The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
35
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHWSAEEKQLITSIWGKVNVADCGAEALARLLIVYPWTQRFFSSFGNLSSATAISGNPNVKAHGKKVLTSFGDAVKNLDNIKGTFAQLSELHCDKLHVDPENFRLLGDILVIILAAHFGKDFTPECQAAWQKLVRVVAHALARKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-A
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| publication title |
Crystal structure determination of pigeon (columba livia) haemoglobin at 3.5 angstrom resolution
rcsb |
| total genus |
35
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-04-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VRG B; 1X3K A; 2MGG A; 2AUR A; 1O1N B; 2W6W A; 1A01 A; 1YHU C; 1DWR A; 3OJ1 A; 4MQJ A; 4HRR B; 1IBE A; 3DR9 A; 3SZK B; 2OHA A; 1YEO A; 2RI4 A; 1HV4 A; 5E6E B; 4ROL B; 2HHD A; 1YIH A; 4O2G A; 4ZVB A; 1YOI A; 2R50 A; 3DHT A; 3QZZ A; 3OVU C; 5CN8 A; 1VXE A; 1XZ2 A; 3NFE A; 1RQA B; 5JDO C; 3VRG A; 3HEO A; 1YMB A; 1J3Y B; 1O1N A; 2EB9 A; 1X9F B; 1Y4R B; 1RQ4 B; 3PI9 A; 2QU0 B; 4HRR A; 1C7C B; 2R4Z A; 3SZK A; 5E6E A; 5EQM A; 4ROL A; 3G52 A; 3OZV A; 1MLG A; 3MN0 A; 112M A; 2V1E A; 2GRZ A; 1MOB A; 2H8F B; 1GBU B; 1RQA A; 4F69 A; 1CP5 A; 1V07 A; 1J3Y A; 1HBH B; 3ARJ A; 1G09 B; 4GZG A; 1GBV B; 1X9F A; 1Y4R A; 1YVQ B; 1O1P B; 3ECX A; 2HHE B; 1RQ4 A; 2QU0 A; 4JAC A; 1ECA A; 1O1M B; 1C7C A; 1HHO B; 1HDA B; 5JOM A; 1J7W B; 4ODC B; 1XZ4 B; 1XZ5 A; 2NSR A; 1KR7 A; 1G0B B; 2Z6S A; 1KFR A; 2EVK A; 1YE2 B; 5KKK A; 2VHB A; 1GBU A; 1MWD A; 2ZSZ A; 1BZ6 A; 1HDS B; 1HBH A; 1G09 A; 1GBV A; 3CY5 B; 1YVQ A; 1O1P A; 1IT3 A; 2HHE A; 1BVC A; 4IRO B; 1O1M A; 1SDL B; 1MYJ A; 1Y4V A; 1HHO A; 3ZHW A; 2HBD B; 1HDA A; 1Y7Z B; 1J7W A; 4ODC A; 1XZ4 A; 2VYY A; 1MBS A; 3MYM A; 3AQ7 A; 1BAB A; 1G0B A; 1X9F C; 3OK5 A; 1G08 B; 1Y46 A; 1MNI A; 1Y85 A; 3HEN A; 1YE2 A; 1XY0 B; 3PEL B; 1HDS A; 1DXD A; 4IT8 A; 2NSS A; 1DWT A; 2V1K A; 3CY5 A; 4AVE A; 4IRO A; 1DO7 A; 2HBD A; 1Y7Z A; 5AZQ A; 1Y4P A; 2ZT1 A; 1G08 A; 1J7S B; 1VXG A; 2V1I A; 1XY0 A; 4MU5 A; 3PEL A; 2MGH A; 4FWZ A; 2VLZ A; 1CH9 A; 2BKM A; 3PI1 A; 1LFY B; 1NZ3 A; 1Y5J B; 1R1X A; 1BZP A; 4L2M A; 1CP0 A; 3WTG B; 3UHK A; 1YOH A; 2ZLV B; 1XQ5 B; 2MYD A; 108M A; 3M39 A; 1WMU B; 5EU2 A; 1JZM A; 1URY A; 2ZS0 A; 3G4U A; 2BLJ M; 1ABW B; 3WCU D; 2XYK A; 1A00 B; 4F6D A; 1UVX A; 1LFY A; 1NZ4 A; 1Y5J A; 3WTG A; 3LB4 A; 3GKV B; 1COH B; 4UZV A; 1WMU A; 1BUW B; 5EET A; 3WR1 B; 3UBV A; 1GVH A; 1RVW B; 2R4W A; 1LHT A; 3S66 B; 2GTL B; 4HHB B; 1MOC A; 2PEG B; 1ABW A; 5HLU A; 3LB1 A; 1Y5K B; 1A00 A; 2D2N A; 2ZS0 C; 4WJG A; 4NXA A; 3GKV A; 2G11 A; 1HBI A; 2YRS B; 3UHH A; 1J41 B; 1YOG A; 5CND A; 1COH A; 4MQK B; 2LHB A; 3UHC A; 1JP6 A; 3WR1 A; 1RVW A; 2ZS1 A; 3PI4 A; 1CH5 A; 1M6M A; 3VRF B; 3P5Q B; 1URV A; 4QAU A; 2GTL A; 3S66 A; 4HHB A; 2PEG A; 3WCV B; 1DWS A; 1Y5K A; 1QPW A; 5CNF A; 3OO4 B; 2YRS A; 3IXF A; 1JDO A; 1J41 A; 3TM3 A; 4MQK A; 1LA6 B; 2D2N C; 1Y22 B; 1YEU B; 4F6F A; 4O4Z A; 3UHW A; 1S5X B; 3OO5 B; 3VRF A; 3E5O A; 3UH7 A; 3P5Q A; 1FN3 B; 1HCO B; 1MLF A; 3WCV A; 1LFT B; 3UGZ A; 3LB2 A; 2ZS1 C; 1MLO A; 3AT5 B; 2MHB B; 2MGL A; 3OO4 A; 2GTL C; 1NEJ B; 2GKN A; 3GQR B; 2ZSP A; 3H58 A; 3UHB A; 1Y22 A; 1YEU A; 1S5X A; 3OO5 A; 1FN3 A; 1HCO A; 3IC2 B; 1N9H A; 1LFT A; 1MBA A; 1RQ3 B; 4DC7 A; 1H97 A; 3AT5 A; 2ZLX B; 2MHB A; 1Y83 A; 1NEJ A; 5ILM A; 3IA3 B; 3LHB A; 3WCV C; 2LH2 A; 3GQR A; 2VEE A; 3ASE A; 4TWU A; 1DLY A; 2SPO A; 3GYS B; 4MBA A; 4NK2 A; 3ARL A; 5CN9 A; 3A5A A; 1JZK A; 3ZJS A; 3IC2 A; 2AUP A; 2V1F A; 1U7S A; 1RQ3 A; 4WJG 1; 2ZLX A; 1CH1 A; 5B85 A; 5B84 A; 4U8U D; 1MLL A; 1CH2 A; 3VRE B; 3K9Z A; 1IWH B; 5MBA A; 3GDJ B; 1A0U B; 3GYS A; 4YU3 A; 102M A; 4DC8 A; 1YE0 B; 3QM6 A; 1YDZ B; 1HGA B; 2D2M D; 1N9F A; 3ORD A; 1NIH B; 2KSC A; 1O1K B; 2VYW A; 1QI8 B; 1UX8 A; 5JDO E; 3R5I B; 2GLN A; 2WY4 A; 2SPL A; 1IWH A; 1VWT B; 1JWN A; 3G4Q A; 1Y0D B; 3GDJ A; 1A0U A; 5AZR A; 3R0G A; 2DHB B; 1FHJ B; 2W6X A; 1OJ6 A; 1YE0 A; 1YDZ A; 1HGA A; 4AVD A; 1NIH A; 4MQG B; 1O1K A; 1QI8 A; 1NPF A; 3AQ9 A; 2ZFO D; 1LH3 A; 2PGH B; 1A0Z B; 1YVT B; 7HBI A; 5EE4 D; 1IDR A; 3S48 C; 1LH2 A; 1DUO A; 3EDB A; 1LH6 A; 1VWT A; 1XZU B; 1CPW A; 1Y0D A; 1LUE A; 4NI0 B; 1UIW B; 1V75 B; 2G12 A; 4F6G A; 1MCY A; 4N7P A; 1MYF A; 4UIQ A; 2W6Y A; 2XKH A; 4N8T B; 4MQG A; 1Y4Q B; 4MXK A; 2SPM A; 2PGH A; 1A0Z A; 1MOD A; 1Y2Z B; 1YVT A; 1OUU B; 3UHS A; 5C6Y A; 1S5Y A; 1GLI B; 1JF4 A; 1XZU A; 1MLU A; 1Q1F A; 1UVY A; 1HBB B; 3K3U A; 4NI0 A; 4UUR A; 1UIW A; 1V75 A; 3E4N A; 1NGK A; 1YHU D; 3QJC B; 1Y31 A; 2MYB A; 1V4U B; 2O5T X; 2OIF A; 1CH4 A; 4N8T A; 111M A; 1CH7 A; 1Y4Q A; 3EOK B; 2DXM B; 1EBC A; 1MNH A; 1JY7 B; 3WHM A; 1LH7 A; 1YEV B; 1Y2Z A; 3D1A B; 1OUU A; 4MQH B; 1F65 A; 1BIJ B; 1Y45 A; 1BBB A; 1GLI A; 1OR6 A; 1MOH A; 5JDO D; 3A2G A; 5HY8 B; 3HF4 B; 1KD2 B; 1HBB A; 5JDO F; 1HJT A; 1F5O A; 1UX9 A; 1BZ1 B; 3QJC A; 103M A; 1V4U A; 3EOK A; 1A9W A; 1VXA A; 2DXM A; 3ZJL A; 1HBG A; 1JY7 A; 1YEV A; 2GNW A; 3D1A A; 1EWA A; 3PI9 B; 1A6M A; 4MQH A; 1BIJ A; 4WCH D; 1CG8 B; 1MNJ A; 1QXD B; 2R1H B; 2MYE A; 3QZX A; 5KDQ B; 5HY8 A; 3HF4 A; 1KD2 A; 1K1K B; 2FRJ X; 3DHR B; 2LH5 A; 1BZ1 A; 1MLK A; 1MYG A; 2ZLU B; 4M4A A; 2AV0 A; 2G3H A; 1JEB A; 1VRF A; 5AB8 A; 5EYS A; 2O5Q X; 4LPI A; 1ECN A; 5CNE A; 3UH5 A; 1CG8 A; 1QXD A; 2R1H A; 3A9M A; 1V4X A; 3S1I A; 1XZ5 B; 2H8D A; 5KDQ A; 3OGB A; 1VHB A; 2GRH A; 4XDI A; 2FRF A; 2HZ1 A; 1K1K A; 1EMY A; 3DHR A; 2SPN A; 2ZLU A; 2HZ3 A; 2Z85 A; 4PQC A; 3CIU B; 1LFL B; 3QMA A; 1W92 A; 1X9F D; 1Y4V B; 1HLM A; 2Z8A A; 2MGM A; 2EVP A; 1BAB B; 1Y46 B; 1Y85 B; 5HLQ A; 4DWT A; 4X0L B; 3CIU A; 1YHE B; 3UHT A; 2OLP A; 3G4R A; 1LFL A; 2MGA A; 4VHB A; 4NI1 B; 3D4X B; 1O1L B; 1JL7 A; 1LFV B; 1Y4P B; 2V1H A; 4C0N A; 4X0L A; 2NRM A; 4MQI B; 1V9Q A; 3UHZ A; 1YHE A; 3LQD B; 1HGC B; 3UGY A; 4NI1 A; 4M4B A; 1R1X B; 3D4X A; 1O1L A; 1VXB A; 1IRC A; 3FH9 B; 1MNK A; 3UHX A; 3UHI A; 1MTI A; 109M A; 2BLH A; 2W72 B; 1BZZ B; 1LFV A; 1CO8 A; 2EF2 A; 2G0Z A; 1DXV B; 2ZSO A; 3ZOL A; 2ZS0 B; 2EKT A; 3ED9 A; 1JPB A; 4MQI A; 1J40 B; 2G0V A; 3LQD A; 4NK1 A; 5CN6 A; 1HGC A; 1OFK A; 3ZJO A; 3GKT A; 2MGJ A; 1YG5 B; 3FH9 A; 1D8U A; 2BLI A; 5CN5 A; 1Y8I B; 2W72 A; 1NQP B; 4C44 A; 2HBG A; 1BZZ A; 2O5S X; 1DXV A; 1DUK A; 2D60 B; 1J40 A; 3M3A A; 2QSS A; 4XS0 B; 4SDH A; 1BZR A; 3G46 A; 3RGK A; 5E83 B; 2ZT2 A; 2D2N B; 3ONZ A; 2FRI X; 1ECD A; 1WVP A; 1YG5 A; 1MKO A; 1BZ0 B; 1DM1 A; 1Y0C B; 1Y8I A; 1NQP A; 1Y4G B; 1Y7D A; 2ZT4 A; 1YHR B; 2G0R A; 3WCU A; 2ZS1 B; 2D60 A; 1MZ0 A; 3ARK A; 1NPG A; 3D1K B; 1IT2 A; 2W72 C; 4XS0 A; 5E83 A; 1FCS A; 1C7B B; 110M A; 1UT0 A; 1QPW B; 1MBN A; 1BZ0 A; 3AQ5 A; 1CQX A; 1Y0C A; 3AQ6 A; 1MYZ A; 1CBM A; 1AJ9 B; 1Y4G A; 1YHR A; 3ZJP A; 2HHB B; 3OZW A; 2D5Z B; 5JGG B; 3WI8 A; 3D1K A; 3G4W A; 3MKB B; 1LTW A; 2GTL D; 1ITH A; 1C7B A; 3BJ2 B; 3WCU C; 1DO3 A; 1OUT B; 1JZL A; 3QJD B; 3ZOM A; 101M A; 4HRT B; 5M3S A; 3WCW B; 5KER A; 1AJ9 A; 2ZT0 A; 2OH8 A; 2HHB A; 2ZSQ A; 1OR4 A; 5CN7 A; 2D5Z A; 5JGG A; 3UI0 A; 1F5P A; 1NWI A; 1AZI A; 2VLX A; 3TM9 A; 1DTI A; 1XCH A; 2H35 B; 3MKB A; 3WCT B; 4OOD A; 4KN3 A; 3WCV D; 3BJ2 A; 3UHN A; 1Y8W B; 1HBR B; 1OUT A; 4B3W A; 3QJD A; 1Y83 B; 4BJA A; 3U3E A; 2Z6T A; 4HRT A; 1G9V B; 3NG6 B; 1MGN A; 3WCW A; 1MWC A; 1N9X A; 1VXC A; 2R4Y A; 1AJH A; 3AT6 B; 1DTM A; 4O1T A; 2O5M X; 2H35 A; 3O7N A; 2DN1 A; 3WCT A; 2MYC A; 1Y8W A; 4O4T A; 1VRE A; 1HBR A; 4G1B A; 3ZJI A; 3WFX A; 1XZ7 B; 4MBN A; 3GQG B; 1V4W B; 4OF9 A; 1YFF B; 5F2A A; 1SDK A; 1G9V A; 3NG6 A; 2ZSS A; 5C6E A; 3A59 A; 1I3D A; 1MBI A; 1SPG B; 3AT6 A; 4YU3 B; 2QMB B; 4KMW A; 2Z6N B; 3WCW C; 3IC0 B; 3MBA A; 1DXC A; 3RJ6 A; 1S0H B; 1JL6 A; 1MLS A; 3OZU A; 5D5R A; 1HSY A; 1YH9 B; 1CMY B; 1CIO A; 1XZ7 A; 2QLS B; 3GQG A; 1V4W A; 3WCT C; 2GKM A; 3ZJQ A; 1YFF A; 3AQ8 A; 2V1G A; 1NZ2 A; 3QM5 A; 3HEP A; 104M A; 3ECL A; 3B75 B; 1SPG A; 1FSL A; 2QMB A; 2QFK A; 1LFQ B; 1Y0W A; 2Z6N A; 4HSW A; 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1CLS A; 1CG5 B; 3GQP B; 5SW7 B; 2WTH A; 4L7Y A; 3HXN A; 1XZV A; 3UHQ A; 3HYU B; 4M4A B; 1HAB A; 1JEB B; 1A6G A; 3ZJH A; 2G10 A; 2W31 A; 2ZLW A; 1YZI B; 2HBF A; 3AG0 A; 1K0Y B; 1QSI B; 1ASH A; 1GDL A; 4ESA A; 3PIA B; 2BNL A; 3BJ1 B; 1V4X B; 2QRW A; 5E29 A; 1S69 A; 1SHR A; 3S65 B; 2H8D B; 1LJW A; 1QXE A; 1CG5 A; 3GQP A; 5SW7 A; 1IOP A; 3HYU A; 1XYE A; 1LH1 A; 2ZLT B; 4PQ6 A; 2R4X A; 5CNG A; 5MBN A; 3QQQ A; 1V5H A; 1YZI A; 1K0Y A; 1QSI A; 2NRL A; 1OFJ A; 2ZSN A; 3PIA A; 3BA2 A; 3BJ1 A; 1HBS A; 4KJT A; 3S65 A; 2BW9 M; 4MPM A; 2HZ2 A; 1M6C A; 2LH7 A; 5CMV A; 1FSX B; 2MGF A; 1FDH A; 2ZLT A; 3HC9 A; 1J52 A; 2QFN A; 5CHQ A; 1HRM A; 1MLR A; 2GL3 A; 2AUO A; 1UFP A; 4MQC B; 3VAU A; 1DKE B; 1G0A B; 1NWN A; 3UHU A; 1GDJ A; 1Y35 B; 6HBW B; 1FSX A; 4ZVA A; 2B7H B; 3WFU A; 1DXU B; 1EW6 A; 1HDB B; 1RTE A; 1UMO A; 5ILP A; 1T1N B; 1FDH G; 1JP9 A; 3KUN A; 1A6N A; 4M4B B; 4MQC A; 3O89 A; 3ZJR A; 1DKE A; 2H8F A; 1G0A A; 2EB8 A; 1Y35 A; 6HBW A; 5HU6 B; 1NS9 B; 3BCQ B; 2BK9 A; 1MYI A; 2B7H A; 2LH3 A; 1XXT B; 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