The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSAADKTNVKAAWSKVGGNAGEFGAEALERMFLGFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKAHGKKVGDALTLAVGHLDDLPGALSNLSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLSTLAVHLPNDFTPAVHASLDKFLSSVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Crystal structure of haemoglobin from donkey (Equus asinus) at 3A resolution
pubmed doi rcsb |
| total genus |
58
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-12-31 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3OO4 B; 2HHB A; 2XYK A; 4WCH D; 1LFL A; 2LH6 A; 3WR1 B; 2ZT1 A; 1R1X A; 1X9F A; 1A0Z B; 3VAU A; 3BA2 A; 1YCA A; 2Z6N B; 4G1B A; 3E5I A; 1Y4R B; 2ZLX B; 2OH9 A; 3ZJL A; 3A9M A; 1CP0 A; 3GQP A; 1XZ2 B; 3WCP B; 3ECX A; 3S66 A; 1EMY A; 2V1F A; 1YDZ B; 3CY5 B; 2ZS1 A; 2V1J A; 1SPG B; 2MGD A; 1YFF B; 1A6G A; 2LH3 A; 2O5S X; 1GCW B; 5E83 A; 3QJC A; 1S61 A; 1IBE A; 1VHB A; 1JL7 A; 1A0U A; 3AT5 B; 5HU6 B; 3R5I A; 1EW6 A; 1VXB A; 1N9I A; 1J3Z B; 1MDN A; 1DLW A; 3UGY A; 1RPS B; 1DXT A; 1GJN A; 3NML A; 1RQ3 B; 3GKT A; 2MHB A; 1MZ0 A; 4MQK B; 3UBC A; 4UIQ A; 3HYU B; 1HBS A; 2QSP B; 1IDR A; 1T1N A; 5HLX A; 5JOM A; 4C0N A; 1A4F B; 1XCH A; 1Y4V A; 2JHO A; 1S5X B; 3S1I A; 4TWU A; 2MGF A; 1MBO A; 3UHX A; 2G0V A; 2RAO A; 5F0B A; 3UHB A; 1A3N A; 2QU0 A; 3ECL A; 1J7Y A; 1Y4B A; 4MQC B; 1MLN A; 3SZK A; 2V1H A; 1HGC B; 1JW8 A; 4KMW A; 1MLO A; 1YH9 B; 4N7N B; 4YU3 B; 3QJD B; 1JZM A; 1HJT A; 3GQR A; 3E5O A; 2MGE A; 1CO9 A; 1NQP B; 5E29 A; 2OH8 A; 1C40 B; 4TWV A; 1FN3 B; 3A59 B; 1OUU A; 1Y0A B; 1W92 A; 1YOG A; 2D2M A; 5D5R A; 1MBA A; 2GNV A; 3AT6 A; 4H0B A; 1MBI A; 2OIF A; 1J7W A; 1Y46 B; 2R1H B; 2R4Y A; 2ZLT B; 1MBS A; 2AUO A; 1LA6 A; 1Y5K A; 3KUN A; 3PEL A; 1OUT A; 1YHR A; 1HBB A; 1S0H A; 3SDN A; 1VRE A; 3K8B A; 1NIH A; 1BIN A; 3UHR A; 2D60 A; 3S1J A; 2ZLV B; 4O4Z A; 1Y31 B; 1GCV A; 2D2N A; 1FSL A; 1HCO A; 1FSX A; 4N7P A; 1GDL A; 3DHT A; 1S5Y A; 2PEG B; 4PQC A; 1G08 B; 3OJ1 A; 1I3E A; 1HAC B; 4ODC A; 1G9V A; 2DHB A; 2BW9 M; 2QLS B; 3MJP A; 2HHE A; 3S48 C; 3GQG B; 3EDB A; 1IRC A; 2DN3 B; 1XYE B; 4ROL A; 5SW7 A; 1Y5F A; 3LB2 A; 2QFK A; 1YE0 A; 2GKN A; 1HBH A; 1ABW B; 3DR9 A; 3KUO A; 1YEN A; 3BJ2 A; 1Y2Z B; 1J41 A; 1IRD A; 3S65 A; 1YG5 B; 3VRF B; 1CIO A; 3BJ3 A; 1RTE A; 4KJT A; 1V4W B; 1BZP A; 1UC3 A; 1FAW B; 1SPE A; 4HHB A; 3MKB A; 5ILP A; 3WCU D; 1YIE B; 4DWT A; 3WCU C; 1A00 A; 4F6G A; 1BZZ A; 3WCU B; 4MQJ B; 1BIJ A; 1Y8K A; 2HCO A; 2H35 A; 3W4U B; 1Y7C A; 3M39 A; 2HBE A; 1Y5J A; 4XS0 B; 2MGA A; 1JF3 A; 1IWH A; 2O5Q X; 2AA1 A; 5EOH A; 2FRJ X; 1KFR A; 2EVP A; 1MNH A; 1KD2 A; 2ZLX A; 3OO5 B; 1XZ4 A; 2O58 X; 3OZW A; 107M A; 1GBV B; 1JWN A; 1VWT B; 5ILR A; 1ASH A; 2VHB A; 4N8T B; 3BOM B; 1R1Y A; 3NG6 A; 1O1L A; 1LFY A; 1HV4 B; 1O1P B; 5CMV A; 1ABS A; 2AV3 A; 5JGG B; 1MNO A; 2HHD B; 3LR7 A; 1O16 A; 1XZ7 A; 1CPW A; 1NEJ B; 1XZV B; 3WHM A; 1V4U B; 1M6M A; 2R80 B; 3KMF A; 1MYI A; 2MGK A; 4MQK A; 3QZZ A; 1B86 B; 1HAB A; 3HF4 A; 1DO1 A; 2W72 A; 4PQB A; 5CHQ A; 2QSS A; 3HXN B; 4ILZ A; 2VEE A; 2DXM B; 1F5P A; 4TYX A; 1GLI A; 1XXT A; 1XY0 A; 3PT8 A; 1Q1F A; 4HBI A; 102M A; 3SDH A; 2AUR A; 1WVP A; 1NS9 A; 2ZSR A; 5D1V A; 1MWB A; 1JPB A; 1GBU B; 1PBX B; 2H8F A; 2VM0 A; 1Y0C B; 2G11 A; 1SI4 B; 2HBS A; 2O5T X; 3UH3 A; 2RI4 B; 1OFK A; 1LTW A; 3LHB A; 3ZOM A; 2MGM A; 1FN3 A; 1K1K A; 2FAL A; 1V4X A; 4DWU A; 3QZX A; 3WI8 A; 3ZJS A; 2MYB A; 2R50 A; 3WCV C; 1JZK A; 3PI8 A; 2ZSP A; 1OFJ A; 3WCW D; 2HBD B; 1VXA A; 3WCW C; 2V1E A; 1J3F A; 3D17 B; 3WCV B; 2BK9 A; 3WTG B; 3ZJO A; 3LQD A; 2M6Z A; 3WCW B; 2VLY A; 3GKV B; 1QI8 B; 2B7H A; 2LH1 A; 3G52 A; 4FWX A; 1C7B A; 3CIU A; 3VRG B; 4SDH A; 3BCQ A; 1V5H A; 1RQA A; 1Y8I A; 5M3S A; 1YGD B; 4F6B A; 1MCY A; 3NMM B; 4YU4 A; 1G09 A; 3HRW A; 1CH4 A; 4WJG A; 1Y4Q B; 3GK9 A; 1GDK A; 1MWC A; 1IOP A; 2Z85 A; 4G51 A; 1Y35 A; 3ARL A; 3QJE B; 1M9P B; 1JDO A; 4IRO A; 1HGA A; 2GLN A; 3B75 B; 1OR6 A; 4HRT B; 3NL7 B; 1Y45 B; 1J7S A; 1ECN A; 1JF4 A; 1Y0W B; 5HLU A; 2E2Y A; 4ROM A; 6HBW A; 1XZU B; 2R4X A; 1DXD A; 3E4N A; 3MJU B; 2DN1 B; 3O7N A; 1Y4F B; 4FWY A; 3OZV A; 3ONZ A; 1Y09 B; 2VLX A; 1O1N A; 1DXU B; 1HBA B; 1HDA A; 2GL3 A; 1Y7G B; 3WFW A; 1MOH A; 2KSC A; 2WTG A; 2GTL C; 1FAW A; 1K0Y B; 1MLM A; 5CHR A; 2FRF A; 1AJG A; 2ZFB B; 4ESA A; 3FS4 A; 2GTL B; 4M4B B; 3IA3 B; 2ZS0 C; 2WTH A; 3UHN A; 5B84 A; 3EOK A; 3UHK A; 4X0L B; 2HZ1 A; 3HHB A; 2ZS0 B; 3GDJ A; 1CBM A; 1UFJ A; 2BMM A; 5HY8 A; 1ECD A; 1Y8H B; 5E6E B; 2AUP A; 4BJA A; 1YE2 B; 1Y22 B; 1HHO A; 2NRL A; 1MNK A; 4WJG 1; 3LB4 A; 3TM9 A; 1YGF B; 4O35 A; 3ASE A; 1YIH B; 4FC3 B; 3HC9 A; 3OO5 A; 2AV0 A; 1SHR B; 1SDL B; 1MLR A; 4XDI A; 1XZ5 A; 2G14 A; 3FH9 B; 1YEU B; 1BUW B; 3GYS A; 4N8T A; 1JEB B; 3BOM A; 1Y83 B; 5CNC A; 1BAB A; 1HV4 A; 3PI9 A; 1DLY A; 2HBC B; 3VRE A; 3A0G A; 1LFZ A; 2V1G A; 3H57 A; 3TM3 A; 4M4A B; 2R4W A; 1YMA A; 4F4O A; 1DKE A; 2IG3 A; 1NEJ A; 1QSH A; 2LH7 A; 5KDQ B; 1YEO A; 5CN6 A; 1GDI A; 2W6Y A; 1LH2 A; 2ZLW A; 1BBB B; 1QXD B; 5CNB A; 1LFT B; 5HAV A; 4MQG B; 1YVQ B; 2ZSS A; 3QM6 A; 1GZX B; 3ZHW A; 3OK5 A; 3HXN A; 1YOI A; 2DXM A; 1UVX A; 1HBR A; 1A3O B; 5CNG A; 1SDK A; 1HLB A; 1YEV B; 3P5Q A; 1DO3 A; 1A6M A; 4FH6 A; 2LH2 A; 3IC2 B; 3AQ9 A; 1Y4G B; 3MOU A; 2G12 A; 3PT7 A; 1GBU A; 1ECA A; 1PBX A; 5AZQ A; 1Y0C A; 4JYQ A; 3K9Z A; 1NZ3 A; 1NZ5 A; 4F6J A; 1DWT A; 5EET A; 2RI4 A; 1DXV A; 2V1I A; 1CMY B; 2WY4 A; 111M A; 1S69 A; 4VHB A; 5C6E A; 4NI1 A; 4MQI B; 1Y7Z B; 3ZJQ A; 110M A; 3NFE B; 7HBI A; 3A5A A; 5EUI B; 3H58 A; 4HRR B; 3UHI A; 2PGH A; 3MBA A; 1QSI B; 1BZR A; 1Y4P A; 1HRM A; 1LFV A; 2QMB A; 3A5G A; 1O1I A; 2YRS B; 2ZLU B; 2O5M X; 1MTK A; 1LH1 A; 3VRG A; 1BJE A; 1LHT A; 3OVU C; 1THB B; 1VXG A; 1ECO A; 1BZ1 A; 1BZ6 A; 2ZSN A; 1CLS B; 1A6N A; 3WFX A; 4H07 A; 1O1K A; 1NS6 A; 4MQH B; 1Y7D B; 1XQ5 A; 2DN2 B; 3IC0 A; 1UMO A; 2Z8A A; 1CO8 A; 3IXF A; 1AJ9 B; 2G0R A; 1COH A; 1HGB B; 2HBF A; 2R4Z A; 1CP5 A; 1UIW A; 1YMC A; 4NI0 B; 1HDB B; 1QXE A; 1NPF A; 1CIK A; 1MYM A; 1UVY A; 1FDH G; 2GRH A; 2HBG A; 2D5Z A; 1D8U A; 1YHE A; 1URY A; 3UHU A; 1Y0T B; 2MYA A; 3ZJP A; 2DN1 A; 4U8U D; 1J40 A; 3G4R A; 4U8U C; 5ILM A; 4H2L A; 1ABY A; 4L7Y B; 3D1K A; 1WMU A; 1JY7 B; 1O1M A; 1DXU A; 1HBA A; 2BKM A; 3ZOL A; 4U8U B; 3MYM A; 3WCT A; 1FDH A; 1V75 B; 1LH5 A; 3DUT B; 1MBD A; 2H8D A; 1LJW B; 3D7O B; 3BJ1 A; 1CG8 A; 1FHJ B; 3QJB A; 1MLF A; 3EU1 A; 3AQ8 A; 1YEQ A; 1YZI A; 2W6V A; 2EKU A; 2QRW A; 2ZFO D; 109M A; 2ZT0 A; 1G0A A; 3PIA A; 2ZFO C; 5KKK A; 2G0S A; 3ODQ B; 1GDJ A; 1BZ0 A; 2ZFO B; 3GOU B; 5KER B; 1G0B A; 1CG5 B; 1RQ4 A; 1YHU D; 5CN4 A; 1YHU C; 3OO4 A; 1Y22 A; 1MLS A; 2SPN A; 1H1X A; 1YGF A; 3WR1 A; 1YHU B; 2OLP A; 4FC3 A; 1O1O B; 5EYS A; 106M A; 1A0Z A; 3PI4 A; 1JZL A; 1A01 B; 105M A; 3D1A B; 1YEU A; 2Z6N A; 1Y4R A; 3A5B A; 1XZ2 A; 3WCP A; 1WLA A; 1Y8W B; 1OBM A; 4O4T A; 1X9F D; 1YDZ A; 1QPW B; 3CY5 A; 3ZJI A; 1X9F C; 2HHB B; 1SPG A; 1YFF A; 1DWR A; 4OOD A; 1GCW A; 2FRI X; 1R1X B; 2SPO A; 1X9F B; 4MAX A; 2W6X A; 4MBA A; 3AT5 A; 5HU6 A; 1J3Z A; 3GQP B; 1MYJ A; 2NRM A; 3S66 B; 2ZS1 C; 1RPS A; 112M A; 2O5B X; 3G4Y A; 1RQ3 A; 4LPI A; 2O5L X; 4PNJ A; 2ZS1 B; 5HLQ A; 3HYU A; 3UHW A; 2QSP A; 5E83 B; 1A4F A; 3QJC B; 2NSR A; 1DTI A; 1IBE B; 1S5X A; 1A0U B; 3R5I B; 1IT3 A; 4G1V A; 3ZJM A; 1AZI A; 1DUK A; 2AUQ A; 3QM8 A; 1MTJ A; 3LR9 A; 1IT2 A; 2XKI A; 4NXA A; 2MYC A; 1DXT B; 1Y85 B; 2MHB B; 1RVW B; 2SPM A; 4MQC A; 2OHA A; 3RJ6 A; 1YMB A; 1HBS B; 1M6C A; 2ZSY A; 1T1N B; 1HGC A; 103M A; 1DM1 A; 1DTM A; 1N9X A; 1YH9 A; 3HEP A; 4N7N A; 4YU3 A; 3ZJR A; 3QJD A; 3GLN A; 1NQP A; 1VXF A; 3ORD A; 2RAO B; 1C40 A; 1HDS B; 2G3H A; 1A3N B; 1S6A A; 3A59 A; 1Y0A A; 2MGH A; 2QU0 B; 4O2G A; 5HBI A; 4NK2 A; 3ZH0 A; 1EWA A; 1NWN A; 1J7Y B; 3UH6 A; 1U7S A; 4GZG A; 3WCV D; 2BNL A; 3SZK B; 1L2K A; 1Y46 A; 4F6I A; 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1A00 B; 4L2M A; 1S56 A; 1BZZ B; 1BIJ B; 1Y8K B; 2HCO B; 1GBV A; 2H35 B; 1VWT A; 5JDO E; 1Y7C B; 1QPW A; 2HBE B; 1X46 A; 1Y5J B; 4HSW A; 1O1P A; 1MLU A; 1IWH B; 3R0G A; 4FH7 A; 1YOH A; 1LUE A; 4DC8 A; 5JGG A; 2AA1 B; 2HHD A; 3K3U A; 1U7R A; 1ITH A; 2ZSQ A; 1KD2 B; 5AB8 A; 1XZ4 B; 1VXD A; 3V2Z A; 4UUR A; 1XZV A; 1V4U A; 2NX0 A; 3HEO A; 2W31 A; 3U3E A; 2LHB A; 2R80 A; 5EQM A; 1OR4 A; 1B86 A; 1R1Y B; 3NG6 B; 1O1L B; 1LFY B; 3UHG A; 1JP8 A; 1DWS A; 2BLH A; 3G4Q A; 1V07 A; 2VRY A; 2GRF A; 1XZ7 B; 4F68 A; 3KMF C; 1NZ4 A; 1MOA A; 3WHM B; 1Y85 A; 3QMA A; 1O1J B; 1RVW A; 2VEB A; 2W72 C; 1HAB B; 3HF4 B; 3AQ5 A; 1DO7 A; 2W72 B; 1SI4 A; 1Y0D B; 2QSS B; 3AQ7 A; 2BWH A; 1GLI B; 5CN8 A; 3ARJ A; 1XXT B; 1XY0 B; 4C44 A; 2GKM A; 1HDS A; 1MOD A; 3PT8 B; 1MLK A; 5MBN A; 3VHB A; 4N7O B; 1KR7 A; 1NXF A; 1NS9 B; 5B85 A; 3ECZ A; 5CNF A; 2H8F B; 2HBS B; 3G4V A; 2HBD A; 1PMB A; 3OGB A; 4FWZ A; 3D17 A; 3WCV A; 2O5O X; 3M38 A; 3PI2 A; 3WTG A; 3D4X A; 3WCW A; 3GKV A; 1QI8 A; 3QQR A; 1K1K B; 1V4X B; 4NXC A; 1UT0 A; 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