3CCSO

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482a
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SKTNPRLSSLIADLKSAARSSGGAVWGDVAERLEKPRRTHAEVNLGRIERYAQEDETVVVPGKVLGSGVLQKDVTVAAVDFSGTAETKIDQVGEAVSLEQAIENNPEGSHVRVIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 37
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00828 Ribosomal_L27A Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.100.10.10 Alpha Beta Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 3ccsO00
1QVFN 3OW2N 1VQ7L 2QA4L 2OTLL 1M90P 1YJWL 3CXCK 3CCEO 1YITO 1Q7YP 2OTJO 1VQ9L 1Q81P 3CCQO 3CC7L 3CMAL 1JJ2K 1W2BK 2QEXO 3G71L 3CC4L 1K8AM 1VQ6O 1QVFK 1VQLL 3OW2K 1K9MP 1VQ4O 1VQML 1VQKL 3I55O 3CC2O 3CPWN 3CCLL 1VQ5O 3G4SL 1YIJO 3CCVO 3CCJL 3I56L 1KD1M 3CMEO 1N8RP 1M1KM 3CCEL 1QVGN 1YI2O 1Q86P 1K73M 1VQ8L 1YJNO 1VQOO 1YJ9O 3CD6O 1KC8P 1VQ6L 2QA4O 3CPWK 3CCRO 1VQ4L 1VQPO 3CCSL 3CC2L 1M90M 1VQNO 1VQ5L 1N8RM 1YIJL 3CCVL 1Q7YM 1QVGK 1NJIP 1Q81M 3CCMO 3CMEL 3CCUO 1YITL 2OTJL 1KQSN 1YHQO 1Q82P 1YI2L 3CCQL 1VQKO 1KC8M 1K9MM 2QEXL 1S72O 1YJNL 3G6EO 1VQOL 1YJ9L 3CD6L 1VQ7O 2OTLO 3G4SO 3CCLO 3CCRL 3I55L 3CCJO 1VQPL 3I56O 1NJIM 1YJWO 1VQNL 1VQ9O 1KD1P 1KQSK 3CC7O 3CMAO 1Q82M 1Q86M 1M1KP 3CCML 3CXCN 3CCUL 1VQ8O 1YHQL 3G71O 3CC4O 1K73P 1JJ2N 1VQLO 1VQMO 1W2BN 3CCSO 1K8AP 1S72L 3G6EL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QVFN 3OW2N 1VQ7L 2QA4L 2OTLL 5DS5A 1M90P 1YJWL 3CXCK 3CCEO 1YITO 1Q7YP 2OTJO 1VQ9L 5DS4A 1Q81P 3CCQO 3CC7L 3CMAL 1JJ2K 3NKDA 1W2BK 2QEXO 3G71L 3CC4L 1K8AM 1VQ6O 1QVFK 1VQLL 3OW2K 1K9MP 1VQ4O 1VQML 1VQKL 3I55O 3CC2O 3GODA 3CPWN 3CCLL 1VQ5O 3G4SL 1YIJO 3CCVO 5DLJA 3CCJL 3I56L 1KD1M 3CMEO 1N8RP 1M1KM 3CCEL 5DQZA 1QVGN 1YI2O 1Q86P 5DS6A 1K73M 1VQ8L 1YJNO 2YZSA 1VQOO 1YJ9O 3CD6O 1KC8P 1VQ6L 2QA4O 3CPWK 3CCRO 1VQ4L 1VQPO 5FCLA 3CCSL 3CC2L 1M90M 1VQNO 1VQ5L 1N8RM 1YIJL 3CCVL 1Q7YM 1QVGK 1NJIP 1Q81M 3CCMO 3CMEL 3CCUO 1YITL 2OTJL 1KQSN 1YHQO 1Q82P 1YI2L 4QDLA 3CCQL 1VQKO 1KC8M 4XTKA 1K9MM 2QEXL 1S72O 4P6IC 1YJNL 3G6EO 1VQOL 1YJ9L 3CD6L 1VQ7O 2OTLO 3G4SO 3CCLO 3CCRL 3I55L 3CCJO 1VQPL 3I56O 1NJIM 1YJWO 1VQNL 1VQ9O 4WJ0A 1KD1P 1KQSK 3CC7O 3CMAO 1Q82M 1Q86M 1M1KP 3CCML 3CXCN 4N06A 3CCUL 1VQ8O 1YHQL 3G71O 3CC4O 1K73P 4W8KA 1JJ2N 1VQLO 1VQMO 1W2BN 3CCSO 1K8AP 1S72L 5DQTA 3G6EL
chains in the Genus database with same CATH topology
1QVFN 3OW2N 1VQ7L 2QA4L 2OTLL 5DS5A 1M90P 1YJWL 3CXCK 3CCEO 1YITO 1Q7YP 2OTJO 1VQ9L 5DS4A 1Q81P 3CCQO 3CC7L 3CMAL 1JJ2K 3NKDA 1W2BK 2QEXO 3G71L 3CC4L 1K8AM 1VQ6O 1QVFK 1VQLL 3OW2K 1K9MP 1VQ4O 1VQML 1VQKL 3I55O 3CC2O 3GODA 3CPWN 3CCLL 1VQ5O 3G4SL 1YIJO 3CCVO 5DLJA 3CCJL 3I56L 1KD1M 3CMEO 1N8RP 1M1KM 3CCEL 5DQZA 1QVGN 1YI2O 1Q86P 5DS6A 1K73M 1VQ8L 1YJNO 2YZSA 1VQOO 1YJ9O 3CD6O 1KC8P 1VQ6L 2QA4O 3CPWK 3CCRO 1VQ4L 1VQPO 5FCLA 3CCSL 3CC2L 1M90M 1VQNO 1VQ5L 1N8RM 1YIJL 3CCVL 1Q7YM 1QVGK 1NJIP 1Q81M 3CCMO 3CMEL 3CCUO 1YITL 2OTJL 1KQSN 1YHQO 1Q82P 1YI2L 4QDLA 3CCQL 1VQKO 1KC8M 4XTKA 1K9MM 2QEXL 1S72O 4P6IC 1YJNL 3G6EO 1VQOL 1YJ9L 3CD6L 1VQ7O 2OTLO 3G4SO 3CCLO 3CCRL 3I55L 3CCJO 1VQPL 3I56O 1NJIM 1YJWO 1VQNL 1VQ9O 4WJ0A 1KD1P 1KQSK 3CC7O 3CMAO 1Q82M 1Q86M 1M1KP 3CCML 3CXCN 4N06A 3CCUL 1VQ8O 1YHQL 3G71O 3CC4O 1K73P 4W8KA 1JJ2N 1VQLO 1VQMO 1W2BN 3CCSO 1K8AP 1S72L 5DQTA 3G6EL
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QVF N;  3OW2 N;  1VQ7 L;  2QA4 L;  2OTL L;  1M90 P;  1YJW L;  3CXC K;  3CCE O;  1YIT O;  1Q7Y P;  2OTJ O;  1VQ9 L;  1Q81 P;  3CCQ O;  3CC7 L;  3CMA L;  1JJ2 K;  1W2B K;  2QEX O;  3G71 L;  3CC4 L;  1K8A M;  1VQ6 O;  1QVF K;  1VQL L;  3OW2 K;  1K9M P;  1VQ4 O;  1VQM L;  1VQK L;  3I55 O;  3CC2 O;  3CPW N;  3CCL L;  1VQ5 O;  3G4S L;  1YIJ O;  3CCV O;  3CCJ L;  3I56 L;  1KD1 M;  3CME O;  1N8R P;  1M1K M;  3CCE L;  1QVG N;  1YI2 O;  1Q86 P;  1K73 M;  1VQ8 L;  1YJN O;  1VQO O;  1YJ9 O;  3CD6 O;  1KC8 P;  1VQ6 L;  2QA4 O;  3CPW K;  3CCR O;  1VQ4 L;  1VQP O;  3CCS L;  3CC2 L;  1M90 M;  1VQN O;  1VQ5 L;  1N8R M;  1YIJ L;  3CCV L;  1Q7Y M;  1QVG K;  1NJI P;  1Q81 M;  3CCM O;  3CME L;  3CCU O;  1YIT L;  2OTJ L;  1KQS N;  1YHQ O;  1Q82 P;  1YI2 L;  3CCQ L;  1VQK O;  1KC8 M;  1K9M M;  2QEX L;  1S72 O;  1YJN L;  3G6E O;  1VQO L;  1YJ9 L;  3CD6 L;  1VQ7 O;  2OTL O;  3G4S O;  3CCL O;  3CCR L;  3I55 L;  3CCJ O;  1VQP L;  3I56 O;  1NJI M;  1YJW O;  1VQN L;  1VQ9 O;  1KD1 P;  1KQS K;  3CC7 O;  3CMA O;  1Q82 M;  1Q86 M;  1M1K P;  3CCM L;  3CXC N;  3CCU L;  1VQ8 O;  1YHQ L;  3G71 O;  3CC4 O;  1K73 P;  1JJ2 N;  1VQL O;  1VQM O;  1W2B N;  3CCS O;  1K8A P;  1S72 L;  3G6E L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QVF N;  3OW2 N;  1VQ7 L;  2QA4 L;  2OTL L;  5DS5 A;  1M90 P;  1YJW L;  3CXC K;  3CCE O;  1YIT O;  1Q7Y P;  2OTJ O;  1VQ9 L;  5DS4 A;  1Q81 P;  3CCQ O;  3CC7 L;  3CMA L;  1JJ2 K;  3NKD A;  1W2B K;  2QEX O;  3G71 L;  3CC4 L;  1K8A M;  1VQ6 O;  1QVF K;  1VQL L;  3OW2 K;  1K9M P;  1VQ4 O;  1VQM L;  1VQK L;  3I55 O;  3CC2 O;  3GOD A;  3CPW N;  3CCL L;  1VQ5 O;  3G4S L;  1YIJ O;  3CCV O;  5DLJ A;  3CCJ L;  3I56 L;  1KD1 M;  3CME O;  1N8R P;  1M1K M;  3CCE L;  5DQZ A;  1QVG N;  1YI2 O;  1Q86 P;  5DS6 A;  1K73 M;  1VQ8 L;  1YJN O;  2YZS A;  1VQO O;  1YJ9 O;  3CD6 O;  1KC8 P;  1VQ6 L;  2QA4 O;  3CPW K;  3CCR O;  1VQ4 L;  1VQP O;  5FCL A;  3CCS L;  3CC2 L;  1M90 M;  1VQN O;  1VQ5 L;  1N8R M;  1YIJ L;  3CCV L;  1Q7Y M;  1QVG K;  1NJI P;  1Q81 M;  3CCM O;  3CME L;  3CCU O;  1YIT L;  2OTJ L;  1KQS N;  1YHQ O;  1Q82 P;  1YI2 L;  4QDL A;  3CCQ L;  1VQK O;  1KC8 M;  4XTK A;  1K9M M;  2QEX L;  1S72 O;  4P6I C;  1YJN L;  3G6E O;  1VQO L;  1YJ9 L;  3CD6 L;  1VQ7 O;  2OTL O;  3G4S O;  3CCL O;  3CCR L;  3I55 L;  3CCJ O;  1VQP L;  3I56 O;  1NJI M;  1YJW O;  1VQN L;  1VQ9 O;  4WJ0 A;  1KD1 P;  1KQS K;  3CC7 O;  3CMA O;  1Q82 M;  1Q86 M;  1M1K P;  3CCM L;  3CXC N;  4N06 A;  3CCU L;  1VQ8 O;  1YHQ L;  3G71 O;  3CC4 O;  1K73 P;  4W8K A;  1JJ2 N;  1VQL O;  1VQM O;  1W2B N;  3CCS O;  1K8A P;  1S72 L;  5DQT A;  3G6E L; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 1QVF N;  3OW2 N;  1VQ7 L;  2QA4 L;  2OTL L;  5DS5 A;  1M90 P;  1YJW L;  3CXC K;  3CCE O;  1YIT O;  1Q7Y P;  2OTJ O;  1VQ9 L;  5DS4 A;  1Q81 P;  3CCQ O;  3CC7 L;  3CMA L;  1JJ2 K;  3NKD A;  1W2B K;  2QEX O;  3G71 L;  3CC4 L;  1K8A M;  1VQ6 O;  1QVF K;  1VQL L;  3OW2 K;  1K9M P;  1VQ4 O;  1VQM L;  1VQK L;  3I55 O;  3CC2 O;  3GOD A;  3CPW N;  3CCL L;  1VQ5 O;  3G4S L;  1YIJ O;  3CCV O;  5DLJ A;  3CCJ L;  3I56 L;  1KD1 M;  3CME O;  1N8R P;  1M1K M;  3CCE L;  5DQZ A;  1QVG N;  1YI2 O;  1Q86 P;  5DS6 A;  1K73 M;  1VQ8 L;  1YJN O;  2YZS A;  1VQO O;  1YJ9 O;  3CD6 O;  1KC8 P;  1VQ6 L;  2QA4 O;  3CPW K;  3CCR O;  1VQ4 L;  1VQP O;  5FCL A;  3CCS L;  3CC2 L;  1M90 M;  1VQN O;  1VQ5 L;  1N8R M;  1YIJ L;  3CCV L;  1Q7Y M;  1QVG K;  1NJI P;  1Q81 M;  3CCM O;  3CME L;  3CCU O;  1YIT L;  2OTJ L;  1KQS N;  1YHQ O;  1Q82 P;  1YI2 L;  4QDL A;  3CCQ L;  1VQK O;  1KC8 M;  4XTK A;  1K9M M;  2QEX L;  1S72 O;  4P6I C;  1YJN L;  3G6E O;  1VQO L;  1YJ9 L;  3CD6 L;  1VQ7 O;  2OTL O;  3G4S O;  3CCL O;  3CCR L;  3I55 L;  3CCJ O;  1VQP L;  3I56 O;  1NJI M;  1YJW O;  1VQN L;  1VQ9 O;  4WJ0 A;  1KD1 P;  1KQS K;  3CC7 O;  3CMA O;  1Q82 M;  1Q86 M;  1M1K P;  3CCM L;  3CXC N;  4N06 A;  3CCU L;  1VQ8 O;  1YHQ L;  3G71 O;  3CC4 O;  1K73 P;  4W8K A;  1JJ2 N;  1VQL O;  1VQM O;  1W2B N;  3CCS O;  1K8A P;  1S72 L;  5DQT A;  3G6E L; 
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