3V3IB

Kinetic and structural studies of thermostabilized mutants of hca ii.
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGFGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFQVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSHDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVSKFRKLNFNGEGEPEEPMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Kinetic and structural characterization of thermostabilized mutants of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 70
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3v3iB00
3S76A 3V7XA 4RIVA 1UGGA 1CA3A 2NWZA 3M5EA 4PYXA 4YX4A 3D8WA 3L14A 2OSFA 3HKNA 1TG3A 2AX2A 3K2FA 5E2RA 3CYUA 2QO8A 1AZMA 1BN1A 3B4FA 4KNJA 4CACA 1LUGA 4CA2A 1ZSCA 3SBIA 1DCBA 3MHLA 1OQ5A 1FQLA 3M1KA 1YO1A 3P55A 5L3OA 1G0FA 4LP6A 4PQ7A 3MHMA 4HBAA 3M5TA 2VVBX 5L6KA 1JCZA 5SZ2A 4KNMA 5BRWA 4RH2A 1FQRA 4CNVA 3V5GA 2FNNA 4Z1NA 1I9QA 3M1JA 4YXIA 1I9NA 2EZ7A 1I90A 3HFPA 3V2JA 4XFWA 4FL7A 4KAPA 4BF1A 1FSQA 4FPTA 5EH5A 3S78B 12CAA 2OSMA 3MZCA 4R59A 4TWLA 5SZ6A 1CNBA 4L5WA 1ZH9A 4KNNA 5FNIA 1CCTA 4JSAA 3R16A 4QJOA 2NN7A 4HU1A 1G4JA 2EU3A 2FOQA 4ZWZA 3K7KA 3N2PA 1KWQA 2NNSA 3RG4A 1HUHA 2ZNCA 3OILA 3S73B 4HEWA 4WW6A 4QIZA 5EHEA 3PJJA 4BCWA 2CA2A 4MDMA 3EFIA 3RYJB 4MLTA 4FVNA 4QK1A 3MHOA 4MDGA 3OY0A 4KUWA 1ZGEA 1TE3X 1LZVA 2X7TA 3VBDA 5DSQA 1UGDA 3MNHA 4MO8A 5AMGA 1RZDA 2WEOA 4Q6EA 1ZSAA 1KEQA 1CAYA 1HUGA 5BRVA 3BL0A 1CCUA 3CA2A 4WR7A 1IF4A 1G54A 1YO2A 4K0ZA 4QIYA 1YDAA 1FLJA 5FDCA 1UGBA 4Q83A 4HF3A 5FLPA 5CLUA 1FR7A 3T82A 1RZBA 3JXFA 1YDBA 5DSNA 5G0BA 4RFDA 3DCSA 3HKQA 3B1BA 1YDDA 4Q99A 4Q7PA 1FSNA 3RLDA 4Q8XA 1OKLA 4Z1EA 3T84A 3F7BA 2HD6A 2CABA 1T9NA 3S72B 4Q7WA 3V3HB 1G3ZA 5FLOA 1TBTX 1RZAA 3D93A 3GZ0A 5JQ0A 5JEGB 1LGDA 2NNOA 4L5VA 2HKKA 7CA2A 5G03A 3RZ7A 1Y7WA 1ZSBA 4HT0A 1H9NA 3F8EA 1JV0A 4RUZA 5A6HA 2NXSA 2FW4A 1BNQA 1CNXA 4QY3A 1CALA 1BNVA 3RG3A 5EHWA 3LXEA 4Z1KA 1ZGFA 1RAZA 3M98A 1G48A 5JG3B 3TVOX 3KOIA 4JSZA 1CILA 1JD0A 4Q87A 5E5UA 3T85A 1ZE8A 1XEVA 1G6VA 4COQA 1TG9A 1HEDA 2VVAX 1YDCA 6CA2A 3M04A 3DVBA 4Q7VA 1ZNCA 3ZP9A 3S8XA 3U3AX 2EU2A 3IBIA 3C7PA 1HECA 3DCWA 5FLSA 1CVHA 1I9MA 5SZ1A 4E3DA 5JQTA 4ZX1A 5EKHA 5IPZA 2HFWA 3M3XA 2CBCA 4Q7SA 2NMXA 5CACA 5DSMA 2Q1QA 1IF5A 1URTA 1AVNA 4MLXA 4YGFA 4Z1JA 5AMLA 2QOAA 4RFCA 5JEHB 5E2KA 1LG5A 3KLDB 3ZNCA 5JGSB 3MHIA 1CAZA 1IF7A 1DMYA 1Z97A 4QJ0A 3ML5A 1BICA 3F7UA 3W6IA 3OKUA 5EKMA 4X5SA 1RJ5A 3DC9A 2NWPA 4YGJA 3R17B 1KOPA 3IBUA 4QEFA 1CVDA 1UGFA 1CAKA 3MNAA 1I8ZA 1CAOA 1CIMA 2NNVA 3KIGA 4QJMA 5J8ZA 4Y0JA 5DSIA 1HEAA 1FQMA 5FNMA 1CVCA 3M1QA 4XIXA 4FU5A 3P44A 3FE4A 2CBDA 5FNJA 4JS6A 2HOCA 4PYYA 3MNIA 4CNRA 3MMFA 1CAMA 5G01A 3DAZA 5EKJA 3M96A 5EZTX 2Q1BA 4CNXA 4E5QA 4YGNA 3D0NA 3P3JA 5FL4A 4QJWA 4YGLA 3M40A 3V3IB 1G53A 4QSBA 3BL1A 3QYKA 1MUAA 3DV7A 4Q9YA 4TWMA 3DA2A 3RZ5A 4ETQC 5DSOA 4MTYA 5DSJA 3OYSA 3CZVA 3IBNA 4QK3A 1CANA 4KP8A 5EHVA 4ZX0A 4HEZA 3P4VA 5C8IA 1G52A 2FOUA 1IF9A 4UOVA 4YVYA 4YYTA 5CA2A 4E3HA 3RZ1B 5JGTB 3SAPA 1CNWA 4HEYA 4M2UA 1I9PA 4ITPA 4M2WA 3S97A 4LU3A 1CAHA 5DSLA 1TEQX 3TVNX 4JSWA 5JDVB 4K0TA 2Q38A 2FNKA 4G0CA 3P5AA 1KOQA 1CINA 4KUYA 3IEOA 1TEUX 5AMDA 5EIJA 5EH8A 1RJ6A 1IF6A 3DVCA 1CNCA 2NNGA 5SZ7A 1MOOA 5FDIA 5HPJA 4C3TA 3BETA 1G1DA 3D92A 3MNUA 4Q06A 4Q6DA 5BYIA 1FQNA 2POVA 2POUA 1BNNA 3S75B 2O4ZA 3V3JA 1CVAA 4QSAA 4CNWA 1ZFQA 3MNKA 4XIWA 1OKNA 3IAIA 5E2NA 4ITOA 1HVAA 2W2JA 3PYKA 1F2WA 4K13A 3N4BA 3N0NA 4Q90A 3KONA 2H4NA 3P5LA 3KS3A 2AW1A 4WW8A 5BNLA 3F4XA 2NN1A 5DSKA 3D9ZA 3RZ0B 4DZ7A 3RZ8A 3TMJA 2FOSA 1CA2A 3MYQA 4ZWIA 3FFPX 3W6HA 3RYXB 3OIKA 4DZ9A 1YO0A 1TH9A 4L5UA 4BF6A 3S74B 3V3GB 4YXUA 1IF8A 3OIMA 1CAJA 3HKTA 4Q09A 3PO6A 4Q0LA 5CJFA 1I9OA 1CNGA 3M2YA 3T5UA 2NXTA 2NWOA 1DCAA 1CRMA 5E5RA 4E4AA 3RJ7A 2NXRA 3JXGA 4RUXA 3SAXA 2NWYA 2CBBA 4WUPA 3NB5A 3K34A 4WUQA 5SZ4A 5EH7A 4Q78A 3S9TA 2FOYA 1CZMA 5BRUA 5EOIA 4WL4A 3T5ZA 1BNMA 1H4NA 4PXXA 1CRAA 3KWAA 1I91A 4QSJA 3DCCA 4M2VA 2FMZA 1CVFA 1FR4A 4IWZA 3ML2A 5DSRA 5E28A 2F14A 4E3GA 4CQ0A 1HEBA 5FNHA 5FNLA 3MDZA 2X7SA 4FIKA 3EFTA 2HL4A 3Q31A 4ZWXA 3M5SA 4K1QA 3JXHC 3OYQA 4KNIA 4GL1X 5SZ5A 3HKUA 3CAJA 4QTLA 3NI5A 2CBAA 3RGEA 1DMXA 1H9QA 1EOUA 4RUYA 3HS4A 3T83A 4Q07A 4XE1A 3U47A 3S71B 4HT2A 4ILXA 5A25A 1BNWA 4KV0A 2WD3A 3IGPA 3P58A 4YHAA 3M2ZA 2QP6A 4Q08A 3SBHA 2GD8A 5FL5A 4QSIA 4MDLA 3FW3A 1UGEA 1CAIA 5DOHA 3RYVB 1A42A 4QJPA 5DVXA 1BCDA 3KOKA 4Q49A 3S77B 1Z9YA 1HCAA 3M14A 3IBLA 1ZFKA 4KUVA 2HNCA 1CNHA 4ZWYA 1FSRA 3N3JA 3DD0A 1BN3A 1LG6A 1CVEA 4RN4A 2IT4A 1G4OA 1KWRA 4R5BA 3NJ9A 3MHCA 1UGAA 4LHIA 2WEGA 3M2NA 3M2XA 3KNEA 3DBUA 4RIUA 3V2MA 1BNTA 1BZMA 5E2MA 2CBEA 3M1WA 3UYNA 1CCSA 2H15A 3DVDA 4E3FA 3P3HA 4FRCA 1UGCA 1CNKA 2WD2A 4FVOA 1TB0X 1G45A 5SZ3A 3RYYA 4G7AA 1J9WA 1I9LA 1BN4A 2FMGA 1V9EA 3OKVA 4XZ5A 1G0EA 3MWOA 3U7CA 4E49A 1RZCA 3HLJA 1CNJA 4K0SA 1OKMA 4IDRX 4KP5A 5FLTA 3RYZA 5JESB 1BV3A 1CVBA 1TTMA 4E9OX 1CNYA 1HCBA 1THKA 2ABEA 3U45X 4YWPA 2FNMA 4Q81A 4Q8YA 5JEPB 5FLRA 1XPZA 4ZAOA 2GEHA 5FLQA 3DC3A 4N0XB 4Q8ZA 2FOVA 4M2RA 4Z0QA 5DOGA 5DSPA 8CA2A 3MNJA 4PZHA 5E2SA 3UYQA 2ILIA 1RAYA 1RZEA 5JG5B 1V9IC 1Z93A 4R5AA 1XQ0A 3V3FA 1AM6A 4JSSA 9CA2A 5G0CA 3M67A 4QK2A 5FL6A 2WEHA 5LMDA 5FNGA 3KKXA 1BNUA 2POWA 3DD8A 5DRSA 2X7UA 4YGKA 1XEGA 1CNIA 5FNKA 2WEJA 5SZ0A 4N16A 4YXOA 1G46A 4QJXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3S76 A;  3V7X A;  4RIV A;  1UGG A;  1CA3 A;  2NWZ A;  3M5E A;  4PYX A;  4YX4 A;  3D8W A;  3L14 A;  2OSF A;  3HKN A;  1TG3 A;  2AX2 A;  3K2F A;  5E2R A;  3CYU A;  2QO8 A;  1AZM A;  1BN1 A;  3B4F A;  4KNJ A;  4CAC A;  1LUG A;  4CA2 A;  1ZSC A;  3SBI A;  1DCB A;  3MHL A;  1OQ5 A;  1FQL A;  3M1K A;  1YO1 A;  3P55 A;  5L3O A;  1G0F A;  4LP6 A;  4PQ7 A;  3MHM A;  4HBA A;  3M5T A;  2VVB X;  5L6K A;  1JCZ A;  5SZ2 A;  4KNM A;  5BRW A;  4RH2 A;  1FQR A;  4CNV A;  3V5G A;  2FNN A;  4Z1N A;  1I9Q A;  3M1J A;  4YXI A;  1I9N A;  2EZ7 A;  1I90 A;  3HFP A;  3V2J A;  4XFW A;  4FL7 A;  4KAP A;  4BF1 A;  1FSQ A;  4FPT A;  5EH5 A;  3S78 B;  12CA A;  2OSM A;  3MZC A;  4R59 A;  4TWL A;  5SZ6 A;  1CNB A;  4L5W A;  1ZH9 A;  4KNN A;  5FNI A;  1CCT A;  4JSA A;  3R16 A;  4QJO A;  2NN7 A;  4HU1 A;  1G4J A;  2EU3 A;  2FOQ A;  4ZWZ A;  3K7K A;  3N2P A;  1KWQ A;  2NNS A;  3RG4 A;  1HUH A;  2ZNC A;  3OIL A;  3S73 B;  4HEW A;  4WW6 A;  4QIZ A;  5EHE A;  3PJJ A;  4BCW A;  2CA2 A;  4MDM A;  3EFI A;  3RYJ B;  4MLT A;  4FVN A; 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