The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSAADKTNVKAAWSKVGGHAGEYGAEALERMFLGFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKAHGKKVGDALTLAVGHLDDLPGALSDLSNLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLSTLAVHLPNDFTPAVHASLDKFLSSVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Water-mediated variability in the structure of relaxed-state haemoglobin
pubmed doi rcsb |
| total genus |
57
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3UH6 A; 1LFY A; 3ECL A; 3EU1 A; 1DXV A; 1LJW A; 5AZQ A; 3S66 A; 2LH7 A; 2HZ1 A; 2R1H A; 3V2Z A; 3UBC A; 4G51 A; 1G9V A; 2GLN A; 2DHB A; 3GQP A; 4N8T A; 5ILR A; 4IRO B; 2AA1 B; 3HEN A; 1DUO A; 1YIH A; 2ZFO D; 3PI8 A; 2QSS A; 3PT8 B; 3A9M A; 1Y8K B; 1O1O A; 1COH A; 4F6J A; 2BMM A; 3VRF A; 3S65 B; 1ECN A; 2O5L X; 3UHV A; 1OUU B; 2ZT4 A; 4KJT A; 1CP0 A; 1FAW A; 1XY0 A; 3AQ9 A; 4MQI B; 5SW7 A; 1Y4P A; 1JP8 A; 2QSP A; 2HBC B; 4O1T A; 2WTH A; 1XYE B; 4MU5 A; 1NQP B; 1PBX A; 1CG8 A; 1FN3 A; 1NIH B; 1BUW A; 1UMO A; 2D5X A; 5CNF A; 4ESA A; 3BCQ B; 3IC2 A; 3LQD A; 1YHU B; 1MCY A; 3D7O A; 2HBS B; 5HU6 A; 2GKM A; 2PEG A; 3ZHW A; 1Y8I B; 3WCT D; 1AJ9 A; 3WFT A; 1A00 A; 1YEO B; 1ECO A; 1OUT B; 1UT0 A; 1QSH A; 3KUO A; 5M3S A; 3WCW B; 1YH9 B; 1LFQ A; 1GBU B; 1XCH A; 3AQ5 A; 2GDM A; 1Y5F B; 1GBV A; 2R4W A; 1UX8 A; 1Y4G B; 1R1Y B; 1N9F A; 1H97 A; 1L2K A; 1HRM A; 1MOH A; 3KUN A; 1Y8W B; 1A0Z B; 3LB4 A; 3OO4 A; 1UFJ A; 1DTM A; 2W72 C; 1LFL B; 3AT6 A; 1YEN A; 3A5G A; 1RQ4 B; 3WCV A; 1CP5 A; 2GTL D; 1Y0W A; 1Y45 A; 2ZSS A; 2QLS A; 2ZS1 A; 4MQH B; 1GDI A; 1YIE A; 5CN7 A; 1Y7Z A; 3ZJJ A; 107M A; 1A3N A; 1GVH A; 1Y0D B; 1B86 B; 1RTX A; 4HRR B; 2D2M D; 1YG5 B; 1O16 A; 3FH9 A; 1THB A; 1EWA A; 1S69 A; 5ILE A; 1JF3 A; 2YRS B; 2MGC A; 2NSR A; 1NEJ A; 1HAC A; 1HDB B; 1YVT B; 1BJE A; 1MBA A; 4G1V A; 4X0L A; 5KDQ A; 1YHU C; 3M3A A; 2O58 X; 2O5M X; 3LB1 A; 1MYI A; 1JPB A; 1Y4R A; 5EUI B; 1YGF A; 1Y4B B; 1GZX B; 3MKB A; 1Y35 B; 1GCV B; 1O1K A; 1EMY A; 3UHC A; 4N7O B; 1Y4V A; 3QJB A; 2MHB B; 1HGB B; 1MNK A; 3G4U A; 3GQR B; 1SDL B; 2VYY A; 3GK9 A; 1O1N B; 1V4X A; 2AUR A; 5B85 A; 2W6W A; 1Y46 B; 1CQ2 A; 1MLJ A; 1Y09 B; 5IKS A; 1UC3 A; 3E4N A; 1G0A A; 1JZM A; 3DHT A; 3M3B A; 1J7W B; 3O89 A; 2HBF A; 1MWC A; 1MLH A; 1YGD A; 2ZS0 C; 4NI1 A; 1C7D A; 2V1J A; 2ZSN A; 1YHE B; 1Y0A A; 1IT2 A; 1MTK A; 5E29 A; 1YFF A; 1FHJ B; 1X9F C; 2B7H B; 1DXC A; 1YHR B; 5EE4 D; 1HDS B; 4NI0 B; 5CN9 A; 4FWY A; 3ZJP A; 1HCO A; 3GLN A; 1Y7D A; 3ZJL A; 1YVQ A; 1DM1 A; 3K9Z A; 5HLX A; 2FAM A; 1A01 A; 5JOM A; 1K0Y A; 1M6C A; 1GDL A; 3D1K B; 4FWZ A; 1YEU A; 5HLU A; 3WCV D; 3ZJO A; 1ECD A; 1ABW A; 1H1X A; 4MQJ A; 2ZS1 D; 1SDK A; 1C7B B; 3WTG A; 1I3E A; 3BJ2 B; 1HAB A; 1O1L A; 1BIJ A; 4FWX A; 1RQ3 A; 1Y22 A; 2MGH A; 3O7N A; 3OO5 B; 1IRD A; 1Y5K B; 5CN8 A; 2W6V A; 5HAV A; 4B4Y A; 1CPW A; 1HV4 A; 1YDZ B; 3PEL A; 2W31 A; 1M9P A; 1J3Y B; 1V4U A; 1KFR A; 4F6D A; 1SWM A; 2HHE A; 1IRC A; 2FRF A; 4NK2 A; 1T1N B; 3PI1 A; 1AZI A; 1LH2 A; 1RPS B; 2H8D A; 3EDB A; 3G4Q A; 3ONZ A; 5KKK A; 4TWV A; 1M6M A; 1NS9 A; 4ROM B; 4GZG A; 3VAU A; 5KER A; 4ZVB A; 2EVK A; 2ZT3 A; 1JEB A; 1DXU A; 1YMC A; 2LHB A; 4ROL B; 5E6E B; 2FAL A; 3ZJS A; 1A4F A; 4H2L B; 5C6E A; 1LUE A; 1MLS A; 3ZJH A; 3A59 A; 2NSS A; 4ZVA A; 2W6X A; 1HHO A; 2QMB A; 1JWN A; 1IWH B; 3ECX A; 1URV A; 1IBE B; 2M6Z A; 1MOA A; 1S0H B; 1X3K A; 3UHK A; 1NS6 A; 1C40 A; 3G53 A; 2D2N B; 3S48 C; 2MYC A; 2VYZ A; 1Y31 A; 1RVW A; 2DN2 B; 110M A; 4KMV A; 1A6G A; 1UVX A; 2VEB A; 4IT8 A; 2V1H A; 1AJH A; 1IOP A; 2ZLU B; 2BK9 A; 1CBM A; 2EB8 A; 1CLS B; 2MBW A; 1Y8H B; 2ZT1 A; 1HGA B; 2BLH A; 2GL3 A; 3BOM B; 1A0U B; 4JYQ A; 3A5A A; 3WCU B; 5CNB A; 4U8U B; 3D17 B; 3ODQ B; 2OHB A; 3UHD A; 1U7S A; 4N7P B; 4MQC B; 2ZFO A; 3LB3 A; 1SHR A; 1MLF A; 3QJE A; 3OZU A; 2D5Z A; 1Y7C B; 2G3H A; 1O1J A; 3U3E A; 2Z6N B; 1MBI A; 2ZFB A; 2D60 B; 1F65 A; 1O1I B; 1FSX B; 1LFV A; 1DKE A; 2BLJ M; 1BZZ A; 5EYJ A; 3DUT A; 4WJG A; 7HBI A; 4HHB B; 101M A; 1UIW A; 2IN4 A; 1HBH B; 3HF4 A; 2OH9 A; 2AV0 A; 4VHB A; 1JY7 B; 3WCT B; 2ZWJ A; 1J7Y A; 2HHD B; 1XQ5 B; 1S6A A; 1Y4F B; 2FRJ X; 1NPF A; 3E55 A; 1Y2Z B; 4ODC A; 1VXD A; 3ED9 A; 3D1A B; 2MYA A; 1I3D A; 4F6F A; 3WR1 B; 3GYS A; 3QQR A; 3UH7 A; 1Y85 A; 1YOG A; 1QI8 A; 3ZJN A; 3WFW A; 2HCO A; 4L7Y B; 4FH7 A; 2VLZ A; 2V1K A; 1MGN A; 3PIA B; 3NG6 A; 1QXD A; 1CH1 A; 2RI4 A; 3PI3 A; 4MBN A; 1EBC A; 5AB8 A; 1HLB A; 1S61 A; 4C44 A; 3H57 A; 1DO4 A; 1A3O A; 4SDH A; 5EU2 A; 5CNC A; 1YE2 A; 1BZ0 A; 2G0X A; 2G0S A; 1K1K A; 1XZ7 B; 1Y0C B; 3IC0 A; 1F5O A; 2QFK A; 1F63 A; 4M4B A; 2RAO B; 6HBW A; 1Z8U B; 1LFY B; 3EOK B; 3EU1 B; 1DXV B; 5CHR A; 4L2M A; 1S5Y B; 1MKO B; 3VRG B; 3FS4 A; 2H8F A; 5CN6 A; 1D8U A; 3KMF A; 4UIQ A; 4G51 B; 4YU3 B; 1RQA A; 2DHB B; 2DN1 A; 3PI9 B; 1MLO A; 3LR7 A; 1DO1 A; 1YEV A; 2W72 B; 3LR9 A; 5JDO D; 1UX9 A; 2QRW A; 3WCT C; 1V07 A; 2MGL A; 1LH7 A; 105M A; 5ILM A; 1GLI A; 1GJN A; 1HBB A; 4MBA A; 3GQG A; 3BJ3 A; 3UBV A; 4JAC A; 2LH6 A; 1LTW A; 1S5X A; 2BLI A; 1MNO A; 1XY0 B; 1R1X A; 1XZV B; 3CIU A; 1QPW A; 1NWN A; 1HDA B; 2QSP B; 1ABY A; 4WCH D; 1G08 B; 3RGK A; 1CG8 B; 1FN3 B; 4AVD A; 3IC2 B; 1GCW B; 5MBA A; 3D7O B; 3AG0 A; 3K3U A; 2HBD B; 2GTL C; 3AQ7 A; 1QSH B; 3PI4 A; 4IRO A; 4HSW A; 1CIO A; 1LFZ B; 1YEQ B; 4HBI A; 6HBI A; 1PMB A; 1Y8K A; 2XKG A; 1HBG A; 2D2M C; 3MOU A; 3NL7 A; 1MYJ A; 3S65 A; 3GOU A; 3MYM A; 2G14 A; 3WI8 A; 4HSX A; 2QU0 A; 2DXM A; 3OO4 B; 1NXF A; 1CH5 A; 2MGD A; 1MLG A; 1BZ1 A; 1HBA A; 2ZT2 A; 1XYE A; 1NQP A; 3PI2 A; 1TES A; 1XZ5 B; 1DXD A; 3BCQ A; 3LHB A; 3BJ1 A; 2QLS B; 2VM0 A; 1BAB B; 3UHI A; 1Y8I A; 3MBA A; 3TM3 A; 1A3N B; 4F4O B; 1QXE A; 3NMM B; 2ZSP A; 2ZS0 B; 3WCW A; 2R80 A; 1GBU A; 1Y5F A; 3UGZ A; 1X9F B; 1Y4G A; 5CNG A; 3OZW A; 2MGF A; 1LHS A; 4ILZ A; 2GNV A; 1HGC A; 1XZ2 B; 2ZLV B; 5D1V A; 1MYM A; 1Y8W A; 1A0Z A; 1WMU B; 1LFL A; 2DN3 B; 1A6M A; 1Y4R B; 3ZH0 A; 1RQ4 A; 3NFE B; 1YGF B; 5CN4 A; 1C7C A; 2ZSO A; 3MKB B; 1O1K B; 4C0N A; 2SPL A; 1VXH A; 1Y4V B; 2MGE A; 2SPM A; 2PGH B; 1Y01 B; 1V5H A; 2OIF A; 3QJC A; 2GNW A; 4DC8 A; 3AQ6 A; 3WHM B; 1Y0D A; 4MXK A; 1B0B A; 5EE4 C; 1B86 A; 3SZK A; 1MYH A; 3HRW B; 3UHG A; 4HRR A; 3MN0 A; 3R5I B; 4MQG B; 1AJG A; 1YG5 A; 112M A; 3DHT B; 3QM6 A; 1A9W E; 5C6Y A; 1G0B B; 1BBB A; 2OHA A; 1ECA A; 4NK1 A; 3IA3 B; 1ASH A; 1DWR A; 1MLK A; 3WCV C; 2Z6T A; 2GKN A; 1C7D B; 1MDN A; 2ZS1 C; 2ZLT B; 5EUI A; 5E29 B; 1N9I A; 1Y4B A; 2VRY A; 3G4V A; 1GCV A; 1Y0T B; 4B3W A; 3HHB A; 3GKV A; 3UI0 A; 4N7O A; 2MHB A; 2ZSZ A; 1HCO B; 3D4X B; 1Y7D B; 3A5B A; 4QAU A; 1YMA A; 1O1N A; 1SI4 A; 1BZR A; 1K0Y B; 1Y09 A; 2XYK A; 1DXT A; 3MJU A; 1O1P B; 1YEU B; 4NS2 A; 3B75 A; 1KD2 A; 1JDO A; 1KR7 A; 1MOC A; 1ABW B; 1YHU D; 4MQJ B; 1MYT A; 1SDK B; 1LH3 A; 3S1J A; 4HRT B; 1MLM A; 2NX0 A; 4XS0 B; 1HAB B; 1FDH A; 1CMY A; 2G12 A; 5E83 A; 1A9W A; 1LFT B; 3WCW D; 2HBE B; 1FHJ A; 1VXF A; 1HV4 B; 3PEL B; 3HXN A; 3UGY A; 1YHR A; 1SPE A; 1MOD A; 1V4U B; 3SDH A; 1HDS A; 1YE0 A; 1J7S B; 2NRL A; 1NZ3 A; 1LA6 B; 5HBI A; 111M A; 3CY5 A; 2H8D B; 1BVC A; 3QM7 A; 1TU9 A; 1J41 A; 1NS9 B; 1GDJ A; 2NRM A; 1OBM A; 3NML A; 2AV3 A; 2VEE A; 5EYS A; 2SPN A; 3GDJ B; 2EB9 A; 4N7N B; 4PQB A; 1MBO A; 1V75 A; 4NXC A; 1JEB B; 1YCB A; 1BVD A; 5JDO E; 1Y4Q B; 1C7B A; 4H07 A; 5CHQ A; 3BJ2 A; 3E5I A; 1A4F B; 2DC3 A; 3OO5 A; 1V9Q A; 1CG5 A; 3E5O A; 5EOH A; 1HHO B; 2R4Z A; 1DO3 A; 5F0B A; 2QMB B; 3ZOL A; 2V1I A; 1RSE A; 1CH2 A; 2V1G A; 1VRE A; 1Y7G B; 1T1N A; 3G4Y A; 3UHT A; 2O5O X; 104M A; 2G0R A; 1SPG B; 4ROM A; 2BW9 M; 3UHN A; 1BZP A; 1CH9 A; 2W6Y A; 4PQC A; 1Y31 B; 1RVW B; 1XXT A; 4O4T A; 2FRI X; 2BWH A; 1MYZ A; 4H2L A; 3BA2 A; 1JL6 A; 3P5Q B; 2Z85 A; 1YMB A; 1WVP A; 1MYF A; 1YOI A; 3MJP A; 5JGG B; 2GRF A; 4UZV A; 3TM9 A; 4H0B A; 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1CO9 A; 2D2M B; 2EF2 A; 2VLY A; 4L7Y A; 5CN5 A; 1RQA B; 2DN1 B; 1YEV B; 1LJW B; 5CNE A; 3A0G A; 3S66 B; 2R1H B; 1NGK A; 1G09 A; 2R4Y A; 1MWB A; 1GLI B; 1GDK A; 1G9V B; 2G0V A; 2AUP A; 3GQP B; 1JF4 A; 4N8T B; 1CO8 A; 2LH5 A; 1VXA A; 4TWU A; 1EW6 A; 1YIH B; 2RAO A; 3PI8 B; 1QPW B; 2QSS B; 1O1O B; 1COH B; 2AUQ A; 3VRF B; 2O5Q X; 1HBR A; 3ZJQ A; 3EOK A; 3UHX A; 1JL7 A; 1S5Y A; 1MKO A; 3VRG A; 1FAW B; 1YOH A; 2D2N D; 5SW7 B; 1Y4P B; 3TLD A; 4YU3 A; 1S56 A; 1PBX B; 3PI9 A; 1BUW B; 1DWS A; 2D5X B; 4ESA B; 3QM5 A; 3LQD B; 2W72 A; 5HU6 B; 2PEG B; 1LHT A; 1AJ9 B; 1A00 B; 4AVE A; 3WCU D; 3G52 A; 4U8U D; 2CMM A; 3NL7 B; 1MNJ A; 2MYE A; 3GOU B; 2AA1 A; 1LFQ B; 1HBI A; 2QU0 B; 1GBV B; 2DXM B; 1XZV A; 3PT8 A; 1BZ1 B; 1HBA B; 1HDA A; 1BZ6 A; 1G08 A; 2MYD A; 3KMF C; 1OUU A; 2GRH A; 1GCW A; 3BJ1 B; 1MLU A; 3OK5 A; 1LH1 A; 4MQI A; 3AT6 B; 2MGK A; 2HBC A; 1YEN B; 2HBD A; 4F68 A; 3R0G A; 1QXE B; 3WCV B; 1NIH A; 1W92 A; 1Y0W B; 1Y45 B; 1CIK A; 2R80 B; 1YHU A; 2HBS A; 2ZS1 B; 1YIE B; 1LFZ A; 1J52 A; 1NZ5 A; 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