The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Crystal structures of manganese- and cobalt-substituted myoglobin in complex with NO and nitrite reveal unusual ligand conformations.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
60
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3LR7 A; 5JDO E; 3UHX A; 2MGC A; 3M3A A; 3ECL A; 2HBF A; 5EYS A; 1HV4 A; 3WFU A; 1WMU A; 2R80 B; 2GTL D; 2RI4 B; 4F6J A; 1HGA A; 2AA1 A; 1MBN A; 1HGC A; 1NS9 B; 1JWN A; 2VYY A; 2W72 B; 4FC3 A; 1GBV B; 2ZS1 B; 1B86 A; 5AB8 A; 5HAV A; 2FRF A; 4N7P A; 1O1K A; 2HBD B; 1Y4R A; 1A01 B; 1YOH A; 2JHO A; 2HHB B; 2QFK A; 3PIA B; 4MBN A; 1Y83 B; 4FC3 B; 4DWU A; 1YEV A; 1IRD B; 3HF4 B; 1MBS A; 3BJ2 B; 1JP9 A; 4PQC A; 1YVQ B; 5HY8 A; 3P5Q A; 1JP8 A; 1TES A; 2LH7 A; 5F2A A; 4UZV A; 1RQ4 A; 1A6N A; 4HRR B; 2HHE A; 5EET A; 4MQH A; 7HBI A; 1DM1 A; 1MYZ A; 4F6B A; 1SI4 A; 3VRE A; 1LFY A; 1NXF A; 1SDL B; 1HGB B; 3BCQ A; 3R5I B; 1Y0W B; 2V1G A; 4F6G A; 1GCV A; 2EB9 A; 2D2N A; 1BZ0 B; 3FH9 A; 1JL6 A; 3HEP A; 1NIH A; 1A6K A; 3AQ9 A; 4ROL A; 2FRK X; 1BVD A; 2MB5 A; 2OH9 A; 4KN3 A; 1LFT A; 3K9Z A; 2VLX A; 1OBM A; 1LFL B; 1V4U B; 3OO5 A; 4HRT B; 3VHB A; 4L7Y B; 104M A; 2MGM A; 3D17 B; 4WJG A; 1JF4 A; 4X0L B; 1HBA A; 2MYA A; 2O5M X; 1DO4 A; 1DTI A; 3D1K A; 3ZJQ A; 1MLQ A; 1EW6 A; 1UIW B; 1RVW A; 1LA6 A; 3UBV A; 1OFK A; 1CP5 A; 1JF3 A; 1Y4V A; 4G1V A; 1H1X A; 3PT7 A; 1DXC A; 1U7S A; 1UVY A; 2GTL B; 2ZLU A; 2MYB A; 1DUO A; 1DWR A; 2NRL A; 1HBR A; 2VYZ A; 1O1L A; 2H8F B; 1YGF A; 108M A; 5ILE A; 1YG5 A; 3QJD B; 1MNH A; 5HU6 A; 1LHS A; 1DLY A; 3HXN B; 3QJE A; 3LB3 A; 2NSR A; 1Y85 B; 1FSX A; 2D5X B; 1VWT A; 2GL3 A; 3UH6 A; 3WI8 A; 1K1K B; 2Z8A A; 1J3Y B; 1T1N A; 3PI4 A; 3HEN A; 3WCV A; 2Z6N A; 1A3N B; 2RAO B; 3OVU C; 3DR9 A; 1Y5K B; 1XCH A; 1XY0 A; 1MYT A; 4MXK A; 5JDO F; 3NMM A; 4YU4 A; 1GDL A; 4F4O A; 1YHE A; 3BJ1 A; 3VRG A; 2GLN A; 1BBB A; 1SPE A; 3UH5 A; 111M A; 1COH B; 1M6M A; 3M3B A; 3KUO A; 1JZK A; 2G0R A; 1Y45 B; 1NS6 B; 1UFJ A; 1V4X A; 5JDO D; 5CNC A; 2HZ1 A; 1MLN A; 3ZJO A; 1G0A B; 3S66 A; 1SPG B; 2G14 A; 5E6E B; 1Y4P A; 4ZVB A; 1DXT A; 3WHM B; 3ZOM A; 3NL7 B; 1FLP A; 1YHU C; 3PI1 A; 1Y7C A; 2MYD A; 1A0Z A; 1URY A; 2DHB B; 1IBE B; 3UHY A; 1HBH B; 3NFE B; 1UC3 A; 1YVT B; 2BLI A; 2D2M C; 3OK5 A; 1MTJ A; 1MWC A; 3NG6 B; 1HSY A; 1YZI B; 1OUT B; 2ZSR A; 3OZW A; 1XZV B; 2R4W A; 1WVP A; 1QXE B; 1CIK A; 1MYI A; 2EB8 A; 2HHD A; 1YOG A; 3UHH A; 3E4N A; 1VXD A; 5KDQ B; 1X9F C; 1OJ6 A; 1S6A A; 3EOK A; 2DXM A; 1PBX B; 1IT2 A; 1KD2 B; 4NZI A; 3ARJ A; 4M4B B; 2Z6T A; 1O1J A; 4XS0 A; 1GDI A; 1LFZ B; 1YE2 A; 1CBM A; 4LPI A; 5EUI A; 1GZX B; 1LUE A; 2G0V A; 1CH3 A; 1CLS A; 1BZ1 A; 3ZHW A; 3OGB A; 1O1N A; 1MLU A; 3IC2 B; 2W6V B; 1V75 B; 1BZZ A; 4PQB A; 1YDZ B; 1XZ4 B; 1MOB A; 1O1M B; 2ZFO A; 5D5R A; 3RGK A; 1RQA A; 1BUW A; 1MYM A; 4H2L A; 3DHT B; 3M38 A; 5MBN A; 1C7C A; 1Y46 A; 2VYW A; 2R1H B; 1HBS A; 5HLQ A; 3GOU B; 3ONZ A; 4O4Z A; 1WLA A; 102M A; 1LFQ A; 1Y5F A; 1C7D B; 1MOD A; 1IRC A; 3D7O B; 1YCB A; 1RQ3 B; 2W72 C; 3OZV A; 2ZS1 C; 3AT5 B; 1Y4G B; 1OR4 A; 1R1X A; 5CN6 A; 1JP6 A; 2GDM A; 1O1I A; 3TM3 A; 2AUQ A; 1YFF A; 1MZ0 A; 1MLK A; 1O1P A; 3S65 A; 2H35 A; 5ILP A; 2QSS B; 3G53 A; 1F5P A; 5KER A; 3GKV B; 1VXA A; 3G46 A; 5E83 A; 1A3O A; 1MBA A; 2QLS A; 2QSP A; 1CMY A; 2BLJ M; 2ZST A; 2QU0 B; 3UHV A; 3MJP A; 4NI1 B; 4IRO A; 3H58 A; 1MNI A; 2Z6S A; 2ZSX A; 4MQI A; 3K3U A; 1A0U B; 3GQG B; 1VXC A; 1Y8K A; 3ODQ B; 1CH9 A; 5C6E B; 4VHB A; 3U3E A; 5D1V A; 1DUK A; 3PI8 B; 1AJ9 B; 3QJB B; 5CN8 A; 1XZ7 A; 1EBT A; 1MNO A; 4M4A B; 2FAM A; 2GRH A; 1FHJ A; 1Y35 B; 2V1I A; 1FSL A; 4HHB A; 4ROM B; 1YH9 B; 2ZLV B; 3EDB A; 1VXG A; 1YHU B; 4ODC B; 2CMM A; 2HBS A; 1Y8I A; 2VLY A; 1LH2 A; 1BVC A; 109M A; 3DHR B; 5CHR A; 1A4F A; 1Y2Z B; 3AT6 A; 2C0K A; 2M6Z A; 3SDN A; 2NRM A; 2D2M B; 3UHB A; 1Z8U B; 4B4Y A; 1Y7D B; 1YOI A; 1DWS A; 2GTL C; 1MKO B; 3H57 A; 1Y8W B; 1S5X B; 2SPM A; 3PI2 A; 1A00 B; 1Y0T A; 3TM9 A; 4PQ6 A; 3WCT A; 1M9P B; 3ZJR A; 1R1Y B; 2DN1 B; 1YIH A; 5CNE A; 3WR1 A; 2R4Z A; 1Y4Q A; 3M39 A; 1QSI A; 1Y4B B; 1XYE A; 4AVE A; 1Y0D B; 1FAW B; 1XZU A; 1DWT A; 1PMB A; 1RTE A; 1UFP A; 4N7O A; 3SDH A; 1Y22 B; 1HBB B; 3A5A A; 1Y09 B; 2ZS0 A; 3BA2 A; 1EMY A; 3ZJL A; 3ARL A; 1CBL A; 4MQK A; 1MTI A; 1XQ5 B; 1JPB A; 2MGB A; 2HBG A; 2MGF A; 4N7O B; 4F6D A; 2O5L X; 2YRS B; 4TYX A; 1J7S B; 5EV5 A; 1JEB B; 1BIJ B; 1NEJ B; 4MBA A; 1QI8 A; 1SDK A; 1Y0A A; 2D2N D; 3WFT A; 4GZG A; 3UHN A; 5M3S A; 1CH7 A; 3D4X A; 5JGG B; 3A5G A; 1AZI A; 1LJW A; 2G10 A; 4F68 A; 3DUT A; 1V4W A; 1ABY B; 2HCO B; 3LQD A; 3B75 A; 2H8D B; 1OUU A; 3ZOL A; 3LHB A; 2O5B X; 2HBE A; 4MXL A; 2EVK A; 1YMA A; 3FS4 A; 1CG5 B; 4QAU A; 1HHO A; 4O1T A; 1BJE A; 2ZLW B; 1HDA B; 2AV0 A; 3ZH0 A; 1MYH A; 1JL7 A; 3V2Z A; 2HBF B; 1YGD A; 3K8B A; 1HV4 B; 1NWI A; 1J7Y A; 1CQX A; 1WMU B; 1HLB A; 1HGA B; 2AA1 B; 4MU5 A; 1HGC B; 1THB A; 1B86 B; 1SWM A; 3MJU A; 4N7P B; 3W4U A; 1O1K B; 3IXF A; 1Y4R B; 2SPL A; 1J7W A; 3HHB A; 3AQ6 A; 3A5B A; 2MGJ A; 1YEV B; 2OHB A; 3EU1 A; 5HY8 B; 3P5Q B; 3A59 A; 1RPS A; 2VHB A; 1HRM A; 1GLI A; 3WCV D; 4DC7 A; 3MN0 A; 2D5Z A; 1RQ4 B; 2HHE B; 3WCW D; 4UIQ A; 2MGK A; 3UHG A; 1MNK A; 3MYM A; 4MQH B; 3OZU A; 3QM6 A; 3AQ5 A; 1SI4 B; 3S1I A; 3VRE B; 1LFY B; 3BCQ B; 1GCV B; 5CMV A; 3G4V A; 2D2N B; 3FH9 B; 4MQC A; 2VM0 A; 1NIH B; 1YEQ A; 1QSH A; 3AQ8 A; 4ROL B; 1MLH A; 3BOM A; 5JDO C; 3QZX A; 1A9W E; 6HBI A; 1F63 A; 1EWA A; 1LFT B; 3OO5 B; 2BKM A; 2O5S X; 2ZLX A; 1DXU A; 2O5O X; 2QMB A; 5JOM A; 5CN4 A; 1HBA B; 4UUR A; 1AJG A; 2R50 A; 2MYC A; 3D1K B; 1MLF A; 1C7B A; 1RVW B; 1LA6 B; 1LH7 A; 1Y7G A; 1Y4V B; 3PT7 B; 3GK9 A; 1J3F A; 1G0B A; 2BNL A; 4JYQ A; 1IWH A; 2OIF A; 2ZLU B; 2SPN A; 2W6W A; 1G08 A; 1HBR B; 1Y7Z A; 1NPG A; 1O1L B; 1YGF B; 2PEG A; 2V1F A; 1YG5 B; 5HU6 B; 1RSE A; 3QJE B; 1F65 A; 2G0Z A; 3ED9 A; 1GJN A; 1FSX B; 2OHA A; 1VWT B; 1IDR A; 3WCW A; 2G11 A; 1CH1 A; 3SZK A; 3G4W A; 1T1N B; 1K0Y A; 5AZR A; 2IG3 A; 2ZSQ A; 2Z6N B; 3WCV B; 3MKB A; 1VRE A; 1XY0 B; 6HBW A; 1HDS A; 3CIU A; 3A2G A; 3NMM B; 4YU4 B; 1YE0 A; 1S5Y A; 4MQJ A; 4F4O B; 1YHE B; 2DN3 A; 3BJ1 B; 3VRG B; 1BBB B; 5EYJ A; 3D1A A; 1DKE A; 4FWX A; 3AG0 A; 1JY7 A; 3UHD A; 2B7H A; 5EE4 D; 1Y8H A; 1QXD A; 1S0H A; 4YU3 A; 4G1B A; 3KMF A; 4L2M A; 2B7H B; 1V4X B; 1U7R A; 3ZJM A; 1C40 A; 1FCS A; 3UHT A; 2HZ2 A; 2ZFO D; 1J3Z A; 3S66 B; 3PI3 A; 1CG8 A; 3HRW A; 1Y4P B; 4NI0 A; 1M6C A; 1DXT B; 1FDH G; 4XDI A; 3PEL A; 1G09 A; 4F6I A; 1Y7C B; 3IC0 A; 1A0Z B; 2MBW A; 5C6Y A; 1TU9 A; 1MYJ A; 1NQP A; 3UHU A; 1ABW A; 3TLD A; 1L2K A; 2OLP A; 1DO1 A; 5E29 A; 2D60 A; 1MOH A; 1JZL A; 1HAC A; 1GCW A; 1VXF A; 1LH1 A; 1Y31 A; 2V1H A; 3WCT C; 2PGH A; 4NK1 A; 3HYU A; 1HDB A; 2HHD B; 3UHR A; 3GQP A; 1UX9 A; 3QJC A; 3EOK B; 2DC3 A; 2DXM B; 1O16 A; 1NPF A; 5CN9 A; 3A0G A; 1MLS A; 2ZSZ A; 2ZWJ A; 103M A; 101M A; 3WCP A; 1O1J B; 3WFW A; 4MPM A; 4XS0 B; 5EU2 A; 1YE2 B; 4SDH A; 1GDJ A; 5EUI B; 2LH6 A; 3QM5 A; 5KKK A; 2MGD A; 4N8T A; 5HLX A; 1CLS B; 1BZ1 B; 3G52 A; 1O1N B; 3ECX A; 3QMA A; 1JW8 A; 2EKT A; 3VRF A; 1J41 A; 1BZZ B; 3GYS A; 2ZFO B; 3GQR A; 1RQA B; 1URV A; 1BUW B; 2V1E A; 4H0B A; 4H2L B; 1YHR A; 1C7C B; 1Y46 B; 1HBS B; 1QPW A; 3ONZ B; 1LFQ B; 1Y5F B; 1YEU A; 3UI0 A; 3QM8 A; 3WCU D; 4F6F A; 3UGZ A; 3WTG A; 106M A; 1BAB A; 3LB4 A; 2VEB A; 5CN7 A; 3PT8 A; 1R1X B; 1UVX A; 1MWD A; 5EOH A; 3WCT D; 1O1I B; 1YFF B; 3GLN A; 1O1P B; 3S65 B; 1YEO A; 2OH8 A; 3QM7 A; 2H35 B; 1LH6 A; 5CHQ A; 3GDJ A; 2KSC A; 5B85 A; 5KER B; 3PI9 A; 5E83 B; 4O35 A; 1A3O B; 1A9W A; 2QLS B; 2QSP B; 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2D6C A; 1MBD A; 3LB1 A; 3D4X B; 1Y0C A; 1CH5 A; 3UGY A; 1RTX A; 3O89 A; 1LJW B; 3ORD A; 2R4Y A; 3RJ6 A; 3DUT B; 1V4W B; 3LQD B; 3B75 B; 1OUU B; 2HBE B; 2R80 A; 2RI4 A; 3FS4 B; 4WJG 1; 5F0B A; 1I3D A; 1NS9 A; 2W72 A; 1HHO B; 2GKM A; 1MLR A; 1GBV A; 2ZS1 A; 4FWZ A; 4ILZ A; 2HBD A; 1A01 A; 3MYN A; 2HHB A; 4F69 A; 3PIA A; 1YGD B; 1Y83 A; 2FAL A; 2GRF A; 3K8B B; 2BK9 A; 1ECD A; 1J7Y B; 1IRD A; 3HF4 A; 3BJ2 A; 1YVQ A; 1UX8 A; 1THB B; 2ZT2 A; 1V07 A; 3QM9 A; 1MNJ A; 3MJU B; 3G4R A; 4HRR A; 3W4U B; 1CO8 A; 1CPW A; 3HEO A; 1J7W B; 3HHB B; 1SDL A; 5CN5 A; 1HGB A; 3UHK A; 3R5I A; 1Y0W A; 2XKG A; 3LB2 A; 5CNG A; 2E2Y A; 1BZ0 A; 4ZVA A; 3EU1 B; 4KMW A; 3A59 B; 1RPS B; 1BIN A; 1GLI B; 2D5Z B; 2ZSN A; 2LH1 A; 1LFL A; 1V4U A; 4HRT A; 2MYE A; 1UT0 A; 5IKS A; 4L7Y A; 5EE4 C; 2BW9 M; 3D17 A; 4X0L A; 4MQC B; 1YMC A; 2G0S A; 3KUN A; 1YEQ B; 1UIW A; 2EKU A; 1QSH B; 2O5Q X; 3BOM B; 2WTH A; 3MOU A; 3UHW A; 2ZFO C; 3QZZ A; 1LH3 A; 2MGL A; 2VEE A; 2GTL A; 2ZLX B; 2BMM A; 4TWU A; 1DXU B; 3AQ7 A; 2QMB B; 3UH7 A; 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