The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSGATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN (METAQUO)
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| publication title |
Replacement of the proximal ligand of sperm whale myoglobin with free imidazole in the mutant His-93-->Gly.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
63
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-12-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DXM A; 1MTJ A; 1Y0W B; 5CNC A; 1DWR A; 3FS4 A; 1YHR B; 3B75 B; 3NL7 B; 3UHC A; 2ZT0 A; 2ZLW A; 1N9X A; 2EVP A; 3GYS B; 2G14 A; 1Y5J B; 2C0K A; 1NEJ A; 1QXD B; 1COH B; 4IRO A; 1S0H B; 1Y5K B; 2D5X A; 2MGM A; 1OFK A; 2LH6 A; 3G46 A; 1SWM A; 2QU0 A; 1BZR A; 1BIN A; 1QPW A; 3UBV A; 5IKS A; 1A0U A; 2JHO A; 1Y0T B; 1YEO A; 3S1I A; 2KSC A; 1CH9 A; 2HHB A; 1YE2 A; 3HF4 A; 2DN3 A; 3UHU A; 1YZI B; 3QJD B; 1IWH B; 3OO5 B; 3WCV D; 4X0L B; 1XZ4 B; 5E83 A; 3OJ1 A; 105M A; 1Y7Z A; 2V1G A; 3PT8 B; 1HGA B; 1MTI A; 2MGI A; 2D2M A; 3ONZ A; 1G09 B; 1YHE A; 5AZR A; 1J3Z B; 2G0R A; 4F4O A; 3UHD A; 2AUP A; 1MYZ A; 3GQP A; 1QI8 A; 2PEG B; 3WCP A; 2BMM A; 3SDN A; 4G51 B; 1MKO B; 4M4B B; 1LTW A; 3AT5 A; 4U8U C; 112M A; 3LQD A; 2MGL A; 3D4X A; 3QM7 A; 1MBS A; 3HHB A; 1QXE B; 1Y4V B; 1HGC A; 2LH1 A; 3A2G A; 1UIW B; 1Y4F A; 4ZVB A; 2EB8 A; 1G0B B; 1NZ2 A; 1Y5F B; 5HBI A; 1A6G A; 1NS6 B; 1YMC A; 1TU9 A; 1RQA A; 2V1F A; 2ZS1 B; 1HDS A; 1J7S A; 1AJ9 B; 1ECD A; 2BLJ M; 3AQ9 A; 5D5R A; 2BK9 A; 2MGJ A; 3BCQ B; 1Y4G A; 2W6Y A; 3O89 A; 1CH5 A; 1BJE A; 3V2V A; 2ZSS A; 1XZ2 A; 3NML A; 5KKK A; 1V4U A; 4N7O A; 2B7H B; 5F0B A; 5HLX A; 2LH2 A; 4MQC B; 1YEU B; 3GQG A; 111M A; 1FN3 A; 2QLS B; 1S56 A; 1JWN A; 4ROL A; 3ZJO A; 2O5B X; 1C7B A; 4XDI A; 1Y85 B; 2D2N D; 1HCO A; 1DTI A; 1XZ7 A; 3PI1 A; 1MYH A; 1GZX A; 1RQ4 A; 1O1J A; 1BVD A; 3GK9 A; 2MGD A; 2GL3 A; 1Y45 B; 1YVT A; 3HRW A; 3QJC B; 1HBS A; 2O5T X; 2MBW A; 3SZK B; 3W4U B; 3WCU B; 3D1K B; 2O58 X; 1DUO A; 1Y31 A; 1Y8W A; 1GBV B; 1WMU A; 2ZT2 A; 3QM8 A; 2W6X A; 1JEB A; 1O1N A; 1OUT A; 3G4Y A; 1XY0 B; 1XZV B; 1HAB A; 1FAW A; 1YGD A; 2ZSX A; 3DUT A; 3LHB A; 1LFQ B; 3P5Q A; 1HBR B; 3D17 B; 3K8B B; 1HBB B; 1YIE B; 3WFW A; 2H8D B; 4NI0 B; 1LFL A; 3HEN A; 3HXN B; 3NMM A; 1YE0 A; 2R50 A; 2QSS B; 1YGF B; 2QFN A; 1GLI A; 1GDJ A; 1A3O B; 1J7Y B; 2H35 A; 3FH9 A; 2ZSR A; 2MYE A; 2Z6T A; 4HBI A; 4DC7 A; 2V1H A; 1J40 A; 3V2Z A; 1DKE B; 1X9F D; 2GTL A; 3DHR B; 1Y0W A; 1O1M B; 3WHM B; 1LH3 A; 5B85 A; 1YHR A; 3G52 A; 3S65 A; 3B75 A; 1HDA B; 3NL7 A; 1HSY A; 1FSX B; 1HDB A; 3GYS A; 5C6E B; 5AB8 A; 1QXD A; 2ZS0 D; 1MBC A; 1S0H A; 1NXF A; 1Y5K A; 1GDL A; 2HZ2 A; 1XZU A; 3UGY A; 2MGF A; 2DC3 A; 4MQH B; 3BOM B; 2W6W A; 1Y0T A; 1CH7 A; 3E5I A; 1IWH A; 3AQ8 A; 1M6M A; 4H07 A; 4UUR A; 4U8U B; 1IOP A; 1DLY A; 3UHR A; 1Y2Z B; 1MZ0 A; 1ECA A; 1HGA A; 3WI8 A; 1G09 A; 4ROM B; 1SPE A; 5M3S A; 1T1N A; 2PEG A; 1O1I B; 4G51 A; 1VXD A; 1HV4 B; 1DO1 A; 1FHJ B; 1JP8 A; 1YH9 B; 1MKO A; 4M4B A; 2DN2 B; 2GRF A; 1CH2 A; 1JW8 A; 4M4A A; 2MHB B; 2FRJ X; 2V1K A; 3RJ6 A; 1QXE A; 1MLO A; 2R1H A; 3A9M A; 3QJE B; 4B4Y A; 1UIW A; 2O5O X; 1Y09 B; 3QM5 A; 3LR9 A; 1G0B A; 1DXT B; 1G08 B; 1Y5F A; 5E29 B; 1NS6 A; 5HU6 B; 3QQQ A; 1SDL B; 2ZS1 A; 3HEO A; 1AJ9 A; 4HRT B; 5MBA A; 5CHQ A; 3WFX A; 1NS9 B; 1NGK A; 1WVP A; 1A3N A; 3ARL A; 5HLU A; 1YOG A; 4JYQ A; 3PT7 B; 103M A; 3M38 A; 1N9I A; 1CG5 B; 1H97 A; 5EU2 A; 2QLS A; 1DXV A; 1Y46 B; 1Y85 A; 1XYE B; 1UX9 A; 3UHB A; 4PQB A; 2O5L X; 1CBL A; 3ZJS A; 3TLD A; 1Y7C B; 1CMY B; 3BJ2 A; 2ZLX B; 1Y8H B; 4N8T A; 2HBS A; 1X3K A; 3A5A A; 3S1J A; 4YU3 B; 2MGB A; 1Y45 A; 2QFK A; 3R5I B; 4MQI B; 4ODC B; 2LH7 A; 3PI4 A; 1GBV A; 3H57 A; 3WR1 A; 1GBU A; 1IRD B; 1BZ0 B; 1XZV A; 1Y8I A; 3G4Q A; 1A01 B; 1LFQ A; 1GDK A; 3D17 A; 1VXE A; 3K8B A; 1HBB A; 1YIE A; 1J3Y A; 4NI0 A; 4HSW A; 3LB1 A; 3ZJR A; 1VXF A; 5EYS A; 1A4F A; 2OHA A; 3MVC A; 1MNK A; 4NXA A; 2QSS A; 2G0X A; 1YGF A; 1BAB B; 1LFT A; 1YHU C; 1A3O A; 1J7Y A; 1S6A A; 3HYU A; 2D60 A; 5ILP A; 1OR4 A; 5JDO F; 1YIH B; 1V4W A; 101M A; 2VM0 A; 3A59 B; 1O1O A; 2FAL A; 1V75 A; 1EW6 A; 3DR9 A; 1DWS A; 3K3U A; 3DHR A; 1O1M A; 3WHM A; 5CNG A; 2FRI X; 3UH5 A; 3WCW B; 2YRS B; 1K1K B; 4OOD A; 1FSX A; 1GCW B; 2W6V B; 5C6E A; 1R1X B; 3ODQ B; 2ZFB B; 1NIH B; 2HCO B; 1MDN A; 5EET A; 3QZX A; 1YEQ A; 4F6D A; 6HBI A; 3OK5 A; 110M A; 2GTL D; 4MQG B; 2WY4 A; 4MQH A; 1Y4R A; 1J3F A; 1RQ3 B; 3ZJP A; 3E55 A; 1MYJ A; 3LB4 A; 1NZ4 A; 4U8U A; 1SI4 B; 5E6E B; 1S61 A; 4NXC A; 3AQ5 A; 1BBB B; 1Y2Z A; 1DO3 A; 1GDI A; 1SHR B; 1VXC A; 1V9Q A; 1MWB A; 4MAX A; 1VXG A; 2D2N C; 3UHH A; 5CNF A; 2MGH A; 107M A; 4N7P B; 2DN2 A; 1MBD A; 3MJP B; 2LH5 A; 2Z85 A; 2MHB A; 1HBH A; 1MLS A; 1F5P A; 4MQK B; 3GQR B; 1MNO A; 1IT2 A; 5JGG A; 3AG0 A; 3KMF C; 3ECX A; 2AV0 A; 5E29 A; 2VEE A; 1GVH A; 2G0V A; 2HBG A; 2QRW A; 1UVX A; 1Y0A A; 4HRT A; 5HLQ A; 2OIF A; 1NS9 A; 2GDM A; 1HHO B; 3OZU A; 2PGH A; 1Y4B B; 2E2Y A; 2ZFO D; 106M A; 1I3E A; 1YEN B; 1LFV B; 4MBA A; 3UH3 A; 1C40 A; 1H1X A; 3PT7 A; 1JL7 A; 1CG5 A; 1MLH A; 5ILE A; 1BUW B; 1URY A; 2ZS1 D; 3G4U A; 3VRE B; 1GJN A; 1V5H A; 1Y46 A; 3BJ1 B; 3MN0 A; 1XYE A; 3EOK B; 2ZWJ A; 1A00 B; 1Y83 B; 4N7N B; 3GLN A; 1Y7C A; 1X9F C; 1CG8 B; 2MB5 A; 2ZLX A; 3UHZ A; 1Y8H A; 1BZZ B; 3OVU C; 1MYG A; 1XZ5 B; 1JP6 A; 2OLP A; 1DXD A; 1J52 A; 3R5I A; 1YDZ B; 4ODC A; 1Y8K B; 1Y35 A; 6HBW B; 1Y4Q B; 2NX0 A; 1HAC B; 1THB B; 1F5O A; 2FAM A; 5B84 A; 3VRF B; 3OO4 B; 1IRD A; 1BZ0 A; 1YHU B; 2O5Q X; 1A01 A; 1MBN A; 1UC3 A; 2OHB A; 3MJU B; 4PNJ A; 3G4W A; 3ECZ A; 1BIJ B; 1KFR A; 1GCV B; 3H58 A; 3QMA A; 2AA1 B; 1BZ1 B; 5HY8 A; 1QSH B; 3WCT C; 3M3A A; 3U3E A; 1ABS A; 4TWU A; 1HRM A; 1I3D A; 3GOU A; 5EOH A; 4VHB A; 3ZOM A; 1RSE A; 1O1K A; 3G4V A; 1URV A; 2RI4 B; 1YIH A; 1S5Y B; 1AJG A; 2ZLT A; 3UI0 A; 4F69 A; 2HBC B; 1YVQ B; 2MYB A; 5CMV A; 3CY5 B; 3AQ6 A; 2YRS A; 3BJ3 B; 1K1K A; 1IRC A; 1GCW A; 4H0B A; 2W6V A; 3O7N A; 3RJN B; 3ODQ A; 2ZFB A; 4DC8 A; 1NQP A; 1BZ6 A; 5CN5 A; 1NIH A; 4G1B A; 3E4N A; 2HCO A; 2Z8A A; 3UHY A; 5HAV A; 2FRK X; 5JDO C; 1RTE A; 4YU4 B; 4C44 A; 3TM3 A; 3IC0 A; 1B86 B; 1Y22 B; 1JY7 B; 1RQ3 A; 2D2N B; 5KDQ B; 3PI9 A; 4G1V A; 1XXT A; 1NPF A; 1LFZ B; 2ZLU B; 5C6Y A; 1S5X B; 2AUO A; 1VWT A; 1J41 B; 3MOU A; 3KUO A; 5KER A; 1MWC A; 4OF9 A; 2EB9 A; 2HHE B; 1SHR A; 2NRL A; 2VRY A; 4UIQ A; 1ABY B; 3ZJQ A; 2HBF B; 1Y0D A; 3PEL B; 4HHB B; 4F6J A; 4N7P A; 2HZ3 A; 1R1Y B; 3MYM A; 4U8U D; 1Y5J A; 1COH A; 4MQK A; 108M A; 1U7R A; 3GQR A; 1EMY A; 2MYC A; 3HEP A; 4PQ6 A; 4KN3 A; 1A6M A; 1O1P B; 1MNH A; 1JZK A; 3WCW C; 2WTH A; 3G53 A; 1Y01 B; 1MYI A; 4HRR B; 2BW9 M; 4XS0 B; 1YZI A; 4LPI A; 3QJD A; 1VHB A; 2VYZ A; 3OO5 A; 3WFT A; 2VHB A; 4X0L A; 3MKB B; 3OGB A; 1XZ4 A; 2ZT3 A; 3UHN A; 1X9F B; 3PT8 A; 1CLS B; 2GNW A; 1J3Z A; 1Y7G B; 2Z6N B; 3PI8 B; 5EUI B; 3IXF A; 3VAU A; 1Y4P B; 2ZLV B; 1Z8U B; 1BUW A; 1UX8 A; 1D8U A; 3VRE A; 3BJ1 A; 1VXB A; 3EOK A; 2BWH A; 4UZV A; 1HBA B; 1A00 A; 3NG6 B; 1M6C A; 1MBI A; 1Y83 A; 4N7N A; 4DWU A; 1YG5 B; 1CG8 A; 1ABW B; 1BZZ A; 4C0N A; 2NSS A; 1Y4V A; 4O1T A; 2GRZ A; 2D2M D; 2BLI A; 3FS4 B; 1YOI A; 2W72 C; 4F68 A; 1YDZ A; 5CN8 A; 1Y8K A; 3ZJI A; 6HBW A; 3WCT B; 1Y4Q A; 1NEJ B; 2DHB B; 2AUQ A; 3VRF A; 2D5X B; 3IC2 B; 5EYJ A; 1YHU A; 3LB3 A; 3BCQ A; 1BIJ A; 1QPW B; 1IT3 A; 2MGG A; 1AZI A; 4DWT A; 1BZ1 A; 1YEO B; 1QSH A; 2B7H A; 1G0A B; 4F6F A; 4MQC A; 3EDA A; 1YEU A; 3UBC A; 1DM1 A; 2OH8 A; 2G3H A; 1PBX B; 1LUE A; 1UFP A; 4TWV A; 2G0S A; 2RI4 A; 5CHR A; 3G4R A; 1FDH A; 3ZH0 A; 3QZZ A; 3QJC A; 1Y7D B; 1M9P B; 3SZK A; 3QQR A; 4O2G A; 3W4U A; 3WCU A; 1Q1F A; 3CY5 A; 3D1K A; 3BJ3 A; 2V1I A; 1CPW A; 1A0Z B; 1MTK A; 5EQM A; 1LH2 A; 2BLH A; 1XY0 A; 3QM9 A; 3UHG A; 1Y4F B; 1YOH A; 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1ABW A; 3UHV A; 3S66 B; 4MBN A; 2GTL B; 7HBI A; 2SPN A; 3QJE A; 1VXH A; 3S65 B; 2R4X A; 4FWX A; 1Y09 A; 1EBT A; 1DXT A; 1HDB B; 1G08 A; 3WCT A; 5HU6 A; 3ED9 A; 2DHB A; 1CO9 A; 1SDL A; 4F6B A; 1W92 A; 3ZJL A; 3IC2 A; 1XZU B; 2SPO A; 109M A; 1IBE B; 4PQC A; 1VXA A; 3A5G A; 1DLW A; 2MYA A; 1G0A A; 5SW7 B; 1RVW B; 4ESA B; 1PBX A; 1NPG A; 3SDH A; 1U7S A; 1YHU D; 1NZ3 A; 1CH1 A; 1YMB A; 1HBG A; 1CMY A; 3WTG B; 3WFU A; 1C7C B; 1DO4 A; 1YCA A; 3D7O B; 1T1N B; 4NI1 B; 2AUR A; 1RTX A; 2XKI A; 4YU3 A; 4AVD A; 1MWD A; 3MBA A; 1ECO A; 2HBD B; 1Y7D A; 1NZ5 A; 2BKM A; 1LHS A; 1M9P A; 1TES A; 4MQI A; 4M4A B; 2ZS0 C; 2M6Z B; 1UVY A; 5CND A; 4B3W A; 1X46 A; 3A5B A; 1F63 A; 3WCV B; 2R1H B; 2HBE B; 1A0Z A; 2ZFO B; 2ZST A; 3R0G A; 2GRH A; 3CIU B; 2WTG A; 1CQX A; 3GDJ B; 1OJ6 A; 1RPS A; 4F6G A; 3WCU D; 2ZSO A; 2MGE A; 1MNJ A; 1BAB A; 1JZL A; 4HSX A; 1LJW A; 1A3N B; 1O16 A; 3OZW A; 1LHT A; 4NK1 A; 3ZHW A; 4L7Y A; 1A9W A; 1DXU A; 1MLF A; 2SPM A; 4QAU A; 2G0Z A; 2LHB A; 3A59 A; 4H2L B; 1CH3 A; 1ITH A; 1Y0C A; 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