3CCJO

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation c2534u
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SKTNPRLSSLIADLKSAARSSGGAVWGDVAERLEKPRRTHAEVNLGRIERYAQEDETVVVPGKVLGSGVLQKDVTVAAVDFSGTAETKIDQVGEAVSLEQAIENNPEGSHVRVIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 36
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00828 Ribosomal_L27A Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.100.10.10 Alpha Beta Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 3ccjO00
2OTJO 3CCRO 1YHQL 1W2BN 3CMEO 3CCQO 1K8AM 3CCLO 2OTLO 1YJ9O 1S72O 1YI2O 1KD1M 3CCMO 3CCEO 1QVGN 3CPWK 3CCSL 1VQ6L 1K73M 1VQ7O 1VQ4L 3OW2N 1VQKO 3G6EL 1YHQO 3CPWN 2QA4O 1YIJL 3CC4L 1Q82M 1VQ8L 3CC2L 1NJIP 1VQ9L 3CCSO 3I56L 1VQ6O 1KQSN 1VQ4O 3G6EO 3I55L 3CCVO 1VQLO 1JJ2N 1Q81P 1Q86P 3CC4O 1YIJO 3G4SL 1M1KP 2QEXL 1KC8M 1VQ8O 3CC2O 1VQ9O 1K9MM 3I56O 1M90P 3I55O 3CD6L 1KD1P 1YJWL 3CMAL 1N8RP 1YITL 1YJNL 1VQPL 1Q7YP 1K73P 3G4SO 1VQ5L 2QEXO 3CCJL 1VQOL 1QVFK 3G71L 1VQNL 3CCUL 1Q82P 1M1KM 3CD6O 3CC7L 1YJWO 1QVGK 3CMAO 1QVFN 1YITO 1YJNO 1VQPO 1VQML 1K8AP 2QA4L 3OW2K 1M90M 1VQ5O 3CXCK 3CCJO 1VQOO 2OTJL 1NJIM 3G71O 3CCRL 3CMEL 1VQNO 1N8RM 3CCQL 1Q7YM 3CCUO 3CCLL 2OTLL 1YJ9L 3CC7O 1KC8P 1S72L 1YI2L 3CXCN 3CCVL 1Q81M 1VQLL 3CCML 1Q86M 1W2BK 1K9MP 3CCEL 1KQSK 1VQMO 1VQ7L 1VQKL 1JJ2K
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GODA 2OTJO 3CCRO 1YHQL 5DS4A 3CMEO 1W2BN 5DQZA 3CCQO 1K8AM 4P6IC 3CCLO 2OTLO 1YJ9O 1S72O 1YI2O 1KD1M 3CCMO 3CCEO 1QVGN 3CPWK 3CCSL 1VQ6L 1K73M 1VQ7O 1VQ4L 3OW2N 1VQKO 3G6EL 1YHQO 3CPWN 2QA4O 1YIJL 3CC4L 1Q82M 3NKDA 1VQ8L 3CC2L 1NJIP 1VQ9L 3CCSO 3I56L 1VQ6O 1KQSN 1VQ4O 3G6EO 3I55L 3CCVO 1VQLO 1JJ2N 1Q81P 4XTKA 1Q86P 3CC4O 1YIJO 3G4SL 1M1KP 2QEXL 1KC8M 1VQ8O 3CC2O 1VQ9O 1K9MM 3I56O 1M90P 3I55O 3CD6L 1KD1P 1YJWL 3CMAL 1N8RP 1YITL 1YJNL 1VQPL 1Q7YP 4QDLA 5FCLA 1K73P 5DQTA 3G4SO 1VQ5L 2QEXO 3CCJL 1VQOL 5DLJA 1QVFK 3G71L 1VQNL 3CCUL 1Q82P 4N06A 1M1KM 3CD6O 3CC7L 1YJWO 1QVGK 3CMAO 1QVFN 1YITO 1YJNO 1VQPO 1VQML 1K8AP 2QA4L 3OW2K 1M90M 1VQ5O 3CXCK 3CCJO 1VQOO 2OTJL 1NJIM 3G71O 3CCRL 3CMEL 1VQNO 1N8RM 3CCQL 1Q7YM 3CCUO 4WJ0A 3CCLL 2OTLL 1YJ9L 3CC7O 2YZSA 1S72L 4W8KA 1YI2L 1KC8P 3CXCN 3CCVL 1Q81M 1VQLL 3CCML 1Q86M 1W2BK 1K9MP 3CCEL 1KQSK 1VQMO 1VQ7L 5DS5A 1VQKL 5DS6A 1JJ2K
chains in the Genus database with same CATH topology
3GODA 2OTJO 3CCRO 1YHQL 5DS4A 3CMEO 1W2BN 5DQZA 3CCQO 1K8AM 4P6IC 3CCLO 2OTLO 1YJ9O 1S72O 1YI2O 1KD1M 3CCMO 3CCEO 1QVGN 3CPWK 3CCSL 1VQ6L 1K73M 1VQ7O 1VQ4L 3OW2N 1VQKO 3G6EL 1YHQO 3CPWN 2QA4O 1YIJL 3CC4L 1Q82M 3NKDA 1VQ8L 3CC2L 1NJIP 1VQ9L 3CCSO 3I56L 1VQ6O 1KQSN 1VQ4O 3G6EO 3I55L 3CCVO 1VQLO 1JJ2N 1Q81P 4XTKA 1Q86P 3CC4O 1YIJO 3G4SL 1M1KP 2QEXL 1KC8M 1VQ8O 3CC2O 1VQ9O 1K9MM 3I56O 1M90P 3I55O 3CD6L 1KD1P 1YJWL 3CMAL 1N8RP 1YITL 1YJNL 1VQPL 1Q7YP 4QDLA 5FCLA 1K73P 5DQTA 3G4SO 1VQ5L 2QEXO 3CCJL 1VQOL 5DLJA 1QVFK 3G71L 1VQNL 3CCUL 1Q82P 4N06A 1M1KM 3CD6O 3CC7L 1YJWO 1QVGK 3CMAO 1QVFN 1YITO 1YJNO 1VQPO 1VQML 1K8AP 2QA4L 3OW2K 1M90M 1VQ5O 3CXCK 3CCJO 1VQOO 2OTJL 1NJIM 3G71O 3CCRL 3CMEL 1VQNO 1N8RM 3CCQL 1Q7YM 3CCUO 4WJ0A 3CCLL 2OTLL 1YJ9L 3CC7O 2YZSA 1S72L 4W8KA 1YI2L 1KC8P 3CXCN 3CCVL 1Q81M 1VQLL 3CCML 1Q86M 1W2BK 1K9MP 3CCEL 1KQSK 1VQMO 1VQ7L 5DS5A 1VQKL 5DS6A 1JJ2K
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2OTJ O;  3CCR O;  1YHQ L;  1W2B N;  3CME O;  3CCQ O;  1K8A M;  3CCL O;  2OTL O;  1YJ9 O;  1S72 O;  1YI2 O;  1KD1 M;  3CCM O;  3CCE O;  1QVG N;  3CPW K;  3CCS L;  1VQ6 L;  1K73 M;  1VQ7 O;  1VQ4 L;  3OW2 N;  1VQK O;  3G6E L;  1YHQ O;  3CPW N;  2QA4 O;  1YIJ L;  3CC4 L;  1Q82 M;  1VQ8 L;  3CC2 L;  1NJI P;  1VQ9 L;  3CCS O;  3I56 L;  1VQ6 O;  1KQS N;  1VQ4 O;  3G6E O;  3I55 L;  3CCV O;  1VQL O;  1JJ2 N;  1Q81 P;  1Q86 P;  3CC4 O;  1YIJ O;  3G4S L;  1M1K P;  2QEX L;  1KC8 M;  1VQ8 O;  3CC2 O;  1VQ9 O;  1K9M M;  3I56 O;  1M90 P;  3I55 O;  3CD6 L;  1KD1 P;  1YJW L;  3CMA L;  1N8R P;  1YIT L;  1YJN L;  1VQP L;  1Q7Y P;  1K73 P;  3G4S O;  1VQ5 L;  2QEX O;  3CCJ L;  1VQO L;  1QVF K;  3G71 L;  1VQN L;  3CCU L;  1Q82 P;  1M1K M;  3CD6 O;  3CC7 L;  1YJW O;  1QVG K;  3CMA O;  1QVF N;  1YIT O;  1YJN O;  1VQP O;  1VQM L;  1K8A P;  2QA4 L;  3OW2 K;  1M90 M;  1VQ5 O;  3CXC K;  3CCJ O;  1VQO O;  2OTJ L;  1NJI M;  3G71 O;  3CCR L;  3CME L;  1VQN O;  1N8R M;  3CCQ L;  1Q7Y M;  3CCU O;  3CCL L;  2OTL L;  1YJ9 L;  3CC7 O;  1KC8 P;  1S72 L;  1YI2 L;  3CXC N;  3CCV L;  1Q81 M;  1VQL L;  3CCM L;  1Q86 M;  1W2B K;  1K9M P;  3CCE L;  1KQS K;  1VQM O;  1VQ7 L;  1VQK L;  1JJ2 K; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GOD A;  2OTJ O;  3CCR O;  1YHQ L;  5DS4 A;  3CME O;  1W2B N;  5DQZ A;  3CCQ O;  1K8A M;  4P6I C;  3CCL O;  2OTL O;  1YJ9 O;  1S72 O;  1YI2 O;  1KD1 M;  3CCM O;  3CCE O;  1QVG N;  3CPW K;  3CCS L;  1VQ6 L;  1K73 M;  1VQ7 O;  1VQ4 L;  3OW2 N;  1VQK O;  3G6E L;  1YHQ O;  3CPW N;  2QA4 O;  1YIJ L;  3CC4 L;  1Q82 M;  3NKD A;  1VQ8 L;  3CC2 L;  1NJI P;  1VQ9 L;  3CCS O;  3I56 L;  1VQ6 O;  1KQS N;  1VQ4 O;  3G6E O;  3I55 L;  3CCV O;  1VQL O;  1JJ2 N;  1Q81 P;  4XTK A;  1Q86 P;  3CC4 O;  1YIJ O;  3G4S L;  1M1K P;  2QEX L;  1KC8 M;  1VQ8 O;  3CC2 O;  1VQ9 O;  1K9M M;  3I56 O;  1M90 P;  3I55 O;  3CD6 L;  1KD1 P;  1YJW L;  3CMA L;  1N8R P;  1YIT L;  1YJN L;  1VQP L;  1Q7Y P;  4QDL A;  5FCL A;  1K73 P;  5DQT A;  3G4S O;  1VQ5 L;  2QEX O;  3CCJ L;  1VQO L;  5DLJ A;  1QVF K;  3G71 L;  1VQN L;  3CCU L;  1Q82 P;  4N06 A;  1M1K M;  3CD6 O;  3CC7 L;  1YJW O;  1QVG K;  3CMA O;  1QVF N;  1YIT O;  1YJN O;  1VQP O;  1VQM L;  1K8A P;  2QA4 L;  3OW2 K;  1M90 M;  1VQ5 O;  3CXC K;  3CCJ O;  1VQO O;  2OTJ L;  1NJI M;  3G71 O;  3CCR L;  3CME L;  1VQN O;  1N8R M;  3CCQ L;  1Q7Y M;  3CCU O;  4WJ0 A;  3CCL L;  2OTL L;  1YJ9 L;  3CC7 O;  2YZS A;  1S72 L;  4W8K A;  1YI2 L;  1KC8 P;  3CXC N;  3CCV L;  1Q81 M;  1VQL L;  3CCM L;  1Q86 M;  1W2B K;  1K9M P;  3CCE L;  1KQS K;  1VQM O;  1VQ7 L;  5DS5 A;  1VQK L;  5DS6 A;  1JJ2 K; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 3GOD A;  2OTJ O;  3CCR O;  1YHQ L;  5DS4 A;  3CME O;  1W2B N;  5DQZ A;  3CCQ O;  1K8A M;  4P6I C;  3CCL O;  2OTL O;  1YJ9 O;  1S72 O;  1YI2 O;  1KD1 M;  3CCM O;  3CCE O;  1QVG N;  3CPW K;  3CCS L;  1VQ6 L;  1K73 M;  1VQ7 O;  1VQ4 L;  3OW2 N;  1VQK O;  3G6E L;  1YHQ O;  3CPW N;  2QA4 O;  1YIJ L;  3CC4 L;  1Q82 M;  3NKD A;  1VQ8 L;  3CC2 L;  1NJI P;  1VQ9 L;  3CCS O;  3I56 L;  1VQ6 O;  1KQS N;  1VQ4 O;  3G6E O;  3I55 L;  3CCV O;  1VQL O;  1JJ2 N;  1Q81 P;  4XTK A;  1Q86 P;  3CC4 O;  1YIJ O;  3G4S L;  1M1K P;  2QEX L;  1KC8 M;  1VQ8 O;  3CC2 O;  1VQ9 O;  1K9M M;  3I56 O;  1M90 P;  3I55 O;  3CD6 L;  1KD1 P;  1YJW L;  3CMA L;  1N8R P;  1YIT L;  1YJN L;  1VQP L;  1Q7Y P;  4QDL A;  5FCL A;  1K73 P;  5DQT A;  3G4S O;  1VQ5 L;  2QEX O;  3CCJ L;  1VQO L;  5DLJ A;  1QVF K;  3G71 L;  1VQN L;  3CCU L;  1Q82 P;  4N06 A;  1M1K M;  3CD6 O;  3CC7 L;  1YJW O;  1QVG K;  3CMA O;  1QVF N;  1YIT O;  1YJN O;  1VQP O;  1VQM L;  1K8A P;  2QA4 L;  3OW2 K;  1M90 M;  1VQ5 O;  3CXC K;  3CCJ O;  1VQO O;  2OTJ L;  1NJI M;  3G71 O;  3CCR L;  3CME L;  1VQN O;  1N8R M;  3CCQ L;  1Q7Y M;  3CCU O;  4WJ0 A;  3CCL L;  2OTL L;  1YJ9 L;  3CC7 O;  2YZS A;  1S72 L;  4W8K A;  1YI2 L;  1KC8 P;  3CXC N;  3CCV L;  1Q81 M;  1VQL L;  3CCM L;  1Q86 M;  1W2B K;  1K9M P;  3CCE L;  1KQS K;  1VQM O;  1VQ7 L;  5DS5 A;  1VQK L;  5DS6 A;  1JJ2 K; 
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