5E2NA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 3-(cyclooctylamino)-2,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)sulfonyl]benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2nA00
1TG9A 2FNKA 3F4XA 3M2YA 4TWMA 1CA2A 1BICA 3IBNA 1CALA 4WW8A 3F8EA 3KKXA 3M1QA 3RYXB 4Z1NA 1CAKA 5EKMA 4Q90A 4ZWXA 1RJ5A 1IF6A 4KNIA 3D9ZA 4QIYA 4X5SA 5IPZA 3OKUA 3BETA 5DSOA 1IF7A 1CZMA 3DCWA 5BRWA 4Q6EA 1CNWA 5FNIA 2ZNCA 3TVNX 3RLDA 3RZ8A 5CLUA 2NMXA 12CAA 2X7TA 4HU1A 3RYZA 5FNGA 5DSKA 3JXGA 3DBUA 1RAYA 1ZGFA 5E28A 3S78B 1BZMA 5EKHA 1RZCA 3RZ7A 2HNCA 4Q06A 4KNMA 2NNVA 4YGFA 3MHLA 4JSAA 3BL0A 3HKUA 5DRSA 3DD0A 1THKA 1H4NA 3MWOA 4BCWA 3DA2A 4KNNA 2OSMA 1YO0A 3CAJA 5DSIA 5JQ0A 3Q31A 2WEJA 3QYKA 4DZ7A 4KUVA 3V2JA 4WUPA 4Z1KA 1CRMA 1BNQA 1MUAA 1RJ6A 4R5AA 4QSJA 1CNJA 5DOGA 4KNJA 3K34A 1CILA 2FW4A 3IEOA 4FRCA 4Y0JA 1RZAA 1HECA 4Q08A 1G0EA 5DSPA 5AMGA 2CBAA 1URTA 1BN4A 5SZ1A 4YGLA 1YO1A 1FSNA 3M3XA 3S8XA 2NWYA 3HKTA 4CA2A 5DSQA 4QJXA 3RZ1B 1CIMA 4KUWA 3K7KA 3R16A 5J8ZA 2GEHA 4YXIA 4FL7A 1YDDA 1KOPA 2CBBA 2HKKA 1CNYA 3SBIA 5FLTA 4E3FA 5JDVB 5BYIA 1TTMA 1TEQX 1HUGA 3M2NA 4E9OX 3C7PA 3MDZA 3P58A 2CABA 1CVEA 2HD6A 1BNVA 1HEAA 5DSJA 5FLOA 3SBHA 4Q6DA 1F2WA 4MTYA 1MOOA 2EZ7A 3B1BA 1G46A 3FFPX 4ILXA 4XZ5A 2WEGA 4QY3A 4Q83A 1BNNA 1CAYA 3K2FA 4RUZA 5SZ5A 3V3HB 1BNMA 5EHVA 2CBCA 2X7UA 3FE4A 1YO2A 3SAXA 1Z9YA 2NN1A 4QJOA 4Q49A 3MZCA 1BCDA 3MNAA 3UYQA 3S77B 2NN7A 3N3JA 4ETQC 3M1KA 3OYQA 1G0FA 4MDLA 1ZGEA 5DSMA 5JG3B 3MNIA 1XEVA 4G7AA 4M2RA 3MNHA 3P3HA 4E49A 2HFWA 5EHWA 3M5SA 1CNXA 4JS6A 3VBDA 1CAHA 1OKNA 4ZAOA 3OIMA 4QJ0A 2FNNA 4QIZA 4Q9YA 4KP5A 5SZ3A 1I91A 1TEUX 4M2VA 5E2RA 3ZP9A 4QJWA 3D93A 3DD8A 3M2XA 3V2MA 1UGDA 2CBDA 4R59A 5BRUA 3MHOA 4WUQA 4FPTA 3M98A 1Y7WA 2WEHA 4Q7SA 3PJJA 4L5WA 2FOYA 4KAPA 4LU3A 4Q81A 5E2NA 3BL1A 3KONA 4Z1EA 3IGPA 2NWOA 1UGAA 4YXUA 3ZNCA 3KOKA 1XPZA 5FL4A 2NWPA 3N4BA 4YVYA 1LZVA 3FW3A 1I9PA 5EH7A 1CCTA 3HLJA 3KWAA 5EIJA 4Q8YA 1CCUA 2QP6A 3MMFA 1EOUA 2NNGA 4CACA 4ZWYA 1YDBA 5SZ2A 4CNXA 1CAMA 3N0NA 4K0TA 4QK2A 3RYVB 4KP8A 1CNKA 2Q38A 3MNUA 4UOVA 3S71B 1A42A 4IWZA 5FDCA 4RFCA 5JGSB 4RIUA 4MLTA 1I9NA 3DAZA 4L5VA 4HT0A 5FNHA 4HEYA 3M96A 1XEGA 1CNIA 1AM6A 1LG6A 5C8IA 3DVDA 4XFWA 1FQMA 4K0SA 1TG3A 3KLDB 5EOIA 3S74B 3HFPA 2AX2A 5G0CA 3V7XA 4E4AA 5CA2A 3HS4A 3M1JA 3RYJB 1CNHA 3U7CA 2QO8A 3DC3A 1RZBA 4CNVA 3P44A 3T85A 3MYQA 1CVBA 3M5EA 4FVOA 3PYKA 3IBLA 4KV0A 3TMJA 1Z97A 4HT2A 1BN3A 1FSQA 2POUA 1CVHA 1CVFA 2H4NA 1KWQA 1UGBA 2POVA 3ML2A 4MDMA 4Q87A 4LHIA 4GL1X 5FL6A 5JEHB 1HCBA 3S76A 3N2PA 4PZHA 3S75B 2H15A 1UGCA 1IF8A 2HOCA 2AW1A 3RZ0B 2WD3A 3IBIA 1BV3A 2F14A 4Q8ZA 1JCZA 1IF5A 1DCBA 1V9IC 1FSRA 1TE3X 3DC9A 1CINA 3DCSA 2O4ZA 3R17B 2ABEA 4PYYA 4WL4A 3U3AX 3MHMA 1G54A 1CCSA 3W6IA 5FNLA 4PQ7A 1OKLA 4G0CA 5HPJA 7CA2A 2GD8A 1FQNA 1G4OA 3HKNA 3M5TA 4ZWIA 1BNTA 1CNGA 1AZMA 1JD0A 1ZSAA 1DMYA 5FLPA 3L14A 4Q07A 1CA3A 2FMGA 2NXTA 4E5QA 4ITPA 3T82A 2WEOA 4N16A 3TVOX 1YDCA 4K13A 5JEGB 3PO6A 3U45X 3P3JA 2ILIA 1CAZA 3MNJA 4QTLA 1I9OA 1CANA 1Z93A 4XE1A 3MHCA 4Z1JA 5EH5A 3M04A 3RJ7A 3NJ9A 3ML5A 5FNJA 3RZ5A 1RAZA 1IF4A 8CA2A 5JEPB 1UGGA 4C3TA 5EZTX 5EH8A 1ZFKA 3DCCA 5FNMA 1BNUA 4KUYA 4E3HA 4ITOA 9CA2A 1FLJA 3T5ZA 2CA2A 4MO8A 4COQA 4N0XB 4QK1A 1KWRA 4XIWA 4YWPA 1CNBA 1RZEA 1I9QA 1LUGA 2NNSA 4L5UA 5DSLA 2EU3A 1G52A 2OSFA 1BN1A 1DCAA 3UYNA 2W2JA 3EFIA 1G48A 4Z0QA 3V3JA 1DMXA 3RG3A 4JSSA 3MNKA 2VVAX 2X7SA 2HL4A 4RFDA 4Q7PA 2QOAA 4QSIA 3KIGA 3W6HA 4FIKA 4WR7A 2POWA 1TH9A 4HBAA 3KOIA 4R5BA 3NB5A 2WD2A 3B4FA 2NWZA 1CAIA 3JXFA 5BRVA 5E2KA 1UGFA 1OKMA 5AMLA 1I9LA 4Q78A 4HEZA 3OILA 3P5AA 1ZE8A 2NXSA 5JG5B 1ZSBA 1JV0A 3DV7A 5LMDA 2FOVA 3S72B 3M1WA 3CZVA 5FLQA 3P4VA 3D92A 4WW6A 5FLSA 3NI5A 3RYYA 1ZSCA 5FNKA 1CVCA 4Q8XA 4YXOA 3M67A 4M2UA 4MLXA 3S97A 1H9QA 3OKVA 4QEFA 2FOUA 3T83A 3CA2A 4YX4A 4YGKA 5AMDA 5G01A 4YYTA 5CACA 4JSZA 3V5GA 1CRAA 1G53A 4K1QA 4Q99A 4HF3A 5EHEA 3F7BA 5FLRA 3V3IB 3OYSA 3RGEA 4QJMA 1HUHA 4M2WA 1TBTX 1CVAA 5SZ4A 4TWLA 1G4JA 5G03A 4FU5A 3OIKA 4RUXA 4XIXA 4YGNA 3DVBA 5A6HA 3EFTA 3JXHC 2CBEA 1HVAA 5E2SA 3KNEA 1G45A 4BF1A 4QJPA 1I90A 1ZFQA 1J9WA 5DOHA 3T5UA 4RUYA 5E5RA 4MDGA 2VVBX 5FDIA 1IF9A 4Q7VA 3D0NA 3U47A 4QSAA 1KEQA 5JQTA 3HKQA 1HEDA 1I8ZA 2FMZA 5G0BA 2NNOA 5BNLA 5CJFA 1HCAA 4YGJA 2NXRA 3M14A 3SAPA 3CYUA 3D8WA 2Q1BA 1KOQA 3F7UA 4IDRX 4QSBA 4ZX0A 5FL5A 1OQ5A 3M2ZA 1H9NA 1G1DA 5JGTB 1LGDA 1UGEA 4CNWA 5A25A 1CNCA 4HEWA 4RIVA 4E3GA 1TB0X 4RH2A 1XQ0A 1T9NA 1CAJA 2FOSA 1LG5A 1RZDA 4E3DA 5SZ7A 3M40A 3S9TA 1V9EA 5DSNA 4LP6A 3IBUA 4PXXA 3DVCA 1FR4A 2Q1QA 4Q7WA 4ZX1A 5DVXA 1YDAA 1CAOA 5E2MA 2EU2A 5EKJA 1I9MA 3OY0A 4Q0LA 2FOQA 4CQ0A 4ZWZA 6CA2A 1G3ZA 3KS3A 1FQRA 4Q09A 5SZ6A 3S73B 4RN4A 1CVDA 2IT4A 3GZ0A 3V3FA 4QK3A 4PYXA 3T84A 1FR7A 4JSWA 1AVNA 1G6VA 1HEBA 5DSRA 3MHIA 3V3GB 1ZNCA 1BNWA 5L3OA 4K0ZA 1ZH9A 3P55A 5E5UA 4FVNA 3RG4A 4BF6A 3LXEA 3P5LA 2FNMA 5SZ0A 1FQLA 3IAIA 4YHAA 4DZ9A 5JESB 5L6KA 4CNRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1TG9 A;  2FNK A;  3F4X A;  3M2Y A;  4TWM A;  1CA2 A;  1BIC A;  3IBN A;  1CAL A;  4WW8 A;  3F8E A;  3KKX A;  3M1Q A;  3RYX B;  4Z1N A;  1CAK A;  5EKM A;  4Q90 A;  4ZWX A;  1RJ5 A;  1IF6 A;  4KNI A;  3D9Z A;  4QIY A;  4X5S A;  5IPZ A;  3OKU A;  3BET A;  5DSO A;  1IF7 A;  1CZM A;  3DCW A;  5BRW A;  4Q6E A;  1CNW A;  5FNI A;  2ZNC A;  3TVN X;  3RLD A;  3RZ8 A;  5CLU A;  2NMX A;  12CA A;  2X7T A;  4HU1 A;  3RYZ A;  5FNG A;  5DSK A;  3JXG A;  3DBU A;  1RAY A;  1ZGF A;  5E28 A;  3S78 B;  1BZM A;  5EKH A;  1RZC A;  3RZ7 A;  2HNC A;  4Q06 A;  4KNM A;  2NNV A;  4YGF A;  3MHL A;  4JSA A;  3BL0 A;  3HKU A;  5DRS A;  3DD0 A;  1THK A;  1H4N A;  3MWO A;  4BCW A;  3DA2 A;  4KNN A;  2OSM A;  1YO0 A;  3CAJ A;  5DSI A;  5JQ0 A;  3Q31 A;  2WEJ A;  3QYK A;  4DZ7 A;  4KUV A;  3V2J A;  4WUP A;  4Z1K A;  1CRM A;  1BNQ A;  1MUA A;  1RJ6 A;  4R5A A;  4QSJ A;  1CNJ A;  5DOG A;  4KNJ A;  3K34 A;  1CIL A;  2FW4 A;  3IEO A;  4FRC A;  4Y0J A;  1RZA A;  1HEC A;  4Q08 A;  1G0E A;  5DSP A;  5AMG A;  2CBA A;  1URT A;  1BN4 A; 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