The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Crystal structures of CO Hemoglobin E (betaE26K) approaching physiological pH (pH 7.5)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
58
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MYZ A; 3QJD B; 1F63 A; 5C6E A; 1Y4P A; 3D4X B; 4KN3 A; 1Q1F A; 3LR9 A; 1R1X A; 1CH1 A; 1GVH A; 5JDO F; 4NI1 B; 5HU6 B; 1O1K A; 4DWU A; 1Y0C A; 1NEJ A; 5CN5 A; 3V2V A; 1HBA B; 1V4W A; 2PGH A; 3WHM B; 3UHZ A; 1A3N B; 2KSC A; 2VM0 A; 1G08 B; 3GQR B; 1NAZ A; 3K3U A; 1XXT B; 3WCW A; 3UHI A; 3UHD A; 2HBC B; 3PI8 B; 1CIO A; 1O1L B; 1S5X B; 3WFX A; 1XZ7 B; 4N7N B; 2ZFO A; 1MTK A; 1ASH A; 1LH5 A; 4ROL B; 1HAC B; 2O5S X; 1C7B A; 3LQD B; 3AQ7 A; 1COH A; 1FLP A; 1MBO A; 2D2M C; 2GL3 A; 2W72 A; 4ROM A; 4NI0 A; 1GDK A; 4MQG A; 2OHB A; 6HBW A; 2AA1 A; 1XZ5 B; 3ORD A; 1QSH A; 2HCO A; 2FAM A; 2V1K A; 3HEP A; 2ZSX A; 4X0L B; 3HRW B; 3A5G A; 3ZJN A; 1Y5J A; 2QFK A; 1LH6 A; 1BZZ B; 5JDO E; 1Y0C B; 1NEJ B; 5E83 A; 1FN3 B; 4ODC A; 1YE0 A; 2RI4 B; 1J40 A; 1UVY A; 1VXD A; 3UHE A; 2E2Y A; 3WCW B; 3PT7 A; 1CBL A; 2GTL D; 3UHG A; 1DO7 A; 2VRY A; 2H35 A; 1MOB A; 4O4T A; 1Y5F A; 1URV A; 1JZL A; 2ZLV B; 2O5M X; 1Y4F A; 1WLA A; 2SPN A; 4HRR A; 2ZT2 A; 3MKB A; 1ITH A; 5EE4 D; 1DO4 A; 1Y46 B; 1WMU A; 3A59 B; 4MQG B; 1QPW A; 1RVW B; 1J7Y B; 1V5H A; 4HRT B; 3G52 A; 2HBE A; 2LH2 A; 2VLY A; 1O1P B; 1YGF B; 1MBC A; 1AZI A; 2Z6N A; 2XKI A; 2ZT0 A; 1C7D A; 3KUO A; 1MLN A; 1HAB A; 3TM9 A; 1NQP B; 3M3B A; 1S0H A; 1BZ6 A; 3UH7 A; 2MGA A; 4MQI B; 1NS6 A; 1XYE A; 1CLS B; 1A6K A; 1J40 B; 5B85 A; 1UFJ A; 1J41 B; 3VRG A; 1URY A; 4MQH B; 1EW6 A; 1MKO B; 2ZS1 C; 1Y4Q B; 3PT7 B; 2ZFO C; 1NPG A; 1X3K A; 1VXA A; 4O2G A; 1S61 A; 2ZSS A; 1Y5F B; 2W72 C; 1U7S A; 1MTI A; 3UHB A; 3NG6 B; 5CNF A; 3QM6 A; 2BLI A; 1QI8 B; 1LHT A; 2WY4 A; 3WCT D; 4ZVB A; 1VXE A; 1YIE B; 1IT3 A; 2H8D A; 3MN0 A; 2HZ3 A; 1YG5 B; 2QSS B; 1JP6 A; 2OIF A; 1Y7G A; 1YH9 A; 3AG0 A; 1A00 A; 2HBE B; 5EU2 A; 105M A; 1R1Y B; 1FSL A; 2Z6N B; 2BKM A; 3BJ1 A; 3GOU A; 1C7D B; 3CY5 B; 3DR9 A; 3UHX A; 1X9F C; 1CQ2 A; 4F68 A; 3S66 A; 2NX0 A; 2D2M D; 2HZ2 A; 1MNI A; 3WTG A; 1L2K A; 3QM8 A; 2YRS A; 1EMY A; 5ILM A; 4HSX A; 2D2N A; 2BMM A; 3ZOM A; 2ZLU B; 1NS9 A; 4F6I A; 1GZX B; 1XY0 A; 3PT8 B; 4WJG 1; 3WCV A; 1OUU B; 3HEN A; 3IC0 A; 2MGL A; 1BAB A; 2AUP A; 2ZSZ A; 1MCY A; 5HAV A; 1CP5 A; 1MWB A; 3ZJJ A; 2DN1 A; 1Y83 A; 3UHW A; 1XZU A; 109M A; 1A00 B; 1TU9 A; 1DXD A; 1RSE A; 1HRM A; 1V75 A; 1Y0W B; 3QM7 A; 1BIN A; 2GLN A; 3BJ1 B; 3ZH0 A; 3GOU B; 1MBI A; 4TWU A; 1VRE A; 4DC8 A; 2SPO A; 3HEO A; 4H07 A; 1DXU A; 3EDA A; 3S65 B; 1YHR B; 4NK1 A; 1HLB A; 1PBX A; 1MYG A; 2DN2 B; 4DC7 A; 2GKM A; 4FC3 B; 5JGG A; 2W6Y A; 4MQK A; 1V4U A; 1ABW B; 3OK5 A; 1CBM A; 1XCH A; 3CIU A; 4HBI A; 5EET A; 2DHB A; 1MBS A; 1BUW B; 2QU0 A; 1B86 A; 2B7H A; 3PI9 A; 2GRZ A; 3ZJQ A; 1LH3 A; 3M3A A; 3ODQ B; 2XKH A; 4NZI A; 5CNG A; 1UX8 A; 3IC0 B; 4XS0 A; 2O5O X; 2PEG A; 3M38 A; 2OLP A; 1HBR A; 1KR7 A; 1HHO A; 2ZT4 A; 1YIH A; 3QM9 A; 2DN1 B; 1B0B A; 2ZS1 D; 5HLQ A; 2ZFO D; 1HBS B; 4FWX A; 1LFL B; 2EVK A; 1EWA A; 3MJU B; 4GZG A; 1FAW B; 1D8U A; 4F6B A; 1CH7 A; 2GTL B; 1MNH A; 4U8U C; 3IXF A; 1JY7 A; 3K8B A; 4F6G A; 1JZM A; 3GKV A; 2HBD A; 2VEE A; 1YFF A; 4PNJ A; 108M A; 1A6M A; 1PBX B; 4NK2 A; 3AT5 A; 4NXC A; 1Y4V B; 2BNL A; 3QQR A; 4UZV A; 1V4U B; 1OFK A; 1XZ2 A; 2ZLX A; 5KER A; 2DHB B; 3VRF A; 1B86 B; 1LH7 A; 1EBC A; 3PI9 B; 1G09 A; 2GRF A; 1A6N A; 3QJE A; 3MVC A; 1S69 A; 1LJW B; 1AJ9 B; 1CG5 A; 1SPE A; 111M A; 4XS0 B; 1HGC A; 2R1H B; 1MLQ A; 3HYU A; 1C7C B; 1J7W A; 5F2A A; 3BA2 A; 5KDQ A; 1HBR B; 1Y0A A; 1HHO B; 5CHR A; 1Y5K A; 1LH2 A; 1MLO A; 1UT0 A; 1SDK A; 4ILZ A; 1J3Z A; 1XZV A; 1LFT B; 3EOK A; 4N7O A; 1Y22 A; 4PQC A; 3PI2 A; 1YEU B; 4AVE A; 2FRI X; 2EB9 A; 1JEB A; 3A5B A; 3PEL B; 1LA6 A; 3K8B B; 1HJT A; 1M6M A; 3FH9 A; 2HHE A; 1YFF B; 1MYM A; 5CNE A; 3S1J A; 3AT5 B; 3DUT B; 4WJG A; 1ECO A; 3V2Z A; 1RTE A; 1C40 A; 1XZ2 B; 3D7O B; 3WCT B; 5KER B; 5ILP A; 1HCO B; 3G4V A; 5E29 A; 5EQM A; 3VRF B; 1HGB B; 3QJC A; 1YMA A; 1HBH B; 1HDS B; 1QSI A; 1YEQ A; 3BCQ B; 3QJE B; 5SW7 B; 1VXH A; 5B84 A; 1JF4 A; 1QXD B; 5CHQ A; 1Y8W B; 2D60 B; 2MGH A; 1AJG A; 2HHD A; 5KDQ B; 2VHB A; 1DUK A; 1HBI A; 1MWC A; 4H2L A; 2D2M B; 3QZX A; 1Y4R A; 1GLI A; 1XZV B; 1J3F A; 1MYH A; 1Y7C B; 3GYS B; 2LH6 A; 1YGD A; 3GKT A; 3UH5 A; 3SDN A; 1JP8 A; 3OO5 B; 4KMV A; 3S1I A; 102M A; 1MLU A; 1LA6 B; 1YDZ A; 1IT2 A; 1CH3 A; 3QJB B; 2HHE B; 5D1V A; 1FHJ A; 4LPI A; 1F5O A; 2HHB B; 1JZK A; 4FH6 A; 2C0K A; 1VXC A; 3NL7 A; 1CPW A; 1A4F A; 1C40 B; 2R4Z A; 1N9F A; 2FAL A; 5CN6 A; 3QJC B; 2ZS1 A; 5CN4 A; 1YEQ B; 1RQA B; 1OUT A; 2SPM A; 1Z8U B; 2VYW A; 3LB4 A; 1SHR A; 4F6D A; 1BZP A; 1DLY A; 1ECD A; 1V9Q A; 4F69 A; 1MLH A; 1G0A A; 5EYS A; 2D2N D; 2MYA A; 3AQ5 A; 5D5R A; 1O1O A; 4N7P A; 4M4A B; 1IDR A; 1HV4 A; 1FSX A; 1YCA A; 2R50 A; 107M A; 5C6E B; 1Y4P B; 1Y85 A; 1MGN A; 3UHT A; 3WCV D; 4ESA A; 1YEV A; 3WR1 A; 3OZV A; 1R1X B; 3E55 A; 1CMY A; 3GQG A; 1BIJ A; 3WFU A; 3ZJR A; 1O1K B; 4YU3 A; 1A3O A; 2DC3 A; 2MYB A; 3QMA A; 4G1B A; 2G0X A; 1V4W B; 1FHJ B; 1XZ4 A; 2PGH B; 1X9F A; 5CND A; 3OO4 A; 2D5X A; 2RAO A; 3EU1 A; 1NPF A; 2AUQ A; 3TM3 A; 2G0S A; 4H0B A; 2GRH A; 1LFZ A; 2HBS A; 3ZJL A; 1OR6 A; 2DN3 A; 2ZS1 B; 1OUT B; 2ZS0 C; 1A01 A; 1HDA A; 2ZFO B; 4MPM A; 1DXT A; 2QSP A; 1C7B B; 2BWH A; 1IRD A; 1COH B; 3SZK A; 1MYT A; 1YE2 A; 1LUE A; 2W72 B; 4JYQ A; 4ROM B; 4NI0 B; 2ZWJ A; 4N7P B; 1SDL A; 1J3Y A; 2JHO A; 2W6X A; 1HDB A; 1S5Y A; 6HBW B; 2AA1 B; 4F6J A; 4MQJ A; 1A0Z A; 3ASE A; 4G51 A; 1Y85 B; 1QSH B; 1NIH A; 2HCO B; 5CNB A; 4ESA B; 2H8F A; 1NZ2 A; 3WR1 B; 1Y5J B; 1CMY B; 3QZZ A; 1YHU A; 1IRC A; 2R4Y A; 4YU3 B; 5E83 B; 2NRM A; 2VYZ A; 3UHN A; 4ODC B; 3G4U A; 1YE0 B; 3UHQ A; 1JWN A; 1YVT A; 2QRW A; 3GDJ A; 2MGI A; 2LH7 A; 2D5X B; 3OO4 B; 1ECN A; 1I3E A; 2RAO B; 1KD2 A; 1YCB A; 3O7N A; 2W6V A; 5HLX A; 4B4Y A; 2OH9 A; 2QMB A; 2H35 B; 1JL6 A; 3H57 A; 2HBS B; 3UH6 A; 2MBW A; 1Y8I A; 3GK9 A; 2G14 A; 1HDA B; 3B75 A; 1Y4F B; 2EKT A; 3ZOL A; 1LFV A; 4HRR B; 3MKB B; 3VRE A; 2MHB A; 1MLL A; 4O4Z A; 3A0G A; 3R0G A; 1SDL B; 1J3Y B; 1WMU B; 1QPW B; 3BOM A; 4F4O A; 1A0Z B; 2VYY A; 1CG8 A; 1RQ3 A; 1Y09 A; 2W6W A; 2AV0 A; 1HAB B; 3UI0 A; 3WCU A; 1WVP A; 1S0H B; 4MBA A; 2GDM A; 4JAC A; 3HXN A; 1NS6 B; 2HBG A; 1ABS A; 1XYE B; 1MNK A; 1Y2Z A; 5IKS A; 4U8U A; 1RQ4 A; 1VXB A; 3VRG B; 1NXF A; 1KD2 B; 1AJH A; 1NGK A; 2W6V B; 1J7S A; 2QMB B; 2G11 A; 1I3D A; 1QXE A; 4MAX A; 1Y4B A; 3A5A A; 1O1M A; 3FS4 A; 3K9Z A; 1MYJ A; 3VHB A; 2QFN A; 3DHT A; 3QM5 A; 2H8D B; 1GBV A; 1LFQ A; 3BOM B; 2R4W A; 1LH1 A; 2FRF A; 2OHA A; 1Y7G B; 1GDI A; 1YH9 B; 2LH5 A; 1HGA A; 1HLM A; 1RQ3 B; 1YHU C; 4UIQ A; 4TYX A; 3MBA A; 2HZ1 A; 1GCV A; 1LFY A; 1X46 A; 3UGZ A; 3DHR A; 1MBA A; 2V1E A; 3UHU A; 1DWS A; 1DXV A; 3S66 B; 3HXN B; 1Y2Z B; 3WTG B; 4MQC A; 4NS2 A; 2YRS B; 3MJP A; 1YZI A; 3HHB A; 2D2N B; 1J7S B; 1NS9 B; 3G4W A; 5EV5 A; 2VEB A; 3BJ3 A; 1IWH A; 5CN8 A; 1MYI A; 4MBN A; 2LH1 A; 2EKU A; 3WCP A; 3MYM A; 1O1M B; 1XY0 B; 2G0Z A; 1Y0D A; 3WCV B; 5E6E A; 1BAB B; 1SPG A; 2G3H A; 4F6F A; 3NML A; 4AVD A; 5MBN A; 3PI3 A; 1Y83 B; 3UHR A; 1XZU B; 1V07 A; 1LHS A; 1HGA B; 1V75 B; 3AQ8 A; 3WCU C; 2LHB A; 1Y4G A; 1Y8H A; 5EUI A; 1MBN A; 1N9X A; 1LFY B; 3IC2 A; 3DHR B; 2QLS A; 3UBV A; 3UHY A; 1GDJ A; 1DXU B; 1DUO A; 1LTW A; 4SDH A; 2VLX A; 1BBB A; 1K1K A; 4L2M A; 4YU4 A; 3UH3 A; 3ZJH A; 1MNJ A; 1G9V A; 1YZI B; 1IBE A; 5JGG B; 1KFR A; 4MQK B; 3HHB B; 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4O1T A; 3UHK A; 1JEB B; 3UGY A; 1XZ5 A; 1IOP A; 3FH9 B; 5HY8 B; 1BZ0 A; 1Y35 A; 4C0N A; 3GQP A; 112M A; 4X0L A; 3HRW A; 1MZ0 A; 3D1A A; 1UVX A; 1BJE A; 3PIA B; 1BZZ A; 3NFE B; 3P5Q B; 1YHE A; 5E29 B; 3WCU D; 1FN3 A; 3RJ6 A; 3KMF A; 1O1J B; 2FRJ X; 1QSI B; 2RI4 A; 1NWI A; 3WCT C; 3RJN B; 4U8U D; 1MWD A; 2DXM B; 1T1N A; 3OGB A; 2ZS0 B; 2HHD B; 2AV3 A; 1S6A A; 1SI4 B; 2LH3 A; 1MLF A; 3M39 A; 2GKN A; 2O5T X; 1DKE A; 2MGK A; 1ABY B; 4H2L B; 4XDI A; 2ZLV A; 2G0R A; 1VRF A; 1J52 A; 1Y4R B; 1MLK A; 1O16 A; 1GLI B; 2Z85 A; 1YGD B; 1Y46 A; 2V1G A; 1YMC A; 3A59 A; 1RVW A; 2ZLW A; 1J7Y A; 3D1K A; 1Y7D A; 1MLG A; 1YDZ B; 4HRT A; 4MXL A; 2MYC A; 3ARL A; 1BZ0 B; 1O1P A; 1Y35 B; 1YGF A; 2ZSN A; 3GQP B; 3NL7 B; 3D1A B; 5CN7 A; 1CH5 A; 3LB3 A; 1A4F B; 3ARJ A; 1NQP A; 2O5Q X; 1YHE B; 4MQI A; 4KMW A; 1NZ5 A; 1V4X A; 1CLS A; 3LB2 A; 3TLD A; 1J41 A; 4VHB A; 4MQH A; 1SHR B; 1MKO A; 1T1N B; 1Y4Q A; 3MOU A; 3ECX A; 2V1H A; 1G0A B; 1Y0T A; 1MYF A; 3D17 A; 1HBG A; 1DWR A; 1O1O B; 1HV4 B; 1M9P A; 1DKE B; 2G12 A; 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