3CCLL

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535c. density for anisomycin is visible but not included in model.
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
150
structure length
145
Chain Sequence
TSKKKRQRGSRTHGGGSHKNRRGAGHRGGRGDAGRDKHEFHNHEPLGKSGFKRPQKVQEEAATIDVREIDENVTLLAADDVAEFRVDVRDVVEEADDADYVKVLGAGQVRHELTLIADDFSEGAREKVEGAGGSVELTDLGEERQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 29
structure length 145
sequence length 150
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
L PF00828 Ribosomal_L27A Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.100.10.10 Alpha Beta Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 3cclL02
4.10.990.10 Few Secondary Structures Irregular Molecule: Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 1 Molecule: Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 1 3cclL01
3CCVO 1Q82P 3CCLL 1VQNL 1YJ9L 1K73M 3CCSL 1VQ5O 3CCQO 1QVGK 1N8RM 3OW2N 3CC4L 1Q81M 1VQ9L 1VQKL 1S72O 1YI2O 1KD1M 3CC7O 1VQNO 3CCSO 1Q81P 1KD1P 1YJWL 2QEXL 2OTLL 1KC8P 1VQOL 3CD6O 1QVGN 1VQ8O 1VQ7O 1YIJO 3G6EL 3CMAL 1Q86P 1KQSK 1M1KP 3CCJO 1VQ4L 1VQPL 1QVFK 3I55L 3CCEL 1K73P 2QA4L 1YJNL 3CCLO 1YJ9O 3CCRL 1N8RP 3G4SL 1Q7YM 3CC4O 1VQ9O 1VQKO 3CCML 3I56L 3CMEL 3CPWK 1K9MM 1YJNO 3G71L 3CXCK 1KQSN 1QVFN 1YJWO 2QEXO 3CCMO 2OTLO 1VQOO 1M90M 3CCUL 1VQLL 1W2BK 1K8AM 3G6EO 3CPWN 3CMAO 1YITL 1YHQL 3CXCN 3CC2L 1VQML 3CCVL 1K8AP 1JJ2K 1VQ5L 1VQ4O 1VQPO 1S72L 1YI2L 3I55O 3CCEO 2OTJL 2QA4O 1Q7YP 3CCRO 3CC7L 3G4SO 1W2BN 3I56O 3CMEO 1K9MP 2OTJO 1VQ6L 3G71O 3CD6L 1JJ2N 1KC8M 1VQ8L 1VQ7L 1YIJL 3OW2K 1M90P 1NJIM 1VQ6O 3CCUO 1Q86M 1VQLO 1Q82M 3CCQL 3CCJL 1YITO 1NJIP 1M1KM 1YHQO 3CC2O 1VQMO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCVO 1Q82P 3CCLL 1VQNL 1YJ9L 1K73M 3CCSL 1VQ5O 3CCQO 1QVGK 1N8RM 3OW2N 3CC4L 1Q81M 1VQ9L 1VQKL 1S72O 1YI2O 1KD1M 3CC7O 1VQNO 4P6IC 3CCSO 1Q81P 1KD1P 1YJWL 5DQZA 2QEXL 2OTLL 1KC8P 1VQOL 3CD6O 1QVGN 1VQ8O 1VQ7O 1YIJO 3G6EL 3CMAL 3NKDA 1Q86P 5DQTA 1KQSK 1M1KP 3CCJO 2YZSA 1VQ4L 5FCLA 1VQPL 1QVFK 5DS4A 3I55L 3GODA 3CCEL 1K73P 2QA4L 1YJNL 3CCLO 1YJ9O 3CCRL 1N8RP 3G4SL 4N06A 1Q7YM 4W8KA 3CC4O 1VQ9O 1VQKO 3CCML 3I56L 3CMEL 3CPWK 5DLJA 1K9MM 1YJNO 3G71L 3CXCK 1KQSN 1QVFN 1YJWO 2QEXO 3CCMO 2OTLO 1VQOO 1M90M 3CCUL 1VQLL 1W2BK 1K8AM 3G6EO 3CPWN 3CMAO 1YITL 1YHQL 4QDLA 3CXCN 5DS5A 3CC2L 1VQML 3CCVL 1K8AP 1JJ2K 1VQ5L 1VQ4O 1VQPO 1S72L 1YI2L 3I55O 3CCEO 2OTJL 2QA4O 1Q7YP 3CCRO 3CC7L 4XTKA 3G4SO 1W2BN 5DS6A 3I56O 3CMEO 4WJ0A 1K9MP 2OTJO 1VQ6L 3G71O 3CD6L 1JJ2N 1KC8M 1VQ8L 1VQ7L 1YIJL 3OW2K 1M90P 1NJIM 1VQ6O 3CCUO 1Q86M 1VQLO 1Q82M 3CCQL 3CCJL 1YITO 1NJIP 1M1KM 1YHQO 3CC2O 1VQMO
chains in the Genus database with same CATH topology
3CCVO 1Q82P 3CCLL 1VQNL 1YJ9L 1K73M 3CCSL 1VQ5O 3CCQO 1QVGK 1N8RM 3OW2N 3CC4L 1Q81M 1VQ9L 1VQKL 1S72O 1YI2O 1KD1M 3CC7O 1VQNO 4P6IC 3CCSO 1Q81P 1KD1P 1YJWL 5DQZA 2QEXL 2OTLL 1KC8P 1VQOL 3CD6O 1QVGN 1VQ8O 1VQ7O 1YIJO 3G6EL 3CMAL 3NKDA 1Q86P 5DQTA 1KQSK 1M1KP 3CCJO 2YZSA 1VQ4L 5FCLA 1VQPL 1QVFK 5DS4A 3I55L 3GODA 3CCEL 1K73P 2QA4L 1YJNL 3CCLO 1YJ9O 3CCRL 1N8RP 3G4SL 4N06A 1Q7YM 4W8KA 3CC4O 1VQ9O 1VQKO 3CCML 3I56L 3CMEL 3CPWK 5DLJA 1K9MM 1YJNO 3G71L 3CXCK 1KQSN 1QVFN 1YJWO 2QEXO 3CCMO 2OTLO 1VQOO 1M90M 3CCUL 1VQLL 1W2BK 1K8AM 3G6EO 3CPWN 3CMAO 1YITL 1YHQL 4QDLA 3CXCN 5DS5A 3CC2L 1VQML 3CCVL 1K8AP 1JJ2K 1VQ5L 1VQ4O 1VQPO 1S72L 1YI2L 3I55O 3CCEO 2OTJL 2QA4O 1Q7YP 3CCRO 3CC7L 4XTKA 3G4SO 1W2BN 5DS6A 3I56O 3CMEO 4WJ0A 1K9MP 2OTJO 1VQ6L 3G71O 3CD6L 1JJ2N 1KC8M 1VQ8L 1VQ7L 1YIJL 3OW2K 1M90P 1NJIM 1VQ6O 3CCUO 1Q86M 1VQLO 1Q82M 3CCQL 3CCJL 1YITO 1NJIP 1M1KM 1YHQO 3CC2O 1VQMO
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CCV O;  1Q82 P;  3CCL L;  1VQN L;  1YJ9 L;  1K73 M;  3CCS L;  1VQ5 O;  3CCQ O;  1QVG K;  1N8R M;  3OW2 N;  3CC4 L;  1Q81 M;  1VQ9 L;  1VQK L;  1S72 O;  1YI2 O;  1KD1 M;  3CC7 O;  1VQN O;  3CCS O;  1Q81 P;  1KD1 P;  1YJW L;  2QEX L;  2OTL L;  1KC8 P;  1VQO L;  3CD6 O;  1QVG N;  1VQ8 O;  1VQ7 O;  1YIJ O;  3G6E L;  3CMA L;  1Q86 P;  1KQS K;  1M1K P;  3CCJ O;  1VQ4 L;  1VQP L;  1QVF K;  3I55 L;  3CCE L;  1K73 P;  2QA4 L;  1YJN L;  3CCL O;  1YJ9 O;  3CCR L;  1N8R P;  3G4S L;  1Q7Y M;  3CC4 O;  1VQ9 O;  1VQK O;  3CCM L;  3I56 L;  3CME L;  3CPW K;  1K9M M;  1YJN O;  3G71 L;  3CXC K;  1KQS N;  1QVF N;  1YJW O;  2QEX O;  3CCM O;  2OTL O;  1VQO O;  1M90 M;  3CCU L;  1VQL L;  1W2B K;  1K8A M;  3G6E O;  3CPW N;  3CMA O;  1YIT L;  1YHQ L;  3CXC N;  3CC2 L;  1VQM L;  3CCV L;  1K8A P;  1JJ2 K;  1VQ5 L;  1VQ4 O;  1VQP O;  1S72 L;  1YI2 L;  3I55 O;  3CCE O;  2OTJ L;  2QA4 O;  1Q7Y P;  3CCR O;  3CC7 L;  3G4S O;  1W2B N;  3I56 O;  3CME O;  1K9M P;  2OTJ O;  1VQ6 L;  3G71 O;  3CD6 L;  1JJ2 N;  1KC8 M;  1VQ8 L;  1VQ7 L;  1YIJ L;  3OW2 K;  1M90 P;  1NJI M;  1VQ6 O;  3CCU O;  1Q86 M;  1VQL O;  1Q82 M;  3CCQ L;  3CCJ L;  1YIT O;  1NJI P;  1M1K M;  1YHQ O;  3CC2 O;  1VQM O; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CCV O;  1Q82 P;  3CCL L;  1VQN L;  1YJ9 L;  1K73 M;  3CCS L;  1VQ5 O;  3CCQ O;  1QVG K;  1N8R M;  3OW2 N;  3CC4 L;  1Q81 M;  1VQ9 L;  1VQK L;  1S72 O;  1YI2 O;  1KD1 M;  3CC7 O;  1VQN O;  4P6I C;  3CCS O;  1Q81 P;  1KD1 P;  1YJW L;  5DQZ A;  2QEX L;  2OTL L;  1KC8 P;  1VQO L;  3CD6 O;  1QVG N;  1VQ8 O;  1VQ7 O;  1YIJ O;  3G6E L;  3CMA L;  3NKD A;  1Q86 P;  5DQT A;  1KQS K;  1M1K P;  3CCJ O;  2YZS A;  1VQ4 L;  5FCL A;  1VQP L;  1QVF K;  5DS4 A;  3I55 L;  3GOD A;  3CCE L;  1K73 P;  2QA4 L;  1YJN L;  3CCL O;  1YJ9 O;  3CCR L;  1N8R P;  3G4S L;  4N06 A;  1Q7Y M;  4W8K A;  3CC4 O;  1VQ9 O;  1VQK O;  3CCM L;  3I56 L;  3CME L;  3CPW K;  5DLJ A;  1K9M M;  1YJN O;  3G71 L;  3CXC K;  1KQS N;  1QVF N;  1YJW O;  2QEX O;  3CCM O;  2OTL O;  1VQO O;  1M90 M;  3CCU L;  1VQL L;  1W2B K;  1K8A M;  3G6E O;  3CPW N;  3CMA O;  1YIT L;  1YHQ L;  4QDL A;  3CXC N;  5DS5 A;  3CC2 L;  1VQM L;  3CCV L;  1K8A P;  1JJ2 K;  1VQ5 L;  1VQ4 O;  1VQP O;  1S72 L;  1YI2 L;  3I55 O;  3CCE O;  2OTJ L;  2QA4 O;  1Q7Y P;  3CCR O;  3CC7 L;  4XTK A;  3G4S O;  1W2B N;  5DS6 A;  3I56 O;  3CME O;  4WJ0 A;  1K9M P;  2OTJ O;  1VQ6 L;  3G71 O;  3CD6 L;  1JJ2 N;  1KC8 M;  1VQ8 L;  1VQ7 L;  1YIJ L;  3OW2 K;  1M90 P;  1NJI M;  1VQ6 O;  3CCU O;  1Q86 M;  1VQL O;  1Q82 M;  3CCQ L;  3CCJ L;  1YIT O;  1NJI P;  1M1K M;  1YHQ O;  3CC2 O;  1VQM O; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 3CCV O;  1Q82 P;  3CCL L;  1VQN L;  1YJ9 L;  1K73 M;  3CCS L;  1VQ5 O;  3CCQ O;  1QVG K;  1N8R M;  3OW2 N;  3CC4 L;  1Q81 M;  1VQ9 L;  1VQK L;  1S72 O;  1YI2 O;  1KD1 M;  3CC7 O;  1VQN O;  4P6I C;  3CCS O;  1Q81 P;  1KD1 P;  1YJW L;  5DQZ A;  2QEX L;  2OTL L;  1KC8 P;  1VQO L;  3CD6 O;  1QVG N;  1VQ8 O;  1VQ7 O;  1YIJ O;  3G6E L;  3CMA L;  3NKD A;  1Q86 P;  5DQT A;  1KQS K;  1M1K P;  3CCJ O;  2YZS A;  1VQ4 L;  5FCL A;  1VQP L;  1QVF K;  5DS4 A;  3I55 L;  3GOD A;  3CCE L;  1K73 P;  2QA4 L;  1YJN L;  3CCL O;  1YJ9 O;  3CCR L;  1N8R P;  3G4S L;  4N06 A;  1Q7Y M;  4W8K A;  3CC4 O;  1VQ9 O;  1VQK O;  3CCM L;  3I56 L;  3CME L;  3CPW K;  5DLJ A;  1K9M M;  1YJN O;  3G71 L;  3CXC K;  1KQS N;  1QVF N;  1YJW O;  2QEX O;  3CCM O;  2OTL O;  1VQO O;  1M90 M;  3CCU L;  1VQL L;  1W2B K;  1K8A M;  3G6E O;  3CPW N;  3CMA O;  1YIT L;  1YHQ L;  4QDL A;  3CXC N;  5DS5 A;  3CC2 L;  1VQM L;  3CCV L;  1K8A P;  1JJ2 K;  1VQ5 L;  1VQ4 O;  1VQP O;  1S72 L;  1YI2 L;  3I55 O;  3CCE O;  2OTJ L;  2QA4 O;  1Q7Y P;  3CCR O;  3CC7 L;  4XTK A;  3G4S O;  1W2B N;  5DS6 A;  3I56 O;  3CME O;  4WJ0 A;  1K9M P;  2OTJ O;  1VQ6 L;  3G71 O;  3CD6 L;  1JJ2 N;  1KC8 M;  1VQ8 L;  1VQ7 L;  1YIJ L;  3OW2 K;  1M90 P;  1NJI M;  1VQ6 O;  3CCU O;  1Q86 M;  1VQL O;  1Q82 M;  3CCQ L;  3CCJ L;  1YIT O;  1NJI P;  1M1K M;  1YHQ O;  3CC2 O;  1VQM O; 
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