The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Visualizing breathing motion of internal cavities in concert with ligand migration in myoglobin
pubmed doi rcsb |
| total genus |
63
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-08-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1J7Y B; 1EBC A; 1YHR A; 3FS4 A; 4ILZ A; 4N7N A; 1A6M A; 1LJW B; 1RQ4 A; 1Y4G A; 4N8T B; 1J3Z A; 5B85 A; 2MGK A; 1MKO B; 1H1X A; 4M4A A; 3EU1 A; 1B86 B; 3AT6 A; 1G0B A; 1Y0C B; 2RAO A; 5E29 B; 1HBA B; 1FHJ A; 4ROL B; 3LQD B; 7HBI A; 4KN3 A; 1Y0A B; 2D5Z A; 1NAZ A; 2HCO B; 1GBV B; 2H8D A; 4OF9 A; 3HXN A; 3UI0 A; 2ZWJ A; 1F63 A; 2D2N A; 2ZT4 A; 3UHR A; 3DR9 A; 2D2N D; 1Y0T A; 1YEQ B; 1YE0 A; 1EMY A; 3AQ5 A; 3GDJ A; 3U3E A; 2W6V B; 2MGA A; 2GKN A; 2O58 X; 1DTI A; 1Y83 B; 3RJ6 A; 1RQ3 A; 2AUO A; 3QQQ A; 1V5H A; 3WCV B; 5EYS A; 3ORD A; 1YGD A; 3QJC B; 4WJG A; 5E83 B; 3ODQ B; 1D8U A; 1OUU A; 2GDM A; 2ZLT A; 1MLU A; 1JZK A; 1DKE A; 1HBR B; 3WTG B; 4MQI A; 2QU0 B; 1O16 A; 2QFK A; 3D4X B; 1SDK B; 3EDA A; 1GCW A; 1NGK A; 1YEO B; 3D1K B; 2ZS1 D; 4QAU A; 2WTG A; 1GZX B; 1DUK A; 1SWM A; 3DUT B; 2ZFO A; 4AVE A; 1V4W A; 1DLY A; 3PI8 A; 3PI1 A; 5D1V A; 1A4F A; 1G08 A; 1T1N B; 4MQK B; 1IRC A; 1RTE A; 104M A; 2QFN A; 1HHO B; 3ZOM A; 3K3U A; 3M39 A; 1MTJ A; 4ODC B; 3VHB A; 3ARL A; 1EBT A; 1CH9 A; 2G0R A; 5EV5 A; 1N9H A; 1YG5 B; 3UHB A; 1O1N B; 1FLP A; 1VXC A; 2QLS B; 4UZV A; 1HCO A; 4MXK A; 3LR9 A; 2QSP A; 1J3Y A; 4F6I A; 1V4U A; 1YCA A; 1XZU A; 4PNJ A; 1KR7 A; 110M A; 4WCH D; 1BZZ A; 5AZQ A; 1BBB A; 2EF2 A; 3WHM A; 2MGB A; 3AQ6 A; 1LH5 A; 1YVQ A; 3BOM A; 3W4U A; 2LH7 A; 2HHB B; 2HBE A; 3QJE A; 2RI4 A; 1RPS A; 1MOD A; 2GL3 A; 3G52 A; 2VYZ A; 1DXU B; 3VRE A; 3G4R A; 2W6Y A; 1COH A; 1MLN A; 1VWT B; 3CY5 B; 3OZW A; 1ABY A; 1X9F B; 1Y8H B; 1C7B B; 2O5B X; 1O1K B; 105M A; 1MBN A; 2AA1 A; 1TES A; 1BIJ A; 2V1E A; 2R50 A; 1HGB A; 1MYF A; 1NZ2 A; 1HBB A; 1CH2 A; 1FAW B; 1MLQ A; 4YU4 A; 3HHB A; 1LFV A; 1HBH A; 1M9P A; 1Y09 B; 1XXT B; 3UBC A; 1S5Y B; 2HZ1 A; 3NG6 B; 1CMY B; 1NPG A; 3DHT B; 1J7Y A; 1A0U B; 1IOP A; 1YGF B; 3E5O A; 1CQX A; 1Y2Z A; 1NPF A; 1QXE B; 3ZJN A; 2MBW A; 3VRG B; 4ZVA A; 3WCV C; 1NWI A; 1I3E A; 1YE2 B; 1B86 A; 4UIQ A; 2MYB A; 4KMV A; 1OR4 A; 1Y0C A; 5E29 A; 3H57 A; 1YCB A; 1O1I B; 2O5M X; 2SPM A; 1Y7G A; 1S61 A; 1SPG B; 3UHD A; 1Y0A A; 1NS9 A; 3BJ3 B; 1YHU B; 3G4U A; 2HCO A; 1DO7 A; 1DTM A; 1S6A A; 2ZLU A; 1JF3 A; 2G12 A; 3LB3 A; 2HHE A; 4L2M A; 2ZSR A; 4N7N B; 1NEJ A; 1Y7D A; 2ZT2 A; 4ROM A; 1RQ4 B; 1HAB B; 1Y4G B; 1MWB A; 3GK9 A; 1MZ0 A; 2LH6 A; 3EU1 B; 1KFR A; 3ZJQ A; 2DC3 A; 3AT6 B; 1G0B B; 4M4B A; 1DO3 A; 2RAO B; 1HGC A; 4G1B A; 1FHJ B; 3WFX A; 6HBW B; 4TWV A; 3MOU A; 1F5P A; 1O1M A; 1N9X A; 1UX9 A; 3WCT D; 2MGL A; 2BLJ M; 1Y0D A; 2NSR A; 1S69 A; 3E55 A; 1MNH A; 4HBI A; 1MOC A; 2H8D B; 3A59 B; 3HXN B; 4MBA A; 4HHB A; 1CP0 A; 4MAX A; 1RQA A; 1Z8U B; 3UGY A; 4YU3 A; 3LR7 A; 2D2N B; 1XY0 B; 1XQ5 A; 3RGK A; 5JDO F; 1Y0T B; 3PEL A; 1WLA A; 2HBC B; 1MWC A; 1YE0 B; 3GDJ B; 5EE4 C; 3S65 A; 2H8F B; 1HBR A; 1MTK A; 1DM1 A; 2ZSS A; 1UFP A; 2QU0 A; 4O4Z A; 3UH7 A; 1L2K A; 1YMA A; 1GZX A; 1JZL A; 1RQ3 B; 4XS0 A; 1LA6 A; 1LH2 A; 1X9F C; 2VRY A; 2LH2 A; 5SW7 B; 4WJG 1; 1XZ5 A; 1NZ3 A; 1OUU B; 2ZLT B; 3QJB A; 4VHB A; 3G4V A; 1B0B A; 1A9W E; 3LB1 A; 1O1L A; 3AQ7 A; 5KER A; 4MQI B; 5JDO D; 2ZLX B; 2ZS1 B; 1GCW B; 4NK2 A; 5C6Y A; 3SDN A; 3PI9 B; 1OJ6 A; 4FH7 A; 2MGI A; 2ZFO B; 1V4W B; 2MB5 A; 2Z6N A; 3PI8 B; 1A4F B; 1G08 B; 1URV A; 1Y31 B; 2OHA A; 1S56 A; 1JY7 B; 1CPW A; 2AV0 A; 1CIK A; 2ZT0 A; 5F0B A; 3HC9 A; 4KMW A; 1EW6 A; 1XZ2 A; 1MLJ A; 1ECO A; 1GDL A; 1RSE A; 5EQM A; 3OO4 B; 1A00 A; 2NX0 A; 4N7O A; 2FRI X; 3R0G A; 2O5L X; 2LHB A; 1YHU C; 3O7N A; 1O1K A; 1V4U B; 3WR1 A; 1IT2 A; 1BZZ B; 1JP6 A; 2LH1 A; 2EVP A; 1BBB B; 3WHM B; 2ZS0 A; 3BOM B; 2ZS0 D; 5HU6 A; 1Y45 A; 2HBE B; 1HLB A; 3OK5 A; 3QJE B; 2RI4 B; 1N9I A; 1RPS B; 1J7W A; 1LUE A; 1H97 A; 3UHN A; 3VRE B; 2AV3 A; 1COH B; 2G10 A; 2MGC A; 5ILE A; 1ABY B; 4PQB A; 2VEB A; 2VYW A; 2MGH A; 3D1A A; 1MYT A; 2W31 A; 2AA1 B; 1BIJ B; 2AUQ A; 1LFY B; 3UHS A; 1HGB B; 2D2N C; 3EOK A; 2ZSO A; 4IRO A; 1J41 A; 3ZJM A; 5MBN A; 2NSS A; 3B75 B; 2GTL D; 3ZJI A; 3ZOL A; 3D7O A; 1A0Z B; 4YU4 B; 3HHB B; 1LFV B; 1HBH B; 1CH5 A; 5KKK A; 3ED9 A; 1YEU A; 1Y2Z B; 3BJ2 B; 3GKV B; 1HAB A; 1YVT A; 2E2Y A; 1OUT A; 1HGA A; 2W6X A; 3HEO A; 1LFQ B; 1LFT A; 2BW9 M; 3QM5 A; 5CN8 A; 1GLI B; 1MLG A; 2MYD A; 6HBW A; 2G0Z A; 2PEG B; 4F69 A; 1MBD A; 2GKM A; 3QM7 A; 1Y7G B; 3MJP A; 1NS9 B; 1JL6 A; 1XZ4 A; 2GRF A; 1MYZ A; 1K1K A; 2ZLU B; 3A59 A; 4O2G A; 1BZP A; 2BKM A; 2ZS1 C; 2HHE B; 2ZT3 A; 4FH6 A; 4FWX A; 1NEJ B; 1XY0 A; 2V1J A; 1Y7D B; 2ZFO C; 5AB8 A; 4ROM B; 1Y4V A; 2HBC A; 3GKT A; 3UGZ A; 3WFT A; 1ITH A; 4M4B B; 1HGC B; 5ILM A; 2IN4 A; 2H8F A; 3ZJR A; 1A6N A; 1O1M B; 2EKT A; 2DXM A; 1Y0D B; 1BIN A; 3KMF A; 1UVY A; 3TM3 A; 1HV4 B; 3PIA A; 4ESA A; 1HDB A; 4HHB B; 5CMV A; 1RQA B; 4MQG A; 1VXG A; 3G4Y A; 4YU3 B; 5SW7 A; 1O1J B; 1CBL A; 1XQ5 B; 3KUO A; 4NI0 B; 3PEL B; 1G9V A; 5CN4 A; 1O1P A; 1F5O A; 4MQH A; 1IBE B; 3S65 B; 2MYC A; 3WCP A; 2O5Q X; 4F6F A; 4X0L B; 2ZLX A; 2ZS1 A; 3ZH0 A; 3PI9 A; 3G53 A; 1O1O A; 1TU9 A; 4XS0 B; 1BUW A; 1LA6 B; 1GCV A; 1V4X A; 1Y31 A; 3IC0 B; 3SZK A; 2H35 A; 1XZ5 B; 1YOH A; 1VRF A; 4B4Y A; 1JY7 A; 2ZSP A; 2B7H A; 3BA2 A; 3QJB B; 1LFZ A; 1O1L B; 2CMM A; 2OH9 A; 3GQR B; 5KER B; 3OO4 A; 2ZSZ A; 3UHK A; 1C7C B; 3K8B B; 106M A; 1GDK A; 5CND A; 2GRH A; 1HRM A; 1VXB A; 3OZU A; 1ECD A; 1V07 A; 1MOA A; 2Z6N B; 3NML A; 1Y46 B; 3ECL A; 1HBS A; 2LH5 A; 1HSY A; 1LHT A; 3WFU A; 1XZ2 B; 1HBG A; 2R1H A; 1A3O A; 3M3B A; 2V1G A; 1A00 B; 4O4T A; 2AUP A; 4N7P A; 4N7O B; 3UHV A; 4FC3 A; 2ZFB A; 3AQ9 A; 2HZ2 A; 1LFL A; 1IRD A; 3WR1 B; 3MBA A; 2BLH A; 2D6C A; 1LFY A; 4OOD A; 2ZS0 B; 5EOH A; 1LHS A; 1MYG A; 5HU6 B; 1Y45 B; 2EB8 A; 1SPE A; 2HBF B; 1Y22 A; 1Y4F B; 3B75 A; 1UC3 A; 1J7W B; 1A0Z A; 5EU2 A; 1QPW A; 1Y5K A; 1YHE B; 5HBI A; 1Y5J A; 5HLQ A; 2BK9 A; 3IC2 A; 3OJ1 A; 3QMA A; 1DWS A; 1MNO A; 1HDS A; 3UBV A; 1JP9 A; 3D1A B; 1J40 A; 4O1T A; 1YH9 A; 3UHX A; 2G14 A; 2XKH A; 5HLU A; 3BJ2 A; 1UFJ A; 1J3F A; 3GKV A; 3BJ1 A; 1Y7Z A; 1A01 B; 3EOK B; 1LFQ A; 1Y8I A; 2MYA A; 4IRO B; 1J41 B; 2FAM A; 4DWT A; 2GTL B; 1GLI A; 3QQR A; 2PEG A; 1F65 A; 3FH9 A; 4HSX A; 1JWN A; 3D7O B; 1ECA A; 1XZ7 A; 2PGH A; 3K9Z A; 1JPB A; 1CH3 A; 3NL7 A; 4U8U A; 1KD2 A; 4U8U D; 2D5X A; 4DWU A; 2V1F A; 1THB A; 3AT5 B; 1BZ1 A; 3WCW D; 1YEU B; 4DC8 A; 2ZLV A; 1YVT B; 2V1K A; 1CG5 A; 2R4W A; 1OUT B; 3UHW A; 1HGA B; 6HBI A; 1MBI A; 5CHR A; 3UHE A; 2D2M A; 1LFT B; 2D2M D; 1YIH A; 2MGF A; 4IT8 A; 3UH3 A; 1NQP B; 2DN2 A; 3WCT A; 2VLY A; 3QM9 A; 3WFW A; 3MJP B; 4NI1 A; 4KJT A; 1XZ4 B; 2ZSQ A; 4F6J A; 1ABW A; 1MYI A; 1K1K B; 1UX8 A; 1CH7 A; 1HV4 A; 5CNF A; 1U7R A; 1QXD A; 1FN3 B; 1HLM A; 1S0H A; 3EDB A; 1O1J A; 1PMB A; 4NI0 A; 5JOM A; 1Y4V B; 3HF4 B; 3GOU A; 1DO4 A; 2Z8A A; 1IBE A; 1C40 A; 1MYM A; 1MWD A; 1QI8 A; 1WMU A; 3WCV D; 4X0L A; 2QSS B; 2NRM A; 5HY8 A; 2DXM B; 1RVW A; 1YZI A; 5CNG A; 1ABS A; 1AJ9 A; 4UUR A; 3PIA B; 4XDI A; 5JGG A; 4ESA B; 2QMB B; 2EB9 A; 1HDB B; 4MQG B; 3ECX A; 3IC0 A; 4C0N A; 2EVK A; 1G9V B; 5HLX A; 4F6D A; 2QRW A; 2ZS0 C; 1O1P B; 3PT8 B; 4MQH B; 5CN5 A; 3GQR A; 1MYH A; 3WCP B; 1PBX A; 1C7C A; 1VXD A; 3K8B A; 3WCU A; 2M6Z A; 3WCU D; 5C6E A; 3ZJH A; 3UHU A; 1O1O B; 2W6W A; 3A5B A; 1A3N B; 1BUW B; 1VXF A; 2G0X A; 1NZ4 A; 2MGG A; 1MNK A; 1Y46 A; 3NMM A; 4NZI A; 1GCV B; 1V4X B; 5EYJ A; 3SZK B; 2H35 B; 1A6K A; 1OFJ A; 1R1X A; 2B7H B; 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1MGN A; 3FH9 B; 2WTH A; 2XKI A; 1XYE B; 1XZ7 B; 2PGH B; 2DN1 B; 1Y4P A; 2SPL A; 1Q1F A; 3M38 A; 3NL7 B; 2IG3 A; 1Y35 A; 3HYU A; 4U8U B; 1DXV A; 1J7S A; 2OIF A; 1KD2 B; 1MBS A; 2D5X B; 5IKS A; 1FN3 A; 1THB B; 1YOG A; 3CIU A; 3WCW B; 1BZ1 B; 1UVX A; 1VHB A; 2ZLV B; 3P5Q A; 1CG5 B; 1MLH A; 3HF4 A; 2HBD A; 3ONZ A; 2D2M B; 4MPM A; 1YIH B; 1XZV A; 1LH6 A; 2LH3 A; 2DN2 B; 3WCT B; 2OHB A; 3ZJP A; 5CNB A; 2QSS A; 4NI1 B; 1MBA A; 3GQG A; 1ABW B; 5CN9 A; 1MNI A; 1WVP A; 2R4X A; 2O5O X; 1QXD B; 3GQP A; 5ILP A; 2QMB A; 3GYS A; 3UHC A; 1JZM A; 1S0H B; 1BZ0 A; 2GLN A; 1CH1 A; 111M A; 1Y7C B; 3LB2 A; 1JW8 A; 2MGD A; 3GOU B; 3PT8 A; 4JAC A; 2GNW A; 1NWN A; 1Y4B A; 1C40 B; 3PI4 A; 1Y0W A; 1A6G A; 1MTI A; 1C7D B; 1QI8 B; 1WMU B; 1IT3 A; 4F6G A; 1FSX A; 2HHD A; 5HY8 B; 1RVW B; 1YZI B; 5KDQ A; 1SDL A; 1A3N A; 3ZJL A; 4TYX A; 1AJ9 B; 1IWH A; 5JGG B; 3VAU A; 4G1V A; 102M A; 3GLN A; 3O89 A; 3AQ8 A; 5EUI A; 2O5T X; 3ZJS A; 1DWT A; 1X46 A; 5CN6 A; 1CQ2 A; 1MOH A; 2VHB A; 1DXD A; 1BZR A; 1YEN A; 1Y5F A; 2R4Y A; 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