The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
52
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSADDKTNIKNCWGKIGGHGGEYGEEALQRMFAAFPTTKTYFSHIDVSPGSAQVKAHGKKVADALAKAADHVEDLPGALSTLSDLHAHKLRVDPVNFKFLSHCLLVTLACHHPGDFTPAMHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-1/2
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| publication title |
Quaternary structural variability in rat hemoglobin
rcsb |
| total genus |
52
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
E
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-05-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 112M A; 1EBC A; 1Y35 A; 1MWC A; 1MBN A; 2MGJ A; 1J3Y B; 2E2Y A; 2GTL C; 3UHV A; 1JPB A; 1S69 A; 1HBS A; 1VXD A; 2ZFB B; 3G46 A; 3G4W A; 3E5O A; 1O1K B; 1YGF A; 2EKU A; 1AZI A; 1CQ2 A; 1Y8K A; 1YEO A; 2QMB B; 4DWU A; 1YFF A; 3HRW B; 5HLU A; 1WMU B; 2G0X A; 1JEB A; 2O5B X; 4FC3 A; 1YE2 B; 4NS2 A; 1UIW B; 1BZ0 A; 4NXC A; 4QAU A; 3OZV A; 2AUR A; 1K0Y B; 3BCQ A; 4XDI A; 4F6G A; 1A9W A; 1GDL A; 1LFL B; 3QJC B; 4FWZ A; 3P5Q A; 1IRD A; 1C7D A; 3D1A B; 4H2L B; 3HEP A; 1MNI A; 1YHR A; 2W72 B; 3S66 A; 3UH3 A; 4NI0 B; 2DXM B; 1K1K B; 4FH7 A; 5CN5 A; 5CND A; 1SI4 A; 3QMA A; 1MOB A; 1URY A; 4AVD A; 2W6Y A; 2PGH A; 4NK2 A; 3EU1 B; 3B75 B; 1RTX A; 4L2M A; 3A5G A; 1MLL A; 3QQR A; 2CMM A; 2DN2 B; 2MGB A; 2Z6T A; 4N7O A; 2BLJ M; 3QJB A; 3MBA A; 1MCY A; 4B4Y A; 4MBA A; 4HSW A; 5C6E B; 1BJE A; 4F6B A; 4O35 A; 1C40 B; 1V75 A; 3ZH0 A; 1RPS B; 3VRE A; 1IWH B; 4YU4 A; 1MTI A; 3UHS A; 1HHO A; 3IA3 B; 1SPG B; 1FAW A; 5C6Y A; 2G14 A; 1G0B A; 4XS0 B; 3GQR B; 1MYG A; 1VXG A; 1NS9 B; 3IXF A; 3UGZ A; 4U8U B; 1G9V B; 1R1X A; 2MGI A; 1HLB A; 1A00 B; 1Y2Z A; 4F4O B; 3HXN B; 1PBX B; 2ZSR A; 1OUU B; 5AZR A; 3UHD A; 1RQA B; 1MBC A; 1Y7G B; 3UBV A; 1UFJ A; 2MGA A; 3EOK B; 3A59 B; 2ZT2 A; 3AQ7 A; 3LR7 A; 1XZ2 A; 4O4Z A; 2HHD B; 4F6D A; 3GDJ A; 3DUT A; 1F65 A; 2D2M D; 4TWV A; 5D5R A; 1YH9 A; 1HBS B; 1UC3 A; 3WCW D; 1MNO A; 1HBI A; 1QSI A; 2SPL A; 1O16 A; 1FDH G; 2ZFO B; 5EYS A; 1Y8K B; 1HBR B; 4MXL A; 2VM0 A; 1YDZ B; 1MBS A; 2V1G A; 3MJU A; 2O5O X; 1WVP A; 2W72 C; 1NZ4 A; 1BZ0 B; 4N7P A; 3ZOM A; 1MYT A; 2LH1 A; 2H8D A; 2R4Z A; 3D17 A; 2AA1 A; 1NEJ A; 4ROM A; 5CNE A; 3VRF A; 1ECN A; 2IG3 A; 1BAB B; 3ZJJ A; 1C7D B; 4ZVB A; 3OO5 B; 109M A; 3E5I A; 2ZLU A; 1H1X A; 3LB3 A; 1M6C A; 2PGH B; 1DKE A; 2ZLX A; 2GNW A; 2D2M A; 4HHB B; 1XZU A; 4NZI A; 3UHG A; 1MLO A; 1A9W E; 1CIK A; 4N7O B; 1DXT A; 3GQG A; 1RVW B; 3K8B A; 1JL6 A; 1YMA A; 1TES A; 4UZV A; 4ODC A; 3WFU A; 3KUO A; 4MQJ A; 1Y0W A; 1Y46 B; 2NRL A; 1S5Y A; 3HHB A; 5EUI A; 4YU4 B; 5KDQ A; 1HHO B; 3OO4 B; 1JZL A; 2HZ2 A; 4TYX A; 1JL7 A; 4MQK B; 4HRR A; 4MQG A; 3S65 B; 1Y0D A; 1YEQ B; 2GNV A; 2QSP A; 1H97 A; 1HSY A; 6HBW B; 1MKO A; 1R1X B; 2GRF A; 3HF4 A; 3RJN B; 1Y2Z B; 1VXH A; 1CG8 A; 2ZS0 B; 3PI2 A; 3WCP B; 1YIE A; 2FRI X; 1W92 A; 1YHU B; 3E4N A; 1A3N A; 2ZS1 C; 1HDA A; 1Y0A A; 1QPW A; 1UVY A; 2WTG A; 3RGK A; 3UHZ A; 1A0Z B; 1YEN B; 1UX9 A; 2RI4 A; 1S0H A; 1YCA A; 5SW7 A; 1IBE A; 1RQ4 B; 2O5L X; 1XZ2 B; 1VRF A; 2SPN A; 3TM3 A; 1COH A; 2HHE A; 3G4Y A; 1MYF A; 3GDJ B; 1CLS A; 3DUT B; 3AQ6 A; 2MHB B; 3AQ9 A; 1XCH A; 1G09 B; 1DTM A; 5EE4 D; 1XZ7 B; 1CQX A; 1J40 A; 1YGD A; 1YCB A; 2G0Z A; 2MGC A; 2R4W A; 1NPF A; 5E29 A; 4MQI B; 2EVP A; 1MBO A; 2ZLT A; 1LH6 A; 3QM7 A; 4F69 A; 1MGN A; 1HJT A; 1GCW A; 3ARL A; 2SPO A; 1DTI A; 1FHJ A; 1BZ6 A; 4KMV A; 2HZ1 A; 1ABW B; 1X46 A; 2MGD A; 1UT0 A; 1J3Y A; 1O1N B; 2EVK A; 2D5Z A; 1CBM A; 1Y5F B; 2MYD A; 2ZFB A; 1A01 B; 3BOM A; 2AA1 B; 1NEJ B; 4ROM B; 2XYK A; 1RSE A; 1Y7D B; 4G1V A; 2D60 A; 1A6M A; 3VHB A; 2D6C A; 2QMB A; 2VLX A; 3HRW A; 2Z6S A; 1Y45 B; 1YE2 A; 1OFJ A; 1YMC A; 3NMM B; 2ZLU B; 1F5P A; 3PI3 A; 4U8U D; 2OLP A; 2D2M B; 2HHB B; 2BWH A; 3MN0 A; 3TM9 A; 1XZU B; 3QJC A; 1FSL A; 1BVC A; 2BLI A; 1JP9 A; 3D1A A; 5F2A A; 4H2L A; 3H58 A; 3LQD B; 3ZJI A; 3GQG B; 3K8B B; 1LFT A; 1GDJ A; 2ZSS A; 3ODQ B; 4NI0 A; 2DXM A; 1K1K A; 4ODC B; 1Y0W B; 2FAL A; 2HBG A; 5EUI B; 5B85 A; 3EDB A; 1QXD B; 1Y4F B; 1Y22 B; 3ZJS A; 1HDB A; 1ECA A; 1G0A A; 3NML A; 1MNK A; 4MQG B; 1Y0D B; 1LA6 B; 2QSP B; 2NRM A; 3R0G A; 1MKO B; 3WCV B; 2EKT A; 5AZQ A; 2MYA A; 2AUQ A; 3QQQ A; 3BA2 A; 1YIE B; 5C6E A; 110M A; 1A3N B; 2ZFO D; 1O1J A; 3PEL B; 1IWH A; 4ILZ A; 1QPW B; 2O5S X; 2RI4 B; 5F0B A; 4XS0 A; 1ECD A; 3WI8 A; 1DXV A; 1NS9 A; 3UHR A; 1ASH A; 1VXE A; 1FSX A; 1A00 A; 1J7W A; 2G3H A; 1XY0 A; 4F4O A; 2G10 A; 1A4F B; 1OUU A; 3CIU B; 1RQA A; 2Z6N B; 1DO7 A; 1J40 B; 1Y7G A; 1CMY A; 1MOA A; 2ZT3 A; 3GOU B; 2ZT0 A; 1MLH A; 3UHC A; 1YEV B; 2SPM A; 1GCW B; 1MLR A; 2HBC A; 4G1B A; 4ESA A; 2HHD A; 1CH7 A; 1J3Z A; 1YVQ A; 5HBI A; 1HV4 B; 7HBI A; 2D5Z B; 2O5M X; 1CBL A; 2EF2 A; 1JF4 A; 2BMM A; 1LFY A; 1N9I A; 3QJE A; 3MJP A; 3BOM B; 5M3S A; 2D60 B; 2D2M C; 1A0U B; 1KD2 A; 4VHB A; 2ZFO A; 3MOU A; 1HBR A; 1QSH B; 1YDZ A; 1LH1 A; 3WCW C; 4NXA A; 1JWN A; 3AT6 A; 3QZZ A; 5MBA A; 1BZ1 B; 2ZT4 A; 1NS6 B; 4WJG A; 1GDI A; 1MNJ A; 1Y4V B; 2GL3 A; 3NG6 A; 2W31 A; 1X9F B; 3OGB A; 1MBA A; 1LFZ B; 1Y83 B; 2GLN A; 5KER B; 2ZS0 D; 3AQ8 A; 1G08 A; 1BAB A; 1CH2 A; 3D4X B; 1VXB A; 1YHU D; 2W6V B; 3WFW A; 3LR9 A; 3OO5 A; 1LFT B; 1HLM A; 5HLX A; 3PT8 B; 1IDR A; 1GLI A; 3QM6 A; 4NK1 A; 2HZ3 A; 2MGG A; 1HDB B; 5JDO E; 2O5Q X; 4HHB A; 1BUW B; 1G0A B; 2QU0 A; 1OJ6 A; 2KSC A; 1WLA A; 5EU2 A; 4G51 B; 4OF9 A; 1LH5 A; 2FRJ X; 3UI0 A; 1Y85 A; 1XYE B; 1MLS A; 1RVW A; 5IKS A; 1Y8H A; 3A0G B; 1C7B A; 3EDA A; 1Y46 A; 3MKB B; 104M A; 1MLG A; 1O1J B; 1S61 A; 1VXA A; 4F6F A; 1I3E A; 1M6M A; 2HBE A; 3OO4 A; 1LTW A; 4MU5 A; 2R80 A; 1MNH A; 2EB9 A; 4MQK A; 4MBN A; 1DXV B; 3S65 A; 1YEQ A; 1HGC B; 3QJD A; 2VYY A; 6HBW A; 5HU6 B; 4IT8 A; 1J7W B; 2ZSQ A; 2ZS0 A; 1SDK B; 1Y4B A; 1XY0 B; 3WCP A; 3ZHW A; 1YHU A; 1BZP A; 2C0K A; 3U3E A; 1MOC A; 4TWU A; 3W4U A; 4SDH A; 1CMY B; 5CNC A; 1A0Z A; 3GKT A; 1YEN A; 2R4Y A; 2D2N B; 4M4A A; 5CMV A; 1DLW A; 1RQ4 A; 2HBC B; 4ESA B; 1BZZ A; 3TLD A; 1J3Z B; 1UX8 A; 1YVQ B; 2VYW A; 1J52 A; 1B0B A; 1HRM A; 2MHB A; 1NZ2 A; 1G09 A; 1RTE A; 2MGM A; 1LFY B; 1XZ7 A; 4LPI A; 3V2V A; 4JYQ A; 3PI8 B; 3QJE B; 1MLJ A; 3MJP B; 2OHB A; 1JY7 A; 4MQI A; 5CHQ A; 1HBA A; 1KD2 B; 4WCH D; 5KKK A; 1DLY A; 2ZSP A; 2H8F A; 5EE4 C; 1LFV A; 4L7Y A; 1ABW A; 3AT6 B; 107M A; 1V4X B; 3WCU D; 1LFQ A; 3G4Q A; 1VWT A; 1O1N A; 3UH5 A; 2WY4 A; 3UHH A; 2QFK A; 3NG6 B; 3K3U A; 1Y5F A; 3G52 A; 2DN3 A; 1A01 A; 1UVX A; 3WCV D; 1A6N A; 1Y7D A; 1G08 B; 5CN6 A; 1CP0 A; 2VRY A; 1Y0C A; 2BKM A; 1Y45 A; 4B3W A; 3D7O A; 1Y8W B; 1T1N A; 1AJG A; 1DUO A; 1AJ9 B; 1GLI B; 3NMM A; 1FN3 A; 1MDN A; 2ZLW B; 3ARJ A; 3CY5 A; 1FLP A; 2HHB A; 1Y7Z B; 2MYB A; 2QU0 B; 5HLQ A; 1BBB A; 5CNB A; 3LQD A; 4U8U C; 1OFK A; 1Y85 B; 3WCT D; 1URV A; 1JZM A; 3QM5 A; 3ODQ A; 1Y8H B; 2HBS A; 1C7B B; 2NSS A; 1JZK A; 1XZV A; 1QXD A; 1Y4F A; 1ABS A; 1Y22 A; 2HBE B; 3WCU A; 2R50 A; 3D1K A; 4O4T A; 1HCO B; 2LH3 A; 2R80 B; 1PMB A; 1M9P A; 4O2G A; 1SWM A; 4H0B A; 1HDS B; 1LA6 A; 3QJD B; 3K9Z A; 3R5I A; 1MOH A; 3WCV A; 1NWN A; 4FH6 A; 5E83 A; 106M A; 4MXK A; 1JDO A; 2ZLV B; 4DC8 A; 1Y4B B; 1YVT B; 1GCV B; 1O1P A; 1N9H A; 3MYN A; 111M A; 2EB8 A; 5EOH A; 2B7H B; 3PEL A; 3W4U B; 3OJ1 A; 3UHN A; 3A9M A; 4C0N A; 1KFR A; 1DXU A; 4M4A B; 2ZFO C; 3ZJQ A; 2G0V A; 2O58 X; 1BZZ B; 1DXD A; 5JDO D; 4FWY A; 3NL7 B; 3PT7 A; 2ZST A; 1X9F D; 1Y4Q A; 1LH7 A; 3ZJM A; 1A4F A; 1Z8U B; 3CIU A; 2LH6 A; 2Z6N A; 3IC2 B; 3WCT A; 1Y31 A; 5EV5 A; 2BNL A; 1JY7 B; 5CNF A; 4C44 A; 2V1H A; 3GOU A; 4AVE A; 1C7C B; 3BJ3 A; 1CO9 A; 1HBA B; 3G4R A; 1YEV A; 3QM9 A; 2H8F B; 3DHT A; 3ZOL A; 2XKG A; 1JP6 A; 4PQC A; 1LFV B; 3PI9 B; 4L7Y B; 2MYC A; 2BLH A; 3WFX A; 1LFQ B; 3ZJN A; 1HV4 A; 3UHU A; 1VWT B; 4HRT A; 4YU3 B; 2FAM A; 3OVU C; 2DN3 B; 3AT5 A; 2OH9 A; 1SHR A; 2G12 A; 1A0U A; 2FRF A; 2MGF A; 1FCS A; 3FH9 A; 4MQC A; 1QSH A; 1Y0C B; 2MYE A; 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2QLS B; 3OK5 A; 2W6W A; 1XXT B; 3DHT B; 4MQH A; 3UHY A; 1SDL B; 1GJN A; 1FDH A; 2QSS B; 1S56 A; 4HRT B; 1GBV A; 1JP8 A; 1EWA A; 2R4X A; 3PI8 A; 1CH4 A; 3AT5 B; 1SHR B; 3FH9 B; 4MQC B; 1BIN A; 5MBN A; 3V2Z A; 1N9F A; 1JW8 A; 2DN1 A; 2ZS1 A; 3NFE B; 1HBH B; 1F63 A; 1DM1 A; 2VLY A; 1XZ5 B; 1ITH A; 5ILM A; 1V4X A; 4KJT A; 5ILE A; 3E55 A; 1CIO A; 2DHB A; 3WFT A; 2OIF A; 3WTG B; 4H07 A; 4NI1 A; 2MB5 A; 3WCU C; 1HBG A; 3LB4 A; 3UHI A; 1BIJ B; 5E6E B; 1YHE B; 3WR1 B; 1LJW B; 3M3A A; 1O1L B; 3WCV C; 1O1M B; 1Y8W A; 2VLZ A; 1J7S B; 1AJ9 A; 3UHX A; 1BZR A; 2ZLW A; 3DHR A; 2WTH A; 1OUT B; 1UFP A; 1Y7Z A; 2VEB A; 3M39 A; 2NSR A; 5HAV A; 3UHB A; 3ARK A; 1HGB B; 1B86 A; 1QI8 A; 1XQ5 B; 4GZG A; 1GBU A; 1YIH A; 2VHB A; 2H35 B; 3SZK B; 4MAX A; 2G0S A; 1MTK A; 4M4B A; 3PIA B; 3WCT C; 1CH3 A; 1Y8I B; 1A3O A; 1HCO A; 3HC9 A; 3UH7 A; 1ABY B; 2MGK A; 1NQP B; 4IRO A; 1HDS A; 1NPG A; 2HBD B; 1Y09 B; 1YMB A; 3ZJO A; 3FS4 B; 2ZLV A; 3GYS A; 3BJ1 B; 3LB2 A; 1Y4R B; 1YVT A; 3BJ2 B; 1GCV A; 1EBT A; 1Y5J A; 3S1I A; 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