5FL5A

Three dimensional structure of human carbonic anhydrase ix in complex with 5-(1-(4-methoxyphenyl)-1h-1,2,3-triazol-4-yl)thiophene-2- sulfonamide
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
Knots found
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
WRYGGDPPWPRVSPACAGRFQSPVDIRPQLAAFSPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQLHLHWGAAGRPGSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGPEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWTVFNQTVMLSAKQLHTLSDTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Efficient Expression and Crystallization System of the Cancer Asociated Carbonic Anhydrase Isoform Ix.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE IX
total genus 68
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fl5A00
4HT2A 3DC3A 5HPJA 2WEOA 5JDVB 1CNBA 4YGFA 4M2VA 4Q7SA 4QJ0A 1IF6A 2HFWA 3PYKA 5L6KA 5EH5A 3ML2A 5DRSA 5JQ0A 2POUA 4Q9YA 1OQ5A 2GD8A 1CNIA 4Q8ZA 5JG3B 5SZ4A 2HNCA 3P5LA 2NNSA 1UGGA 1BCDA 3S76A 4JSSA 1DMXA 1H4NA 5FNLA 2NWPA 3EFIA 3KONA 1G46A 3K7KA 3S77B 3MZCA 4KUWA 5FL4A 5JGTB 4M2WA 1CNCA 4CA2A 3MNKA 1CVHA 3MNHA 1UGBA 1JD0A 4HEZA 1V9IC 1G3ZA 5E2MA 4E49A 3P58A 1MUAA 4MDGA 4UOVA 3OY0A 2FOVA 5SZ7A 1ZSAA 4R5BA 5EHVA 2H4NA 1CAKA 1G6VA 2FNNA 1CA2A 5FL5A 1RZCA 7CA2A 4FVOA 1IF9A 4L5UA 3MHIA 2X7SA 2FOUA 2VVBX 1CINA 4KV0A 1FLJA 1I8ZA 1TEUX 5EOIA 3OYSA 3RZ1B 4QSJA 4R5AA 2CBDA 1BN1A 1G1DA 3NB5A 1ZGEA 4DZ7A 1ZNCA 3C7PA 3HLJA 5FDIA 1HEBA 1MOOA 3SAXA 1CVEA 5FLSA 4QK2A 5FNIA 3T83A 4ZAOA 3MHCA 4L5VA 4Z1JA 4FPTA 4G0CA 3V2MA 5G0CA 4KNIA 3M67A 4WUQA 3S97A 4QJOA 4M2UA 2Q38A 1BZMA 1RZAA 5FLPA 5EKJA 3U3AX 1THKA 1ZSBA 3N0NA 4Q09A 3CZVA 2WD2A 5JG5B 4C3TA 5DSOA 1TE3X 3BETA 3RZ7A 3DAZA 4QIYA 3N2PA 1YDAA 3B4FA 1I9OA 3FFPX 1I9NA 3V3IB 1CAJA 1LG5A 4MLXA 3RLDA 12CAA 2Q1QA 5BRWA 2CABA 5J8ZA 1FQRA 4JS6A 1CCUA 3IEOA 3S9TA 4QSAA 4CNVA 1Z97A 4LHIA 3S74B 4K0ZA 1CAIA 3V3FA 4RUXA 4YYTA 4L5WA 3SAPA 3R17B 5DSIA 3D93A 4HBAA 1BNWA 4K13A 5SZ3A 4Q99A 1ZFKA 4CQ0A 3HKQA 2FMZA 3F8EA 3LXEA 5EKHA 1CA3A 4Z0QA 3UYQA 2NXRA 1JV0A 3ZNCA 4RUZA 5DSQA 4YX4A 5G0BA 1BNUA 1CANA 1XEGA 1KWRA 3M2ZA 5DSMA 4YXIA 4YGLA 3U7CA 2Q1BA 1CAYA 5JEHB 1CVCA 3M5EA 4CACA 1H9NA 4RH2A 1TG9A 3BL1A 1BN4A 2ILIA 4R59A 1CNGA 4HEYA 5JEPB 4ITPA 3U47A 1KOPA 4PYXA 3HKNA 3SBHA 1BNMA 4FIKA 9CA2A 3TMJA 5EIJA 3RYZA 4HT0A 1XPZA 4E4AA 4WW8A 3MHOA 4Q78A 2NMXA 4XE1A 2HD6A 1FSRA 4XZ5A 1DCBA 1AZMA 3OILA 4ZWXA 3N4BA 3T82A 4QK1A 2OSMA 2NNOA 3IAIA 4Z1NA 3M1KA 4KNMA 3DV7A 4YGKA 3D92A 5DSLA 4WUPA 5G03A 4WW6A 2X7UA 5DOGA 5SZ0A 4ZX1A 4Q06A 2WD3A 3RYXB 4KNJA 3IBIA 5EH7A 1CNWA 3MNAA 3M14A 3HFPA 4TWLA 3V3GB 3IGPA 5DSKA 3S75B 2HKKA 3U45X 3RYJB 1FQNA 2NNVA 3IBNA 3RGEA 3V5GA 4QJXA 3JXHC 4XIXA 1XEVA 4JSWA 4RIVA 1ZGFA 5JEGB 3W6IA 4TWMA 2EU3A 3K34A 4ZX0A 1I9QA 1CNKA 1CNYA 4LP6A 1KOQA 3M3XA 3S72B 2NWOA 1BNQA 1A42A 3PO6A 5E2SA 3OIMA 1F2WA 4Q7PA 4QIZA 3DCWA 5DVXA 3DA2A 1AM6A 3M98A 3P3HA 4YGNA 2ZNCA 3CYUA 4QSBA 3OYQA 3M1JA 3P3JA 2OSFA 2CBAA 3RZ5A 5FLTA 1CVDA 5AMLA 5EH8A 1KEQA 3RYYA 3V3HB 3M96A 1BV3A 4HF3A 2W2JA 3KS3A 3R16A 3VBDA 1Z9YA 5JESB 3KOIA 3P55A 2EZ7A 3OIKA 5BYIA 2FMGA 1BN3A 5EHEA 4RIUA 1RZBA 3KWAA 1YO1A 5SZ5A 2CA2A 3M40A 3RYVB 5BRUA 3MHMA 4ITOA 1J9WA 4QK3A 3MNIA 1BNNA 2FOYA 6CA2A 2CBEA 1CCSA 3PJJA 1TTMA 3F7BA 5C8IA 1UGFA 1XQ0A 4PQ7A 4PZHA 3KNEA 2CBBA 4K0SA 5JGSB 3MDZA 3BL0A 4XIWA 1LUGA 4YGJA 4ETQC 3L14A 2EU2A 4G7AA 1G48A 1G4OA 2NWZA 3B1BA 3DCSA 3IBUA 4DZ9A 5LMDA 1UGAA 3D0NA 1HUGA 1OKNA 3T84A 3S78B 5CACA 1TBTX 2NXSA 4QJMA 5E2KA 1EOUA 5AMDA 5IPZA 3M1WA 1URTA 3RZ8A 3P44A 2NWYA 4YWPA 1BICA 4Q49A 1FR7A 4Z1EA 4CNWA 1UGCA 2GEHA 2QOAA 4WR7A 2AW1A 2NXTA 5E5UA 4FVNA 4Z1KA 1V9EA 1CCTA 1IF7A 3RJ7A 4QJPA 1FQLA 4BF6A 4QSIA 4BF1A 4QEFA 1I9LA 4FRCA 5CJFA 1OKLA 2H15A 1FR4A 1YDCA 3P5AA 5A6HA 1CVFA 4YXUA 1CAMA 2QP6A 3V3JA 4Q0LA 1FSNA 4LU3A 1G0FA 4MO8A 2WEJA 1CNJA 4Q8YA 2FOQA 1HEDA 5CLUA 1CNXA 4QTLA 1G45A 3F7UA 3D8WA 4ZWYA 3V2JA 4MTYA 2POVA 3RG4A 1FQMA 2AX2A 3MHLA 1BNTA 3D9ZA 4Q8XA 5E2RA 4KUVA 8CA2A 1AVNA 3V7XA 4RN4A 5BRVA 2NN7A 4XFWA 1G0EA 2ABEA 3F4XA 3KKXA 5SZ1A 1OKMA 3Q31A 1RJ6A 3MNUA 1Z93A 5E28A 5JQTA 1YDBA 4Q08A 3T5UA 4Q83A 1ZH9A 4Y0JA 3K2FA 5FNGA 1I9MA 4WL4A 1FSQA 5L3OA 5FLRA 3HKUA 3KOKA 4N16A 3SBIA 3FW3A 5SZ6A 4COQA 4KP5A 5EKMA 3TVOX 4CNRA 3KIGA 1IF4A 1ZSCA 1H9QA 2FOSA 4HU1A 5FNMA 1G53A 3OKUA 5FNKA 1YO0A 4IWZA 5AMGA 2FNMA 3NI5A 4KNNA 3DVDA 1CNHA 3GZ0A 5DSPA 3T85A 2FW4A 3M2YA 3MMFA 4ZWZA 3NJ9A 5FNHA 2WEHA 1CZMA 1HECA 1LG6A 4FL7A 1CRAA 3ML5A 4KP8A 4Q90A 4E3FA 1TH9A 1I90A 4X5SA 4GL1X 2IT4A 4ZWIA 2HOCA 4E3DA 1RZEA 3HKTA 4PXXA 5FL6A 3M1QA 3M5TA 1I9PA 3W6HA 4YHAA 3CA2A 4RUYA 5EHWA 3DC9A 1TEQX 3QYKA 4KAPA 3M04A 1KWQA 4Q87A 3S73B 5E2NA 4E9OX 1LZVA 1JCZA 1RZDA 1UGEA 1RJ5A 1UGDA 4PYYA 1RAZA 1YO2A 4JSZA 1DCAA 2NNGA 3JXGA 4QY3A 1CIMA 1TG3A 1HCAA 4CNXA 2QO8A 4E5QA 4Q81A 5DSNA 4Q6EA 5BNLA 5G01A 1CAOA 2F14A 2NN1A 4M2RA 3CAJA 1CAHA 3S71B 3ZP9A 5CA2A 1LGDA 2O4ZA 3DVBA 1CAZA 4IDRX 4K0TA 1CVAA 3MNJA 1HVAA 3DBUA 3OKVA 4YXOA 1ZFQA 4FU5A 4Q7WA 1BNVA 4E3HA 5A25A 1RAYA 4MLTA 2VVAX 4K1QA 4BCWA 4MDLA 3IBLA 1CALA 4JSAA 2WEGA 4MDMA 1G52A 1HCBA 5DOHA 3EFTA 5E5RA 3UYNA 5EZTX 2CBCA 1I91A 3JXFA 1G4JA 5SZ2A 1HUHA 1IF8A 1G54A 1CRMA 3DD0A 4QJWA 2POWA 3MWOA 5FLOA 3HS4A 3DCCA 3DVCA 4ILXA 3MYQA 3M5SA 3M2NA 4N0XB 1YDDA 5DSRA 1DMYA 1Y7WA 4YVYA 1CILA 3KLDB 4RFDA 1CVBA 4Q07A 3RZ0B 5FDCA 2FNKA 4HEWA 3P4VA 1TB0X 5FNJA 3S8XA 3DD8A 4RFCA 3M2XA 1ZE8A 3RG3A 5FLQA 1IF5A 1HEAA 3FE4A 3TVNX 4E3GA 1T9NA 3N3JA 2HL4A 4KUYA 4Q6DA 4Q7VA 3T5ZA 2X7TA 5DSJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HT2 A;  3DC3 A;  5HPJ A;  2WEO A;  5JDV B;  1CNB A;  4YGF A;  4M2V A;  4Q7S A;  4QJ0 A;  1IF6 A;  2HFW A;  3PYK A;  5L6K A;  5EH5 A;  3ML2 A;  5DRS A;  5JQ0 A;  2POU A;  4Q9Y A;  1OQ5 A;  2GD8 A;  1CNI A;  4Q8Z A;  5JG3 B;  5SZ4 A;  2HNC A;  3P5L A;  2NNS A;  1UGG A;  1BCD A;  3S76 A;  4JSS A;  1DMX A;  1H4N A;  5FNL A;  2NWP A;  3EFI A;  3KON A;  1G46 A;  3K7K A;  3S77 B;  3MZC A;  4KUW A;  5FL4 A;  5JGT B;  4M2W A;  1CNC A;  4CA2 A;  3MNK A;  1CVH A;  3MNH A;  1UGB A;  1JD0 A;  4HEZ A;  1V9I C;  1G3Z A;  5E2M A;  4E49 A;  3P58 A;  1MUA A;  4MDG A;  4UOV A;  3OY0 A;  2FOV A;  5SZ7 A;  1ZSA A;  4R5B A;  5EHV A;  2H4N A;  1CAK A;  1G6V A;  2FNN A;  1CA2 A;  5FL5 A;  1RZC A;  7CA2 A;  4FVO A;  1IF9 A;  4L5U A;  3MHI A;  2X7S A;  2FOU A;  2VVB X;  1CIN A;  4KV0 A;  1FLJ A;  1I8Z A;  1TEU X;  5EOI A;  3OYS A;  3RZ1 B;  4QSJ A;  4R5A A;  2CBD A;  1BN1 A;  1G1D A;  3NB5 A;  1ZGE A;  4DZ7 A;  1ZNC A;  3C7P A;  3HLJ A;  5FDI A;  1HEB A;  1MOO A;  3SAX A;  1CVE A;  5FLS A;  4QK2 A;  5FNI A;  3T83 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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