5FNLA

Native state mass spectrometry, surface plasmon resonance and x-ray crystallography correlate strongly as a fragment screening combination
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Native State Mass Spectrometry, Surface Plasmon Resonance, and X-Ray Crystallography Correlate Strongly as a Fragment Screening Combination.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fnlA00
1I9LA 3P4VA 3P3JA 1CVFA 1CNIA 1ZSCA 4FPTA 3RG3A 5FLQA 5JG3B 3RZ5A 3BETA 1XEGA 2FW4A 4LHIA 3DD8A 1LG5A 1G46A 1AVNA 1CILA 1CAOA 1KOQA 4Q08A 3MMFA 3M14A 3V2MA 1A42A 2QOAA 1G52A 4RUZA 3MWOA 4WUQA 3S97A 4CNXA 4MLTA 4E3GA 3M1QA 4TWMA 5DOHA 1OKMA 3D9ZA 2HFWA 4Q7WA 1HEAA 4PYXA 4K0ZA 5FNHA 4KNNA 1UGFA 3SAPA 1IF6A 4JSWA 3MHOA 4N16A 2POWA 4PYYA 5JGSB 3CA2A 3P58A 5L6KA 1CALA 3DV7A 3MHCA 1UGEA 2FOVA 5FNKA 3M98A 4N0XB 1FSRA 1V9IC 1IF4A 1G53A 1Z9YA 1CNCA 2HKKA 2Q1BA 4M2VA 4Z1JA 1MUAA 3N4BA 1ZFKA 4XZ5A 4Q99A 5DSLA 3DCSA 1ZH9A 5DSIA 1BNMA 3M5EA 4CNWA 2NWZA 4QIYA 2WEHA 2X7TA 4UOVA 5CJFA 4FVOA 4RIVA 3U45X 1YDAA 3HKNA 4QJWA 3PJJA 3HKQA 1JV0A 4Q49A 2ABEA 4FU5A 3M40A 1DMXA 5CACA 2GEHA 3D93A 2FOUA 4E4AA 1AM6A 4G0CA 1YDCA 1ZGFA 6CA2A 3DAZA 1FSQA 5JGTB 1V9EA 4IWZA 5EHEA 1I90A 3RZ0B 3F7BA 3HS4A 1I9NA 5FL4A 5JEPB 5BYIA 5DSJA 7CA2A 3OIMA 4Q8ZA 4R5AA 5SZ6A 4ZAOA 3M2NA 4WL4A 4WW8A 4E5QA 3MNIA 3F4XA 3R17B 4FIKA 5E2MA 3UYNA 3RJ7A 3RYZA 1KWRA 1HECA 3IGPA 5HPJA 2FMGA 5EH7A 3IEOA 4FRCA 1BNQA 3L14A 4JSAA 3MNAA 1CIMA 1RZCA 1TEQX 3M3XA 1CAIA 3PO6A 1EOUA 4Q9YA 2VVAX 4E3HA 3TVNX 3FE4A 4YGLA 4KNIA 1CANA 2AX2A 3HFPA 3EFTA 5SZ0A 3JXFA 3T5ZA 1Z97A 5SZ3A 1RZAA 2NNSA 3RZ8A 5DSRA 1I9PA 1KWQA 4R59A 4HT2A 1G6VA 1ZNCA 4Q7SA 5SZ1A 4E9OX 2FMZA 3M67A 1CA2A 1LUGA 8CA2A 3M5SA 5JQ0A 5FDCA 2FNMA 4ZWXA 2NMXA 2Q38A 5EZTX 5G03A 2X7UA 1RAZA 4DZ7A 4YGNA 2NNVA 2GD8A 5EKMA 3S8XA 3BL0A 1CAZA 1CVDA 3CZVA 3NI5A 4Z1EA 3S74B 1FR7A 2HOCA 5BRWA 2Q1QA 4Q87A 3S78B 3P5LA 3ML5A 5AMLA 4HF3A 4KUYA 5E5RA 5DSKA 3V5GA 1LZVA 4E49A 1TB0X 3UYQA 1JCZA 4YGKA 1AZMA 4RN4A 2CBEA 3R16A 2AW1A 1HEBA 4BF6A 1I91A 1TTMA 3VBDA 2O4ZA 3RYJB 1IF5A 4G7AA 3MHMA 3MDZA 2F14A 4PXXA 3TVOX 3MHIA 1HCAA 3RYXB 4ZX0A 1KOPA 4GL1X 3OIKA 3N3JA 4K13A 1I9OA 1HCBA 4QJXA 3K34A 4ITPA 3U47A 4QK1A 3KONA 1HVAA 3JXHC 4ETQC 1CVEA 3SBIA 3KOKA 4E3FA 4YYTA 2W2JA 2ZNCA 3Q31A 3SBHA 3RG4A 5EIJA 4Q6EA 1TG3A 4JSSA 3DBUA 3D0NA 4ZWZA 3U7CA 4LP6A 1TBTX 4Q06A 4Q8XA 2NN1A 1MOOA 1Z93A 1CVCA 4M2UA 1H9QA 1CAHA 3HLJA 2X7SA 1XQ0A 2WEJA 4KNMA 5LMDA 5JDVB 3V3FA 4YXOA 3V3IB 4RUYA 3OYQA 1BNTA 1G4OA 1RZEA 4LU3A 3OKVA 4X5SA 5EH8A 3RGEA 1I8ZA 3K2FA 3P5AA 5FLTA 1CAJA 4YXIA 2HD6A 4CQ0A 1RJ5A 5FLPA 3M1JA 3EFIA 2EU3A 1YO2A 1BN4A 1FQRA 2EZ7A 1I9MA 5JEGB 1OKNA 1BZMA 2FNNA 2WD2A 3MHLA 3MNHA 1CNGA 1YDBA 1TEUX 3MNKA 3JXGA 4MO8A 5FLRA 3N0NA 5FNLA 12CAA 1CZMA 2FOSA 5E28A 4CACA 1BCDA 2HL4A 3P3HA 3K7KA 3RLDA 2CBAA 4JS6A 3IBUA 3PYKA 4K0SA 1UGAA 4CNVA 1OKLA 4QJOA 5EKHA 4TWLA 4Y0JA 5C8IA 3IBIA 2NN7A 2CBDA 3HKTA 4WR7A 5FNJA 1YO0A 4QJPA 1UGGA 4M2WA 1I9QA 5G0BA 1ZSAA 2NXSA 3MNUA 4HEWA 4KAPA 1CVHA 3KNEA 4ILXA 2FOYA 4XE1A 5DSOA 4Q90A 1CCSA 2HNCA 4MDLA 1CINA 4HEZA 4QY3A 1G54A 3V2JA 1F2WA 3KIGA 4DZ9A 5JEHB 3D8WA 1G3ZA 2OSFA 2OSMA 3NJ9A 4L5UA 1BNUA 1IF8A 5E2SA 5JQTA 4Q09A 4RIUA 3RZ7A 5EKJA 1YO1A 3DCCA 4ZWIA 3S72B 1G0FA 1CNWA 5CLUA 1G48A 2CA2A 3D92A 4YXUA 5EH5A 1ZFQA 1XPZA 3ZP9A 3N2PA 4COQA 1FSNA 1TG9A 3DC3A 1TH9A 4QSJA 1FR4A 4KUVA 5EHVA 5L3OA 3KKXA 3P44A 1Y7WA 3CYUA 4WW6A 3IAIA 4XIXA 5E5UA 4IDRX 1RJ6A 5FL5A 4MDMA 3HKUA 3V3GB 3KWAA 4MTYA 5E2KA 5DOGA 4FL7A 5DRSA 4ZX1A 3S77B 1CA3A 3M04A 4FVNA 4Q7VA 5DVXA 3V7XA 1CRMA 1IF7A 9CA2A 1URTA 4QSIA 3TMJA 3M2XA 4QEFA 5IPZA 2WD3A 4BCWA 1CNJA 2VVBX 3B1BA 1UGDA 4QIZA 3DVDA 2CBCA 4HT0A 2H4NA 1ZSBA 2WEGA 3IBNA 1OQ5A 2POVA 2FNKA 3V3HB 1ZGEA 1THKA 3MZCA 3RZ1B 3S73B 3T82A 4RH2A 1CVBA 3DA2A 3M2ZA 5FDIA 4HBAA 1CVAA 2H15A 4QJMA 1RZBA 4K0TA 1CAKA 2NWYA 5BRVA 3T5UA 1ZE8A 3DD0A 1G45A 4QSBA 1JD0A 1CAMA 4QSAA 5AMDA 4KP8A 3FFPX 3DVCA 3M5TA 4Z1NA 2FOQA 1CCTA 4PZHA 5EHWA 3T83A 4HU1A 1BV3A 1BNNA 1DCBA 3W6HA 4Q8YA 4MLXA 4Q83A 1RAYA 4XIWA 2WEOA 1DCAA 4QJ0A 4QK2A 5SZ7A 5FNIA 4MDGA 3GZ0A 5E2NA 5EOIA 4Q78A 5J8ZA 3ZNCA 3CAJA 4L5WA 1UGBA 3C7PA 4Q81A 4CA2A 2ILIA 3DCWA 3QYKA 3SAXA 5JG5B 2NXTA 2NWOA 1FQMA 1HUHA 1XEVA 1FLJA 2NNOA 1CNHA 1T9NA 3M2YA 3ML2A 4PQ7A 4YGJA 1HEDA 3F8EA 1LGDA 4ITOA 1H4NA 3S9TA 1CNYA 3S71B 4C3TA 1BN1A 1DMYA 2NNGA 1CNXA 5FLSA 3LXEA 4YGFA 4YWPA 1CRAA 3NB5A 3RYVB 2NWPA 3M96A 4K1QA 5FLOA 5SZ2A 5DSQA 5SZ4A 3DVBA 3S76A 5A25A 5JESB 3KLDB 3MYQA 1H9NA 4KUWA 3B4FA 1G0EA 5SZ5A 4M2RA 3T85A 5BNLA 4KP5A 3DC9A 4Q07A 4QTLA 3V3JA 1BICA 1BNVA 4HEYA 1G4JA 4RUXA 3FW3A 3W6IA 4Z1KA 2CBBA 4YX4A 5DSNA 4QK3A 3U3AX 3RYYA 4CNRA 5BRUA 5FNGA 2POUA 3MNJA 4YHAA 1TE3X 3F7UA 4Z0QA 4Q6DA 3OILA 1HUGA 5AMGA 3KS3A 5FL6A 4BF1A 4ZWYA 3OY0A 4WUPA 5DSPA 5FNMA 4L5VA 3S75B 4JSZA 1FQNA 1LG6A 4RFDA 5DSMA 2QO8A 2CABA 3IBLA 4KNJA 3KOIA 1UGCA 5G01A 3M1WA 1CNKA 3OKUA 4Q0LA 4Q7PA 1CCUA 1KEQA 2QP6A 4E3DA 1BN3A 5G0CA 4RFCA 3OYSA 4YVYA 3P55A 4XFWA 3T84A 2EU2A 4KV0A 1FQLA 1RZDA 1IF9A 1J9WA 5E2RA 5CA2A 3BL1A 4R5BA 3M1KA 2IT4A 1CNBA 1G1DA 1YDDA 5A6HA 1BNWA 1CAYA 2NXRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1I9L A;  3P4V A;  3P3J A;  1CVF A;  1CNI A;  1ZSC A;  4FPT A;  3RG3 A;  5FLQ A;  5JG3 B;  3RZ5 A;  3BET A;  1XEG A;  2FW4 A;  4LHI A;  3DD8 A;  1LG5 A;  1G46 A;  1AVN A;  1CIL A;  1CAO A;  1KOQ A;  4Q08 A;  3MMF A;  3M14 A;  3V2M A;  1A42 A;  2QOA A;  1G52 A;  4RUZ A;  3MWO A;  4WUQ A;  3S97 A;  4CNX A;  4MLT A;  4E3G A;  3M1Q A;  4TWM A;  5DOH A;  1OKM A;  3D9Z A;  2HFW A;  4Q7W A;  1HEA A;  4PYX A;  4K0Z A;  5FNH A;  4KNN A;  1UGF A;  3SAP A;  1IF6 A;  4JSW A;  3MHO A;  4N16 A;  2POW A;  4PYY A;  5JGS B;  3CA2 A;  3P58 A;  5L6K A;  1CAL A;  3DV7 A;  3MHC A;  1UGE A;  2FOV A;  5FNK A;  3M98 A;  4N0X B;  1FSR A;  1V9I C;  1IF4 A;  1G53 A;  1Z9Y A;  1CNC A;  2HKK A;  2Q1B A;  4M2V A;  4Z1J A;  1MUA A;  3N4B A;  1ZFK A;  4XZ5 A;  4Q99 A;  5DSL A;  3DCS A;  1ZH9 A;  5DSI A;  1BNM A;  3M5E A;  4CNW A;  2NWZ A;  4QIY A;  2WEH A;  2X7T A;  4UOV A;  5CJF A;  4FVO A;  4RIV A;  3U45 X;  1YDA A;  3HKN A;  4QJW A;  3PJJ A;  3HKQ A;  1JV0 A;  4Q49 A;  2ABE A;  4FU5 A;  3M40 A;  1DMX A;  5CAC A;  2GEH A; 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