The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
45
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MVNWAAVVDDFFQELFKAHPEYQNKFGFKGVALGSLKGNAAYKTLAGKVVDYINAWIGGSADAAGLASRHKGRNVGSAEFHNAKACLAKACSAHGAPDLGHAIDDILSHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Neural hemoglobin
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| publication title |
Carbonmonoxy structure of Tyr11Phe/Gln44Leu/Thr48Val/Ala55Trp Cerebratulus lacteus mini-hemoglobin
rcsb |
| source organism |
Cerebratulus lacteus
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| total genus |
45
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| structure length |
110
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| sequence length |
110
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-05-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QSP A; 1ABS A; 1Y7D A; 3HEN A; 1Y46 A; 3UH6 A; 1XZ5 A; 5KER A; 2ZFO C; 5CN7 A; 1MTI A; 1X46 A; 1HCO B; 1Y7Z B; 1OUT B; 1DO7 A; 2R80 B; 1MYH A; 4U8U B; 3RJN B; 1MBO A; 1A4F A; 1HJT A; 2SPL A; 4NI1 A; 5HLU A; 3ARL A; 1BBB A; 5M3S A; 1HBA B; 3MYM A; 1BUW A; 1DKE B; 4N8T A; 2PGH A; 1N9X A; 4ROM A; 5CMV A; 1Y7G B; 2PEG A; 1HBB B; 1QSI B; 3MJP B; 3M3A A; 1YVT A; 1MYZ A; 3M39 A; 3HC9 A; 3WCV C; 1O1L A; 2DN2 B; 1YEV B; 4FH6 A; 1XZV A; 1MYF A; 109M A; 1JEB B; 1Y4P A; 1YCA A; 2FRF A; 1CH2 A; 1FHJ A; 3ZJQ A; 3S66 A; 5HY8 B; 2LH3 A; 5B85 A; 1QXD A; 1S5Y A; 4HSX A; 1MNJ A; 2HZ3 A; 1CG5 A; 2W72 B; 1S0H A; 1VWT A; 2SPN A; 5CNG A; 2FRK X; 2ZFO A; 4NK2 A; 1HAC B; 2KSC A; 2SPM A; 1DLY A; 1RVW A; 1OBM A; 2D5X B; 1XCH A; 1XZ7 A; 1SPG A; 3NG6 B; 3A2G A; 1EBC A; 3OK5 A; 4N7O B; 5KDQ A; 3S1J A; 1YOH A; 3EDB A; 1GZX B; 3WCU C; 2MBW A; 4NXA A; 3EDA A; 4N7N B; 1CLS A; 3PI8 B; 1FLP A; 3UGY A; 3AQ7 A; 110M A; 1OUU B; 1A0U B; 3OO5 A; 1JZK A; 1IBE B; 2XKG A; 1HDB B; 1O1P B; 3GKT A; 3GOU A; 1OR6 A; 5HAV A; 1G9V A; 1VRF A; 1JW8 A; 3K8B A; 4ZVA A; 1QI8 B; 4MXK A; 1Y4F A; 2O5O X; 1NAZ A; 1NXF A; 1V75 B; 3NMM A; 2ZS0 C; 1LFY B; 5C6E A; 1Y0T A; 1Y0A B; 1YHU C; 6HBW A; 1MLJ A; 1G0A A; 3BJ2 A; 3GQR A; 5CN8 A; 3QM5 A; 1I3E A; 3CIU A; 2HBF A; 2B7H A; 4MQH A; 1YHR A; 2HBE A; 3CY5 A; 1CO9 A; 1ABY A; 2MGF A; 1A3O B; 3QJD B; 4C0N A; 3WCU A; 3V2Z A; 2BLI A; 3ZJO A; 1Y8I A; 3A5B A; 1DXV A; 3B75 B; 3WFX A; 4AVE A; 2ZT4 A; 3R5I A; 3IC2 A; 1YE2 A; 2V1I A; 1YDZ A; 1DTM A; 2MGK A; 3AT6 A; 3LB4 A; 1LHT A; 1Y4Q B; 2ZFO D; 1NWI A; 3HEP A; 2GNW A; 2MGC A; 1EMY A; 3WCW C; 1LFT A; 2QU0 A; 1MBC A; 5F0B A; 4C44 A; 2D2M B; 4TYX A; 5MBA A; 3HXN B; 1R1Y A; 1Y0W B; 3WHM B; 1O1N B; 1YEO B; 2ZS0 A; 5CNC A; 4H2L B; 4B3W A; 1SI4 B; 1YHU A; 5HLX A; 1A9W A; 4X0L B; 1HBS A; 4HRT A; 5IKS A; 5CNF A; 1V07 A; 2MGG A; 104M A; 1BZ0 A; 4HSW A; 1H97 A; 1IWH B; 4O4Z A; 1ECN A; 1Y09 A; 3VRE B; 2BNL A; 1UIW A; 2FAM A; 2MGH A; 1MOA A; 2W6W A; 1XQ5 B; 2G14 A; 3ZJI A; 3QM9 A; 1J7S A; 5JDO F; 4KN3 A; 1JL7 A; 1LFZ A; 1UC3 A; 1CH1 A; 3BJ1 A; 1O1K A; 2ZLT B; 4ROL A; 2DC3 A; 1M9P A; 2ZT1 A; 2HBS A; 1BZP A; 1U7R A; 1S6A A; 1Y8H A; 2W31 A; 1Y85 B; 1A0Z A; 1URV A; 3WCW A; 3WCP B; 1BVD A; 1LA6 A; 1A4F B; 3OGB A; 1B86 B; 2ZLV A; 4MQJ B; 1A6K A; 2MHB B; 1HGB A; 4FC3 B; 2R50 A; 1G09 B; 1GBV A; 4ROM B; 1RQA A; 3WCU D; 3DHR A; 4ODC A; 1ABW B; 2OHA A; 3PI4 A; 2Z85 A; 1J3Z B; 3GK9 A; 5ILP A; 4G1V A; 1FAW A; 1F5O A; 1SHR A; 1D8U A; 1V4U A; 1JL6 A; 2GTL C; 3AQ6 A; 4FWZ A; 1J3Y A; 1NWN A; 1UX8 A; 1LFQ B; 1YVQ A; 2G3H A; 1FSL A; 1MLO A; 1MWC A; 1Y8K B; 4WJG 1; 2R4X A; 2ZLX B; 2DN3 B; 3VRF A; 4MQC A; 1HGA B; 3AT5 A; 1XZ4 B; 3P5Q B; 2HZ2 A; 2ZLW A; 5AZQ A; 3LR7 A; 1DWT A; 1SDL B; 1NPG A; 1N9I A; 2ZS0 D; 1LJW A; 1YFF A; 2JHO A; 1YHU D; 3W4U B; 1BZ6 A; 5HU6 A; 1MLF A; 2ZS1 C; 2ZST A; 1YEN B; 3GKV A; 2WTH A; 103M A; 2DXM A; 3OZU A; 1GCV A; 4PQ6 A; 1Y5F A; 1R1X B; 1YH9 B; 1GBU A; 2VYW A; 1MGN A; 1CP0 A; 1MTK A; 1Y0C B; 3OO5 B; 1EBT A; 1XY0 B; 3UHC A; 5EUI A; 4YU4 A; 4G1B A; 1HHO A; 1RQ4 A; 2AUO A; 1S5X A; 3ODQ A; 2GTL A; 2HBD B; 1TU9 A; 2GKM A; 3QMA A; 3K9Z A; 1YE0 A; 5SW7 B; 3A0G A; 1DXT B; 2QSS B; 3FH9 B; 1DO1 A; 2VYY A; 3UHV A; 3ZJJ A; 1O1M B; 2ZSN A; 1EWA A; 3NL7 B; 2HHE A; 2D60 A; 3TLD A; 3WCW D; 3QQR A; 3UHS A; 1Y31 A; 3MYN A; 1GDK A; 2ZSZ A; 3UHB A; 3AG0 A; 2EKT A; 3FS4 A; 2DN1 B; 3GQR B; 1WLA A; 2HBF B; 1Y7C B; 3LB2 A; 2HBE B; 2Z6N A; 1Y4G B; 2ZS1 A; 3PI9 A; 2LH6 A; 1HGC A; 2H8D B; 2MGA A; 3UHG A; 2SPO A; 3QQQ A; 1LHS A; 1HV4 B; 3GYS B; 2MGE A; 1X9F C; 5CN4 A; 5D1V A; 1FN3 A; 5KKK A; 1CG8 B; 2QLS B; 4SDH A; 5ILR A; 1FSX B; 2XYK A; 1Y2Z A; 1V9Q A; 1GCW B; 1THB A; 1MWD A; 2XKI A; 1Y83 A; 1NPF A; 1XZU B; 3QZX A; 4UZV A; 3UHY A; 1A00 B; 3ZJR A; 1LFL A; 1TES A; 1YZI B; 2QU0 B; 1S69 A; 3D1A A; 1FDH G; 6HBI A; 2VEE A; 1VXE A; 5HLQ A; 1JY7 A; 1K1K A; 3OJ1 A; 1HBH A; 3G4R A; 2ZLU B; 3LR9 A; 4NS2 A; 4JAC A; 1JP6 A; 2O5S X; 3GDJ B; 2BWH A; 3ECL A; 3EU1 A; 1T1N B; 3D17 B; 1MKO B; 1MLN A; 3BJ3 A; 1EW6 A; 3NFE B; 2GTL D; 1KD2 A; 1X9F A; 1URY A; 1BAB B; 3BOM B; 3LHB A; 1OJ6 A; 2VLY A; 1Y5J B; 3PEL A; 4NI0 B; 1O1K B; 1V4X A; 4XS0 A; 1CPW A; 3A5G A; 3D1K A; 1M9P B; 3O89 A; 3DUT B; 1O1J A; 4DWU A; 1BZ1 B; 2QMB B; 3BCQ B; 2D5Z B; 2ZSP A; 1PBX B; 3WCT D; 1Y4R A; 1YIH B; 3LQD A; 2BMM A; 2EB9 A; 1BZR A; 4ODC B; 4PQB A; 1MYG A; 1C40 A; 1Y5K B; 2MYD A; 4OF9 A; 4OOD A; 1MNH A; 1RPS B; 3ZH0 A; 1A3N B; 106M A; 2IN4 A; 1NEJ B; 1DXU A; 3GQG A; 1MYM A; 1JDO A; 1Y4B B; 1DXD A; 5C6Y A; 1Y0D A; 1YIE B; 3HYU A; 3WTG A; 2R1H B; 1CMY A; 2GDM A; 2R4Y A; 4MQC B; 1V4W B; 3ASE A; 2VM0 A; 1KFR A; 2VRY A; 1Y45 A; 2AUP A; 1MTJ A; 3UGZ A; 3UH5 A; 1JF3 A; 3UHD A; 3HF4 B; 1LJW B; 2D2N C; 2AV3 A; 1O1I A; 2O5M X; 1AJG A; 1Y35 B; 1J7W B; 1Y8W B; 2RAO B; 2HHB B; 3PI3 A; 1W92 A; 2AV0 A; 1A6G A; 3A59 B; 2MGB A; 2DXM B; 1GCV B; 1QPW A; 3UHZ A; 1BZZ A; 2BW9 M; 1J40 B; 4L7Y A; 2EVP A; 1HDA B; 3GQP B; 4MPM A; 4YU4 B; 1HBR B; 1CQX A; 1RQ4 B; 2GTL B; 1NIH B; 5EOH A; 1J41 A; 4HRR A; 3A0G B; 4MQK B; 4MQG B; 2ZSO A; 2R4Z A; 2BLJ M; 1CBM A; 4F69 A; 2AA1 B; 1DWR A; 4DC8 A; 1WMU A; 1LFV A; 4XDI A; 3E55 A; 1OFJ A; 3PT8 B; 1U7S A; 3PIA B; 1CIO A; 1COH A; 2D2N A; 1ECA A; 5E6E A; 3WCV A; 2G0V A; 3WCT B; 1YGF B; 4IT8 A; 1NZ4 A; 5JDO D; 1CH5 A; 1YG5 B; 1MBI A; 2V1E A; 1X3K A; 4KJT A; 2CMM A; 3OZW A; 2HCO A; 5HBI A; 4ESA B; 3SZK A; 3PT7 A; 2ZFB B; 3MBA A; 1GLI B; 4O1T A; 2MGL A; 5CN6 A; 4F4O B; 3UHI A; 2BLH A; 1K0Y B; 3OO4 B; 3QJB B; 1C7B B; 4M4A A; 1Y83 B; 1SDK B; 1J52 A; 3AQ9 A; 3DHT B; 3VRG B; 1QXE A; 1MCY A; 1YGD A; 3D7O A; 1HRM A; 1XXT A; 1YEU A; 1YMA A; 2W6V A; 3E5O A; 1JY7 B; 4MBA A; 2QRW A; 1LH7 A; 3OZV A; 1IT3 A; 1J7Y A; 1XYE B; 4MXL A; 1HLB A; 2RI4 B; 2QFN A; 3IC0 B; 1LTW A; 4H07 A; 1C7D A; 3G4Q A; 3BA2 A; 3UHQ A; 4TWV A; 5E29 A; 3QJE B; 1MNO A; 1OR4 A; 2DHB B; 3HHB B; 1VHB A; 5E83 A; 2O5L X; 4IRO A; 1YOI A; 4TWU A; 3MKB A; 3ECX A; 2HHD A; 4VHB A; 3K3U A; 1NS9 A; 1QSH A; 1BIJ B; 3UBC A; 1YHE A; 1IRD B; 4O35 A; 1C7C B; 1CH9 A; 2QFK A; 2HBC A; 4B4Y A; 3ZJN A; 3D4X A; 2H35 A; 3ZOL A; 3DR9 A; 3ED9 A; 1NQP A; 3QJC A; 1VXA A; 3AQ8 A; 3G52 A; 5EU2 A; 2H8F A; 1A01 B; 1HAB A; 3UHN A; 2G0Z A; 3MJU B; 3QM8 A; 2M6Z B; 5CHQ A; 2D2N D; 3WCV D; 1BIN A; 3M38 A; 3WR1 A; 3MN0 A; 4G51 A; 3A5A A; 2ZT2 A; 2QSP B; 1Y7D B; 1RQ3 A; 1Y46 B; 3G4U A; 1XZ5 B; 4U8U C; 5KER B; 3V2V A; 4LPI A; 2O58 X; 3UHU A; 3HRW A; 1CO8 A; 1IDR A; 2YRS A; 3S65 A; 3GQG B; 1G0B A; 1MBD A; 3G4V A; 4NI1 B; 1H1X A; 3UBV A; 4NXC A; 1Y0D B; 1BBB B; 3UHT A; 1VXG A; 3KUN A; 1N9H A; 2G0X A; 1BUW B; 1PMB A; 4N8T B; 2PGH B; 4MQI A; 4N7P A; 2PEG B; 1KR7 A; 3WFU A; 3ZJP A; 2OIF A; 1Y45 B; 3NML A; 3HEO A; 1YVT B; 1O1O A; 3RJ6 A; 5F2A A; 1O1L B; 2R4W A; 1M6M A; 2W72 C; 1XZV B; 1HBG A; 1Y4P B; 1FHJ B; 3S66 B; 1HCO A; 1Y7Z A; 1YMB A; 1OUT A; 4MBN A; 1QXD B; 1S5Y B; 2R80 A; 4U8U A; 1CG5 B; 1S0H B; 1VWT B; 1NS6 A; 2ZFO B; 3ZOM A; 1V5H A; 2MGD A; 1HBA A; 2VLZ A; 1RVW B; 2MGM A; 1XZ7 B; 1SPG B; 1DKE A; 3AQ5 A; 5KDQ B; 1J41 B; 1Y7G A; 4HRR B; 1HBB A; 1QSI A; 1GDI A; 3MJP A; 1MNI A; 2EF2 A; 1CLS B; 2DN2 A; 1YEV A; 1JEB A; 4F6I A; 2LH7 A; 1MOH A; 3UHW A; 5HY8 A; 2ZSR A; 3GOU B; 3WCV B; 2GRH A; 1G9V B; 3A9M A; 1UVX A; 3K8B B; 1O16 A; 2W72 A; 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2NRL A; 3WHM A; 1O1N A; 1YEO A; 2OLP A; 2HBS B; 5ILM A; 1UFP A; 101M A; 4H2L A; 1SI4 A; 1Y8H B; 4M4B A; 1A0Z B; 3WCW B; 1LA6 B; 4X0L A; 5B84 A; 3MVC A; 2ZLV B; 1Z8U B; 1HGB B; 1IWH A; 2BK9 A; 1Y22 A; 2ZS1 D; 1GBV B; 1RQA B; 3DHR B; 3ZHW A; 2NSR A; 2ZSY A; 1FAW B; 1MBN A; 1O1O B; 2VYZ A; 1FCS A; 1SHR B; 1V4U B; 4DC7 A; 1JP9 A; 3TM3 A; 2V1K A; 1J3Y B; 4ILZ A; 108M A; 1YVQ B; 4YU3 A; 2ZLT A; 1HDS A; 2AUR A; 3KMF C; 3ECZ A; 3VRF B; 1Y85 A; 1AJ9 A; 1YEQ A; 3AT5 B; 3WCP A; 1NS6 B; 5JGG A; 2ZLW B; 1B86 A; 4MQJ A; 2MHB A; 1NGK A; 1YFF B; 4FC3 A; 1RSE A; 1DO4 A; 2NX0 A; 1G09 A; 5EYJ A; 107M A; 1ABW A; 5HU6 B; 1J3Z A; 1RTE A; 3GKV B; 4L2M A; 112M A; 1Y5F B; 7HBI A; 1GBU B; 2GLN A; 1CBL A; 1MLR A; 1LFQ A; 1X9F D; 5EUI B; 1HHO B; 4QAU A; 1Y8K A; 3ODQ B; 1S5X B; 3R0G A; 2ZLX A; 2DN3 A; 1N9F A; 1HGA A; 1BJE A; 2OH9 A; 1XZ4 A; 3P5Q A; 1YE0 B; 5AZR A; 5CND A; 2D2M D; 1JZM A; 1MOD A; 3KMF A; 1SDL A; 2W6X A; 4JYQ A; 1MYI A; 2HHE B; 3G4Y A; 5EET A; 2D60 B; 2O5B X; 4F6D A; 3W4U A; 3G46 A; 1RTX A; 1Y31 B; 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