The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| publication title |
The Stereochemistry of the Protein Myoglobin
pubmed rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
61
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1973-04-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1J7W A; 3ZJP A; 1DLW A; 4F4O B; 3UHK A; 5SW7 B; 3ZJJ A; 1LH1 A; 1A0U B; 4MQK A; 4NI0 B; 1Y45 A; 1O1I B; 2Z6S A; 3MN0 A; 3ZJH A; 1YEN A; 1GCV B; 3MJP A; 3LQD B; 3AG0 A; 1HAC A; 1MNO A; 1Y4B B; 3CIU A; 3MOU A; 3ONZ B; 1XZU A; 3WCU A; 1Y35 B; 1B0B A; 1CBM A; 1LH3 A; 1O1P B; 3D1A B; 4G51 B; 1MLG A; 1WMU A; 2RAO A; 5EOH A; 3DHR A; 2D5Z B; 1FLP A; 1FSL A; 2O5S X; 2VEE A; 3NG6 A; 1MOH A; 1LH7 A; 2SPM A; 1MWC A; 2M6Z B; 1F5P A; 4PNJ A; 1GJN A; 1XXT A; 5C6E B; 1M9P A; 3ZJS A; 4DC8 A; 3ECL A; 2ZT0 A; 1YE0 B; 3WCW C; 4F6D A; 1Y09 A; 1YEO A; 1Y0D B; 2AA1 A; 3DHT B; 2ZFB A; 2HHE A; 4FC3 B; 3PI9 B; 1ABY B; 1JEB A; 1VXG A; 3LB4 A; 2YRS A; 2GKN A; 5EET A; 1V5H A; 1FDH G; 1K0Y A; 3A5A A; 3K9Z A; 1CQX A; 2GTL D; 3UHU A; 1C7D B; 1LUE A; 1O1O B; 1OUU A; 4M4A A; 4N8T A; 3NMM A; 1Y46 A; 3FS4 A; 1HJT A; 1XZ5 B; 2ZST A; 1Y5F A; 1VXC A; 1XQ5 B; 1SI4 B; 1N9H A; 1YHU D; 1HDB B; 1GBV B; 4ODC B; 1CG8 B; 4F6I A; 2BW9 M; 2W72 A; 2HBG A; 2QMB A; 3G4Y A; 1HRM A; 1A3O A; 1SWM A; 1OUT A; 2R80 B; 3ZJR A; 1YEV A; 2ZS1 C; 1RPS A; 4NXA A; 1NXF A; 4U8U C; 2PGH B; 2G11 A; 4MQH A; 3WCT D; 4ROL A; 3A5B A; 3MBA A; 1VRF A; 2VLX A; 1Y8K A; 3OJ1 A; 4H2L A; 1O1J A; 2DXM B; 3UH3 A; 3P5Q B; 1NZ5 A; 108M A; 1AJ9 B; 2ZLT A; 1MYM A; 2XKI A; 1O16 A; 1MBI A; 5HLQ A; 1LFQ A; 1OFK A; 2DN2 A; 1MBN A; 4JYQ A; 2D2N D; 1Y83 B; 1IRC A; 1DXD A; 4FH7 A; 3WTG B; 4DWU A; 4MQC A; 1GLI A; 1BVD A; 4N7O A; 3GQG A; 1MLR A; 3WCT A; 5HLU A; 1RQ3 B; 5JOM A; 3HC9 A; 1HBS B; 3SZK B; 2JHO A; 1Y0T A; 6HBW B; 3WCP B; 3QJD A; 3OVU C; 3CY5 A; 1NIH A; 1YOG A; 2ZFO B; 4IRO B; 2QLS B; 3ZH0 A; 3GDJ A; 1MYZ A; 3BCQ A; 3UH7 A; 3W4U A; 4WJG A; 2VM0 A; 2OH8 A; 5CN4 A; 2R1H B; 1HV4 A; 1U7S A; 1Y7C B; 1DKE B; 3IC0 B; 4MPM A; 2ZSO A; 1WLA A; 3IA3 B; 1T1N B; 1YZI B; 1J3Y A; 2Z6T A; 3QJC B; 3A0G B; 3UHD A; 4HHB A; 2GTL C; 1G0B B; 1AZI A; 3HYU A; 1A0Z A; 2B7H A; 4O2G A; 1YHU C; 1IRD A; 1CG5 B; 1YIE A; 3KMF C; 3PI4 A; 1HLB A; 1LFT A; 3D1K A; 5D1V A; 1JF3 A; 4MBA A; 3R0G A; 1VXB A; 2HHD A; 5CNF A; 1X9F D; 2QSS B; 1Y4R B; 1F65 A; 3A5G A; 1IBE A; 4UIQ A; 3QJB B; 1V4X B; 1DUK A; 4MQG B; 1Y5K A; 1FHJ A; 1YDZ A; 1Y8W A; 3WCT C; 2BK9 A; 1BIJ A; 2O5Q X; 3LHB A; 3HEN A; 1YGD B; 1A6K A; 4NS2 A; 2H35 A; 1ECA A; 1GDJ A; 2ZLV B; 1HBH B; 3PIA B; 2R4Y A; 3HRW B; 1FDH A; 2LH5 A; 3S65 A; 1NEJ A; 2EB9 A; 1X9F A; 1A9W E; 2ZS0 B; 1Y4P A; 1NPG A; 1Y22 A; 5KKK A; 3ZJQ A; 2MYC A; 1Y4Q A; 3ARK A; 2D2N C; 2LH7 A; 4MQJ B; 3BA2 A; 4F6J A; 3D17 B; 1G0A A; 1MBA A; 3EU1 A; 105M A; 1MLM A; 1GCW B; 2XYK A; 3UHG A; 1KD2 A; 1Y01 B; 4B3W A; 1J3Z A; 1SDK A; 1Y85 B; 1S61 A; 1S5X B; 3WCV B; 4ROM B; 1HGB A; 2VHB A; 1J7Y B; 3OO4 B; 5KER B; 3GKV A; 2VEB A; 2ZT3 A; 1YGF A; 1HGA A; 3ODQ B; 1HBA A; 1H97 A; 5EV5 A; 3AQ5 A; 1YIH B; 1MTJ A; 1SDL A; 2MYD A; 3G4U A; 2MGI A; 2Z6N A; 2HHB B; 1Y7G A; 3WR1 A; 5CNB A; 2ZLX B; 3UHT A; 1ABW B; 1LFL B; 5JGG A; 1XY0 B; 2W31 A; 2OIF A; 2DHB B; 3E5I A; 1J7W B; 1QSI A; 2ZT1 A; 3G52 A; 5JDO E; 4F6B A; 3QM7 A; 1NS9 A; 4MQK B; 1X9F C; 2QFN A; 4ZVB A; 1NS6 A; 1XZV B; 1Y45 B; 2BLJ M; 2GRF A; 1YEN B; 3MJP B; 4PQ6 A; 2VLY A; 1YH9 A; 2MYA A; 3HEP A; 4F68 A; 5HBI A; 2FRF A; 3R5I A; 3UHV A; 1Y8H A; 2V1E A; 3CIU B; 2FAL A; 1XZ4 B; 3GK9 A; 1XZU B; 3WCU B; 1MLL A; 3VHB A; 1QXE B; 1A3N A; 3G4Q A; 1CMY B; 1WMU B; 2RAO B; 3BJ2 A; 1YHE A; 3MVC A; 1C7C A; 1QPW A; 3DHR B; 5KDQ A; 1XZ7 A; 2W6W A; 3NG6 B; 3SDH A; 1XYE A; 3B75 A; 3ECZ A; 1S56 A; 1XXT B; 3UHY A; 1FN3 B; 1MLQ A; 2ZSS A; 5E6E A; 1B86 A; 1FAW B; 1Y09 B; 1YEO B; 2AA1 B; 1CP0 A; 5CHQ A; 5EUI A; 1COH A; 1YVQ A; 1PBX A; 1MYI A; 1CBL A; 1Y0W A; 2LH1 A; 1SPG A; 3BJ3 B; 1KFR A; 1K0Y B; 1IT3 A; 3HEO A; 3SDN A; 1OUU B; 4M4A B; 4N8T B; 3NMM B; 1BBB A; 1Y46 B; 2NRL A; 2W6Y A; 3FS4 B; 1Y5F B; 3UHC A; 3UHQ A; 2VLZ A; 2HBC A; 1YE2 A; 1CLS A; 3PT8 A; 1QI8 B; 2ZSQ A; 2W72 B; 2AV0 A; 1YOH A; 4L7Y A; 1LFZ A; 1GDL A; 1THB A; 1LH2 A; 4MQI B; 3WCW A; 5HLX A; 2QMB B; 1EWA A; 1A3O B; 1YEV B; 1RPS B; 1GBU A; 3UH5 A; 2FRI X; 2ZT2 A; 4TYX A; 4MQH B; 4ROL B; 1Y8I A; 2BMM A; 2MGH A; 3WI8 A; 1Y31 A; 1Y8K B; 4H2L B; 5E83 A; 1O1J B; 2AV3 A; 3E5O A; 5MBN A; 2QSP A; 1CPW A; 4N7P A; 1QSH B; 2D2M A; 2ZLT B; 4VHB A; 5E29 A; 1LFQ B; 2DN2 B; 1HDA B; 1CH7 A; 1TU9 A; 2R50 A; 2G12 A; 5CN7 A; 3FH9 A; 4MQC B; 1MNJ A; 4N7O B; 2HBE B; 3GQG B; 2ZS1 A; 2D60 A; 3WCT B; 1YFF A; 1V75 B; 4U8U A; 2MBW A; 1MKO A; 1RQ4 A; 1Y0T B; 1YEU A; 3TM9 A; 3QJD B; 1DTM A; 3CY5 B; 3TM3 A; 1NIH B; 3OGB A; 3GQR A; 3GDJ B; 1NQP A; 3BCQ B; 3W4U B; 1YOI A; 2WY4 A; 3VRG A; 1CH1 A; 1UX9 A; 1O1M A; 3QM6 A; 3LR7 A; 1HV4 B; 1MOA A; 1OR6 A; 1VXE A; 4G1B A; 1J3Y B; 3EDA A; 1ECD A; 5HAV A; 3VRF A; 4HHB B; 3VRE A; 2W6V A; 1UX8 A; 1YG5 B; 3HYU B; 1R1X A; 1A0Z B; 2B7H B; 3OZV A; 3GLN A; 1HHO A; 1D8U A; 2MGG A; 109M A; 1IRD B; 1C40 B; 1JP9 A; 1HSY A; 1YIE B; 2IN4 A; 3ZOL A; 1UVY A; 5C6Y A; 3E55 A; 4G1V A; 4PQC A; 1K1K A; 2D2M C; 2HHD B; 2FRK X; 1DXC A; 2O5B X; 1FSX A; 1IBE B; 2RI4 B; 1A6G A; 1G9V A; 1N9F A; 1CO9 A; 2HCO B; 3OZU A; 1Y5K B; 1Y4G A; 1FHJ B; 3V2V A; 1MZ0 A; 2NSR A; 1BIJ B; 1SHR A; 3GKT A; 3UHE A; 2GTL A; 1JP8 A; 3LB2 A; 1IOP A; 3NML A; 1X46 A; 2H35 B; 4YU3 B; 1JY7 A; 1W92 A; 3H57 A; 1Y2Z A; 1MLU A; 1YHU A; 4NXC A; 3S65 B; 1NEJ B; 3DUT B; 3KMF A; 1AJH A; 1X9F B; 4O4T A; 1Y4P B; 1DXV A; 1Y5J A; 4ESA A; 1Y22 B; 1G09 A; 4C44 A; 1NZ2 A; 3A59 A; 3HXN A; 3QZX A; 3BOM A; 3AQ7 A; 2XKH A; 3U3E A; 104M A; 5ILR A; 1G0A B; 3EU1 B; 3QM5 A; 3ARL A; 5EE4 C; 3MJU A; 4FH6 A; 1O1K A; 1URY A; 5SW7 A; 3PT7 A; 1KD2 B; 3UHZ A; 1CIK A; 2DN3 A; 2NRM A; 3UHS A; 1L2K A; 1V4W A; 1DXT A; 1MBC A; 1Y4F A; 1J7S A; 1HGB B; 1YHR A; 3PI2 A; 2G0V A; 4HRR A; 1F63 A; 2G0X A; 3LR9 A; 1OR4 A; 3H58 A; 3GKV B; 2HBS A; 1HGA B; 1HBA B; 3AT5 A; 2V1J A; 2ZWJ A; 2D5Z A; 2D2N A; 1XZ2 A; 3RJN B; 2WTG A; 1MYT A; 1SDL B; 3NFE A; 1S5Y B; 4JAC A; 2Z6N B; 3QQR A; 3UBV A; 3IC2 A; 1Y7G B; 3WR1 B; 3KUN A; 4M4B A; 2EKU A; 1A4F A; 1Y0D A; 5JGG B; 1JL6 A; 1C7B A; 5IKS A; 5CNC A; 2O5O X; 1HBG A; 5CN5 A; 1NS6 B; 1NWI A; 2GL3 A; 2LH3 A; 1HCO A; 3ZJI A; 3HF4 A; 3MYN A; 3UHR A; 3EOK A; 1YH9 B; 1JPB A; 2VRY A; 5CHR A; 1VWT A; 3R5I B; 1MBO A; 5CN6 A; 1Y8H B; 2GRZ A; 1XQ5 A; 1MLN A; 2C0K A; 1CIO A; 3OO5 A; 1A3N B; 2ZSR A; 4X0L A; 1IT2 A; 1HAB A; 4FWZ A; 2GNW A; 3BJ2 B; 1A00 A; 1YHE B; 1NPF A; 1QPW B; 4WJG 1; 2KSC A; 1XZ7 B; 3WFX A; 3PEL A; 1XYE B; 3B75 B; 1IWH A; 2G0S A; 2OH9 A; 1MOB A; 1HDS A; 1MNK A; 5E6E B; 3UBC A; 4ZVA A; 2V1H A; 2PEG A; 2DC3 A; 5EUI B; 4DC7 A; 1COH B; 3ZJM A; 1YVQ B; 5F0B A; 5HU6 B; 1PBX B; 1S0H A; 1TES A; 1CH2 A; 1Y0W B; 1SPG B; 2R4X A; 1JZL A; 2ZFO D; 1J41 A; 1LHS A; 2MGL A; 1VHB A; 2MGF A; 1MTK A; 1JZM A; 2HBC B; 1YE2 B; 1CLS B; 5D5R A; 1MLO A; 2QRW A; 1Y7Z A; 3PT8 B; 3ED9 A; 3WHM A; 2AUO A; 2GRH A; 1MNI A; 2H8D A; 1GZX A; 4OOD A; 1LH6 A; 1ECO A; 1THB B; 3WCW B; 2HZ2 A; 3UH6 A; 1MWB A; 1AJG A; 1HBS A; 1HBR B; 3S1J A; 2QU0 B; 1BZ1 A; 2Z8A A; 3MKB A; 4AVE A; 2HBD A; 4KMV A; 4MXK A; 1GBU B; 1MBD A; 1DXU A; 1RQA A; 3UHH A; 1NAZ A; 2LH2 A; 2OLP A; 106M A; 1OJ6 A; 1BZZ A; 1Y8I B; 4XDI A; 1U7R A; 2XKG A; 1LFV A; 4N7N A; 1Y31 B; 2BLI A; 3G4V A; 2ZT4 A; 5E83 B; 3GYS A; 1BZ6 A; 2QSP B; 3QJE A; 1YVT A; 1M6M A; 3A0G A; 4N7P B; 2D2M B; 1BZ0 A; 5E29 B; 1RTX A; 1V4U A; 2MHB A; 1HAC B; 3A9M A; 1Y0A A; 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3PI1 A; 1UFJ A; 3LB1 A; 4O35 A; 1G09 B; 4KJT A; 2GLN A; 3A59 B; 3HXN B; 1DTI A; 1GVH A; 3BOM B; 3M39 A; 3QM8 A; 1BIN A; 1JP6 A; 3O89 A; 1G08 A; 2MGA A; 3MJU B; 2ZLU A; 5CMV A; 1O1K B; 3WFU A; 3PT7 B; 1GLI B; 1EBC A; 1MLK A; 4F6G A; 1MLF A; 1XZV A; 2ZS0 C; 5JDO C; 2W6X A; 1NGK A; 2EF2 A; 2EVP A; 1EBT A; 4NI1 A; 2DN3 B; 1J40 A; 1M6C A; 1RVW A; 1V4W B; 4HRT A; 1Q1F A; 1OBM A; 1DXT B; 3KUO A; 1Y4F B; 2VYW A; 1J7S B; 1O1L A; 1LHT A; 1J3F A; 1XZ4 A; 1YHR B; 1MLS A; 4HRR B; 1HBB A; 1QXE A; 2LHB A; 3IXF A; 2QFK A; 1CMY A; 107M A; 2ZSZ A; 4C0N A; 2HBS B; 3K8B A; 2ZSY A; 2MYB A; 4NZI A; 3AT5 B; 2BKM A; 1BAB A; 2D2N B; 1XZ2 B; 1A01 A; 2SPO A; 2MGB A; 2MYE A; 3WCV C; 3NFE B; 4NK1 A; 3ZHW A; 4QAU A; 4FWY A; 1FN3 A; 3IC2 B; 3EDB A; 4M4B B; 1A4F B; 1FAW A; 2GNV A; 3UHB A; 1C7B B; 1CQ2 A; 1Y7D A; 3ARJ A; 1LJW A; 3M38 A; 2WTH A; 1HBI A; 4HBI A; 5B85 A; 1BZP A; 4OF9 A; 1LFT B; 1NWN A; 3D1K B; 1HCO B; 2SPL A; 3BJ3 A; 3HF4 B; 1LFY A; 1Y0C A; 4PQB A; 3EOK B; 3ASE A; 1HGC A; 1VWT B; 4B4Y A; 1BUW A; 2O5L X; 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