5G0C | Genus

Total Genus 82

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	82
Knots found	KnotProt 2.0: K +3₁
sequence length	258
structure length	258
Chain Sequence	HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFKVNFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLTQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDASKASQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLNETVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__478130384870953__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__478130384870953__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/5g0c/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__478130384870953__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"478130384870953","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/5g0c/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__478130384870953__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	An Unusual Natural Product Primary Sulfonamide: Synthesis, Carbonic Anhydrase Inhibition and Protein X-Ray Structures of Psammaplin C. pubmed doi rcsb
molecule keywords	CARBONIC ANHYDRASE 2
total genus	82
structure length	258
sequence length	258
other databases	KnotProt 2.0: K +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2016-03-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	5g0cA00

3M14A 3S9TA 1I9OA 1Z93A 5EH7A 5E5RA 1KOPA 4PYXA 4QJ0A 4BF1A 1YO0A 4KUYA 1KWQA 2NXRA 1BNQA 1ZE8A 3MDZA 5AMGA 4QJWA 4DZ7A 4Q7VA 4CNRA 3M5EA 3P5AA 1XQ0A 4PZHA 4TWMA 3MNUA 2FNKA 5FL5A 2NWPA 2X7SA 4FVNA 3RYXB 2POUA 4Q8YA 3PJJA 3R17B 4TWLA 2NNSA 5EKHA 3S77B 1LG5A 1BICA 1CVAA 4KP8A 4N16A 5SZ5A 4Z1EA 4KNIA 1MUAA 2CA2A 1I9QA 2W2JA 3MHOA 2CBDA 3N2PA 4KNJA 4QSIA 1BNVA 4WL4A 3RG4A 3SBIA 1YDBA 2NWYA 3D0NA 3V3HB 1CNJA 1F2WA 1LG6A 2NXTA 5DSNA 1OKLA 3RZ5A 3F8EA 5EIJA 1ZNCA 4YXUA 4HT2A 3B1BA 5FNHA 3F4XA 1DCBA 1G48A 5L3OA 3OIKA 5E28A 4ZWIA 1H4NA 3ML2A 4QIZA 1CNKA 1JV0A 2X7UA 1MOOA 3U3AX 1FSQA 3ML5A 4YX4A 1CNYA 5EHWA 5DVXA 4Q7SA 1RZBA 3CZVA 1G6VA 1CZMA 1JCZA 1I90A 2HL4A 1UGCA 4YXOA 1IF7A 5EH5A 1CNBA 5G0CA 8CA2A 1G4OA 3DD8A 1TEUX 3HKNA 4FPTA 5C8IA 1CVBA 3KLDB 1HECA 6CA2A 3HS4A 5DSMA 1RZEA 3V3GB 4QK2A 4LP6A 4Z0QA 1G3ZA 1HEBA 1I8ZA 3HKQA 1BV3A 4UOVA 1CINA 5JG3B 2FOYA 5E2RA 1CAHA 3MNIA 3DVDA 1I9NA 3MHLA 4K0ZA 1CNGA 1V9IC 4HT0A 3CA2A 3IGPA 3IBLA 1ZSAA 3M1KA 1CNCA 5FLSA 4ZX1A 4DZ9A 3PYKA 4FIKA 1CAZA 4CNXA 5EZTX 3BL0A 3OILA 4L5VA 4KUVA 5DSPA 5EKJA 4MDLA 3KWAA 2NNVA 3M1JA 3IBNA 3OYQA 4PXXA 4QJPA 4ZWXA 4Y0JA 3W6HA 3M96A 5E2MA 4Q7PA 5DSQA 2HFWA 3MHIA 3V2MA 1G45A 1XPZA 5DSRA 5JQTA 4YGJA 4G0CA 4QSJA 5FNJA 4Q8XA 5DSLA 2VVAX 3RYZA 5JEHB 5BRVA 2Q38A 5DSOA 3D9ZA 4YGKA 3MNAA 4Z1KA 5JGSB 3JXFA 1CANA 4K13A 12CAA 3F7BA 2CBEA 3M5SA 1TG9A 4E3DA 4JSZA 1UGDA 3DV7A 3M2XA 3TVNX 4RUYA 4YYTA 4YGLA 4MDMA 2Q1QA 5SZ2A 4M2WA 1CAYA 4ITOA 5DSJA 5JQ0A 1FQRA 3RLDA 1FQLA 2NXSA 4M2UA 2AX2A 5HPJA 1RZCA 1CRAA 4KNNA 5SZ4A 2EU3A 4R59A 5JEGB 2VVBX 3RJ7A 1UGAA 3RGEA 4X5SA 1AVNA 1BNMA 4PYYA 3M1WA 1DCAA 4QJMA 3CAJA 1Z9YA 1BZMA 1H9QA 3S75B 3CYUA 4K1QA 3M5TA 1CNIA 5JG5B 3MYQA 3LXEA 5FLPA 3IBIA 5FNGA 3RYJB 3RG3A 4E3HA 1XEGA 1T9NA 5FLOA 4E5QA 1Z97A 2NNGA 4HEZA 4LHIA 3N4BA 2CBAA 1CVDA 1BN4A 3RYYA 1YO2A 2WEJA 3M2YA 4XE1A 1CVEA 3KS3A 2QO8A 1G0EA 2IT4A 4QEFA 4JSSA 3NI5A 5FL4A 1KEQA 1HEDA 4ZWZA 2QOAA 3RYVB 2CBBA 1RJ6A 3P3JA 4Q06A 5FLTA 4HU1A 4E3FA 1OKNA 2WEOA 3RZ7A 2OSMA 5BRUA 3TVOX 2FOSA 5FNKA 3T5ZA 3IAIA 3D8WA 4ILXA 3KIGA 1CNHA 1ZGEA 4HF3A 1G53A 1CAMA 3M40A 4HBAA 4M2RA 2O4ZA 2POWA 2GD8A 2FNMA 3MNKA 3P44A 4CNVA 5JESB 5SZ0A 3P58A 3FE4A 1RZAA 1BNTA 5SZ6A 1HEAA 5AMLA 3P55A 1OKMA 1FR4A 1ZFKA 1HVAA 3OY0A 3DCWA 3T5UA 5IPZA 5EHVA 5E2KA 3M1QA 2AW1A 4Q78A 4HEYA 5FDCA 5A25A 2HNCA 3FW3A 1CAJA 1FSNA 3UYNA 4Q9YA 3K7KA 5JEPB 3OYSA 5SZ3A 1HCAA 3M3XA 1HUGA 4YGFA 2NN1A 4E9OX 4E3GA 5CACA 4FU5A 4XFWA 1KOQA 2NWZA 3UYQA 2FMGA 1BNWA 1CCTA 2NMXA 3V2JA 1I9PA 1BN3A 4IDRX 3DVBA 3TMJA 4CACA 4Q0LA 4M2VA 2CABA 1UGBA 4RUXA 2NWOA 5E2SA 4QJOA 4COQA 2OSFA 1JD0A 3BETA 4FVOA 3DAZA 1FSRA 1CA2A 1IF6A 1V9EA 1CILA 2FW4A 3D92A 3DCSA 1ZFQA 4ZWYA 3QYKA 4YGNA 2FMZA 2CBCA 4G7AA 3RZ8A 4JSWA 1UGEA 5EKMA 1OQ5A 1CALA 1ZSBA 4MO8A 3S73B 4XZ5A 3EFIA 5FNIA 2FOUA 4LU3A 1AM6A 4QY3A 4YHAA 2ZNCA 5EH8A 4WW8A 1RZDA 4KNMA 4QIYA 3IBUA 4BF6A 3OKVA 4RH2A 1CAKA 3DBUA 4E49A 4K0SA 1I9LA 4RFCA 4QJXA 4E4AA 5CA2A 5L6KA 3M98A 3OIMA 3P4VA 5AMDA 1TE3X 2ILIA 5FNMA 4Q7WA 4ZAOA 2FNNA 4KV0A 2X7TA 3U7CA 3HLJA 3SAPA 1RAZA 3T85A 1ZGFA 5FLQA 3ZP9A 3T84A 3MMFA 3KONA 5G03A 5EHEA 3EFTA 4Z1NA 2F14A 1ZSCA 5DOHA 3U47A 1CAOA 2HOCA 1CRMA 1TB0X 1TG3A 1DMYA 3HKTA 4XIWA 4C3TA 1CVFA 5FLRA 1LZVA 5FL6A 3KNEA 3T83A 4Q07A 4FL7A 1ZH9A 4Q49A 4WR7A 5BNLA 5LMDA 5DSKA 4N0XB 3NB5A 3S97A 1FQNA 4Q81A 3V3JA 1BNNA 3V5GA 3U45X 3KOKA 3N3JA 4MDGA 2H4NA 1YDCA 4RN4A 3MNJA 5DOGA 1H9NA 3KKXA 3W6IA 3MNHA 5J8ZA 1BN1A 3OKUA 2WD2A 3DCCA 1G4JA 2FOQA 3MWOA 5DRSA 2NNOA 4R5BA 2HKKA 4RUZA 3SBHA 4K0TA 4XIXA 4Q09A 1J9WA 4Q90A 5FNLA 5SZ1A 4Q99A 1TEQX 3R16A 3S8XA 5JDVB 5A6HA 3IEOA 4YWPA 3SAXA 1CVCA 4HEWA 1A42A 3JXHC 1Y7WA 3NJ9A 4JSAA 3HKUA 1FR7A 1CAIA 2WD3A 4Q83A 3MZCA 2POVA 2NN7A 5CLUA 1LUGA 1CCUA 1CIMA 3K2FA 3FFPX 1TTMA 1IF8A 3PO6A 3F7UA 4RIUA 4KP5A 4FRCA 3S78B 1RJ5A 1UGFA 4ETQC 5CJFA 4WUPA 3C7PA 4JS6A 4MLTA 3V7XA 4ITPA 5BYIA 1EOUA 3P3HA 3RZ1B 2GEHA 4QSBA 4RIVA 4MTYA 5G01A 5G0BA 3T82A 4KAPA 2WEHA 5FDIA 4PQ7A 1YDAA 1I91A 1KWRA 3DC9A 3M67A 5SZ7A 3S71B 3S76A 3K34A 1TBTX 3D93A 3P5LA 4ZX0A 1IF9A 3MHCA 1G1DA 3KOIA 2ABEA 4Q8ZA 1XEVA 4Q08A 3Q31A 3N0NA 1LGDA 3V3FA 3ZNCA 4Q87A 5BRWA 1AZMA 3DD0A 3M2ZA 4YXIA 3GZ0A 1THKA 4MLXA 4CA2A 7CA2A 3RZ0B 1UGGA 1CA3A 1G46A 1HUHA 2FOVA 5E2NA 5JGTB 2EU2A 4BCWA 9CA2A 4YVYA 4Z1JA 3DVCA 1FQMA 1IF5A 4IWZA 4QK1A 1I9MA 1YDDA 2H15A 1TH9A 3B4FA 4RFDA 3VBDA 1BNUA 5E5UA 4Q6EA 5DSIA 2EZ7A 1G0FA 3M2NA 4Q6DA 4WUQA 4QSAA 4L5UA 2HD6A 4R5AA 3DC3A 1CCSA 4QK3A 1IF4A 3JXGA 2Q1BA 3DA2A 1FLJA 4L5WA 3M04A 4GL1X 1CNWA 1DMXA 3BL1A 4WW6A 3S74B 1G52A 1HCBA 1RAYA 3MHMA 1YO1A 1BCDA 2QP6A 3V3IB 1CVHA 3L14A 5EOIA 4QTLA 4CQ0A 1CNXA 4CNWA 3S72B 2WEGA 4KUWA 1URTA 3HFPA 1G54A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3M14 A;  3S9T A;  1I9O A;  1Z93 A;  5EH7 A;  5E5R A;  1KOP A;  4PYX A;  4QJ0 A;  4BF1 A;  1YO0 A;  4KUY A;  1KWQ A;  2NXR A;  1BNQ A;  1ZE8 A;  3MDZ A;  5AMG A;  4QJW A;  4DZ7 A;  4Q7V A;  4CNR A;  3M5E A;  3P5A A;  1XQ0 A;  4PZH A;  4TWM A;  3MNU A;  2FNK A;  5FL5 A;  2NWP A;  2X7S A;  4FVN A;  3RYX B;  2POU A;  4Q8Y A;  3PJJ A;  3R17 B;  4TWL A;  2NNS A;  5EKH A;  3S77 B;  1LG5 A;  1BIC A;  1CVA A;  4KP8 A;  4N16 A;  5SZ5 A;  4Z1E A;  4KNI A;  1MUA A;  2CA2 A;  1I9Q A;  2W2J A;  3MHO A;  2CBD A;  3N2P A;  4KNJ A;  4QSI A;  1BNV A;  4WL4 A;  3RG4 A;  3SBI A;  1YDB A;  2NWY A;  3D0N A;  3V3H B;  1CNJ A;  1F2W A;  1LG6 A;  2NXT A;  5DSN A;  1OKL A;  3RZ5 A;  3F8E A;  5EIJ A;  1ZNC A;  4YXU A;  4HT2 A;  3B1B A;  5FNH A;  3F4X A;  1DCB A;  1G48 A;  5L3O A;  3OIK A;  5E28 A;  4ZWI A;  1H4N A;  3ML2 A;  4QIZ A;  1CNK A;  1JV0 A;  2X7U A;  1MOO A;  3U3A X;  1FSQ A;  3ML5 A;  4YX4 A;  1CNY A;  5EHW A;  5DVX A;  4Q7S A;  1RZB A;  3CZV A;  1G6V A;  1CZM A;  1JCZ A;  1I90 A;  2HL4 A;  1UGC A;  4YXO A;  1IF7 A;  5EH5 A;  1CNB A;  5G0C A;  8CA2 A;  1G4O A;  3DD8 A;  1TEU X;  3HKN A;  4FPT A;  5C8I A;  1CVB A;  3KLD B;  1HEC A;  6CA2 A;  3HS4 A;  5DSM A;  1RZE A;  3V3G B;  4QK2 A;  4LP6 A;  4Z0Q A;  1G3Z A;  1HEB A;  1I8Z A;  3HKQ A;  1BV3 A;  4UOV A;  1CIN A;  5JG3 B;  2FOY A;  5E2R A;  1CAH A;  3MNI A;  3DVD A;  1I9N A;  3MHL A;  4K0Z A;  1CNG A;  1V9I C;  4HT0 A;  3CA2 A;  3IGP A;  3IBL A;  1ZSA A;  3M1K A;  1CNC A;  5FLS A;  4ZX1 A;  4DZ9 A;  3PYK A;  4FIK A;  1CAZ A;  4CNX A;  5EZT X;  3BL0 A;  3OIL A;  4L5V A;  4KUV A;  5DSP A;  5EKJ A;  4MDL A;  3KWA A;  2NNV A;  3M1J A;  3IBN A;  3OYQ A;  4PXX A;  4QJP A;  4ZWX A;  4Y0J A;  3W6H A;  3M96 A;  5E2M A;  4Q7P A;  5DSQ A;  2HFW A;  3MHI A;  3V2M A;  1G45 A;  1XPZ A;  5DSR A;  5JQT A;  4YGJ A;  4G0C A;  4QSJ A;  5FNJ A;  4Q8X A;  5DSL A;  2VVA X;  3RYZ A;  5JEH B;  5BRV A;  2Q38 A;  5DSO A;  3D9Z A;  4YGK A;  3MNA A;  4Z1K A;  5JGS B;  3JXF A;  1CAN A;  4K13 A;  12CA A;  3F7B A;  2CBE A;  3M5S A;  1TG9 A;  4E3D A;  4JSZ A;  1UGD A;  3DV7 A;  3M2X A;  3TVN X;  4RUY A;  4YYT A;  4YGL A;  4MDM A;  2Q1Q A;  5SZ2 A;  4M2W A;  1CAY A;  4ITO A;  5DSJ A;  5JQ0 A;  1FQR A;  3RLD A;  1FQL A;  2NXS A;  4M2U A;  2AX2 A;  5HPJ A;  1RZC A;  1CRA A;  4KNN A;  5SZ4 A;  2EU3 A;  4R59 A;  5JEG B;  2VVB X;  3RJ7 A;  1UGA A;  3RGE A;  4X5S A;  1AVN A;  1BNM A;  4PYY A;  3M1W A;  1DCA A;  4QJM A;  3CAJ A;  1Z9Y A;  1BZM A;  1H9Q A;  3S75 B;  3CYU A;  4K1Q A;  3M5T A;  1CNI A;  5JG5 B;  3MYQ A;  3LXE A;  5FLP A;  3IBI A;  5FNG A;  3RYJ B;  3RG3 A;  4E3H A;  1XEG A;  1T9N A;  5FLO A;  4E5Q A;  1Z97 A;  2NNG A;  4HEZ A;  4LHI A;  3N4B A;  2CBA A;  1CVD A;  1BN4 A;  3RYY A;  1YO2 A;  2WEJ A;  3M2Y A;  4XE1 A;  1CVE A;  3KS3 A;  2QO8 A;  1G0E A;  2IT4 A;  4QEF A;  4JSS A;  3NI5 A;  5FL4 A;  1KEQ A;  1HED A;  4ZWZ A;  2QOA A;  3RYV B;  2CBB A;  1RJ6 A;  3P3J A;  4Q06 A;  5FLT A;  4HU1 A;  4E3F A;  1OKN A;  2WEO A;  3RZ7 A;  2OSM A;  5BRU A;  3TVO X;  2FOS A;  5FNK A;  3T5Z A;  3IAI A;  3D8W A;  4ILX A;  3KIG A;  1CNH A;  1ZGE A;  4HF3 A;  1G53 A;  1CAM A;  3M40 A;  4HBA A;  4M2R A;  2O4Z A;  2POW A;  2GD8 A;  2FNM A;  3MNK A;  3P44 A;  4CNV A;  5JES B;  5SZ0 A;  3P58 A;  3FE4 A;  1RZA A;  1BNT A;  5SZ6 A;  1HEA A;  5AML A;  3P55 A;  1OKM A;  1FR4 A;  1ZFK A;  1HVA A;  3OY0 A;  3DCW A;  3T5U A;  5IPZ A;  5EHV A;  5E2K A;  3M1Q A;  2AW1 A;  4Q78 A;  4HEY A;  5FDC A;  5A25 A;  2HNC A;  3FW3 A;  1CAJ A;  1FSN A;  3UYN A;  4Q9Y A;  3K7K A;  5JEP B;  3OYS A;  5SZ3 A;  1HCA A;  3M3X A;  1HUG A;  4YGF A;  2NN1 A;  4E9O X;  4E3G A;  5CAC A;  4FU5 A;  4XFW A;  1KOQ A;  2NWZ A;  3UYQ A;  2FMG A;  1BNW A;  1CCT A;  2NMX A;  3V2J A;  1I9P A;  1BN3 A;  4IDR X;  3DVB A;  3TMJ A;  4CAC A;  4Q0L A;  4M2V A;  2CAB A;  1UGB A;  4RUX A;  2NWO A;  5E2S A;  4QJO A;  4COQ A;  2OSF A;  1JD0 A;  3BET A;  4FVO A;  3DAZ A;  1FSR A;  1CA2 A;  1IF6 A;  1V9E A;  1CIL A;  2FW4 A;  3D92 A;  3DCS A;  1ZFQ A;  4ZWY A;  3QYK A;  4YGN A;  2FMZ A;  2CBC A;  4G7A A;  3RZ8 A;  4JSW A;  1UGE A;  5EKM A;  1OQ5 A;  1CAL A;  1ZSB A;  4MO8 A;  3S73 B;  4XZ5 A;  3EFI A;  5FNI A;  2FOU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5G0CA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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