3WTT | Genus

Total Genus 40

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	40
sequence length	118
structure length	118
Chain Sequence	PVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transcription/dna
molecule keywords	Runt-related transcription factor 1
publication title	A novel allosteric mechanism on protein-DNA interactions underlying the phosphorylation-dependent regulation of Ets1 target gene expressions pubmed doi rcsb
source organism	Mus musculus
total genus	40
structure length	118
sequence length	118
chains with identical sequence	H
ec nomenclature
pdb deposition date	2014-04-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
C	PF00178	Ets	Ets-domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	3wttC00

4L0ZB 1LDDA 2IJLA 2K4BA 3KP2A 2IA0A 1DUXC 3EUHA 2EK5A 1YO5C 2NS0A 1IXCA 1UFMA 3HOSA 3N4MA 2VT2A 1CF7B 1STZA 3KP5A 5E8GA 3K9TA 3QU6A 5L3CA 2R3SA 4UXNA 3O3KA 1U5TC 3FMSA 1TNSA 4JBAA 4U88A 4QLCU 2XAHA 1S6LA 2VC0A 4QWQA 5E1ZB 4BYYA 3LWFA 4HQEA 3M8EA 4IRGA 3J80K 1GVJA 3VB2A 4UVCA 2DLLA 3BPXA 4BNCA 3I5UA 1TLHB 3P9CA 3QPHA 1HSJA 5D4RA 5F1RA 2XASA 3EETA 4HF0A 3FXRA 4I02A 4RB1A 2BV6A 3J81Z 3HHHA 1DPRA 3BJOA 2NNNA 3KP3A 2YR2A 4TV7A 4U7BA 4OOIA 4G7ZF 2A3SA 1FOKA 5HOOA 3RKYA 1O7LA 3E6CC 3F3XA 2CGPA 2CWEA 2PFBA 3RYPA 5FGMA 1KA8A 4NHJA 4HV5A 2HDCA 4UVAA 4U0YA 3M8FA 1WI9A 5D8KB 2LNBA 2XGXA 2R7FA 2PBIA 1J0RA 2EB7A 3C18A 2CYYA 5A2QK 3M9AA 1G3YA 2ZFWA 2EJRA 2G7UA 3RPUA 3QAHA 3CLOA 3NRVA 2DQRA 2MLKA 5FB2A 2FU4A 2Z33A 2J5PA 5K5RA 1XGSA 1SMYF 2JT1A 1IN7A 4A0YA 4IVNA 3RYRA 2ZKZA 2GAUA 3JTHA 2JPBA 4GO1A 1DDNA 4LGWA 1IW7F 3WTXC 5ERIA 2HYGD 4A5NA 1B9MA 1L3LA 2Z9OA 1UHWA 3GZ6A 5TJJA 2MH2A 3WTZA 2ESHA 4A6EA 3PQKA 5ICFA 2L02A 1BC7C 3KCCA 5FLXZ 3RIRA 1P4XA 4LJZF 5E20A 2YX7A 3K2ZA 1G4DA 1BM9A 3GYHX 3ZQ7A 4A0ZA 1SD6A 2MH9A 2DAOA 2HKXA 2K02A 5CVRA 4M74A 3IHUA 1F1ZA 5DDGA 3HRMA 1P6RA 3L9FA 2V6CA 1KYWA 1D3YA 5DV5A 2O8XA 3OV8A 1LB2A 4LB5A 3IWFA 3F6VA 5L3GA 2V9VA 1KU7A 5EEHA 1XB4A 3CO7C 2YX4A 1EH8A 2E7XA 3BZ6A 2M87A 1BI3A 1IXRC 4OMYA 2V1DA 1HW5A 1PP7U 4I09A 2H94A 3DFGA 3ZP5A 5CVJA 4HQMA 3BP8A 2VOOA 5LGUA 4H0EA 4Y15A 2XROA 4UUVA 2NYXA 3I58A 1OPCA 2VBYA 2GIVA 5DCMB 3WTVC 2F5FA 3TO6A 4CO8A 5E8IA 1R36A 5K5QA 1XGOA 2OQRA 5D5VB 3HIFA 2MD5A 3F8FA 3E6BA 4A0XA 1TW2A 2HS5A 2LDUA 5ILSA 5LLQA 2VE9A 2A6EF 3IKTA 2XHKA 1ON2A 4IJAA 2K4JA 3NEUA 1U8RA 2ZJ2A 1XCBA 2QQAA 2BE5F 3FZVA 2O0YA 3WTWC 2ZMEA 1SMTA 2RC4A 5LGTA 2J5OA 1Z6TA 4ENJA 3L7WA 2P6TA 1TQPA 4KFCA 3W6JB 3QU3A 1YS7A 3R0AA 4UV8A 2O03A 2EA2A 3GXOA 6PAXA 2AS5F 1EH6A 2FE3A 3DPLC 5K5OA 5LRSA 2G9WA 1QPMA 2IA1A 1XGNA 1V4RA 3N97A 2EV6A 3GFIA 4FX4A 2YSRA 3MWMA 2Z5UA 3R6SA 1O3RA 1WKMA 3GWZA 3ZN1A 1AOYA 3HUGA 2CQKA 1R1TA 3C1DA 4U7DA 3EYYA 4L9VA 2L01A 2OU2A 1QZZA 2IW5A 4LD5A 3WU1B 1OYYA 2FBKA 2CO5A 3GZ5A 3RI4A 1K7AA 4WWCA 1MKMA 1ZGAA 4BQAA 1U5TB 3HYIA 4EJVA 3F22A 2IVMA 2X4HA 3O2PE 2HZTA 3JSOA 4ZYGA 4HLXA 3IWZA 2QVOA 2HFHA 3TKYA 3HRTA 1K78B 4JK1X 1YYVA 3WGHA 4AVPA 1GXPA 1FPQA 5LGNA 3GLXA 4BAYA 4HF1A 2RQPA 2HQRA 1B59A 4M72A 1MDMB 2KKOA 2XKOA 1QBJA 1ZH5A 2EA4A 4O6JA 4XSXF 1J7KA 3RTRA 4L9NA 3H3UA 1B1BA 4I7HA 5ED4A 3RPQA 5E17F 2GWRA 3MQ0A 3IL2A 1Z9CA 2WV0A 1R1VA 3CTAA 4G6QA 3F72A 4CGZA 1FSEA 2L4MA 4HLYA 3V8LA 4ZZDA 5CLSA 2M8EA 3RDIA 1T38A 5DUIA 4P5OA 5IT9K 4M6XA 3EQLF 5FFXA 1IN6A 3BY6A 4KNYA 4KA4A 2DI3A 1T0FA 2QBYB 1W7PB 4F7ZA 2PMUA 3BWGA 1KQ0A 4KDPA 4MQ9F 3ERED 3JAMZ 4G7OF 3VODA 1P2FA 1TTYA 1O7FA 1C0WA 2STWA 1B9NA 4PZJA 2EFPA 3MCZA 4KIGA 3V7SA 2K86A 5HS9A 3TDZC 2YU3A 2JZYA 2LSOA 4IPAA 2HOEA 4I01A 1SAXA 4K2EA 1K79A 3WU0A 5KVRA 1F5TA 1YS6A 1CGPA 3DF8A 2WC2A 4RAZA 3FXUA 1ZYRF 3G3ZA 2H27A 5HS8A 2Y0MA 3BJAA 4YFXF 5HDKA 3QP5A 1HXDA 5H6RA 3ZPLA 2BBYA 4HOBA 1KYZA 1RNLA 2ZXJA 4LK0F 4XLNF 5LEJA 4RGSA 1V3FA 1H0MA 1LDKB 1Z05A 3R0JA 4CHUA 4EJTA 2XIGA 4FHTA 4IF4A 4ESJA 3TOAA 3SXYA 3REOA 1YTYA 4FX0A 2VBXA 2YPRA 3C3WA 1D5VA 3J81K 1Z1DA 1USTA 4BHCA 2M45A 2P5VA 4E70A 2EWNA 5BQTA 3DEUA 3L00A 3F8MA 1OR7A 1FYLA 1XSVA 1EV7A 4RB0A 3JW4A 3V7CA 4M9ZA 4NQWA 4A5MA 2DTRA 4GCVA 4N9HA 3TO7A 3I59B 3KZZA 2ISZA 4WK8F 2NNYA 4OINF 1KGSA 4DNCA 2LF7A 1P4WA 1R00A 2RDPA 3P9IA 4RGUA 3QOPA 3I71A 5FD6A 1BC8C 4JQFA 2IA2A 2W85A 1BI1A 3F8BA 2D1VA 5D5XB 4D0PA 1J9IA 1BIBA 5ICGA 5CVIA 1YQAA 4WF2A 1I1GA 4L9TA 3G73A 1ULYA 3I59A 3ZMUA 3KLOA 2K27A 5D4SA 4LG0B 3M7GA 4AIJA 4WCGA 4HX4A 5D5UB 1OYIA 5HLIA 1XMAA 2HGCA 5JFRA 3VOEA 3FM5A 1XSDA 2UWMA 1QNTA 4HF2A 1BI2A 2EV0A 2A5YB 4EJOA 2D2WA 2FNAA 2AXLA 5BPIA 5FLXK 1G3SA 1S7OA 1KQ8A 1HKTA 4IXAA 2VC1A 2V79A 4KIBA 4LG0A 1HSTA 2P6SA 2DO7A 3DXJF 1BBYA 3DKWA 3CJNA 2P4WA 2KRFA 2A68F 1LQ1A 2TDXA 3V7RA 2QM3A 1Z7UA 4G94A 4GYIA 5DD4A 3I64A 3CUQB 2IT0A 1BOAA 3OOPA 3DQVC 4YG2F 1FY7A 2HTJA 1Y0UA 3JSPA 2ZO4A 3KETA 4BXUA 3F8NA 2OAZA 2RNJA 3ZMDA 3SFZA 3PQJA 2L54A 4B09A 4YIIA 1UHMA 4R1HA 4CICA 1PUEE 4G6DA 1P92A 5D5WB 1R5HA 3LQRA 2K7LA 3KEQA 2IP2A 1T39A 3GFMA 4RS8A 1HW2A 3CUQA 1TW3A 1RZ4A 2P8TA 5DD8A 5J8CA 2FNPA 2GXGA 1IRFA 5HLHA 4I0BA 1L0OC 1F4KA 4AIHA 4Q48A 1U78A 4EMSA 1MZBA 5ICEA 1RUOA 2VONA 4EQQA 1WRJA 1KU9A 2QUFA 2W24A 3K69A 2LF8A 2ZMEB 2GXBA 4EVIA 4ZYHA 4LLLA 1J75A 3E6DA 5BMZA 1E17A 3BDDA 3ZMZA 4P9UA 3ZMSA 4MTDA 2ELHA 3D0SA 2ZNYA 2HQNA 3K1MA 2F5DA 4A12A 4MQVA 4CZZA 4WXCA 4ENMA 4BHBA 4S04A 1HKQA 3DP7A 2A61A 4M9SA 2HWVA 4UHTA 2O3FA 5CJ9A 2Y75A 3HRSA 3IKVA 1YG2A 2DT5A 3COAC 1KQ9A 5L3DA 3MAJA 3T5XA 1JXSA 2PQ8A 1TNTA 2RGVA 3LA2A 2ACJA 3ROUA 3KEOA 2W57A 2VE8A 3F23A 5CYVA 4RGXA 1X3UA 1ON1A 1RUNA 1BN5A 2EFWA 3IRRA 1FYMA 1I5ZA 3U9GA 4R8HA 1I6XA 1YLFA 3F21A 3SZPA 4KUMA 3WGGA 4ZYDA 1GHCA 2HTSA 3IRQA 3F6OA 1FX7A 1O3SA 3QPTA 2DBBA 4S05A 1S3JA 1LVAA 4PDKA 1IXSB 1KU3A 1S8NA 5DEQA 2PEXA 2L4AA 3ABUA 3EYIA 5AIQA 1ZGJA 4FT8A 3CUQC 4EJUA 1R58A 4IHSA 2OD5A 1LEBA 2FSWA 5KK1A 1R23A 1JGSA 2O61A 2ESNA 2FQ3A 1J5YA 3KP7A 4Y13A 3ELKA 5LRRA 3H92A 2A07F 2FBHA 3S2WA 2VN2A 1DPUA 2LKPA 1R1UA 4XLPF 3AAFA 2STTA 4CDGA 2F2EA 4P55A 4PGHA 2D1HA 1SFEA 2F5EA 4BH9A 4KICA 1B6AA 1FZPB 4RAYA 4M6YA 3LAJA 3P9KA 4CXFA 1FT9A 2E7WA 1ZLJA 2R7DA 2BGCA 5LHGA 3ZMVA 3SQNA 4HA8A 1W4MA 4AIKA 4MTEA 2RKHA 4Q47A 1MJBA 3RKWA 4EV0A 1XCVA 3TDUC 1ZRFA 2VBWA 1ZAOA 3LA7A 1ZRDA 4RB2C 5ILVA 3HHGA 4Z2YA 3SHFA 2XV4S 2CSOA 3PFIA 1I1SA 1F9NA 1XSXA 2XUBA 4HZFA 3GUDA 2XAJA 1HKSA 2D45A 3GO5A 2M30A 5AONA 1SD7A 5ILUA 2DPUA 3K1NA 1KU2A 5LEKA 2BYVE 1XDUA 3GFJA 3WG9A 2KIMA 5TRDA 3L2CA 2EFQA 1ONVA 5D6EA 2Q2EA 1IF1A 4MNUA 1TBXA 1YW9A 2GA2A 1MD0A 1YIOA 3L09A 3P7NA 2G7HA 3TGNA 3T8RA 2QWWA 1QZYA 2IRFG 1E2XA 2P5KA 3FF5A 3R61A 4Q4ZF 3D5LA 3E3VA 3ZMTA 3V8JA 3HTUA 4IRHA 1FBUA 3I0TA 3VEPA 3W6KB 2COMA 3BROA 1W7PD 3ABTA 2PI0A 3ULQB 4IRIA 2FA5A 2XVCA 2VXZA 2KIFA 5HLGA 4LLNA 4EGYA 3WTYC 2OBPA 3B73A 3EDPA 4HYEA 2OZUA 1Z6RA 2ISYA 2L3DA 5DCFA 1BIAA 4WXDA 1H9GA 2UXXA 3U2RA 3I53A 4ENNA 4Q5SF 3BOQA 1XGMA 2B0LA 5F6FA 2DFIA 3E5UA 4A6DA 2Q0OA 4M73A 3V8KA 1I27A 3Q9VA 4HX7A 3J80Z 2P7VB 1U6GA 4KIFA 1LDJA 1CF7A 4L0YB 3HSFA 3FM3A 1IUYA 1XD7A 2JRTA 2JTVA 5JI6A 4HDVA 1MGTA 3GF2A 3GFLA 4O5VA 3LA3A 5J8FA 4L18B 3M1EA 3LAPA 3HSRA 2GQQA 4OU0A 2E1NA 5HVQC 2FEZA 4P9FA 3RKXA 1IN4A 2PLYA 3FMQA 2M5WA 2FOKA 5JR3A 3E5XA 1REPC 5L3EA 2P7CB 2M1BA 1D8JA 4MEXF 1O3QA 1Z91A 1A04A 3TQNA 2DQLA 2VBZA 1ODDA 2EFNA 3E5QA 4OIRF 3GX4X 3H3ZA 1J59A 1JHHA 2HEOA 3KFWX 1Q1HA 1HW1A 2PG4A 1MJ9A 2ZCWA 2DU9A 4U0WA 3FX3A 4XSZF 3JTGA 5A2QZ 2VT3A 3TO9A 1FBQA 4L5IA 4Y17A 3T0YA 3FWEA 2H6BA 2MBFA 3K1PA 3HOTA 5E1WA 4NB5A 2P5LC 3E97A 1IAWA 2XKPA 2CG4A 1SD5A 2E1CA 2HKOA 1FLIA 2XAGA 4RGRA 3WGIA 5AIPA 3GW2A 4ASNA 2KJBA 4UV9A 1TQIA 1P4AA 3DV8A 1JHFA 1LNWA 3FMRA 2FF4A 3KP4A 4HAMA 1ZG1A 1BJAA 4HW0A 3T8TA 3B02A 1LJ9A 1ZG5A 5ICCA 2JSCA 1AWCA 2DW4A 5HDGA 5D6FA 2QLZA 2ETHA 1W5SA 1FSHA 2QENA 1S29A 3WTSC 2Y48A 3RJPA 1ZRCA 2HYFA 2H09A 1O57A 1FBSA 1YW7A 2V1XA 4UNOA 3WTTC 1FNNA 4DQ2A 2C6YA 4I2OA 3J7AO 4EJWA 3I54A 3WE2A 4ZYEA 3F8CA 4R79A 4OIPF 4HX8A 4ON0A 3IC7A 4KN7X 4KYWA 1YFHA 1NHAA 4O3MA 4ENKA 1FYKA 1MJAA 4EM2A 4M9XA 4LK1F 1O3TA 5DYMA 5BPDA 4MGRA 1USSA 2DK8A 4KT5C 2IPQX 4AD9A 1HBXG 5DUKA 4HV6A 1SD4A 1S7AA 3GVAA 5D8LB 1QGPA 5BS6A 3WTUC 3KP6A 3LSTA 5LBQA 1XN7A 4B8XA 4L5JA 4ESFA 1XMKA 2X0LA 4PCQA 3LQQA 3C7JA 4I0AA 1WWXA 2QQ9A 4IHTA 1EH7A 1ZARA 1BI0A 2EFOA 2V1UA 3CUOA 3R60A 2A69F 4M71A 2Z3YA 4HBLA 4LB6B 3O6BB 1SFXA 4XRFA 3QP6A 4OMZA 3U1DA 1OKRA 2H6CA 1FP2A 2WWYA 1D8KA 3I4PA 3KE2A 2QQBA 1FC3A 2RV8A 1UCRA 4ZZLA 3Q5FA 3SZTA 2O6GE 4BHPA 1J2XA 2FBIA 1FP1D 3CO6C 3KZYA 4KN4X 2FMYA 2ADUA 2OQGA 5DCMA 4ZH4F 2GZWA 4CYDA 1T2KA 3BPVA 4ETSA 1HQCA 3FXQA 2XAQA 5HDNA 2UXNA 1IN5A 2NAZA 2NRAC 4EM1A 2JPCA 4WXHA 2MLGA 2FXAA 3T1BA 3V4GA 4RB3C 3GEZA 1QO0D 1WQ2A 1ZREA 2FMLA 1JE8A 5EEGA 4N9IA 1G3TA 1ZHFA 4GYGA 4GGGA 1SFUA 1WSUA 4MHGA 4KMFA 5FO5A 5FFZA 3ML6A 1PP8F 3NQOA 3CDHA 4PGGA 2A6HF 1G6NA 2W25A 1H9TA 4UVBA 4WX9A 2GA1A 2DK5A 4LLGF 5LHHA 3HSEA 3MZYA 1UB9A 4YFNF 1ZN2A 2PMHA 4GXOA 5IT3A 1G3WA 5F64A 5H6QA 1U2WA 3ECHA 5BOXA 3DPTA 4G7HF 2OA4A 2W84A 1LEAA 2XRNA 2MA3A 3MZHA 2VOPA 4OIOF 1U5TA 4HDUA 2KJCA 3HRUA 5H20A 5JVTA 2RN7A 2ZNZA 2VODA 4LMYA 5J6XA 3FHZA 2XAFA 5CVVA 5JHUA 4AWXB 3WODF 1B4AA 5HS7A 1FWZA 2FRHA 2Z99A 2DPDA 1R7JA 3VFZA 2UZKA 1IN8A 1K78A 3KLNA 2KIUA 2Q8KA 3WE3A 4LFUA 2OZ6A 1QQIA 5L3BA 1ZLKA 3MEXA 4G9YA 2QZ8A 5L3FA 5CVUA 1OMIA 4G8XA 1K6OA 1GXQA 3ZN0A 1MDMA 3JAMK 3MFKA 5IT9Z 1T98A 1IZ1A 2HR3A 3ISPA 1OYWA 4I98B 1RIOH 3HTSB 2EV5A 4A2UA 1TQMA 3K0LA 2F5CA 3ECOA 3Q9SA 3TOBA 1R5GA 2WTEA 4YFKF 4EGZA 3R4KA 4ESBA 4MEYF 5E18F 2ZBKA 1YW8A 2CFXA 2CW0F 4EM0B 5K1YA 4U0VA 1IRGA 1R22A 2RVCA 1VTNC 1W5TA 4N0BA 2BEOA 1RI7A 5LHIA 3QRFF 3LFKA 2PJPA 1ZG3A 4XBFA 2QBYA 4P96A 5FD5A 2MC3A 4YIFA 1U3EM 2QYOA 4L9JA 1W7PA 5E1XA 1XDSA 3E6MA 1DP7P 1T6SA 4KMUX 1PDNC 2PN6A 4OIQF 3BJ6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4L0Z B;  1LDD A;  2IJL A;  2K4B A;  3KP2 A;  2IA0 A;  1DUX C;  3EUH A;  2EK5 A;  1YO5 C;  2NS0 A;  1IXC A;  1UFM A;  3HOS A;  3N4M A;  2VT2 A;  1CF7 B;  1STZ A;  3KP5 A;  5E8G A;  3K9T A;  3QU6 A;  5L3C A;  2R3S A;  4UXN A;  3O3K A;  1U5T C;  3FMS A;  1TNS A;  4JBA A;  4U88 A;  4QLC U;  2XAH A;  1S6L A;  2VC0 A;  4QWQ A;  5E1Z B;  4BYY A;  3LWF A;  4HQE A;  3M8E A;  4IRG A;  3J80 K;  1GVJ A;  3VB2 A;  4UVC A;  2DLL A;  3BPX A;  4BNC A;  3I5U A;  1TLH B;  3P9C A;  3QPH A;  1HSJ A;  5D4R A;  5F1R A;  2XAS A;  3EET A;  4HF0 A;  3FXR A;  4I02 A;  4RB1 A;  2BV6 A;  3J81 Z;  3HHH A;  1DPR A;  3BJO A;  2NNN A;  3KP3 A;  2YR2 A;  4TV7 A;  4U7B A;  4OOI A;  4G7Z F;  2A3S A;  1FOK A;  5HOO A;  3RKY A;  1O7L A;  3E6C C;  3F3X A;  2CGP A;  2CWE A;  2PFB A;  3RYP A;  5FGM A;  1KA8 A;  4NHJ A;  4HV5 A;  2HDC A;  4UVA A;  4U0Y A;  3M8F A;  1WI9 A;  5D8K B;  2LNB A;  2XGX A;  2R7F A;  2PBI A;  1J0R A;  2EB7 A;  3C18 A;  2CYY A;  5A2Q K;  3M9A A;  1G3Y A;  2ZFW A;  2EJR A;  2G7U A;  3RPU A;  3QAH A;  3CLO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3WTTC

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