The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLWGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
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| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
53
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1DXT B; 3V2V A; 2IG3 A; 1Y46 B; 1J7Y A; 3MBA A; 1LFQ B; 2D5X A; 1G0A B; 5EU2 A; 3WCV B; 1MKO A; 3ZJM A; 1I3E A; 3ZJP A; 1Y4Q B; 5EV5 A; 2OLP A; 2SPO A; 1YVT B; 2D2M D; 1HBR A; 2ZS0 D; 4FC3 A; 1HAC B; 2VM0 A; 1CPW A; 1THB A; 1COH A; 4YU3 B; 1YHU B; 2G0S A; 1DXU B; 4M4A A; 1DXV A; 1VXH A; 1S69 A; 1H97 A; 1HGA A; 2Z8A A; 3WFU A; 2O5Q X; 1C40 B; 1OUU A; 5EYS A; 1MLO A; 3WCT C; 4PNJ A; 1Y83 B; 3NMM B; 3GOU B; 4HRT A; 1N9H A; 1Y0W A; 1S61 A; 1CG8 A; 1C7D A; 2HBC A; 4U8U D; 5CN7 A; 5CHR A; 1IDR A; 1LFL A; 2AV3 A; 4YU4 A; 1JEB B; 1K0Y B; 4MBA A; 1G08 A; 1LJW B; 4ODC B; 2HBD B; 5ILE A; 1XZU A; 3OGB A; 1ABW B; 3GDJ B; 1YGD A; 3O7N A; 1CH9 A; 5HAV A; 1GDJ A; 3EDB A; 1X9F C; 1RTX A; 3HYU B; 3EOK B; 4G1B A; 1A9W A; 1CG5 B; 2G3H A; 5E29 B; 3V2Z A; 3A5G A; 1MBO A; 2D2N D; 1Y4R A; 1BUW B; 1YH9 A; 1LHT A; 1BIJ B; 1YFF B; 2ZS1 C; 2MGJ A; 1NS9 B; 2W6X A; 3ZOL A; 2RI4 A; 2ZSR A; 1MLU A; 1Z8U B; 1Y4B B; 3NL7 B; 2PEG B; 1JZM A; 2R80 A; 1BBB B; 3DHR A; 4HSX A; 1EW6 A; 3D4X A; 3A9M A; 1AJH A; 2HZ1 A; 2ZST A; 2R4Y A; 4XS0 B; 1Y2Z A; 3G4W A; 4MBN A; 1NPG A; 1QSH A; 1SHR A; 5F0B A; 1S0H B; 5AZQ A; 1J7S A; 3ECZ A; 1F63 A; 2EB9 A; 3CIU B; 1YEN B; 2ZSZ A; 1O1J B; 3E55 A; 1V4U A; 2D2N B; 1Y8K B; 2O5O X; 1UIW A; 2EB8 A; 2HBF B; 2JHO A; 2W72 B; 5EOH A; 3WHM B; 3UH3 A; 1VRE A; 4MQH B; 1YOI A; 1MNJ A; 2GRZ A; 4NK2 A; 4MQK A; 5C6E B; 1HDB A; 1YCB A; 1ECO A; 1OUT B; 3QJC B; 3A5A A; 2XKH A; 1B86 B; 2BLH A; 3NG6 A; 2MYB A; 2IN4 A; 3S66 B; 4ESA B; 1ASH A; 2MBW A; 1C7B A; 1V5H A; 1T1N B; 1JL6 A; 2MYA A; 4MQI A; 3GQP B; 3UHB A; 1M6M A; 1FHJ B; 1VXE A; 1FAW B; 3WR1 B; 3BOM B; 3LR7 A; 4MAX A; 1FN3 B; 4N7N A; 1XZ4 B; 1GJN A; 1YEU A; 1KD2 A; 3UHS A; 3MKB B; 2QSP A; 3PT8 A; 3UHV A; 1A6G A; 1L2K A; 3K8B B; 2AUQ A; 1Y7D A; 1YIE A; 3ONZ A; 3OJ1 A; 3ARJ A; 2ZLW B; 2B7H B; 1CH5 A; 3A2G A; 3ORD A; 1LFT A; 1XY0 A; 3IC0 B; 2ZLX B; 3DUT A; 2MGE A; 1VXD A; 2ZFB A; 1M9P A; 3DHT A; 1NEJ A; 2HHE A; 1LFY A; 1GDK A; 2ZLV A; 3ECL A; 1MTK A; 3IA3 B; 2GNW A; 1DXD A; 1RPS B; 1FDH A; 1Y5K B; 5E83 A; 1KFR A; 1V75 A; 4FH6 A; 2SPN A; 1NWI A; 3GQG B; 3HF4 A; 1RQ4 B; 1YEV A; 1FDH G; 3UHR A; 1MLN A; 3BJ1 B; 1MLS A; 1VXF A; 2MGA A; 3EU1 B; 1SDL A; 5D5R A; 4JAC A; 1GZX B; 3O89 A; 3GKV B; 1MYF A; 1HBI A; 1CO9 A; 4G51 A; 2MYC A; 1YE2 B; 1Y45 B; 2QRW A; 2VEB A; 3K3U A; 3ASE A; 1VHB A; 3AT5 A; 3PEL A; 4NK1 A; 3ZJL A; 1BZ1 A; 4UZV A; 4H2L A; 4MQC A; 1CH3 A; 1EWA A; 3UHI A; 3R0G A; 5E6E A; 1RQ3 A; 4H07 A; 1Y0D A; 1UFP A; 1U7R A; 1QSI A; 4X0L A; 1BZZ A; 2QLS B; 3PI9 A; 1O1I A; 3SZK B; 3WTG B; 5JDO C; 3QJE A; 2HHB B; 3OO4 A; 4B3W A; 2ZT1 A; 3TLD A; 1O1N B; 1XQ5 B; 1Y8H A; 2FRK X; 4B4Y A; 1N9F A; 1MYT A; 1CMY B; 2MGC A; 4F4O A; 2QFN A; 3AQ8 A; 3ODQ B; 1OBM A; 1MLK A; 1W92 A; 2ZSX A; 4BJA A; 2D60 B; 2D5Z A; 3KMF A; 1O1L A; 3M38 A; 1HSY A; 5JDO E; 1HV4 A; 3PIA B; 1BZP A; 2HBS A; 3DR9 A; 1MBI A; 1RSE A; 2G10 A; 2M6Z B; 3BJ2 B; 1Y7G A; 3A5B A; 1DWT A; 5CNC A; 1G9V B; 3WFT A; 1DKE A; 4F6D A; 1HHO A; 5CND A; 1HGB A; 2DN2 A; 1RQA B; 2AA1 B; 1Y4V B; 2GL3 A; 1DO3 A; 1MYG A; 1A3O A; 1HDS A; 1HBG A; 1O1O A; 1YDZ B; 2MGL A; 2CMM A; 3UHH A; 1LFZ A; 1V4W A; 3QM9 A; 4MU5 A; 3RGK A; 3UH6 A; 3S65 B; 1DM1 A; 1QXE B; 2H35 A; 1MDN A; 2W6V B; 2HZ3 A; 2Z85 A; 1HBB A; 1LH7 A; 2LHB A; 1XZ5 A; 1YHR B; 1JPB A; 1JDO A; 1SWM A; 2LH2 A; 1N9I A; 1J40 B; 2VLY A; 2ZLU A; 4IRO A; 1GLI A; 4HHB A; 3UBC A; 1SPG B; 1J3Y B; 2VYZ A; 1SDK B; 2OHA A; 3BCQ B; 1DO1 A; 1JL7 A; 5ILM A; 4M4B A; 1MLQ A; 1HDA A; 1Y31 A; 2DN3 A; 1SI4 A; 3WFW A; 1BZ0 B; 3WCT D; 3WCU D; 7HBI A; 3WFX A; 111M A; 2RAO B; 1CH2 A; 3G4V A; 1YGF B; 1C7C A; 2GRF A; 1HCO A; 2DN1 A; 1DUO A; 3VRE B; 2G0V A; 2NX0 A; 1G09 B; 3UHQ A; 5EE4 C; 1OFK A; 1F5P A; 2ZLT A; 1NQP A; 4KJT A; 104M A; 1Y0T B; 3VAU A; 1LA6 B; 5KER A; 1Y5F B; 5HU6 B; 1R1X A; 3VHB A; 103M A; 3UHY A; 1FSX B; 1XZV A; 3ZOM A; 3VRG B; 3HEN A; 1ECA A; 1QPW A; 3NFE B; 2GDM A; 3BJ3 B; 4HRR A; 5CN4 A; 3M3A A; 2DXM B; 1Y4G B; 2V1I A; 2HBE B; 1ABS A; 1VXG A; 1X9F A; 1U7S A; 2R4X A; 2ZS1 D; 2GTL B; 3PI8 A; 4N8T A; 1OJ6 A; 1QI8 A; 1A4F B; 2R4W A; 3MYM A; 1GBV B; 1O1P A; 1IBE B; 3ZH0 A; 1DXT A; 1F65 A; 1CIO A; 1Y46 A; 3H57 A; 1LFQ A; 1A01 B; 1Y8W B; 2ZS1 A; 2YRS B; 2PGH A; 1G0A A; 3D1K B; 1URV A; 1DTI A; 4ROM A; 3S48 C; 1MBD A; 1NZ5 A; 1A0Z B; 4MXL A; 1SPE A; 2HCO B; 3UHX A; 3B75 B; 1A0U B; 4NI0 A; 1NZ2 A; 3QJD B; 3VRF B; 1J41 B; 2QU0 B; 1RVW B; 3LQD B; 1DXU A; 1MNK A; 2ZFO C; 3WCW C; 1V4X B; 3A59 B; 1J7Y B; 1G0B B; 4MPM A; 2D5X B; 1S5Y A; 2XKG A; 1MYM A; 1MKO B; 2BK9 A; 1MLL A; 1Y83 A; 1ABY A; 2QFK A; 3IXF A; 3MJU B; 1MYH A; 4F6I A; 4FC3 B; 1MLR A; 2G14 A; 1CP5 A; 4PQC A; 1THB B; 1Y8I A; 5CNB A; 1JEB A; 1HBS A; 2EKU A; 2ZT4 A; 1MGN A; 2D2M B; 4C0N A; 1CBL A; 4M4A B; 4FWX A; 2W31 A; 1H1X A; 4ODC A; 2HBD A; 4F6F A; 2ZS0 B; 1GCW B; 2XKI A; 4MQJ B; 1HGA B; 5HLX A; 3GDJ A; 1MWD A; 1YEQ A; 1BJE A; 1BIN A; 1OUU B; 1DLW A; 1Y22 B; 3HYU A; 1Y7Z A; 3UHZ A; 2V1E A; 1XXT B; 2DHB A; 3IC2 B; 5E29 A; 3OO5 B; 1AJG A; 1CG8 B; 1BIJ A; 2R1H A; 4L7Y B; 2HBC B; 5JGG B; 2HBG A; 1MBS A; 1YVQ A; 2PEG A; 1EMY A; 1B0B A; 2O5B X; 1YMA A; 3ARK A; 3NML A; 2BW9 M; 1J52 A; 4LPI A; 3WCV C; 4U8U B; 1XZU B; 4XS0 A; 1IWH A; 4O4Z A; 2E2Y A; 2ZSY A; 1S0H A; 1GDI A; 1O1K A; 1Y4R B; 3CIU A; 1Y4F A; 1UT0 A; 1YEN A; 1YHU C; 1Y8K A; 3FH9 A; 2RI4 B; 1MYI A; 1XZ7 B; 2HBF A; 1O16 A; 1J3Z A; 3H58 A; 3MYN A; 2W72 A; 3WHM A; 2R80 B; 2WTH A; 3D17 A; 3DHR B; 1GDL A; 1VRF A; 3D4X B; 1MTJ A; 2EF2 A; 1HBH A; 3G52 A; 3QJC A; 3UHT A; 1Y5J A; 4N7P B; 4NZI A; 4F6B A; 1SHR B; 2MHB A; 2VLZ A; 1MZ0 A; 2D2M C; 5B85 A; 1J7S B; 1HJT A; 4WJG 1; 2D6C A; 2G0Z A; 3GQP A; 3D7O A; 1V4U B; 1FHJ A; 1LFV A; 1FSL A; 3ZJQ A; 3BOM A; 2BNL A; 2O58 X; 2MGM A; 1NPF A; 2Z6N B; 3GYS A; 1Y0C A; 4VHB A; 1D8U A; 1O1M A; 1DO4 A; 1HDB B; 3MKB A; 1DXC A; 1YZI A; 3G4Y A; 3UHD A; 2V1F A; 3K8B A; 4QAU A; 3AG0 A; 1JY7 A; 6HBW A; 3NG6 B; 3KUO A; 2GKN A; 4ROL B; 3PI1 A; 1MLJ A; 2B7H A; 1WLA A; 3G4R A; 1CBM A; 3E5O A; 3A0G A; 1YMC A; 3MVC A; 3ED9 A; 5KDQ A; 5CN5 A; 4N7N B; 1URY A; 2WY4 A; 4N7O A; 1NGK A; 1MLG A; 1MOA A; 1XZ2 B; 1Y85 A; 1YEU B; 4F68 A; 1Y0A A; 1JP6 A; 2H8D B; 3LB4 A; 2QSP B; 1RPS A; 2QSS A; 3PT8 B; 1DLY A; 3QJB A; 1HAB A; 1JZK A; 5MBA A; 3HRW A; 1RQ4 A; 2D2N C; 2O5S X; 1UFJ A; 4MXK A; 3ONZ B; 4H0B A; 3OK5 A; 4SDH A; 2W72 C; 1BZ6 A; 2Z6T A; 1UX9 A; 4UIQ A; 4WJG A; 1M9P B; 1UMO A; 3DHT B; 4NI1 A; 1NEJ B; 5EQM A; 2HHE B; 1Y35 A; 1TES A; 1LFY B; 3ZJH A; 3HC9 A; 3M39 A; 2ZLV B; 3ZHW A; 4NXA A; 3E5I A; 2MGG A; 1MYZ A; 3RJ6 A; 3SZK A; 3WTG A; 5E83 B; 1V75 B; 1YE0 A; 5ILP A; 3K9Z A; 2AUP A; 3PT7 B; 1BVD A; 1XQ5 A; 1CQX A; 1GBU A; 5EE4 D; 4ZVA A; 1SDL B; 1CMY A; 1Y7C B; 3PI4 A; 1NS6 A; 1GCV B; 112M A; 1WVP A; 1LHS A; 5MBN A; 3AT5 B; 3ARL A; 1MWC A; 2BMM A; 2EKT A; 3ZJO A; 4H2L B; 4MQC B; 5E6E B; 1RQ3 B; 1S5X A; 3HEP A; 2M6Z A; 4G1V A; 5HY8 B; 5EUI B; 3ECX A; 1QSI B; 1NIH B; 2MGF A; 3PI9 B; 1O1I B; 1VWT A; 3QJE B; 1YMB A; 3E4N A; 1Y8H B; 4TWV A; 1RQA A; 1IRD A; 3UHU A; 1HGC A; 4O4T A; 1JP8 A; 3UI0 A; 2D5Z B; 1O1L B; 1BAB B; 4KMW A; 2HBS B; 1AJ9 B; 3R5I A; 2MGI A; 2HZ2 A; 3S65 A; 3G4U A; 2W6V A; 1MOC A; 2QMB A; 1MBN A; 1PMB A; 1DKE B; 3AT6 A; 1I3D A; 5EET A; 1R1Y A; 3QZX A; 1J40 A; 4DWU A; 1YCA A; 3EDA A; 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3B75 A; 1A0U A; 1Y4Q A; 3UGY A; 2WTG A; 3VRF A; 3QJD A; 2FRI X; 1X9F B; 3PI8 B; 1YVT A; 2LH3 A; 4N8T B; 1RVW A; 1QI8 B; 1HAC A; 1DWR A; 5AZR A; 3UBV A; 4YU3 A; 1V4X A; 3A59 A; 1YHU A; 1G0B A; 1YEO B; 2BKM A; 1BVC A; 2ZSP A; 2ZS1 B; 1GVH A; 1YOG A; 3QZZ A; 3GQR B; 2PGH B; 2R4Z A; 4ROM B; 1MOB A; 107M A; 1C40 A; 3MJU A; 1FLP A; 1Q1F A; 4F6G A; 2MGH A; 1VXC A; 3NMM A; 1F5O A; 4NI0 B; 3GOU A; 3ZJJ A; 2NRM A; 108M A; 2FAM A; 2W6W A; 1HBR B; 4OOD A; 2OH8 A; 3WI8 A; 2D2M A; 3PI2 A; 2EVK A; 1GCW A; 2ZS0 A; 4MQJ A; 1COH B; 2OIF A; 2BLI A; 3QM7 A; 3QM6 A; 2GLN A; 5CN9 A; 1K0Y A; 1LJW A; 1S5Y B; 1MYJ A; 1DXV B; 1MLF A; 1Y22 A; 1ECD A; 1AZI A; 3WCU C; 2XYK A; 1XXT A; 1ABW A; 1ABY B; 3IC2 A; 3OO5 A; 2GTL C; 3EOK A; 1MNO A; 5B84 A; 4L7Y A; 1CG5 A; 2GNV A; 5JGG A; 4HRT B; 1Y8I B; 1BUW A; 1Y0W B; 1C7D B; 4DC8 A; 1YFF A; 3OZU A; 1HBS B; 1NS9 A; 3ZJI A; 4NS2 A; 1LFL B; 4U8U A; 1Y4B A; 2ZSQ A; 3NL7 A; 1YEQ B; 4YU4 B; 1G08 B; 1BBB A; 1MWB A; 1Y7Z B; 1JZL A; 5HLU A; 5CNE A; 1YGD B; 2DHB B; 3UHE A; 5JDO F; 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