5JEPB

Human carbonic anhydrase ii (t199s) complexed with benzo[d]thiazole-2-sulfonamide
Total Genus 76

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLSTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI1 (8-11)3H1 (13-18)TIV1 (3-6)3H2 (21-24)TIV10 (240-243)O2 (203-205)TIV4 (25-28)TIV11 (250-253)S1 (32-33)S8 (108-109)TI2 (34-37)S2 (39-40)TI4 (41-44)S6 (78-82)S3 (46-50)TVIII1 (75-78)TI5 (51-54)S10 (116-124)S5 (66-70)TIV6 (72-75)S4 (56-61)S12 (171-177)3H5 (163-165)TIV5 (62-65)S7 (88-97)TI7 (136-139)AH3 (219-226)TIV7 (98-101)TI6 (100-103)TIV8 (105-108)S9 (112-113)TIV9 (108-111)S11 (140-149)3H3 (125-127)AH1 (130-134)O1 (127-129)3H4 (154-156)TII1 (168-171)3H6 (180-183)TII2 (175-178)S16 (256-257)S13 (190-195)TVIa1 (199-202)TIV3 (18-21)S15 (215-217)AH2 (157-162)TII3 (232-235)S14 (206-211)Updating...
connected with : NaN
publication title Water-Restructuring Mutations Can Reverse the Thermodynamic Signature of Ligand Binding to Human Carbonic Anhydrase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2016-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5jepB00
1JD0A 3OY0A 5DSLA 3K7KA 2WEHA 3RZ5A 1CNCA 5CACA 4Q07A 1CNJA 3IBNA 4XZ5A 3D9ZA 4QSIA 3T83A 1J9WA 3CA2A 4FU5A 2FW4A 4QTLA 4YVYA 5JEGB 3EFTA 2CA2A 1CAMA 1Y7WA 2POUA 1ZGFA 5FLQA 5EOIA 9CA2A 4Z1EA 4QSAA 2ZNCA 5G03A 1BNNA 2FOYA 4FRCA 4JSSA 3M67A 5FLPA 3V7XA 1CAHA 5EKMA 3M2XA 5JEPB 4K13A 2NN1A 3RGEA 3DVDA 4E3GA 4N16A 5FLSA 1BNUA 2HL4A 4QIZA 2POVA 1I9NA 1ZGEA 4ITPA 3IBUA 4Q99A 4TWMA 2FNNA 3M5TA 3RG4A 4L5VA 3RYVB 4PXXA 3V5GA 3U7CA 3DCCA 1A42A 2OSMA 3OKVA 3RZ0B 4MDMA 5SZ4A 4HU1A 5SZ1A 2NXTA 4KUYA 3S9TA 5FNGA 3DD8A 3KWAA 2H4NA 3ML5A 3M2YA 5DSKA 4FVOA 3RYZA 1CVHA 1BNTA 4HT0A 2NWYA 4Q8YA 1H4NA 2NNVA 1CNGA 3MHCA 5EH7A 2ABEA 4QJOA 4HF3A 4M2WA 2W2JA 1Z9YA 4Q6EA 1Z93A 3RZ8A 2WEGA 2WD3A 2NWZA 3F8EA 1H9QA 4QIYA 4M2VA 4PZHA 4Y0JA 4Q06A 1CRMA 3RYXB 4ETQC 4ZX0A 3RG3A 4YXIA 1DCAA 4Q49A 4ZAOA 3S8XA 1ZE8A 4E49A 4MLXA 1ZFKA 4G7AA 3C7PA 1I9QA 5FLTA 3OYSA 4HEYA 4Z0QA 3U45X 3DD0A 4LP6A 2HD6A 4E5QA 1YO1A 1CCTA 3V2MA 1I9LA 4ZWZA 5FNHA 3OYQA 2NXRA 3DC3A 1CAYA 1FSNA 3DCWA 1G46A 1UGCA 4Q09A 3KLDB 5FNLA 1KWRA 4N0XB 1AM6A 1HUHA 1YDBA 5AMGA 3TMJA 1CVAA 3Q31A 3M5SA 2EU2A 3KS3A 5BRVA 3MMFA 4COQA 3JXGA 1RZEA 4IDRX 2F14A 1UGGA 1UGBA 4E3FA 3PJJA 1AZMA 3EFIA 2NN7A 4PQ7A 1FSRA 5HPJA 4KNNA 1F2WA 3M1KA 3ZP9A 4JSWA 3N3JA 1I90A 1FR4A 1IF7A 4CQ0A 3V3HB 5SZ5A 3HKTA 7CA2A 4L5UA 4QEFA 3B1BA 5SZ7A 3DAZA 4KUWA 4C3TA 3W6IA 5E2NA 3S76A 3KOIA 2QOAA 3MWOA 3S71B 4DZ9A 5E2MA 3P5LA 3M98A 4WUQA 1KEQA 2QO8A 1CNIA 1CNHA 1TH9A 3S77B 3V3JA 3QYKA 4FIKA 4QSJA 1TBTX 1RAYA 3F7UA 3MHOA 3PYKA 3HFPA 1TG9A 2POWA 1BZMA 1G6VA 2O4ZA 3MDZA 4WR7A 2H15A 5FNMA 3OILA 4G0CA 3RYYA 3T82A 8CA2A 1LUGA 4LU3A 4YX4A 4MDGA 4KNIA 2NWPA 2CBEA 1AVNA 1H9NA 3S73B 1HCAA 4BCWA 1CVFA 3S78B 5JQ0A 5E2SA 3FW3A 3HS4A 1TEUX 4XE1A 4ZX1A 5AMDA 4Q7VA 2WEJA 3UYQA 3T5UA 1MOOA 2CBBA 3S74B 2NMXA 5EHWA 3IGPA 3FFPX 3MNIA 1RAZA 4R59A 1HEBA 1CINA 1HEDA 4ZWXA 1BNQA 4RFCA 1CZMA 2AW1A 4HEWA 1BNWA 4JSZA 1OQ5A 1CNKA 3V3GB 2FOSA 4Z1JA 5DOGA 5DVXA 4QK1A 1CILA 1G0EA 3M5EA 3L14A 1RZAA 5C8IA 2NNSA 3D0NA 5CLUA 4UOVA 4MLTA 5E2KA 3DVBA 4DZ7A 3SBIA 4BF1A 1CNXA 5EHEA 3KNEA 4QJPA 1RZBA 4YXUA 1ZNCA 2NNOA 1IF8A 3S72B 1FSQA 4CNXA 4KNJA 1G54A 5BNLA 1OKNA 4YGJA 5SZ0A 1YDDA 3M04A 5FNIA 1YDAA 2HFWA 2AX2A 1CALA 4Z1KA 1CIMA 1IF9A 4HBAA 2VVAX 3F7BA 5FDIA 1CA2A 3KIGA 2HKKA 3DC9A 4Q7WA 1LZVA 5JDVB 3SBHA 5BRWA 5FDCA 4KNMA 4FVNA 4R5AA 3T85A 2X7SA 3P3HA 3P4VA 3MNHA 4Q87A 4RN4A 1G53A 4WL4A 2QP6A 2WEOA 2EZ7A 5JG5B 1RZCA 4TWLA 4QSBA 3BL1A 4FL7A 3B4FA 2Q1QA 5G0CA 1V9IC 5EH8A 3HKQA 5A25A 3T84A 2WD2A 2HNCA 1HVAA 3RJ7A 1T9NA 3M3XA 3VBDA 3DVCA 4QJMA 5DOHA 5JQTA 4RH2A 4ITOA 1CCSA 5EH5A 5A6HA 1I9PA 2CBAA 2FNMA 1BNVA 4MO8A 2CABA 3M40A 1MUAA 3UYNA 3D8WA 5L6KA 1LG6A 1XQ0A 1THKA 1UGEA 5G01A 3N0NA 5E5UA 3M1QA 1FLJA 4Z1NA 3KKXA 2FMGA 3CYUA 3FE4A 3DBUA 2CBCA 1HECA 1TB0X 1ZH9A 2OSFA 3KONA 3M1WA 1BN4A 1BN1A 4Q6DA 1XEGA 5DSMA 5FNKA 4PYYA 2GEHA 1IF4A 5FNJA 4LHIA 1CVDA 4Q8XA 4JSAA 4QK3A 1RJ6A 1ZSAA 3F4XA 3U3AX 4E3HA 1I91A 4MTYA 5E28A 1CNYA 5BRUA 5JG3B 4YGFA 3RZ1B 4RIUA 2Q1BA 1OKMA 4E4AA 3MNAA 4K1QA 5FLOA 3IAIA 4YWPA 4KUVA 3R17B 4Q7PA 3P44A 3HLJA 4X5SA 3K2FA 3R16A 4ILXA 4YGKA 1BV3A 2Q38A 3IEOA 3OIKA 2CBDA 2NXSA 5DSRA 3S97A 5DSJA 5FLRA 5JGTB 5G0BA 1FQLA 1FQNA 3SAPA 3CAJA 1FR7A 4K0TA 3OKUA 3V3FA 5JGSB 1CAKA 1UGDA 4QY3A 4RUYA 3BL0A 4CNRA 4HEZA 4R5BA 3S75B 3SAXA 3LXEA 3IBLA 3M14A 3P3JA 1KOQA 4Q9YA 3DA2A 1G3ZA 1CRAA 2EU3A 1CAOA 1TTMA 4FPTA 4ZWIA 5CA2A 3NI5A 3P5AA 1LGDA 3P58A 5BYIA 4MDLA 3HKNA 5IPZA 4QJ0A 1RZDA 2X7TA 3ZNCA 4YGLA 2VVBX 1FQMA 4WW6A 4Q83A 1CVBA 3N4BA 4WUPA 1IF5A 4KAPA 4Q0LA 1UGFA 1CAJA 4Q78A 5J8ZA 6CA2A 3JXHC 5AMLA 4QK2A 4M2RA 1TEQX 1CVCA 3M2ZA 3K34A 3M96A 3TVOX 3KOKA 4GL1X 4CNVA 3MZCA 4Q8ZA 4WW8A 4Q90A 3V3IB 3RLDA 5EIJA 3MHIA 1JV0A 4RUZA 1CA3A 4Q7SA 3W6HA 3P55A 4YGNA 5DSQA 1BNMA 1DMYA 3NJ9A 4HT2A 3T5ZA 3BETA 1OKLA 4K0SA 1JCZA 4M2UA 1KWQA 1CNWA 1YO2A 5EHVA 1BCDA 3OIMA 4YYTA 5DSIA 12CAA 4CNWA 1RJ5A 4RIVA 5JEHB 1HEAA 1I9OA 5L3OA 1G4OA 1UGAA 2X7UA 1ZSCA 2HOCA 1CAIA 3JXFA 1G52A 1CCUA 2NNGA 5EKJA 5FL4A 3DV7A 1EOUA 3MYQA 4IWZA 1Z97A 1XEVA 1YO0A 4XIWA 4BF6A 4CA2A 3D93A 5EZTX 5DRSA 1TE3X 3CZVA 4XFWA 1I9MA 3TVNX 2FNKA 2ILIA 3MNKA 4E9OX 5SZ2A 4JS6A 1I8ZA 4CACA 1URTA 4KV0A 4ZWYA 1KOPA 4KP5A 2FOUA 4Q08A 1DCBA 3PO6A 5LMDA 4YXOA 2GD8A 1HUGA 4QJWA 3MHMA 3M2NA 3DCSA 1G4JA 1LG5A 4QJXA 5JESB 3RZ7A 3RYJB 3U47A 1ZSBA 5DSOA 5FL5A 3ML2A 1V9EA 1XPZA 5DSNA 1CNBA 3HKUA 1IF6A 1CANA 1ZFQA 5DSPA 3NB5A 3MHLA 4PYXA 5EKHA 1G45A 2FOQA 5E2RA 1DMXA 3N2PA 5SZ6A 3V2JA 5E5RA 4Q81A 3D92A 1G0FA 1TG3A 1BN3A 2FMZA 1G48A 2IT4A 4E3DA 1CAZA 1BICA 4RUXA 5SZ3A 1FQRA 1G1DA 3M1JA 3MNJA 4L5WA 5CJFA 1CVEA 4RFDA 3GZ0A 2FOVA 4YHAA 4XIXA 1HCBA 2NWOA 3IBIA 4K0ZA 5FL6A 1YDCA 3MNUA 4KP8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JD0 A;  3OY0 A;  5DSL A;  3K7K A;  2WEH A;  3RZ5 A;  1CNC A;  5CAC A;  4Q07 A;  1CNJ A;  3IBN A;  4XZ5 A;  3D9Z A;  4QSI A;  3T83 A;  1J9W A;  3CA2 A;  4FU5 A;  2FW4 A;  4QTL A;  4YVY A;  5JEG B;  3EFT A;  2CA2 A;  1CAM A;  1Y7W A;  2POU A;  1ZGF A;  5FLQ A;  5EOI A;  9CA2 A;  4Z1E A;  4QSA A;  2ZNC A;  5G03 A;  1BNN A;  2FOY A;  4FRC A;  4JSS A;  3M67 A;  5FLP A;  3V7X A;  1CAH A;  5EKM A;  3M2X A;  5JEP B;  4K13 A;  2NN1 A;  3RGE A;  3DVD A;  4E3G A;  4N16 A;  5FLS A;  1BNU A;  2HL4 A;  4QIZ A;  2POV A;  1I9N A;  1ZGE A;  4ITP A;  3IBU A;  4Q99 A;  4TWM A;  2FNN A;  3M5T A;  3RG4 A;  4L5V A;  3RYV B;  4PXX A;  3V5G A;  3U7C A;  3DCC A;  1A42 A;  2OSM A;  3OKV A;  3RZ0 B;  4MDM A;  5SZ4 A;  4HU1 A;  5SZ1 A;  2NXT A;  4KUY A;  3S9T A;  5FNG A;  3DD8 A;  3KWA A;  2H4N A;  3ML5 A;  3M2Y A;  5DSK A;  4FVO A;  3RYZ A;  1CVH A;  1BNT A;  4HT0 A;  2NWY A;  4Q8Y A;  1H4N A;  2NNV A;  1CNG A;  3MHC A;  5EH7 A;  2ABE A;  4QJO A;  4HF3 A;  4M2W A;  2W2J A;  1Z9Y A;  4Q6E A;  1Z93 A;  3RZ8 A;  2WEG A; 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