The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
145
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structure length |
145
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Chain Sequence |
ADFDAVLKCWGPVEADYTTIGGLVLTRLFKEHPETQKLFPKFAGIAQADIAGNAAVSAHGATVLKKLGELLKAKGSHAAILKPLANSHATKHKIPINNFKLISEVLVKVMQEKAGLDAGGQTALRNVMGIIIADLEANYKELGFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
High Resolution Structures of Blackfin Tuna Myoglobin
rcsb |
| total genus |
61
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| structure length |
145
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| sequence length |
145
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-02-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4FC3 B; 1U7R A; 2EVK A; 2FRI X; 2V1G A; 2C0K A; 4GZG A; 3MJU A; 3UBV A; 1A6N A; 1HHO B; 1G08 A; 1YOG A; 2BWH A; 5SW7 A; 1XZ2 B; 3FS4 A; 2MYE A; 2BW9 M; 5HLQ A; 2G14 A; 1BZP A; 2QLS A; 2ZLT B; 3TM3 A; 3PT7 B; 5C6E B; 2MGI A; 5KER A; 4F69 A; 4BJA A; 1HBI A; 3WCT A; 4UZV A; 1M9P B; 1HLM A; 1IWH B; 3NFE B; 1YHU D; 2Z6S A; 3W4U A; 2HBD B; 3EU1 A; 3WFW A; 3A5B A; 1JY7 A; 2AUP A; 1NEJ A; 1OUT B; 1X46 A; 3ARJ A; 1Y0C A; 2EVP A; 2ZST A; 1NIH A; 3NMM B; 4MAX A; 3VHB A; 5B85 A; 3WI8 A; 1YIE B; 4MQC B; 1IT2 A; 5F2A A; 3G46 A; 1IRC A; 2R1H A; 2GRZ A; 1Y4V B; 1YMB A; 1VWT B; 1BZR A; 3OGB A; 1RQ4 B; 4HRR A; 4MQI A; 1MLM A; 1O1J A; 1Y0T A; 3WCW D; 1X9F A; 2PGH B; 1RQ3 B; 3E55 A; 3OO4 B; 1XZ4 A; 2B7H A; 1GCV B; 1K1K B; 1YVT A; 1DXU A; 3E5I A; 2ZSY A; 3NG6 B; 1G09 A; 1HDS A; 1HV4 B; 1YZI A; 3DR9 A; 1LH3 A; 1CQ2 A; 3QJB A; 1MOB A; 3WCV B; 1YG5 A; 1HDA A; 5EE4 C; 1HBH A; 2O5O X; 2RI4 A; 2D2M D; 3HF4 A; 1BZ1 A; 4JYQ A; 4ROM B; 1DXD A; 1SDK A; 1V4W B; 3MYM A; 2VLY A; 1RTX A; 2W72 C; 1YGF B; 1A01 B; 1CO8 A; 1QXE A; 1BZZ A; 4WJG A; 4AVD A; 4F68 A; 2ZLU A; 3WFU A; 2QMB A; 4HHB A; 1N9H A; 1HGB B; 4OF9 A; 2GNV A; 3LB4 A; 4MQG A; 3IC2 B; 3ZOL A; 103M A; 102M A; 1Y7C B; 2D2N D; 2NSR A; 3HXN A; 1HGA A; 1A4F A; 1COH B; 4B3W A; 3PEL A; 5JDO F; 1YEQ B; 4NXA A; 1HBG A; 1IOP A; 1Y4Q A; 3LB3 A; 1EWA A; 1YE0 A; 1LH5 A; 3QQQ A; 1OJ6 A; 1LUE A; 4FWX A; 2GTL A; 1LHS A; 1MWC A; 3A2G A; 2W31 A; 3TLD A; 1RVW B; 4ZVB A; 2EKU A; 2MYB A; 3BJ3 A; 4XS0 B; 5JDO E; 5CNG A; 2ZFB B; 3ZJH A; 4PQ6 A; 1Y5J A; 2ZWJ A; 3PI1 A; 1IRD B; 1HCO B; 3WCU A; 3GK9 A; 1Y0A A; 3GOU A; 1GVH A; 4XDI A; 2ZSN A; 1YHU B; 4YU4 B; 2ZSX A; 4UUR A; 2G10 A; 2H8D B; 3AT6 A; 2VHB A; 2HHD A; 3DHT A; 1ABY B; 3IC0 A; 1O1M A; 2XKH A; 1HBR B; 1DKE A; 3G4W A; 1Y46 A; 3A9M A; 1HBB B; 1MLK A; 1A0Z A; 1A3N A; 1YE2 A; 2ZFO A; 3GDJ B; 1Y85 B; 1YGD A; 3B75 A; 2VYZ A; 2NX0 A; 1Y8I A; 3SZK A; 1Y35 B; 1NZ3 A; 4U8U C; 1G0B B; 5KDQ A; 2ZS1 C; 4F4O A; 1O16 A; 1Q1F A; 1S61 A; 5EOH A; 1UX8 A; 1VXB A; 2R4Z A; 1FAW A; 1WMU B; 1Y0D A; 2ZS0 B; 1J7S B; 3GKV A; 2QSS A; 1Y09 B; 2V1H A; 1J40 B; 1SHR A; 4IRO B; 1GBU A; 3K8B B; 3WCP B; 1O1O B; 1M6M A; 2BNL A; 4N7P A; 1DTI A; 1MOD A; 3VRG B; 1A0U A; 2KSC A; 5EUI B; 4HBI A; 3G4R A; 3LQD A; 2ZT4 A; 3IA3 B; 2EF2 A; 2LH1 A; 1JP8 A; 1U7S A; 4L2M A; 2GDM A; 2D2M B; 3VRF A; 1JPB A; 1HGC A; 1H1X A; 1G0A A; 1YVQ A; 3PI8 A; 3KMF A; 4KJT A; 4NI1 A; 2R4X A; 1UIW A; 1RQA A; 4O1T A; 2CMM A; 1QSI B; 2EB9 A; 2DN1 A; 2G0R A; 5CN7 A; 2VLX A; 1N9X A; 3ZH0 A; 1MZ0 A; 1MLH A; 2MHB B; 1YH9 B; 2D2N B; 2AV3 A; 3PT8 A; 1MBS A; 1Y0W B; 2G11 A; 3UHS A; 1NS6 A; 2E2Y A; 3GYS A; 1O1L B; 3QM8 A; 2H35 A; 4DC8 A; 3SDH A; 3ASE A; 1O1I B; 4N8T B; 1XYE B; 5HLX A; 1ABW A; 1XZV B; 1CG5 A; 5E6E B; 3EOK A; 1JW8 A; 1XY0 B; 1X9F D; 2DXM A; 1FN3 A; 4DWT A; 3UH7 A; 2DN3 B; 2GL3 A; 1QXD A; 1JEB A; 5CN8 A; 1QSH A; 1Y4R B; 3UH6 A; 1DUK A; 1YFF A; 1YCA A; 1XZ7 B; 2YRS A; 1DTM A; 1J41 B; 2O5Q X; 3LB1 A; 1MNO A; 1J7Y A; 4ROL B; 1VXA A; 1XXT A; 3G4U A; 101M A; 2FRJ X; 4F6F A; 2ZSO A; 1V07 A; 1URV A; 3QM7 A; 2HBC B; 1J3Y B; 1MKO A; 5D1V A; 1RSE A; 3S66 B; 2MYC A; 1DLY A; 3WCV C; 5CMV A; 1W92 A; 3A5G A; 2BK9 A; 1R1Y A; 1CBL A; 1XZU B; 1TES A; 4F6B A; 3A5A A; 1KD2 B; 1BIN A; 1G08 B; 1Y22 B; 3HRW B; 3CY5 A; 5HY8 A; 2HHB B; 5CNE A; 1Z8U B; 2GTL D; 1MLR A; 1C7C A; 4C0N A; 1MCY A; 3QQR A; 6HBW A; 1Y83 B; 4MPM A; 2R80 A; 5KER B; 1FDH G; 1KFR A; 2AUR A; 4HSX A; 2V1J A; 1O1P B; 3HHB A; 3QJD B; 1MNI A; 2ZSS A; 4FWY A; 3HYU B; 3OO5 A; 4NK2 A; 1IDR A; 2BMM A; 1MBI A; 1CP5 A; 1NEJ B; 3MBA A; 3EDA A; 2MYA A; 2OHA A; 1BIJ B; 1CG8 A; 3VAU A; 3UH5 A; 4M4A A; 1HSY A; 1Y0C B; 1MLN A; 1OFJ A; 3G53 A; 1B0B A; 1HDB A; 3CIU B; 1C40 B; 4G51 A; 2Z6N A; 1A3O A; 3LR9 A; 2XKG A; 1MDN A; 1CMY B; 2ZFO D; 2M6Z A; 4MQJ A; 4YU3 B; 1LH2 A; 3BCQ A; 1CO9 A; 5CNB A; 3AT5 A; 1B86 A; 1MBN A; 2R4Y A; 1IBE B; 1MLO A; 1Y31 B; 5D5R A; 1LTW A; 2QU0 B; 3ZJS A; 4ESA B; 1CIO A; 1UVX A; 3UH3 A; 1ABS A; 2D6C A; 2RI4 B; 3ARL A; 3HF4 B; 1GDL A; 2ZS0 C; 1SDK B; 1HBS A; 3ONZ B; 3QJC A; 5CHQ A; 1DUO A; 1QXE B; 4MQH B; 2VYW A; 3R5I B; 3BOM A; 1BZZ B; 2RAO B; 1CQX A; 1AJH A; 4HHB B; 1MYH A; 1BUW A; 1MBC A; 5JOM A; 1Y7Z A; 1LJW B; 2D2M C; 1VRF A; 4O35 A; 1R1X A; 4TYX A; 3HXN B; 3PEL B; 2FRK X; 1Y4Q B; 1YE0 B; 3NL7 A; 1TU9 A; 2LH5 A; 3O89 A; 1A00 A; 1N9F A; 1GLI A; 5HU6 A; 1MTI A; 1GDK A; 1NQP A; 3D1A B; 1NS9 B; 1MYZ A; 3G4V A; 3MJP A; 1FSX A; 4NS2 A; 1GBV B; 1THB B; 4TWV A; 2D2N C; 2ZT3 A; 3DUT B; 1Y5J B; 1NXF A; 4TWU A; 2O5M X; 1UMO A; 1J3Z A; 2W72 A; 1LFL A; 1WLA A; 1BBB B; 1YHE A; 1MOC A; 1VXD A; 3MKB A; 110M A; 4ODC A; 2HBF A; 1LFZ B; 4G1V A; 1T1N A; 4KMW A; 3WR1 B; 2ZLV B; 3UHN A; 2HBE A; 3IC0 B; 1NAZ A; 3PI2 A; 3A0G B; 1BAB A; 1UVY A; 1A9W A; 1Y46 B; 1CIK A; 2FAM A; 1Y4G A; 3QZZ A; 1A0Z B; 3D7O B; 1A3N B; 1DO3 A; 2AV0 A; 1FHJ A; 5CNF A; 1LFT A; 2ZFO B; 4F6G A; 4F6D A; 1VXE A; 3S1I A; 2G0V A; 1Y8I B; 2NSS A; 1Y01 B; 1JP6 A; 3DHR B; 1K0Y A; 1LFY A; 1YDZ A; 1D8U A; 3GQG B; 3OK5 A; 3WTG A; 3ECX A; 1SPE A; 5AZQ A; 1Y4F A; 5HAV A; 1Y8W A; 3K3U A; 3FH9 A; 1DXV B; 1Y4B A; 1YHR B; 1GBU B; 3QMA A; 2ZT2 A; 1Y5K A; 1GCW B; 3UHY A; 1GZX A; 1RPS A; 3LQD B; 1EBT A; 2W6V A; 1NZ5 A; 4B4Y A; 3VRF B; 1QI8 B; 1WVP A; 1FLP A; 1G0A B; 3GQP A; 2QFK A; 1MLU A; 2MGF A; 1Y7D A; 1XZ5 A; 3PI8 B; 3QM5 A; 1EBC A; 1LFQ A; 1Y4P A; 1CLS B; 1UIW B; 1DO4 A; 4U8U A; 3D4X A; 1DWT A; 2ZS1 A; 1PBX A; 4KN3 A; 1YEV A; 1JDO A; 3PT8 B; 1GDI A; 3GYS B; 2AUO A; 1MTK A; 4FC3 A; 3M38 A; 1ECA A; 2G3H A; 1ABW B; 2MGH A; 1C7B B; 1S56 A; 1VHB A; 1Y8H B; 1VRE A; 2HBS B; 3ZJQ A; 5CNC A; 1HHO A; 3V2Z A; 1XZ2 A; 1YFF B; 4WJG 1; 3KUN A; 1LFV B; 3BA2 A; 1H97 A; 2OHB A; 2ZLT A; 3PT7 A; 1V4U B; 3AQ8 A; 5C6E A; 4WCH D; 1V9Q A; 3GLN A; 2HZ2 A; 1HRM A; 3HC9 A; 104M A; 2V1F A; 3PI4 A; 1M9P A; 1SPG B; 1JF4 A; 2GNW A; 3PIA B; 1IWH A; 3NFE A; 3OVU C; 2D60 B; 1V75 B; 1UX9 A; 2MGL A; 4FWZ A; 2V1E A; 2VYY A; 1NZ2 A; 3NMM A; 2R4W A; 4PNJ A; 1S5X B; 4MQC A; 1A9W E; 3M3A A; 1DLW A; 3WCW B; 5JDO D; 3QJE A; 1FCS A; 1LA6 B; 1Y8K A; 1Y4V A; 5JGG B; 1VWT A; 2ZLW B; 1OUU A; 5MBN A; 3MOU A; 2H8F A; 1RQ4 A; 2GKN A; 5C6Y A; 3ORD A; 3WCT D; 3HHB B; 2VLZ A; 2MB5 A; 3ZJO A; 1VXC A; 1MYT A; 2PGH A; 3OO4 A; 1GCV A; 1DWR A; 1XQ5 B; 3UBC A; 1HBA B; 1K1K A; 1OBM A; 3OO5 B; 3P5Q B; 2D5Z B; 3ZJL A; 4H2L A; 1AJ9 A; 1BZ6 A; 2XKI A; 1HV4 A; 1XCH A; 4M4A B; 3ODQ B; 3WCV A; 5ILP A; 2GRH A; 3BJ2 B; 1YIH B; 1V4W A; 3WHM B; 3V2V A; 4O4Z A; 1DXT B; 1YGF A; 1A01 A; 1CP0 A; 4HSW A; 4M4B A; 2M6Z B; 4MQJ B; 1HGB A; 5CND A; 2V1K A; 4X0L A; 4FH7 A; 3K9Z A; 1OFK A; 1BZ0 B; 1FSL A; 3LHB A; 1Y2Z A; 1SDL A; 1UT0 A; 1COH A; 1YEQ A; 3TM9 A; 3ED9 A; 2QSP A; 3D1K B; 3S65 B; 1EMY A; 3VRE A; 2WTH A; 1AJG A; 1GJN A; 5E83 B; 1SI4 B; 1MLF A; 4XS0 A; 2D5X B; 4QAU A; 1QPW B; 1HAB B; 2ZFB A; 1O1N B; 1HJT A; 1S69 A; 1NWI A; 1LH6 A; 1YEN A; 3QJC B; 1IRD A; 4L7Y B; 3BOM B; 1BJE A; 112M A; 4YU4 A; 3MYN A; 1OR6 A; 1JWN A; 107M A; 3UI0 A; 3D17 A; 2H8D A; 1N9I A; 3RGK A; 1Y7Z B; 4U8U D; 1Y7G A; 5CN5 A; 2O5T X; 5F0B A; 2GKM A; 3MJU B; 1HBB A; 1LHT A; 3NL7 B; 5SW7 B; 3FS4 B; 1CH4 A; 4N7O A; 2QLS B; 2JHO A; 1F65 A; 1Y35 A; 2HZ3 A; 1G0B A; 2O5L X; 3ARK A; 2MBW A; 1S0H A; 4NI0 A; 3UHZ A; 5EU2 A; 1O1K A; 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2PEG A; 106M A; 1MYF A; 1HGA B; 1CH7 A; 1J3Y A; 1A4F B; 1EW6 A; 3S66 A; 1A6G A; 3A59 A; 3OJ1 A; 1CBM A; 1ECD A; 2GTL B; 3PI9 A; 1XZU A; 3BJ3 B; 1KD2 A; 1Y5F A; 3UHB A; 2DHB A; 1HAC A; 1Y22 A; 2AA1 A; 5CN9 A; 3HRW A; 2HHB A; 3WCU B; 2EKT A; 1Y0A B; 3GOU B; 1YEO A; 3WFX A; 3KUO A; 1CH3 A; 1Y83 A; 2VEE A; 5ILM A; 1O1P A; 3PI3 A; 1M6C A; 3QJD A; 3AT6 B; 5AZR A; 2HHD B; 3UHD A; 3DHT B; 3WFT A; 3E5O A; 1O1M B; 1DKE B; 2SPN A; 3HYU A; 1JF3 A; 2WY4 A; 1DM1 A; 1ECO A; 109M A; 1YE2 B; 1BIJ A; 4JAC A; 3MN0 A; 1J7W A; 1YGD B; 3B75 B; 1VXF A; 4VHB A; 3SZK B; 1CH2 A; 2MGK A; 5B84 A; 5KDQ B; 4DWU A; 4F4O B; 3ZJR A; 3CIU A; 1A6K A; 1C40 A; 3UHC A; 2HZ1 A; 3QJE B; 1FAW B; 1Y8K B; 1MBD A; 1GDJ A; 1CMY A; 1Y0D B; 1YCB A; 3GKV B; 2QSS B; 1OUU B; 1SHR B; 1MNK A; 1F63 A; 4YU3 A; 4NXC A; 4F6I A; 5E29 A; 2H8F B; 1I3E A; 1MWD A; 4N7P B; 1A0U B; 1S5Y A; 1YEU A; 1MYI A; 2ZS0 D; 5JDO C; 1MBO A; 5CN4 A; 1DXC A; 3BJ1 A; 2ZLX A; 2HBG A; 1UC3 A; 3UHK A; 1IBE A; 1F5O A; 5KKK A; 1Y31 A; 4H2L B; 1HGC B; 1AJ9 B; 2QRW A; 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