5JFR | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	369
structure length	366
Chain Sequence	KVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGQYRIHAGKTVPIVKGTRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPIRLPRTKHLLNVINENFGTLAFCRRWLDRLGESKYLMALKNLCDLGIVDPYPPLCDIKGSYTAQFEHTILLRPTCKEVVSRGDDY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords	Methionine aminopeptidase 2
publication title	Discovery of potent, reversible MetAP2 inhibitors via fragment based drug discovery and structure based drug design-Part 2. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	122
structure length	366
sequence length	369
ec nomenclature	ec 3.4.11.18: Methionyl aminopeptidase.
pdb deposition date	2016-04-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00557	Peptidase_M24	Metallopeptidase family M24

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	5jfrA02
3.90.230.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Creatine Amidinohydrolase	Creatinase/methionine aminopeptidase superfamily	5jfrA01

2NNYA 4LB5A 2TDXA 1FT9A 5H6RA 3R6SA 4MQ9F 5EEHA 1E2XA 4Q47A 4GXOA 2P98A 4O6JA 1HW2A 4L9TA 1WL9A 4ETSA 3IKVA 4P55A 2VC0A 4OU0A 1XMAA 3CO6C 2QWWA 3HTUA 3TOAA 4G94A 3DXJF 5LHHA 1Y0UA 2A69F 1X3UA 2EFPA 3ZP5A 1K7AA 2BWVA 1DPRA 1UB9A 3CUOA 1XB4A 4GYGA 4G7HF 4WX9A 2GQQA 3GWZA 1PP7U 2EA2A 1WRJA 2KJCA 4XSXF 5HOOA 2CWEA 4UVBA 2VBWA 4KIBA 1T39A 4HAMA 4YG2F 2F5DA 5FD5A 3FHZA 1IRGA 1XGMA 1STZA 1FX7A 4L5IA 3F6VA 1W2MA 3FX3A 5DD4A 1QZZA 1WLRA 3C18A 3F8MA 1EH8A 4NB5A 3GEZA 2D1VA 3L24A 3NRVA 4WWCA 5ILSA 4EM2A 2JRTA 5CVJA 2EV5A 4ENKA 3EQLF 2OD5A 4U7DA 2BWYA 3DQVC 1FYMA 3E6BA 5BPIA 2P4WA 3WTTC 2BBYA 4UNOA 1REPC 3E3VA 5JVTA 3SZTA 4ZYHA 2B3LA 2O03A 1XGOA 2Y48A 3DP7A 3W6JB 1I1GA 3HRTA 1O3TA 2HFHA 4Q4ZF 1JE8A 3HSFA 4KMFA 1YFHA 2OA4A 2LKPA 3I4PA 3HHGA 5CVUA 4PGHA 2Q0OA 2Q95A 4U76A 3L09A 2GZWA 1DUXC 1TNSA 2GWRA 4ENNA 4OIQF 1H9GA 4A0XA 4HX4A 4QWQA 5A2QZ 2H09A 2HTSA 2Z3YA 5DDGA 3ERED 3TDZC 2WV0A 4ZZDA 2XAQA 5DV5A 4MEYF 3GLXA 3GVAA 3RDIA 3RPQA 4HDVA 2DK8A 1O57A 4PCQA 2GZ5A 4A5MA 3KP4A 4PDKA 3JW4A 1ZREA 3IL2A 5FFZA 5LLQA 2V1DA 5LGNA 3TDUC 3V7CA 2OAZA 2NS0A 5E1WA 2VT2A 4P5OA 2CG4A 1SD6A 3S2WA 1BBYA 2RVCA 2A6EF 1TQIA 5CYVA 3V7SA 1O0XA 3C3WA 4KNYA 4RGRA 2V3ZA 5HLHA 4GYIA 2V1XA 3J80Z 1S6LA 4FX0A 3ZMSA 1XCBA 3MX6A 1T6SA 1W7PD 2OQRA 1HW5A 4FLKA 1ZLKA 1WWXA 4UV9A 2G9WA 3TAVA 1O3SA 1CF7A 3I71A 4HW0A 4MATA 1LDDA 4RB2C 3MR1A 4U88A 4HF2A 2GU7A 3I54A 1BN5A 5HS8A 2Q92A 3DPLC 2E7XA 4UXNA 4RB1A 3BIQA 4OIOF 2RNJA 1XGSA 2V9VA 2E1CA 5LEJA 3IWFA 2OZ6A 3IU8A 1P6RA 4EVIA 4KN4X 4IDYA 4RZZA 4HA8A 5JR3A 2Z5UA 3IKTA 2DLLA 2DO7A 3QOPA 4EM0B 3KP3A 2DFIA 2RKHA 1HBXG 1YW9A 2DPUA 4EV0A 1BI3A 4A0YA 1PDNC 1SFEA 3BP8A 4ENMA 2LDUA 3DV8A 2P99A 5D6EA 2VONA 1C27A 5IT3A 2M1BA 1DP7P 5K1YA 2VE9A 3DEUA 1T2KA 4ON0A 4A2UA 4I2OA 4LG0B 4IVNA 2F2EA 3RKYA 3FZVA 4HF0A 5H6QA 4HX8A 3B02A 1ZG3A 3DF8A 4RAYA 1D5VA 3TO9A 3ECHA 3IWZA 2Y0MA 3F72A 3NQOA 3MZYA 2DI3A 3L00A 4Q48A 2ZMEB 4A6EA 5CDEA 1TLHB 4CICA 4B8XA 2HYFA 4I02A 2QBYB 1FNNA 3R61A 3K1MA 1FBQA 4UVCA 2ZFWA 1U6GA 3B73A 1U2WA 3I59A 2ZCWA 2P6SA 3ELKA 3FM3A 5LGTA 4IF7A 1R5HA 5HDKA 2A3SA 1AOYA 1IN5A 4WXDA 3O2PE 1KYWA 1IXRC 4JQFA 4E70A 1KU3A 3BITA 4YFKF 2GXGA 2A68F 2UXXA 2BH3A 3QP6A 4MGRA 4AVPA 1MDMB 1FBUA 3ZMDA 1Q1HA 5K5OA 2DPDA 3PQJA 3I58A 4EGYA 3I64A 2XIGA 2PLYA 1F9NA 1SD7A 1OYYA 4WK8F 2STTA 3HUGA 3RYPA 1XDUA 2QLZA 2FOKA 2Q93A 2GU6A 2MLKA 1B1BA 3ML6A 5E8IA 4EM1A 4IKSA 2YPRA 2EWNA 2H6CA 4S2TP 2XAJA 5DUKA 4CO8A 2M5WA 1N51A 5J8FA 1FLIA 2B3KA 2CSOA 3RJPA 1G6NA 1V3FA 1ON1A 3ZMUA 2VT3A 1T98A 4HF1A 1R1VA 3J81K 4HOBA 3D27A 1FYKA 1BC7C 3EYIA 2EFNA 1ZH5A 4G7ZF 4EJOA 1FP2A 1BM9A 3P9IA 3D0SA 1FC3A 4I01A 5DCMB 5J8CA 2RN7A 4G8XA 4HQEA 2Z33A 3WTWC 1K6OA 5HS9A 3RIRA 2EVOA 1W7PB 4HLXA 3ZN1A 3COAC 3RVAA 1R22A 3E6DA 5FLXZ 3F6OA 2DU9A 5HS7A 2X4HA 4DQ2A 3IRQA 4OOIA 2EA4A 3U9GA 1DDNA 1WL6A 2VC1A 1G4DA 3KEQA 1LNWA 4XLNF 1P2FA 1EH7A 4P9FA 1F4KA 4H0EA 3BOQA 1UHWA 2HS5A 4L9JA 1O7LA 2H94A 3ECOA 2L01A 4KIGA 1BI0A 3BIPA 3KEOA 2HYGD 2FF4A 2MD5A 5F64A 4KFCA 1S8NA 2VOPA 1O7FA 2O61A 5LHGA 3Q5FA 1QPMA 3HYIA 3T1BA 1QBJA 2JSCA 3GUDA 5EEGA 2KIFA 4B28A 1G3SA 1J9IA 1U5TB 5ILUA 2QENA 2X0LA 3KP7A 2DTRA 4CXFA 1A04A 3GFIA 1GVJA 1Z6TA 2VE8A 4AIHA 2VXZA 3T8RA 2XVCA 3K69A 4RGXA 4RGZ1 1FY7A 2ZO4A 2XV4S 3EUHA 2OQGA 1RI7A 1ZAOA 1XGNA 2IW5A 2BN7A 3C7JA 2B0LA 2O8XA 1ZARA 3F8CA 3CTAA 1IN7A 1YLFA 2G6PA 1XSDA 1R23A 4IRGA 2XKPA 4RS8A 3QRFF 4FLLA 2LSOA 3SFZA 1T38A 5IT9Z 4IKUA 4CDGA 3E5XA 1I1SA 2BHDA 2EK5A 3W6KB 4B09A 2RDPA 4M74A 1B6AA 2FE3A 2OU2A 3KETA 2FXAA 5FB2A 4ZWUA 2HZTA 2ZSGA 3FXUA 1MGTA 1IN8A 5FD6A 3GFMA 5CVIA 4MTDA 2QVOA 2EB7A 1J5YA 5CNXA 3U2RA 3K1NA 1I5ZA 4QLCU 3G73A 4PV4A 1ZN2A 4BH9A 2VBZA 4Q5SF 1HKQA 2EJRA 5D5XB 5DCFA 1IUYA 2ETHA 2P7CB 5FO5A 1WBQA 4EGEA 2Y75A 2GTXA 4CZZA 5D4RA 1LEAA 3IU7A 4ZNGA 1XSVA 3T8TA 4I09A 2WWYA 3V8JA 3FF5A 3KFWX 2KKOA 2Z99A 3HOTA 1S29A 3GYHX 5LHIA 1LEBA 4IRIA 4BQAA 4R79A 3Q9SA 4AIJA 3MQ0A 1P4XA 2ESHA 3RI4A 4A0ZA 4U71A 4Y13A 4S2RP 2K27A 4HYEA 4M9XA 3R0JA 3IG4A 3LQRA 1FWZA 1MKMA 3D5LA 2MH2A 5FCHA 4U6WA 2BHCA 1ZYRF 3RYRA 5E5BA 2G7UA 3I53A 3TKYA 3KLNA 3J7AO 1BI1A 2CO5A 5FCFA 3CUQC 2YSRA 2DBBA 3CB6A 3TOBA 1C24A 2F5CA 4BHPA 2H6BA 3V4GA 3JTHA 4ZYDA 2YX7A 1ZHFA 4U0WA 1QQIA 3ABTA 3LAJA 3LSTA 4LK0F 2IRFG 3M9AA 5ICGA 4U7BA 2B3HA 4AWXB 1C23A 4XBFA 2E7WA 1D8JA 5JHUA 3T5XA 4YIFA 3PFIA 1IXCA 3WGIA 1P4WA 1RIOH 2BV6A 2W25A 2XRNA 1TQPA 2PMHA 2BGCA 4WXHA 3F8BA 2GIVA 5HLIA 1K78A 3BJAA 1XD7A 2P6TA 1R00A 2K02A 3ISPA 2MC3A 3KP6A 3ZPLA 3PKCA 1QGPA 3JAMZ 2BWXA 3OV8A 4KICA 2PJPA 1KQ0A 5E18F 1M35A 3GX4X 1ODDA 2UWMA 4JBAA 1GHCA 3L2CA 2P9AA 1TW2A 2KIMA 3N97A 2W57A 1XNZA 1TW3A 3ZMVA 2NQ7A 4KYWA 3BWGA 2IT0A 3ABUA 1UCRA 3SQNA 4RZYA 1FP1D 4LG0A 3REOA 2V79A 4LFUA 4KUMA 3KE2A 3RORA 2Q8KA 2D1HA 4F7ZA 3BDDA 4GCVA 4I0BA 1TQMA 3IHUA 3LFKA 1Z7UA 5ICFA 1A16A 3JTGA 4LB6B 5D5UB 4RB0A 1C22A 2IA2A 2HTJA 2ZMEA 4ZWOA 3WGGA 3KLOA 2V6CA 1YW7A 4KMUX 5L3DA 2QBYA 3DFGA 4RGUA 5DUIA 4R8HA 1SMTA 1S7AA 4R1HA 4UHTA 3CTZA 4A6VA 3CO7C 4O5VA 5CDVA 1OMIA 2GG3A 5ED4A 2FBKA 4FLIA 3VEPA 3Q9VA 3BPVA 3R0AA 2GA2A 4DNCA 1L3LA 3IC7A 3BJ6A 2COMA 2BB7A 3F22A 4BHBA 1MDMA 1ZG1A 2DT5A 3R4KA 1HKSA 2V3XA 2AXLA 1W5SA 1J59A 4L0YB 4FLJA 5E20A 1U3EM 1HQCA 2KRFA 2DK5A 2BWTA 1K78B 2L4MA 4FUKA 2FBIA 1J2XA 2R7FA 2UXNA 4HQMA 3HIFA 1BC8C 1UHMA 2L02A 2FBHA 1Z05A 4D0PA 3ZQ7A 3V8LA 3GFJA 2VBXA 1YS6A 3ZN0A 1G3WA 4OIPF 3K2ZA 2V1UA 2PEXA 5L3CA 1FSEA 2DW4A 4L5JA 3CDHA 5E17F 3TO7A 1D3YA 3GF2A 2BWUA 3GFLA 1ZGAA 2FA5A 1U78A 1KP0A 2PMUA 3J80K 5DCMA 4UUVA 4S05A 1FYLA 4IHTA 1USSA 2PG4A 3MZHA 5L3BA 1J75A 5LGUA 1W7PA 3VB2A 1K79A 4LMYA 1EV7A 4I0AA 3KP2A 2FSWA 3U1DA 1KU2A 6PAXA 2H27A 2XUBA 1VTNC 3EDPA 4PGGA 2ZXJA 2R3SA 3HRUA 4LLGF 1FSHA 3F3XA 4A12A 5CJ9A 5KK1A 2XAGA 2GXBA 1BIAA 2FRHA 2WC2A 4G9YA 5CDLA 1WKMA 3WU1B 2YR2A 5D8LB 4UVAA 1B9MA 1ZRFA 1GXPA 3OOPA 2IW2A 2M87A 2VBYA 1SD4A 3QPHA 3BROA 5F6FA 1CGPA 2ISZA 1U5TA 4L9NA 3E5QA 2XAFA 3QU3A 4IKRA 1ONVA 2O0YA 4U6CA 1MZBA 1O3QA 5D5VB 2Q96A 3PKEA 2YX4A 3GO5A 2J5OA 4HV5A 4OOKA 5AIPA 1JHHA 4RGSA 2P5LC 1LQ1A 4S01A 1HSJA 3FMRA 3P9KA 3RPUA 1LVAA 1U8RA 2OKNA 3H3ZA 2BHAA 2DQRA 2HKOA 1SFUA 4S00A 3MFKA 4ZWPA 2OBPA 1MD0A 4CHUA 1ZGJA 2XROA 3S6BA 3HTSB 2EVMA 1B59A 2LF7A 4EJWA 1HW1A 1BIBA 1BJAA 3M7GA 1P92A 4U6EA 4ENJA 1R7JA 3HHHA 4ZH4F 1USTA 5CE6A 1W7VA 1KU7A 2BEOA 2F5EA 5BMZA 1J7KA 4EJTA 4G7OF 1RUNA 3ULQB 3QPTA 2VN2A 4UV8A 5HVQC 3F8FA 3HOSA 4LD5A 5K5RA 1YJ3A 2IVMA 1PUEE 1RUOA 3EETA 1R1UA 1EH6A 5D4SA 4U0YA 3BJOA 4WF2A 4KT5C 3SXYA 1IAWA 4U69A 1P4AA 2EFOA 5AIQA 4AD9A 3ZMTA 2YU3A 2O6GE 4IECA 4BYYA 3QP5A 3E6MA 3PQKA 5H20A 5D5WB 2NRAC 5LBQA 2RV8A 3FXQA 3HRMA 2KIUA 4KM3A 4OMZA 2GAUA 1IW7F 3M1EA 2XAHA 1C0WA 1HKTA 1AWCA 2PQ8A 5E1ZB 2QZ8A 4U73A 4CYDA 2RGVA 2ZJ2A 1U5TC 1W4MA 5LRSA 2ZNZA 2CYYA 2ADUA 2F5FA 1FBSA 3WG9A 4YFNF 4CGZA 1O3RA 5CLSA 1G3TA 1LB2A 3FM5A 1MJAA 3K9TA 3WODF 1HSTA 4FO7A 4U6JA 4N9HA 3EYYA 5FLXK 1OYIA 1TNTA 5AONA 3V7RA 2NYXA 3TO6A 4Y17A 4MNUA 5BPDA 2D45A 2NNNA 2L54A 3L7GA 1YS7A 4HX7A 2GG0A 1S7OA 3IRRA 1YVMA 5L3GA 3RKXA 1GXQA 1H0MA 1I27A 4A6WA 4O3MA 5TRDA 3BPXA 4AIKA 1JHFA 5BS6A 4IJAA 4ZYEA 2OZUA 1QZYA 2GG8A 3V8KA 4EGZA 5E8GA 4XRFA 3L9FA 2W24A 3AAFA 3CUQB 2E1NA 4GO1A 5CVVA 4HZFA 2LNBA 1JXSA 2P7VB 1WY2A 4QR8A 4HV6A 4FHTA 2JPBA 3PKBA 3Q6DA 3VOEA 5LRRA 3F23A 3E6CC 2IA1A 2CGPA 2GU5A 1ULYA 3TQNA 3F21A 1T0FA 4LJZF 3E5UA 1OKRA 5IT9K 3MAJA 4KA4A 1J0RA 3WTXC 5CVRA 1SAXA 4JUQA 1E17A 3LAPA 4M6XA 3H3UA 2BWSA 5ICEA 2DQLA 2HQNA 4EJVA 2IJLA 4BXUA 5DYMA 3WTZA 5L3FA 5J6XA 1Y1NA 4U70A 2RQPA 4PNCA 4ESFA 3WTUC 4L9VA 4WCGA 1R58A 5F1RA 3I0TA 1XSXA 4I98B 3QAHA 1IXSB 4BHCA 2L3DA 4XSZF 2K4JA 4ASNA 2C6YA 1IN4A 2IPQX 3GZ6A 1RZ4A 3N4MA 3K0LA 2K4BA 3LQQA 4N0BA 2JZYA 3GW2A 3M8FA 4I7HA 1KGSA 1YG2A 5HLGA 5JFRA 1LJ9A 4IF4A 1YIOA 4HLYA 4K2EA 4P96A 3WE3A 2BYVE 1HXDA 1L0OC 5D8KB 1BI2A 4BNCA 1LDKB 1KQ8A 1Z9CA 1XN7A 1KU9A 4U75A 5FGMA 1FPQA 2HOWA 1YO5C 3FMSA 2FU4A 2QM3A 4EMSA 4M72A 2FQ3A 2HQRA 2HDCA 2HEOA 2XHKA 1IN6A 1B9NA 1V4RA 4EJUA 4HBLA 3GXOA 5D6FA 2A5YB 4TV7A 1OPCA 2O3FA 2GA1A 3LA3A 2QQ9A 4L18B 3TGNA 3LA2A 1R1TA 2QQAA 5K5QA 3KZZA 3RTRA 2XASA 1OR7A 2ZBKA 1YQAA 3WGHA 2M8EA 2EFWA 4Z7MA 1UFMA 4KDPA 3KCCA 4FKCA 2HKXA 2K86A 1RNLA 3CB5A 4FT8A 5A2QK 4G6QA 2Z9OA 5HDNA 4ESBA 4BAYA 4FX4A 2HGCA 3F8NA 5E1XA 4U1BA 2J5PA 1LDJA 2MBFA 1ZRCA 2G7HA 3LWFA 3JAMK 4HDUA 3CLOA 3WTYC 1Z6RA 3O3KA 1BOAA 1NHAA 1MATA 2STWA 3CJNA 1WQ2A 3DPTA 2ACJA 1XCVA 1D8KA 1QNTA 2Q94A 2K7LA 1ON2A 1ZRDA 1F1ZA 2CQKA 4HXXA 4M6YA 3SZPA 5L3EA 4KN7X 4MTEA 2HR3A 1IZ1A 3PKAA 2ESNA 4FO8A 2RC4A 4PZJA 1JAWA 1QO0D 1QXZA 4U0VA 2EV6A 3MCZA 1Z91A 4M9SA 3VODA 5DD8A 2MH9A 2BE5F 4P9UA 1FZPB 1PP8F 2ZKZA 1F5TA 4MEXF 4Z2YA 3DKWA 2ISYA 1WN1A 4IXAA 4ZYGA 3KZYA 5LEKA 3JSOA 1R5GA 2MLGA 3J81Z 2AS5F 2FNPA 4XLPF 2XGXA 2EV0A 4IRHA 2FEZA 3MATA 1IRFA 1XMKA 3WE2A 1SMYF 3L7WA 2A61A 2HWVA 4IU6A 5BQTA 3SHFA 1KQ9A 3FXRA 2GU4A 4Y15A 3JSPA 2IA0A 2GG2A 1CF7B 4A5NA 3RKWA 3VFZA 1CHMA 3GZ5A 2BWWA 4RAZA 3WTSC 3K1PA 4G6DA 2M45A 2HOEA 2EVCA 3R60A 1YW8A 2GG5A 2IP2A 1TTYA 4OMYA 2W84A 1R36A 3HSRA 4A6DA 3QU6A 3FWEA 2W85A 4IHSA 4NHJA 2EFQA 2GGBA 3P9CA 1H9TA 2A07F 2LF8A 1YYVA 3TB5A 5ICCA 5HDGA 3WTVC 2VODA 4LLNA 4LGWA 5JI6A 2D2WA 2BHBA 2P5KA 1WI9A 2PFBA 4U6ZA 1WSUA 1MJBA 5BOXA 2NAZA 4LLLA 2DAOA 4L0ZB 3ZMZA 1SD5A 2L4AA 4GGGA 5ERIA 4WXCA 2PBIA 3I5UA 3BY6A 3ROUA 3E97A 3C1DA 2JT1A 1QXYA 1MJ9A 1YTYA 2A6HF 1ZLJA 4JK1X 2MA3A 1SFXA 4M9ZA 1JGSA 1Z1DA 3M8EA 2NQ6A 4ZZLA 3KP5A 5KVRA 2M30A 1G3YA 2Q2EA 2CW0F 1PV9A 2MATA 2XKOA 4EQQA 1KYZA 2KJBA 4M73A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3NEU A;  2ZNY A;  2P8T A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5JFRA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations