5E2RA

The crystal structure of the human carbonic anhydrase ii in complex with a 1,1'-biphenyl-4-sulfonamide inhibitor
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
GMSHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of 1,1'-Biphenyl-4-sulfonamides as a New Class of Potent and Selective Carbonic Anhydrase XIV Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 74
structure length 261
sequence length 261
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2rA00
4UOVA 3R17B 1FQNA 3DC3A 3DVCA 3OYSA 3P44A 3M3XA 4HEYA 5EHVA 5FNIA 4QEFA 4CNWA 1DCAA 1IF6A 3LXEA 2POWA 3DVBA 4Q49A 1CNCA 3TMJA 1G52A 5FLSA 1G3ZA 1TEUX 1THKA 5EZTX 3CZVA 3B4FA 3F7BA 1BN1A 4QIZA 4TWMA 4PZHA 4E49A 2HL4A 3S73B 3D93A 1Z9YA 1DMXA 4X5SA 1RZBA 1H9QA 3MNAA 4KNMA 3RG4A 1FSQA 4K0SA 4RFDA 4XFWA 3P55A 5BNLA 1Y7WA 4L5UA 1LZVA 1UGFA 4RFCA 1I9PA 2FMGA 2NWYA 3N4BA 4G7AA 3TVNX 4YYTA 4FVNA 2FOQA 1KOPA 1UGCA 3FE4A 1I9OA 3KOIA 3MNKA 5DOHA 1BNMA 4RUYA 1CRAA 4HEWA 1CCTA 4FU5A 3V2MA 3OKUA 1ZFKA 5DSOA 3S71B 2QOAA 4HU1A 5CLUA 4MDLA 4E3DA 3MHMA 3S75B 5JEHB 4G0CA 1AM6A 4Q8XA 3BETA 3N0NA 4LP6A 1UGAA 4GL1X 3MMFA 1FQRA 5DVXA 4WW6A 1ZSCA 1CCUA 4IDRX 4RIUA 1V9EA 3RGEA 4BF1A 1CNHA 3V7XA 4JSWA 5E2KA 5BRWA 2NN7A 6CA2A 4QJPA 2CBEA 1ZH9A 4KNNA 1CZMA 1IF8A 3SAPA 3BL0A 5FNGA 2FOVA 1IF7A 4E9OX 3JXGA 4YHAA 4ZWYA 5EHWA 4CQ0A 2ABEA 3K34A 3DCSA 3M2XA 3JXHC 1UGBA 1A42A 3DA2A 3P3HA 5EKHA 2NNSA 1OQ5A 2EZ7A 5E2NA 5FLQA 2ILIA 5FDIA 3M14A 5DOGA 1CINA 5SZ1A 1G0EA 2GEHA 2POVA 2CBCA 3MZCA 3D9ZA 1T9NA 4Z0QA 3RZ0B 3DVDA 4QSAA 5DSRA 3RYZA 2Q1BA 1I91A 2Q38A 4ZX1A 4Q6EA 12CAA 4XIWA 1TH9A 1CAOA 3NJ9A 4Q90A 3RLDA 4Q08A 5EOIA 3RYJB 5SZ7A 1TG3A 1G53A 4CACA 2ZNCA 4L5WA 2WD2A 5SZ4A 3FW3A 1Z97A 1G1DA 2EU2A 4KNJA 1CIMA 3SBIA 1J9WA 2NMXA 2NXTA 3F4XA 1HEDA 3M2YA 1KEQA 2EU3A 2HD6A 4ILXA 3DCWA 3S8XA 4CA2A 4Q8ZA 1ZE8A 1I8ZA 4Q81A 1V9IC 4FPTA 3IGPA 8CA2A 1MOOA 4FL7A 5FLPA 4QK1A 3ML5A 1TG9A 3V3JA 5DSIA 1BN3A 3MNJA 2QO8A 1BN4A 1F2WA 5G03A 5FLTA 5DSNA 4Q99A 2NXRA 4ETQC 5HPJA 3KWAA 3HKUA 1HUHA 5DSLA 2HFWA 1JD0A 1I9LA 3K7KA 5J8ZA 1DMYA 4K0ZA 2O4ZA 4E3FA 7CA2A 3KNEA 3HKNA 2CABA 1ZNCA 4YGJA 3MHIA 4Q9YA 5JQ0A 4ZWIA 1G45A 1RZCA 2NXSA 4KUYA 4MO8A 3OIMA 3P5LA 5FLOA 1FR4A 3HFPA 4Z1JA 1CVAA 3P4VA 3MNIA 1CANA 3T5UA 1TEQX 3GZ0A 4YXIA 3T82A 3V5GA 1BCDA 4KV0A 4M2UA 4PYYA 1HCBA 3D8WA 4E3GA 1H4NA 1FSRA 5LMDA 3KONA 5DSMA 4C3TA 1CNJA 1FQLA 3P5AA 2FOYA 1CAHA 1HEAA 3V3HB 4Q8YA 1CRMA 3DCCA 1G0FA 3U47A 1ZGEA 4Q87A 3DBUA 3KIGA 3JXFA 3T83A 5FNMA 5JG5B 4DZ9A 1XPZA 1BV3A 4YXOA 4Q7PA 3KS3A 4MLTA 3BL1A 1CVHA 3S97A 4KAPA 1OKLA 2HOCA 5A25A 4QIYA 1AZMA 1CNXA 3RJ7A 3IEOA 5BRVA 4FIKA 1CILA 5E2SA 3M5TA 1G4JA 3N2PA 1BICA 3M2ZA 4N16A 1BNQA 3MNHA 2VVAX 1HECA 2FMZA 5DSKA 5JEGB 3S72B 5JGSB 1CNBA 5DSPA 2NWZA 4JSAA 3M96A 1CAMA 3D0NA 4Q83A 1BNNA 3M1QA 1I9MA 1H9NA 3EFIA 2WEGA 3MNUA 4KUWA 4YVYA 1CA2A 4KNIA 4QSBA 5DSQA 5G01A 5JGTB 3DD8A 1EOUA 1TE3X 1LG5A 4JSZA 4Q7SA 3HS4A 3IBIA 3M67A 2W2JA 4CNRA 5CA2A 1YO2A 3KLDB 4K1QA 5FNKA 3W6IA 5SZ6A 4QTLA 4PQ7A 4L5VA 3RG3A 3OKVA 2HNCA 3DV7A 4XIXA 5CACA 4ZWXA 4YXUA 4RN4A 4KUVA 1YO1A 4ITOA 4RUXA 3CAJA 4KP8A 3PO6A 1IF5A 4Q78A 4HT0A 3V2JA 3NB5A 1RZEA 2FNKA 3M2NA 2CA2A 2WEJA 3SBHA 5EHEA 3HKQA 1XEVA 1CVFA 5JDVB 1CNGA 1TB0X 4LHIA 5FNLA 4QJXA 1BNTA 1ZFQA 2Q1QA 3MYQA 5SZ3A 5CJFA 3OYQA 4E5QA 5IPZA 3ZNCA 3V3IB 1BZMA 5DSJA 5E28A 2WEOA 3MHCA 3EFTA 3PYKA 4ZAOA 4XZ5A 1CA3A 1FSNA 5SZ0A 4Q7VA 1BNUA 2H4NA 3U45X 5G0CA 4Q7WA 1OKMA 3V3GB 2AW1A 2X7TA 2CBBA 2NWPA 3W6HA 1CAJA 4XE1A 3QYKA 1FQMA 1RZDA 3VBDA 3OIKA 1RJ5A 4HEZA 5A6HA 4QK2A 3P3JA 4M2VA 3U7CA 4YGKA 1AVNA 5E5RA 3B1BA 3F8EA 5EH7A 4N0XB 1CVEA 3P58A 4Q07A 3CA2A 4Q09A 4DZ7A 4Z1KA 4QK3A 4R5BA 4WUQA 4K0TA 5C8IA 5L6KA 3IBUA 1YO0A 4QSJA 3KOKA 4R59A 2F14A 3UYQA 4ZX0A 1XQ0A 1ZSAA 1G46A 3N3JA 5BRUA 1DCBA 2FNMA 1G54A 5EH8A 1CAZA 5JEPB 3IAIA 1RZAA 4Y0JA 2FOSA 3S74B 1FR7A 5L3OA 3M40A 5EIJA 1RJ6A 2WD3A 3HLJA 3T85A 4WR7A 1CAIA 3DD0A 1CNWA 1MUAA 4HT2A 4QSIA 1TTMA 3L14A 3ML2A 2IT4A 2NWOA 4QJWA 4KP5A 4E4AA 4Q6DA 1FLJA 3RYYA 1CNKA 3S76A 1LGDA 5BYIA 3SAXA 5FL5A 3PJJA 1CVCA 4YX4A 1UGGA 4HF3A 1CALA 5EKMA 4RH2A 3R16A 4K13A 2FOUA 3M1WA 1TBTX 4Q06A 2OSMA 1YDAA 5AMGA 4YGNA 3IBNA 1CVDA 1BNWA 1I9QA 3MHOA 2CBAA 3F7UA 3S78B 2HKKA 2VVBX 3S77B 4MDMA 4YGFA 1CAYA 5FNHA 3RYVB 1UGEA 3Q31A 2CBDA 4YWPA 1XEGA 1ZSBA 3FFPX 3OY0A 1YDBA 4LU3A 5AMLA 1YDCA 3MWOA 4M2WA 3U3AX 3RZ7A 5JG3B 4R5AA 4WL4A 4PXXA 1I9NA 3K2FA 2AX2A 5FNJA 1LUGA 2X7UA 4PYXA 2NN1A 4QY3A 1HCAA 5SZ2A 4BCWA 2NNGA 2OSFA 1CNIA 3M5EA 5AMDA 3C7PA 4QJOA 2X7SA 3D92A 3MHLA 3ZP9A 4COQA 3DC9A 3DAZA 3RYXB 4HBAA 1OKNA 5DRSA 1G4OA 3V3FA 3RZ1B 2QP6A 4MDGA 5E2MA 5G0BA 1KWRA 5FDCA 1KWQA 3M1KA 3RZ8A 1CVBA 4JS6A 4Z1EA 4YGLA 5FLRA 1IF9A 5FL6A 4ZWZA 9CA2A 3M1JA 3M5SA 3MDZA 4IWZA 1JV0A 4CNXA 2NNVA 3OILA 4QJMA 5E2RA 4RUZA 4ITPA 1LG6A 4WUPA 4Q0LA 1UGDA 1HVAA 2FW4A 1ZGFA 3TVOX 4CNVA 1HUGA 5EKJA 5JQTA 1CNYA 1JCZA 3M98A 4QJ0A 5JESB 3S9TA 2WEHA 3HKTA 4TWLA 4RIVA 1G6VA 1RAZA 2NNOA 4M2RA 4WW8A 5SZ5A 4MLXA 3RZ5A 4E3HA 2GD8A 1HEBA 1KOQA 4Z1NA 2POUA 2FNNA 4FRCA 2H15A 1BNVA 1CCSA 3CYUA 4FVOA 3KKXA 1URTA 3NI5A 1RAYA 3T5ZA 3T84A 3UYNA 1G48A 4MTYA 4BF6A 3M04A 5EH5A 5E5UA 1IF4A 1I90A 1YDDA 3IBLA 1Z93A 4JSSA 1CAKA 5FL4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4UOV A;  3R17 B;  1FQN A;  3DC3 A;  3DVC A;  3OYS A;  3P44 A;  3M3X A;  4HEY A;  5EHV A;  5FNI A;  4QEF A;  4CNW A;  1DCA A;  1IF6 A;  3LXE A;  2POW A;  3DVB A;  4Q49 A;  1CNC A;  3TMJ A;  1G52 A;  5FLS A;  1G3Z A;  1TEU X;  1THK A;  5EZT X;  3CZV A;  3B4F A;  3F7B A;  1BN1 A;  4QIZ A;  4TWM A;  4PZH A;  4E49 A;  2HL4 A;  3S73 B;  3D93 A;  1Z9Y A;  1DMX A;  4X5S A;  1RZB A;  1H9Q A;  3MNA A;  4KNM A;  3RG4 A;  1FSQ A;  4K0S A;  4RFD A;  4XFW A;  3P55 A;  5BNL A;  1Y7W A;  4L5U A;  1LZV A;  1UGF A;  4RFC A;  1I9P A;  2FMG A;  2NWY A;  3N4B A;  4G7A A;  3TVN X;  4YYT A;  4FVN A;  2FOQ A;  1KOP A;  1UGC A;  3FE4 A;  1I9O A;  3KOI A;  3MNK A;  5DOH A;  1BNM A;  4RUY A;  1CRA A;  4HEW A;  1CCT A;  4FU5 A;  3V2M A;  3OKU A;  1ZFK A;  5DSO A;  3S71 B;  2QOA A;  4HU1 A;  5CLU A;  4MDL A;  4E3D A;  3MHM A;  3S75 B;  5JEH B;  4G0C A;  1AM6 A;  4Q8X A;  3BET A;  3N0N A;  4LP6 A;  1UGA A;  4GL1 X;  3MMF A;  1FQR A;  5DVX A;  4WW6 A;  1ZSC A;  1CCU A;  4IDR X;  4RIU A;  1V9E A;  3RGE A;  4BF1 A;  1CNH A; 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