The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDIHIRLFKSHPETLEKHDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTELTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Rational design of a structural and functional nitric oxide reductase.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
62
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-10-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ZFO A; 4N7N A; 1W92 A; 1Y7G B; 1DWT A; 3G4R A; 4JYQ A; 1SI4 A; 1U7S A; 4O4Z A; 3HHB A; 4XS0 B; 5CN5 A; 1GDJ A; 3D1K A; 5JDO C; 1LH5 A; 1G9V B; 3QQR A; 102M A; 2ZSN A; 2EVP A; 1N9F A; 1Y4P B; 1DXT B; 5ILE A; 4HHB B; 1NPF A; 1SDK A; 1DTM A; 4NS2 A; 1N9H A; 1ECO A; 4F6B A; 2IN4 A; 2ZT3 A; 2LH3 A; 1FHJ B; 3NMM B; 3M3A A; 3W4U A; 1V75 A; 1DXU A; 4NZI A; 2GKM A; 5M3S A; 3QJD A; 1Y45 A; 5EYS A; 2GTL D; 1LTW A; 3UBC A; 1LFV A; 1XCH A; 3G4V A; 2RAO A; 1UX8 A; 1HCO B; 1OR4 A; 2ZS1 C; 2VRY A; 1IBE A; 1HBS A; 1S69 A; 1YIH A; 2HHD A; 1J41 B; 2MGJ A; 1NAZ A; 1V4X A; 3M3B A; 1AJ9 B; 2JHO A; 1VWT B; 1BIN A; 2ZT0 A; 1V4W A; 2R4Z A; 1GCW A; 1FN3 A; 1XYE B; 1SPG B; 2GRH A; 3PI8 A; 2ZSQ A; 3A0G A; 3S66 A; 4U8U A; 3G4Q A; 2ZT2 A; 1QSI A; 1BBB A; 1VXB A; 3NFE A; 3A59 A; 1Q1F A; 3LQD B; 1GBV A; 1IBE B; 5AB8 A; 3OK5 A; 1JZM A; 1Y0A B; 1YZI A; 3ARL A; 1YEU A; 2AV0 A; 2NRL A; 1F5P A; 1C7C A; 1HDA A; 1R1Y A; 4ZVB A; 4HSX A; 1YG5 B; 2QMB A; 1YHE B; 2ZSX A; 2B7H A; 1HGA A; 3RGK A; 1GDI A; 1ABW A; 2HBS B; 4MAX A; 3PI8 B; 3A0G B; 4MQI A; 1MTJ A; 3A5G A; 5F2A A; 1LH2 A; 3BCQ B; 5CHR A; 3MBA A; 3NFE B; 2BLJ M; 3A59 B; 2YRS A; 3ZOM A; 2NX0 A; 1HV4 A; 1Y0W B; 4NI1 B; 4PQB A; 1O1L A; 2ZLX A; 1DXD A; 1Y2Z A; 1O1M A; 2AV3 A; 3BJ2 B; 1JWN A; 1O1P A; 1YEU B; 2H8F A; 3HF4 A; 1TU9 A; 1YHR B; 1C7C B; 1M6M A; 1Y8I A; 2PEG B; 4KN3 A; 2HHE A; 4JAC A; 2MYD A; 1MNI A; 1JZL A; 1DXV B; 3ODQ A; 1A4F B; 1EWA A; 1YDZ B; 5CN8 A; 2MBW A; 1MNJ A; 2QLS A; 1LH6 A; 1NEJ A; 3ARJ A; 3O7N A; 2HBC A; 5E6E A; 4ROM A; 1YOG A; 1XZ7 B; 1ABW B; 2MGI A; 4HRT B; 2MHB B; 1SWM A; 3HRW A; 3EU1 A; 1LFY A; 1NZ3 A; 4F6G A; 2D2M B; 2YRS B; 1GJN A; 1YOH A; 1HV4 B; 1Y4F A; 1O1L B; 3VRF B; 1G0B A; 5F0B A; 1MNO A; 1Y4R B; 3UHU A; 2H8F B; 3HF4 B; 3D7O B; 3E5O A; 3WCT B; 3PEL A; 3PI4 A; 3R0G A; 1S5X A; 1VRF A; 2GRZ A; 1LHS A; 1B86 B; 2V1F A; 3PIA A; 4ZVA A; 3ODQ B; 4ESA A; 3UHY A; 1YEQ A; 3QJC A; 5E6E B; 3WR1 B; 3A9M A; 2QSS B; 3QMA A; 1RQ4 A; 1HGC A; 4YU3 A; 1GVH A; 2MB5 A; 1COH B; 4N8T B; 5E29 A; 1NPG A; 3K3U A; 5E83 B; 1C7B B; 2GDM A; 2IG3 A; 1G0B B; 1Y46 B; 1JY7 B; 2G10 A; 2D2M C; 1Y7C A; 3PEL B; 101M A; 2D2N C; 3AG0 A; 3PIA B; 2XKH A; 2FRI X; 1YEO A; 3IC0 A; 1URV A; 1J3Y A; 1O1O A; 1M9P A; 3QJC B; 3LB1 A; 2D5X A; 1UIW A; 1DTI A; 1Y8W A; 4F68 A; 1CP0 A; 4YU4 A; 1S5Y A; 3EOK A; 1HGC B; 2G0X A; 3WCT C; 3UHR A; 1RVW A; 3LB4 A; 5HLU A; 1A00 A; 1MLG A; 3LB2 A; 1SDL A; 3RJN B; 1UVY A; 2Z8A A; 1XZU B; 5ILP A; 2O5B X; 2XKG A; 1Y35 A; 1DLY A; 1BZP A; 1I3E A; 3CIU A; 1MOH A; 1JP8 A; 2C0K A; 4O2G A; 1XZ4 A; 3D17 A; 1QPW B; 5SW7 A; 1AJH A; 3UHQ A; 4F4O A; 1NIH A; 1J3Y B; 1PBX B; 2GRF A; 1RPS A; 1O1N A; 2EKU A; 2VHB A; 4B4Y A; 3MN0 A; 1MWD A; 3QZZ A; 3AQ7 A; 1SHR B; 4YU4 B; 2HHB A; 3S65 A; 1QI8 A; 2ZS0 D; 1C40 A; 1RVW B; 3BOM B; 4SDH A; 1X9F B; 2OH8 A; 1NWN A; 2KSC A; 5CN4 A; 1MBO A; 3GKV B; 1C7D A; 1LH1 A; 1LH3 A; 1LA6 B; 2FRF A; 5KDQ A; 1A0Z A; 1HAC A; 3UH5 A; 1X3K A; 1ECA A; 3HXN B; 1RQA B; 1A01 A; 1K1K B; 1LFQ B; 1DO7 A; 1DWS A; 1BVD A; 1MWB A; 2OHA A; 1LFT A; 1CLS B; 1MNK A; 111M A; 2M6Z B; 1XZ4 B; 1A3O A; 2HBD A; 2FAL A; 1NGK A; 1BAB A; 3DHR B; 4F4O B; 107M A; 1A0U A; 2DHB B; 3ZJS A; 110M A; 4MQK A; 1YHU D; 2D5Z A; 5HLX A; 4M4A A; 3E4N A; 1RPS B; 2HBE B; 3PI9 B; 3M38 A; 1XY0 A; 1YGF B; 5EE4 C; 2EVK A; 2HHB B; 3G52 A; 3S65 B; 1O16 A; 1QI8 B; 3IC2 A; 2ZWJ A; 4FWY A; 4MQC A; 2GNW A; 2V1J A; 2LH1 A; 1S56 A; 5KER A; 2Z6N B; 3WHM B; 1O1K B; 5KDQ B; 1A0Z B; 2ZS1 A; 3FS4 B; 1VXD A; 6HBW B; 2V1G A; 4IRO A; 1HDB A; 1UT0 A; 3A5A A; 3OO4 A; 3LR7 A; 1FSX B; 1Y5K A; 1CBL A; 4TWV A; 2GKN A; 1VXE A; 1X9F C; 3ZJO A; 1A0U B; 2BW9 M; 1Y7G A; 3K8B B; 2Z6T A; 1YEV B; 1XQ5 A; 4XS0 A; 4B3W A; 1QXE B; 1ABY B; 1HBB A; 2GTL B; 1G9V A; 1MYT A; 3NG6 B; 5AZR A; 3GYS A; 2O5S X; 1BZZ A; 3ASE A; 1DO1 A; 3MJP B; 3OGB A; 1Y83 B; 4MQC B; 3UHZ A; 3VRE B; 1F63 A; 1Y4P A; 2VEE A; 1DXT A; 1Y5F B; 1Y7Z B; 3UHG A; 2W6X A; 1MNH A; 5KER B; 1GDK A; 4HHB A; 1A6M A; 2MGE A; 1MBN A; 1YE0 B; 3A5B A; 3WFT A; 2G0V A; 1FHJ A; 4IRO B; 1D8U A; 2DN1 B; 3NMM A; 4FC3 B; 3OO4 B; 4N7P B; 1Y4Q B; 3R5I B; 1MYH A; 2EF2 A; 4AVD A; 3B75 B; 1DUK A; 3WCU D; 4MU5 A; 4FH7 A; 3S1I A; 1LFZ B; 3HEN A; 5MBN A; 1OJ6 A; 2DC3 A; 2OHB A; 1HCO A; 4MQH B; 1XQ5 B; 1G0A B; 1XZ2 B; 1HBB B; 5EYJ A; 1J41 A; 3GYS B; 1BZZ B; 3GLN A; 1AJ9 A; 1MOA A; 1VWT A; 2WY4 A; 3OJ1 A; 5CN6 A; 3WFX A; 1Y5J B; 1RSE A; 1WVP A; 3S48 C; 1XYE A; 1SPG A; 4FH6 A; 2GTL C; 1LHT A; 1BUW B; 4C44 A; 3WCW D; 1J7S B; 4MQJ B; 3SDH A; 2HCO B; 1Y0T B; 3D4X B; 3GK9 A; 3OVU C; 1LFL A; 2W6V B; 3LQD A; 1A6N A; 1CBM A; 1YMB A; 1JEB B; 1MLM A; 3MKB A; 3UH7 A; 1THB A; 2HZ2 A; 1Y0A A; 1IRC A; 2VEB A; 4KJT A; 1U7R A; 1JZK A; 1YEN B; 1IDR A; 1NZ2 A; 3UI0 A; 1QSH A; 1K0Y A; 1MBI A; 1G09 B; 5KKK A; 1YG5 A; 1YHE A; 3UBV A; 1R1X A; 2G0Z A; 5CNC A; 2HBS A; 1Y8H B; 3ORD A; 1ASH A; 3HC9 A; 3V2Z A; 1JDO A; 2SPL A; 1EBT A; 3ZH0 A; 1MTK A; 3BCQ A; 1LFL B; 7HBI A; 2LH6 A; 2SPN A; 1WLA A; 3UHK A; 1Y0W A; 4NI1 A; 1MLU A; 1A9W E; 3MKB B; 2MGC A; 4MPM A; 2AUQ A; 2R4W A; 2ZSR A; 1MLO A; 1THB B; 3BJ2 A; 4G1V A; 3KUN A; 1Y31 B; 1TES A; 1J3Z B; 1GCV A; 1YHR A; 1ITH A; 103M A; 1Y09 B; 1QSH B; 2PEG A; 1OFJ A; 1K0Y B; 4UZV A; 1DXV A; 1Y4G B; 2AUR A; 1Y22 B; 1CH3 A; 1CH2 A; 2MYB A; 1A4F A; 1YDZ A; 1MLJ A; 1AJG A; 1CO8 A; 5CMV A; 3H57 A; 3UHT A; 1R1X B; 2HBF B; 3GQR B; 3UHI A; 1HLM A; 5B84 A; 1XZ7 A; 4HRT A; 1F65 A; 2MHB A; 1ECD A; 5C6Y A; 1A3N B; 1JL7 A; 1XZ5 B; 4MBN A; 2MGL A; 2H35 B; 2ZFO D; 1AZI A; 3WCV D; 2D2M A; 4ROL B; 3E55 A; 4OOD A; 2MGA A; 2ZSO A; 3ZJR A; 4NXA A; 5CHQ A; 2OH9 A; 2D2N A; 3DR9 A; 4NK2 A; 2EB8 A; 3ZJH A; 3VRF A; 1RQ3 B; 1DKE B; 1Y4R A; 1YGD B; 3MVC A; 4QAU A; 3GOU A; 1GCV B; 3ZJN A; 3D7O A; 3WCT A; 1YVQ B; 4WCH D; 1B86 A; 3QM9 A; 3O89 A; 1Y85 B; 5CN9 A; 1NQP B; 3BA2 A; 4FWX A; 1O1I B; 3CY5 B; 1Y0C B; 3WR1 A; 2QSP A; 2QSS A; 1V5H A; 1LH7 A; 2GLN A; 1YFF B; 3PT7 B; 4MBA A; 1COH A; 3WTG A; 4N8T A; 2ZLT B; 5ILR A; 2D2N B; 4UUR A; 5E83 A; 1C7B A; 5HLQ A; 2FRJ X; 3IA3 B; 1T1N B; 3UHD A; 3KUO A; 1BZ0 B; 1JY7 A; 1Y46 A; 1Y8K B; 1HBG A; 2VYZ A; 3DHT A; 3HYU B; 5CNF A; 1NZ4 A; 1UX9 A; 3GOU B; 3ECX A; 2V1E A; 3UHH A; 2RI4 A; 5D5R A; 1Y01 B; 4MXL A; 2LH2 A; 1BJE A; 3ZJI A; 3QM8 A; 3MJU B; 2W31 A; 3UHC A; 1CH9 A; 2O5T X; 1HHO B; 5EUI B; 1BZ1 A; 2QSP B; 1XZV A; 1VXF A; 4U8U D; 1MYM A; 4HBI A; 1CIO A; 4PQ6 A; 3U3E A; 3WTG B; 1HRM A; 2H8D B; 2MYE A; 2W6W A; 4NI0 A; 2ZSS A; 4F6D A; 1XZU A; 1VXG A; 3KMF C; 1LUE A; 2ZS0 B; 3WFW A; 1HDS B; 3DHT B; 2G0S A; 2DN2 A; 3AQ8 A; 1YIE A; 2W6Y A; 1J3F A; 2R1H B; 3UGY A; 2RI4 B; 1QPW A; 2O5M X; 3TLD A; 1HGB B; 1PBX A; 4H07 A; 2BKM A; 1CMY B; 5CNB A; 3AT5 A; 5HU6 B; 1J7W B; 1BZ1 B; 1XZV B; 1SHR A; 2R4Y A; 2O5O X; 3NML A; 1FLP A; 5CNE A; 5JOM A; 3BOM A; 3BJ1 B; 2G0R A; 1YHU B; 1X9F A; 1URY A; 4NI0 B; 2VLZ A; 4DC8 A; 3MYN A; 3GKV A; 2Z6S A; 1LA6 A; 3LB3 A; 1WMU A; 4DC7 A; 3QM5 A; 2ZSP A; 2QRW A; 3HXN A; 1RQA A; 2V1I A; 1FDH G; 2DN2 B; 1K1K A; 3GDJ A; 1LFQ A; 4LPI A; 1YIE B; 1GZX B; 1CLS A; 1O1J B; 2M6Z A; 3A2G A; 2AUO A; 3DHR A; 4HRR B; 4L7Y B; 5HY8 A; 2DHB A; 4F6F A; 4H2L B; 1HBI A; 3AT5 B; 2HBE A; 3PI1 A; 3PI9 A; 1YGF A; 2ZS0 C; 1CG8 A; 2FAM A; 3WCU A; 1MBA A; 2OIF A; 1EW6 A; 1YE2 B; 1MLF A; 3RJ6 A; 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1J7S A; 1VHB A; 4MQJ A; 2HCO A; 1Y0T A; 3G53 A; 3EDA A; 104M A; 3D4X A; 1DUO A; 1XXT B; 1NS9 A; 2W6V A; 2XKI A; 1Y4B B; 2EKT A; 1QXD B; 1JEB A; 1IWH B; 3ZJM A; 1PMB A; 4WJG 1; 2W72 C; 1HAB B; 4G51 B; 3WCV A; 2BWH A; 3AQ9 A; 1FSL A; 1IOP A; 1GBU B; 1J7Y B; 1YEN A; 1GDL A; 1EBC A; 1G09 A; 1RTX A; 1MTI A; 3WCW C; 1X46 A; 2R4X A; 3HEP A; 112M A; 2WTH A; 5JDO D; 3FH9 B; 1Y8H A; 5ILM A; 1MOB A; 1RTE A; 1YH9 B; 4AVE A; 5IKS A; 2BLI A; 4ODC A; 1NS9 B; 5JGG A; 3NL7 B; 2QU0 A; 2ZFB A; 3OO5 B; 2AUP A; 1A9W A; 3SDN A; 2ZSZ A; 1HJT A; 2ZLW B; 4N7O B; 2ZFO B; 2R80 A; 3WCV B; 1KR7 A; 2VYW A; 1Y31 A; 1J3Z A; 2GL3 A; 4DWT A; 4N7N B; 4M4B A; 105M A; 1SI4 B; 1DO3 A; 3MYM A; 1Y09 A; 3HHB B; 4UIQ A; 2VLY A; 2BLH A; 3D1K B; 1Y4G A; 1Y22 A; 2VYY A; 3ZJJ A; 2ZS1 D; 2HBF A; 3GQR A; 4TYX A; 1MCY A; 1MYJ A; 1OR6 A; 1MLL A; 2MGF A; 1A3N A; 1XZ5 A; 1L2K A; 2H35 A; 1SDK B; 4ODC B; 4ROL A; 5JGG B; 2QU0 B; 2ZFB B; 1BZR A; 2O5Q X; 1NXF A; 3W4U B; 1V75 B; 1DXU B; 2BNL A; 3QJD B; 1Y45 B; 1BVC A; 1V07 A; 2R80 B; 1LFV B; 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