The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGKALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
The high salt (phosphate) crystal structure of CO Hemoglobin E (Glu26Lys) at physiological pH (pH 7.35)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
58
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y4F B; 4ROM B; 1WMU A; 3ECL A; 2AUP A; 4YU3 A; 1YE2 B; 1I3E A; 1Y5J B; 1O1K B; 3NMM B; 1YHU A; 2EKU A; 3AT6 B; 4XS0 A; 1FN3 B; 4FH6 A; 4JYQ A; 1DXV A; 1A6G A; 1D8U A; 4F6B A; 3PT8 A; 3QJE A; 3QZZ A; 2R4X A; 105M A; 2Z8A A; 1CP5 A; 1VXE A; 1O1O A; 4G1B A; 1Y4G B; 3HXN B; 2D5Z A; 3QJD A; 3B75 B; 5JDO F; 4F6I A; 1RQA B; 1A01 B; 2EVP A; 2HHE A; 1UVY A; 1CBM A; 2M6Z A; 5EU2 A; 1ECA A; 2ZFO C; 1MYI A; 2VRY A; 1H1X A; 2G0X A; 2EF2 A; 3HF4 B; 1G0A B; 5AB8 A; 1X9F D; 1MYT A; 2ZT1 A; 2LH5 A; 4N7O B; 1HBH A; 2NSS A; 4ROL A; 3LB3 A; 1YEV A; 2ZFB A; 3G4Q A; 3AQ8 A; 5AZR A; 1MNH A; 3CY5 B; 1LHT A; 4HRT A; 1BIJ B; 5KDQ B; 5B84 A; 5HLX A; 1QSI A; 1FHJ A; 3WFX A; 2W72 B; 5C6E A; 1MBC A; 1R1X A; 3NFE B; 4HHB B; 1GCW A; 1B0B A; 1V4U B; 1Y4V B; 3DHT A; 1BUW B; 1YHU C; 3WCV C; 1C7C B; 1ABY A; 4H07 A; 1MWC A; 1BVD A; 1Y0T B; 1CLS A; 1A6M A; 1RVW B; 1CH9 A; 1BZR A; 1JL7 A; 4O1T A; 1XZ2 A; 3QM6 A; 3AQ7 A; 2ZSY A; 3W4U A; 1JP6 A; 1IDR A; 1IOP A; 1Y8W A; 1YFF B; 5CN6 A; 1XYE A; 1HGA A; 1Y0A A; 2RI4 B; 2D60 A; 4DWT A; 1G9V A; 4ODC B; 4BJA A; 2GDM A; 1OJ6 A; 4WJG 1; 3OZW A; 4UZV A; 2GTL C; 1MLJ A; 1NIH B; 3OO4 B; 1EBC A; 1C7D B; 3UH3 A; 4U8U A; 1Y09 B; 3IA3 B; 1DWS A; 4UIQ A; 2ZSN A; 3NL7 B; 2MGH A; 3VRE B; 1CG5 B; 1XXT B; 1PBX B; 3QJC B; 1R1Y B; 4FWZ A; 1HBB B; 1MGN A; 1MTJ A; 3MJP A; 3UHY A; 1CMY A; 2QSP B; 1A00 B; 1MWB A; 2R4Z A; 1YHE A; 5E83 A; 4B3W A; 3PEL B; 1YMB A; 1ECD A; 1U7R A; 1J7Y A; 2SPO A; 3GQG A; 3HHB A; 3DHR A; 2QMB B; 2ZS0 D; 1S6A A; 4X0L B; 1J3F A; 1AJG A; 1NS6 A; 1YH9 B; 3HEP A; 1HGC A; 3ZJI A; 4MQG B; 1CPW A; 2AUR A; 1UX8 A; 1LH7 A; 3GKV A; 1THB B; 1ABS A; 1LFL A; 4O35 A; 2MHB A; 4MXK A; 3K9Z A; 4H0B A; 1HAC B; 3A5A A; 1Y7C A; 2GKN A; 1N9X A; 3EDA A; 4NI0 A; 6HBW A; 2H8D B; 1Y0C A; 1XQ5 A; 1Y5K A; 4YU4 B; 1FDH A; 1Z8U B; 1HBG A; 4ESA B; 2D2M D; 3OVU C; 1VXF A; 1CG8 B; 2D2N D; 1LJW A; 4MU5 A; 1HSY A; 3GKT A; 1DTM A; 1A9W E; 5EUI B; 4IRO B; 4MQJ A; 4ZVA A; 1J7S B; 4MBA A; 1FSX B; 1BZ0 B; 1JZK A; 3QM7 A; 3AT5 A; 5AZQ A; 2FRK X; 1Y01 B; 2MGG A; 1G08 A; 1MLS A; 1PMB A; 3A2G A; 4G51 B; 3D1A B; 2HHB B; 1S69 A; 5CNC A; 3BJ3 A; 2HZ3 A; 1Y4Q A; 2QSS A; 2OIF A; 1VXD A; 1I3D A; 1Y7D A; 2VM0 A; 1WMU B; 2FRF A; 1GBU A; 1L2K A; 4YU3 B; 3ZJH A; 1CH7 A; 1Y0D A; 2MYD A; 1YHU B; 4O4T A; 2V1K A; 2ZLW A; 4XS0 B; 5JGG A; 2DN3 B; 1DXV B; 2ZST A; 1Y4P A; 1ECO A; 1CQ2 A; 3QJE B; 5ILR A; 1O1O B; 1VWT A; 3OK5 A; 1JEB A; 4MQC A; 1BZZ A; 2D5Z B; 3QJD B; 3IC2 A; 5EQM A; 3WCU D; 3UHE A; 3VAU A; 1OUT A; 5SW7 A; 1YG5 A; 3TLD A; 5CNF A; 1UFJ A; 1UC3 A; 1CIO A; 3KMF C; 3LB1 A; 2HHE B; 2M6Z B; 3UHD A; 1URV A; 4UUR A; 1Y46 A; 1X9F C; 4G1V A; 4NS2 A; 1NQP A; 2GL3 A; 1COH A; 3A59 A; 3RJ6 A; 2O5O X; 2AA1 B; 2HBG A; 1LH2 A; 5CN4 A; 2NSR A; 1CH4 A; 4ROL B; 3IXF A; 1YEV B; 1NAZ A; 3G4V A; 4MQI A; 2ZFB B; 3WR1 A; 1Y8K B; 3PI1 A; 1U7S A; 2QU0 A; 1YZI A; 1G0B B; 2PGH A; 1YVT A; 4HRT B; 1QSI B; 1FHJ B; 1G09 A; 3D1K A; 4B4Y A; 3UBC A; 5C6E B; 5EE4 C; 1R1X B; 1GCW B; 1J7W A; 5MBA A; 5CNB A; 1VHB A; 3DHT B; 2O58 X; 4DWU A; 1V5H A; 1VRF A; 1ABY B; 1QPW A; 3HRW B; 2GNW A; 1DUO A; 4M4B A; 2GRF A; 5JOM A; 3D4X A; 4MQH A; 4OF9 A; 3PI4 A; 4HSW A; 3BCQ A; 3G53 A; 1SPG A; 3W4U B; 1SDK A; 1MBN A; 3WCT D; 4HSX A; 2DC3 A; 1RQ4 A; 1Y8W B; 1HGA B; 1UIW B; 1F5P A; 1Y0A B; 7HBI A; 2ZLT A; 1G9V B; 2QRW A; 1MLH A; 2YRS A; 1XZU A; 2B7H A; 5MBN A; 1LFY B; 1VRE A; 1QSH A; 1DWR A; 4U8U B; 5E6E A; 1MOD A; 4ILZ A; 2W6X A; 3HEN A; 2H8F A; 3MJP B; 1CMY B; 3AQ5 A; 1HBI A; 1N9H A; 5CNE A; 1YHE B; 5E83 B; 1MNK A; 2VLY A; 2ZS0 C; 1J7Y B; 1W92 A; 3GQG B; 2BK9 A; 3HHB B; 3DHR B; 2QLS B; 1YEO A; 1UT0 A; 1NS6 B; 1V9Q A; 3BJ1 A; 3LR9 A; 3WCW A; 1A0U A; 1HGC B; 1A3O A; 1K0Y A; 1LA6 A; 2VYW A; 4QAU A; 2ZS1 D; 3GKV B; 1ABW A; 1LFL B; 1MNO A; 4IT8 A; 2MHB B; 2ZSR A; 1Y85 A; 1YOG A; 3O89 A; 2ZLX A; 1Y7C B; 1WVP A; 5CN8 A; 1MBI A; 6HBW B; 1DXU A; 1Y0C B; 2D2M C; 4F6J A; 1XQ5 B; 3ZJS A; 1NXF A; 1NZ2 A; 3K3U A; 1YIH A; 2D2N C; 1BVC A; 3G4W A; 2G3H A; 1O1I A; 1LFZ A; 1HGB A; 2GRH A; 2Z85 A; 4F6F A; 5F2A A; 3EDB A; 4XDI A; 2GLN A; 1LJW B; 3MKB A; 1MOA A; 4MQJ B; 2O5L X; 2V1I A; 1UX9 A; 1ITH A; 1Y7G A; 2XKH A; 1MLL A; 2ZLU A; 3AT5 B; 1G08 B; 2V1F A; 3HYU B; 108M A; 3UGZ A; 2VEE A; 2HBC A; 2MGL A; 3OO5 A; 2QFN A; 3BJ3 B; 3WCV A; 3AQ6 A; 1Y4Q B; 1DM1 A; 2QSS B; 2G0R A; 3QZX A; 2IG3 A; 1Y7D B; 2HBS A; 4PNJ A; 5IKS A; 1HAB A; 1DO1 A; 3GLN A; 2R80 A; 1Y0D B; 2HBD B; 2ZLW B; 2O5B X; 1MOC A; 3WCW C; 4WJG A; 1Y4P B; 1YMA A; 2O5S X; 3WCU C; 1KR7 A; 1DXT B; 2ZSX A; 1MCY A; 1VWT B; 1BAB A; 1JEB B; 3U3E A; 1SDL B; 1BZZ B; 5F0B A; 3IC2 B; 2GTL A; 4MQK A; 1O1M A; 1OUT B; 5SW7 B; 1T1N B; 1J41 B; 1FAW A; 1MDN A; 3WHM B; 1YG5 B; 2G12 A; 2G0V A; 1O1N B; 3QJB A; 1DKE A; 1JF4 A; 4MXL A; 1MLK A; 2HBE A; 3VHB A; 1XZ7 A; 1H97 A; 4TYX A; 2O5Q X; 3KUN A; 1LUE A; 1Y46 B; 1DXC A; 1DO7 A; 1NQP B; 1BZ6 A; 1COH B; 3A59 B; 1RPS B; 5EOH A; 1J3Y A; 1Y4R A; 2DN1 A; 1XY0 B; 1FCS A; 2FRI X; 4MQI B; 2ZSP A; 1DLY A; 1HHO B; 1CO9 A; 1LHS A; 1HCO A; 2QU0 B; 1YZI B; 3ZJQ A; 3LB2 A; 2PGH B; 1YVT B; 2XYK A; 1A3N A; 2HZ2 A; 1G09 B; 4TWU A; 1MTI A; 3WI8 A; 1YEU A; 1J7W B; 1Y5F A; 3G4U A; 1YMC A; 1BBB A; 5CN7 A; 3UHX A; 104M A; 3WTG A; 1VXG A; 3ZJN A; 1NPF A; 1QPW B; 4M4B B; 1MNI A; 1IT2 A; 3D4X B; 3PI9 B; 3WCT C; 1CH3 A; 2GNV A; 4MQH B; 2OHB A; 3BCQ B; 1SPG B; 1RTE A; 3GK9 A; 1SDK B; 4MAX A; 1NEJ A; 1RQ4 B; 1CO8 A; 3GYS A; 3LQD A; 3ARK A; 2YRS B; 2W6Y A; 101M A; 1XZU B; 3H57 A; 2B7H B; 3SZK A; 2ZLV A; 1HDB A; 3QM5 A; 3EU1 A; 1HDS A; 1QSH B; 2DN2 A; 1S56 A; 4FWY A; 5E6E B; 2LH1 A; 1HV4 A; 1HDA A; 3V2V A; 2V1E A; 2HCO A; 5EYS A; 1YGD A; 1DUK A; 4VHB A; 1M9P A; 1VXB A; 2H8F B; 3BOM A; 1A4F B; 3UHB A; 1DTI A; 3AG0 A; 2FRJ X; 2FAM A; 1YEO B; 2EKT A; 1BIN A; 1LFV A; 2ZS1 C; 3BJ1 B; 2MGJ A; 3WCW B; 1A0U B; 1VXC A; 1CBL A; 4TWV A; 112M A; 1K0Y B; 2MGK A; 1LA6 B; 2V1H A; 4F4O A; 3KMF A; 4F69 A; 1QXE A; 2ZFO B; 3VRG A; 1QXD A; 5E29 A; 1X9F A; 1QI8 A; 1Y85 B; 1DO4 A; 2G0S A; 2ZLX B; 1FSL A; 2PEG A; 4LPI A; 4NZI A; 1DXU B; 1F63 A; 1EW6 A; 1YE0 A; 5CHQ A; 1YIH B; 1JY7 B; 3A0G A; 4MBN A; 2V1G A; 1MTK A; 3ORD A; 3G52 A; 4WCH D; 3MKB B; 3V2Z A; 1S5Y A; 4M4A A; 1MLR A; 2MYB A; 1Y7G B; 2DXM A; 2G10 A; 4NI1 B; 3DR9 A; 2ZLU B; 3PT7 A; 1O1P A; 2BLH A; 5CMV A; 3GQR A; 1Y5J A; 2HBC B; 1FLP A; 3OO5 B; 3AT6 A; 3NML A; 3UBV A; 4FWX A; 3WCV B; 5HY8 A; 1Y7Z A; 5C6Y A; 5HBI A; 2HBS B; 1HAB B; 1JF3 A; 3PT8 B; 1LH1 A; 1CH1 A; 1GLI A; 2GKM A; 2R80 B; 4PQB A; 4GZG A; 1MZ0 A; 3A5G A; 2HZ1 A; 3B75 A; 3ONZ A; 1HLM A; 1XZV A; 2MB5 A; 2ZT4 A; 106M A; 1HRM A; 5JDO E; 2GTL B; 4MQK B; 1O1M B; 3DUT A; 3HC9 A; 1FAW B; 1GDI A; 3UH5 A; 2ZFO D; 2HHD A; 3S65 A; 1DKE B; 1G0A A; 2VLZ A; 2HBE B; 1IWH A; 3LB4 A; 1XZ7 B; 4N7O A; 1A0Z A; 1OBM A; 4JAC A; 2ZSZ A; 1HBH B; 3GDJ A; 1J40 A; 3UHH A; 4NXC A; 5B85 A; 1MLN A; 1HLB A; 2ZS0 A; 1JL6 A; 1YGF A; 5KDQ A; 1YHR A; 1J3Y B; 1Y4R B; 1NS9 A; 2DN1 B; 3MJU A; 1A6K A; 1F65 A; 3UHK A; 1Y2Z A; 5JDO D; 1V4U A; 5ILM A; 1Y4V A; 1HCO B; 2Z6N A; 1YEQ A; 1EBT A; 1YDZ A; 1X46 A; 1GCV A; 1CLS B; 2MYA A; 2NRL A; 1YEU B; 1YHU D; 3M39 A; 1Y5F B; 1XZ2 B; 3SDN A; 1IT3 A; 1NZ4 A; 1BBB B; 3MOU A; 1O1J A; 4HBI A; 2ZSO A; 3OJ1 A; 2MYC A; 2D2M A; 2D2N A; 1XYE B; 2RI4 A; 2D60 B; 3ASE A; 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5JGG B; 1AJ9 A; 1Y7Z B; 5HY8 B; 2DN3 A; 3ZJR A; 1V4W A; 2D6C A; 1LFT A; 1NWN A; 2E2Y A; 107M A; 3AQ9 A; 2BNL A; 2QFK A; 3QMA A; 3QM9 A; 3WCT A; 1GLI B; 3E5I A; 3M3A A; 5KER A; 4MQC B; 1N9F A; 3UHU A; 2ZT0 A; 3A9M A; 2EB9 A; 1V4X A; 2OH8 A; 1RQ3 A; 3MN0 A; 2MGI A; 3ONZ B; 1DWT A; 2EVK A; 1VXA A; 1XZV B; 1YOH A; 4SDH A; 1MOB A; 2D5X A; 1MLQ A; 4N8T A; 1GDK A; 5CN5 A; 2MBW A; 2VHB A; 1O1L A; 3DUT B; 2LH2 A; 3S66 A; 1MYJ A; 1GBV A; 2HHD B; 3S65 B; 1IWH B; 3ZJP A; 2AA1 A; 1A0Z B; 1LH5 A; 5D1V A; 1Y8I A; 4DC7 A; 2NX0 A; 1NZ5 A; 2HBF A; 3GDJ B; 1J40 B; 1IBE A; 3WR1 B; 3UHW A; 1Y8K A; 3ZHW A; 1YOI A; 2ZS0 B; 1G0B A; 3FH9 A; 1S61 A; 1YGF B; 1YHR B; 2WTG A; 1NS9 B; 5JDO C; 1MBA A; 3D1K B; 3E5O A; 3MJU B; 2XKI A; 3UHV A; 3ZJO A; 4KMV A; 1S5X A; 2ZS1 A; 1F5O A; 1Y2Z B; 1J3Z A; 5CHR A; 2SPL A; 5EE4 D; 2Z6N B; 1YEQ B; 1JDO A; 1M6C A; 1MYZ A; 1GJN A; 1HJT A; 1YDZ B; 3HRW A; 3ZJJ A; 1GCV B; 1MBS A; 1ECN A; 4N7P A; 3MYN A; 4O4Z A; 1Y0W A; 1WLA A; 3UHZ A; 3GQP A; 1O1J B; 2D2M B; 5M3S A; 2VYY A; 1OFJ A; 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