5E5UA

Crystal structure of the complex between carbonic anhydrase-like domain of ptprg and immunoglobulin domains 2-3 of cntn6
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
DPYWAYSGAYGPEHWVTSSVSCGGSHQSPIDILDHHARVGDEYQELQLDGFDNESSNKTWMKNTGKTVAILLKDDYFVSGAGLPGRFKAEKVEFHWGHSNGSAGSEHSVNGRRFPVEMQIFFYNPDDFDSFQTAISENRIIGAMAIFFQVSPRDNSALDPIIHGLKGVVHHEKETFLDPFILRDLLPASLGSYYRYTGSLTTPPCSEIVEWIVFRRPVPISYHQLEAFYSIFTTEQQDHVKSVEYLRNNFRPQQALNDRVVSKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Cell adhesion/hydrolase
molecule keywords Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma
publication title Structural Basis for Interactions Between Contactin Family Members and Protein-tyrosine Phosphatase Receptor Type G in Neural Tissues.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 73
structure length 264
sequence length 264
chains with identical sequence C
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2015-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e5uA00
1BCDA 3OYSA 4Z0QA 2NWYA 1CAMA 4R5AA 3P58A 3S77B 1HUHA 3V3GB 1I9LA 3DCSA 1CNGA 3F8EA 5AMDA 5CLUA 1MOOA 2POUA 1RZDA 1H4NA 4CACA 3GZ0A 1BZMA 1CAJA 3BL1A 5E2NA 1CNKA 1YDAA 3MHLA 5FDCA 2NNOA 3M2YA 1UGBA 4E9OX 3S78B 2O4ZA 4QJ0A 4QJMA 3DVDA 2EU3A 5JQ0A 4PZHA 1CNIA 1T9NA 5G03A 2X7SA 4QIZA 5HPJA 4QJPA 1CAOA 1KOPA 4Q90A 1FSQA 1URTA 1I9QA 1Y7WA 3W6HA 4Q7PA 4RUZA 4HT0A 3M96A 3MZCA 5SZ6A 3M1QA 2AX2A 3R16A 2EU2A 3M2ZA 1FR7A 3M2NA 3K7KA 5E2RA 1ZFQA 1IF5A 2Q1BA 3M2XA 2H4NA 3MHIA 5FLOA 5DOHA 3CYUA 4R59A 3M14A 4FRCA 1LG6A 1AVNA 4KUWA 2CBAA 4QK3A 1JCZA 4QK1A 1JD0A 1FSRA 3Q31A 1IF8A 5FNKA 3RYYA 4HT2A 5E5RA 5CACA 4MDGA 5JEGB 3KKXA 3V3HB 1BV3A 4PYYA 4ZX1A 4FU5A 1UGCA 1CAYA 5L3OA 4Q0LA 2HNCA 1G0EA 3K2FA 2Q1QA 3K34A 3P5LA 5E2SA 4PYXA 1H9NA 1G54A 4TWLA 4XZ5A 2GD8A 2NWOA 3N3JA 3S8XA 3OYQA 5E28A 3P44A 5FNJA 2CA2A 4Q08A 5CJFA 3D92A 4QSBA 3CZVA 1FR4A 3ZNCA 3JXFA 3T85A 5DSQA 1I91A 3RYXB 3U45X 3DD8A 1XEVA 4N16A 5J8ZA 4PXXA 5SZ4A 1FQLA 1CCUA 5EKMA 1IF4A 4L5UA 5DSOA 1G48A 5EZTX 2NWPA 4YXOA 3RJ7A 3CA2A 2FOVA 1TEQX 1ZNCA 4Z1KA 4K1QA 1YO2A 1BNVA 1YO0A 3T5UA 1CVFA 2CBCA 1HCBA 5JEPB 4Z1EA 1LUGA 4Q8YA 2FOYA 8CA2A 3TVNX 2WEJA 4E5QA 5EIJA 1A42A 3RG3A 1XEGA 1YO1A 1BN3A 3UYQA 1TTMA 1CNXA 3MNAA 3OKUA 5EKHA 2CBEA 1DMXA 1BNUA 2FOQA 2NN1A 3F7BA 1IF9A 5FNGA 3F4XA 3P4VA 3KONA 1CIMA 3DVCA 1G53A 3ML2A 2IT4A 3MWOA 2NXRA 2HFWA 4YGNA 1CNHA 4M2WA 4YVYA 2GEHA 1CVHA 2ILIA 4UOVA 1RZBA 4QTLA 2QO8A 5EH8A 5FNIA 4HEZA 4WW8A 3V7XA 1FQRA 4KP8A 2EZ7A 4TWMA 5DSPA 1CINA 1OQ5A 4HEWA 4RFCA 3N2PA 4YHAA 4ZWYA 4Q8XA 1I9MA 5E2MA 4KNNA 2HOCA 1ZH9A 2POWA 4MTYA 3U3AX 1CALA 4ILXA 3S71B 3DV7A 7CA2A 1KOQA 5EHEA 2ZNCA 1CAHA 1HEBA 4CA2A 4CNRA 4QSIA 3D93A 5FNMA 3T82A 3MNIA 4Q07A 3M1JA 4RFDA 3S75B 3M04A 5SZ5A 1UGFA 5EHWA 4YYTA 4ZWZA 3DAZA 4KV0A 4Q7SA 3DCWA 3M1WA 1RJ6A 3S73B 4YGKA 4E3FA 4WL4A 5FDIA 3FW3A 2NNGA 1CAZA 5G0CA 1G45A 4ITOA 1Z93A 3OKVA 5DSJA 3D8WA 1HVAA 2NNSA 2W2JA 4Q6DA 2WEGA 4K0ZA 4JSWA 4FVNA 4KAPA 3M5EA 1BNQA 4RH2A 4YWPA 1ZE8A 3KWAA 3PO6A 3DBUA 3MHCA 1RZAA 3RZ5A 1ZSBA 1G0FA 2FMGA 4KUYA 4COQA 5AMLA 3KNEA 1G4JA 1LGDA 3IBLA 1YDDA 1HCAA 3V3FA 3MYQA 1CNJA 2F14A 1CILA 3T84A 3OIMA 1CVCA 5DSLA 1CZMA 2NMXA 1H9QA 1ZFKA 1OKNA 3HLJA 4M2RA 4PQ7A 3S76A 5FL4A 4C3TA 4E3GA 1HEDA 1G3ZA 3C7PA 3V3JA 4YX4A 4QEFA 3RGEA 4BCWA 4YGFA 3RZ7A 4QJOA 5G0BA 1CVBA 3P3HA 2FOSA 4Q7VA 1I90A 3DCCA 1CRMA 1BN4A 5DSRA 4L5VA 5FL5A 4E4AA 5BRUA 1Z97A 1RAYA 4IWZA 4JSSA 1IF7A 4KNJA 3HFPA 5DSMA 4WW6A 1BNWA 3M67A 4QJXA 4Z1NA 4XFWA 3DA2A 3IAIA 2WEHA 3MHOA 4WR7A 3PJJA 3MNKA 4Q78A 4QK2A 3ML5A 3R17B 1XPZA 5A6HA 5JG5B 1CNWA 3S97A 5SZ0A 5SZ3A 4LHIA 4ETQC 4QJWA 2NXSA 5FLPA 3DC9A 5E5UA 1TH9A 3RYJB 4Q87A 1UGAA 4XIXA 3S72B 3SBIA 1CVAA 2WEOA 3HS4A 1ZGEA 5EH7A 4DZ7A 1RZCA 1AM6A 3MNUA 1OKLA 5FLSA 1TB0X 4M2UA 5JESB 1F2WA 5C8IA 2AW1A 1UGEA 1CA2A 4N0XB 4Q09A 3IBUA 4Y0JA 3V2JA 1TG9A 1J9WA 3DVBA 1MUAA 5JEHB 3NB5A 5FLQA 4CNVA 5LMDA 4MLTA 4KNMA 3D9ZA 4HU1A 4IDRX 4Q9YA 3MHMA 5E2KA 5EHVA 9CA2A 1BICA 3SBHA 4GL1X 1KWQA 4E3HA 1YDBA 3P5AA 3B4FA 1CNCA 1RAZA 3M3XA 4XE1A 4L5WA 1G46A 4CNWA 5EOIA 1ZSCA 4BF1A 4Q49A 4G7AA 4Z1JA 1KWRA 4QSJA 4YGLA 1I8ZA 1ZGFA 4QIYA 3UYNA 4Q8ZA 4FL7A 4Q83A 3N0NA 3T83A 4K13A 5A25A 5DSNA 4MO8A 1CNYA 4JSAA 3EFIA 1I9NA 3SAPA 1DMYA 2QOAA 4ZWXA 4Q06A 2H15A 5JQTA 5DRSA 1CVEA 5FLRA 3RZ1B 3OILA 4M2VA 2VVAX 4RUYA 3PYKA 4ZX0A 4FVOA 4HEYA 1BNTA 4RUXA 2ABEA 5FNHA 5IPZA 4FPTA 1CAKA 1CCTA 4RIUA 3ZP9A 1KEQA 4ITPA 5CA2A 4Q81A 1CCSA 1YDCA 3SAXA 3EFTA 1DCBA 1UGGA 3KOKA 2HL4A 3P3JA 3DC3A 4JS6A 3W6IA 5BNLA 1HECA 2HKKA 3HKQA 1EOUA 1G52A 4K0SA 2X7TA 1CANA 1TE3X 4DZ9A 5FL6A 3HKNA 5JDVB 3JXHC 3RYVB 3RG4A 1TEUX 4HBAA 2FW4A 1CNBA 1DCAA 1XQ0A 3KOIA 1RJ5A 1CAIA 1FQMA 4WUQA 3QYKA 5DSKA 1CRAA 1TG3A 2HD6A 3KS3A 2CBDA 3L14A 4WUPA 4YGJA 4BF6A 2FOUA 2VVBX 3P55A 1HEAA 5FLTA 1V9EA 4ZWIA 3MMFA 2X7UA 4YXUA 1I9PA 1G6VA 3S9TA 6CA2A 1BN1A 2NNVA 2WD2A 2FNMA 4XIWA 2FNKA 1THKA 3HKTA 4K0TA 2POVA 4CNXA 1IF6A 3M5SA 5AMGA 3B1BA 1TBTX 1UGDA 3MDZA 12CAA 1JV0A 3S74B 5SZ7A 2FMZA 4HF3A 1BNNA 1G1DA 3KLDB 3KIGA 3M1KA 4LU3A 3IBIA 3IBNA 3NJ9A 4QY3A 1LG5A 4FIKA 5DOGA 5BRWA 3BETA 4QSAA 3MNHA 4KUVA 1I9OA 3D0NA 2NXTA 3RZ8A 1Z9YA 5JGTB 3NI5A 1OKMA 3JXGA 2NWZA 1AZMA 4RN4A 1LZVA 4JSZA 1BNMA 4G0CA 3RLDA 2QP6A 4Q99A 2CBBA 2OSFA 5JGSB 3F7UA 4E3DA 4Q7WA 4MDLA 3IEOA 4R5BA 4RIVA 3V3IB 3OY0A 1RZEA 3VBDA 4LP6A 4E49A 5FNLA 5SZ2A 4MDMA 3CAJA 3OIKA 3M98A 3RYZA 3U7CA 3M5TA 1ZSAA 3M40A 3RZ0B 3MNJA 3TVOX 2Q38A 1FQNA 3V5GA 1HUGA 5JG3B 4Q6EA 2CABA 2NN7A 5BRVA 3FFPX 4ZAOA 3IGPA 3HKUA 3V2MA 2FNNA 1CA3A 3LXEA 5EKJA 1CVDA 1V9IC 5G01A 3U47A 2OSMA 3DD0A 1FLJA 4CQ0A 5L6KA 5DVXA 4KNIA 5EH5A 4KP5A 1G4OA 3T5ZA 5SZ1A 5BYIA 2WD3A 3BL0A 3N4BA 5DSIA 4MLXA 4YXIA 4X5SA 1FSNA 3TMJA 3FE4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BCD A;  3OYS A;  4Z0Q A;  2NWY A;  1CAM A;  4R5A A;  3P58 A;  3S77 B;  1HUH A;  3V3G B;  1I9L A;  3DCS A;  1CNG A;  3F8E A;  5AMD A;  5CLU A;  1MOO A;  2POU A;  1RZD A;  1H4N A;  4CAC A;  3GZ0 A;  1BZM A;  1CAJ A;  3BL1 A;  5E2N A;  1CNK A;  1YDA A;  3MHL A;  5FDC A;  2NNO A;  3M2Y A;  1UGB A;  4E9O X;  3S78 B;  2O4Z A;  4QJ0 A;  4QJM A;  3DVD A;  2EU3 A;  5JQ0 A;  4PZH A;  1CNI A;  1T9N A;  5G03 A;  2X7S A;  4QIZ A;  5HPJ A;  4QJP A;  1CAO A;  1KOP A;  4Q90 A;  1FSQ A;  1URT A;  1I9Q A;  1Y7W A;  3W6H A;  4Q7P A;  4RUZ A;  4HT0 A;  3M96 A;  3MZC A;  5SZ6 A;  3M1Q A;  2AX2 A;  3R16 A;  2EU2 A;  3M2Z A;  1FR7 A;  3M2N A;  3K7K A;  5E2R A;  1ZFQ A;  1IF5 A;  2Q1B A;  3M2X A;  2H4N A;  3MHI A;  5FLO A;  5DOH A;  3CYU A;  4R59 A;  3M14 A;  4FRC A;  1LG6 A;  1AVN A;  4KUW A;  2CBA A;  4QK3 A;  1JCZ A;  4QK1 A;  1JD0 A;  1FSR A;  3Q31 A;  1IF8 A;  5FNK A;  3RYY A;  4HT2 A;  5E5R A;  5CAC A;  4MDG A;  5JEG B;  3KKX A;  3V3H B;  1BV3 A;  4PYY A;  4ZX1 A;  4FU5 A;  1UGC A;  1CAY A;  5L3O A;  4Q0L A; 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