The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
142
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structure length |
142
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Chain Sequence |
LTAEEKAAVTGFWGKVKVDEVGAEALGRLLVVYPWTQRFFEHFGDLSSADAVMNNAKVKAHGKKVLDSFSNGMKHLDDLKGTFAQLSELHCDKLHVDPENFKLLGNVLVVVLARHHGSEFTPLLQAEFQKVVAGVANALAHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-1/2
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| publication title |
Crystal Structure determination of Goat Methemoglobin at 2.7 Angstrom
rcsb |
| total genus |
44
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| structure length |
142
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| sequence length |
142
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| chains with identical sequence |
D, J, L
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-10-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1V4U A; 4XDI A; 1OUU A; 3AG0 A; 1ECN A; 1Y8W B; 1GZX A; 1DO3 A; 5D5R A; 1HBI A; 2DN2 A; 1BZZ B; 4IT8 A; 2HHB B; 5EUI A; 3UHC A; 1QI8 A; 4DC8 A; 1JY7 B; 1O1O B; 5IKS A; 1GBU A; 1JZM A; 1GCV A; 2DN1 B; 3S1J A; 4PQ6 A; 1DLW A; 3ODQ A; 3WI8 A; 1J7Y A; 3UHB A; 1NWN A; 1PBX A; 4MQH A; 1G0A A; 1NZ2 A; 1SPE A; 2XKI A; 1THB B; 3HRW B; 4NZI A; 1S5X A; 2G0V A; 3HF4 A; 4KN3 A; 3GLN A; 1M6M A; 2ZFO C; 4ODC B; 1YEQ A; 1YEV A; 3A59 A; 2AUQ A; 3ZJP A; 1BZ0 A; 2E2Y A; 3QJD B; 3QQR A; 3QM5 A; 1EW6 A; 2ZSN A; 2V1H A; 4F6I A; 3PIA A; 4PQB A; 2OHB A; 3UBV A; 3RJN B; 1RQ3 B; 1ECA A; 3GQG A; 1LFY A; 3NG6 A; 1XZ4 B; 1G09 B; 2NRM A; 1Y7G B; 1MDN A; 3LR9 A; 2R80 A; 1Y7D B; 4M4A B; 1YIE A; 2HBS B; 2ZLW A; 2MGD A; 4GZG A; 1DO1 A; 4L7Y A; 1GCW B; 2HHE B; 3S1I A; 3TLD A; 3AQ9 A; 2CMM A; 3SDN A; 1YOI A; 2ZT0 A; 3MJP A; 1Y4V B; 1Y7C A; 5CN7 A; 1BJE A; 4G1V A; 1MLH A; 3BCQ A; 5JDO F; 1IOP A; 1N9F A; 1V5H A; 1R1Y A; 1J7W A; 2ZSR A; 1AJG A; 2MYA A; 2OLP A; 4U8U B; 3UGY A; 1FSX B; 2NSS A; 1V75 B; 4O35 A; 1MLM A; 1Y85 B; 3E4N A; 1QSI A; 1Y46 B; 2GKM A; 3WCU C; 1F5O A; 1SDK B; 5E6E A; 1MBI A; 4ROM B; 2V1K A; 2O58 X; 1FDH A; 4TWU A; 1HV4 B; 3DR9 A; 4TYX A; 1SHR B; 2OIF A; 1GJN A; 3DUT A; 1MTI A; 3WHM B; 3LB4 A; 3UHH A; 1IBE B; 2Z85 A; 3D4X A; 1Y31 A; 4MBA A; 1LFL A; 1J40 B; 1VXG A; 4HHB A; 3GOU A; 3ZH0 A; 1MYF A; 4N7P B; 4N7N B; 1S56 A; 5EU2 A; 3UH3 A; 3D17 B; 1BZ1 A; 4MQJ A; 5CNB A; 1LA6 B; 4UIQ A; 2PEG A; 1Y09 B; 2V1G A; 3WFU A; 1DXT A; 4ZVA A; 1X46 A; 2OH8 A; 4HRR A; 1XZ5 A; 3HYU B; 3LB3 A; 1CLS B; 2D5X B; 1CQX A; 1X9F B; 1RTX A; 1MKO A; 1DTI A; 1Y4F A; 1RPS A; 3OZV A; 3PT8 B; 1MLN A; 1BVC A; 4B3W A; 2ZSO A; 3PI9 A; 1VRE A; 3MJU A; 2W6W A; 4LPI A; 1HBH A; 3UHV A; 4YU3 A; 1HGC B; 1HBS A; 3ORD A; 1MGN A; 1DO7 A; 1MCY A; 1GLI B; 4OF9 A; 1FHJ A; 4FH7 A; 1YH9 B; 1URY A; 5HLU A; 1C7D B; 1O1I A; 1FCS A; 4PNJ A; 1MNI A; 1XZV A; 2QMB A; 3B75 A; 1YGD A; 1DXU A; 2DN3 B; 1MOA A; 3WCW B; 3GKT A; 3PI8 B; 1GDL A; 1NS6 B; 2WTG A; 1YGF B; 4U8U C; 4PQC A; 2D2N A; 3RGK A; 5ILM A; 3UHX A; 1YFF A; 1J52 A; 3VRG B; 3QJC A; 3O7N A; 3QJB B; 2QRW A; 1ECO A; 1Y35 B; 1CMY A; 1TU9 A; 1Y0W A; 1HAB B; 3BOM A; 1Y0T B; 1LUE A; 3G4Y A; 4FC3 A; 2BKM A; 5KDQ A; 2MGE A; 2HBD A; 1J7S B; 1MOC A; 4FWZ A; 1BAB B; 3CY5 B; 3NL7 B; 1I3D A; 5E83 B; 5F0B A; 3K9Z A; 3HEO A; 5HBI A; 1MYJ A; 1XZ7 B; 1V4W A; 3UHG A; 2MGK A; 3QM8 A; 3ZJL A; 3NFE A; 109M A; 4FWY A; 1G9V A; 2EB8 A; 1A00 A; 5EET A; 3WR1 B; 3ZOL A; 1YVT A; 3HXN A; 1YHU B; 5AZR A; 3AT5 A; 1BIJ A; 3ECZ A; 1BUW A; 1G0B A; 1NEJ B; 1AJH A; 2G11 A; 1ABW A; 2ZST A; 3R0G A; 1Y2Z B; 3QZX A; 2D60 B; 3OK5 A; 1HDB A; 1MYM A; 4H2L A; 2AUP A; 2MGF A; 4MQG A; 3M3A A; 5CN6 A; 1O1N A; 1Y4B A; 1WMU B; 3HHB B; 1CP5 A; 3DHT A; 1XQ5 A; 3VRE A; 3ZJI A; 1XYE B; 1DXV A; 1K0Y B; 1MYZ A; 1XY0 B; 1NQP B; 2G0Z A; 1QXE B; 2VYW A; 1LHS A; 3KMF A; 3WCT C; 1X9F D; 2R50 A; 3UH7 A; 1O1L B; 5B84 A; 1Y22 B; 3FH9 B; 3EOK A; 2EVK A; 2GDM A; 3M39 A; 3UHI A; 3QZZ A; 5E29 B; 3V2V A; 1MLO A; 1UVY A; 1DWT A; 1HBR B; 1Y8H A; 4YU4 B; 3SZK B; 3OZU A; 1V07 A; 1O1K B; 3WCW D; 1YEU B; 5HY8 B; 2GNV A; 4ODC A; 3WCV B; 3AT6 B; 5AZQ A; 3ECX A; 1MLL A; 2GRH A; 2HBC B; 3OO4 B; 2H8D A; 1Y7Z B; 3FS4 B; 2MHB B; 1C7B B; 1MBC A; 2G12 A; 1LFZ B; 101M A; 4MBN A; 6HBW A; 3ED9 A; 4BJA A; 1AZI A; 1J3Y B; 2RI4 A; 3ECL A; 3QM6 A; 1HRM A; 4KMV A; 4NI0 A; 1HGB A; 2HBS A; 1W92 A; 4C44 A; 2ZT4 A; 2BNL A; 2HHE A; 1Y5J B; 3GYS B; 3W4U A; 1CG5 B; 5HU6 B; 2G0S A; 1UIW B; 1Y5K A; 3ZOM A; 1LFV B; 2EKU A; 1J3Z B; 5SW7 B; 2AA1 B; 1XZU A; 4F68 A; 1CH2 A; 1DUO A; 3G4W A; 2ZFO B; 1RSE A; 1JDO A; 1MWC A; 1O1M B; 1YHU D; 3SDH A; 1Y5F A; 3D1A B; 1S61 A; 1Y4G A; 1HCO B; 1H1X A; 5HAV A; 1JP9 A; 2HZ1 A; 2ZS1 A; 1Y85 A; 1G08 B; 1UC3 A; 3MBA A; 2LHB A; 3UHU A; 1ASH A; 3DHR A; 2QLS B; 1CO9 A; 2QU0 A; 3IC0 A; 4ROM A; 2MYE A; 4G51 B; 2G10 A; 1ECD A; 1SHR A; 4M4B B; 3A5G A; 2QSS B; 1IDR A; 1Y4P A; 4O2G A; 1XXT B; 5CN8 A; 3EDB A; 1MBO A; 1HBA B; 2HCO B; 2HHD A; 2B7H A; 3EU1 B; 1O1J B; 1XZ2 A; 2OHA A; 2PGH B; 4HSW A; 1YHE A; 4NXC A; 4F4O B; 1LH2 A; 1QSH B; 1NS9 A; 1C40 B; 1IRD B; 1SI4 A; 1YCB A; 1Y0A A; 4N7O A; 1RQ4 A; 4HRT A; 3WCP B; 5JDO E; 1S69 A; 2DHB A; 3HYU A; 1MBA A; 5C6Y A; 2MGB A; 3UHY A; 1IT3 A; 1X9F A; 5EE4 D; 1A3O A; 4F6J A; 2EB9 A; 3QJE B; 1T1N A; 2XYK A; 1RVW A; 3WCU B; 1UT0 A; 1A3N A; 4AVD A; 3MKB A; 1ABY A; 3WCV D; 4F6D A; 2DXM A; 1CQ2 A; 4MQC B; 1MBS A; 1FLP A; 1GLI A; 3GKV B; 1VXC A; 3OO5 A; 4MQI B; 1C7D A; 1WVP A; 2SPO A; 4NI1 A; 1HHO B; 1A01 A; 3PT7 A; 3A0G A; 3WFW A; 2GRF A; 1LH3 A; 3S66 B; 1MYG A; 2VLX A; 3AQ6 A; 2GL3 A; 3G4V A; 1CBM A; 2O5M X; 1CP0 A; 5JGG B; 1C7C B; 1YG5 A; 2D2M C; 3VRG A; 2ZLU A; 1R1X B; 4MAX A; 1Y8I B; 2HBF A; 3BJ2 B; 3BJ1 A; 1X3K A; 3RJ6 A; 3ZJO A; 1HAC A; 2LH7 A; 2FRF A; 3E5O A; 1Y0D B; 1MNJ A; 1YHR B; 4N8T B; 2R4Z A; 1F65 A; 3R5I B; 3V2Z A; 2GTL C; 1CH4 A; 2ZFO D; 4AVE A; 1N9X A; 3NL7 A; 3UHS A; 1SPG B; 2W72 A; 1JEB B; 3PI3 A; 2ZSQ A; 1YOG A; 1CH5 A; 2LH5 A; 1LFT A; 2AUO A; 2MGI A; 3D1K B; 1KD2 A; 2Z6N B; 1NPG A; 1MYT A; 3O89 A; 2FAL A; 1Y45 B; 4ZVB A; 3UHN A; 2SPL A; 1F63 A; 1SDL B; 3BJ3 B; 5ILE A; 1CH9 A; 1NAZ A; 2EF2 A; 1HGA B; 3ZJQ A; 1JF3 A; 1MYI A; 1HDS B; 1GBV A; 4IRO B; 3ZJJ A; 3WFT A; 1JL6 A; 3UBC A; 3WTG A; 1CG8 B; 2MGH A; 3UHR A; 1MLF A; 1MLU A; 1NPF A; 5C6E B; 1XYE A; 1IT2 A; 2AV0 A; 1YEN B; 3NMM A; 2ZLT B; 1HBB B; 1K0Y A; 1N9H A; 2WY4 A; 1DWS A; 2BWH A; 2M6Z B; 1K1K A; 2HZ3 A; 1YIH A; 3UHD A; 1MOB A; 1D8U A; 3LB1 A; 1S0H A; 3PEL B; 2R1H A; 1O1L A; 2H35 B; 4MU5 A; 2ZS0 B; 5KER B; 4ESA B; 1JW8 A; 1NWI A; 1FN3 A; 3WCU D; 4ROL B; 3NML A; 112M A; 1FAW A; 1OFK A; 3VRF A; 1NIH A; 5CNG A; 1A4F A; 1DKE A; 3GQP B; 1QPW A; 1MBN A; 1Y83 A; 1Y0C A; 1V4X A; 3K8B A; 3S65 B; 1MWB A; 1CIK A; 2D5Z B; 1V4U B; 4UUR A; 1OUU B; 4WJG 1; 3QMA A; 4O4Z A; 3AQ5 A; 3ZJR A; 5JDO C; 1GZX B; 2DN2 B; 1OUT A; 5EUI B; 1QI8 B; 5CNF A; 1YZI A; 5HLX A; 1GBU B; 1Y4Q A; 1GCV B; 3ODQ B; 1AJ9 A; 3WFX A; 1M9P A; 1J7Y B; 1PBX B; 2O5T X; 1G0A B; 3WCT B; 1IWH A; 1YE0 A; 1S5X B; 2NSR A; 1YE2 A; 3A5A A; 3HF4 B; 1Y8K A; 108M A; 4FWX A; 1MOH A; 1YEQ B; 1YEV B; 3TM3 A; 1Y5J A; 3A59 B; 4WCH D; 4O4T A; 1LH6 A; 4DC7 A; 1BZ0 B; 1CG5 A; 3HEP A; 1QXD B; 1VWT B; 5SW7 A; 2ZS1 C; 3PIA B; 1VXE A; 2WTH A; 1MWD A; 1B0B A; 1FDH G; 3GQG B; 1LFY B; 3NG6 B; 1A6G A; 1LFQ A; 2GKN A; 2ZLX A; 1A0Z B; 4U8U D; 1VXB A; 2R80 B; 1A9W A; 1HJT A; 2Z8A A; 2C0K A; 2ZLW B; 1GVH A; 1HCO A; 1EBC A; 2LH1 A; 4L7Y B; 3S48 C; 4F6B A; 1BVD A; 2ZFB A; 2H8F A; 3QM7 A; 3UHE A; 2DC3 A; 4G1B A; 1LJW A; 2ZS0 C; 3MJP B; 1DLY A; 1Y7C B; 1YDZ A; 1V9Q A; 1DM1 A; 1RQA B; 2ZSS A; 1HDA A; 2LH2 A; 3PI1 A; 2SPN A; 1VHB A; 3BCQ B; 3GQR A; 2D6C A; 4X0L A; 2MGA A; 1B86 A; 2YRS A; 3LQD A; 6HBI A; 1R1Y B; 1J7W B; 3P5Q A; 1XCH A; 5CHQ A; 1BZ6 A; 1S5Y A; 3QM9 A; 2VYY A; 3CIU A; 3ONZ A; 2SPM A; 3PI4 A; 1QSI B; 1CH1 A; 2ZSX A; 3BA2 A; 1KR7 A; 5E6E B; 3IC2 A; 1EWA A; 1CO8 A; 3H58 A; 3DUT B; 1Y8W A; 4F6G A; 3D4X B; 1Y31 B; 1LTW A; 1LFL B; 1BZZ A; 4HHB B; 3GOU B; 2HHB A; 1TES A; 3G4U A; 1BZR A; 1JY7 A; 1O1O A; 2G0X A; 2JHO A; 3QQQ A; 2DN1 A; 3IA3 B; 4NK1 A; 1BZ1 B; 4MQJ B; 1MTK A; 1GDK A; 2BK9 A; 1YCA A; 1YEO B; 2PEG B; 3UHZ A; 1THB A; 3HRW A; 1DXT B; 5MBN A; 4HRR B; 2VLY A; 3KUO A; 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3D7O B; 1LA6 A; 2BW9 M; 4DWU A; 2BLH A; 4MQK B; 104M A; 1Y09 A; 4ESA A; 4H2L B; 4MQG B; 2MBW A; 106M A; 1O1N B; 1Y4B B; 2V1J A; 1CLS A; 2D5X A; 3DHT B; 1XQ5 B; 1Y01 B; 3VRE B; 3MYN A; 5EQM A; 1DXV B; 3PT8 A; 4MPM A; 1U7R A; 5CND A; 2D5Z A; 4ILZ A; 3M38 A; 2GRZ A; 1YVQ B; 1HGC A; 1RTE A; 2V1F A; 2D2N C; 1HBG A; 1YH9 A; 1DXD A; 1MLJ A; 3EOK B; 4MXL A; 3ASE A; 2DN3 A; 3ZJS A; 3WCW A; 1MBD A; 2FAM A; 3PI8 A; 3EDA A; 1MNH A; 1NS6 A; 1YGF A; 3G53 A; 3AQ8 A; 3WCT A; 1Y8H B; 1A6K A; 1URV A; 3QJB A; 1Y35 A; 2VM0 A; 4B4Y A; 3AQ7 A; 5CNC A; 1HAB A; 2VEB A; 1Y0T A; 1PMB A; 2D2N D; 2H8D B; 5CN9 A; 4F69 A; 1UFP A; 2LH6 A; 1QXD A; 1VWT A; 1JP8 A; 1M6C A; 4KMW A; 1CBL A; 6HBW B; 2MGL A; 1J7S A; 1JWN A; 1DTM A; 1UX9 A; 1BAB A; 2W31 A; 3CY5 A; 5HLQ A; 2RI4 B; 1A0Z A; 5E83 A; 2NX0 A; 4NI0 B; 1HGB B; 1XZ7 A; 2HBE B; 1EBT A; 2D2M D; 3TM9 A; 2BLJ M; 3W4U B; 3WR1 A; 1JL7 A; 1CPW A; 1O16 A; 1Y5K B; 2Z6S A; 1YHU A; 5B85 A; 1RQA A; 1MLG A; 1NEJ A; 1EMY A; 1ITH A; 1XZU B; 1F5P A; 2GTL D; 4O1T A; 1Y2Z A; 3GDJ B; 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