5FNHA

Native state mass spectrometry, surface plasmon resonance and x-ray crystallography correlate strongly as a fragment screening combination
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
publication title Native State Mass Spectrometry, Surface Plasmon Resonance and X-Ray Crystallography Correlate Strongly as a Fragment Screening Combination.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fnhA00
1BNMA 2POUA 3CZVA 4K0TA 1CNBA 1HVAA 4QSAA 1TTMA 3U3AX 5FNLA 3EFIA 9CA2A 5JG5B 3PO6A 4Q49A 3HKUA 1FSNA 4R59A 2CBEA 2EU3A 4M2UA 3F7UA 1IF6A 3UYQA 5JQTA 1CRMA 3B1BA 5AMLA 1ZH9A 3IBUA 3KWAA 4KNIA 4QJPA 3IEOA 3MWOA 4PXXA 1OKLA 4MDMA 2EZ7A 2FOSA 3P3JA 5SZ0A 1I9QA 1AM6A 4Q90A 2CABA 3S73B 1UGEA 4FIKA 5FLRA 1YO1A 1CALA 4K1QA 3NI5A 3BL1A 2NMXA 4MO8A 1J9WA 3M04A 4BF6A 4ZWZA 4MTYA 1JV0A 1BN1A 4ITPA 4MDGA 3VBDA 2GD8A 3MNJA 4MLTA 1CNJA 4HT0A 5FL4A 3U7CA 4XZ5A 3ZP9A 5BNLA 4QJ0A 5FNMA 3V2MA 5A6HA 4Q7PA 1V9IC 5E2MA 3M67A 5FLOA 4Z1NA 4Q8XA 3V3GB 3M2ZA 3N4BA 1IF5A 4Q83A 4ZX1A 3IBNA 2NXRA 3S8XA 1CAHA 5E5UA 4E3HA 4JSZA 1UGAA 5FLPA 1H9NA 4L5UA 4Q87A 1TBTX 3DVCA 4FL7A 3MHLA 2Q38A 5DOHA 5DSQA 1RZDA 1ZGFA 3HKQA 1BNVA 1CVCA 3SAPA 5EZTX 3T5ZA 4RIVA 2EU2A 4PQ7A 5EKMA 1TE3X 4GL1X 4Q09A 2WEJA 4UOVA 4YYTA 2WEGA 2HL4A 3MHMA 1H9QA 3M2NA 2QO8A 2NNGA 3D0NA 4RUZA 1BZMA 1OKMA 3KOIA 5SZ2A 3M2YA 5JEHB 4LHIA 3K2FA 1I9PA 3F4XA 3RGEA 5EHVA 2IT4A 4CNWA 1F2WA 3DVDA 4CNVA 3HFPA 4CNRA 1BNTA 3FFPX 1CZMA 3EFTA 2CBAA 3PJJA 4XIWA 1BNNA 3M5SA 1IF9A 3S75B 1CCUA 4Q9YA 4XE1A 3V3JA 4G7AA 2CBDA 3HS4A 1ZSCA 1ZGEA 1T9NA 5FL5A 2OSMA 2NWYA 5JEGB 3P5AA 5BRUA 1KWQA 1CNYA 3MHIA 2AX2A 1I8ZA 4WUPA 3OKUA 1BV3A 4E3GA 1AZMA 8CA2A 3KONA 3M96A 3R17B 1DMYA 2VVAX 1Y7WA 4RFDA 1BNQA 5E28A 3OYSA 4COQA 1UGBA 4ZAOA 3DV7A 4JSSA 3N3JA 4BF1A 4M2VA 3T85A 1CVAA 1RZAA 3RZ7A 1CAOA 1HEBA 3S74B 3OIMA 1ZFKA 3KOKA 2NXSA 3KNEA 3D9ZA 3NB5A 5SZ5A 1I91A 1FQLA 1G46A 5E2RA 3T82A 3V2JA 4IWZA 4E5QA 5CA2A 5DSKA 3F7BA 1H4NA 5EIJA 3IGPA 3OKVA 3RYVB 4QJMA 1G3ZA 1LG5A 5L3OA 3Q31A 4WR7A 2FOVA 1AVNA 5DSNA 4PYXA 2Q1QA 4E3DA 1HCBA 1IF8A 2HNCA 5EKHA 3CA2A 1G1DA 1CIMA 3V5GA 4QJWA 1CAJA 1I9LA 1KWRA 5FNIA 5BYIA 3SAXA 1HEAA 1BNUA 3P55A 4YGFA 5E5RA 3P3HA 1RZCA 5SZ3A 2QP6A 4QSIA 4CACA 1CA3A 3RZ8A 1YDBA 5EHEA 4K13A 1MOOA 2ABEA 5G03A 2HKKA 4K0SA 7CA2A 2FMGA 4Q78A 3S77B 5DOGA 4PZHA 4Q6DA 1LGDA 1TG9A 3TMJA 5FLTA 5DSMA 4ZWXA 4KNNA 4L5WA 1G45A 3IBLA 4QIYA 5FNKA 4WW6A 2WEOA 5FDIA 4N16A 1CVDA 4Z1EA 4ZWIA 4RUYA 1UGFA 4QK3A 1THKA 1HEDA 1CRAA 3M14A 3RYJB 3HKNA 3KLDB 4R5AA 5J8ZA 3DD8A 1ZFQA 2HD6A 3ML2A 3M98A 4KNMA 4YGNA 1CNHA 1FR4A 2VVBX 4JSAA 4RN4A 1KOQA 3DA2A 4IDRX 5FNHA 5JDVB 4C3TA 1URTA 3FE4A 4YVYA 2AW1A 4WL4A 4QTLA 1V9EA 2FOYA 4LU3A 4XFWA 3M40A 4MLXA 1I9NA 1KEQA 2NNVA 3HKTA 4KNJA 4QEFA 3CYUA 3S72B 1TEQX 1G53A 5IPZA 3MNKA 2FW4A 3MNAA 2NN7A 4KUWA 4M2WA 5FLQA 1MUAA 2H4NA 1CAYA 4BCWA 4WUQA 1G54A 1ZNCA 1EOUA 5E2SA 4DZ7A 1JCZA 5DSPA 5EH5A 1BCDA 3P4VA 2FMZA 3MMFA 3M1WA 2POWA 3MNHA 1YO2A 4E3FA 4KP8A 1CA2A 4CA2A 3P58A 5SZ1A 3M5TA 1Z93A 4QSJA 1CCSA 1UGDA 3BL0A 3S9TA 4YXUA 1BICA 3QYKA 4ILXA 4QSBA 1HUHA 4Q7WA 5L6KA 5EOIA 1DCBA 1TG3A 5DSIA 2NNSA 1CINA 4Q06A 4YX4A 3RG3A 5EKJA 4FVOA 2CA2A 3MYQA 5JQ0A 3MHOA 3M1JA 4YGKA 1XEVA 4Q07A 3CAJA 5DSLA 4Q08A 5CJFA 5G0BA 5G01A 1YDDA 5JESB 1A42A 1CNGA 2WD2A 3V3IB 3N0NA 4HBAA 3L14A 1CAIA 3SBIA 1CANA 3V3HB 1UGCA 3RYYA 3NJ9A 1XEGA 4HT2A 3PYKA 3OY0A 4Q81A 4YGJA 4KAPA 3KS3A 4L5VA 5JGSB 4HEYA 4QJXA 5SZ4A 1RJ6A 3LXEA 5FNJA 4M2RA 2FOQA 5FLSA 1CVHA 1LG6A 5A25A 1G4JA 4YXOA 2H15A 2CBBA 5BRVA 3P44A 3ML5A 3DCWA 3W6HA 3OYQA 1RJ5A 2ZNCA 5DSOA 3DCCA 5E2KA 3RZ5A 3C7PA 4HEWA 3MHCA 5JG3B 1FSRA 4HF3A 4KP5A 2X7TA 2NWZA 1CNCA 3S78B 2F14A 5C8IA 1RAZA 3S97A 3MNIA 5JEPB 5BRWA 1I9OA 1FQMA 2FOUA 5FNGA 4RFCA 3RZ0B 4ETQC 3SBHA 3BETA 1DCAA 1HUGA 3TVOX 3KKXA 3RJ7A 4R5BA 1RZBA 3RG4A 3F8EA 4JS6A 3DC9A 4G0CA 2FNMA 1FQNA 2O4ZA 3DD0A 4K0ZA 1KOPA 4Z1JA 1LZVA 1Z9YA 1ZSAA 3OILA 4ZX0A 1RZEA 3P5LA 3MDZA 3UYNA 4HU1A 1OKNA 4QJOA 1I90A 4QIZA 4Q8YA 3OIKA 3JXGA 4RUXA 1BNWA 1G0FA 4KUYA 1XPZA 3IAIA 4YWPA 3D92A 5EH7A 1Z97A 3K7KA 4KV0A 4Q0LA 3IBIA 4Q7SA 1ZE8A 4QY3A 2FNKA 1G4OA 5FDCA 2NXTA 1IF4A 3DBUA 2NN1A 5AMGA 5G0CA 3U45X 2GEHA 3KIGA 3MNUA 1BN3A 4TWLA 1IF7A 4Y0JA 5DVXA 1YDAA 5HPJA 2NNOA 4Q7VA 1CVBA 1FR7A 4YXIA 2X7SA 1CNXA 1JD0A 3R16A 3FW3A 1CVEA 4N0XB 2ILIA 5JGTB 1FLJA 1G48A 1UGGA 2FNNA 3DCSA 1CAKA 4YHAA 3TVNX 1CNKA 1YO0A 2QOAA 1TB0X 4XIXA 5DRSA 4CQ0A 4FPTA 1LUGA 5CACA 1G6VA 2NWPA 3V3FA 2Q1BA 3M1KA 3V7XA 3DVBA 3M5EA 4JSWA 4PYYA 2OSFA 1CAMA 3RYXB 4FVNA 1CAZA 4RIUA 3T84A 3ZNCA 6CA2A 1HCAA 3D8WA 1HECA 4WW8A 1FSQA 2X7UA 3GZ0A 1TEUX 1G52A 3RLDA 1BN4A 1YDCA 5AMDA 5DSJA 3D93A 4X5SA 3N2PA 4FU5A 4ZWYA 1TH9A 1FQRA 4Q8ZA 12CAA 3W6IA 5DSRA 3T83A 4TWMA 4HEZA 4CNXA 4Z1KA 4MDLA 3M3XA 1G0EA 1DMXA 5CLUA 1CNWA 3HLJA 3B4FA 2CBCA 3S71B 1CILA 5E2NA 1CCTA 1ZSBA 4ITOA 4Q99A 3RZ1B 4DZ9A 4FRCA 2POVA 4KUVA 3RYZA 4RH2A 2WEHA 2WD3A 5SZ6A 4YGLA 5FL6A 3JXHC 4Z0QA 1CVFA 4E9OX 4E49A 1I9MA 2W2JA 3T5UA 5EH8A 3S76A 3DAZA 3U47A 4QK1A 1OQ5A 4Q6EA 4QK2A 3MZCA 1XQ0A 4LP6A 3M2XA 4E4AA 3DC3A 5EHWA 1RAYA 3JXFA 5SZ7A 2HOCA 2NWOA 1CNIA 2HFWA 3M1QA 3K34A 5LMDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BNM A;  2POU A;  3CZV A;  4K0T A;  1CNB A;  1HVA A;  4QSA A;  1TTM A;  3U3A X;  5FNL A;  3EFI A;  9CA2 A;  5JG5 B;  3PO6 A;  4Q49 A;  3HKU A;  1FSN A;  4R59 A;  2CBE A;  2EU3 A;  4M2U A;  3F7U A;  1IF6 A;  3UYQ A;  5JQT A;  1CRM A;  3B1B A;  5AML A;  1ZH9 A;  3IBU A;  3KWA A;  4KNI A;  4QJP A;  3IEO A;  3MWO A;  4PXX A;  1OKL A;  4MDM A;  2EZ7 A;  2FOS A;  3P3J A;  5SZ0 A;  1I9Q A;  1AM6 A;  4Q90 A;  2CAB A;  3S73 B;  1UGE A;  4FIK A;  5FLR A;  1YO1 A;  1CAL A;  4K1Q A;  3NI5 A;  3BL1 A;  2NMX A;  4MO8 A;  1J9W A;  3M04 A;  4BF6 A;  4ZWZ A;  4MTY A;  1JV0 A;  1BN1 A;  4ITP A;  4MDG A;  3VBD A;  2GD8 A;  3MNJ A;  4MLT A;  1CNJ A;  4HT0 A;  5FL4 A;  3U7C A;  4XZ5 A;  3ZP9 A;  5BNL A;  4QJ0 A;  5FNM A;  3V2M A;  5A6H A;  4Q7P A;  1V9I C;  5E2M A;  3M67 A;  5FLO A;  4Z1N A;  4Q8X A;  3V3G B;  3M2Z A;  3N4B A;  1IF5 A;  4Q83 A;  4ZX1 A;  3IBN A;  2NXR A;  3S8X A;  1CAH A;  5E5U A;  4E3H A;  4JSZ A;  1UGA A;  5FLP A;  1H9N A;  4L5U A;  4Q87 A;  1TBT X;  3DVC A;  4FL7 A;  3MHL A;  2Q38 A;  5DOH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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