5E2NA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 3-(cyclooctylamino)-2,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)sulfonyl]benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2nA00
2EU3A 4CQ0A 4Z1NA 5L6KA 4HBAA 1CA2A 3S74B 4JSZA 4XZ5A 5DSQA 1XQ0A 4QSJA 4WUQA 3VBDA 2WD3A 3DC3A 4Q8ZA 3RLDA 4ZWZA 3U45X 1FQMA 4YGFA 2QP6A 4XIWA 1KEQA 1UGFA 5EH7A 1Z9YA 2FOYA 4PXXA 1JD0A 4WW8A 3IBLA 2FOSA 1V9EA 4QIYA 3M1KA 1IF7A 3V3JA 2HOCA 4BF1A 3D8WA 2NWZA 1DCBA 3P44A 5L3OA 3DVDA 4Q7VA 3K7KA 4HT0A 4LU3A 8CA2A 3KWAA 1BN1A 5FDCA 3M2YA 5JESB 4XE1A 3ZP9A 1IF6A 1RZBA 1I9MA 1TG3A 3U47A 1BNMA 3DAZA 5JEPB 1HEBA 3TVOX 1CAYA 3Q31A 5EZTX 1FSQA 1CNGA 5FNKA 5BRVA 3S8XA 3M3XA 4ZX0A 3PO6A 4Z1JA 2Q1BA 1RJ6A 4KUYA 4M2WA 4ZWYA 5FL4A 4Y0JA 1G52A 3MHMA 7CA2A 1TE3X 5DSIA 3V3FA 2CBCA 3M67A 1FSNA 4PYXA 3DVBA 4CNVA 2CBEA 1CAZA 1CVFA 4G0CA 4HF3A 3L14A 3M2XA 4ETQC 4Z0QA 3KIGA 3NB5A 3DD0A 3DVCA 4L5WA 5DOHA 5CA2A 4LHIA 3R16A 3IEOA 4Q6DA 3R17B 1YDBA 2NNVA 5SZ0A 1KWQA 1G0EA 2ABEA 5DRSA 2IT4A 4CNXA 1RAYA 4K0TA 1A42A 4KAPA 4QK2A 1OKMA 3D9ZA 1CVBA 4MDMA 1CVEA 1TG9A 4K13A 2FNMA 1F2WA 2WEGA 1YO1A 2POWA 2NNGA 2NMXA 1HUHA 4X5SA 5DSJA 2NNSA 3P55A 1TH9A 5AMLA 1LGDA 4C3TA 4ZWXA 3ML5A 4DZ7A 5E2NA 4Q08A 4RFCA 5JGTB 3RZ8A 4Q49A 3KONA 4Q8XA 5JGSB 3S72B 3MNIA 1G46A 3MNKA 3BETA 4KNNA 9CA2A 1YDCA 3V2MA 1I8ZA 2H4NA 5JEHB 4CACA 3OIKA 5DSRA 4QJOA 4RUYA 5DSLA 1HECA 3M96A 4YX4A 1I9OA 4YVYA 3T84A 3V3HB 3P3JA 2WEOA 1LG5A 1FR4A 4MDGA 3TMJA 3M1WA 4YHAA 4MLXA 4QTLA 5C8IA 4QEFA 3HKTA 1RZCA 1H9NA 1CNKA 3M2NA 4FPTA 4QK1A 4BF6A 1ZSBA 5FNMA 4IDRX 3KOIA 2OSFA 3P58A 3V3IB 3OYQA 4WL4A 4Q99A 1AVNA 1HUGA 5SZ7A 1KOQA 3N0NA 4QJPA 1ZH9A 2H15A 3KNEA 1I90A 3HKNA 4UOVA 2CA2A 1DCAA 3MHOA 4YGLA 3MYQA 1CNCA 4HU1A 4RUZA 5DOGA 3TVNX 5G0BA 5EKHA 4PYYA 4R59A 1FQLA 3F7UA 5BNLA 3CZVA 4Z1EA 1EOUA 1RZAA 2F14A 5BRWA 3SAXA 4Q6EA 4QJXA 1IF8A 3UYNA 3U7CA 3M1JA 1CCUA 3M98A 1LUGA 2AW1A 1KOPA 5SZ5A 1OKLA 3C7PA 4Q83A 5DSOA 5LMDA 3RZ5A 2HD6A 3DCSA 3RG3A 4G7AA 4MDLA 1BN3A 1CAKA 4R5BA 2WD2A 1MUAA 1IF5A 1ZFQA 2X7UA 3HS4A 4RFDA 1ZGFA 4WW6A 4PZHA 5SZ2A 5CJFA 4M2VA 4XIXA 5FNJA 4CA2A 1CRAA 3OIMA 1BNNA 1URTA 2Q38A 5CACA 4K0ZA 1AZMA 1CNIA 1CAIA 3SBIA 5SZ6A 2NWPA 5FDIA 1G4JA 3MWOA 4Q78A 4QSAA 1ZE8A 3M2ZA 1JV0A 3P3HA 5JG5B 2FOUA 1ZSCA 1MOOA 3MMFA 1CAMA 1CCSA 1HCBA 4Q87A 4LP6A 2VVAX 5EOIA 5FLPA 1CNBA 3M1QA 2W2JA 1Z97A 3FFPX 2AX2A 4KP8A 1XEVA 2EZ7A 4FL7A 3S75B 5EKMA 2FW4A 5IPZA 3QYKA 3T5ZA 3DCWA 2HKKA 4KUVA 2NXSA 4KNMA 1CNHA 1CRMA 1TBTX 3M04A 3B4FA 2Q1QA 4RUXA 2FMZA 1ZNCA 3CYUA 3N2PA 4ZAOA 2CBAA 1I9NA 1BZMA 4E3GA 2HFWA 3EFIA 1UGEA 2WEHA 3JXHC 4FVNA 2FOVA 3DD8A 1BNTA 1CZMA 2CBDA 3KOKA 3P4VA 1FR7A 5JDVB 4JS6A 1CILA 1H4NA 3N4BA 1HEDA 2HL4A 4KNIA 4E5QA 5EHVA 4JSSA 4YGKA 5SZ4A 4DZ9A 1CAJA 5DSMA 3S76A 3NJ9A 1LZVA 1H9QA 1G0FA 3HFPA 4RIVA 4QJ0A 1YDAA 5FNIA 4HT2A 2NNOA 1BNUA 1CALA 1CNXA 1UGAA 4RH2A 4YWPA 3V3GB 4E49A 1JCZA 1BNVA 1THKA 1G6VA 3D92A 5EHWA 3BL1A 6CA2A 4KNJA 2FOQA 2ILIA 2FNNA 3KLDB 3MNUA 3S97A 4MLTA 5A25A 1I91A 1TEUX 3OY0A 4KP5A 5E5RA 4Q81A 2NXRA 1T9NA 1CIMA 5JQ0A 3MNHA 4TWMA 5EKJA 3T85A 3KKXA 5BRUA 1CAOA 2ZNCA 3B1BA 2CABA 4E9OX 1Y7WA 3HKUA 5AMDA 12CAA 4E3DA 3T83A 1DMXA 3OKUA 4QY3A 1ZSAA 3OYSA 3S9TA 4K1QA 1I9QA 1DMYA 4HEYA 5SZ3A 3D93A 4BCWA 4CNRA 1ZGEA 4MTYA 4ILXA 4HEZA 1CNJA 3ML2A 3M5EA 1CA3A 3S73B 3CA2A 4FIKA 5E2KA 3MHLA 1HCAA 5DSKA 3K34A 5DSNA 4QJWA 1UGCA 1G1DA 5FLQA 3RYXB 1BN4A 2X7TA 2FMGA 5E5UA 1CINA 4QK3A 3BL0A 3HLJA 1XPZA 5G01A 1RJ5A 3SAPA 1LG6A 4FVOA 2VVBX 4COQA 5G03A 3S78B 5HPJA 2NWOA 1CCTA 3CAJA 3M14A 3PJJA 5BYIA 4Q7SA 4WUPA 3ZNCA 1CANA 4QSIA 3F8EA 3MHIA 1FSRA 1TTMA 5FLRA 5E2RA 3RYZA 5E2SA 1RZDA 4KV0A 4E3FA 2POUA 4M2UA 1G53A 3JXGA 4JSAA 1G54A 4Q90A 3M40A 4YXIA 4ZWIA 1UGGA 1I9PA 4QIZA 1G48A 3V7XA 1CVCA 5SZ1A 3M5SA 3DBUA 3T5UA 4YXOA 3F4XA 4Q09A 3U3AX 4FU5A 3W6IA 2NN1A 1BV3A 3MNJA 5AMGA 2OSMA 1TEQX 1CAHA 4QJMA 5FL6A 5EHEA 3DC9A 5DSPA 1FQNA 3F7BA 1YO2A 1BCDA 2NWYA 5EH8A 5E28A 3P5AA 5FLOA 5FNGA 1UGDA 3RJ7A 4E3HA 1CVDA 4TWLA 3IAIA 1UGBA 3D0NA 4L5UA 3IBNA 3DA2A 2GEHA 3OILA 1RAZA 3NI5A 4Q7PA 1I9LA 3RYVB 4ITPA 3DCCA 1V9IC 1TB0X 3IBIA 4Q06A 2WEJA 1CNYA 5EH5A 3S77B 1BNWA 1BICA 3JXFA 4YGNA 2CBBA 1G45A 3T82A 3V2JA 3V5GA 4Q7WA 1FQRA 5FNLA 1OKNA 1ZFKA 5EIJA 5FL5A 4WR7A 5FLSA 4FRCA 4E4AA 2FNKA 4K0SA 5JG3B 4Q0LA 1YO0A 1CVHA 4CNWA 4QSBA 1IF4A 4GL1X 3RZ7A 3RGEA 1FLJA 5JQTA 4ITOA 5CLUA 3W6HA 1HVAA 3GZ0A 3P5LA 1CNWA 3FE4A 3KS3A 2EU2A 4Q07A 3S71B 2POVA 4Z1KA 4RIUA 1HEAA 3RYJB 4L5VA 4YXUA 3SBHA 2HNCA 4XFWA 5FLTA 3RZ0B 3M5TA 2QOAA 1XEGA 3MHCA 3IBUA 4JSWA 4M2RA 1CVAA 5DVXA 3MDZA 4RN4A 4Q9YA 1Z93A 3RYYA 5J8ZA 4R5AA 4YGJA 3N3JA 3RZ1B 3DV7A 3MZCA 4IWZA 3LXEA 1OQ5A 1RZEA 2GD8A 5E2MA 3K2FA 4N16A 3IGPA 3EFTA 5FNHA 3FW3A 4KUWA 3HKQA 3OKVA 3PYKA 1G3ZA 2QO8A 1IF9A 5A6HA 1KWRA 2NN7A 5JEGB 1YDDA 4PQ7A 1J9WA 1AM6A 2O4ZA 2X7SA 4N0XB 3UYQA 4YYTA 1G4OA 5G0CA 2NXTA 4ZX1A 4MO8A 3RG4A 4Q8YA 1BNQA 3MNAA 4HEWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2EU3 A;  4CQ0 A;  4Z1N A;  5L6K A;  4HBA A;  1CA2 A;  3S74 B;  4JSZ A;  4XZ5 A;  5DSQ A;  1XQ0 A;  4QSJ A;  4WUQ A;  3VBD A;  2WD3 A;  3DC3 A;  4Q8Z A;  3RLD A;  4ZWZ A;  3U45 X;  1FQM A;  4YGF A;  2QP6 A;  4XIW A;  1KEQ A;  1UGF A;  5EH7 A;  1Z9Y A;  2FOY A;  4PXX A;  1JD0 A;  4WW8 A;  3IBL A;  2FOS A;  1V9E A;  4QIY A;  3M1K A;  1IF7 A;  3V3J A;  2HOC A;  4BF1 A;  3D8W A;  2NWZ A;  1DCB A;  3P44 A;  5L3O A;  3DVD A;  4Q7V A;  3K7K A;  4HT0 A;  4LU3 A;  8CA2 A;  3KWA A;  1BN1 A;  5FDC A;  3M2Y A;  5JES B;  4XE1 A;  3ZP9 A;  1IF6 A;  1RZB A;  1I9M A;  1TG3 A;  3U47 A;  1BNM A;  3DAZ A;  5JEP B;  1HEB A;  3TVO X;  1CAY A;  3Q31 A;  5EZT X;  1FSQ A;  1CNG A;  5FNK A;  5BRV A;  3S8X A;  3M3X A;  4ZX0 A;  3PO6 A;  4Z1J A;  2Q1B A;  1RJ6 A;  4KUY A;  4M2W A;  4ZWY A;  5FL4 A;  4Y0J A;  1G52 A;  3MHM A;  7CA2 A;  1TE3 X;  5DSI A;  3V3F A;  2CBC A;  3M67 A;  1FSN A;  4PYX A;  3DVB A;  4CNV A;  2CBE A;  1CAZ A;  1CVF A;  4G0C A;  4HF3 A;  3L14 A;  3M2X A;  4ETQ C;  4Z0Q A;  3KIG A;  3NB5 A;  3DD0 A; 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