3L2VA

Crystal structure of the prototype foamy virus (pfv) intasome in complex with manganese and mk0518 (raltegravir)
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Recombination/dna
molecule keywords Integrase
publication title Retroviral intasome assembly and inhibition of DNA strand transfer
pubmed doi rcsb
source organism Human spumaretrovirus
total genus 97
structure length 365
sequence length 365
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2009-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 3l2vA04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 3l2vA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 3l2vA02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3l2vA03
2LDMA 4L59A 4CEZA 4C5GA 4OKKA 4E7HA 3AVFA 2F8SA 4QOZB 2YNGA 3AO1A 4CGIA 4EDUA 3RTVA 1S1XA 1A5WA 3FDRA 3HPOA 2BUDA 2IG0A 3LANA 2M0OA 4LSLA 2P0KA 4H8KA 4FJ5A 2FBXA 1U49A 4N41A 4BE1A 4CF9A 3E01A 4NYFA 3K5LA 3AVGA 2YNHA 4FM1A 1KLMA 2X4XA 4AHCA 2Z1JA 2FBYA 1Z25A 3D0PA 3V9ZA 5J1EA 4E1MA 1JLQA 1NJZA 3OYJA 1WAFA 4E89A 4IKFA 1HYVA 1XHXA 5C24A 5J2NA 4CJ3A 1WSFA 1TV6A 1TK5A 3SYZA 4X34A 4OJRA 4EZ9A 4QCLA 3KKRA 3SUPA 4N47A 1ZBFA 2WACA 4OLBA 1RDAA 1S9GA 4W5TA 3ZT0A 2ATQA 4PUOA 4HUEA 4NCAA 1BIZA 3ULDA 1VSMA 5D6YA 2ZQBA 4AHTA 1J53A 1XI1A 1BL3A 3O3GA 1G15A 2PQWA 4M3ZA 1J5OA 3M8QA 2O4IA 1N27A 1RBTA 4FJGA 1JLBA 3MEEA 5FROA 4Z0UA 3PMIA 4KKOA 3QIIA 1QSSA 1S9EA 1SKSA 3ITHA 3QLHA 4K8ZA 4FLXA 1JKHA 4DQQA 1NK5A 4KFBA 1VSJA 1A5VA 2IDOA 4DS4A 3O4NA 4KTWA 4E3SA 2GBZA 5KTQA 1MU2A 3NHGA 3IG1A 1T8EA 2X4WA 2RHIA 3WNHA 4DTSA 3QIOA 4I2QA 2Y1JA 4PL6A 2E4LA 3AVJA 4Z4FA 3T3FA 1YTUA 2FHDA 4DU3A 3DLRA 4Z4IA 3DRPA 3VQ9A 2D0BA 2EFIA 4RG2A 3V4IA 3ZT4A 1WSGA 1TAQA 3U3YA 2ITGA 5HP1A 5HBMA 4Q5WA 4Q5VA 3SV4A 2L3RA 3QIPA 3T1AA 4QQ6A 3KKSA 5KRTA 2EKOA 1CZBA 3L3VA 3P83D 4CGGA 1BGXT 3LDSA 1S1WA 3AVIA 2HB5A 4Z4CA 1T03A 1G5VA 4FLVA 2L8DA 5C25A 4DQRA 3HJFA 3LGLA 2FBVA 3VQ8A 2HMIA 1CXQA 1S5JA 3SUQA 3LX7A 2E6LA 3ZSQA 4NYNA 3DLMA 4LH5A 2XY8A 2G8UA 1WLJA 4RG8A 1NKEA 1VK0A 3VQCA 3LWLA 1WN7A 1VSIA 3WNFA 1FKPA 1K6YA 4E7JA 3KK2A 2IOCA 4CGFA 4CEQA 2RJFA 4IG3A 5D6XA 4HVJA 4AHRA 1OI1A 4I2PA 1KFSA 1LW0A 3OYLA 3AO4A 4QAGA 3NF8A 3NE6A 4B9VA 3NNQA 4FLWA 3ASKA 3HXMA 4PLLA 5SWMA 1N6QA 3SI6A 2R5MA 4E1NA 3DOLA 2RF2A 2DIQA 4FJIA 1RDDA 2X4YA 1SKWA 4CF1A 5E41A 3AA3A 4WE1A 5C6SA 4CFDA 2M1HA 1DLOA 4II1A 3IAYA 3AO3A 1RT7A 4CHQA 2QKKA 1HYSA 3AVCA 2JGUA 4QVZA 5CY4A 4AHSA 1JL1A 3KLFA 4DTNA 2F5KA 4GVMA 1IKYA 4O0JA 3NH1A 4DF4A 5KCHA 2YRVA 3CFPA 1YT3A 4DFMA 4AILC 1RDBA 4CGHA 3MP6A 3MEGA 4B8CA 4E0DA 3SPZA 2HHTA 4M3RA 3TAEA 1ITGA 1RT5A 3OYIA 4JS4A 2JZ2A 4Y1CA 1MHNA 4FU6A 1DTTA 2VG7A 4BDYA 3HK2A 4CJVA 2FC0A 4DMNA 1SL1A 4DTMA 1NKBA 5D6WA 3QEWA 4R5PA 3ZSYA 3KD5E 4CF2A 4W5RA 4XIUA 3PX6A 2QQRA 3AVKA 4GY5A 3HVTA 3SV3A 3LH0A 4AHUA 3AVMA 5T7BA 3LP2A 4DTUA 4LH4A 3TANA 4KHYA 2B5JA 4EZ6A 3MXJA 1OZ2A 2KW4A 1IG9A 1KLNA 3LAMA 3PX0A 2PYLA 5DMRA 2OPSA 1HYZA 1UA1A 4B08A 4IDKA 4A4GA 1C0TA 3DRSA 5J2QA 2G8KA 1EKEA 4CK2A 2IC3A 1REVA 3C95A 2R7YA 4HUFA 3AVAA 3VN5A 4DG1A 1S6QA 2Z1GA 4B9SA 4FZYA 2P51A 4ELUA 2A1SA 3MEAA 4CJTA 2E6MA 3MXIA 2VG5A 4HUGA 4ZTJA 3KK3A 3PX4A 1HQUA 1HNIA 2B4JA 5SZTA 3NGZA 1KRPA 2LSNA 4KHSA 3ZT1A 3SPYA 5C0MA 3OYHA 1VRTA 4IUTA 4M42A 3HP9A 1C0MA 4CGJA 2XY6A 2DFEA 4RW7A 2E5QA 1W0HA 1RCHA 3SZ2A 2P5OA 1EXQA 2D9TA 3OB9A 4CHZA 4KTZA 4OKEA 3ME9A 3P8HA 2OYQA 4KB1A 4FJHA 3RMAA 4J2EA 3ZSZA 3RR8A 4MQ3A 4O5BA 3PFSA 1KVAA 3ISNC 4BACA 4C8NA 3KJVA 4IUPA 4PA1A 1L3SA 3V9WA 2HQEA 3A2FA 1B9DA 4KPYA 3OYCA 3TWHA 3DLBA 4PY5A 3LPTA 2RHXA 3V9UA 2DIGA 4F2SA 3ZEHA 4CF8A 4FW2A 1BCMA 2KFZA 1RBUA 5FRMA 2GF7A 3NF9A 3VQPA 4KREA 5J2PA 2RI3A 2YHBA 3DB4A 3KLGA 4ZTFA 1ZBLA 4OPKA 2W42A 1RTIA 1C0UA 3HYFA 1C6VA 3KTQA 4NZGA 3RRGA 4FM0A 2RHUA 4A4EA 1D9FA 4I9LA 3UT1A 1NOZA 4KHQA 4PQUA 1S1VA 3LZJA 2HVIA 2KZZA 3QNNA 2PY5A 1IKVA 1VSFA 4F4KA 3C6UA 1KVCA 3L2RA 4DQSA 3QEVA 4CECA 4CJKA 1BQMA 3PY8A 2HHSA 4B8AB 2VYTA 4OLAA 2I5JA 4E19A 3QBYA 4FJLA 3B6OA 3HO1A 1N5YA 2HHQA 5FDLA 1GOBA 3HM9A 2XHBA 3AO5A 3ZT3A 4BDZA 3VQBA 2P1JA 4RW9A 5HRSA 1CZ9A 4M3WA 2VG6A 4IBNA 4W5NA 1RBRA 3AVLA 2EQKA 2QK9A 1WAJA 2R5AA 3LGFA 4IURA 4FXDA 2LTOA 3M8PA 3RMDA 4C8OA 1IKWA 3VQAA 3NBPA 1L3UA 3JSMA 4KI6A 2YKNA 1LWFA 2EHGA 2IS3A 4N4IA 4F2RA 1VSHA 2WOMA 2HNDA 1YVUA 3DM2A 1NJYA 1RBVA 3SCXA 2EQMA 3CM5A 3U6FA 3NTKA 2E6NA 4Z02A 1NK9A 1BISA 3SQ4A 1Q9XA 1J9AA 3MEDA 4Z4GA 2IGIA 4PLIA 1YTAA 1TKDA 1WSJA 1CLQA 1VSEA 3ZT2A 5FRNA 2XDPA 3DB3A 3SD4A 2RKIA 4DTXA 3UIQA 1X9SA 4DSFA 1BQNA 1RTHA 2NUBA 3H6ZA 1KSPA 1FKOA 2DFHA 3CQ8A 4CEEA 3BDPA 1VSKA 4MFBA 4FL6A 4LY7A 3KUFA 1SL0A 1NK0A 1H3ZA 3SQ2A 1QS4A 5KI6A 1LAVA 4OVAA 1WJSA 1JLAA 1JLEA 3H8ZA 2B8AA 4CHYA 4NS5A 3K2PA 2A1RA 4FW1A 4UC4A 3V9SA 3B6PA 3LLRA 4OGEA 4DFJA 3O8VA 4B9LA 1RTJA 5HRRA 4CEDA 3U3GA 1QQCA 2HNZA 4KHUA 3DOKA 3AVNA 2RJEA 1BIUA 3OYDA 3ZSVA 4DTRA 4QW2A 4I9QA 5CZ1A 3QETA 4CIEA 1U45A 4J2BA 4K8XA 3V81A 4GW6A 1ASUA 2LCCA 1JLCA 4OVLA 2G8IA 1LAWA 1TVRA 5KGXA 2BDPA 4DTJA 1JL2A 2L89A 4O44A 4C5HA 3DRRA 3MXMA 1B92A 3TR8A 3M8RA 2HHXA 2DAQA 4DFKA 4L8RB 3CFRA 1RT6A 4DWIA 2HQXA 1C1CA 4HHTA 3UWNA 1LV5A 5I3UA 1OZ3A 1U4BA 3G10A 5KCOA 4DU4A 4IUQA 2DTUA 4JLHA 4M3TA 3HPHA 1GOCA 3TAGA 2XO7A 1ZBUA 2GFAA 4FVMA 2RI2A 3TABA 1XNIA 1EP4A 1GOAA 1WJRA 3ZSRA 4E7LA 4CRIA 2JTFA 3HSTB 1L3TA 4N76A 1Q8IA 1HJRA 3OJSA 4CEOA 1NJXA 3CEYA 1QE1A 3L2WA 3QJ6A 3EY1A 2MWPA 4C5IA 3P1GA 3PO4A 3OJUA 4DLGA 4QQDA 3CM6A 4DS5A 3PV8A 3E9FA 4IG0A 4HCZA 4C8KA 4Z4EA 3EAEA 4CFBA 4FJXA 3V1OA 1NK4A 4J2DA 1HRHA 4DLEA 3MP1A 1RDCA 1JLFA 3LAKA 3AV9A 3NCIA 1J54A 2EX3A 5I42A 4LSNA 3SUOA 4O4GA 1JXEA 3OVNA 3QNOA 1LW2A 2BE2A 2G8FA 4PWDA 1XWLA 2HHVA 3M9QA 2G8VA 4B9MA 3OYEA 4H4OA 1NK6A 5HRNA 3OYKA 4FLYA 1WSEA 4CK3A 4ID5A 3QKJA 3NTHA 4BDPA 4BE2A 3VQEA 3NGYA 4KTQA 3ALYA 4CIGA 3DLEA 3TARA 4CEBA 1HPZA 4TSXA 1OYXA 1D8YA 1UWBA 4N4HA 4FJMA 2BANA 1SUQA 1Y97A 3LALA 3OMCA 3S3NA 3VQQA 2ZE2A 3KLIA 4CE9A 3L2VA 1TAUA 1CXUA 4IFVA 1HMVA 2XK0A 3K59A 4CJLA 3LP1A 3AA2A 5CZ2A 3GOXA 2RHZA 1QHTA 4RW8A 4EP5A 3NDKA 3SUNA 3LP3A 3VQDA 2NLUA 4CJQA 2GUIA 2OZSA 1XHZA 3L8BA 4E7IA 3MAQA 1T05A 4DU1A 2G3RA 3I0SA 5IN1A 3NH0A 1U48A 3OYAA 4FCYA 2RI5A 4DSJA 5J26A 3THVA 1I39A 3ASMA 4FK4A 4A4HA 2OPPA 4IFYA 4DFPA 4DSEA 3MEWA 2BIVA 2G8HA 4Z4HA 4JS5A 5D3GA 3QEPA 3HP6A 2IAJA 3VQ4A 3S3OA 4KAZA 1RT4A 3L2QA 4O55A 3G0ZA 3OQ5A 4DF8A 5CYQA 4IUVA 1X1PA 2HW3A 5K14A 4FLZA 4FZZA 2RHYA 1EETA 1VSLA 3SQ1A 1FK9A 4YFUA 4CEAA 1RT1A 3DYAA 2HHUA 3ZSWA 2EQUA 1LWEA 4OPJA 1KCFA 1T7PA 2M16A 2D0AA 2OA8A 2Z1IA 1ZBHA 2DY4A 2X78A 2XY7A 4B9WA 1X9WA 1RTDA 3RR7A 4DTPA 1R0AA 4B9NA 4FK2A 4FLTA 4CF0A 4O0IA 1IO2A 4F8RA 3SJJA 4FZXC 3WNGA 1TKZA 4ZHRA 4GMJB 2QXFA 3PNWC 4OGCA 1ASVA 4DQPA 2GV9A 3K57A 1C1BA 3ZCMA 1A5XA 1DTQA 1B9FA 2YKMA 5IAYA 2KZMA 2ETJA 4G1QA 2CKKA 4F3OA 4HTUA 3V6DA 1SV5A 3KLHA 3CYMA 3FEOA 4KV8A 2HNYA 3BGRA 2GFUA 3O3FA 4CJUA 2PYJA 3PO5A 3H08A 4KI4A 3HPGA 3C6TA 4FJJA 1WJQA 3AA5X 3PUFA 2KQ2A 2OPQA 4CIFA 3OYFA 3OY9A 3AVBA 3L3UA 5EU7A 4CEFA 1U04A 3O3HA 1WGSA 3EZ5A 2PZSA 2R57A 3OS0A 3K58A 5HRPA 3SNNA 1BHLA 3C4SA 3HL8A 1JXBA 1ZYQA 4N56A 3TI0A 3V1QA 1XC9A 5HLFA 3IS9A 3E9GA 1RT3A 4B9XA 4M3YA 3OYBA 3OMGA 4BWMA 2VWJA 2D0CA 4ID1A 3FFIA 1VRUA 3NFAA 2D5RA 4BD3A 4NCGA 3QEIA 2XRIA 1U47A 1KTQA 1RT2A 4CHPA 2R58A 2RN2A 4A4FA 1S1UA 4HCCA 2G8WA 4RW4A 2ZD1A 4BWJA 2F8TA 4FJ9A 1HNVA 2VWKA 4N4GA 4FLUA 3PMTA 5KGWA 4FJ7A 1RBSA 5M9OA 3JYTA 1TKXA 4JRPA 1HQEA 3OYMA 4M3UA 1FXXA 4C5EA 2YNFA 4DTOA 4Q0BA 3LPUA 1TGOA 3ZSXA 5DK5A 3OA6A 2B6AA 2QKBA 4LD6A 3AO2A 4HCBA 4NCBA 1D5AA 3TAQA 4UQGA 1UA0A 2O4XA 3KLEA 1ZBIA 4DSIA 1BI4A 3M8SA 4CJRA 1QSYA 2LRQA 3L42A 1X9MA 4CJEA 4M3XA 1UOCA 2OZMA 3QEXA 3T19A 3QERA 1UAXA 4DSKA 3K5NA 3DLKA 1L3VA 2BGGA 2JLEA 3HVRA 1IKXA 2HHWA 3NF7A 4W5OA 3OYNA 4F3TA 2X35A 3S6WA 2OPRA 2FBTA 2X6SA 3RWUA 2P5GA 5KH6A 2QQSA 3OS1A 1TKTA 4QQGA 3NGIA 3BDLA 3K5MA 3QESA 3KD1E 3META 2HVHA 4FM2A 2X6NA 3MECA 4W5QA 5KE2A 2MWOA 4LD0A 5J2MA 4M45A 4KB0A 4KHNA 1KFDA 3F70A 3VQ7A 4FK0A 2K3XA 4CJFA 3QINA 4BE0A 3LYIA 3V9XA 3TAPA 3DMJA 4N5SA 2O4GA 5KE3A 2AJQA 1F21A 5JS2A 2RJDA 1LWCA 2K3YA 2YNIA 1IH7A 4CK1A 1O1WA 2LVMA 1I3AA 2Y1IA 3OYGA 2KFNA 1WSHA 2DFFA 2RPIA 3OS2A 1NK7A 4CJSA 4ELVA 5JS1A 3SQ0A 1SL2A 3FC3A 2WONA 4B9UA 3WNEA 1JLGA 2Q3SA 3EYZA 4AHVA 3QO9A 3K5OA 3DLGA 4H4MA 2RJCA 2YHAA 3TAFA 3CG7A 1Z26A 1TL1A 1NK8A 1S1TA 4B3OA 4AH9A 4C8MA 3KIOA 3MEUA 2YV0X 3AVHA 4CJ5A 4FJNA 3NTIA 4ELTA 3L2UA 3DI6A 4CJ4A 1QSLA 1SSFA 5HROA 2KTQA 3V1RA 4CESA 4CJPA 3F73A 4J2AA 3HT3A 2BKDN 1EX4A 1TK8A 3S9HA 2XY5A 3D45A 3NF6A 3NAEA 3C94A 3IRXA 4M41A 1W9HA 4CFAA 4KRFA 2O4XB 1TL3A 1KHCA 1NJWA 1BI4B 3VQ5A 4CGDA 1TK0A 4B9TA 5C42A 4CCHA 3FLGA 2RO0A 5J39A 1Q9YA 1C1AA 3RMCA 4KHWA 4CHNA 4KO0A 4DQIA 4I7FA 1BCOA 1NKCA 2F96A 4DSLA 3I0RA 5KRSA 4RW6A 1RI0A 3KK1A 1QTMA 3NH2A 1RILA 4YNQA 4IUUA 1SKRA 4FYDA 4JRQA 4CHOA 4EP4A 5CYMA 4FJKA 3VQ6A 1RNHA 1L5UA 5CIUA 3CFOA 1ASWA 4C8LA 3RMBA 3AA4A 3VA3A 1S6PA 4OKJA 4CERA 3LWMA 3O4QA 4CJWA 4Y1DA 3I8DA 3VA0A 2EQJA 3MP8A 1WSIA 1KVBA 3MO8A 3MEVA 4ICLA 1D9DA 3LZIA 3DLHA 3RRHA 3Q1JA 4FJ8A 3P5JA 3TAMA 3F9KA 4E7KA 2X74A 1NOYA 3P8DA 3LP0A 2Z1HA 1WNSA 4CFCA 3S3MA 3ZSOA 1VSDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LWHA 1BYMA 4RGXA 1YX3A 4WQ5A 4EGYA 4OKKA 2F8SA 3NAUA 3TQNA 2D0OA 1MUZA 3RTVA 2E2HJ 1S1XA 2PMZA 3JCMV 1Y1WJ 2BUDA 3ZR8X 2IG0A 1VZ0A 2EWSA 5AQFA 2FBXA 4R79A 1UMQA 4BE1A 2QW9A 4M7AG 4KT0E 2A28A 3JSOA 2DRKA 1YX5A 3AVGA 1R1VA 2Y9ZA 2Z1JA 3MWMA 2FBYA 1Z25A 4ZGDB 3D0PA 2FJ1A 3TP3A 1X3NA 2V6EA 3G6EN 1P4XA 1Z6RA 2EQIA 1JLQA 4DR7K 1HYVA 2Y48A 5J2NA 5ICFA 1X3UA 5LRSA 2A6TA 2P5VA 4XLFA 5I9EB 4AM7A 3EGDA 1O3TA 3SYZA 4OJRA 4EZ9A 1S7AA 1LB2A 1ZBFA 2WACA 2QAZA 1RDAA 2ZMEC 4PJOF 3QYGB 3LDPA 4NXMK 2R5YA 3CMEA 1J5YA 4C0GA 2VKDA 2WA0A 1VSMA 5D6YA 3CCLN 1J53A 1OR7C 1VQ6N 3LQRA 4M3ZA 2JA2A 3E6CC 2Q97A 5J47A 3G73A 3CMAT 1Q7YR 2DFUA 1RBTA 4CCOA 4JKDA 1VYUA 3F10A 2XROA 1DDNA 4GYIA 3GTLJ 2VXEA 4MFEA 1EBMA 2LSOA 4OOIA 3U8XA 2EWNA 3CCJN 3ITHA 3QLHA 3AHUA 1Q82R 2GLOA 4N9HA 1UG1A 4FE7A 4DQQA 2GA2A 4ISFA 1VSJA 1D0ZA 1A5VA 3WU1B 1WI3A 4YOWA 2LNBA 3W2AA 4KTWA 2JVGA 1LEBA 3JRZA 4E3SA 2GBZA 2QDLA 3CMEI 3JB9I 3I0WA 3BTJA 1HSQA 3NHGA 2ED1A 2EVRA 2KHOA 5E18F 2X1CA 3KPHA 4ZC3A 4JZ3A 1FBUA 2BE7D 2XAGA 2M1BA 1S7EA 3M0RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1TL3 A;  1KHC A;  1NJW A;  1BI4 B;  3VQ5 A;  4CGD A;  1TK0 A;  4B9T A;  5C42 A;  4CCH A;  3FLG A;  2RO0 A;  5J39 A;  1Q9Y A;  1C1A A;  3RMC A;  4KHW A;  4CHN A;  4KO0 A;  4DQI A;  4I7F A;  1BCO A;  1NKC A;  2F96 A;  4DSL A;  3I0R A;  5KRS A;  4RW6 A;  1RI0 A;  3KK1 A;  1QTM A;  3NH2 A;  1RIL A;  4YNQ A;  4IUU A;  1SKR A;  4FYD A;  4JRQ A;  4CHO A;  4EP4 A;  5CYM A;  4FJK A;  3VQ6 A;  1RNH A;  1L5U A;  5CIU A;  3CFO A;  1ASW A;  4C8L A;  3RMB A;  3AA4 A;  3VA3 A;  1S6P A;  4OKJ A;  4CER A;  3LWM A;  3O4Q A;  4CJW A;  4Y1D A;  3I8D A;  3VA0 A;  2EQJ A;  3MP8 A;  1WSI A;  1KVB A;  3MO8 A;  3MEV A;  4ICL A;  1D9D A;  3LZI A;  3DLH A;  3RRH A;  3Q1J A;  4FJ8 A;  3P5J A;  3TAM A;  3F9K A;  4E7K A;  2X74 A;  1NOY A;  3P8D A;  3LP0 A;  2Z1H A;  1WNS A;  4CFC A;  3S3M A;  3ZSO A;  1VSD A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2VXE A;  4MFE A;  1EBM A;  2LSO A;  4OOI A;  3U8X A;  2EWN A;  3CCJ N;  3ITH A;  3QLH A;  3AHU A;  1Q82 R;  2GLO A;  4N9H A;  1UG1 A;  4FE7 A;  4DQQ A;  2GA2 A;  4ISF A;  1VSJ A;  1D0Z A;  1A5V A;  3WU1 B;  1WI3 A;  4YOW A;  2LNB A;  3W2A A;  4KTW A;  2JVG A;  1LEB A;  3JRZ A;  4E3S A;  2GBZ A;  2QDL A;  3CME I;  3JB9 I;  3I0W A;  3BTJ A;  1HSQ A;  3NHG A;  2ED1 A;  2EVR A;  2KHO A;  5E18 F;  2X1C A;  3KPH A;  4ZC3 A;  4JZ3 A;  1FBU A;  2BE7 D;  2XAG A;  2M1B A;  1S7E A;  3M0R A;  1AT1 B;  2E2J J;  4DTS A;  5FU7 C;  2J5P A;  1Z7U A;  2QCO A;  4FSX A;  2OBP A;  1GVJ A;  3TU4 K;  3S2D J;  2FO0 A;  2DLL A;  3MZY A;  4AIA A;  4PL6 A;  5HDG A;  3FF5 A;  5DM6 L;  2ADU A;  4BR7 A;  3FXQ A;  3IV5 A;  1ENH A;  4NB4 A;  4RTW A;  1TC3 C;  3GTP J;  2FHD A;  4NLC A;  5KYN A;  1FTZ A;  1W4S A;  4CA0 A;  1O13 A;  1JGG A;  3QPS A;  4IHT A;  1CKB A;  4OU0 A;  3VQ9 A;  4RG2 A;  2XF7 A;  3V4I A;  3JB9 D;  3ZT4 A;  1TAQ A;  3CPW M;  5LD2 C;  2JXB A;  5AZJ A;  4BUP A;  3EYY A;  1LJ9 A;  3E7L A;  2CW7 A;  4YDU A; 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 5GAN g;  4M3B A;  2RNJ A;  1G3T A;  4O0I A;  5FLV A;  1JRI A;  3I58 A;  3BQZ A;  4I2O A;  1U2V B;  1BI0 A;  1H3H A;  1KO9 A;  3VEW A;  5GAN 2;  1M1K O;  2HZY A;  1YW8 A;  3WNG A;  2YJE A;  4CZG A;  4OMP A;  4GMJ B;  1VQM I;  3PNW C;  1LDJ A;  2YSR A;  3K57 A;  2NOF A;  3JS6 A;  2KZM A;  4BY6 B;  3U2R A;  1IB8 A;  3ZMU A;  5F2R A;  3CCU I;  4X1E A;  4HTU A;  4B1V A;  2K9N A;  2RQT A;  3FEO A;  2HF3 A;  2VPL A;  2HNY A;  4IO9 L;  1MMN A;  3I59 A;  2GFU A;  4CJU A;  1N8R U;  1VQ8 I;  3VYU B;  5BRD A;  4MO5 A;  3VEZ A;  1SFO J;  1FPQ A;  4KI4 A;  2WUS A;  4A5N A;  4FJJ A;  3C6T A;  3E5X A;  2HL3 A;  2V1N A;  1AD5 A;  4KMF A;  1RI9 A;  1SRL A;  4X6A J;  3PNY A;  4C8Q E;  4IOC L;  3LSI A;  4BVP A;  3GNF B;  2XRN A;  4B09 A;  1ETO A;  3RSE B;  4RAG A;  3VJP A;  2KIS A;  2K7A A;  1BHL A;  4M7A A;  3UKU B;  1KYZ A;  1QVG P;  3C4S A;  4B1Z A;  1X6O A;  1A0N B;  3G2B A;  2AZS A;  4KH0 B;  4E2F B;  3AL0 B;  3CQX A;  1XC9 A;  5HLF A;  1RT3 A;  2JM9 A;  3RER A;  1UZC A;  1H0M A;  2Q2R A;  3K6G A;  3QAH A;  3HC7 A;  2DZ9 A;  2VAS A;  2VWJ A;  4DW6 A;  3CMM A;  4ID1 A;  1SKU B;  3E97 A;  2XGC A;  2YS9 A;  3UDC A;  1K8A O;  2PNI A;  4BD3 A;  4D5C A;  3GTJ J;  1XMX A;  4EAT A;  3DXK B;  2XRI A;  1JJ2 M;  1RT2 A;  4CHP A;  1VQ7 T;  2XPW A;  4A4F A;  4BQN A;  4ENJ A;  2G8W A;  3JRI A;  1OEB A;  1B8I A;  3OIO A;  3J7Z O;  1HNV A;  5D6E A;  4E7Z A;  4GDF A;  5E3L A;  2K4B A;  3LSP A;  3JYT A;  1D1C A;  2COY A;  5BR8 K;  1HQE A;  3OYM A;  5FLX E;  4C5E A;  1NG7 A;  3ZSX A;  3GNG A;  5DK5 A;  4NXN K;  4IEE A;  4DR4 K;  1QVT A;  1MW7 A;  3PNT A;  3VS7 A;  4DYR A;  3AO2 A;  3DEE A;  4A3D J;  3A8L B;  2FUG 2;  4OMN A;  3ZBD A;  3VB2 A;  4NCB A;  1NJI C;  3T7Z A;  4UQG A;  5FPN A;  3DTE A;  2O4X A;  1LEA A;  1D8J A;  1YN8 A;  3G7Z A;  4ILJ A;  5C12 A;  4N4O B;  2EAY A;  1ZBI A;  1BOT O;  4PJM A;  3BP8 A;  1R4N B;  1QQM A;  2LRQ A;  3L42 A;  1X9M A;  1V29 B;  4CJE A;  1VQM N;  2OZM A;  4X1V A;  1QU3 A;  2DRM A;  5ECA A;  3QOD A;  5DY9 A;  1LE8 B;  4J00 A;  4BBS J;  4J9E A;  4UB6 C;  4EJT A;  2G0E A;  5ADX A;  2OUM A;  3EG9 B;  2ZPI B;  3LWI A;  5FPM A;  5E84 A;  1UEL B;  5K7Z A;  3CCU N;  4LOC A;  3CD6 T;  2HHW A;  1MV3 A;  3KP7 A;  2OZ6 A;  2F2X A;  3GTG J;  3S6W A;  2OPR A;  2FBT A;  2RH2 A;  3C12 A;  2IGN A;  2LQN A;  3BT9 A;  1EZZ B;  3RWU A;  1I5L A;  5KH6 A;  1VQ8 N;  4AC0 A;  2QQS A;  4YIR X;  2FPF A;  4KRT A;  1BBY A;  4XLE A;  2GX9 A;  1BB9 A;  2P84 A;  4CCK A;  1PUF B;  3MET A;  2WSE E;  2X6N A;  5LJ5 g;  2HBP A;  2NXN B;  5KE2 A;  2DMP A;  3KFV A;  1W7P B;  4AID A;  1EWR A;  5JIC A;  4NL2 A;  4X0G A;  5F1X A;  1I6X A;  1M9S A;  5J4Y A;  1WEF A;  3PM1 A;  3R60 A;  1T33 A;  3WE3 A;  2JTE A;  1W70 A;  3ROU A;  1R4M B;  1VQN Q;  1S3X A;  2KLO A;  1M90 R;  2RJD A;  1LWC A;  4UNF A;  5DLQ E;  2I0N A;  2Y1I A;  3OYG A;  3G6E A;  4D7M A;  3KTU A;  1I4K 1;  3MMV A;  2IIR A;  3OS2 A;  5JS1 A;  2TRT A;  2NUP A;  1SL2 A;  2K4Y A;  2HZD A;  5KNL A;  3K4L A;  1B72 A;  3L09 A;  4AHV A;  4LG3 A;  3H3O B;  4H4M A;  3TAF A;  4HVW A;  5L8R E;  3CG7 A;  1NK8 A;  5HLI A;  1I81 A;  4DYQ A;  1TWF J;  3KFW X;  5EX5 A;  3Q0W A;  3BPX A;  5KYY A;  1EFN A;  1IV8 A;  5FU6 B;  3LDN A;  1BDG A;  1WBD A;  4FJN A;  3CCL A;  2E7X A;  1RKW A;  2YHX A;  3QDR B;  3L2U A;  1MBE A;  1MGT A;  1VQ6 A;  3UB5 A;  3HHG A;  3WHC A;  2B86 A;  2JVV A;  3BF3 A;  3DI6 A;  1ATN A;  2ELJ A;  2CDT A;  3OA9 A;  1ZG1 A;  4CC7 A;  2J7I A;  1G3S A;  3W0L A;  3G6E I;  3F73 A;  1U1S A;  3O8M A;  2L7F P;  4J2A A;  2YDL A;  2ME6 A;  1P90 A;  4JP0 A;  1TK8 A;  2ZB9 A;  4HWI A;  1K9A A;  3NF6 A;  1JT0 A;  1TUD A;  3C94 A;  1FMW A;  3HRT A;  1DU0 A;  1W9H A;  4DOW A;  3ZQL A;  4KRF A;  1U9O A;  2ZZD A;  4BR2 A;  3FDY A;  3MD2 A;  1PD1 A;  2DO7 A;  1NJW A;  1MZB A;  1WHH A;  4C1N I;  5FFZ A;  4B9T A;  3DEW A;  2DI3 A;  4CCH A;  1FBS A;  2RO0 A;  1C1A A;  1J6Z A;  4JK7 A;  4J9D A;  3S32 A;  3P9C A;  5DUK A;  3CCL I;  2ATC B;  5IH2 A;  2F96 A;  5IHN A;  5KRS A;  1M2V B;  1VQ6 I;  3NH2 A;  4KIG A;  4JZ4 A;  1FX7 A;  4YRV A;  3HOY J;  1SG5 A;  1OOT A;  4IUU A;  4WCI A;  2PI0 A;  2KYB A;  4HF0 A;  4EP4 A;  5CYM A;  4GYG A;  3ZPL A;  3BEX A;  2GAU A;  2CQN A;  1SSH A;  3VWB A;  1RPW A;  1M2O A;  4C8Q C;  2XHK A;  3OH6 A;  2L3P A;  5LL6 Z;  5KK1 A;  3H3V K;  1Y0M A;  3HTU A;  5GAO q;  1A31 A;  1VI0 A;  3LWM A;  3QB0 A;  3VA0 A;  3MO8 A;  3SMP A;  4ICL A;  2C0T A;  3E6M A;  3LZI A;  4F7U A;  5DYM A;  1QVF S;  3A1P A;  5FPD A;  4MFD A;  4U87 A;  3IKM A;  3F9K A;  2VE8 A;  4L6V 5;  2GGR A;  4CFC A;  4H4K C;  3S3M A;  2YUQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 1WSF A;  1M4Z A;  1TV6 A;  1TK5 A;  3OOU A;  5IT9 E;  3SYZ A;  3D5L A;  4X34 A;  4OJR A;  4EZ9 A;  4QCL A;  3KKR A;  1ZEL A;  1VQ4 A;  3SUP A;  3X25 B;  4N47 A;  1ZBF A;  2WAC A;  4OLB A;  2HD0 A;  1RDA A;  2YLB A;  4PJO F;  1M1K C;  3QYG B;  3J7A F;  1S9G A;  4W5T A;  3ZT0 A;  2ATQ A;  2ZSH B;  4PUO A;  4HUE A;  4NCA A;  3PL8 A;  3CME A;  4C0G A;  2VKD A;  1BIZ A;  2WA0 A;  3ULD A;  1VSM A;  2X6W A;  5D6Y A;  2OV7 A;  2ZQB A;  2QEX T;  4AHT A;  2ZPB B;  1J53 A;  1OR7 C;  4OP0 A;  1XI1 A;  1BL3 A;  3O3G A;  1G15 A;  2PQW A;  4M3Z A;  5LJ3 j;  2O01 E;  2JA2 A;  1J5O A;  3DQV C;  1LJO A;  2R7V A;  4M78 E;  3M8Q A;  4C92 A;  2O4I A;  1VQP T;  3CCV A;  1XQH A;  3CMA T;  1N27 A;  3RQ4 A;  3C2G A;  1RBT A;  4FJG A;  4NL3 A;  4CCO A;  3CBM A;  1JLB A;  1UB4 A;  3K4K A;  4X9D A;  3SZG A;  2EIF A;  2VXE A;  4B44 A;  3MEE A;  5FRO A;  4F92 B;  3PMI A;  4KKO A;  4Z0U A;  3QPH A;  3QII A;  1QSS A;  1D1A A;  4HEA 2;  1S9E A;  2EWN A;  1SKS A;  4M7D A;  3ITH A;  3QLH A;  3AHU A;  2LYC A;  4K8Z A;  4FLX A; 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