9CA2A

Engineering the hydrophobic pocket of carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAYLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Engineering the hydrophobic pocket of carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 76
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1991-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 9ca2A00
2WEHA 5EHVA 3ZP9A 1URTA 5FNLA 1ZNCA 3M1WA 1UGBA 3NI5A 1CNCA 3DC3A 1FSRA 1CAYA 1UGFA 3IAIA 4QK3A 3R16A 2CBDA 2HKKA 3NJ9A 4ZAOA 4R5BA 1CNXA 1RJ5A 2NMXA 2NNGA 4BCWA 2HNCA 1G48A 5FLPA 3M5TA 3FW3A 5EZTX 5SZ4A 5L6KA 4WUQA 3RZ1B 1TBTX 2AW1A 3B1BA 1CVFA 4HF3A 1JCZA 4Q06A 2POUA 4M2UA 1ZFQA 1KWQA 4C3TA 1IF6A 3JXGA 1CIMA 2FOYA 3DD8A 5A6HA 4MLXA 5SZ2A 1CANA 3M2NA 2FNMA 4TWLA 1CVHA 1Z97A 2X7UA 3M04A 3MNAA 4Q09A 1RAYA 3D0NA 2ZNCA 5FLSA 1DMYA 1YDDA 3DV7A 3HFPA 5SZ6A 4HU1A 5FNMA 2QP6A 1CILA 3S75B 4QJ0A 1TG3A 4M2RA 1G4OA 3RZ7A 3RGEA 4BF1A 1IF8A 4RH2A 1CA2A 3V3IB 1HVAA 5EH7A 5EIJA 1F2WA 4QK1A 1AZMA 4RIVA 1KOQA 3M98A 5CA2A 1YO1A 5E28A 4KUVA 5SZ7A 1HECA 4JSAA 3RLDA 1CVAA 4Z1KA 1HCAA 1HEDA 3MHIA 4LU3A 1CRAA 4KP5A 1TEQX 4FVOA 5CACA 4Q9YA 3M1JA 4E4AA 3IBIA 5DSLA 1CAJA 1RZEA 4QJPA 3OIKA 4K0ZA 4K0TA 4KNJA 4RUYA 2EU3A 3DVCA 4PXXA 1MUAA 4LHIA 1CAMA 4Z1EA 5DSNA 3HKUA 3HLJA 3S72B 3BL0A 3S9TA 4YGLA 3W6HA 3M1KA 3SBHA 2CBAA 3EFTA 2WEOA 1RZAA 3DCCA 3RYVB 1G54A 2CBEA 3MNKA 4M2WA 2NNOA 5FLQA 5FL5A 5AMLA 1OKMA 3RYZA 4KNNA 4ZX1A 4FL7A 4Z1JA 5E5RA 1BN3A 3K7KA 4RFDA 5E2SA 3V2JA 5JQ0A 2NNSA 5G01A 5SZ0A 4E3HA 3R17B 1CCTA 4KAPA 5DSRA 5JEPB 3PYKA 5JGTB 3P5LA 5FLOA 5FDIA 4Z0QA 2X7SA 1BICA 3MZCA 4KUWA 5JQTA 3V2MA 3RYYA 3D92A 1YDBA 1CNWA 3U7CA 4CACA 1FSNA 1H9QA 3M3XA 5JEGB 3ZNCA 3CA2A 1BNUA 2WD3A 3ML2A 2CBCA 4RUXA 3Q31A 3KLDB 3MHLA 2FOSA 2NWYA 1UGEA 2FOUA 2NN1A 3M2XA 3RZ5A 1KEQA 3T5ZA 4ZWZA 5BRUA 1FQMA 4IDRX 4M2VA 4Q7SA 1I9LA 4YVYA 3F7UA 3IEOA 5JEHB 1LGDA 3U47A 2FMZA 1FQRA 1G4JA 4FPTA 5G0BA 1J9WA 5JG3B 2FOVA 5JESB 1CNIA 4G7AA 1I9OA 1IF9A 3CAJA 5BNLA 4KV0A 1CAIA 3KNEA 1A42A 3MNHA 3N0NA 3OY0A 1BZMA 3DVDA 3P4VA 4Q8ZA 3S74B 3T84A 1I9NA 1FR7A 4RFCA 2ABEA 5DSQA 1RZBA 4MTYA 4Q0LA 4QJWA 2NWZA 2O4ZA 5DOGA 1CZMA 8CA2A 3SAXA 3DA2A 3P3HA 3PO6A 4YGJA 2NN7A 3S71B 4RUZA 4YGKA 2HOCA 4Q7VA 5G03A 1CCSA 1BN4A 4HT2A 3NB5A 1ZFKA 1CA3A 4YGNA 1I9MA 1G45A 1H9NA 4WR7A 3GZ0A 1I8ZA 5DSMA 5FLTA 4MLTA 1CALA 3L14A 4YXIA 3M1QA 3SBIA 2CA2A 1CNGA 4WUPA 2HFWA 1ZSBA 4MDGA 4HEYA 5JG5B 5FL4A 3B4FA 4BF6A 4YGFA 4Q8XA 4ZX0A 3MNUA 1G53A 5JGSB 4XIWA 5FNHA 2WEJA 3F4XA 3ML5A 5AMGA 4TWMA 4Q7WA 4PYYA 1UGGA 4JSSA 4QSJA 3LXEA 1I9QA 4ZWIA 4R5AA 5FNGA 1BNNA 1ZGEA 1AM6A 4Q07A 3DCWA 9CA2A 3P3JA 4HBAA 1YO2A 3DD0A 1KOPA 1TTMA 4L5VA 3IBLA 1RAZA 3FE4A 5E2MA 1UGAA 3KOIA 5EH8A 4XE1A 3T5UA 4GL1X 1IF7A 3HKQA 3S77B 3TVOX 4YXUA 3W6IA 4ZWXA 4R59A 2FMGA 4DZ9A 5EKMA 3KWAA 5AMDA 1HEBA 5FDCA 3S73B 5E2NA 4CNXA 5BRVA 2EZ7A 3VBDA 1BNVA 1Y7WA 3BL1A 3P58A 4IWZA 4QEFA 4MDMA 3U45X 4ILXA 4FVNA 4PYXA 4QTLA 1ZE8A 3MMFA 2OSFA 4G0CA 4E3FA 1G0FA 1XQ0A 5DSPA 3M67A 4MO8A 1CAOA 3MNIA 1BNQA 4Q7PA 3S97A 5E2RA 1YDAA 4Q49A 2AX2A 5BRWA 3RYXB 5EKJA 3D93A 4XIXA 1LZVA 3MHMA 1H4NA 4Q81A 1LUGA 3V3JA 2POVA 3MNJA 1CAHA 4ITOA 4LP6A 5HPJA 4QIYA 5EH5A 4Q99A 4L5UA 1LG6A 2GEHA 3OKVA 2Q1BA 1CNYA 4YHAA 4COQA 5A25A 4JSWA 3M5SA 4FRCA 4Q90A 3M96A 2HL4A 5C8IA 1CVEA 3UYNA 3HKNA 6CA2A 4YX4A 3D8WA 3MHOA 5L3OA 3U3AX 1TE3X 1IF4A 3D9ZA 4KUYA 4WW8A 3MWOA 2H4NA 4KNIA 3V7XA 4QJMA 3DVBA 1HCBA 2WD2A 1V9IC 1HUGA 1HEAA 4E3GA 1T9NA 3SAPA 1DCBA 2FNKA 4PQ7A 1OQ5A 4HT0A 3DBUA 3M14A 2WEGA 5EHEA 4XFWA 4YXOA 5IPZA 1I90A 4Q87A 1CNJA 1ZGFA 1UGDA 1BNTA 1TB0X 1BNWA 3FFPX 1AVNA 1G1DA 4X5SA 3T85A 4E49A 1XEVA 2VVAX 1CVCA 1CAKA 2OSMA 3CZVA 4K1QA 5EOIA 7CA2A 3KONA 3DAZA 3M40A 1TEUX 2X7TA 1OKLA 4QK2A 4WW6A 5E2KA 1CVDA 1TG9A 3PJJA 3M5EA 12CAA 1CNBA 1DMXA 5FLRA 2POWA 4Q78A 1G6VA 4CNRA 5CJFA 3P5AA 3N4BA 5SZ3A 1FSQA 3OKUA 4Y0JA 2VVBX 3K34A 2GD8A 2NXSA 4ETQC 4Q83A 3MYQA 3BETA 4N0XB 1CNHA 2NXTA 5BYIA 3OYQA 4ZWYA 1Z9YA 1XEGA 5EKHA 3OIMA 5DSKA 4K13A 1FQNA 3QYKA 2CBBA 1HUHA 3EFIA 4K0SA 3JXHC 4HEWA 4WL4A 4HEZA 1FR4A 3TVNX 1UGCA 4KNMA 3N2PA 3F8EA 3HS4A 1CINA 1RZCA 3TMJA 3RYJB 4E9OX 1XPZA 3IGPA 4CNWA 4Q6DA 1TH9A 5E5UA 1JV0A 3V3HB 4CA2A 4QJOA 1ZSCA 3V5GA 4E3DA 4N16A 4Q08A 2HD6A 1RZDA 3M2ZA 2IT4A 3MDZA 5FNIA 1DCAA 1BV3A 2NWOA 4ITPA 3T83A 1YDCA 2FW4A 3P55A 3KKXA 4L5WA 3K2FA 5DSJA 2NXRA 5FNKA 3T82A 1Z93A 3IBUA 5DRSA 3RZ0B 4QSAA 4FU5A 3S8XA 4QSIA 5SZ1A 3JXFA 3N3JA 1ZSAA 3C7PA 4QSBA 1KWRA 2NNVA 4Q8YA 4MDLA 3CYUA 2Q38A 1G52A 3DC9A 1BCDA 5LMDA 1CNKA 1OKNA 4CNVA 3RJ7A 1MOOA 3OYSA 3HKTA 4QY3A 5DSIA 3RG3A 3RZ8A 3KS3A 3V3GB 2H15A 5CLUA 1CCUA 4RN4A 3P44A 2FOQA 4KP8A 1CAZA 1I9PA 2CABA 3S76A 3S78B 3UYQA 1RJ6A 2EU2A 1BN1A 1G3ZA 3OILA 4QJXA 1FLJA 5DOHA 3MHCA 4XZ5A 3F7BA 4UOVA 5SZ5A 1YO0A 2F14A 3IBNA 4JS6A 5EHWA 4PZHA 2ILIA 1CRMA 2Q1QA 5DSOA 4CQ0A 1THKA 1IF5A 5G0CA 4Q6EA 3RG4A 4Z1NA 4YYTA 2QOAA 1G46A 5FL6A 2W2JA 1EOUA 1LG5A 5J8ZA 1JD0A 2NWPA 2FNNA 1I91A 2QO8A 5JDVB 1ZH9A 1CVBA 1V9EA 1G0EA 3V3FA 1FQLA 4E5QA 4QIZA 3DCSA 4FIKA 5FNJA 4DZ7A 3KOKA 5DVXA 1BNMA 3M2YA 3KIGA 4JSZA 4YWPA 4RIUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WEH A;  5EHV A;  3ZP9 A;  1URT A;  5FNL A;  1ZNC A;  3M1W A;  1UGB A;  3NI5 A;  1CNC A;  3DC3 A;  1FSR A;  1CAY A;  1UGF A;  3IAI A;  4QK3 A;  3R16 A;  2CBD A;  2HKK A;  3NJ9 A;  4ZAO A;  4R5B A;  1CNX A;  1RJ5 A;  2NMX A;  2NNG A;  4BCW A;  2HNC A;  1G48 A;  5FLP A;  3M5T A;  3FW3 A;  5EZT X;  5SZ4 A;  5L6K A;  4WUQ A;  3RZ1 B;  1TBT X;  2AW1 A;  3B1B A;  1CVF A;  4HF3 A;  1JCZ A;  4Q06 A;  2POU A;  4M2U A;  1ZFQ A;  1KWQ A;  4C3T A;  1IF6 A;  3JXG A;  1CIM A;  2FOY A;  3DD8 A;  5A6H A;  4MLX A;  5SZ2 A;  1CAN A;  3M2N A;  2FNM A;  4TWL A;  1CVH A;  1Z97 A;  2X7U A;  3M04 A;  3MNA A;  4Q09 A;  1RAY A;  3D0N A;  2ZNC A;  5FLS A;  1DMY A;  1YDD A;  3DV7 A;  3HFP A;  5SZ6 A;  4HU1 A;  5FNM A;  2QP6 A;  1CIL A;  3S75 B;  4QJ0 A;  1TG3 A;  4M2R A;  1G4O A;  3RZ7 A;  3RGE A;  4BF1 A;  1IF8 A;  4RH2 A;  1CA2 A;  3V3I B;  1HVA A;  5EH7 A;  5EIJ A;  1F2W A;  4QK1 A;  1AZM A;  4RIV A;  1KOQ A;  3M98 A;  5CA2 A;  1YO1 A;  5E28 A;  4KUV A;  5SZ7 A;  1HEC A;  4JSA A;  3RLD A;  1CVA A;  4Z1K A;  1HCA A; 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