3WTV | Genus

Total Genus 37

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	37
sequence length	118
structure length	118
Chain Sequence	PVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transcription/dna
molecule keywords	Runt-related transcription factor 1
publication title	A novel allosteric mechanism on protein-DNA interactions underlying the phosphorylation-dependent regulation of Ets1 target gene expressions pubmed doi rcsb
source organism	Mus musculus
total genus	37
structure length	118
sequence length	118
chains with identical sequence	H
ec nomenclature
pdb deposition date	2014-04-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
C	PF00178	Ets	Ets-domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	3wtvC00

4HX8A 4N0BA 4U0VA 3WTSC 5A2QZ 1J2XA 1J7KA 4WX9A 2Z5UA 2KJBA 1DPRA 4L5JA 4OMZA 4QWQA 1LQ1A 3DP7A 3JAMZ 3V8LA 3ZN1A 1MGTA 1ON2A 3DKWA 3LQRA 4AVPA 2HS5A 2ZBKA 4O5VA 2RDPA 2K4JA 1GXPA 4S04A 5H6QA 1BOAA 4EM2A 2V6CA 1F1ZA 2ZO4A 1T98A 1CF7B 2HWVA 3TO6A 4ESFA 1EV7A 3N97A 2HR3A 1LB2A 4KUMA 5BS6A 5K5RA 2HZTA 2A6HF 4EVIA 2BE5F 5CVVA 1I1SA 3E5XA 1IW7F 2G7UA 3BPVA 4LB5A 1QGPA 2OU2A 5ERIA 4IPAA 3R60A 1OPCA 5BQTA 2HGCA 4HLYA 1F5TA 4EJUA 4WCGA 2FF4A 2KIUA 5E8IA 3HOSA 2O8XA 4UV9A 2RVCA 1BI3A 4L9TA 1YW9A 4EJTA 3E3VA 4A0YA 1LNWA 3KEOA 1XCVA 2DQRA 3QU3A 5CVUA 2EFOA 2W84A 5LRRA 3LAPA 4FT8A 1KYWA 1XGOA 3E5UA 1ZLJA 2P5VA 3ZMUA 2JPBA 2Y75A 4EM0B 5J8FA 2QVOA 4M9ZA 3I5UA 2YPRA 3RPQA 5AIQA 1GVJA 3VEPA 1R1TA 2UWMA 3HSRA 5LEKA 4LFUA 5CVJA 2QUFA 2RKHA 1MJAA 3TGNA 5J8CA 3F8NA 4I2OA 2W57A 4HF0A 2EJRA 1SMTA 3VB2A 5LGNA 2IJLA 3GWZA 1USTA 5HDGA 3PQJA 2ESNA 4ZYEA 3KLNA 1WSUA 3QP5A 1S7AA 2WC2A 1HSJA 3C1DA 2FQ3A 2PBIA 1FC3A 2H09A 1LEBA 1K7AA 2FBHA 3EDPA 4Y17A 5ICFA 1HW5A 3CO6C 2K7LA 1T2KA 5CJ9A 3TQNA 1Z91A 2RGVA 3LQQA 2A3SA 3MQ0A 3OOPA 1YS7A 3F22A 4YG2F 2F5CA 2IP2A 3ZPLA 3CJNA 1MJ9A 4L18B 4H0EA 3CUOA 4R1HA 5EEGA 4HA8A 1W7PB 1FBQA 3C18A 3K2ZA 2F5DA 1RUNA 1HSTA 1JGSA 2QLZA 4OINF 4G6DA 5BOXA 1ZRCA 1YO5C 4YFNF 4LB6B 4R8HA 3M9AA 2D1HA 2CYYA 1REPC 2FXAA 2HKXA 4MQVA 1FX7A 2VXZA 2B0LA 3F8FA 1MDMA 3J80Z 4XBFA 2COMA 5LEJA 4IRIA 4I7HA 1G6NA 1WKMA 5LRSA 2HTJA 1IF1A 2KIMA 2ZMEB 4OOIA 4MTDA 3Q5FA 2KJCA 2DO7A 1EH6A 1XMAA 1EH7A 3CUQA 4ESJA 2ISYA 1X3UA 3I0TA 1XB4A 2QWWA 1IRFA 2HOEA 1TQPA 1B1BA 2VT2A 1B6AA 2E1CA 2O6GE 1LDJA 4G7HF 2PEXA 4RGSA 1IXRC 4HX7A 2G7HA 3I71A 1MZBA 4YIFA 3MAJA 4HDUA 1FPQA 3SFZA 2YX4A 1U3EM 2F5FA 2IPQX 4IHTA 3WE3A 1KQ0A 4M71A 1KU7A 1BI2A 2Y48A 3RI4A 5LGUA 1HKTA 3AAFA 2X4HA 3RKYA 1YFHA 4G8XA 1ONVA 5JVTA 2G9WA 4M6XA 2FA5A 1FWZA 2HKOA 1YIOA 3ELKA 1ON1A 1SAXA 2DI3A 3H3UA 3CTAA 5DD8A 2TDXA 1TW3A 4RGUA 3E6CC 3E5QA 1IZ1A 3IKVA 1XSDA 4OIOF 3E6DA 3KZZA 5ICCA 2LF7A 1K79A 2L4MA 4FX4A 2PN6A 3LA7A 4AWXB 4AIHA 3I58A 3EETA 4RGRA 4KT5C 1FOKA 1F9NA 2JZYA 1G3YA 2GA2A 1S8NA 3JW4A 1G4DA 5HLIA 2P5KA 4BHPA 1R5HA 3DPTA 4G94A 1STZA 5E1XA 3QU6A 3J81K 4ENMA 1SD6A 5JHUA 3M1EA 4AIKA 4XLPF 4QLCU 4AIJA 2WV0A 3MCZA 2YSRA 2UZKA 1ZRDA 3DXJF 5DDGA 5DCMA 5E17F 1W5SA 5DEQA 3DPLC 4G7ZF 3EYIA 2A61A 1K6OA 4CYDA 5F64A 4IJAA 3GFIA 2VONA 5E1WA 3IKTA 3HIFA 4RB0A 3HRSA 2STWA 3L09A 3GW2A 5D8KB 4LLLA 5HDNA 3WTVC 3WTTC 1OR7A 3KP2A 3U9GA 1ZLKA 4Y13A 3BY6A 1IUYA 3C3WA 2ZKZA 2WWYA 4EGZA 2M45A 1JHFA 1FYMA 5AONA 3LA3A 3FZVA 3JTGA 4HF1A 2O61A 4P9FA 4B8XA 2BV6A 3ECOA 4M9SA 5CVRA 3TDUC 1XDSA 4L9JA 3R0AA 2A5YB 2OQRA 2MBFA 3L9FA 1R58A 5HDKA 4RAZA 4L0YB 2IVMA 4GO1A 4HDVA 4G9YA 2NNNA 1I27A 2CSOA 3E97A 1SD7A 1BC7C 2GQQA 2RNJA 2OD5A 2XUBA 1TNSA 3ECHA 2Z33A 4O3MA 1WRJA 4IHSA 1A04A 4Q48A 3V8JA 2NNYA 3GO5A 2K27A 5DUKA 3NRVA 5FGMA 5FD6A 3FX3A 3GEZA 5D4RA 1Z6RA 2W25A 2P5LC 4KIFA 3KP6A 1J0RA 2O3FA 1R00A 5ILSA 4F7ZA 3NEUA 3LSTA 1IN5A 3K0LA 5H20A 1BI1A 4WXCA 3SQNA 1UCRA 4EJWA 3QPTA 1BIBA 2FE3A 2A6EF 1IXSB 2E7XA 4XSZF 3WODF 3MZYA 1PP8F 3IL2A 1QZYA 2C6YA 2PFBA 1LDDA 2XAGA 1YW8A 2XVCA 5HS7A 4E70A 1JHHA 3L2CA 3P9IA 3D0SA 1BIAA 2RQPA 1ZH5A 2L01A 1MDMB 3QP6A 4LD5A 1U5TC 3G3ZA 3RTRA 4U88A 3ML6A 2EV0A 2M30A 3ULQB 5CVIA 2FMYA 2OZ6A 4U7DA 1OYYA 5E8GA 4A6DA 5JI6A 5D8LB 3O2PE 5D5VB 1GXQA 4GYIA 4GGGA 1J9IA 3CUQB 2OAZA 3V7CA 3ABUA 2F2EA 2O03A 2XASA 3E6MA 2M5WA 2H6BA 2LNBA 1RNLA 2EFWA 2EA4A 4P5OA 1JE8A 2DLLA 3R4KA 3MEXA 4L9VA 4YFXF 1E17A 5JFRA 1B9MA 2R3SA 5D5UB 3RJPA 4UUVA 1FBUA 3ERED 4ASNA 5D6FA 2QQBA 2MA3A 2WTEA 3RKXA 1HW1A 3EQLF 1IN6A 3K9TA 5L3FA 3BOQA 1SFUA 4I0AA 1S6LA 1RZ4A 1RI7A 2FEZA 2JPCA 1TQMA 2FNAA 3J7AO 3IWFA 3SXYA 5J6XA 1BN5A 1QZZA 2JSCA 2OZUA 1LEAA 3REOA 5L3CA 3MFKA 1FY7A 1LDKB 4TV7A 4ON0A 4A5MA 4LG0B 4XSXF 4BHBA 4DQ2A 2GXGA 3T1BA 3HOTA 3FXUA 3WU1B 4PDKA 1SFXA 2VOPA 1XGNA 3F23A 1HBXG 4A5NA 2M8EA 2XROA 5BPDA 3GZ5A 1XD7A 2MH9A 4CZZA 4I09A 2XGXA 3FWEA 4A2UA 4NQWA 2XV4S 3GVAA 1U8RA 1P92A 4I98B 4GXOA 2BBYA 5HOOA 1Z05A 1Q1HA 2LDUA 3V7SA 3MZHA 3TOAA 4PCQA 1BI0A 3WU0A 2H6CA 5IT9K 1YQAA 2W85A 2K4BA 2O0YA 5TJJA 2VC0A 5BMZA 3T8RA 2ETHA 2V79A 3EYYA 3K1NA 3DV8A 1QO0D 1WI9A 4NB5A 1GHCA 5LGTA 1FNNA 3Q9VA 4UVAA 3GX4X 3K1PA 4MEXF 5TRDA 1W5TA 3GFLA 3GLXA 3ROUA 2J5OA 3DFGA 1KU2A 2QENA 2NRAC 4BNCA 1QPMA 2QQ9A 3GFMA 1J59A 4IVNA 1UHWA 3B73A 2OBPA 1F4KA 2XHKA 1O7FA 3CO7C 1ZN2A 1Z9CA 5KK1A 1FYKA 1DPUA 3RYPA 3GYHX 4G7OF 4Z2YA 4JQFA 3KP5A 4IF4A 2KKOA 2DT5A 4OIRF 4CICA 4KMUX 1P4AA 4CGZA 1BJAA 2HYFA 4RGXA 2JRTA 3Q9SA 3BROA 4G6QA 1QNTA 2IW5A 4O6JA 3WE2A 4FHTA 4CXFA 3FMSA 2STTA 1AOYA 1BC8C 2IA1A 2L02A 3M8FA 1UFMA 2P7VB 2DU9A 4L5IA 5FFXA 2KIFA 1WQ2A 3KFWX 1KQ8A 4RB1A 3QAHA 4PGHA 4WXHA 2EFNA 5HS9A 2ESHA 2LKPA 4P55A 2BGCA 3HRUA 2H27A 3I53A 4EMSA 3I54A 1J5YA 4UHTA 2PMHA 1D8JA 3RIRA 4Q4ZF 4BYYA 4HQEA 3JAMK 2IA0A 1SMYF 2BEOA 2VOOA 3I59B 4D0PA 1Z6TA 2GWRA 5D4SA 3VOEA 2Z9OA 4Q47A 2FMLA 1B4AA 2F5EA 4HV5A 1PP7U 5FB2A 5H6RA 4MTEA 1S3JA 3ZMDA 2ZFWA 4M72A 2FRHA 2FNPA 3BJAA 2DBBA 1SD4A 4EV0A 2NAZA 1HKSA 3WGHA 2EV6A 4ETSA 1IN8A 5E20A 3TO9A 4XRFA 1AWCA 2P6SA 1UB9A 4BQAA 1R1VA 1K78A 1FBSA 5F1RA 2HFHA 4A12A 5ICEA 5BPIA 1W7PA 2E7WA 2VT3A 1KQ9A 3QPHA 1DDNA 3P9CA 4MNUA 1Y0UA 2MD5A 1V4RA 1FYLA 1ZARA 1OMIA 2W24A 5LHHA 3WTYC 3KETA 5HLGA 2DK5A 2YX7A 5HLHA 2D1VA 4IXAA 3IRQA 4HOBA 2DPDA 3EUHA 3HSFA 4HZFA 3GFJA 3V7RA 1ZGJA 3FM3A 2L3DA 3HSEA 2XAJA 5ILUA 5FO5A 5IT9Z 1W4MA 1YLFA 4Q5SF 4KN4X 4M73A 2PG4A 3CLOA 5DYMA 3IRRA 3G73A 1LVAA 3FXQA 4BH9A 4HW0A 1YG2A 5JR3A 4KYWA 4S05A 1XSXA 1IXCA 4M74A 2FSWA 1ZRFA 4LJZF 3SZTA 4UXNA 4BHCA 1T38A 4WF2A 2DPUA 1KU9A 4Y15A 2FBKA 1SFEA 4KIBA 3PFIA 1VTNC 3HRTA 3HUGA 4ENKA 1TTYA 3KCCA 3R61A 2X0LA 4ZZLA 3T0YA 1O7LA 3W6JB 2D45A 1FZPB 1ZHFA 3KEQA 4JK1X 4RB2C 4ZYDA 4KNYA 1U5TA 1D8KA 3N4MA 5IT3A 4ZYHA 3CDHA 2XAQA 2ZJ2A 3HHGA 1OKRA 3F6OA 5F6FA 2E1NA 2MLKA 2ZNZA 1R23A 3P9KA 1UHMA 2DTRA 2EFPA 2FOKA 3GZ6A 1XGSA 4BAYA 1I1GA 3J80K 2VBYA 5ED4A 4LLGF 3WTZA 1R22A 2DFIA 4HV6A 4YIIA 5D5WB 2MC3A 1G3SA 3BJ6A 4KA4A 2AS5F 3IWZA 2K86A 2HTSA 5CLSA 1S29A 2OA4A 3GF2A 2VN2A 4ENJA 5DCFA 4HF2A 4YFKF 3ZMZA 2QQAA 5ICGA 3TOBA 5E18F 1U78A 3FMQA 2LSOA 4OIQF 3F6VA 3HTSB 2OQGA 3VFZA 3K69A 1ODDA 1XDUA 1Z7UA 1TW2A 1U6GA 1XN7A 5EEHA 5HS8A 4KIGA 1W7PD 1T6SA 2VBXA 2VC1A 3HTUA 3WGGA 3TKYA 2IT0A 1OYWA 3J81Z 2CW0F 3R6SA 2EA2A 4EGYA 1B9NA 4HX4A 1RUOA 1ZGAA 3LAJA 1ZAOA 2XKOA 3FXRA 5HVQC 4PGGA 4RS8A 2RV8A 2ACJA 3T8TA 1TNTA 1KYZA 4UV8A 4EJVA 2FBIA 1MKMA 3FM5A 5LLQA 2XIGA 1O57A 1KA8A 1LJ9A 1OYIA 1C0WA 1T39A 2ELHA 3RPUA 5KVRA 2CG4A 2QBYA 3HRMA 4L9NA 4P9UA 1H9TA 2HYGD 4A0XA 1G3TA 2V1XA 4A6EA 5L3GA 1H9GA 1S7OA 5L3EA 4OMYA 1TQIA 4HBLA 1I5ZA 2GAUA 3ISPA 4KN7X 5L3DA 3V8KA 2IA2A 5AIPA 1QBJA 2ZXJA 4I0BA 1FP1D 1V3FA 2PLYA 3M8EA 3WTWC 2Y0MA 2A69F 4ENNA 3JTHA 5DV5A 1O3RA 1BM9A 3B02A 3ABTA 6PAXA 2PJPA 3F8CA 3WTXC 1IN4A 5D5XB 4IRHA 1KU3A 2QM3A 3KE2A 3F72A 1I6XA 2JTVA 2BYVE 2KRFA 3ZMVA 2UXXA 4CHUA 2GA1A 3MWMA 4WK8F 2DK8A 4WXDA 1FP2A 1BBYA 2HDCA 5ILVA 1R36A 1DUXC 2PMUA 1IAWA 3U2RA 4AD9A 1TBXA 1FSHA 2PQ8A 4N9IA 4UVBA 3KP3A 2CFXA 2D2WA 1XMKA 3D5LA 4N9HA 1K78B 5DCMB 3LFKA 4OU0A 3F8BA 2P6TA 5FLXK 2ZCWA 3TO7A 2HQNA 4EQQA 3DQVC 3WG9A 4RB3C 1O3QA 1PDNC 2R7FA 1D3YA 2EFQA 2HEOA 3IHUA 3SHFA 4DNCA 2M1BA 2V9VA 4KICA 1CF7A 5FD5A 4M9XA 3BZ6A 4M6YA 4EM1A 1P4WA 2CO5A 1E2XA 1P6RA 2P4WA 2DQLA 2P7CB 4MQ9F 1R5GA 2VBWA 2ISZA 1IRGA 4EJOA 3HHHA 1T0FA 1ZYRF 3BPXA 1H0MA 4XLNF 3NQOA 3L00A 3FF5A 2V1DA 4I02A 1L3LA 4CO8A 3IC7A 3U1DA 2MH2A 2CGPA 2ADUA 3BJOA 5K5OA 3ZMTA 3LWFA 1HXDA 1J75A 2GXBA 4OIPF 3V4GA 2Z99A 1MD0A 1HW2A 4LMYA 3RYRA 3BP8A 5FFZA 5LBQA 3I64A 5E1ZB 4UVCA 2QYOA 3FHZA 5A2QK 1ZREA 2XAFA 2CQKA 4KMFA 2XKPA 1D5VA 1U5TB 2VBZA 2NS0A 2CWEA 2EV5A 4IRGA 4I01A 2DAOA 1FSEA 2HQRA 2JT1A 1ZG1A 3CUQC 1XSVA 5LHIA 1IN7A 4BXUA 2Z3YA 3F8MA 4L0ZB 3H3ZA 4R79A 2PI0A 4LLNA 4GYGA 5K1YA 4B09A 2IRFG 4P96A 3E6BA 3VODA 4LG0A 2YR2A 4CDGA 2QZ8A 4UNOA 2M87A 4HLXA 4ESBA 2XRNA 5DD4A 4HQMA 4U7BA 1HQCA 4LK1F 1P4XA 1TLHB 5L3BA 5LHGA 3HYIA 3O3KA 4U0WA 3DF8A 1DP7P 2VE9A 1FLIA 3K1MA 3C7JA 5D6EA 3JSOA 1YW7A 4RAYA 3KLOA 1XCBA 4WWCA 5CYVA 1YYVA 3P7NA 2L4AA 3WTUC 1O3TA 3QOPA 1JXSA 2R7DA 1U2WA 4KFCA 1B59A 5DUIA 2FU4A 2K02A 4ZH4F 3SZPA 2VODA 1ULYA 3JSPA 1USSA 1QQIA 2XAHA 1PUEE 3FMRA 1P2FA 4KDPA 3RDIA 4GCVA 3W6KB 2UXNA 2A68F 3L7WA 2L54A 2ZMEA 2MLGA 3I4PA 4HYEA 3RKWA 5K5QA 3WGIA 5FLXZ 2EK5A 1HKQA 1XGMA 3S2WA 2GIVA 1NHAA 4FX0A 2Q2EA 4ZZDA 1WWXA 4ZYGA 4PZJA 1CGPA 3ZP5A 4NHJA 2Q8KA 1ZG3A 3GXOA 3TDZC 4LK0F 2V1UA 2QBYB 1YS6A 2EB7A 2LF8A 1RIOH 3ZQ7A 2NYXA 3H92A 1SD5A 3PQKA 3ZMSA 3KZYA 3F21A 2ZNYA 3ZN0A 4JBAA 4K2EA 2VE8A 4A0ZA 3DEUA 2P8TA 3KP4A 3GUDA 3LA2A 2Q0OA 2GZWA 3T5XA 2RN7A 3QRFF 2H94A 2DW4A 1L0OC 2AXLA 1EH8A 1ZG5A 3KP7A 2YU3A 4MHGA 1YTYA 4MEYF 2J5PA 3OV8A 3F3XA 2EWNA 3COAC 1O3SA 3R0JA 2A07F 2RC4A 1Z1DA 1G3WA 3BWGA 4U0YA 3M7GA 3O6BB 1FT9A 1R7JA 3BDDA 1KGSA 4LGWA 1R1UA 1MJBA 4MGRA 3I59A 4HAMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4HX8 A;  4N0B A;  4U0V A;  3WTS C;  5A2Q Z;  1J2X A;  1J7K A;  4WX9 A;  2Z5U A;  2KJB A;  1DPR A;  4L5J A;  4OMZ A;  4QWQ A;  1LQ1 A;  3DP7 A;  3JAM Z;  3V8L A;  3ZN1 A;  1MGT A;  1ON2 A;  3DKW A;  3LQR A;  4AVP A;  2HS5 A;  2ZBK A;  4O5V A;  2RDP A;  2K4J A;  1GXP A;  4S04 A;  5H6Q A;  1BOA A;  4EM2 A;  2V6C A;  1F1Z A;  2ZO4 A;  1T98 A;  1CF7 B;  2HWV A;  3TO6 A;  4ESF A;  1EV7 A;  3N97 A;  2HR3 A;  1LB2 A;  4KUM A;  5BS6 A;  5K5R A;  2HZT A;  2A6H F;  4EVI A;  2BE5 F;  5CVV A;  1I1S A;  3E5X A;  1IW7 F;  2G7U A;  3BPV A;  4LB5 A;  1QGP A;  2OU2 A;  5ERI A;  4IPA A;  3R60 A;  1OPC A;  5BQT A;  2HGC A;  4HLY A;  1F5T A;  4EJU A;  4WCG A;  2FF4 A;  2KIU A;  5E8I A;  3HOS A;  2O8X A;  4UV9 A;  2RVC A;  1BI3 A;  4L9T A;  1YW9 A;  4EJT A;  3E3V A;  4A0Y A;  1LNW A;  3KEO A;  1XCV A;  2DQR A;  3QU3 A;  5CVU A;  2EFO A;  2W84 A;  5LRR A;  3LAP A;  4FT8 A;  1KYW A;  1XGO A;  3E5U A;  1ZLJ A;  2P5V A;  3ZMU A;  2JPB A;  2Y75 A;  4EM0 B;  5J8F A;  2QVO A;  4M9Z A;  3I5U A;  2YPR A;  3RPQ A;  5AIQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3WTVC

Total Genus

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Chain Sequence

Structure visualization

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