The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGKALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Crystal structures of CO Hemoglobin E (betaE26K) approaching physiological pH (pH 7.5)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
56
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5ILP A; 3WI8 A; 4MQI B; 1MLF A; 1Y0W B; 1J40 B; 1XZ5 A; 4G51 A; 3GYS A; 3ZJL A; 1SDL A; 1YEO A; 1A3O A; 1GDJ A; 1V4X B; 3UHY A; 3QJC B; 3PT8 B; 1MNK A; 1SDK A; 1CO8 A; 4PQB A; 1JY7 B; 3GKT A; 1DXD A; 1YHR A; 4ZVB A; 1DKE B; 1XQ5 B; 1M6M A; 2QU0 A; 3PEL A; 3BJ2 A; 2MYC A; 2M6Z A; 3KUN A; 5F2A A; 5EYJ A; 1MTJ A; 1ABW B; 1O1P A; 1O1J B; 3S66 A; 2QFN A; 3ZJS A; 4L7Y B; 1CG8 B; 1PBX A; 2HBD A; 1CG5 A; 4PQC A; 1BUW B; 1ECO A; 1BBB A; 3PI3 A; 1C7D B; 4DWU A; 5CMV A; 2EF2 A; 4FC3 A; 2ZFO D; 2GRH A; 2FAL A; 5CN6 A; 2O5L X; 1Q1F A; 3HRW B; 3HEN A; 2QSP A; 5CNF A; 3M3B A; 1JZK A; 3WCW D; 1VXG A; 1YVQ B; 1IWH B; 3D17 A; 1O1M A; 1Y4P B; 3RJN B; 2ZS1 C; 1VXB A; 2HBF B; 3EU1 B; 3QJE B; 2ZFO C; 1FAW A; 3ARL A; 2O5Q X; 1YZI B; 4N7O B; 4C0N A; 1XZV A; 1W92 A; 3G46 A; 1QSH B; 1DXU A; 1M9P B; 1T1N A; 2FRF A; 2RAO B; 3WR1 A; 3WCW C; 1CQX A; 3UHC A; 3GQG A; 1CPW A; 2OHA A; 4IRO B; 1DWT A; 1V07 A; 2V1G A; 2ZLT A; 1U7S A; 3OZW A; 1JF3 A; 6HBW A; 1Y85 A; 3GKV A; 3TM3 A; 4MQK A; 3O89 A; 1DWS A; 2HZ1 A; 1EWA A; 2O58 X; 2H35 B; 1O1L B; 4G1B A; 1X46 A; 3VRG B; 1RPS A; 2R80 B; 3IC2 B; 1JEB B; 1DXT A; 4F6I A; 1G0B B; 3WFU A; 3UGZ A; 5EOH A; 4ODC B; 4N7N B; 2VYY A; 3WCV B; 5AZR A; 2DXM B; 1Y4F A; 4M4A A; 1NZ4 A; 2LH2 A; 1MLH A; 1Y46 A; 2GL3 A; 2ZT2 A; 1AJ9 B; 1GDL A; 3NG6 A; 4O4Z A; 3KMF C; 112M A; 1UVY A; 1J3Y A; 3ARJ A; 3DHR B; 1CH2 A; 2NX0 A; 1RTX A; 3GDJ B; 4MQG B; 3S48 C; 4H0B A; 5EE4 D; 1NPG A; 3S65 B; 5MBA A; 3AQ8 A; 3HXN A; 5EET A; 1DLY A; 2MGG A; 2HCO A; 4F4O B; 2GTL B; 1NGK A; 2PGH A; 2SPL A; 1Y0D B; 1A00 B; 3LQD A; 2MGF A; 3ZJN A; 1QXD A; 5JDO D; 3QM8 A; 1HAB B; 1Y8K A; 2EB9 A; 5EE4 C; 1J7W A; 1LJW A; 1B86 B; 1YH9 B; 2MHB B; 3TM9 A; 1YHU D; 4HRR A; 2V1E A; 1GLI A; 3PIA A; 1RQ4 A; 1VXA A; 5JDO E; 2ZLV A; 2QMB A; 1LH2 A; 4MPM A; 3G4U A; 1DWR A; 1XZ4 A; 3UBV A; 3ZOM A; 3UHU A; 3G4V A; 2GDM A; 2WTG A; 1XYE B; 3MJU B; 1CBM A; 2VEB A; 1HDA A; 3DHT A; 3AT5 A; 3RGK A; 1YHU C; 4MQH A; 1S61 A; 1YFF A; 1YG5 A; 1J3Z A; 3E5I A; 2XKI A; 1A3N B; 4NXA A; 3HYU A; 5ILM A; 1MWB A; 2D5Z B; 2BKM A; 1Y01 B; 3ZJH A; 1FCS A; 1CQ2 A; 3VRF B; 2GTL D; 4ESA B; 1CP5 A; 1Y5J B; 5SW7 A; 1A4F A; 1BIN A; 1BIJ B; 1JPB A; 2QSS A; 3LB1 A; 3MBA A; 3HF4 A; 1YEQ A; 2QLS B; 1Y45 B; 2YRS A; 3WHM A; 1CMY A; 1Y7G B; 4X0L A; 1S5Y B; 1GBV A; 1X3K A; 3NL7 B; 2R1H A; 1YE2 B; 3GQR A; 1BVD A; 1YDZ A; 1CP0 A; 2BMM A; 2W72 A; 3ORD A; 5JGG B; 1G08 A; 1YMB A; 2G0Z A; 7HBI A; 1EMY A; 2Z6N B; 2XKH A; 3A59 B; 2FRK X; 5E29 A; 1RVW A; 3UH7 A; 1K0Y B; 1UT0 A; 1HHO A; 1MBS A; 3A5A A; 1THB B; 2DN2 A; 2HHE A; 3P5Q B; 4N7P B; 2D2N B; 1HBG A; 3CY5 A; 1HGA B; 1Y31 A; 1LA6 A; 2MGD A; 2MGE A; 1LHS A; 2W6V B; 3WCT D; 1SHR A; 3OO5 A; 3QM6 A; 3UHZ A; 3CIU A; 1LTW A; 3IC0 A; 4ROM A; 4HHB A; 1HDS B; 4U8U A; 4HSX A; 1V75 B; 1WMU B; 4DWT A; 1HBR A; 3AQ5 A; 4O35 A; 1XXT A; 2ZLW A; 2HBC A; 2VLX A; 3MKB A; 3LB4 A; 1MYG A; 4F6G A; 1NXF A; 3WCT C; 4UUR A; 1LFV A; 1SDK B; 1LH1 A; 1UX9 A; 3BOM A; 1Y0T B; 3K8B A; 2NSR A; 1MYI A; 2WY4 A; 5CN8 A; 3FH9 A; 2ZS0 D; 4NI0 B; 3GQP B; 2G0X A; 1NS9 A; 1SPG B; 2ZFB A; 3ZJR A; 1QSI B; 4M4B A; 2ZT0 A; 2VM0 A; 3BJ2 B; 1MNH A; 2M6Z B; 1FN3 B; 2D2N D; 2GRF A; 5E6E B; 3DUT A; 1HDB B; 1C7C A; 2D2M B; 3S66 B; 1UIW A; 3ODQ A; 2ZS0 C; 1MLO A; 5D5R A; 3WFT A; 1QPW A; 1G9V A; 1AZI A; 3A2G A; 3VRE A; 3ZJO A; 1GCW A; 2DHB A; 3ZH0 A; 1VXD A; 3OJ1 A; 3B75 A; 2QRW A; 2DC3 A; 3QJB B; 1YGD B; 3D1A B; 4NXC A; 1DO4 A; 1Y5K A; 5KKK A; 4UZV A; 2W6W A; 3UHV A; 2VYZ A; 4WCH D; 3LR9 A; 1YVT A; 2GNW A; 3PI4 A; 1BZ1 B; 1JP6 A; 1Y35 B; 5EU2 A; 1N9H A; 1Y7C B; 4HRT A; 1EBT A; 3D17 B; 3AG0 A; 1F65 A; 1HBS A; 1BZ0 A; 1Y4G A; 4MXK A; 4NS2 A; 1Y4B A; 3RJ6 A; 4H2L B; 3MN0 A; 2DN3 B; 1YCA A; 4WJG 1; 1Y22 A; 1GZX B; 1FAW B; 2HHD A; 3UH3 A; 1BZ6 A; 2HBS B; 2V1H A; 3OZV A; 1Y7Z B; 2PEG B; 2WTH A; 1DXU B; 1HBA A; 3K9Z A; 3D4X B; 2VRY A; 3WFW A; 1HCO A; 3BJ3 A; 3GOU A; 1Y7D A; 3A0G B; 2BK9 A; 4F6B A; 2V1F A; 4F6J A; 1O1O B; 2ZS1 B; 1MNO A; 1FSX A; 4B4Y A; 3QQQ A; 1HLM A; 2ZLT B; 2ZFO B; 2EKU A; 1Y0C A; 5JOM A; 5EYS A; 6HBW B; 1YEV A; 2SPO A; 1XZ2 A; 1Y8I A; 1MLS A; 3UBC A; 1QI8 B; 3D1K A; 1IRC A; 1LFY A; 1S5X B; 1Y4Q B; 4IT8 A; 1XY0 A; 2SPN A; 3EOK A; 1VWT B; 2E2Y A; 3WCW B; 5HLQ A; 1MYF A; 2W31 A; 2HBG A; 1SI4 B; 4HBI A; 1HBH B; 1OR6 A; 5KER B; 1Y8H A; 3PI9 A; 1A0U A; 2H8F A; 2LH7 A; 2ZSR A; 3U3E A; 5EUI A; 2LH5 A; 1JL7 A; 3D7O B; 3ECZ A; 3FS4 A; 1ABY A; 3OVU C; 2R4Z A; 4NI1 B; 4F69 A; 1DXV B; 1YIH A; 3HEO A; 1YOI A; 2ZSQ A; 2HHB B; 1OUT A; 4PNJ A; 2HBE A; 2ZSP A; 2ZLX B; 4MQC B; 1IBE A; 1NS6 B; 5KDQ B; 2ZS1 D; 1HAC A; 1N9X A; 3A5B A; 1RQ3 A; 5M3S A; 4SDH A; 3WTG B; 1O1K A; 1M6C A; 1MDN A; 1CH1 A; 1J7S B; 3SZK B; 3SDH A; 1J41 A; 1YEN A; 3LQD B; 1HBB A; 1HGC A; 1LFZ A; 1Y83 A; 4TYX A; 5B84 A; 1Y8W B; 4DC8 A; 1Y4R B; 3MVC A; 3E4N A; 1Y8K B; 1MLJ A; 2IN4 A; 3UH6 A; 2D60 A; 2G0S A; 1VXC A; 3WCP B; 4YU3 B; 3AT6 A; 1Y09 B; 1C7B A; 3UHS A; 2QMB B; 3UHB A; 1BZZ B; 2G0V A; 1OFK A; 1XZ4 B; 1A01 B; 2FRJ X; 2MYE A; 5HBI A; 2FRI X; 2R4W A; 3PI8 A; 1A0Z B; 3WCU C; 1YHE A; 3SDN A; 1YE0 A; 3G4Q A; 4XS0 A; 4DC7 A; 4MQH B; 1Y5F B; 1X9F C; 1IOP A; 1CLS B; 2MGK A; 1YFF B; 4ROL B; 1BAB A; 3G4R A; 2ZLU A; 2AUR A; 2VHB A; 3OO4 A; 1Y4V A; 1OJ6 A; 2ZSY A; 5ILE A; 4ZVA A; 1BVC A; 2D5X B; 2AA1 B; 1Y0W A; 1J40 A; 1MKO B; 3AQ6 A; 1AJG A; 1GVH A; 1MLN A; 3WCU A; 1YGF B; 1KR7 A; 1N9I A; 3NMM A; 1A6K A; 4MU5 A; 1V4X A; 1UX8 A; 1YHU B; 3QJC A; 1X9F A; 3PT8 A; 3HF4 B; 1GJN A; 1JY7 A; 5EQM A; 109M A; 1J7Y B; 3IXF A; 1MYH A; 4X0L B; 1R1Y B; 6HBI A; 1DKE A; 1G0A A; 2CMM A; 1XCH A; 2R1H B; 2GRZ A; 4AVE A; 3MYN A; 1LH3 A; 2O5S X; 1FDH G; 1V4W B; 1NWI A; 1COH A; 1G09 B; 1YOH A; 3BJ1 B; 1KD2 B; 1ECA A; 1MOH A; 3R5I B; 1XZ7 B; 1YMA A; 2V1I A; 4L7Y A; 1CG8 A; 3G53 A; 5E29 B; 2O5O X; 5IKS A; 1VXF A; 1C7D A; 1HHO B; 1L2K A; 1LFL B; 2O5B X; 1FLP A; 2Z6S A; 1LFT B; 2BLI A; 4N8T B; 5AZQ A; 1GCV B; 1LH6 A; 3UHK A; 3WFX A; 1O1I A; 2G12 A; 4MBN A; 1MLM A; 2EKT A; 3HRW A; 3UHQ A; 2DN1 B; 3UHE A; 1CH5 A; 3QM9 A; 1MNJ A; 1MYT A; 1YVQ A; 2IG3 A; 5CHR A; 3ONZ A; 1IWH A; 1CIK A; 4LPI A; 1Y4P A; 4MAX A; 2B7H A; 2AV0 A; 3CIU B; 1HV4 B; 3IC0 B; 2V1K A; 5HU6 A; 2HBF A; 3EU1 A; 3QJE A; 1YZI A; 4N7O A; 1LFQ B; 1SWM A; 3LHB A; 1YEU B; 1QSH A; 2MBW A; 1M9P A; 1R1X B; 2RAO A; 1V4U B; 2MGB A; 111M A; 2Z6T A; 1NQP B; 1WVP A; 3K3U A; 1F5P A; 4IRO A; 3G4Y A; 1FHJ B; 5HY8 B; 3PT7 A; 3W4U B; 2H8D B; 1CH3 A; 2RI4 B; 1EW6 A; 1B0B A; 1J52 A; 4OF9 A; 5CNC A; 1DLW A; 2W72 C; 1O1L A; 3WCT B; 3PI1 A; 4F6F A; 1MLG A; 2AUO A; 1YIE B; 2R80 A; 2MGA A; 4AVD A; 1S0H B; 2Z8A A; 2C0K A; 1G0B A; 2LH6 A; 1C7C B; 1UIW B; 3ODQ B; 1UMO A; 1UVX A; 1A6M A; 4ODC A; 4N7N A; 3WCV A; 2DXM A; 1NPF A; 1Y2Z A; 1Z8U B; 4FH6 A; 1MBO A; 1ECD A; 5E83 B; 3HHB B; 1Y0A B; 2ZSX A; 1Y5K B; 3QZZ A; 1AJ9 A; 1NZ3 A; 1MYJ A; 2ZS0 B; 3ZJQ A; 5JDO F; 4C44 A; 1MBN A; 3NFE A; 5HLX A; 1A6N A; 1IRD A; 3DHR A; 2O5M X; 3PI2 A; 1K1K B; 2MYA A; 3GDJ A; 1S56 A; 1XZU B; 4MQG A; 1A9W E; 1NZ5 A; 1DTI A; 1Y4B B; 3QJD B; 3VAU A; 2VLY A; 4KN3 A; 4U8U C; 3M38 A; 3MJP B; 2EVP A; 3LB2 A; 4F4O A; 1J3F A; 2ZST A; 1CH7 A; 5C6E B; 1MOD A; 1MLL A; 2D6C A; 1IT2 A; 1Y0D A; 1DO7 A; 1GBU A; 4O1T A; 3BCQ A; 3BJ3 B; 5AB8 A; 1HAB A; 1YMC A; 2MB5 A; 1AJH A; 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3UHT A; 1Y0T A; 2GKN A; 4O4T A; 102M A; 1V9Q A; 1Y4F B; 2D2M C; 3ASE A; 4NI0 A; 2KSC A; 4M4A B; 2NRM A; 3GQP A; 1G0A B; 4NK2 A; 1SPG A; 1QSI A; 1Y46 B; 4F68 A; 3NG6 B; 3NML A; 1COH B; 4MXL A; 5CND A; 4ILZ A; 3OZU A; 1NIH A; 1FN3 A; 1MBD A; 1J3Y B; 1CH9 A; 2ZSZ A; 5E6E A; 1O1N A; 2V1J A; 1HDB A; 1MTI A; 2D2M A; 1YOG A; 3HXN B; 2JHO A; 3BA2 A; 1ECN A; 3O7N A; 2HCO B; 2PGH B; 3G52 A; 1JZM A; 3QJB A; 1HJT A; 1QXD B; 4OOD A; 1YGD A; 3D1A A; 5D1V A; 1VXH A; 1QXE A; 1O1I B; 3WCU D; 2Z85 A; 1J7W B; 1LJW B; 4PQ6 A; 4TWV A; 1MTK A; 5CNG A; 4HRR B; 1GLI B; 2MYD A; 3PIA B; 1BZ1 A; 1X9F D; 1RQ4 B; 1Y35 A; 1VRF A; 3ONZ B; 1Y7C A; 1CH4 A; 1JDO A; 1RQA A; 4UIQ A; 2ZLV B; 2B7H B; 2EB8 A; 4H2L A; 3A9M A; 5HU6 B; 2BLH A; 2DN3 A; 1GZX A; 1UFJ A; 1LH7 A; 3ARK A; 3V2V A; 2HBS A; 1FSL A; 1BZP A; 1HDA B; 1Y7Z A; 2ZT3 A; 2PEG A; 1JZL A; 3DHT B; 3AT5 B; 2AUQ A; 3D4X A; 2ZT4 A; 1OUU A; 3A0G A; 1YG5 B; 4MQJ A; 1J3Z B; 2G14 A; 5MBN A; 2BNL A; 1O1O A; 2ZS1 A; 3KUO A; 3HYU B; 2ZFO A; 4MQI A; 3PT7 B; 3UHW A; 1DTM A; 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