The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
137
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structure length |
136
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Chain Sequence |
GFKQDIATIRGDLRTYAQDIFLAFLNKYPDERRYFKNYVGKSDQELKSMAKFGDHTEKVFNLMMEVADRATDCVPLASDANTLVDKQHSSLTTGNFEKLFVALVEYMRASGQSFDSQSWDRFGKNLVSALSSAGMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| molecule keywords |
Dehaloperoxidase A
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| publication title |
Mutation of Methionine-86 in Dehaloperoxidase-hemoglobin: Effects of the Asp-His-Fe Triad in a 3/3 Globin
rcsb |
| source organism |
Amphitrite ornata
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| total genus |
57
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| structure length |
136
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| sequence length |
137
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-05-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YHU D; 1GDJ A; 5E29 A; 3ARJ A; 1Y5K A; 3ED9 A; 1Y4P B; 1LFT A; 1YDZ B; 1G9V B; 1JY7 A; 1MBC A; 2ZT4 A; 1O1M A; 4C0N A; 3M38 A; 1FDH A; 1DKE B; 4ODC A; 1HBG A; 1YE0 B; 2B7H B; 2MYE A; 4AVE A; 2GRZ A; 3UHQ A; 1X9F D; 4N7P B; 3BJ1 B; 1KFR A; 1MNI A; 4FH6 A; 4UIQ A; 3WFW A; 1Y31 B; 1MLS A; 4MU5 A; 3ZH0 A; 1A01 B; 1YCA A; 1C7D A; 1J52 A; 1H97 A; 1LA6 A; 3S66 A; 1A00 A; 1FSX B; 1XQ5 A; 1Y7Z A; 1J3Z B; 2BLH A; 3IC2 B; 1O1P B; 1EWA A; 1RQA A; 2MBW A; 4NI0 B; 1UC3 A; 1PBX A; 1MLK A; 2MGM A; 1H1X A; 1QSI B; 1Y5J B; 3LB1 A; 1HDB B; 1OJ6 A; 1IT2 A; 2NSS A; 2V1J A; 2D5Z A; 4O1T A; 1QSH A; 1HAC A; 5E83 B; 1XY0 B; 4F6G A; 2QU0 B; 1QI8 B; 1YMA A; 2Z6N A; 1HLM A; 1Y7G B; 2O58 X; 2PEG A; 3ZJI A; 2BWH A; 1GCV B; 5CND A; 1YH9 A; 1BZZ A; 2VM0 A; 2DN3 A; 3QM8 A; 1Y85 B; 2OHA A; 3OZW A; 1GVH A; 4G1V A; 5EET A; 3CIU A; 3PIA B; 1EMY A; 1XZ4 B; 2GNV A; 3HHB B; 2RI4 A; 1WLA A; 1HGB A; 4HHB A; 3SDH A; 106M A; 1BAB A; 3ECZ A; 1GBU A; 1BBB B; 5CN7 A; 1SWM A; 1S5Y B; 1NZ5 A; 1CBM A; 3WCW A; 3QM9 A; 5CN4 A; 1HSY A; 1NWI A; 3ODQ B; 1HBH A; 4MQH A; 5HBI A; 3UHH A; 2M6Z A; 2VHB A; 2LH1 A; 3D17 A; 3RGK A; 4JYQ A; 1ABS A; 1JP9 A; 2FAL A; 2ZS0 A; 2SPM A; 2MGL A; 1YEO B; 1O16 A; 3PI2 A; 5JDO C; 2R4X A; 1S56 A; 2W72 B; 4ZVA A; 4H0B A; 1V4X B; 1Y22 B; 1B86 A; 1J7W B; 5MBN A; 1J41 A; 2LH2 A; 4F4O B; 5CHR A; 2SPN A; 5HLX A; 4MQK A; 1FDH G; 3DHT A; 3ZJR A; 2MGD A; 1T1N B; 1BUW A; 4L7Y A; 3HYU B; 1Y5F A; 5KER B; 2HZ1 A; 4MQI A; 1I3E A; 5F2A A; 3AT6 B; 1YHU A; 3A59 A; 5HU6 B; 1YIE B; 3OO4 A; 2DC3 A; 1EBC A; 3UHT A; 3E5O A; 2ZLV A; 1NIH A; 4TWV A; 1ECO A; 1O1L A; 1N9F A; 4HRT A; 1Y2Z A; 2HBC B; 4U8U A; 3QQQ A; 3WFT A; 1ECN A; 2R50 A; 1LH1 A; 1Y4G B; 1J40 A; 1X9F A; 1NZ2 A; 5CNG A; 1YGD A; 4G51 B; 1AJH A; 5CMV A; 1C7C B; 2ZLW A; 1MOH A; 5JGG A; 1HGA B; 2HBD A; 4JAC A; 1LFV B; 5D1V A; 1HDA A; 2XKI A; 1C40 A; 3D4X B; 3K9Z A; 3D1K A; 2MHB A; 2GKM A; 2H35 A; 1CLS B; 3UHV A; 4C44 A; 3R0G A; 1LFY A; 2ZFO D; 4H2L A; 4MQG A; 1MLR A; 1JDO A; 2MGB A; 1TU9 A; 3GLN A; 1CG5 A; 1VXB A; 2QSP B; 2D5X A; 1S0H B; 1HDS A; 1XZ7 A; 1OR6 A; 3G4R A; 1GZX A; 1QXD B; 2ZLU B; 1SI4 A; 2AV0 A; 2AUO A; 4MQJ B; 3QZZ A; 1LH5 A; 2ZSP A; 1Y01 B; 3BOM B; 4FWX A; 4FWY A; 1SHR A; 5HAV A; 1XZ2 B; 2QMB B; 1HAB A; 1CQ2 A; 5AB8 A; 4MAX A; 3QJD A; 3WHM B; 1YZI A; 3PI8 A; 3ZJP A; 2HBE A; 2DHB A; 5CN5 A; 3WCT B; 2VYY A; 2BNL A; 2ZT3 A; 1G08 B; 1Y45 B; 1A0U B; 1IT3 A; 2DN1 B; 105M A; 1BVC A; 4B4Y A; 1Y0C B; 1A6K A; 3LQD A; 4N8T A; 2H8F A; 1UX9 A; 1GLI A; 1DXV A; 5EUI A; 1N9H A; 4F6F A; 4MBA A; 110M A; 1N9I A; 1XZV B; 1R1X B; 4OOD A; 3M39 A; 1A4F B; 2OIF A; 2QFN A; 1SDK A; 2ZS1 B; 3GOU B; 2MGH A; 3A5A A; 1YVT A; 3K8B B; 2Z85 A; 1Y8I B; 1BZ1 B; 2G10 A; 3GQP A; 3HEO A; 1CH3 A; 2W31 A; 4MXL A; 2SPO A; 1SPG A; 1YEV B; 2EKU A; 1AJ9 A; 1QPW B; 1SPE A; 1DUO A; 2QRW A; 1QXE A; 2ZWJ A; 2HHD B; 3VRF A; 3WCU A; 1CIO A; 1LH3 A; 3TM3 A; 3UHC A; 1HBB A; 1VXF A; 1JW8 A; 3WTG B; 3OVU C; 1YOG A; 2V1H A; 1RQ3 A; 3UHZ A; 2AUR A; 1YIH B; 1NZ3 A; 1ABY B; 3PEL A; 3EOK B; 2D2N C; 3E55 A; 3NL7 B; 4YU3 A; 1O1J A; 1JL6 A; 4B3W A; 4M4B A; 3PT8 B; 1R1Y B; 2HZ3 A; 2YRS A; 7HBI A; 3QJB B; 2MYC A; 2ZLX B; 3NMM A; 3AG0 A; 2MGE A; 5EE4 C; 1YEQ A; 1NEJ A; 2H8D B; 1Y8H A; 2O5B X; 4DWT A; 1RVW B; 1YHE B; 1J7S A; 3WFX A; 2NRM A; 1NS9 A; 3WCV A; 1HGC A; 1Y83 B; 4ROM A; 2ZT1 A; 4FC3 B; 1COH A; 1LH7 A; 3ORD A; 1MLH A; 1DXT B; 1NS6 B; 2R80 B; 2DXM B; 1VWT A; 2WTG A; 1X46 A; 1MGN A; 1YGF A; 2ZFO A; 3QJC B; 2O5O X; 3UGY A; 2BKM A; 2WTH A; 3O89 A; 5SW7 A; 1VHB A; 1A0Z B; 4XS0 B; 3AQ8 A; 4F6D A; 3BJ2 A; 1ABW B; 1CH9 A; 2LH5 A; 3OK5 A; 2R1H A; 2DN2 B; 1DO1 A; 2V1K A; 4ESA A; 2FRJ X; 4DC7 A; 2AA1 B; 1V75 A; 1X3K A; 1MLL A; 5KDQ B; 3E4N A; 5JOM A; 1O1I A; 2GTL C; 1Y0T B; 1HJT A; 1MLG A; 1MLN A; 1JF3 A; 2FRK X; 4YU4 B; 1MLJ A; 3SZK B; 3S1J A; 2ZST A; 3QQR A; 1MCY A; 3NG6 B; 2VYZ A; 1FN3 B; 1CMY A; 1Y4P A; 1LFQ A; 3M3A A; 3WCP A; 1FCS A; 2R4W A; 2ZS1 C; 5IKS A; 2NRL A; 1J3F A; 3A2G A; 3AT5 B; 1A3O A; 3DUT B; 4TYX A; 1Y0D B; 5E29 B; 3HC9 A; 1Y4V B; 1JL7 A; 1Y5K B; 3UH6 A; 4F6B A; 2AUP A; 1LFT B; 2O5L X; 2B7H A; 4NK1 A; 3NML A; 5E6E B; 3GQR A; 5EOH A; 1CH2 A; 3ZJL A; 1MOC A; 3GK9 A; 1N9X A; 4O4Z A; 1A01 A; 4VHB A; 1Y46 B; 1O1M B; 1MDN A; 1Y8K A; 1CP5 A; 1VXA A; 3D1A A; 3AQ9 A; 3ZJS A; 1J3Z A; 2G14 A; 1Y7D A; 2MGA A; 4LPI A; 4SDH A; 4NXC A; 3DR9 A; 1MNH A; 1D8U A; 3QMA A; 2GRH A; 1C7D B; 1Y09 A; 4ZVB A; 1LA6 B; 3S66 B; 1W92 A; 3AQ5 A; 1Y5J A; 3W4U B; 1XQ5 B; 3U3E A; 3RJ6 A; 1RQA B; 1M9P A; 1BIJ A; 5CN9 A; 1PBX B; 1URV A; 1Z8U B; 2ZSO A; 3PI3 A; 5KKK A; 3HF4 B; 1WMU A; 3OZU A; 1MKO A; 1THB A; 4WCH D; 3DHR B; 3BCQ B; 3MBA A; 2D5Z B; 1V07 A; 5HLU A; 5EQM A; 1GJN A; 1GBV B; 3QJE B; 1XXT A; 1JP6 A; 1DXU A; 2Z6N B; 2PEG B; 5CHQ A; 1YFF A; 3OJ1 A; 1JP8 A; 1F5P A; 3MKB A; 5EYS A; 3WCV C; 1BZZ B; 1Y7C B; 2EVP A; 2DN3 B; 2PGH A; 3MYN A; 2CMM A; 4O4T A; 1UVX A; 3WCT D; 2D2M A; 3FS4 B; 3CIU B; 1LFL A; 1HHO A; 2GNW A; 3WI8 A; 1DUK A; 4N7O B; 1G0A A; 2RI4 B; 1CO8 A; 3QZX A; 4HHB B; 1YOH A; 1XCH A; 4MQC A; 1LJW A; 3UHR A; 4NZI A; 1K0Y A; 4G1B A; 1S61 A; 1HBS A; 1LFZ A; 4BJA A; 1URY A; 1Y4B A; 2LHB A; 5B85 A; 2E2Y A; 1A9W E; 1IRC A; 1HBH B; 4MQH B; 1J7W A; 2ZS1 D; 2M6Z B; 3D17 B; 1V4U A; 1RPS B; 2ZS0 B; 2W6W A; 3UH7 A; 1S5X A; 1YMC A; 4ILZ A; 1MZ0 A; 1O1K A; 1LHS A; 5D5R A; 1SDL A; 3GDJ B; 1B86 B; 2NX0 A; 3R5I B; 1Y35 A; 1T1N A; 3HYU A; 2HBF A; 3D7O A; 3HXN A; 1J41 B; 4IRO A; 3VRE B; 1Y4R A; 1YEU B; 1BJE A; 1Q1F A; 3WFU A; 3MN0 A; 4MQK B; 1MLO A; 3DHT B; 3E5I A; 4L7Y B; 1BUW B; 3UHE A; 1Y5F B; 5F0B A; 2ZSQ A; 2ZFB A; 3ONZ B; 4MQI B; 3MJP A; 2D6C A; 1Y0W A; 107M A; 1Y4Q B; 4FWZ A; 2HBC A; 1MWC A; 1JPB A; 4WJG A; 6HBI A; 2GL3 A; 2D2N B; 1FAW B; 1DXC A; 5EYJ A; 1C7B A; 1C7C A; 5ILE A; 1JEB A; 4U8U B; 2G12 A; 3MVC A; 1HGA A; 1NGK A; 2MYD A; 2ZSZ A; 1YG5 A; 3D4X A; 4F68 A; 1YGD B; 3GYS A; 5AZQ A; 1G0B A; 2ZLW B; 2QLS A; 1Y0A A; 5JGG B; 3ZJJ A; 2HHE A; 2HBD B; 1MTI A; 1HDA B; 1C40 B; 2IG3 A; 3O7N A; 1IBE A; 3D1K B; 2QSP A; 1BZ6 A; 2H35 B; 1JWN A; 1XZU A; 1HLB A; 3GQG B; 1MBO A; 4N7N A; 1LFY B; 1QXD A; 4DWU A; 2QSS B; 4H2L B; 4MQG B; 3AQ6 A; 1LTW A; 103M A; 2KSC A; 1CG5 B; 4MQJ A; 3A5B A; 2D5X B; 1HDS B; 1XZ7 B; 3UHB A; 1MTJ A; 4HSW A; 3UHK A; 1A6N A; 1GZX B; 1VXE A; 5JDO D; 1O1N A; 1XZ5 B; 1BZR A; 2O5T X; 2HCO A; 1IDR A; 2VLZ A; 2D2M C; 1AZI A; 4OF9 A; 1HBR A; 2ZSX A; 1K1K A; 3WCW C; 3QM6 A; 2Z6T A; 1HAB B; 4IT8 A; 3WR1 A; 6HBW A; 1UIW A; 3QJD B; 1Y45 A; 3EU1 A; 2DN1 A; 2ZLT A; 2MGF A; 1FSL A; 2QFK A; 1IOP A; 1MYJ A; 1J7Y A; 2DHB B; 2ZS0 C; 2JHO A; 3P5Q A; 1YHR B; 2GTL B; 3S1I A; 1IWH A; 1M6M A; 2HHB A; 1YE2 A; 1OUU A; 1XZV A; 1R1X A; 1MNJ A; 2HBG A; 3ARK A; 3H58 A; 2D60 B; 4N8T B; 2H8F B; 1OBM A; 1B0B A; 1VXH A; 3PI9 A; 5C6E B; 1GLI B; 1A3N B; 1DXV B; 5EUI B; 4GZG A; 1MYT A; 3ZJQ A; 3IC0 A; 5ILR A; 3ZJM A; 3VRG A; 1O1O B; 1U7R A; 3K8B A; 112M A; 1HBA A; 5CN8 A; 1V4W A; 1Y8I A; 1BZ1 A; 1KD2 A; 1UMO A; 4HRR A; 3NFE A; 2OH8 A; 4F6J A; 3TM9 A; 1MYM A; 2HHD A; 1YVT B; 1YHU C; 102M A; 3SDN A; 3GQP B; 1HRM A; 1CH5 A; 2EF2 A; 1MLF A; 2G11 A; 3MJU A; 3GKV A; 4MPM A; 1AJ9 B; 1BZP A; 2GRF A; 1A9W A; 1CH4 A; 4M4A A; 3VRF B; 3WCU B; 1I3D A; 2AUQ A; 1DWR A; 3NL7 A; 3ASE A; 2HBS A; 2ZSN A; 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3UHY A; 3UHN A; 1LFQ B; 3WCP B; 1V5H A; 4N7P A; 5E6E A; 3BJ1 A; 1MYI A; 1NAZ A; 1A3O B; 1Y31 A; 1JY7 B; 3G4V A; 2D2N D; 1Y46 A; 4U8U D; 4ODC B; 1MWB A; 4PQB A; 1MNK A; 1EW6 A; 1FSX A; 3GQR B; 3UGZ A; 2OLP A; 3IC2 A; 1O1P A; 2G0X A; 4NI0 A; 4UZV A; 1BVD A; 5EE4 D; 3WCU C; 3A5G A; 1VRF A; 2EB9 A; 1MLU A; 1YMB A; 1Y8K B; 1QSI A; 1HDB A; 1A00 B; 3W4U A; 3D1A B; 1ECA A; 1Y7Z B; 2ZSR A; 1Y7D B; 2AV3 A; 3HF4 A; 3ZHW A; 1Y09 B; 2EB8 A; 5E83 A; 1XY0 A; 2QU0 A; 3ZJO A; 1QI8 A; 3UHS A; 1Y7G A; 3DHR A; 1RTE A; 3BCQ A; 1GCV A; 2VYW A; 1M9P B; 1BIJ B; 1QSH B; 3ECL A; 3G4U A; 1OFK A; 1HAC B; 1Y85 A; 1WMU B; 1GBV A; 3QJE A; 2BMM A; 1MKO B; 1THB B; 1UFP A; 3PIA A; 1YH9 B; 1XZ4 A; 3HHB A; 1Y7C A; 2LH6 A; 2Z8A A; 2FRF A; 1BBB A; 1UVY A; 1XXT B; 3FS4 A; 2IN4 A; 1MYF A; 1MYH A; 1DXU B; 4DC8 A; 1DLY A; 1S5Y A; 3MOU A; 1YFF B; 3MKB B; 4KMV A; 4N7O A; 5CNF A; 1JZM A; 3VHB A; 1HGB B; 3ODQ A; 2ZFO C; 3ARL A; 2PGH B; 1BAB B; 1GBU B; 4HSX A; 3UI0 A; 2D2M B; 2GTL D; 2SPL A; 3WCW B; 1U7S A; 1LFL B; 1HHO B; 3PI1 A; 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