5FL6A

Three dimensional structure of human carbonic anhydrase ix in complex with 5-(1-(4-methylphenyl)-1h-1,2,3-triazol-4-yl)thiophene-2- sulfonamide
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
Knots found
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
WRYGGDPPWPRVSPACAGRFQSPVDIRPQLAAFSPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQLHLHWGAAGRPGSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGPEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWTVFNQTVMLSAKQLHTLSDTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Efficient Expression and Crystallization System of the Cancer Asociated Carbonic Anhydrase Isoform Ix.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE IX
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 66
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fl6A00
1UGAA 1G54A 4E3FA 1ZNCA 4HF3A 3ZNCA 5C8IA 3IEOA 4K0TA 3DVDA 3MHLA 4FU5A 3S71B 1CINA 3RZ1B 1CRAA 1FR7A 3KKXA 1J9WA 3KNEA 3MDZA 3MNKA 1TG3A 4M2RA 3D92A 3KLDB 4Q9YA 4E3GA 3DC9A 5AMLA 4JSAA 5G0BA 3HKQA 1CA3A 1Z93A 4KUYA 1I9PA 3M5SA 3U3AX 1G45A 4YXOA 3PO6A 5EHVA 3IAIA 1CNCA 4LHIA 3F4XA 1YDAA 2NNVA 2OSMA 4K0ZA 3D0NA 1CANA 3IBNA 2X7TA 5FLPA 2CBCA 1A42A 1TEQX 1F2WA 1FQLA 2WEJA 1YO1A 5BRUA 5DSNA 3M2ZA 3RZ7A 1XEGA 4KNNA 5JEGB 2NN7A 3N4BA 1RAZA 3W6IA 2O4ZA 5JEPB 5A25A 4Q7SA 1RZBA 1CNGA 2QP6A 1T9NA 5DSOA 1CRMA 1H4NA 2H15A 4G0CA 1FQMA 3MNHA 1CVDA 1LUGA 3OKUA 1XPZA 4ZWZA 3KOIA 5E2RA 1CVFA 4QJPA 2FOYA 4MLTA 3RG3A 4XIWA 3MHCA 3S77B 4QJWA 3IBIA 4M2WA 1DMYA 5EH8A 1CAHA 2NMXA 3GZ0A 3M1JA 3MNAA 3P5LA 1ZGEA 3RGEA 4R5BA 4YGJA 3CYUA 3NB5A 1UGCA 1I9OA 3ZP9A 1IF7A 1CVAA 1DCBA 3M96A 1CIMA 3U47A 1TTMA 1H9QA 4FVOA 3JXFA 4QSIA 4QSAA 2EU3A 4IDRX 5JG3B 1CVHA 2F14A 3KOKA 4PYXA 5G0CA 2ABEA 4CA2A 5LMDA 5BYIA 1CNKA 2GD8A 1BNUA 3RG4A 3IBUA 3OKVA 5FLSA 5CJFA 4QY3A 1CNYA 2NNGA 1RZDA 3N3JA 5AMGA 5JG5B 2VVBX 4FVNA 3TMJA 3M40A 4KNJA 1CZMA 4CQ0A 1I9NA 7CA2A 4ZAOA 4KUWA 4JSWA 4CACA 2EU2A 3N2PA 3LXEA 1YDCA 1OQ5A 4CNRA 3M2XA 4Z0QA 4CNVA 1KOQA 5DVXA 2OSFA 5BRWA 4Q0LA 1TH9A 1I9LA 3DBUA 5E5UA 5FNMA 1RJ6A 1CNBA 5L3OA 1CAIA 2IT4A 1BNWA 1G0EA 4Y0JA 4Z1KA 1LG5A 1IF6A 3M1KA 1LG6A 1G53A 3MNIA 1CVCA 3UYQA 1BN1A 1Z97A 3QYKA 3DAZA 1HCAA 3M2NA 3P3JA 4IWZA 4N16A 3OY0A 3RYYA 3EFIA 4RUZA 4KV0A 4E4AA 1CALA 2FOUA 2GEHA 1FR4A 4Q87A 4YHAA 4HEWA 5EIJA 1RZCA 5EOIA 3RZ8A 3S8XA 5FL4A 3P5AA 4HBAA 1AZMA 3FE4A 3DVBA 1BNVA 3RYZA 5DRSA 3M04A 4PZHA 3DV7A 5E2MA 4ETQC 1CA2A 4KP5A 4ITOA 1FQNA 5E2SA 1TG9A 4Z1NA 4RIVA 1V9EA 1XEVA 3JXHC 5G03A 8CA2A 4DZ9A 2CBEA 1EOUA 1ZE8A 4Q08A 4R5AA 5FL6A 4ZWIA 4GL1X 4CNWA 3T5UA 1THKA 5FL5A 1G52A 4MDMA 3M2YA 1CNJA 1RZAA 4QIYA 1JV0A 3D93A 3M3XA 2ZNCA 2FMZA 1BN4A 3BL0A 1CCUA 4QSBA 1CCSA 3IGPA 4Z1EA 1CVEA 1JD0A 1FSRA 4G7AA 1AVNA 4LU3A 4RUXA 2NN1A 5DSIA 2FMGA 2NXRA 3S97A 4JSZA 4RUYA 1ZSBA 3B4FA 3MHMA 3MWOA 3RYVB 2QO8A 3HKUA 4PQ7A 4MTYA 4QJ0A 5DSKA 2FOSA 5J8ZA 4Q6DA 2FNMA 4QSJA 4XIXA 3M14A 2NNSA 3RYJB 3P58A 5JQ0A 4E49A 4JSSA 4X5SA 5DSLA 5FDIA 3ML5A 3K2FA 5FDCA 3L14A 5FNJA 3S76A 5EKHA 4QK1A 5CACA 2AW1A 3RYXB 5EKMA 4ZX1A 4Q7VA 3R17B 3MHIA 1BCDA 1YO0A 3ML2A 1RAYA 3DD8A 3K34A 3V3FA 3MNUA 5EH7A 5JGTB 2AX2A 4Q8YA 2WEHA 4Q7PA 5DOHA 4N0XB 1UGFA 4Q6EA 5L6KA 3SBIA 1CILA 4ILXA 1CAOA 4MDLA 4QJOA 1TBTX 2CBAA 5FLTA 1HVAA 2WD2A 5FNIA 2NWOA 3KONA 5JESB 4MDGA 1HEAA 4E9OX 4QJMA 4L5WA 2Q1BA 4M2VA 1BICA 2NWPA 1V9IC 4TWMA 4RFCA 1CAJA 1I8ZA 3V2JA 1CVBA 5EKJA 1BNTA 1FQRA 2HKKA 3SAPA 3CZVA 2FOVA 1ZFQA 5EHWA 3S78B 5EH5A 4K13A 2H4NA 3SAXA 4YGKA 5E5RA 2VVAX 3D8WA 4PXXA 1CAYA 1HUGA 3KS3A 3M67A 4JS6A 4Q8XA 3OIKA 2CBDA 1TE3X 3M1QA 1MOOA 3R16A 3S72B 1ZSAA 1BNNA 5AMDA 3T85A 4WR7A 3OIMA 4ITPA 4WW8A 4ZWYA 1TB0X 5JQTA 5CLUA 3NI5A 3F7UA 3S74B 1XQ0A 2NWYA 2POVA 1H9NA 2NWZA 4ZWXA 2QOAA 1ZGFA 4QJXA 1BNMA 4RFDA 1UGGA 3KWAA 3DCSA 3F8EA 1URTA 5E2KA 4MO8A 2X7UA 3CAJA 3DVCA 3HKNA 4CNXA 5CA2A 5SZ5A 4XFWA 5SZ4A 4QK2A 1DCAA 4K1QA 3P4VA 4Q09A 3TVNX 1FSNA 5BNLA 1Y7WA 3M5EA 5BRVA 5JDVB 3DC3A 3RJ7A 1I91A 3K7KA 3N0NA 4MLXA 1HCBA 2FNKA 1LZVA 3V7XA 1Z9YA 3MHOA 3MYQA 4Q8ZA 2HD6A 5IPZA 4YVYA 4YWPA 5SZ0A 5E2NA 4Q83A 1G0FA 2FNNA 1OKLA 4Q06A 3IBLA 3MMFA 3B1BA 1IF5A 4UOVA 5SZ2A 3U7CA 3DD0A 2CABA 1OKNA 1I9QA 4TWLA 4WL4A 3T5ZA 3BETA 2NXTA 4YXIA 1UGDA 4KUVA 2WEOA 4KNMA 3F7BA 2CBBA 4E3DA 1FLJA 2CA2A 4YXUA 1OKMA 1DMXA 4KNIA 5DSJA 1CCTA 4BF1A 2Q38A 3CA2A 3MZCA 4QTLA 5DSMA 4WUPA 5FNLA 4C3TA 3S9TA 2W2JA 1RZEA 6CA2A 1CNIA 2FW4A 3V3JA 1G1DA 4BF6A 1RJ5A 3EFTA 3T84A 3RLDA 4E5QA 1YDDA 2NNOA 3DCWA 1YDBA 5SZ7A 3HLJA 4RH2A 3C7PA 3OILA 3DCCA 4QIZA 5SZ3A 12CAA 2HNCA 3HKTA 3P3HA 1G6VA 4KAPA 1MUAA 2HL4A 4YX4A 4HEZA 4Q99A 4COQA 1LGDA 2FOQA 3VBDA 1TEUX 3V3IB 5EZTX 4KP8A 3UYNA 1ZH9A 3RZ5A 2WEGA 1CAZA 3FW3A 5JGSB 1YO2A 1G48A 3OYQA 1CNHA 4Q78A 4YYTA 2X7SA 4Q90A 4YGFA 3S75B 3M5TA 5DSQA 5FLQA 4HT0A 2HFWA 5DOGA 4YGLA 4E3HA 4FIKA 1G3ZA 1HEDA 4LP6A 4BCWA 4YGNA 1CAMA 1I9MA 2ILIA 5HPJA 1ZFKA 3U45X 3V3GB 1IF9A 3W6HA 4HT2A 1G4OA 3P55A 3Q31A 5DSPA 4L5VA 5G01A 1HEBA 1UGBA 3SBHA 3PYKA 4Q49A 5SZ6A 4HU1A 2NXSA 1UGEA 3V5GA 5DSRA 3V3HB 4DZ7A 1G4JA 1KOPA 5SZ1A 1I90A 1BNQA 3BL1A 3HS4A 1HECA 3PJJA 2POWA 4K0SA 1KWQA 1G46A 4QK3A 5FLRA 1BV3A 3FFPX 3HFPA 4HEYA 1JCZA 1AM6A 3JXGA 4L5UA 5A6HA 2WD3A 4RIUA 3NJ9A 4FPTA 3MNJA 5FNHA 3RZ0B 1FSQA 1CNWA 4QEFA 3TVOX 4Q07A 1IF8A 2EZ7A 1BZMA 4M2UA 3M98A 1HUHA 4PYYA 4XE1A 3V2MA 4Q7WA 3OYSA 5FNGA 4RN4A 1CAKA 1BN3A 3DA2A 4WUQA 4Z1JA 3T83A 4WW6A 2POUA 4Q81A 9CA2A 2HOCA 5EHEA 1KWRA 3P44A 4FRCA 1IF4A 2Q1QA 5FLOA 5FNKA 4ZX0A 4R59A 4XZ5A 3KIGA 1CNXA 1ZSCA 3M1WA 4FL7A 3S73B 1KEQA 3D9ZA 5E28A 5JEHB 3T82A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1UGA A;  1G54 A;  4E3F A;  1ZNC A;  4HF3 A;  3ZNC A;  5C8I A;  3IEO A;  4K0T A;  3DVD A;  3MHL A;  4FU5 A;  3S71 B;  1CIN A;  3RZ1 B;  1CRA A;  1FR7 A;  3KKX A;  1J9W A;  3KNE A;  3MDZ A;  3MNK A;  1TG3 A;  4M2R A;  3D92 A;  3KLD B;  4Q9Y A;  4E3G A;  3DC9 A;  5AML A;  4JSA A;  5G0B A;  3HKQ A;  1CA3 A;  1Z93 A;  4KUY A;  1I9P A;  3M5S A;  3U3A X;  1G45 A;  4YXO A;  3PO6 A;  5EHV A;  3IAI A;  1CNC A;  4LHI A;  3F4X A;  1YDA A;  2NNV A;  2OSM A;  4K0Z A;  3D0N A;  1CAN A;  3IBN A;  2X7T A;  5FLP A;  2CBC A;  1A42 A;  1TEQ X;  1F2W A;  1FQL A;  2WEJ A;  1YO1 A;  5BRU A;  5DSN A;  3M2Z A;  3RZ7 A;  1XEG A;  4KNN A;  5JEG B;  2NN7 A;  3N4B A;  1RAZ A;  3W6I A;  2O4Z A;  5JEP B;  5A25 A;  4Q7S A;  1RZB A;  1CNG A;  2QP6 A;  1T9N A;  5DSO A;  1CRM A;  1H4N A;  2H15 A;  4G0C A;  1FQM A;  3MNH A;  1CVD A;  1LUG A;  3OKU A;  1XPZ A;  4ZWZ A;  3KOI A;  5E2R A;  1CVF A;  4QJP A;  2FOY A;  4MLT A;  3RG3 A;  4XIW A;  3MHC A;  3S77 B;  4QJW A;  3IBI A;  4M2W A;  1DMY A;  5EH8 A;  1CAH A;  2NMX A;  3GZ0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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