The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VEWSTAERSAIAGLWGKISVDEIGPQALSRLLIVYPWTQRHFAAFGNLSSPAAINGNPKVAHHGKVVMGGLERAIKNMDNIKAAYSSLSVMHSEKLHVDPDNFRLLADCITVCVAMKFGPSAFTPDVQEAWQKFLAVVVAALSRYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein/oxygen binding
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| molecule keywords |
Alpha-chain hemoglobin
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| publication title |
Crystal structure of oxy-hemoglobin from Brycon cephalus
rcsb |
| total genus |
54
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-11-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ZFB A; 2DN1 B; 1Y4G A; 2ZT0 A; 3OJ1 A; 3UH3 A; 1HBG A; 4ROM B; 1MLU A; 1DUO A; 1Y7D A; 1Y7G A; 2ZLT A; 3ECZ A; 1LFQ B; 2V1E A; 4F6G A; 1OUT A; 3WCW B; 1MBC A; 1Y0C B; 4MQJ B; 5CND A; 1LFY B; 1CG8 B; 5E6E B; 3UHU A; 2LHB A; 2AA1 B; 3IC2 B; 3D4X A; 1BAB B; 1YZI B; 1FSL A; 1N9H A; 2D60 A; 3HRW A; 3EU1 A; 2ZSP A; 3TM9 A; 1Y8I B; 1X46 A; 1HV4 B; 1YE0 A; 2W6X A; 2GKN A; 1HGB B; 3SZK B; 3AT5 A; 3WCW D; 2B7H B; 4NI1 B; 1CMY A; 1XZ7 A; 3G4R A; 3GQR A; 4OOD A; 1O1N A; 1LH3 A; 3ASE A; 4FH6 A; 1YHR A; 3G53 A; 3ZJO A; 1Y7C B; 1LFZ B; 1XZ5 B; 4ODC B; 1V4X A; 3G4U A; 3A5G A; 3ED9 A; 1A6K A; 5SW7 A; 1XY0 B; 1A01 A; 3PEL B; 4F6D A; 3WHM A; 1VXH A; 2HHB B; 1ITH A; 2EB8 A; 3GOU A; 5EQM A; 2QU0 A; 4M4B B; 2LH1 A; 1CG5 B; 1PBX B; 1DWS A; 1MYI A; 4B4Y A; 1O1L A; 1LHS A; 1YFF A; 3WCP A; 1MYH A; 3OO4 B; 1DLY A; 3WCT A; 4WCH D; 1O1M A; 1IBE A; 1J7S A; 1MLS A; 1LTW A; 3B75 A; 1SI4 A; 3IA3 B; 1C7B A; 1F63 A; 2QMB B; 1O16 A; 1Y83 A; 3UHQ A; 2VEE A; 2W6Y A; 2PGH B; 1V75 A; 1Y4Q B; 1G0B B; 2AUP A; 5CHR A; 1F5P A; 4MQI B; 1Y0D B; 1IRC A; 4NI0 A; 3QJB B; 4O35 A; 2GDM A; 2VLX A; 3EDB A; 1M9P A; 3QJD A; 1MLH A; 1K0Y B; 1HBS B; 1CH1 A; 1BZ1 B; 4HHB A; 2DC3 A; 1HGA B; 1BZ0 A; 4N7O A; 3S66 A; 2MGG A; 2D2M A; 3MBA A; 4BJA A; 3PT8 B; 1MBD A; 3A2G A; 2MBW A; 3MKB B; 3QJC A; 3WFU A; 5MBA A; 2DHB B; 4YU4 A; 4AVD A; 2O5O X; 3OZW A; 3UHE A; 4U8U C; 3OZV A; 3UHW A; 2O5L X; 3WFX A; 2MGC A; 3WR1 A; 1LFL B; 4TWV A; 2GNV A; 1V4W A; 1MNI A; 1IDR A; 2XKG A; 2PEG B; 1LJW A; 3QJE A; 1JZK A; 1YHU A; 4DC8 A; 2GRH A; 1K1K A; 2ZSN A; 2DXM B; 2EB9 A; 1MLL A; 1DO3 A; 4MQK A; 3ZJJ A; 1A0Z B; 3PT7 A; 3CY5 B; 1C40 B; 3BJ3 A; 1MCY A; 1LHT A; 3PI4 A; 5EOH A; 2GRF A; 1XZV B; 1IRD A; 1A9W A; 1DXU A; 1HBR B; 2QFK A; 3SDH A; 4N7P A; 1VXA A; 1YVQ B; 1Y4V A; 1DKE B; 3RGK A; 2MGJ A; 4ZVB A; 1Y35 A; 1NZ3 A; 1I3E A; 1ABS A; 1ECO A; 4U8U B; 1N9X A; 5E29 A; 4KMV A; 1TU9 A; 3UHD A; 2DN1 A; 1QPW B; 2DN2 B; 4HRT B; 4ROM A; 4ILZ A; 1YH9 B; 2YRS B; 3GKV B; 1LFQ A; 1S5Y B; 3DHT B; 1AZI A; 2ZFB B; 3SDN A; 2CMM A; 1Y0C A; 3FS4 B; 4MQJ A; 3D7O B; 1LFY A; 2G12 A; 1CG8 A; 5E6E A; 1MOH A; 4U8U D; 3IC2 A; 1BAB A; 1YZI A; 4DWU A; 1IWH A; 5JGG B; 3GDJ B; 3D17 B; 2V1K A; 3K3U A; 1Y8I A; 1LH7 A; 1HGC B; 1FDH G; 1BZZ B; 1WVP A; 4WJG A; 3ZJP A; 5JDO E; 1MWD A; 2H8F B; 1HV4 A; 2ZLV B; 1EW6 A; 1Q1F A; 3NL7 B; 3AT6 B; 2ZT4 A; 1HGB A; 3SZK A; 1Y31 B; 2QFN A; 2B7H A; 4IRO B; 1MLM A; 4NI1 A; 3ZJR A; 4C0N A; 3K8B B; 3A5B A; 1GDK A; 1Y8K B; 1B86 B; 3AT5 B; 3VRG B; 1Y7C A; 3IXF A; 1LFZ A; 1XZ5 A; 1AJH A; 1S5X B; 1UX9 A; 4ODC A; 3ZJL A; 2MHB B; 1FN3 B; 1XY0 A; 3PEL A; 5EET A; 3OVU C; 2HHB A; 4NXA A; 2HBC B; 2MGB A; 3GLN A; 4N8T B; 1YEU B; 4M4B A; 1V4X B; 1CG5 A; 2HBF B; 3WFT A; 1PBX A; 1SDL B; 1J3Z B; 109M A; 3OO4 A; 3RJ6 A; 1NS6 B; 106M A; 1OR4 A; 3CIU B; 4MQC B; 2ZSO A; 3HEP A; 1VRF A; 1V4U B; 5CN9 A; 1GLI B; 2FRI X; 3ONZ B; 1HRM A; 3D1A B; 2QMB A; 1MKO B; 1XQ5 B; 2PGH A; 5AZQ A; 1Y4Q A; 1G0B A; 1YMB A; 4MQI A; 5CN8 A; 3QJB A; 3QM6 A; 2BW9 M; 3AQ9 A; 1YG5 B; 1A9W E; 3UHY A; 2FAM A; 1K0Y A; 1RTX A; 3NFE B; 2V1I A; 1UVX A; 5EU2 A; 1BZ1 A; 1QSH B; 3RJN B; 1HGA A; 1NGK A; 2GTL A; 3UHG A; 3UBC A; 1CH5 A; 1TES A; 3VRF B; 1HJT A; 1T1N B; 1DO7 A; 1UMO A; 1NZ5 A; 3PT8 A; 1DO1 A; 3MKB A; 2DHB A; 1WMU B; 2W6W A; 3ZOM A; 3ZH0 A; 2H8D B; 1MWC A; 1JWN A; 1S69 A; 1UT0 A; 4G1V A; 4UUR A; 1LFL A; 1HSY A; 2IG3 A; 3FH9 B; 1JPB A; 4MXL A; 3M38 A; 3QMA A; 1YIE B; 2PEG A; 2GKM A; 2BKM A; 3DR9 A; 3TM3 A; 2ZLW B; 2ZT2 A; 2DXM A; 1RQ3 B; 1A0Z A; 2ZST A; 2VLZ A; 1RSE A; 4MU5 A; 3QQR A; 3CY5 A; 2BLH A; 3ZJS A; 1C40 A; 2RAO B; 1B0B A; 1Y4B B; 1K1K B; 1XZV A; 5CMV A; 1Y0T B; 2HBD B; 1C7C B; 1NZ4 A; 1HBR A; 1O1J B; 1R1X B; 3ARJ A; 1HAC B; 1WLA A; 111M A; 3UHN A; 1YVQ A; 3M39 A; 1DKE A; 107M A; 1MOB A; 2V1H A; 1O1P A; 4U8U A; 1CBL A; 1LH6 A; 1X3K A; 5EV5 A; 4ROL B; 1YMC A; 1NWI A; 1DXT B; 1YHE B; 1QPW A; 3QM9 A; 2GNW A; 2DN2 A; 4HRT A; 1M6C A; 1YH9 A; 2Z6S A; 2YRS A; 3GKV A; 4JYQ A; 1OJ6 A; 1S5Y A; 3DHT A; 3BOM B; 1Y7Z B; 2Z6T A; 2MYC A; 1CH7 A; 3FS4 A; 3D7O A; 3PI3 A; 5CNF A; 5JGG A; 3W4U B; 3GDJ A; 3KUO A; 3D17 A; 1VRE A; 2FRF A; 1HGC A; 1BZZ A; 2H8F A; 2ZLV A; 3ARK A; 3NL7 A; 1IWH B; 3AT6 A; 2SPO A; 3D1K B; 1LFT B; 1Y31 A; 1Y8H B; 4IRO A; 2ZSR A; 3K8B A; 3UHK A; 2JHO A; 2HBE B; 1YGF B; 1IT3 A; 1Y8K A; 1B86 A; 1EMY A; 1NPF A; 3O89 A; 5B85 A; 3VRG A; 1S5X A; 3M3B A; 2MHB A; 5CHQ A; 2HBG A; 1FN3 A; 2E2Y A; 4YU3 B; 2VHB A; 2LH3 A; 4VHB A; 5ILR A; 1DXD A; 2HBC A; 4N8T A; 1BVD A; 1RQA B; 1YEU A; 5EE4 C; 2G0S A; 2HBF A; 5HAV A; 2OH9 A; 4SDH A; 2O58 X; 2HZ2 A; 1GBU B; 1SDL A; 104M A; 2GTL C; 1J3Z A; 5E83 B; 2RI4 B; 1HAB B; 4NZI A; 1NS6 A; 3CIU A; 4MQC A; 1F65 A; 1V4U A; 1MOC A; 4PQB A; 1YOI A; 1GLI A; 3ONZ A; 3D1A A; 1MKO A; 1XQ5 A; 5C6E B; 1SHR B; 1MTJ A; 2VYZ A; 2EKT A; 1XZU B; 1ABW B; 1BZR A; 1BUW B; 2FRJ X; 1IOP A; 1DTM A; 2MGE A; 1YG5 A; 2ZSX A; 2BLJ M; 1OR6 A; 1ECD A; 3NFE A; 1ECN A; 1FCS A; 2ZSQ A; 3G46 A; 1QSH A; 1MBN A; 4FWX A; 1LA6 B; 4GZG A; 3VRF A; 3E4N A; 1VHB A; 5F0B A; 1T1N A; 1XCH A; 1YIH B; 2O5B X; 1A00 B; 1WMU A; 1CO8 A; 1XXT B; 2D5X B; 2GTL B; 2H8D A; 2ZFO C; 1MDN A; 4NK1 A; 1CLS B; 1LFV A; 7HBI A; 3NMM B; 1HBB B; 1VXB A; 3VRE B; 2XKI A; 1GZX B; 3S65 B; 1XZ4 B; 3AQ5 A; 1BBB B; 3FH9 A; 1FSX B; 2LH2 A; 3WCU C; 1S0H A; 3QQQ A; 1MLR A; 2QLS B; 3ZJM A; 1YIE A; 5EE4 D; 1YEV B; 2ZLX B; 4HBI A; 1J3Y B; 4N7N B; 1OFJ A; 1MTK A; 2ZLW A; 5HLU A; 6HBW B; 2GTL D; 4PQ6 A; 1RQ3 A; 2R4X A; 1MBA A; 2D2N B; 1EBT A; 1HDB B; 1H97 A; 2NRL A; 2RAO A; 4O4Z A; 3KUN A; 1NZ2 A; 1Y4B A; 4NK2 A; 1Y0T A; 1G08 B; 2HBD A; 1C7C A; 1MYG A; 4KMW A; 2VLY A; 1O1J A; 1GCV B; 3AQ7 A; 1R1X A; 1HAC A; 3ZOL A; 2VYW A; 1BIJ B; 1CIK A; 2O5M X; 2R1H B; 2D5Z B; 1CQX A; 2SPM A; 5KDQ A; 2MGK A; 4XDI A; 2ZFO B; 2C0K A; 4O1T A; 2FAL A; 3TLD A; 1YEO B; 4ROL A; 1Y5J B; 4QAU A; 1FHJ B; 1XYE B; 1Y01 B; 1DXT A; 1YHE A; 1YOG A; 3WCU B; 1O1P B; 1Y5F A; 4MQG B; 110M A; 1MLN A; 4F6I A; 5JOM A; 1MWB A; 3BOM A; 4MPM A; 1Y7Z A; 2AUQ A; 1RVW B; 2V1F A; 2XYK A; 4MBA A; 4C44 A; 1V07 A; 3E55 A; 2ZFO D; 1MYM A; 1VWT B; 1JEB B; 4NS2 A; 1RTE A; 1COH B; 3W4U A; 1MOA A; 1J40 B; 2ZS1 C; 2V1J A; 1V5H A; 3WCU D; 2QRW A; 5CN5 A; 4ESA B; 2R50 A; 1Y2Z B; 3D1K A; 1LFT A; 1Y8H A; 1URV A; 3UI0 A; 5B84 A; 2HBE A; 1LH2 A; 1YGF A; 2EKU A; 1YEN B; 2WTH A; 1GVH A; 1VXF A; 1A6N A; 3MYM A; 2AV0 A; 1J7Y B; 1CH4 A; 4YU3 A; 1BJE A; 1KFR A; 1OUU B; 1CIO A; 1RPS B; 1RQA A; 3ZJI A; 4FC3 B; 2BK9 A; 3WFW A; 1GBU A; 2G14 A; 5M3S A; 5E83 A; 2RI4 A; 1HAB A; 3EDA A; 1Z8U B; 1MLF A; 3UHH A; 4OF9 A; 3IC0 B; 3QZZ A; 3S1I A; 1NWN A; 1YCA A; 3ZJH A; 2ZS1 B; 3HHB B; 3GQG B; 1FDH A; 3AG0 A; 1NS9 B; 1G9V B; 1JY7 B; 1YGD B; 2VRY A; 5C6E A; 1J41 B; 1SHR A; 1J7W B; 1QXE B; 2WTG A; 1XZU A; 1ABW A; 4XS0 B; 1BUW A; 1O1K B; 2R4W A; 3PIA A; 5AB8 A; 1VXD A; 1MNH A; 1OFK A; 1A3O B; 1EBC A; 4HSW A; 3UH7 A; 2ZS1 D; 3G4W A; 3GYS B; 3G4V A; 1LA6 A; 2VM0 A; 2MGM A; 1YIH A; 1SPG B; 1A00 A; 5D1V A; 1Y45 B; 4G51 B; 1N9I A; 2QSS B; 4JAC A; 1XXT A; 2D5X A; 1KR7 A; 1H1X A; 1C7D B; 1OBM A; 1M6M A; 1DO4 A; 1UVY A; 1CLS A; 4F68 A; 3PI2 A; 3NMM A; 1HBB A; 3VRE A; 2OHB A; 2BLI A; 1YDZ B; 1GZX A; 2W31 A; 5JDO F; 3S65 A; 1XZ4 A; 1BBB A; 1FSX A; 2HCO B; 1VXC A; 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5CNC A; 2G0V A; 1ECA A; 1MYT A; 1Y5K B; 3BJ1 B; 4H07 A; 1NIH B; 1YEN A; 3OZU A; 3UHS A; 1J7Y A; 3LHB A; 1AJ9 B; 3HF4 B; 2HZ3 A; 112M A; 1OUU A; 1JP8 A; 2MYE A; 4MQH B; 3QM5 A; 1RPS A; 5EYS A; 4FC3 A; 1XZ2 B; 3PI8 B; 1QI8 B; 3ECX A; 2V1G A; 3HEN A; 1NQP B; 1G09 B; 1Y4F B; 3OO5 B; 1AJG A; 2Z85 A; 3IC0 A; 5EUI B; 1N9F A; 2ZS1 A; 1JL6 A; 1JL7 A; 3HHB A; 3GQG A; 4KN3 A; 4DC7 A; 1MGN A; 1NS9 A; 1G9V A; 1JY7 A; 3MYN A; 2G0Z A; 1YGD A; 1YVT A; 4O2G A; 1HBA B; 1J41 A; 1BVC A; 1J7W A; 1QXE A; 1QSI B; 4XS0 A; 1Y85 B; 1HDS B; 3BA2 A; 1JZL A; 2O5S X; 1O1K A; 3AQ8 A; 1DXC A; 2ZSS A; 1NEJ B; 3S1J A; 1RQ4 B; 1Y46 B; 1JF4 A; 3GK9 A; 1A3O A; 1JP6 A; 1Y22 B; 3GYS A; 2BNL A; 2D2N C; 2HHE B; 3PIA B; 1R1Y B; 2Z6N B; 2FRK X; 2MB5 A; 3LB2 A; 2G0R A; 1GDL A; 1MTI A; 4FWY A; 5KKK A; 1HCO B; 1SPG A; 3HXN B; 1Y45 A; 4G51 A; 2R4Y A; 2QSS A; 5ILM A; 5CN6 A; 1C7D A; 2ZS0 C; 1UFP A; 1GDI A; 1DTI A; 3E5O A; 3UHZ A; 2H35 B; 3OGB A; 1YDZ A; 3ODQ B; 2Z8A A; 1A3N B; 4MBN A; 1O1O B; 3BCQ B; 2HCO A; 2M6Z A; 1BZ6 A; 3DUT B; 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