5G01A

An unusual natural product primary sulfonamide: synthesis, carbonic anhydrase inhibition and protein x-ray structure of psammaplin c
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFKVNFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLTQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDASKASQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLNETVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Unusual Natural Product Primary Sulfonamide: Synthesis, Carbonic Anhydrase Inhibition and Protein X-Ray Structures of Psammaplin C.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2016-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5g01A00
4Q08A 1TG9A 3DV7A 3PYKA 4M2VA 3S8XA 3M04A 4RUXA 5E28A 3OIMA 3BL0A 1YDCA 1KOPA 3DA2A 5EHEA 2CBBA 3T5ZA 4YGJA 5E2KA 3S77B 3M2NA 1I9NA 1V9EA 2NWOA 4Q07A 6CA2A 4E5QA 1FQLA 3OKVA 4JSAA 4Q78A 3P5AA 5HPJA 4Q7VA 3HKUA 1G4JA 5DSNA 4K0SA 2WEJA 3SAPA 4XIWA 12CAA 4KUYA 1KOQA 4WUQA 5FNHA 3M1WA 3IBIA 3S76A 1RAZA 5EIJA 5CJFA 4MDLA 3FFPX 1Z9YA 2POVA 1LG6A 4QJOA 5DSQA 1CA3A 5SZ1A 4Q83A 3P5LA 4KP8A 1AM6A 5DSIA 5BNLA 4QJ0A 1FR7A 3FW3A 3DC9A 3T82A 3M1QA 3B1BA 3IAIA 1RZCA 1XPZA 3M5SA 4Q09A 3V3FA 5G0CA 1F2WA 4MO8A 3R17B 4YX4A 3U47A 3ML2A 3V3IB 3RYZA 5DSKA 2X7UA 4QSJA 2NWPA 1CZMA 2HNCA 4WW8A 5SZ5A 1HEBA 2NNGA 1G0EA 4ZWXA 2CABA 2FOUA 2WEGA 3CAJA 4K13A 1OKLA 4X5SA 4YXIA 1BNTA 3KNEA 5SZ7A 3M1KA 5DVXA 1YDDA 3P3HA 3DBUA 1DCBA 5JDVB 3K34A 5JG5B 3MNIA 4FPTA 1UGFA 1OKNA 4ILXA 1CVAA 5EKHA 1LGDA 3ZP9A 1XQ0A 1ZGFA 4RFDA 5FDIA 3S97A 5DSJA 2CA2A 4MTYA 2ABEA 4KUVA 1FQMA 3DCCA 3N3JA 3T5UA 1I9MA 5JEPB 1BNVA 1CANA 1CNCA 5FDCA 3S71B 1BZMA 3NI5A 5J8ZA 3BETA 4FRCA 1I8ZA 8CA2A 5SZ6A 1CVHA 3MZCA 1UGBA 1IF5A 1Z93A 3V3HB 1HECA 1HCBA 3MHIA 2NXRA 4JSSA 1KWQA 3C7PA 2NMXA 4QJWA 3M98A 3DCWA 3T84A 5AMDA 1G48A 5FLTA 1FQRA 4ZWZA 4HT2A 5FLOA 1DMXA 2ILIA 3RZ0B 4LHIA 5A6HA 1ZE8A 3M67A 1CNWA 3P44A 1CCUA 4M2WA 2X7TA 3JXFA 1RZDA 4QJXA 1IF4A 1HCAA 1Y7WA 1CVFA 2FOVA 4XE1A 2FOYA 4K0TA 3W6HA 3V3JA 2H4NA 4TWMA 1G54A 3DD8A 4CNVA 4QK3A 4QSAA 3KOIA 5AMLA 1IF7A 1ZSAA 3V2JA 4KAPA 3RZ7A 4FU5A 4ZWIA 3M5EA 3HKTA 3N2PA 4YGKA 1UGAA 3OKUA 2NXTA 1CA2A 1FR4A 1I9PA 4ZWYA 1UGCA 3LXEA 1FSNA 3NJ9A 4WUPA 1AVNA 1CAOA 1OQ5A 4HBAA 5SZ2A 1TEUX 1RJ5A 3M2ZA 4Z1EA 1I90A 4C3TA 2HL4A 1JD0A 4KNNA 1YO1A 4Q81A 4Z0QA 2H15A 2WD2A 4Q8YA 1CVEA 2NNOA 3B4FA 1THKA 5BRUA 1HEDA 1I9QA 4QJMA 2O4ZA 3OYQA 2FW4A 2NNSA 5FLRA 4CNRA 3S74B 1CAZA 4XFWA 5FLQA 2NWYA 3UYQA 5JESB 1LG5A 4KNJA 1CRMA 4QJPA 4HEYA 1BN3A 1T9NA 2OSMA 5E5UA 4L5WA 2FOSA 1V9IC 3DCSA 3MNAA 3DC3A 3JXHC 3PJJA 5E2MA 1YDAA 1ZSBA 4R59A 4HEWA 4QY3A 2X7SA 3QYKA 1CNGA 3T85A 5L3OA 4RN4A 4YWPA 1CNXA 5C8IA 3P3JA 4Q7WA 3DVCA 1HEAA 3F8EA 4MDMA 1CRAA 1TEQX 5FNLA 3IBNA 4XZ5A 4GL1X 5BRWA 4E3FA 4YXOA 2ZNCA 4Q87A 2GD8A 3P55A 4UOVA 2OSFA 5IPZA 4JS6A 5DSPA 3HS4A 3KONA 1H9NA 4M2UA 5LMDA 1EOUA 3OIKA 4FL7A 5A25A 2HFWA 3F4XA 3GZ0A 4KP5A 4WR7A 1G6VA 3R16A 1CAHA 3M5TA 3MDZA 4WL4A 1ZSCA 3MNKA 4Z1NA 3SAXA 4Y0JA 3MNJA 4YGFA 3S75B 2F14A 1DMYA 4JSWA 3L14A 1BNUA 1I91A 3IEOA 3RYXB 4QTLA 1YO2A 3N4BA 3SBIA 4ITOA 1ZFKA 3S73B 3P58A 5E2SA 4JSZA 5JQ0A 3IGPA 1BNWA 4QK2A 3U7CA 4E3DA 1CNBA 1UGDA 2VVBX 4KNIA 1G3ZA 2AW1A 3EFTA 1Z97A 4FIKA 3KIGA 1CVCA 2WD3A 5EH5A 4YVYA 5SZ3A 1BN1A 3IBUA 3KOKA 3OILA 3K7KA 5EKMA 5L6KA 5FNJA 4HT0A 3V3GB 3UYNA 1CNKA 4YGNA 2NN1A 4PYXA 4PZHA 5E5RA 3FE4A 2QP6A 1TBTX 4Q6EA 4K1QA 1BNMA 3EFIA 3S78B 4QK1A 1BICA 1IF8A 3NB5A 5G03A 3V5GA 3KS3A 1TE3X 3RZ5A 1TH9A 4BF1A 4E4AA 5DSOA 4QIYA 1FSRA 3K2FA 5EKJA 9CA2A 1CAKA 1G46A 3MHLA 5FNIA 2FNMA 1KWRA 4Q8XA 1G45A 5SZ0A 4DZ9A 3M40A 2WEHA 3VBDA 5BRVA 4CA2A 2HOCA 3D8WA 3N0NA 1CNYA 4PQ7A 3OY0A 2GEHA 1CCSA 1ZNCA 1ZGEA 3RZ8A 4PXXA 3D92A 5CA2A 5E2NA 1ZH9A 3RYYA 1A42A 3TVNX 3D9ZA 2CBCA 2VVAX 1UGEA 2CBEA 1ZFQA 3S72B 5FNKA 3HLJA 2Q1BA 1G1DA 4QEFA 4FVNA 1I9LA 4IWZA 3CZVA 1CVDA 2QOAA 5E2RA 4YXUA 2IT4A 4Q0LA 3RJ7A 5EOIA 5FLPA 3RZ1B 3RLDA 4MDGA 1CINA 2QO8A 1H4NA 4E49A 3KLDB 4ZAOA 4HU1A 5EHWA 2CBDA 1CAMA 5FL5A 1CALA 4G7AA 2NXSA 1RJ6A 4FVOA 3MHOA 1TTMA 2NNVA 2NWZA 3P4VA 1CAIA 3T83A 3F7BA 3CYUA 1HUHA 5DRSA 2WEOA 4MLTA 3SBHA 1OKMA 1FLJA 4XIXA 3MMFA 4QSIA 4WW6A 3M2YA 1UGGA 1BNQA 3M96A 3OYSA 1CNHA 1RAYA 4Z1JA 2FNKA 1BCDA 4R5BA 4BCWA 4E3HA 5DOGA 4Z1KA 1XEGA 1G53A 2EU3A 3RYVB 1HVAA 3TMJA 1IF6A 3ML5A 3MWOA 4Q90A 3RYJB 4Q7SA 4G0CA 2FMGA 4E3GA 5G01A 1IF9A 4CQ0A 5EH8A 1LZVA 1CAJA 3KKXA 4MLXA 4K0ZA 4YGLA 7CA2A 3M2XA 5AMGA 3S9TA 3CA2A 3W6IA 3MNHA 3HKNA 3D93A 3DVBA 2HD6A 3KWAA 3Q31A 2AX2A 4RH2A 2POUA 4E9OX 4ETQC 4KV0A 1BNNA 5JEHB 4KUWA 3TVOX 1MOOA 4Q06A 2FMZA 3M14A 1JCZA 1J9WA 1CNIA 3MHCA 1CAYA 3HFPA 1I9OA 4Q99A 1CILA 4RUZA 4DZ7A 2Q38A 1RZEA 3DD0A 4QIZA 5BYIA 1MUAA 5CACA 3ZNCA 1LUGA 4RIVA 3U3AX 4LU3A 2FNNA 4Q6DA 4COQA 1AZMA 1TB0X 4PYYA 4L5UA 1URTA 4RFCA 4HF3A 2CBAA 4IDRX 5EH7A 3F7UA 5FL6A 3V2MA 4TWLA 5FLSA 4CNWA 4Q49A 4L5VA 1CIMA 4LP6A 3D0NA 5EZTX 5FNMA 5CLUA 4Q9YA 4CACA 3V7XA 2POWA 4N0XB 2EU2A 1HUGA 4ITPA 2Q1QA 4RIUA 1XEVA 3DAZA 1RZAA 3M1JA 1KEQA 2EZ7A 3PO6A 4RUYA 1FSQA 4ZX0A 1CCTA 1H9QA 1G0FA 4KNMA 4HEZA 5EHVA 3MHMA 3RGEA 3BL1A 5DSLA 5DSMA 4ZX1A 1G4OA 1CNJA 1TG3A 4R5AA 1YO0A 4M2RA 2W2JA 3RG4A 4YYTA 5JG3B 4Q7PA 1JV0A 5JEGB 5SZ4A 5DSRA 3MYQA 4N16A 5JGTB 3RG3A 1G52A 5JGSB 3HKQA 5JQTA 3JXGA 3DVDA 5G0BA 4QSBA 2FOQA 1CVBA 2HKKA 1RZBA 3MNUA 1BV3A 2NN7A 1YDBA 3U45X 3M3XA 4Q8ZA 4BF6A 5FNGA 1BN4A 1FQNA 5DOHA 4CNXA 4YHAA 5FL4A 3IBLA 1DCAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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 4Q08 A;  1TG9 A;  3DV7 A;  3PYK A;  4M2V A;  3S8X A;  3M04 A;  4RUX A;  5E28 A;  3OIM A;  3BL0 A;  1YDC A;  1KOP A;  3DA2 A;  5EHE A;  2CBB A;  3T5Z A;  4YGJ A;  5E2K A;  3S77 B;  3M2N A;  1I9N A;  1V9E A;  2NWO A;  4Q07 A;  6CA2 A;  4E5Q A;  1FQL A;  3OKV A;  4JSA A;  4Q78 A;  3P5A A;  5HPJ A;  4Q7V A;  3HKU A;  1G4J A;  5DSN A;  4K0S A;  2WEJ A;  3SAP A;  4XIW A;  12CA A;  4KUY A;  1KOQ A;  4WUQ A;  5FNH A;  3M1W A;  3IBI A;  3S76 A;  1RAZ A;  5EIJ A;  5CJF A;  4MDL A;  3FFP X;  1Z9Y A;  2POV A;  1LG6 A;  4QJO A;  5DSQ A;  1CA3 A;  5SZ1 A;  4Q83 A;  3P5L A;  4KP8 A;  1AM6 A;  5DSI A;  5BNL A;  4QJ0 A;  1FR7 A;  3FW3 A;  3DC9 A;  3T82 A;  3M1Q A;  3B1B A;  3IAI A;  1RZC A;  1XPZ A;  3M5S A;  4Q09 A;  3V3F A;  5G0C A;  1F2W A;  4MO8 A;  3R17 B;  4YX4 A;  3U47 A;  3ML2 A;  3V3I B;  3RYZ A;  5DSK A;  2X7U A;  4QSJ A;  2NWP A;  1CZM A;  2HNC A;  4WW8 A;  5SZ5 A;  1HEB A;  2NNG A;  1G0E A;  4ZWX A;  2CAB A;  2FOU A;  2WEG A;  3CAJ A;  4K13 A;  1OKL A;  4X5S A;  4YXI A;  1BNT A;  3KNE A;  5SZ7 A; 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