3T85A 2WD3A 4XFWA 3DVDA 4KNIA 5BRWA 1BNTA 3RJ7A 4CNXA 1G3ZA 1AZMA 1YDAA 4Q81A 5EHVA 4YYTA 4FPTA 1G53A 1OQ5A 3D8WA 3S74B 1HEBA 5FNJA 1CVBA 3F8EA 4Q99A 2POWA 3OKVA 3KKXA 4WL4A 1MUAA 3T82A 7CA2A 4MLTA 1CNJA 4ZX0A 3KLDB 5SZ2A 5EKMA 4Q8YA 2X7TA 5EH8A 5E5RA 4XZ5A 1JCZA 5BRVA 2NWZA 5DSIA 4YGFA 3KOIA 4HT2A 3SAXA 5EHEA 2FOVA 4Q8ZA 1FQMA 4Q9YA 1CVFA 3M67A 1CRMA 3DCWA 1RAYA 3MHCA 2AX2A 3DC9A 1G48A 4QK3A 5BYIA 4KAPA 2CBBA 4QJPA 3IGPA 3U47A 2H15A 1BNUA 2F14A 3S72B 4PXXA 4YGNA 4MLXA 5JQ0A 1I9QA 1H9NA 4FVOA 1CVCA 4Q07A 1ZSBA 2X7SA 3IBUA 4Q83A 6CA2A 5JGTB 1CAOA 1HVAA 2POUA 4MDMA 4LP6A 2EU3A 5DSMA 4E3GA 3K34A 3U7CA 1G4OA 4HEZA 3MHOA 4KNNA 4WW6A 5AMLA 3FE4A 2ZNCA 3M2XA 3CA2A 5DSNA 5BNLA 1UGEA 2OSMA 1BNMA 1TEQX 4PQ7A 3RYVB 1F2WA 3D0NA 3MHMA 4QJMA 4Q0LA 1FR4A 4L5UA 5JG5B 1TH9A 8CA2A 1IF6A 3KNEA 4E4AA 1BN1A 4QK1A 5G03A 3RZ1B 1G4JA 2FMGA 4Q6EA 4QTLA 2CABA 3S9TA 1Z93A 4Q09A 4N0XB 1RZAA 3TVOX 5FLOA 4RUXA 4JSAA 1KWRA 4Q08A 3V3IB 2AW1A 1CILA 4Q8XA 3HKQA 4QK2A 3DVCA 4ZWYA 3V3JA 4CNRA 5J8ZA 5JDVB 5SZ4A 1CRAA 3RLDA 4Z1NA 4HEWA 3DBUA 1G45A 5E2KA 3D9ZA 4RUZA 3SAPA 2X7UA 5FLTA 1FSRA 2NXSA 4DZ9A 4WUPA 3DV7A 1FSQA 4QJ0A 3MNKA 4ZWXA 3W6HA 5JG3B 1G46A 4TWLA 4Q49A 4KUVA 1XQ0A 5CLUA 3M1QA 3HS4A 3M5EA 1LG5A 3M1KA 3EFTA 3R16A 1BV3A 1G6VA 4YX4A 1CNIA 1CNGA 4X5SA 3S8XA 1A42A 3P4VA 5E2SA 3GZ0A 1RAZA 3S77B 1CINA 3T84A 4Q87A 5DOHA 1TE3X 1ZGEA 1I9OA 1I8ZA 4FRCA 3F7UA 1ZFQA 1CNHA 1I90A 2NN1A 3M1JA 4KUWA 5EKHA 2WEGA 4KP8A 3S97A 2WEOA 2ILIA 3KS3A 5LMDA 1XEGA 4FVNA 1I91A 4M2VA 3P3JA 2O4ZA 4L5WA 1UGDA 4PYXA 4KNJA 4RN4A 1V9EA 3M5TA 5FNIA 3RZ7A 2NWYA 4R5AA 4QSIA 5DRSA 5EIJA 1JV0A 3D93A 3RZ8A 4UOVA 5E2NA 1YO1A 2CBEA 2NXTA 1CA2A 1YDCA 4RFDA 3S73B 4CA2A 5E5UA 4YXOA 4KNMA 1CANA 1Y7WA 4Q7SA 2FOUA 1TEUX 4QIYA 3M14A 3RYJB 4Z1JA 1ZNCA 1RZDA 1CIMA 4FIKA 4YXUA 4QSJA 1TB0X 4R5BA 5E2MA 3IBIA 3M96A 2NNVA 2HKKA 4PZHA 4RUYA 5DVXA 3MYQA 12CAA 4BCWA 1CAJA 5DSJA 5DOGA 1CNYA 3P5LA 5DSRA 4Q78A 1CCTA 1KEQA 4RH2A 2OSFA 2WEHA 4L5VA 3DAZA 5C8IA 1URTA 3UYNA 3V7XA 3ZNCA 4ZX1A 3JXGA 3M98A 5JESB 1CNXA 2WEJA 2EZ7A 4MTYA 3RYZA 3IBLA 2Q1QA 1XPZA 3K7KA 5SZ5A 1UGCA 1IF9A 2VVAX 3M40A 3OY0A 4QY3A 1G0EA 4PYYA 3OYQA 3P58A 4K0TA 4ZWIA 3MHIA 1CCUA 4ILXA 1JD0A 1HEAA 4LU3A 3ZP9A 1DMYA 1LG6A 1BN3A 4MDLA 3BL1A 3L14A 3P55A 3CZVA 4HEYA 3IEOA 4RIVA 5DSPA 5EH7A 3KONA 1I9NA 4YVYA 3T83A 4G0CA 4YGLA 3RZ0B 4K0ZA 3M2NA 1RZBA 2W2JA 3HLJA 1YDBA 1EOUA 3T5ZA 5AMGA 5FLPA 5SZ0A 3SBIA 1ZSAA 4E5QA 4M2RA 1HUHA 5CACA 3TVNX 3S75B 3MZCA 3MMFA 4HT0A 5EOIA 1TBTX 1MOOA 5G0BA 1CAIA 5CA2A 1BCDA 5EKJA 4ETQC 3B1BA 2FW4A 3NJ9A 5FLQA 2HD6A 1OKNA 4G7AA 5FNMA 5A6HA 4Q6DA 3KWAA 1BZMA 1KOQA 2H4NA 4YGKA 1I9PA 1CNWA 5EZTX 3RZ5A 1BNNA 1YO2A 3N4BA 4XIXA 5SZ1A 1CVDA 4QIZA 1FQNA 1TG3A 2HNCA 3NI5A 4M2UA 5E28A 1KWQA 3PO6A 4RIUA 1HEDA 1DCBA 2NNSA 4YHAA 3NB5A 1BNWA 1CALA 1CAMA 2HL4A 4XIWA 4HU1A 3N3JA 4M2WA 3V3HB 3MNUA 2CBCA 1IF5A 1H9QA 1OKMA 1IF8A 3IAIA 1CVEA 1UGAA 1Z9YA 3W6IA 4HBAA 1CNBA 3P44A 4KV0A 4QSBA 2HOCA 3CYUA 1CCSA 1FQLA 4IDRX 1CAYA 4Q7PA 4COQA 2FNKA 1UGGA 3M2YA 4JSSA 4CQ0A 2FMZA 3OILA 1CZMA 3B4FA 1G52A 1FLJA 2NNOA 4ZWZA 5FDIA 5BRUA 4FL7A 3KOKA 3PYKA 3P5AA 4DZ7A 4TWMA 2GEHA 3V5GA 3OKUA 3Q31A 4BF6A 5FNKA 4WW8A 3RG3A 4E3HA 3MNAA 2GD8A 3U45X 5JQTA 2CBDA 1YDDA 1CAHA 2FOQA 2NNGA 3DCSA 1ZH9A 1LUGA 4Q06A 4Q90A 2VVBX 5FL5A 3OIKA 3V3GB 3M04A 4XE1A 5DSKA 3V3FA 3D92A 4MDGA 3FW3A 1IF4A 1LGDA 5DSOA 1G0FA 5IPZA 1THKA 1HUGA 3QYKA 4QSAA 2WD2A 1CNCA 3M3XA 1ZFKA 3M2ZA 4WR7A 1CVHA 1KOPA 3VBDA 2QO8A 1TG9A 3LXEA 5SZ3A 3S78B 1YO0A 5FLSA 2FNMA 2NWOA 1V9IC 1FR7A 3P3HA 4Q7WA 1G1DA 5FDCA 3S76A 4E49A 4LHIA 4JSWA 2EU2A 2NN7A 1CAZA 3DCCA 5SZ7A 4Z1KA 3DVBA 3JXHC 5A25A 2ABEA 1OKLA 9CA2A 1UGBA 5FLRA 4C3TA 3N0NA 1HCAA 4KUYA 3SBHA 5CJFA 2FNNA 4RFCA 2POVA 1H4NA 1DMXA 3FFPX 3M5SA 3UYQA 3OYSA 1CNKA 4KP5A 5DSLA 3DD0A 1AVNA 1RJ5A 1Z97A 5EHWA 4YWPA 1ZE8A 3MNHA 3MWOA 5JGSB 1I9MA 4E9OX 1RJ6A 2CBAA 5FL4A 1CAKA 1XEVA 3F4XA 5JEGB 4Z1EA 4E3DA 2NMXA 5SZ6A 1DCAA 3V2JA 3U3AX 5AMDA 3M1WA 1J9WA 3ML5A 5JEHB 3PJJA 4MO8A 5E2RA 4CACA 4QJWA 3EFIA 3N2PA 4Q7VA 4YGJA 3T5UA 3TMJA 5G01A 5EH5A 4K13A 2NWPA 4GL1X
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5FNH A;  3DD8 A;  3RG4 A;  4K0S A;  3V2M A;  2QP6 A;  1BNV A;  1UGF A;  2IT4 A;  3IBN A;  1HEC A;  1BN4 A;  3JXF A;  4QEF A;  1RZC A;  1RZE A;  5FNL A;  5FNG A;  4IWZ A;  4QJX A;  1FSN A;  3MHL A;  2CA2 A;  4E3F A;  3CAJ A;  2QOA A;  3HKN A;  3S71 B;  4BF1 A;  2Q1B A;  1HCB A;  3MNJ A;  4Y0J A;  2FOS A;  4JS6 A;  3R17 B;  5DSQ A;  4FU5 A;  5L6K A;  1BNQ A;  3RYY A;  1LZV A;  3MNI A;  1T9N A;  3OIM A;  4CNW A;  4R59 A;  3C7P A;  1CVA A;  3MDZ A;  4CNV A;  1G54 A;  4Z0Q A;  1IF7 A;  1AM6 A;  2HFW A;  3HKU A;  1CA3 A;  1I9L A;  3RGE A;  5HPJ A;  3HKT A;  1FQR A;  5G0C A;  1ZGF A;  2Q38 A;  4WUQ A;  4ITO A;  3HFP A;  4ITP A;  4JSZ A;  3F7B A;  5L3O A;  4YXI A;  3DC3 A;  3BL0 A;  4N16 A;  5JEP B;  3KIG A;  1TTM A;  3BET A;  4QJO A;  2NXR A;  3K2F A;  1ZSC A;  4HF3 A;  4ZAO A;  4K1Q A;  1BIC A;  3RYX B;  3ML2 A;  5FL6 A;  2FOY A;  3DA2 A;  3T85 A;  2WD3 A;  4XFW A;  3DVD A;  4KNI A;  5BRW A;  1BNT A;  3RJ7 A;  4CNX A;  1G3Z A;  1AZM A;  1YDA A;  4Q81 A;  5EHV A;  4YYT A;  4FPT A;  1G53 A;  1OQ5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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