4JP0A

Crystal structure of cry35ab1
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
380
structure length
378
Chain Sequence
LDTNKVYEISNHANGLYAATYLSLDDSGVSLMNKNDDDIDDYNLKWFLFPIDDDQYIITSYAANNCKVWNVNNDKINVSTYSSTNSIQKWQIKANGSSYVIQSDNGKVLTAGTGQALGLIRLTDESSNNPNQQWNLTSVQTIQLPQKPIIDTKLKDYPKYSGNIDNGTSPQLMGWTLVPCIMVNDPNIDKNTQIKTTPYYILKKYQYWQRAVGSNVALRPHEKKSYTYEWGTEIDQKTTIINTLGFQINIDSGMKFDIPEVGGGTDEIKTQLNEELKIEYSHETKIMEKYQEQSEIDNPTDQSMNSIGFLTITSLELYRYNGSEIRIMQIQTSDNDTYNVTSYPNHQQALLLLTNHSYEEVEEITNIPKSTLIKLKKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Toxin
molecule keywords 43.8 kDa insecticidal crystal protein
publication title Structural and biophysical characterization of Cry34Ab1 and Cry35Ab1
rcsb
source organism Bacillus thuringiensis
total genus 100
structure length 378
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05431 Toxin_10 Insecticidal Crystal Toxin, P42
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 4jp0A03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4jp0A01
1K61A 1JLXA 1Z4SA 1MBFA 1OCPA 4OUJA 3HOVJ 4OW4A 3O44A 1BLDA 4A3EJ 3LSPA 3HSMA 4QO3A 1HOMA 3LNQA 3ZX7A 3S17J 3GTOJ 2MSYA 1JTYA 2DRZA 4BKXA 2CUFA 2Z49A 4M3EA 3R4SA 1ZR4A 3ZC8A 5JLVA 1PWAA 4IEJA 1HWNB 3HN1A 1NTCA 2DTZA 1MNMC 1U9OA 4FTHA 1ENHA 3HBWA 2D7IA 2E2IJ 1JKQC 3WO3A 2G0EA 1POGA 5JLWA 2NOGA 4V2GA 5HODA 2HOTA 4HA2A 2XGEA 3ZOBA 4G6MA 4D8HA 2IAIA 4KC3A 4I4UA 4LOCA 2KDZA 3HOXJ 4H04A 2K40A 2K43A 3QYDA 2F2FC 5BNGA 1XHBA 1HCRA 1W3GA 4JYKA 5EEAA 1FV3A 3CA3A 1MBHA 1YRNA 2JN6A 4J19A 4A69C 3HGGA 1MBGA 2LIEA 3LLPA 2Y9WC 1WH5A 5DS9A 1AVXB 3FJEA 1TC3C 3WHBA 3VT2A 1HWMB 2RG9B 2QCOA 3SFIA 1TFMB 2L7MP 1BARA 3OBRA 1SFOJ 1Q04A 4W1UA 4USOA 2J3PA 21BIA 4RBOA 1IHKA 1YRNB 3BQYA 2JA8J 4II0A 3T8SA 2JA6J 2UUSA 1S0EA 3BAOA 4IHZA 5F8SA 1BA5A 4Z8SB 3BRGC 5FLVA 5M5XJ 3S1NJ 1ZR2A 1MC9A 2RQ9A 3ZXDA 2Q9XA 5FKOA 2GLOA 5M3MJ 4D0TA 2WB1N 3LOCA 4M3GA 4XICA 4G1RA 3BA4A 2Y0SN 5EG0A 4ZKTB 2D7RA 2NTDA 3QQAA 3CRGA 4DEPA 3JRFA 2ET2A 2VU9A 1UG2A 1ZGWA 2MW8A 1ETKA 4R6UB 4B4CA 4A3GJ 4Y7NJ 1IUFA 3UD7A 2ID3A 3QPSA 1P7IA 2NVXJ 1EYLA 3OOUA 4B1RA 3RMXA 1IGNA 1UPSA 4IHXA 2VSEA 1DLLA 3VEQA 2O7OA 1YTOA 4L5EA 3H6SE 3CA6A 1HLVA 1CQTA 1I1BA 2L9RA 2HXIA 2YU9J 3C9ZA 1JT7A 3RSJA 2ZQNA 2H1KA 4LO7B 4I4VA 2K4AB 1HCEA 1EPWA 2OPTA 1SR4C 4I6IA 1ETVA 1F36A 2R93J 3A23A 4EFQA 1GVDA 4A3LJ 3MPPG 2KH2A 3K2AA 4GOYA 3UJ4A 4EFPA 3JR9A 5B2HA 1DZCA 3PUBA 4DZPA 2VKVA 4V2FA 1JT3A 3GBGA 3CAHA 5DZUA 3AKFA 3O4OA 4BY7J 3BTAA 9ILBA 1BW5A 4EFRA 1R8OA 4JAWA 1RZOB 1GDTA 4HNVA 4FCYA 1NZKA 3WA1A 2R5YA 1ORKA 5M5YJ 4BY1J 4UUSB 2Y9XE 3V79C 5EZGA 1VNDA 2NS7A 2I10A 2Y2ZA 2VKEA 3ZQIA 5GPCA 4C2MJ 3OJMA 2NVHA 1QVTA 5F08A 4OWJA 2FGFA 1JT5A 1AHDP 1S0DA 2E4MA 5EHAA 3FJIA 1TOOA 2DA7A 3BG5A 5IYDJ 1VCLA 5GP9A 2R5YB 1DFCA 2D5VA 1MBJA 5IP9J 2LKXA 3DCFA 2NM1A 2R0QC 3I2AA 1MH3A 4P0LA 3CRIA 2ZQOA 4XFUA 3D1NI 4LO7C 1R9TJ 5E3OA 3BX1C 3S1RJ 3FJAA 2D1ZA 3FK6A 5BXRA 1T9FA 4LO0A 1FTZA 2D23A 3AH2A 4FE4A 3G1LA 3PHZA 5EDNA 3ZQGA 4ENDA 4I6ZA 1ILR1 3AKHA 4A3KJ 2XPUA 1I50J 1G2HA 4KEKA 4G12A 1X2MA 4D0ZA 3ZXGA 4MFEA 4JPZA 4JX6A 2CU7A 3RMYA 3FIWA 2K9NA 3BTCA 1ETQA 2WAQN 1LFUP 5BVPI 5F8YA 1FTTA 1XS9A 3LSGA 5FNXA 2NVTJ 3BR5A 3JRHA 5IP6A 3EF2A 3IM5A 4QTRA 4D7MA 3A01A 1AF9A 1Q03A 3Q7WA 1OCTC 4OEFA 1XC5A 4FE7A 5E3NA 1AFCA 1AVAC 2ERMA 5FKLA 4CJMA 2NYYA 1FV2A 4AUXA 3BB2A 4KEJA 3OJ2A 3AJ5A 3S14J 5GPAA 3W6VA 3H3VK 1YF8B 2AHQA 3A01B 1LE8B 3FUOA 4I1BA 2RAEA 2Z48A 1JUPA 1M16A 2FQ4A 3O5WB 3MKLA 4ZLBB 1JTXA 1HDPA 1RETA 2E4MC 3JRDA 1K83J 2IEKA 5E3MA 2Y31A 1NK2P 3CQZJ 2M0CA 2XB0X 3TEDA 2GO2A 2P81A 3HEFA 1RKWA 1J0SA 5BP5C 4A3CJ 3BAQA 1DQOA 1HIBA 4XRSG 3PO2J 1JY0A 4Q9PA 2YS9A 4EEEB 4GFBA 2ELKA 4LO0C 3BG3A 2LFBA 3OSFA 4LO8B 3BR6A 1BA7A 3AKGA 2WRYA 2Y9ZA 3CA5A 1BJZA 1GUUA 1BLAA 3NBNA 4GAIA 4EEFG 4B3AA 3S1MJ 3WINA 2M2EA 2E19A 3RTJB 1W3AA 1GGPB 1HF0A 1W3FA 5F0FA 1JUSA 1ETYA 1CE7B 2BFHA 4QSHA 1WD4A 1WBAA 1SZ6B 2JK3A 1IRAX 2DJNA 3B9UA 1JKPC 1Z77A 2DMTA 5FKMA 3OGFA 2CQXA 3N7KA 4I3NA 1EVTA 4XRMA 4USPA 1PUMB 1BFFA 3NAUA 1W0UA 4X37A 4X38A 1YYNA 3O8GA 3F0CA 1LFBA 1D5YA 4HJJA 4M3FA 3H6RB 2EQRA 1H8AC 2IBDA 4QBCA 3VWCA 1FWUA 3HOWJ 3P53A 2DA6A 4ISQA 2DN0A 1ETXA 4Z9WB 3N7MA 4IHWA 4IZEA 1I1EA 4G9MA 4QKSA 4I1EA 3IIRA 4OEGA 5IOZA 4ZFUB 2XRLA 2VI6A 1ISXA 4JKQA 1HCDA 3PG0A 3VSFA 2DA2A 2LR8A 3LSRA 2K9SA 4IHVA 2QYIB 1HKNA 3IAGC 1TWCJ 2KT0A 2COBA 1RR7A 2VXRA 5D63A 5DVHA 3GTJJ 1WI3A 1V6UA 2CQQA 2F8XC 3HALA 4CYCA 1V6WA 5FKKA 1G82A 1FIAA 1MH4A 1ABRB 2L0KA 3OSGA 2D43A 1Z0HA 3L1PA 1S0FA 1PUUB 3PMEA 2HYJA 2ECBA 1WBCA 3S2DJ 2KKIA 3M4OJ 2NP0A 3FJCA 3MALA 2CJJA 1HWOB 3Q7YA 2O8KA 2LTPA 4QC4A 2R5ZA 1EF4A 1IV6A 4CYCB 2EZKA 3S16J 3O4BA 2HW9A 2AQZA 3RZDJ 5EZHA 5HPZA 5BXTA 3NJ5A 2EZHA 2ESUA 4D7NA 4QBVA 3WINC 3Q3SA 1YXWA 2FJ1A 1TWHJ 2R5ZB 1IILA 1E0OA 2B63J 4L4IA 1HDDC 3CU1B 3FJ8A 3IM7A 3JRAA 1D0HA 3HM5A 2MC2A 2MLLB 1QXMA 4I96A 4AN6A 3BAGA 3JRBA 4XFTA 1TWEA 1ETWA 1BASA 4ZBVB 1XG6A 4I2SA 1NUNA 3AJ6A 3SJMA 1ETOA 3S1QJ 5M3FJ 3TC2A 1DIWA 3HGYA 5K7HA 3SNVA 3HKZN 1BL0A 1U8BA 2CRGA 4L4HA 2PMZN 1AU7A 4Q91A 3VT1A 3WMVA 4UUSA 4Y52J 5EC5A 1K5VA 3NARA 4ISRA 4I4XA 3UKGA 3AZVA 2XGDA 4J2XA 1S7EA 1Y1WJ 2VSAA 4I4YA 1E3OC 1G9CA 5DUYA 1O4XA 1TIEA 5FZUA 3OIOA 3IH2A 2HWAA 3HOYJ 1X2NA 2MIBA 3CCYA 5EYRA 1X58A 4RDUA 2Y30A 2DMNA 3ZQHA 1JTCA 5FZZA 2H8RA 4C3JJ 5C44J 4P6AA 2JJ7A 4I4QA 3VUOA 3I2XA 31BIA 2K8RA 3AH1A 4A3DJ 5BXPA 3OJVA 1XYFA 5F04A 3WO2A 3QPLA 2TCTA 3HOZJ 2HOAA 3AKIA 3CRHA 5K7FA 5F1JA 1JT4A 3H6QA 4W97A 2P39A 3GTKJ 1CVSA 3BR3A 3Q7XA 2FFVA 5DTDA 1II4A 4JKXB 5EGOA 3H0GJ 3GTMJ 4JQ0A 2XSDC 3FISA 1WPKA 1B8IA 1UHSA 3BAHA 1DQGA 5IPAA 4J2SA 1DFQA 1T33A 2M9HA 3F1RA 1AVWB 1TTUA 1G9DA 5EGOB 4J2YA 3GTQJ 2M34A 2XGCA 4FISA 4HR6C 1DU6A 1WH7A 1A5JA 1B8IB 4X6AJ 1IRPA 3DEWA 4LO3A 2L7ZA 4I0YA 1QPIA 4EB2B 1H88C 3BA5A 2DA1A 2HXOA 4TLPA 3Q0UA 1ITBA 3FJJA 1Y1VJ 3NBDA 2OF7A 4BXXJ 5K7ZA 4AYBN 1IG7A 1IJWC 3HOUJ 2D24A 4DZJA 1LE8A 3G1OA 2EZIA 1JGGA 1S0CA 3CMYA 3ZQFA 3I4MJ 3RTIB 1S0BA 2NZ9A 4XKIA 3CQAA 3BR0A 3FJBA 4IHYA 1BW6A 1RY7A 2EBIA 3KMVA 3O49A 4G6JA 4JX4A 3OGGA 3Q0WA 1JJ8C 1OQLB 2LIQA 1W0TA 2DMUA 1Z2VA 1PUFA 3B6AA 4AN7B 1BFGA 2FDBM 1F31A 2KI6B 1MD6A 4GP0A 1IC8A 3BA7A 5FKNA 3FJFA 1AXMA 9ANTA 2MGQA 2HI3A 1K5UA 5EF6A 3C2BA 4DYCA 2QF7A 4I4SA 3K7AJ 3O8HA 4X1EA 5E24E 4DENA 4A3JJ 1XG1A 3CA0A 5JMCA 4LO1A 2L5XA 4MO7A 3S15J 2JA7J 1PUFB 4XIDA 1JKOC 3UJ0A 4A7ZA 1HWPB 5BOWA 3BR2A 3I4NJ 3B6CA 1ZQ3P 1R8NA 1MSEC 2HDDA 2R9KB 3OBTA 4GOVA 2GBYA 2CUEA 2HQ5A 1QVUA 3FJHA 3IM6A 2N8GA 2LP0A 1G9AA 1VF9A 4F34A 1QQLA 2FFUA 3ILAA 2YUGA 1N4KA 2HZ9A 3UDAA 3WO4A 2X2SA 4EKXB 1RPWA 3JRIA 3VPRA 1JQZA 3V0AA 1Q1UA 2Y9GA 4M3DA 4MIMA 4BBSJ 1GV2A 4LO3C 3TP3A 3BADA 3BQZA 3I29B 3R4UA 3IH4A 4I76A 1FQ9A 5GAQA 3A21A 4AC0A 3JREA 3TW7A 1JT6A 2MG4A 4M3BA 4GP3A 4ZGRB 3W9TA 2VXTI 5IYBJ 1L2HA 3MVPA 4JX5A 1KNMA 2L7FP 3TP0A 1H89C 5F8WA 2XPWA 4UUTA 41BIA 3RZOJ 3H6RA 3V0AB 3NBEA 4XRSA 1TWFJ 4A3FJ 3LSJA 1Z0XA 4FVVA 3Q0VA 1T4QA 2D44A 1BFBA 4A7YA 2FD5A 1ZKGA 1U9NA 3GTPJ 4G9NA 1AVUA 3N7LA 2JWTA 5M5WJ 3FJ9A 5DSSB 4A3BJ 1ISWA 1SR4A 4QKRA 4S0HB 2AFGA 1FEXA 5C4XJ 1JKRC 3FKIJ 3G1MA 4X3AA 2ZB9A 2DA5A 2X9DA 6I1BA 3FFZA 4XK4A 4D5FA 2ID6A 1ISVA 2BEAA 3HB9A 2I1BA 4LO1C 4XFSA 2DMQA 2E2HJ 2WV1A 1EV2A 3BT9A 5D61A 4LO2A 2NS8A 4DYRA 5J1RA 3CA4A 5C3EJ 2ECCA 2LK2A 2Y9FA 3IH3A 3K1XA 5FNWA 1ISYA 2JA5J 1V6VA 3POKA 5FJ8J 2DA4A 5G00A 4BBRJ 3BRFA 3VT0A 2LVSA 1TP0A 2TRTA 4ZA3B 1RKTA 2IWTB 2BEBA 3N7JA 4H9WA 4P0JA 2LLKA 2W48A 3WMUA 4I4RA 3D7WB 1IJTA 3BAVA 2VLCA 4I4PA 1IOBA 3UD9A 3BTLA 2X48A 1FMZA 3FGMA 3IV5A 3BTJA 1DZDA 5F0HA 5EG0B 4A3MJ 5C4JJ 1ITYA 2D20A 2ME0A 2EZLA 4IY8A 5IYCJ 1XZZA 1FMMS 4A3IJ 1QRYA 2NVYJ 1JT0A 1IDZA 3A02A 5FZYA 3BTIA 5J1UA 3PM1A 1WCMJ 1JUMA 1ZTRA 3E7LA 4P0KA 4MLOA 1FJLA 3GTGJ 1YBIA 2M49A 3M3YJ 1FGAA 2WBCA 3E8LC 1ISZA 3HOMA 1NK3P 1WGXA 1FIPA 1U78A 1APLC 4FGFA 1I3QJ 3NBCA 2M8GX 2XB5A 2LD5A 2JMWA 2DMPA 4A93J 2DREA 5BQUA 2R92J 2X2TA 4GAFA 4IYBA 5F27A 4A7KA 3BG9A 4KBBA 4JRAA 4ZFYB 4Q9GA 2DA3A 3O4DA 4C3IJ 1AKHA 1UMQA 4ABZA 2IHOA 4LO2C 2FX0A 4QALA 4OEEA 4MFDA 4J23B 1OFCX 2AXMA 3V0BA 5F0CA 4J2KA 3FUQA 1TWGJ 4ZFWB 1IRZA 2XOAA 3S8KA 5FLMJ 2HWMA 1PZZA 2EH3A 4KEIA 1P7JA 1AKHB 1SANA 5EG6C 3ZC9A 5IOYA 1MSFC 4QIWN 3N0KA 4X39A 1A6IA 2NVQJ 3A07A 2R7ZJ 3V0BB 4IQPA 1TWAJ 1M2TB 5I1BA 1A8DA 3JUTA 3HDDA 4QD2B 3RQIA 1DU0A 3ZQLA 1RESA 1G9BA 1BFCA 4M6VA 3F62B 1B72A 3FJKA 2E2JJ 2Q3NB 4NDLA 2D22A 3O3QA 3S2HJ 2AO9A 5D62A 8I1BA 1QQKA 1RMLA 3HMYA 1WD3A 2P23A 5BP5A 1RG8A 2DRYA 4ZOTA 2XPVA 1TWMA 3A22A 2X6OA 2RSTA 2K9QA 3GTLJ 1B72B 5IP7J 3FK7A 2GM4A 1F43A 1GV5A 5F90A 1IDYA 2HOSA 1FWVA 4YOLA 4I4OA 2QN4A 4DYQA 3A03A 3O4CA 3RKQA 4I7IA 4PC4A 2LY9A 1T56A 1IT0A 4DCKC 1FN0A 1OJLA 2DS0A 3HBLA 5BXSA 3LTQA 4OWKA 4JP0A 4WBCA 2O9LA 5J1YA 3MN2A 3P6JA 1S0LA 5BQUC 2Y9YA 2E1OA 1V6XA 3PO3J 1ZK8A 2FO1A 1GT0C 5JLXA 2F2FA 3P6IA 3VSZA 1DJSB 3AZWA 4I37A 4IZXA 3QR5A 2AAIB 3AH4A 4DW6A 3UD8A 4IONA 1MBEA 3BAUA 1I6HJ 3WHCA 4QD2C 5E3LA 4I8MA 3CA1A 3BRDA 2KI4A 4D5CA 1PC8B 2VUAA 3S8JA 2VUMJ 3ZQCA 2ZR1B 3BR1A 3TW6A 2KLLA 2VPRA 3O4AA 4OWLA 1VFCA 2ME6A 4C3HJ 3JRCA 5J3LA 1Q1VA 1P63A 1VI0A 3CDLA 2GZBA 1MBKA 1JJ6C 1ONKB 1S0GA 3SDGA 3JRRA 1JLYA 2YUSA 3FJDA 7I1BA 4F83A 3JRGA 4IY9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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