The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Direct observation of ultrafast collective motions in CO myoglobin upon ligand dissociation.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
64
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-07-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MBO A; 1YEU A; 4HRT A; 3SZK A; 2BLJ M; 1KFR A; 2AA1 A; 1QXD A; 2HZ2 A; 1O1K A; 4FC3 B; 2R1H A; 5HU6 A; 4F6I A; 1CG5 B; 4M4A B; 3SZK B; 1LFT A; 3KUO A; 3QM6 A; 1YEO A; 4U8U D; 3WCV A; 2DN1 A; 4H0B A; 4O4Z A; 2ZT1 A; 4F6J A; 1O1K B; 2R1H B; 5HU6 B; 3ZJJ A; 1RQA B; 3A5G A; 3GQR B; 1NZ5 A; 2GKN A; 2GL3 A; 1A3N A; 1BZ1 A; 1VRE A; 3WCV B; 2DN1 B; 4F6B A; 3DHR B; 3RGK A; 3PEL A; 1Y8W B; 1XYE A; 4HRR B; 2QMB A; 1DUO A; 3BJ3 A; 1ABY A; 1A3N B; 4C44 A; 1BZ1 B; 2MHB B; 3UHZ A; 4O1T A; 3PEL B; 1FSX A; 2SPN A; 1RQ4 A; 1VWT A; 2W6Y A; 1K0Y B; 1YZI A; 2SPO A; 2OH9 A; 2W72 B; 3BJ3 B; 4FWZ A; 1ABY B; 102M A; 1SWM A; 4MQK A; 5JGG A; 2OLP A; 1R1X B; 1IWH A; 5EE4 D; 3ZJQ A; 2V1K A; 1X3K A; 1VWT B; 107M A; 5CNB A; 1YHR A; 1Y5F A; 1DLW A; 1DUK A; 3WFX A; 4L2M A; 3WCT D; 1VHB A; 3LB2 A; 1J7S A; 1M6M A; 6HBW A; 4F6F A; 1EWA A; 1YHR B; 4F6D A; 1YH9 B; 1M9P A; 1XZ2 A; 1S0H B; 2B7H A; 1S56 A; 1CO9 A; 1S61 A; 1DXD A; 3G4Q A; 3D4X B; 3SDH A; 1PBX A; 2XKI A; 5MBN A; 2GTL A; 1T1N A; 1FN3 B; 3MBA A; 3K3U A; 1V4X A; 1XZ2 B; 1YGF A; 3ASE A; 5EUI A; 2GLN A; 3WI8 A; 2AUP A; 5CHQ A; 2VLX A; 1PBX B; 3ZOM A; 1Y7G B; 2DHB A; 2D6C A; 3VRG A; 1VXA A; 4MQI A; 1JEB A; 1GDJ A; 1S6A A; 4F68 A; 1MYH A; 1Y0T A; 2KSC A; 3QM9 A; 1J40 B; 3HEP A; 1O1O B; 3QQQ A; 2DHB B; 2ZS0 D; 3VRG B; 1I3E A; 1JEB B; 4MBN A; 2MGB A; 3ED9 A; 1WMU B; 1HBH A; 4QAU A; 1Y4F A; 2IN4 A; 1HV4 A; 3PI8 A; 1HGC A; 2MGC A; 3S65 A; 2MGK A; 3HYU B; 1YVQ A; 1O1N B; 5ILE A; 2VLZ A; 4XS0 B; 1A9W A; 3QM5 A; 4N7P A; 1OFJ A; 1HV4 B; 2ZLX A; 3NMM B; 2XYK A; 3PI8 B; 1CP0 A; 1JW8 A; 1HGC B; 1YE0 A; 3G4V A; 1C40 A; 1MLM A; 1HRM A; 2G0Z A; 1LH7 A; 3MKB A; 2LH5 A; 3S65 B; 3UHE A; 3WCW D; 1YVQ B; 1NPG A; 1SPG B; 3HF4 B; 1RPS B; 1BZ0 A; 4N7P B; 5KDQ A; 1EBC A; 2QSS A; 4BJA A; 2D2N C; 1C40 B; 1OUT B; 1MBN A; 1QSH A; 4ESA B; 4U8U C; 1YEV A; 3IC0 A; 1LH2 A; 3UH6 A; 1BZ0 B; 1LUE A; 3WR1 A; 2QSS B; 1JY7 B; 1GCV A; 3FS4 A; 1ECD A; 2LH6 A; 1QSH B; 3UHC A; 2DN2 B; 3MJU A; 3VAU A; 2ZFO D; 4HSW A; 5CN4 A; 1YMB A; 3WR1 B; 4HHB A; 4X0L A; 2HHB A; 2AUR A; 1YEQ A; 1YCB A; 1DXV B; 4C0N A; 3G4R A; 4X0L B; 2HHB B; 3ODQ A; 3D1A A; 1JP6 A; 3OO5 B; 2G11 A; 2HBD B; 1CH9 A; 1A0U B; 3WCU A; 1SDK A; 4JYQ A; 1Y8K A; 4NK2 A; 4MAX A; 1MZ0 A; 1MBD A; 1HJT A; 2ZSZ A; 3ODQ B; 1VXC A; 3D1A B; 2EVP A; 3IC2 A; 1MLS A; 3BCQ A; 3R5I A; 1YHE A; 3QM8 A; 5C6E A; 6HBI A; 1HBA A; 1B86 A; 3WCU B; 1SDK B; 1OR6 A; 2RI4 A; 3A2G A; 1HGA B; 1BBB A; 3IC2 B; 1MNO A; 4NI0 A; 1MWB A; 1YHE B; 1EW6 A; 5C6E B; 3QQR A; 1WLA A; 2EB9 A; 1CMY A; 4ODC A; 4U8U B; 4NI0 B; 1A01 A; 3AQ9 A; 1S69 A; 1YDZ B; 1A9W E; 3ZJO A; 3LB1 A; 1CMY B; 1HBR A; 4NXC A; 1J7Y A; 2BWH A; 4H07 A; 3OK5 A; 2O5Q X; 2HHD A; 3ZH0 A; 1YMC A; 2R80 A; 2HBS B; 5CHR A; 3ONZ A; 1J7Y B; 3GOU A; 1UIW B; 1Z8U B; 3E4N A; 3UH7 A; 3HEO A; 2MYA A; 1RTX A; 1UC3 A; 3ONZ B; 1MKO B; 4DWU A; 3AT5 A; 1UMO A; 2WTG A; 3AG0 A; 1FDH A; 2EKU A; 2DN3 A; 2G0R A; 3WCT A; 3D17 A; 1M6C A; 3LB4 A; 1Y31 B; 3ZJR A; 2ZSY A; 1ITH A; 3ZJM A; 3QMA A; 5CMV A; 1G0B A; 3AT5 B; 3GQP A; 3A9M A; 1EMY A; 2DN3 B; 4G1B A; 3WCT B; 1RTE A; 1Y22 B; 3D17 B; 1IT3 A; 1F65 A; 1OFK A; 1YFF A; 4GZG A; 1IDR A; 1CH7 A; 1FHJ B; 2ZLW B; 4UZV A; 4B3W A; 1JP8 A; 1MWC A; 1G0B B; 1V07 A; 2YRS A; 2EKT A; 3UHG A; 4ILZ A; 1O1L A; 1LH1 A; 3G4U A; 1GBV B; 3CIU B; 2HBF B; 1BIJ B; 4YU3 B; 2ZS1 D; 1J52 A; 3O89 A; 2VLY A; 3BA2 A; 3A0G B; 3ARL A; 3ZJP A; 1DKE A; 1O1L B; 2ZS0 A; 1GJN A; 3QJD A; 2ZFO C; 1Y0A A; 4O4T A; 5EET A; 1XZ4 A; 3HRW B; 5CNF A; 2QSP A; 3W4U A; 2M6Z A; 2OH8 A; 3WCP A; 3AT6 B; 1DKE B; 3OZW A; 2ZS0 B; 1Y0W A; 1CO8 A; 3QJD B; 5ILR A; 1XZ4 B; 1HAB B; 1V5H A; 2M6Z B; 2G10 A; 1MYF A; 1F63 A; 1G09 B; 1XXT A; 4NK1 A; 1GCW A; 1UT0 A; 3WCW A; 3UHS A; 1MDN A; 4TWV A; 2Z6T A; 4WJG A; 2MGF A; 5E29 A; 1XXT B; 1GCW B; 3NFE B; 5JOM A; 1MTK A; 2ZLV B; 3WCW B; 2O5O X; 1SDL A; 1NWI A; 2NRM A; 1YEN A; 5E29 B; 3UHT A; 1O1P B; 1MNI A; 1AZI A; 1BZZ A; 1DWR A; 1SHR A; 2D5Z B; 1CG8 A; 1COH B; 1G0A A; 2D2M C; 1JZM A; 3GK9 A; 1L2K A; 1CQX A; 2MGH A; 1SHR B; 3ECX A; 1GLI B; 1CG8 B; 1YOG A; 2QLS A; 5HLX A; 3LR7 A; 1CG5 A; 4N7N B; 4M4A A; 2ZFO B; 1MLN A; 2V1H A; 2D60 B; 104M A; 3UHX A; 1GDK A; 4MQC A; 1AJH A; 1BUW B; 1MOD A; 1MWD A; 2MYE A; 2QLS B; 1UVY A; 2D2N D; 1RQA A; 3PI2 A; 3GQR A; 3E5O A; 2Z6S A; 4O35 A; 5ILM A; 4MQC B; 1J3F A; 3DHR A; 1GDI A; 2GDM A; 3ZOL A; 1YHU C; 1Y8W A; 1PMB A; 4HRR A; 3BJ2 A; 2ZLU B; 3H58 A; 2AV3 A; 2MHB A; 2MBW A; 3HHB A; 3IA3 B; 3MN0 A; 2ZSN A; 1DO3 A; 3GDJ A; 1FLP A; 1K0Y A; 3BJ2 B; 1LFZ A; 2MGL A; 2W72 A; 1U7R A; 1Y5K A; 3UHB A; 3HHB B; 5B84 A; 1R1X A; 3AQ6 A; 3GDJ B; 1LFZ B; 5ILP A; 1Y5K B; 3PI4 A; 1BVC A; 5HAV A; 1MCY A; 1MNH A; 2D2M B; 1V4U A; 3UHI A; 3BOM B; 2RAO A; 2ZS1 C; 1RQ3 A; 4MBA A; 1HCO A; 1YH9 A; 3HC9 A; 3QJE A; 1S0H A; 3G4W A; 1V4U B; 1THB B; 3D4X A; 2OHB A; 2RAO B; 4WJG 1; 109M A; 1YOH A; 2HBG A; 1RQ3 B; 1HCO B; 4ROM B; 1FN3 A; 3QJE B; 5AB8 A; 3M3B A; 3GYS B; 1DXU A; 1Y7Z B; 2MGD A; 103M A; 1MLF A; 1C7D B; 1W92 A; 1Y7G A; 1MLL A; 1A4F A; 1MLQ A; 1HBS A; 3S1J A; 3M39 A; 1DTI A; 1HBG A; 1YHU B; 1CH5 A; 4NI1 B; 1DXU B; 4VHB A; 1J40 A; 2VEB A; 1O1O A; 2V1I A; 2R50 A; 1A4F B; 4KMV A; 1HBS B; 3WFT A; 1HSY A; 1LHS A; 1WMU A; 105M A; 2MYD A; 4N7O A; 4SDH A; 1O16 A; 3HYU A; 1HHO B; 1O1N A; 4N7O B; 3AQ7 A; 3PIA A; 4XS0 A; 1NS9 A; 1N9I A; 3NMM A; 1MOC A; 4ROL A; 5B85 A; 1G9V B; 2JHO A; 4PNJ A; 5KER A; 2DXM A; 2ZS1 B; 1SPG A; 3HF4 A; 1QI8 B; 3PIA B; 1RPS A; 1NS9 B; 1TU9 A; 1KD2 B; 1NS6 A; 4ROL B; 1MLJ A; 1MBA A; 1OUT A; 5CNE A; 2C0K A; 1NXF A; 2BK9 A; 3QJC A; 3UBV A; 4ESA A; 5KER B; 2BW9 M; 1QXE B; 2OIF A; 2ZSX A; 4MQH A; 2DXM B; 1G08 A; 4PQC A; 5HLQ A; 2O5M X; 2W31 A; 1ASH A; 1NS6 B; 4YU4 A; 1NPF A; 1IRC A; 1JY7 A; 3V2Z A; 3LB3 A; 1MNK A; 3QJC B; 4OOD A; 1N9F A; 2DN2 A; 4MQH B; 1G08 B; 2GRZ A; 1GDL A; 1BJE A; 1Y5J B; 1Y45 A; 2ZSS A; 3MYM A; 4FH7 A; 4YU4 B; 1Y4R A; 1B0B A; 1JL6 A; 1Y85 B; 3UH3 A; 1DXV A; 1MTJ A; 3A5B A; 1A3O B; 3VRF B; 1Y45 B; 2PGH A; 1Y4B A; 1KR7 A; 3NL7 A; 1A6G A; 3K8B B; 1VXD A; 1Y4R B; 3QJB A; 3OO5 A; 2HBD A; 2FAL A; 1A0U A; 1XQ5 A; 4MQG A; 2PGH B; 1Y4B B; 3UHU A; 3NL7 B; 4HBI A; 2H8F A; 3QJB B; 2W6W A; 1V75 B; 2NRL A; 2EF2 A; 1MYJ A; 2MGM A; 1O1M A; 3RJ6 A; 3WCU D; 4MU5 A; 1XQ5 B; 4MQG B; 1UVX A; 2H8F B; 2R4Y A; 1HGA A; 1J41 B; 1LFL B; 3UHD A; 1LJW B; 1O1M B; 3E5I A; 3UHY A; 1DWS A; 1VXH A; 2D2N A; 1HGB B; 1XZV A; 3GKV A; 4U8U A; 3UHV A; 2ZLT B; 1YDZ A; 3PI1 A; 5HY8 B; 1HDS A; 2D2N B; 1NGK A; 1XZV B; 5E6E A; 2ZSR A; 3GKV B; 4MPM A; 3TM3 A; 1Y0D A; 3DUT B; 2D2M D; 3VHB A; 3ARK A; 3CY5 A; 3G53 A; 1MYM A; 1Y46 A; 1HDS B; 2HBS A; 5E6E B; 5CN6 A; 1Y0D B; 1UIW A; 1N9X A; 3UH5 A; 3PT8 B; 3CY5 B; 112M A; 1Y46 B; 3RJN B; 3OO4 B; 1DWT A; 4H2L A; 7HBI A; 3IXF A; 1LFY A; 1XY0 B; 1MKO A; 1Y7D A; 1V4W A; 1Y8H A; 1MYI A; 1Y4V A; 2D5X A; 1C7B B; 3R0G A; 4H2L B; 1Y4G A; 1Y31 A; 1O1J B; 3B75 B; 3GKT A; 3OVU C; 1LFY B; 3A59 A; 110M A; 1YHU D; 1Y7D B; 3KMF C; 1V4W B; 1Y8H B; 3PI9 B; 1Y4V B; 2GRH A; 1LH5 A; 2D5X B; 4JAC A; 1C7C B; 1F5O A; 1Y22 A; 1Y4G B; 1CH2 A; 3A59 B; 1FHJ A; 2ZLW A; 2G3H A; 2G14 A; 4AVD A; 2FAM A; 1NWN A; 5C6Y A; 1S5X B; 1GBV A; 3CIU A; 2HBF A; 1BIJ A; 4YU3 A; 2FRK X; 5EQM A; 3P5Q A; 4UIQ A; 1A6M A; 2NX0 A; 1Y7C B; 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1SI4 B; 4HSX A; 1R1Y B; 4IT8 A; 1ECA A; 1YIH A; 4F69 A; 1IT2 A; 4O2G A; 2ZLU A; 3PT7 B; 3NG6 B; 1J3Z B; 4TWU A; 1JDO A; 4ZVB A; 3UHR A; 1Y83 B; 1LH6 A; 1OUU A; 1VXF A; 1YIH B; 1URY A; 2E2Y A; 4MXL A; 1YEU B; 1DXT A; 1GVH A; 4HRT B; 2LH3 A; 4UUR A; 1OUU B; 1U7S A; 2AA1 B; 2LH2 A; 1QXD B; 2SPL A; 2GNW A; 3KUN A; 1DXT B; 2LH1 A; 1LFT B; 5HLU A; 1YEO B; 2GTL C; 2D2M A; 3G46 A; 3BJ1 A; 3BOM A; 1BAB A; 1JPB A; 3UHW A; 1MLH A; 1LFV A; 1S5Y A; 1FAW A; 1THB A; 3BJ1 B; 1BAB B; 1HLB A; 4DC7 A; 1XYE B; 2QMB B; 4ROM A; 4G51 A; 1MGN A; 1LFV B; 4ZVA A; 3GYS A; 1Y7Z A; 1S5Y B; 1FAW B; 1FSX B; 2BLI A; 1C7D A; 1RQ4 B; 1YZI B; 1JF4 A; 4G51 B; 5JDO C; 1NIH A; 1YHU A; 2Z8A A; 4MQK B; 4NI1 A; 5JGG B; 1IWH B; 2AUO A; 2IG3 A; 3ORD A; 1YMA A; 1URV A; 3HEN A; 1NIH B; 1Y5F B; 2ZT3 A; 1BZR A; 2FRI X; 5CN7 A; 2PEG A; 3OGB A; 3LHB A; 1J7S B; 2CMM A; 6HBW B; 3NML A; 1CH1 A; 2MB5 A; 4LPI A; 1M9P B; 1HHO A; 2B7H B; 1Y0C A; 1Y2Z A; 2PEG B; 1LFQ A; 2QFN A; 4FH6 A; 5SW7 A; 2GTL B; 1T1N B; 1G9V A; 5EOH A; 3ZHW A; 1MYG A; 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