5FLSA

Native state mass spectrometry, surface plasmon resonance and x-ray crystallography correlate strongly as a fragment screening combination
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
publication title Native State Mass Spectrometry, Surface Plasmon Resonance and X-Ray Crystallography Correlate Strongly as a Fragment Screening Combination.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5flsA00
1BN3A 2WEOA 5DSMA 3M96A 3RGEA 1CCSA 5FL6A 4YXUA 1BN4A 4Q99A 3IEOA 5LMDA 4K0TA 1A42A 5L6KA 1MUAA 3P3HA 4QTLA 4E4AA 5FL5A 3P44A 2NXTA 1CINA 5EHWA 1FLJA 4WW6A 3U7CA 3HKUA 1HCAA 3S78B 3P5AA 4FVNA 3IBNA 3S74B 4XIXA 4IDRX 4Q7SA 4HEZA 5EIJA 3D8WA 1FSQA 1LGDA 2HNCA 4QJXA 5DSIA 4COQA 4IWZA 4JS6A 5DOHA 3MYQA 3M2XA 3T84A 4RN4A 3V2JA 1CNKA 4K0SA 3M2NA 1BNUA 4RFCA 5DSNA 3DAZA 1CALA 1IF7A 3KOIA 3V3HB 5SZ2A 1CVEA 4YGFA 3DCWA 5C8IA 1G54A 1HEBA 3KLDB 2FMGA 4HEWA 1CAMA 3SAPA 4G0CA 2CBDA 1HEAA 1YDBA 3T85A 4XZ5A 5EHVA 3U47A 4YGJA 4RIUA 1J9WA 2NXRA 4YGNA 4BF1A 4QK3A 4Q8XA 5E2KA 1T9NA 4PXXA 1CNWA 2H4NA 4MDMA 4YXOA 4Q8ZA 2POVA 3CYUA 1CVDA 3MNIA 5E2SA 1G46A 4KUWA 3V7XA 3V3FA 5DRSA 1IF6A 5BRWA 2GEHA 1EOUA 3P58A 5E5UA 4YGLA 3V5GA 2NXSA 4BF6A 1CAOA 1YO1A 4MO8A 2X7UA 3NB5A 4Q6EA 2OSMA 3DCCA 5CLUA 4KP8A 1CNHA 3CA2A 2HFWA 4E49A 4QIZA 3S73B 3RZ8A 3KIGA 1ZGFA 2FMZA 3V3JA 2FNKA 1CANA 5CJFA 3F7BA 4KNMA 1I9OA 5EHEA 5SZ5A 3DV7A 3M3XA 1YDAA 5JEHB 3PYKA 4TWLA 4DZ9A 5E28A 5L3OA 3DD8A 1TEUX 5FNJA 2CBCA 3R17B 1ZSCA 2NNGA 1V9EA 1KOQA 3M5SA 3T5UA 3DC3A 3OIMA 1UGCA 8CA2A 1FQNA 4QK2A 4RIVA 4YHAA 3F4XA 4E3DA 5FNIA 2FOSA 2FNMA 3M5EA 4Q7PA 2HKKA 4KP5A 4LU3A 3Q31A 2O4ZA 3HS4A 3TVNX 4L5VA 5SZ0A 4R5BA 3ML5A 4PQ7A 1CAIA 4Z1NA 5FDCA 5G0CA 3M67A 3LXEA 1HVAA 5E5RA 4Q87A 3CZVA 3IAIA 1DCAA 3U45X 5FLRA 4KUYA 2HD6A 3OIKA 1CVBA 4C3TA 1OKNA 3KONA 2NN7A 1I9MA 4RFDA 2NWYA 1CNYA 1F2WA 3MNHA 1HCBA 3DC9A 3KWAA 4CNWA 5J8ZA 4M2WA 3RZ1B 4DZ7A 3SAXA 1BNTA 5SZ7A 3UYNA 2W2JA 3L14A 1KEQA 3D93A 4HT0A 1CCTA 1TEQX 4XE1A 1CCUA 1TG3A 4RUXA 1FR4A 5EZTX 4MDLA 3ZNCA 2NNVA 5EH7A 1G3ZA 5SZ3A 4UOVA 3IBLA 5BYIA 2Q1BA 3MWOA 4Q08A 5FNLA 5JGTB 4QJPA 1BNWA 3M1KA 1H9QA 3M5TA 4JSAA 4L5WA 1UGAA 1YDDA 4ZWXA 2CABA 2ABEA 1FR7A 1I9QA 1URTA 3BL1A 1AVNA 1RJ5A 3MNJA 3BL0A 4QJOA 4FPTA 1I9LA 3S77B 1AM6A 1ZFKA 1CNCA 3D9ZA 5IPZA 3V2MA 4ZWYA 1LG6A 5JEPB 3TVOX 5FLPA 5FLQA 1FQRA 4KAPA 4YWPA 4PYXA 4FIKA 4JSSA 4Q81A 3B1BA 4Q09A 5SZ6A 4YYTA 2NWOA 3OY0A 3HFPA 1BZMA 1BV3A 3JXHC 4Q78A 1TBTX 1UGBA 5AMLA 1CA3A 3VBDA 3HKTA 4K0ZA 4WUPA 2Q38A 5JEGB 3S71B 4WW8A 2WD2A 1IF5A 5BRUA 3DA2A 2Q1QA 4K1QA 5FNHA 4Z1JA 3EFTA 4Q83A 2GD8A 3OILA 1LZVA 4Q06A 5DSRA 1FSRA 1G45A 4TWMA 1DMXA 1FSNA 4JSZA 1UGGA 3DBUA 1H4NA 1CNIA 5FL4A 9CA2A 1HUHA 1AZMA 1TTMA 2EU3A 3RYXB 3ZP9A 5BNLA 1YDCA 1CZMA 3MZCA 4YX4A 2FW4A 1JCZA 1JV0A 1Z97A 4ITPA 5FLSA 1CVAA 2FOQA 1BCDA 4K13A 3RYVB 3MMFA 1ZNCA 1ZSAA 5DSPA 4QSBA 5DOGA 4CNVA 1YO2A 4RUYA 1DMYA 1UGEA 3MHCA 1ZH9A 3T83A 5DSKA 1BNQA 4Q49A 2QP6A 3M2YA 1UGDA 4QIYA 2VVBX 1CAKA 4CACA 3MNAA 1Z9YA 3DVDA 3DCSA 3V3GB 5AMDA 3N0NA 3T5ZA 3W6IA 2NNSA 1HEDA 1BNVA 3ML2A 2CBBA 3M98A 5DSLA 3RZ7A 4MTYA 2NN1A 5A6HA 4ITOA 1YO0A 3P4VA 4QJMA 1XEVA 3RZ0B 4PZHA 3GZ0A 4ZWIA 1G53A 3P3JA 1TB0X 3DVBA 1DCBA 4YXIA 5EKMA 1IF9A 1UGFA 3M1JA 1HECA 1CAYA 1ZSBA 2OSFA 2X7SA 4ZX1A 4JSWA 5CA2A 7CA2A 1XQ0A 1CRMA 1ZGEA 1CILA 1JD0A 3V3IB 4ETQC 5JQTA 3EFIA 5HPJA 1RZBA 3HKNA 4E3HA 2VVAX 3D92A 3MNUA 4XFWA 4CA2A 3R16A 4ZAOA 5EH5A 2FOYA 2FOUA 5E2RA 4QJ0A 4MLXA 4Q6DA 5EKHA 3OYSA 1I90A 1G1DA 3K2FA 3NI5A 4Y0JA 4HEYA 4MLTA 3IBIA 4G7AA 1CVFA 3MHLA 4QY3A 3RZ5A 3U3AX 4KV0A 3T82A 5JQ0A 3F8EA 3K34A 3KNEA 1G0EA 3PO6A 5E2NA 1FQMA 4L5UA 3MHMA 5G03A 3KS3A 4E9OX 2QOAA 1CA2A 4Z1EA 4FL7A 4ZWZA 5EOIA 3S9TA 2WEHA 4FRCA 3M1QA 3MHOA 3S97A 1BN1A 4WL4A 5E2MA 4CNXA 4Q0LA 5FDIA 3S76A 3B4FA 3W6HA 3SBHA 4YGKA 4KNJA 5G0BA 1RAZA 4XIWA 4CNRA 1CNJA 3JXGA 4PYYA 3OKUA 1ZE8A 4Q7VA 5DSJA 1RAYA 2FNNA 1BNMA 1XPZA 3S75B 5AMGA 2ZNCA 3MDZA 1CRAA 1I8ZA 3M14A 4Z0QA 3KOKA 3PJJA 4QSIA 3IBUA 4Q90A 4N16A 1FQLA 5SZ4A 2AX2A 1CIMA 5DSOA 5JG5B 1CAHA 4Q8YA 4X5SA 3M2ZA 1CNBA 3RG4A 3TMJA 1MOOA 4YVYA 4QSJA 4WR7A 4M2VA 1Y7WA 2NNOA 2POWA 3FFPX 3FE4A 2NWPA 1I91A 3RYYA 1I9NA 1I9PA 1ZFQA 3SBIA 1G48A 1CAZA 4WUQA 1OQ5A 1TE3X 4KNNA 1G4OA 2POUA 1CVCA 3KKXA 1CNXA 1G6VA 1KOPA 2CBEA 1CAJA 3N3JA 4LP6A 4RH2A 1KWRA 3DVCA 5EKJA 3MNKA 4E5QA 6CA2A 12CAA 2IT4A 5SZ1A 1BNNA 1G4JA 2WD3A 3M1WA 5FLTA 5G01A 5FNGA 3P5LA 4GL1X 1OKLA 3N2PA 4M2RA 3OKVA 1IF4A 1OKMA 2HOCA 4Q9YA 1RZDA 1TH9A 3QYKA 3DD0A 3NJ9A 5FNKA 4FVOA 2EU2A 3C7PA 3BETA 1IF8A 3OYQA 3UYQA 4E3FA 1LUGA 2WEJA 4R5AA 1RZEA 4Z1KA 4HF3A 2CBAA 2AW1A 5JESB 4HBAA 2ILIA 4E3GA 1HUGA 5EH8A 3MHIA 3D0NA 5FNMA 3IGPA 1RZAA 3RYJB 1XEGA 5BRVA 2NMXA 4N0XB 4BCWA 4LHIA 1RZCA 1V9IC 1Z93A 3M04A 2F14A 2X7TA 1CVHA 1G0FA 4QK1A 3FW3A 4ZX0A 4QJWA 5DVXA 1RJ6A 1TG9A 1H9NA 2WEGA 4Q7WA 4QEFA 3RLDA 3K7KA 4RUZA 2QO8A 4MDGA 5JG3B 3N4BA 3RYZA 5JGSB 3M40A 4FU5A 4HT2A 1LG5A 3CAJA 3HKQA 4KUVA 4Q07A 2FOVA 4ILXA 3S72B 3RJ7A 5FLOA 3RG3A 2H15A 1G52A 2CA2A 2HL4A 4R59A 1BICA 5CACA 5A25A 5DSQA 2EZ7A 4M2UA 4HU1A 1THKA 4QSAA 3P55A 3HLJA 3S8XA 4CQ0A 3F7UA 1CNGA 3JXFA 4KNIA 5JDVB 2NWZA 1KWQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BN3 A;  2WEO A;  5DSM A;  3M96 A;  3RGE A;  1CCS A;  5FL6 A;  4YXU A;  1BN4 A;  4Q99 A;  3IEO A;  5LMD A;  4K0T A;  1A42 A;  5L6K A;  1MUA A;  3P3H A;  4QTL A;  4E4A A;  5FL5 A;  3P44 A;  2NXT A;  1CIN A;  5EHW A;  1FLJ A;  4WW6 A;  3U7C A;  3HKU A;  1HCA A;  3S78 B;  3P5A A;  4FVN A;  3IBN A;  3S74 B;  4XIX A;  4IDR X;  4Q7S A;  4HEZ A;  5EIJ A;  3D8W A;  1FSQ A;  1LGD A;  2HNC A;  4QJX A;  5DSI A;  4COQ A;  4IWZ A;  4JS6 A;  5DOH A;  3MYQ A;  3M2X A;  3T84 A;  4RN4 A;  3V2J A;  1CNK A;  4K0S A;  3M2N A;  1BNU A;  4RFC A;  5DSN A;  3DAZ A;  1CAL A;  1IF7 A;  3KOI A;  3V3H B;  5SZ2 A;  1CVE A;  4YGF A;  3DCW A;  5C8I A;  1G54 A;  1HEB A;  3KLD B;  2FMG A;  4HEW A;  1CAM A;  3SAP A;  4G0C A;  2CBD A;  1HEA A;  1YDB A;  3T85 A;  4XZ5 A;  5EHV A;  3U47 A;  4YGJ A;  4RIU A;  1J9W A;  2NXR A;  4YGN A;  4BF1 A;  4QK3 A;  4Q8X A;  5E2K A;  1T9N A;  4PXX A;  1CNW A;  2H4N A;  4MDM A;  4YXO A;  4Q8Z A;  2POV A;  3CYU A;  1CVD A;  3MNI A;  5E2S A;  1G46 A;  4KUW A;  3V7X A;  3V3F A;  5DRS A;  1IF6 A; 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