3HOSA

Crystal structure of the mariner mos1 paired end complex with mg
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
341
structure length
336
Chain Sequence
VPNKEQTRTVLIFCFHLKKTAAESHRMLVEAFGEQVPTVKTCERWFQRFKSGDFDVDDKEHGKPPKRYEDAELQALLDEDDAQTQKQLAEQLEVSQQAVSNRLREMGKIQKVGRWVPHELNERQMERRKNTCEILLSRYKRKSFLHRIVTGDEKWIFFVNPKRKKSYVDPGQPATSTARPNRFGKKTMLCVWWDQSGVIYYELLKPGETVNAARYQQQLINLNRALQRKRPEYRVIFLHDNAPSHTARAVRDTLETLNWEVLPHAAYSPDLAPSDYHLFASMGHALAEQRFDSYESVKKWLDEWFAAKDDEFYWRGIHKLPERWEKCVASDGKYFE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase, dna binding protein/dna
molecule keywords Transposable element mariner, complete cds
publication title Molecular architecture of the Mos1 paired-end complex: the structural basis of DNA transposition in a eukaryote
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila mauritiana
total genus 84
structure length 336
sequence length 341
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.-:
pdb deposition date 2009-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01359 Transposase_1 Transposase (partial DDE domain)
A PF17906 HTH_48 HTH domain in Mos1 transposase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3hosA02
1.10.10.1450 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 3hosA01
3.30.420.470 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hosA03
1L0OC 4AVPA 3DV8A 3R0AA 4CXFA 2ACJA 1D3YA 4BAYA 4OMZA 4WF2A 4MEXF 1O57A 2EFNA 2F2EA 1F1ZA 2IA1A 1BJAA 2EV6A 1UFMA 3FM5A 3GF2A 2V1DA 5L3EA 3T0YA 4XLNF 2GZWA 1MDMA 2BEOA 2R3SA 3W6JB 1S3JA 3WTYC 2OZ6A 1F9NA 2R7FA 3WG9A 1IXCA 3H3ZA 1ZAOA 2O6GE 3NQOA 4M9ZA 1WI9A 5H6RA 3QU6A 4EGZA 1LEBA 1A04A 2KJBA 1PP7U 3G3ZA 4S04A 3RYRA 2WTEA 3TDUC 3V7SA 2FMLA 4YFXF 2W57A 1J5YA 3R4KA 2KRFA 3B73A 2DI3A 3BY6A 3BOQA 3KP2A 1FLIA 1UB9A 2V6CA 3VFZA 3ZMUA 2YPRA 4KUMA 4ENKA 1D8KA 1I5ZA 3HSEA 3RPQA 3F21A 4EM2A 3ABTA 2KJCA 4AD9A 3E6CC 2HYFA 4RB0A 5A2QZ 4ENJA 2HZTA 2DT5A 1ZLJA 3VODA 5J6XA 4L18B 3RTRA 4WX9A 4QLCU 2DK5A 3E5QA 1USTA 4LMYA 2E7WA 1W5TA 2FBIA 3LWFA 5BMZA 4Q4ZF 4OIRF 2DBBA 1IN5A 2IW5A 2STTA 2TDXA 3E5UA 1WSUA 3T8TA 3IRRA 1BOAA 4KN4X 5E20A 1FYKA 1Z91A 2HKOA 2L54A 3QAHA 1O3RA 1HW1A 4I0AA 1HSJA 3ML6A 2H27A 3FX3A 1FBSA 5EEGA 1KQ0A 3GFJA 1T38A 2M45A 4A2UA 1FBQA 2BGCA 1LJ9A 2LF7A 2DK8A 5IT9Z 5E1XA 5L3BA 5LGTA 4BHPA 4HOBA 4Q47A 3W6KB 2UWMA 4OIQF 4EM1A 1ZGJA 1IF1A 1B9MA 1XGSA 5ILVA 1KGSA 5LEJA 4GXOA 1Z6RA 5L3GA 2FBKA 4MQVA 5TRDA 1FYMA 3K1PA 4OIPF 5DYMA 2P5KA 1ZARA 1QGPA 4HF0A 3L2CA 1TW3A 1XCVA 3JAMZ 3U1DA 1EH8A 1LDKB 2XHKA 3FM3A 2M8EA 3DF8A 4D0PA 1G3SA 5LEKA 4UV8A 1FSHA 1QZZA 4AIKA 3WTTC 2QBYA 2YSRA 3RKYA 2GWRA 3P9CA 3QPTA 4A5NA 1MJ9A 3FXQA 2DAOA 2VODA 2COMA 3GO5A 4IJAA 3OV8A 4GCVA 1JXSA 2VT2A 3N4MA 1ON1A 1MGTA 4OU0A 4YG2F 3F2KA 1KU9A 3FHZA 1NHAA 4PZJA 2ZBKA 4RAYA 2EJRA 3BZ6A 2RVCA 1R1TA 4G8XA 4L9JA 2MBFA 3VOEA 2FF4A 3O6BB 1XSVA 1R00A 4RB2C 3IKVA 1W7PD 4XLPF 1K78A 4MDAA 4I09A 4ZH4F 1HKQA 2IP2A 4HDUA 2DFIA 4HV5A 2XASA 4LLLA 1F4KA 2HR3A 4H0EA 4I7HA 1Z6TA 4LG0A 4OMYA 3WGIA 4WWCA 1VTNC 4CICA 3GZ6A 2QUFA 4JQFA 3Q9VA 2XKPA 3E5XA 2QYOA 4LFUA 4HDVA 1Y0UA 2DPUA 4UVBA 4M6YA 2XIGA 2VC1A 4DNCA 2FBHA 5BQTA 3K1MA 1TQPA 1TQIA 3I0TA 4TV7A 1KU3A 2V1UA 2Z9OA 5BS6A 1IZ1A 5CVVA 4EM0B 2VN2A 1OYIA 4MDBA 3BJOA 3FZVA 5HLGA 1RIOH 3I58A 1XDSA 2DU9A 3M8EA 3GYHX 3WGHA 1ZRDA 1ZH5A 3O2PE 4HF1A 3NEUA 3F8BA 2ZO4A 1SD4A 5ICCA 3IWFA 1U5TA 1KU2A 3KCCA 5CR4A 4FT8A 3RI4A 2XAHA 1R1VA 3DKWA 5HLIA 3ULQB 4BXUA 2EFWA 1TBXA 4HZFA 2LKPA 1XDUA 1B1BA 3SZPA 4U88A 2NRAC 1J0RA 4NHJA 1H9TA 2IPQX 2XV4S 4IXAA 1XGNA 3K69A 1TNSA 1XSXA 2J5PA 3TO6A 4ASNA 1BM9A 2OQGA 2W25A 4YFNF 2IRFG 5ILUA 2IT0A 2OZUA 1QQIA 1Z7UA 3NRVA 1JHFA 4Y13A 4OOIA 1IRGA 4HLYA 4HV6A 2VBXA 2EFQA 1XGMA 3RYPA 4FHTA 4U0VA 3C18A 5K5RA 3BJ6A 5DCMA 1SMTA 2EB7A 1MJAA 4GO1A 3V7RA 5E18F 1UCRA 3MWMA 3QRFF 4P9UA 3SZTA 5D5UB 3RDIA 5L3CA 4ZYGA 2ZNZA 1KU7A 1FPQA 3HRMA 2FNPA 5E8GA 3K2ZA 1FZPB 2XAFA 1FX7A 3SXYA 1I1SA 2H6BA 4MTDA 4AIJA 3GEZA 1Z1DA 4A12A 4ZZLA 3GWZA 3HOTA 1T39A 3F72A 3HTUA 3J80Z 5E1WA 4R79A 3V7CA 3WTWC 1KA8A 2W84A 1O3QA 1ZREA 1W5SA 2NNNA 1SD7A 1HSTA 2D45A 4R1HA 1B9NA 1TLHB 2O8XA 3GW2A 4U7BA 3KFWX 4NB5A 5D5XB 3BROA 3CO7C 4KMFA 2FE3A 2AS5F 1R23A 3M9AA 3Q5FA 1YTYA 1S29A 5DD8A 1G3TA 2HS5A 2ESNA 4L9VA 3BJAA 2DW4A 3MZHA 4IHSA 2QVOA 5FFZA 1USSA 1SFXA 2M30A 4GYIA 5ED4A 2L3DA 4MNUA 2HQRA 1ZHFA 2IJLA 3I64A 1XMKA 4LLNA 5DUIA 3MZYA 3L00A 3KEOA 1R22A 4Q5SF 3T8RA 1SFUA 2Z33A 3GX4X 3ECOA 2KIFA 2M1BA 2VOPA 2GIVA 1UHMA 1YO5C 3GXOA 5DUKA 2MD5A 3EDPA 4LB6B 3I54A 4YIFA 3P7NA 4KDPA 2Y48A 4KICA 2V9VA 3P9IA 4RGUA 2P7CB 3GVAA 1U8RA 2F7TA 1XGOA 5HS9A 4IVNA 1G4DA 4G7ZF 5J8FA 2FEZA 3IWZA 1G6NA 2NAZA 3DPLC 4FX0A 1IUYA 2GXBA 4PGHA 2H94A 1DUXC 5LRRA 3GLXA 3CJNA 1XMAA 2F5FA 1MDMB 1U78A 1KQ9A 2F5CA 2HTSA 2RV8A 5K5QA 1P4WA 4UHTA 3DEUA 1GXPA 3E6DA 3HHGA 4WXCA 1HKSA 2MH9A 1QPMA 3ZMVA 2KIUA 1YG2A 4L5IA 2IA2A 3LFKA 1YS7A 4BYYA 3VEPA 2PBIA 1RZ4A 2G9WA 1ZLKA 1KYWA 1CF7A 4P5OA 3ROUA 5BPDA 2ISZA 3F23A 2GA1A 5AIQA 2R7DA 1WKMA 1U3EM 2GQQA 1BI1A 2JZYA 3ABUA 3BPVA 2K4JA 3ELKA 2DQRA 1XSDA 3JSPA 2ETHA 3DQVC 1S6LA 4WXDA 2HEOA 2AXLA 2CYYA 1X3UA 2QQ9A 2HYGD 1YFHA 1JGSA 3QU3A 4CZZA 3CUQC 3F6OA 3I59A 1O3SA 2DLLA 3SHFA 2H6CA 3TO9A 2FRHA 4IRHA 1F5TA 2EK5A 4K2EA 5HS8A 4UUVA 1REPC 3V8KA 3DXJF 2Z3YA 2UXXA 1V3FA 2MH2A 1PP8F 4RGSA 5JR3A 4A0YA 1BIAA 2QQBA 3H92A 3LSTA 5F1RA 2PG4A 4BHBA 5A2QK 1BBYA 5ICFA 3JW4A 2MLKA 4OIOF 2A69F 1OPCA 1PUEE 5DD4A 2K27A 2JPCA 3M8FA 4Y15A 3ZMTA 3LAJA 2E1NA 2RQPA 2QWWA 1D8JA 3GZ5A 1XCBA 3J7AO 1ZN2A 4HX7A 3WODF 3TOBA 2B0LA 4L0ZB 1RI7A 5FLXZ 5EEHA 2F5EA 3MFKA 2X0LA 2VONA 2FA5A 4L9TA 3I5UA 1FSEA 5BPIA 4UNOA 5LGNA 3K0LA 2RGVA 5HS7A 4LLGF 2L4MA 2XRNA 1FNNA 3ERED 3B02A 3KP5A 1RNLA 2WWYA 3RIRA 3CLOA 1I1GA 4XSZF 1HQCA 5LLQA 5IT9K 2QBYB 2IVMA 3Q9SA 1RUOA 4ESJA 2OQRA 1I6XA 2CGPA 5D5WB 1LDDA 3LA3A 4U0YA 5CVJA 3EUHA 2OBPA 2A68F 3WTVC 4O5VA 3F3XA 4CHUA 1GVJA 4XBFA 1ZG5A 4PCQA 4ENMA 1T2KA 4O6JA 2V1XA 3E6MA 1MD0A 1S7OA 3ZN0A 3JAMK 3MEXA 2QLZA 5CVRA 4HYEA 2RNJA 1P6RA 2JTVA 3EYYA 5FLXK 3GFMA 3E6BA 3IRQA 4CDGA 2UZKA 3JTGA 3IKTA 3R6SA 3L7WA 2D2WA 3V8LA 4LG0B 4N9IA 3T5XA 1P2FA 3KETA 1U2WA 3C3WA 2ZKZA 2NNYA 4ENNA 3JSOA 3HOSA 1J59A 3O3KA 5F64A 3DPTA 4P9FA 4JK1X 2P6TA 2HTJA 3F6VA 5K1YA 2A07F 3EETA 1IN7A 2ZCWA 2QENA 1JE8A 1PDNC 1E17A 1J9IA 1BN5A 4BHCA 1ZRCA 1Z05A 1EH7A 1IXRC 4BH9A 1RUNA 3LQRA 4ZYHA 2D1HA 3HIFA 1J7KA 4UVAA 3KEQA 1EH6A 2RKHA 3AAFA 4UV9A 2W24A 2EFPA 1P92A 2M5WA 4UVCA 5D8KB 4E70A 5CYVA 5D8LB 4B09A 2W85A 3HHHA 4KFCA 3GFIA 1QZYA 4EVIA 3LAPA 3QP5A 2GA2A 3CUQB 4S05A 4KN7X 3IC7A 1BIBA 2HGCA 4OINF 4ESBA 4RGRA 4MHGA 5FO5A 4BQAA 3KP7A 3MCZA 3OOPA 1TTYA 4ETSA 4M9XA 3J81Z 2P5LC 1D5VA 1QBJA 3GUDA 1ODDA 4KYWA 3LQQA 1IN4A 3R0JA 3EQLF 4HX8A 5LRSA 5LHGA 4I0BA 2P8TA 2FOKA 1MZBA 2ZMEB 1R7JA 5FD6A 2DQLA 5JHUA 1DPUA 4B8XA 1IN8A 3ZP5A 4XRFA 1W7PA 2QZ8A 3LA2A 2HKXA 3K9JA 2L4AA 4RAZA 1P4XA 1JHHA 1FYLA 1K6OA 2OAZA 4ZYEA 1WQ2A 3WE2A 5LHIA 4HW0A 1W4MA 1P4AA 1Z9CA 2E1CA 4PDKA 1ONVA 2D1VA 3COAC 3F8NA 2FQ3A 3IL2A 1ZG1A 3KP4A 3J81K 1G3WA 1I27A 5JVTA 2VC0A 1T98A 2MC3A 1YW8A 5HLHA 2O0YA 2V79A 3HRSA 4HLXA 3HRTA 2BBYA 4M6XA 4Q48A 4LD5A 1YW9A 4WXHA 4RB1A 3I4PA 1SMYF 3REOA 2P4WA 1AWCA 1LNWA 2GXGA 5AONA 4L0YB 4YIIA 2YX4A 1TW2A 2L02A 2CW0F 1ZRFA 4QWQA 2DTRA 2P6SA 2FSWA 2O3FA 3PQJA 1B6AA 4RS8A 1OMIA 4DQ2A 1LVAA 4EJVA 1GXQA 2RN7A 2PFBA 3KE2A 4PGGA 4KIFA 1YYVA 5HDGA 3J80K 2E7XA 3GFLA 1SAXA 1IXSB 1CGPA 1R1UA 2A3SA 3RJPA 3PQKA 4JBAA 2PEXA 3HSRA 2LSOA 2LNBA 2XAGA 2G7HA 5CLSA 5HVQC 3V4GA 4N0BA 5H6QA 5D4SA 1TNTA 4KIBA 4Y17A 3BPXA 4M9SA 2CSOA 4A0ZA 3N97A 2XKOA 2RDPA 2EV5A 1OYYA 2RC4A 4HF2A 2STWA 4G7HF 1QNTA 3LA7A 1J75A 3KZYA 5DCFA 3CUOA 3PFIA 4MQ9F 5JFRA 2BYVE 1YW7A 3E97A 2XGXA 2YU3A 3R61A 5H20A 1WWXA 2XAQA 3TGNA 5HOOA 3CDHA 5E8IA 2BV6A 3EYIA 5FD5A 3CO6C 2VXZA 2PLYA 4IRGA 4P96A 3KP3A 3SFZA 2JSCA 2A6EF 3TQNA 3BWGA 4I2OA 2DO7A 2ZFWA 2Q0OA 2PJPA 4R8HA 1BI3A 3C7JA 3WTZA 4AWXB 4KMUX 2QM3A 1CF7B 4EJOA 2ZNYA 2JPBA 2G7UA 5ILSA 1IRFA 5E17F 1U5TC 2YR2A 3HTSB 4EJUA 2XROA 3ZMSA 2QQAA 3MQ0A 4RB3C 3RKXA 1HW2A 4EJTA 2VE8A 1OR7A 5DEQA 1IAWA 3QPHA 4P55A 2C6YA 2OD5A 1LEAA 2CO5A 2VOOA 2NS0A 2GAUA 3I59B 1WRJA 1XD7A 1H0MA 1YS6A 3HUGA 2ESHA 2FMYA 3K9TA 5K5OA 2JRTA 1DP7P 1FT9A 2VT3A 2H09A 1EV7A 1KYZA 1FOKA 3FXRA 4L5JA 1ZGAA 4IF4A 2VBYA 3IHUA 2FNAA 1K79A 1OYWA 2Z5UA 2X4HA 4HA8A 5AIPA 3WTXC 1DDNA 5KVRA 4KNYA 5LGUA 5FFXA 2EV0A 4LK1F 1BI2A 4IPAA 1HKTA 1HBXG 3WU1B 3K9KA 3F22A 3FMQA 1R36A 4ON0A 2PN6A 2WV0A 2A6HF 1QO0D 4XSXF 4GGGA 2K7LA 4EGYA 3FWEA 5D6EA 4U0WA 1YQAA 2EWNA 2CG4A 2MA3A 2O61A 2XAJA 4LB5A 4LGWA 5FB2A 1LDJA 5D5VB 4CYDA 3U2RA 1H9GA 2PI0A 3F8FA 5D4RA 4Z2YA 1UHWA 1S8NA 2A61A 4U7DA 2OA4A 2ZXJA 3M7GA 1FBUA 2VBZA 2Q2EA 1B4AA 3P9KA 3H3UA 4IHTA 4MGRA 6PAXA 2FXAA 1U6GA 3KLNA 3FXUA 5CJ9A 4WCGA 2XVCA 2ADUA 1Q1HA 3VB2A 3ECHA 2CQKA 2F5DA 2PQ8A 1IN6A 1HXDA 1OKRA 4EQQA 2K02A 1K78B 4MTEA 1STZA 1BI0A 3DP7A 3HRUA 4L9NA 3WGGA 4G7OF 1MJBA 4HBLA 1DPRA 3RPUA 3FMRA 4ESFA 4M72A 5ERIA 2OU2A 2VBWA 4HAMA 3G73A 1E2XA 5JI6A 4LK0F 5F6FA 2HFHA 1YLFA 4KT5C 3ISPA 1O7FA 3RKWA 2EA4A 4G9YA 3L09A 2UXNA 4M73A 5TJJA 3JTHA 2Q8KA 2K86A 1BC7C 4FX4A 3D0SA 3ZN1A 3D5LA 3E3VA 3WU0A 1S7AA 3BDDA 3KLOA 1O7LA 2PMHA 4EMSA 2P7VB 3KP6A 3KZZA 2BE5F 2YX7A 4KA4A 1FC3A 4I98B 1T6SA 4N9HA 5D6FA 4IRIA 5L3FA 1U5TB 2PMUA 4M74A 3T1BA 5DDGA 3DFGA 2LDUA 2FU4A 4O3MA 3CUQA 4UXNA 2IA0A 2K4BA 1FP1D 4G94A 3I53A 3FF5A 3QOPA 3I71A 4G6DA 2ELHA 1YIOA 3R60A 4GYGA 5CVUA 1ZYRF 2HQNA 2ISYA 3S2WA 2EFOA 5KK1A 1KQ8A 5ICGA 1IW7F 4HX4A 3L9FA 1ZG3A 1SD6A 2O03A 1AOYA 1ON2A 3C1DA 3ZPLA 4HQMA 1SD5A 1XB4A 1ULYA 3HYIA 2ZMEA 1G3YA 1L3LA 1B59A 2WC2A 4A6EA 5DCMB 3MAJA 1R5HA 2LF8A 4A5MA 1FP2A 2J5OA 1V4RA 4CO8A 3F8MA 4LJZF 4MEYF 2A5YB 3TO7A 5LHHA 5HDNA 5J8CA 5L3DA 4HQEA 2L01A 3V8JA 2HOEA 1TQMA 1W7PB 2Z99A 4ZZDA 4F7ZA 1R58A 4EJWA 2MLGA 5BOXA 1J2XA 4A0XA 3ZQ7A 2EA2A 5DV5A 2M87A 3SQNA 1T0FA 2HDCA 3TDZC 3TOAA 4CGZA 1HW5A 3WTSC 5CVIA 4ZYDA 3ZMZA 3K1NA 3WTUC 4YFKF 3HSFA 2ZJ2A 4KIGA 2P5VA 1FY7A 1FWZA 4A6DA 2XUBA 4EV0A 2KKOA 2KIMA 2Y75A 3U9GA 1XN7A 4I02A 2DPDA 3BP8A 3FMSA 1LB2A 5ICEA 5E1ZB 3WE3A 2CWEA 3M1EA 5HDKA 1K7AA 3TKYA 3CTAA 1LQ1A 4RGXA 5IT3A 1O3TA 5LBQA 2HWVA 3ZMDA 2JT1A 1R5GA 1MKMA 1BC8C 4NQWA 2CFXA 3QP6A 2NYXA 2VE9A 3F8CA 4I01A 4WK8F 5FGMA 2Y0MA 1C0WA 1GHCA 1SFEA 4BNCA 4M71A 4G6QA 4AIHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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