The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHTVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Complex of myoglobin with phenol bound in a proximal cavity.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
62
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-09-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LH3 A; 2DXM A; 3OO4 A; 1CQX A; 3UHB A; 4QAU A; 1Y5F A; 2W6W A; 3LB1 A; 3D1A B; 1F5O A; 1MNK A; 1GCV B; 3A0G B; 1Y0D B; 2YRS B; 3IA3 B; 3QJD B; 3SZK A; 2MBW A; 3ARL A; 4TYX A; 3M3A A; 1NZ3 A; 1Y09 A; 1A0U A; 3ZJJ A; 1Y0A B; 6HBW B; 1JF4 A; 2ZST A; 5HU6 A; 1QXE B; 5ILE A; 1HGC B; 1H97 A; 1B0B A; 2NRM A; 3IC0 B; 1DO1 A; 1V75 A; 1YGD B; 1CG5 A; 1Y85 A; 1Z8U B; 1O1M A; 3TM3 A; 3DUT A; 4NK1 A; 5E83 B; 2H8D A; 1Y8W B; 1YHU A; 3VRF A; 2ZT2 A; 1VXE A; 1YZI A; 1GVH A; 1JP6 A; 2HZ1 A; 1J3Y A; 3GKV A; 1YFF B; 3VAU A; 3QJB A; 4ESA A; 1LH1 A; 4O2G A; 2MGL A; 3NG6 B; 1DXT A; 1XZ4 B; 1MOH A; 2O5L X; 5EE4 C; 1JEB A; 2D2M B; 3OO5 A; 1MWD A; 1LFQ A; 3BA2 A; 2JHO A; 103M A; 1Y7C A; 5CHQ A; 1Y7G A; 102M A; 3GOU B; 2ZLX A; 3S65 B; 1T1N B; 4L7Y A; 3UHR A; 1DKE B; 1YDZ A; 5SW7 A; 3KUN A; 1Y4P A; 3PI2 A; 1A3N B; 1YE0 A; 2OHB A; 3UH3 A; 4PQC A; 1NEJ A; 3PIA B; 1LFT B; 3A2G A; 3HRW A; 3EOK A; 4YU4 A; 1MBA A; 3UHT A; 5B84 A; 3GDJ B; 1MNH A; 1NZ2 A; 1NS9 A; 2Z8A A; 1Y4Q A; 2ZLV B; 1V4W A; 3CY5 A; 1CPW A; 1G9V A; 1CH9 A; 1R1Y A; 2HZ2 A; 5CNE A; 1VXC A; 1Y0C B; 2SPN A; 1HAC A; 4DWT A; 3S48 C; 4N7N A; 3NML A; 1ASH A; 1Y5K B; 3PI3 A; 1CG8 B; 2MYB A; 1I3D A; 2ZT4 A; 2HBG A; 1J41 A; 2HBC A; 1HBB B; 3LB2 A; 4MQH B; 1DO3 A; 2PEG A; 1YH9 B; 4VHB A; 3ZJP A; 5EE4 D; 3ASE A; 1FSX A; 3QZX A; 2VYW A; 1NZ4 A; 2WY4 A; 1XQ5 A; 1YEN B; 3K8B A; 5HLX A; 2R1H A; 1QSI A; 2DN1 A; 5HAV A; 3UHK A; 1MYG A; 1MTK A; 3MN0 A; 3PI1 A; 1LFL B; 1MLM A; 1A6G A; 1CQ2 A; 4ODC B; 1KD2 B; 1FHJ B; 1DLW A; 1A3O A; 3WCV B; 1WMU B; 1CLS B; 1CIK A; 1GDK A; 3PT8 A; 2ZFO C; 3DHR A; 1A6N A; 1O1N B; 2HBE B; 3G4Q A; 4B4Y A; 3HEN A; 5EOH A; 1Y4R B; 3K3U A; 1J3Z A; 3HEP A; 3S66 A; 2QFK A; 1IDR A; 1VWT B; 3ZJL A; 4H07 A; 3ARJ A; 4UZV A; 1UFJ A; 1O1O B; 3WCW A; 3UHX A; 1MTI A; 1K0Y A; 1LFY B; 2B7H B; 3HF4 B; 1Y5J B; 1YHE B; 3MKB B; 1YIE B; 3BJ2 B; 2ZLU B; 1Y0W B; 1JF3 A; 4F6D A; 2V1E A; 2GRF A; 2ZSN A; 3ODQ B; 3WCU B; 3UH6 A; 2MGD A; 3A5G A; 1HLM A; 2ZLW A; 3UHQ A; 2ZSS A; 1OBM A; 2O5Q X; 2ZLT A; 3AT5 A; 5CN7 A; 1M9P B; 3GYS A; 4WJG 1; 2MYD A; 5EYJ A; 3NMM B; 1Y4G A; 3M38 A; 4NXC A; 2DC3 A; 1RQ4 B; 2R4Z A; 2MYE A; 4MQJ B; 1THB A; 1BIJ A; 4UUR A; 1S69 A; 3ZJQ A; 1YE2 B; 1GJN A; 2DN2 A; 3AG0 A; 3D7O A; 5HY8 B; 5JDO F; 5KKK A; 1QSH A; 1HV4 B; 3WCP A; 4N8T B; 2QMB A; 2D2M C; 1YIH A; 2AUP A; 4H0B A; 1LUE A; 2ZFO D; 3BJ1 B; 2QFN A; 1IT3 A; 3MYM A; 2HBD B; 3IC2 B; 2GNW A; 3ZJR A; 2VLX A; 1ECA A; 3ONZ A; 1OR6 A; 1YEV A; 2VEE A; 2VHB A; 2NRL A; 3PI9 A; 1Y0T A; 1J7Y A; 2V1H A; 1MOD A; 1MYH A; 5HLQ A; 3ECZ A; 1JZM A; 4PQ6 A; 3MYN A; 1QPW A; 1PBX B; 1C7D A; 1SHR B; 3W4U B; 1O1I B; 1Y2Z B; 2QSS A; 1CH5 A; 1SI4 B; 3BCQ A; 2LH7 A; 4ILZ A; 4L2M A; 1LJW A; 1YEO B; 1V4U A; 2D5X A; 1MCY A; 3NFE B; 2R80 A; 3ZJH A; 1MKO B; 1J7S B; 1N9I A; 2ZS0 B; 1FN3 B; 4GZG A; 3QJE B; 1OUU A; 1YVQ B; 3UHW A; 1O1K B; 1HAB B; 4F6G A; 2QLS B; 3QM8 A; 3D4X B; 1MNO A; 2VLY A; 3G4Y A; 3DHT B; 1JP9 A; 2D5Z B; 4NI0 B; 4H2L B; 3HXN A; 2MGM A; 1UT0 A; 3FH9 A; 1BBB A; 3V2Z A; 1C40 A; 3ZJN A; 1J7W A; 1NS6 A; 4MQC A; 3VRG A; 3MJP A; 2VM0 A; 1AJ9 B; 1A0Z B; 1J52 A; 2AV3 A; 4YU3 B; 1DWS A; 2LH2 A; 1R1X A; 1VRE A; 1MLG A; 2D2M D; 5AZR A; 1JY7 A; 4N7P B; 1C7C B; 1URY A; 3CIU B; 1XY0 B; 3KMF C; 1Y4B A; 4G51 A; 1IBE A; 1HGB A; 1U7R A; 1XZU A; 1ITH A; 3PEL A; 3OVU C; 1H1X A; 1LH7 A; 4HRR A; 2DHB A; 2V1G A; 5CN5 A; 1RQ3 B; 1VXD A; 3TM9 A; 1BZ0 A; 3WHM A; 110M A; 1BUW B; 3WCV C; 2HHB B; 3G4U A; 1I3E A; 2Z6N A; 1BIN A; 5EUI B; 5CN6 A; 1MYI A; 1G0B B; 3HEO A; 5JDO C; 1C7B A; 1O1L B; 4NI1 A; 4HBI A; 1Y22 A; 3UHG A; 1AJG A; 1LH2 A; 2G11 A; 1GBV A; 1WVP A; 1MLK A; 3MOU A; 4FC3 A; 1Y31 A; 4HRT A; 1BAB B; 4IRO A; 112M A; 4M4B A; 1B86 B; 1CBL A; 2ZSY A; 1YGF B; 1TES A; 1BZZ B; 4IT8 A; 2MHB A; 1GZX B; 1A00 B; 1A0U B; 1DXV A; 1RVW B; 1CH7 A; 2LH6 A; 2ZFB B; 2ZSQ A; 1MYF A; 1QXD B; 2E2Y A; 3AT6 A; 3WCU C; 1FLP A; 4F68 A; 1SPG B; 5HU6 B; 1HLB A; 3O7N A; 4KJT A; 1O1J B; 2RAO B; 2W72 A; 4NZI A; 1Y7D A; 1MOC A; 1LA6 B; 1HSY A; 3ECX A; 2V1J A; 1Y46 A; 2H35 A; 3LHB A; 1IWH B; 1M6M A; 3RJN B; 3QJB B; 1EWA A; 3G4R A; 1V4X A; 1XZ7 A; 3HHB B; 2G0R A; 4KMV A; 1QI8 A; 3EDA A; 2HCO A; 3OO5 B; 101M A; 1YEQ A; 3WCV D; 3D1K A; 2VYY A; 1DM1 A; 1O16 A; 3G53 A; 2G3H A; 3LB3 A; 3UI0 A; 3P5Q A; 5JDO D; 1NAZ A; 4MBA A; 1Y4P B; 2QSP A; 2RI4 B; 3WCT A; 5JGG B; 1NQP A; 4U8U C; 1OUT B; 1G09 B; 1GDI A; 1M6C A; 1N9F A; 1DXU A; 2HHD B; 1XZ2 A; 1MLF A; 2HBS A; 4KMW A; 2ZS0 C; 1J40 B; 3WCU D; 1UVX A; 1O1P B; 2G0X A; 1JWN A; 1UFP A; 1Y7Z A; 2LHB A; 111M A; 1MLS A; 5JDO E; 1MLU A; 1CP0 A; 2D60 B; 1DLY A; 1HBS B; 3BJ3 A; 5CND A; 1CH2 A; 1IOP A; 4XS0 B; 2SPO A; 3A59 A; 2ZFO A; 3OZV A; 2QRW A; 1YOH A; 1UMO A; 2M6Z B; 1YOG A; 1UIW B; 1DXC A; 2QU0 A; 2VRY A; 2GTL A; 1VHB A; 1HDB A; 2AV0 A; 4C44 A; 5E6E B; 4MQK B; 1NIH A; 1MYZ A; 3ZJO A; 2MGI A; 1G0A B; 1XZV A; 2W6V B; 3D17 A; 1Y8I B; 5CHR A; 1KFR A; 4FH7 A; 2BK9 A; 1HDA B; 3D1A A; 5CNF A; 1GCV A; 5AB8 A; 5C6E B; 1GCW B; 3A0G A; 6HBI A; 1Y0D A; 2YRS A; 3QJD A; 1MLQ A; 3S1I A; 4F6F A; 2C0K A; 1RTE A; 1V5H A; 3GQR B; 1HBR A; 1Y0A A; 4ROL A; 108M A; 6HBW A; 1PMB A; 1QXE A; 5ILR A; 1HGC A; 2HZ3 A; 3EU1 B; 1JZK A; 3A9M A; 1NZ5 A; 1W92 A; 3IC0 A; 1YGD A; 5CN8 A; 1HBA B; 4JAC A; 1MYJ A; 3PI8 B; 1S5Y B; 2ZS0 D; 5E83 A; 1MDN A; 4O1T A; 1Y8W A; 4F6I A; 4TWU A; 5D5R A; 5C6Y A; 4NXA A; 1YFF A; 2PGH B; 3OJ1 A; 1SDL B; 4O4T A; 1XZ4 A; 3WTG A; 5EU2 A; 4AVD A; 4FH6 A; 1ABY B; 1GBU B; 1HGA A; 4G1B A; 1Q1F A; 1Y4V B; 4MXK A; 3S65 A; 1T1N A; 1Y4F B; 1DKE A; 3AQ6 A; 5HLU A; 4B3W A; 5EET A; 3UHD A; 2Z85 A; 1A3N A; 4DC8 A; 5KDQ B; 3M3B A; 1HBI A; 1A01 B; 1NXF A; 2O5S X; 2ZLT B; 3VRE B; 3PIA A; 1LFT A; 1MNJ A; 2R4W A; 3WFU A; 3UH7 A; 2DN3 B; 2IN4 A; 1SDK B; 2HHE B; 3GDJ A; 1DO7 A; 4NS2 A; 1XXT A; 4F4O B; 3LQD B; 3AQ5 A; 1HCO B; 1YHU C; 1ECO A; 1DO4 A; 4N7O B; 1CH4 A; 2MB5 A; 2G0V A; 1COH B; 1CIO A; 1Y0C A; 1CH3 A; 2BNL A; 2V1I A; 2NSR A; 2OLP A; 1FSL A; 5F0B A; 1YIH B; 2CMM A; 1YMC A; 3B75 B; 3NL7 B; 5AZQ A; 1Y5K A; 4NK2 A; 1CG8 A; 2ZSZ A; 1MLL A; 2O58 X; 1A9W E; 3GKT A; 3OZW A; 2MGF A; 2MGJ A; 1Y83 B; 1MBD A; 3PI4 A; 1BZ6 A; 4MQH A; 1YH9 A; 3FS4 B; 5M3S A; 3GQP B; 5EQM A; 1YMA A; 2G10 A; 5E29 B; 4M4A B; 1D8U A; 3BOM B; 1V9Q A; 2SPL A; 2GKM A; 1V4U B; 2VLZ A; 2Z6S A; 3UH5 A; 2O5M X; 1YEN A; 4F6J A; 1SWM A; 1SPE A; 2BLI A; 2EVK A; 3K9Z A; 1K1K B; 1LHT A; 4HHB B; 1CBM A; 2H8F A; 1LFL A; 1NWI A; 1RPS B; 2ZT3 A; 2VYZ A; 4ODC A; 3SDN A; 1KD2 A; 1FHJ A; 1A4F A; 1RQA B; 1VXH A; 3WCV A; 1WMU A; 2AUR A; 1CLS A; 3UHI A; 2GLN A; 1O1N A; 2HBE A; 1L2K A; 1C40 B; 1JP8 A; 1BZ1 B; 3QM9 A; 2EB9 A; 4AVE A; 2ZS1 B; 1Y4R A; 2FRJ X; 1YCB A; 5CNG A; 1VWT A; 1YHR B; 2AUO A; 3WFW A; 3R5I B; 4U8U B; 1O1O A; 4TWV A; 1VXF A; 1LFY A; 5MBA A; 2B7H A; 3HF4 A; 4KN3 A; 1Y5J A; 4MQG B; 3MKB A; 1YIE A; 2XYK A; 1Y8K B; 1Y8H B; 3BJ2 A; 3GQG B; 1DWT A; 4X0L B; 2ZLU A; 1BVC A; 1Y0W A; 3ODQ A; 1DXD A; 5ILP A; 3WCU A; 1CP5 A; 1AZI A; 2O5O X; 2AA1 B; 2BWH A; 5KER B; 1IT2 A; 1V07 A; 5CMV A; 1M9P A; 1MOB A; 2V1F A; 1S61 A; 1XYE B; 2NX0 A; 1HRM A; 2HBF B; 1JZL A; 1C7B B; 2EF2 A; 5JOM A; 2R50 A; 1RQ4 A; 4MQJ A; 4MBN A; 2GDM A; 1BJE A; 2NSS A; 1CMY B; 3UBV A; 1YE2 A; 4ROM B; 1MLJ A; 2GNV A; 3PT7 A; 2GKN A; 1JL6 A; 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4WCH D; 2H8D B; 1YHU B; 3VRF B; 3ZJS A; 1YZI B; 2OHA A; 1J3Y B; 1YMB A; 3GKV B; 4MU5 A; 4ESA B; 1ECD A; 1OFK A; 1DXT B; 1MLO A; 4BJA A; 1RQ3 A; 1JEB B; 1WLA A; 1JDO A; 1BUW A; 1LFQ B; 2HHB A; 1Y7C B; 2O5B X; 1Y7G B; 1MBS A; 2ZLX B; 3UHZ A; 2GTL B; 3UBC A; 4L7Y B; 5EUI A; 1YDZ B; 1G0B A; 3VHB A; 5SW7 B; 4C0N A; 1O1L A; 3UHE A; 2ZS1 C; 1A6K A; 3WR1 A; 2R4Y A; 5B85 A; 1Y01 B; 1YE0 B; 7HBI A; 3UHH A; 1BAB A; 2O5T X; 1NEJ B; 3HRW B; 3SDH A; 3EOK B; 4YU4 B; 4ZVA A; 1B86 A; 2IG3 A; 2EB8 A; 4PQB A; 4O4Z A; 2GRZ A; 1YGF A; 1BZZ A; 1NS9 B; 1Y4Q B; 1GZX A; 4FWY A; 5CNB A; 1A00 A; 3CY5 B; 1V4W B; 1RVW A; 2FAM A; 4JYQ A; 2ZFB A; 1QXD A; 1HBR B; 1G9V B; 4ROL B; 1SPG A; 1R1Y B; 3UHC A; 1HAC B; 4O35 A; 1O1J A; 3G4V A; 2RAO A; 4N7N B; 1JL7 A; 3E4N A; 3WFT A; 1DUK A; 1J3F A; 2BKM A; 1LHS A; 1J41 B; 1LA6 A; 2HBC B; 3A5A A; 1IWH A; 1DTM A; 2PEG B; 1VXB A; 3HHB A; 2BW9 M; 3LR7 A; 1YOI A; 3WTG B; 3QM6 A; 1FSX B; 2GL3 A; 3ZOL A; 1HGA B; 2ZWJ A; 3G52 A; 4SDH A; 1N9H A; 5D1V A; 1XQ5 B; 3K8B B; 2R1H B; 1QSI B; 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