The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
PROTEIN (HEMOGLOBIN)
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| publication title |
Crystal structure of the S-nitroso form of liganded human hemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
57
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-09-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GLI A; 2EB8 A; 1J41 A; 3GKT A; 3QZZ A; 2QMB A; 4M4B B; 1BZ1 B; 3PIA A; 1DXU B; 2V1K A; 2OHB A; 4HRT B; 3E5O A; 1DO3 A; 1BVD A; 5SW7 A; 4MQK A; 1BZ1 A; 1HBB B; 2OLP A; 2VYZ A; 5HAV A; 1MZ0 A; 3UHC A; 1YCA A; 1MLO A; 3SDN A; 2W6W A; 1GBU B; 4HRT A; 2V1J A; 1R1Y B; 5M3S A; 3DR9 A; 3UH3 A; 1HBB A; 1YVT B; 1FDH G; 4YU4 A; 1LH1 A; 3HC9 A; 1C7B B; 1R1Y A; 3HEP A; 2VYY A; 3WCT D; 1HV4 B; 2ZLX A; 1JDO A; 4ZVA A; 3RJN B; 1DO1 A; 1URY A; 1DO7 A; 1YVT A; 2HZ1 A; 2MGK A; 1O1I B; 3WCU B; 1X9F C; 4N7N B; 1IRC A; 1C7B A; 1DXT B; 3UBV A; 1QPW B; 3UHR A; 1HV4 A; 1O1O B; 4BJA A; 1MYJ A; 4MQI A; 3OJ1 A; 3HRW B; 4WJG A; 107M A; 1Y5J B; 1O1I A; 3MBA A; 1XZU A; 5CN9 A; 2D60 A; 3WCU A; 4N7N A; 2AV3 A; 112M A; 3WFU A; 3ZJQ A; 3MOU A; 1DXT A; 3UHN A; 1QPW A; 1IWH B; 1YIE B; 2LH3 A; 3HRW A; 1A00 B; 1B0B A; 1Y5J A; 1Y35 B; 1YMB A; 3OGB A; 2R50 A; 3ZJN A; 3LB1 A; 2ZS0 B; 1J7W B; 4U8U D; 2WY4 A; 1HGA B; 2ZLU B; 3OK5 A; 1VXD A; 1YIE A; 1ABY B; 1A00 A; 2BKM A; 1YEQ B; 1ABS A; 1Y35 A; 4NXC A; 2ZFO B; 1O1K B; 3ARJ A; 1S56 A; 1YOG A; 1J7W A; 1EBC A; 2LH5 A; 1YMA A; 1HGA A; 2BLI A; 1CIO A; 2R1H B; 1ABY A; 3HXN B; 1MKO B; 1CH5 A; 1YEQ A; 1R1X B; 3PT8 B; 3MYN A; 2HBC B; 1O1J B; 2LH1 A; 1O1K A; 1S5X B; 4H0B A; 1Y8H B; 1YIH B; 3VAU A; 2R1H A; 3HXN A; 1MKO A; 1FLP A; 3UHB A; 4DC8 A; 1R1X A; 2HBC A; 2OHA A; 1O1J A; 2FRK X; 1YIH A; 3K3U A; 2SPN A; 3UHE A; 1F5O A; 2YRS B; 3OO5 B; 1HBI A; 2XKG A; 2GRH A; 1J52 A; 1V9Q A; 5EU2 A; 3HHB B; 3V2Z A; 1IBE B; 2YRS A; 3OO5 A; 3WCU C; 5EYJ A; 3ZH0 A; 4F6I A; 4MBN A; 1J3F A; 1O1L A; 1LFY B; 1Y4F B; 3S66 A; 3QM7 A; 1FN3 B; 3PI3 A; 1A0Z B; 1NPG A; 3VRG B; 2OH8 A; 1RSE A; 1BIJ B; 1FAW B; 2ZLT A; 3HHB A; 1IBE A; 3PI1 A; 1S6A A; 2H8F B; 1LFY A; 1Y4F A; 3QJC B; 1NWN A; 2HBF B; 1GCW B; 1FN3 A; 2R80 B; 1A0Z A; 1FHJ B; 1GDL A; 3VRG A; 3ZOL A; 1L2K A; 1NXF A; 3RJ6 A; 5HLX A; 1BIJ A; 1LFZ B; 1FAW A; 1YHU D; 2HBE B; 5CMV A; 1O16 A; 3QZX A; 3MN0 A; 2ZS0 C; 1Y4G A; 5F0B A; 3QJC A; 1XQ5 B; 2HBF A; 1GCW A; 3FS4 B; 2R80 A; 1FHJ A; 3TLD A; 3DHT B; 2MB5 A; 1NWI A; 1LFZ A; 2HBE A; 2ZFO C; 2O58 X; 5C6E B; 1LHT A; 1NS9 B; 3D17 B; 3WCV B; 1XQ5 A; 3FS4 A; 3DHT A; 4DC7 A; 2BK9 A; 3MVC A; 3WHM A; 1QXE A; 2V1G A; 1D8U A; 5C6E A; 3UBC A; 1NS9 A; 3WCP B; 1MOA A; 3ORD A; 2G10 A; 3D17 A; 3WCV A; 1YEN B; 2D5X B; 4F68 A; 4OOD A; 1Z8U B; 1Q1F A; 2G14 A; 1YZI B; 4F4O B; 3WCP A; 3A59 B; 2W6X A; 1Y31 B; 1YEN A; 2D5X A; 1J3Z B; 1MTI A; 5D1V A; 2HHE B; 1BIN A; 1BZZ B; 1GBV B; 1MNO A; 4XDI A; 1YZI A; 3ZJL A; 3AQ8 A; 4F4O A; 3A59 A; 3UHS A; 4FC3 B; 1Y31 A; 3SDH A; 5AZR A; 1J3Z A; 1NIH B; 1ECN A; 3M3A A; 1UFJ A; 1BZZ A; 3ZJM A; 1GBV A; 3IC2 B; 1MLJ A; 2H35 B; 4FC3 A; 1Y46 B; 1V4W B; 1VXH A; 2HZ3 A; 1MBS A; 3IC2 A; 1I3E A; 5HLQ A; 2H35 A; 4MXL A; 5MBA A; 3WTG B; 1RQA A; 1Y0A B; 2HZ2 A; 1Y46 A; 1DWS A; 1V4W A; 4LPI A; 3LR9 A; 3S1J A; 1MLR A; 3AT5 B; 3KMF A; 1J3Y B; 1MYG A; 1XZ5 B; 3WTG A; 3PEL B; 1HBG A; 1Y0A A; 1VRE A; 4N8T B; 4F6B A; 1MLG A; 1VXC A; 1Y5K B; 2RI4 B; 1MLF A; 1OUU B; 3AT5 A; 5JGG B; 2GLN A; 2ZSX A; 2GTL B; 1CH9 A; 1HBR B; 1J3Y A; 1XZ5 A; 3WCW B; 3PEL A; 1LJW B; 5EE4 D; 4N8T A; 4NI1 B; 1Y5K A; 1ABW B; 2RI4 A; 3QJE B; 2EVP A; 1OUU A; 1NZ3 A; 5JGG A; 1YOI A; 1CBL A; 2GTL A; 1HBR A; 1JP6 A; 1UVY A; 3UHD A; 3WCW A; 4HHB B; 1LJW A; 1V5H A; 4NI1 A; 3GOU A; 1UX9 A; 1CG8 B; 1ABW A; 3QJE A; 3VRE B; 2GL3 A; 2GRZ A; 2AUP A; 1ECD A; 1IOP A; 4HHB A; 4MAX A; 1BZ6 A; 4NXA A; 1CG8 A; 3VRE A; 1F65 A; 1DWR A; 1NGK A; 4PQB A; 5JDO C; 3PT7 B; 1LTW A; 2ZSY A; 5CNB A; 2V1H A; 2D2M D; 1GZX B; 1EW6 A; 4KN3 A; 4XS0 B; 3A2G A; 2W72 B; 2BNL A; 3PT7 A; 2MGC A; 7HBI A; 1BAB B; 5IKS A; 4MQH B; 105M A; 2Z85 A; 1G09 A; 1DXV B; 1GZX A; 1PMB A; 2FAM A; 3KMF C; 1EWA A; 4XS0 A; 2IG3 A; 1PBX B; 2Z6S A; 5CN4 A; 1W92 A; 2W72 A; 1BAB A; 5CHQ A; 1IDR A; 4MQH A; 1FSL A; 1DXV A; 3QJB B; 5CNG A; 5CNF A; 2MYD A; 4VHB A; 3AQ9 A; 3DUT B; 1JWN A; 1Y5F B; 1JZM A; 2MYC A; 1FSX B; 1PBX A; 5B84 A; 1HAB B; 1BZR A; 1FCS A; 2O5T X; 5CN6 A; 3HYU A; 1T1N A; 2NSR A; 1JW8 A; 3QJB A; 2GTL C; 3UHQ A; 3K8B B; 4TWU A; 3DUT A; 1CH3 A; 3WCW C; 1Y5F A; 1A4F B; 1HAB A; 1CO9 A; 1CH2 A; 1YMC A; 3RGK A; 1JL7 A; 1MLH A; 1Y22 B; 2GNV A; 2ZT0 A; 3NL7 B; 1MLN A; 5JDO F; 5KKK A; 1WVP A; 3K8B A; 1MWD A; 1VWT B; 3AG0 A; 4KMV A; 2D6C A; 1A4F A; 1BZP A; 1JL6 A; 1CPW A; 4NS2 A; 1CQX A; 103M A; 1Y22 A; 3ZJH A; 1JPB A; 1THB B; 3NL7 A; 4M4B A; 1Y2Z B; 1LFL B; 1VWT A; 4B3W A; 3QQR A; 1DXU A; 1BVC A; 1XY0 B; 1DTM A; 1YCB A; 4AVD A; 2IN4 A; 1THB A; 1FDH A; 1XZV B; 4FWY A; 1Y7Z B; 4G1B A; 3GKV B; 1Y2Z A; 1LFL A; 2H8D B; 5EV5 A; 1J40 B; 1XY0 A; 1LUE A; 5B85 A; 1EMY A; 1SDK B; 3LR7 A; 1MOC A; 1GBU A; 1ECO A; 5F2A A; 1CQ2 A; 1XZV A; 1Y7Z A; 3GKV A; 2W72 C; 2H8D A; 106M A; 2R4W A; 1M6C A; 1A6G A; 3B75 B; 4FWZ A; 1J40 A; 1YOH A; 2W6Y A; 1SDK A; 3UHW A; 2LH6 A; 1M9P B; 1LH2 A; 3ZJI A; 3QM8 A; 3B75 A; 3G52 A; 3NG6 B; 3R5I B; 5HLU A; 1HBH B; 1MTK A; 2B7H B; 1YDZ B; 1Y4V B; 3GK9 A; 3A0G B; 4ILZ A; 1O1O A; 5AB8 A; 1M9P A; 1O1P B; 3O7N A; 2D2N D; 3NG6 A; 3R5I A; 2MGJ A; 3UHV A; 2VHB A; 2G0S A; 1A6K A; 1QSH B; 1UT0 A; 3HF4 B; 1YDZ A; 1Y4V A; 2NX0 A; 3A0G A; 1IWH A; 4HRR B; 1O1P A; 2FRJ X; 3VRF B; 1Y4Q B; 1XZ2 B; 3WCT B; 1YH9 B; 1MYI A; 3EDA A; 1QSH A; 2KSC A; 2ZS0 A; 4HRR A; 2ZLU A; 1Y4Q A; 3LQD B; 1Y4R B; 4WJG 1; 1XZ2 A; 1DO4 A; 1JP8 A; 2ZFO A; 3WCT A; 2XKI A; 1YH9 A; 2VEB A; 1O1M B; 2VEE A; 1COH B; 1LH3 A; 3PI4 A; 2FRF A; 4MPM A; 4NI0 B; 1Y4R A; 3EDB A; 5ILE A; 2AV0 A; 1G9V B; 3GQP B; 3PT8 A; 1O1M A; 3H58 A; 1COH A; 1DWT A; 5MBN A; 2ZSO A; 1S5X A; 5KER B; 1Y8H A; 2MGA A; 3LHB A; 4NI0 A; 1V07 A; 1Y0W B; 1LH5 A; 3UHX A; 1Y8I B; 2ZSZ A; 2ZT1 A; 1G9V A; 2MGF A; 1YEU B; 4U8U B; 2D5Z B; 1A0U B; 1H1X A; 1RTE A; 2BMM A; 4H07 A; 5KER A; 2O5M X; 1Y0W A; 1J7S B; 1Y8I A; 1YEU A; 4U8U A; 1A0U A; 3G4Q A; 1RQ4 B; 3BA2 A; 4L2M A; 2NRM A; 2BWH A; 3WCV D; 3QM5 A; 1UFP A; 4DWU A; 2VLZ A; 3BJ2 B; 3O89 A; 4IRO B; 4KMW A; 1DUO A; 1HGC B; 1GVH A; 110M A; 1RQ4 A; 2XKH A; 1HGB B; 1Y4B B; 1LA6 B; 2MGM A; 1CO8 A; 3ARL A; 4HBI A; 2QRW A; 2H8F A; 1WLA A; 3BJ2 A; 4IRO A; 1HGC A; 1NZ4 A; 1WMU B; 1YE0 B; 1VXF A; 1ITH A; 1HGB A; 3WCT C; 3AT6 B; 4ROL B; 4H2L B; 1OJ6 A; 2QLS B; 1WMU A; 2GKN A; 3KUN A; 1OFJ A; 1YG5 B; 3ODQ B; 3AT6 A; 1MBC A; 4ROL A; 1MYZ A; 4H2L A; 1VXA A; 3S1I A; 101M A; 2QLS A; 4FWX A; 4MBA A; 4MQG B; 3ODQ A; 1S69 A; 3QJD B; 2HHB B; 4PQC A; 1Y7G B; 2HBD B; 5EOH A; 1HBS B; 2MGB A; 1YHU B; 3CY5 B; 2V1F A; 2BLH A; 2ZWJ A; 3OZU A; 1Y85 B; 1A01 B; 4MQG A; 1MLM A; 4U8U C; 3S48 C; 3QJD A; 2HHB A; 1Y7G A; 2HBD A; 3IC0 B; 1HBS A; 2M6Z B; 1XZ7 B; 1YHU A; 3A5A A; 3D1A B; 3CY5 A; 1AJ9 B; 1TU9 A; 1HHO B; 2G12 A; 2ZSP A; 2HHE A; 2ZLV B; 1EBT A; 2NRL A; 3UHK A; 4MXK A; 2LHB A; 2QU0 B; 1HLB A; 2ZS1 D; 1XYE B; 3IC0 A; 2M6Z A; 1XZ7 A; 3D1A A; 2GTL D; 1NIH A; 1AJ9 A; 1HHO A; 2XYK A; 2WTH A; 2ZLV A; 1DUK A; 1NZ5 A; 2O5Q X; 2VM0 A; 2G0X A; 2QU0 A; 3ASE A; 1RTX A; 1XYE A; 1Y4P B; 5EYS A; 3BJ3 B; 3W4U B; 1MLS A; 3ARK A; 2ZT3 A; 6HBI A; 1G0B B; 2MGL A; 2C0K A; 1A9W E; 4X0L B; 1MOD A; 2VLX A; 3BJ3 A; 1YE2 B; 3W4U A; 1QXD B; 1C7C B; 2AA1 B; 1JZL A; 3D7O B; 5C6Y A; 3NFE B; 1G0B A; 4X0L A; 3MJU B; 1YE2 A; 1HRM A; 2QSS B; 1QXD A; 1C7C A; 4AVE A; 3D4X B; 2AA1 A; 2R4Y A; 4TYX A; 3NMM B; 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1ECA A; 3H57 A; 3UH5 A; 1MLQ A; 1GJN A; 2D2M A; 4N7O B; 1KFR A; 3U3E A; 1VHB A; 4ODC B; 4L7Y B; 1KD2 B; 5CN7 A; 1GDK A; 1GDJ A; 1MTJ A; 1RVW A; 5EUI B; 1V75 B; 4G51 B; 5SW7 B; 3WCU D; 2Z8A A; 4MQK B; 1MBI A; 1A6M A; 1JEB B; 2EB9 A; 4IT8 A; 5D5R A; 4N7O A; 3UHG A; 1NPF A; 4L7Y A; 1KD2 A; 4ODC A; 2V1I A; 1OR6 A; 3VHB A; 3ZJP A; 1IT2 A; 5EUI A; 1V75 A; 4G51 A; 2QFK A; 2ZT4 A; 1JEB A; 1AJH A; 2MGG A; 4O2G A; 4YU4 B; 1DTI A; 4ESA B; 4YU3 B; 5EE4 C; 1BBB B; 2ZLX B; 3ZOM A; 1N9H A; 4M4A B; 2ZS0 D; 1K1K B; 3IXF A; 1CIK A; 4ESA A; 4YU3 A; 4HSW A; 1MBA A; 1S0H B; 2ZFO D; 1BBB A; 4F6G A; 3UGZ A; 1UC3 A; 4MQI B; 4M4A A; 3CIU B; 1K1K A; 3AQ5 A; 1XZU B; 1IT3 A; 2D60 B; 1MYM A; 1RQ3 B; 1Y0D B; 1MNJ A; 2Z6T A; 3G4U A; 1MWC A; 1H97 A; 1YEV B; 1S0H A; 1TES A; 1HLM A; 1OUT B; 3CIU A; 5HY8 B; 1HBH A; 4JYQ A; 3A9M A; 1RQ3 A; 1Y0D A; 2B7H A; 1MGN A; 1MLU A; 1YEV A; 1A3N B; 2D2M C; 3LB3 A; 3P5Q B; 4F6J A; 1OUT A; 4O4T A; 1XXT B; 1SI4 B; 5HY8 A; 2G0R A; 1Y0T B; 2PGH B; 2MYB A; 1F5P A; 3HF4 A; 3A5G A; 1A3N A; 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